4MH5A

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with (s)-glutamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
GTNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and interlobe interactions of the ionotropic glutamate receptor GluK3 ligand binding domain revealed by high resolution crystal structure in complex with (S)-glutamate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 3
molecule tags Receptor/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mh5A02
4QF9A 4JB7A 4BDQA 4U4XA 4XIGQ 1IXIA 3MBPA 3IJXB 1Y1MA 2QS3A 3TEPA 3HHFA 4DIGA 4KQPA 4LQ2A 3QXMA 5H8SA 2DVZA 1MPBA 3TPAA 2DQVA 4ZZEA 2CZLA 3USDA 1LAHE 2I6EA 3PUZE 3TAJA 1XT8A 1Y20A 2DXRA 3IORA 3UN6A 2E0SA 2X7PA 2NUVA 1R9QA 2O51A 5H8HB 1TXFA 2V25A 2QPQA 3CVGA 1FW0A 1RKMA 3M3LA 4OMBA 3C4MA 4KR5A 3DP8A 1SI0A 2Q2CA 4KHZE 3KBRA 3PU5A 3VV5A 1SYHA 3IOUA 4NWCA 4ZEBA 2WKYA 4DXBA 1GGGA 2XX8A 5HPQA 2HAVA 3LBSA 1MQIA 1N3WA 1FQEA 1UTBB 1B3EA 4X9TA 4H67A 3GBBA 1MY0A 4O3AA 1P1NA 3Q26A 2QRYA 4OWDA 4MH5A 1FQBA 1SW2A 1PB9A 3E3KA 3PPRA 5I56B 1MXVA 3OSQA 2XXTA 3W15C 4OHNA 5I2NB 1UTHB 1PBQA 1JQFA 2HXWA 1H45A 1B3HA 4ELOA 2PVUA 4ZE9A 1SQYA 3F11A 1CE2A 2Y7WA 1JEUA 3MQ9A 3G3IA 3MZ9A 1A8FA 4XKRA 4RNSA 3THIA 1M5CA 2I3WA 3T9HB 3K01A 2VD2A 3V8XB 4IY5A 3OO9A 4NF5B 1OLCA 4LVQA 3SEXA 3RUMA 3IX1A 1LAGE 1DTGA 4YMAA 3U8QA 3TYHA 3RT6B 1MQHA 2IA4A 3KG2A 3A3UA 4AB5A 2F5XA 3PV0E 3VVEA 3CFLA 3QSLA 1B3LA 3T96B 1URGA 3AXFA 3Q25A 1S9TA 4FATA 1AH5A 3QUJA 3RY3A 5KCJB 3FXQA 3IB1A 1XHYA 3W9VA 1LSTA 2F6GA 1O64A 4F1UA 2XHDA 5B7DA 3BFUA 4QFLA 3MVWA 2FYIA 1TFDA 1M5FA 4DCYA 4EDPA 2I49A 1Z7ME 4RYAA 1LAFE 1POY1 2NXOA 3EN3A 1OVTA 4MFIA 4WKMA 3OELA 4U2RA 5CBSA 3BFTA 3VE1B 2OJTA 1FQAA 3FV1A 1B0HA 3FVOA 1B46A 3IB2A 4Q30B 1F9BA 5L8DA 1Y3NA 3HSTA 4ZEDA 4MLVA 3L6GA 1ZLQA 4IO5A 2F6PA 3RQTA 4DXCA 3FATA 4ESWA 2O7IA 1D9YA 2UXAA 3HHGA 3N5LA 4F22A 4HCYA 3SETA 4G2ZA 2QS1A 5DEXB 3K1MA 1UIUA 1US4A 3HPIA 4KFQA 4OESA 2D3IA 2PX1A 3B7DA 3I5OA 3ILUB 2NVUB 1BLFA 1JNFA 2QSXA 3S9LC 2Y7IA 2V84A 1OIBA 3LUYA 3V89B 3BKIB 1US5A 4FEDA 3U94A 1JETA 4F3PA 3ODBA 4ZECA 2Z8FA 1ZJLA 3VVFA 5DYHA 3PUYE 3O66A 4H1XA 3T22A 1Q35A 1S50A 1ZIUA 4OFOA 1FTKA 2ZNSA 1OMPA 2Y7PA 1N0TA 2HZLA 4FE8A 1SYIA 2V93A 3K00A 4H5GA 1LFIA 4IO4A 1MPCA 3IJOB 3ZKKA 1MY2A 3MUQA 1UTBA 2OWTA 3T9VA 2NWJA 4ZEKA 2REGA 1Y3QA 5H8QB 4O3CA 3CFXA 3C35A 4YB6A 4Q5TA 1QW0A 3H6WA 4NE4A 1MS7A 3OD7A 4F18A 3MP8A 5I56A 1GV8A 1IQ7A 4RJZA 3PPOA 3TCGA 3K6UA 3DELB 5I2NA 1MQGA 1UTHA 4FJPA 3OXNA 1O7TA 4YZZA 4N13A 1LGBC 1R1NA 2CMOA 4F29A 3VXCA 5KDTB 2NOOA 2DE4A 3KSJA 2O69A 4JWOA 3IAZA 1ATGA 1EZOA 2ZYNA 4TLLB 4NF5A 4R72A 1WDNA 1VE4A 4QHQA 2ZNTA 2DWJA 3N6UA 1N3XA 4LP2B 4Q0CA 2XXPA 3D4GA 4GIZA 4NF4A 4PFUA 2AIXA 4U1ZA 1YAEA 1ZMGA 1USYE 1GR2A 2Q9TA 4RXLA 3T9UA 3CRBA 4I62A 1MQJA 4FECA 4LA9A 2I4BA 3SESA 5KCJA 4I1DA 3RLFE 4F39A 4GOTA 3H6UA 2GRVA 4LZ8A 3PD8A 1AL3A 5I59A 4IO7A 1VSOA 4PE5B 3TDJA 1EH3A 3VFJA 1TFAA 2G29A 3U92A 4L17A 3MZBA 3RT8A 3TTMA 3S4UA 4WXJA 3D4CA 3SERA 1P1WA 5FHNA 2XD3A 5CBRA 4YICA 4RPOA 3SDFA 4F19A 1TT1A 1PEBA 3G3JA 1MXYA 1B7ZA 3G3HA 5EHMA 3QUFA 4RY1A 4G8MA 2H25A 3TMGA 1AMFA 1IIWA 5HM4B 5H8NA 3JZJA 4U21A 4MBPA 4F1YA 2FNCA 5ICQA 1ZKBA 1JW1A 3OENA 4F3GA 4E0WA 1D4NA 5AA2B 5B70A 2ABHA 1SBPA 5DEXA 2R9JA 1MM6A 1XS5A 4JDFA 4OENA 4AB6A 4EF1A 3K1NA 4IO2A 4YKPA 2DS9A 1XVXA 1FTOA 2QS4A 3V5AA 1AOVA 3LSXA 4F2OA 1FQDA 1A54A 3Q28A 5I58B 3H6TA 1IITA 2H9BA 4P0GA 2B65A 4YB5A 2QMXA 1NNFA 3MVZA 2ZXTA 3IOWA 1JW4A 3LSFB 5CC2A 3R6UA 5BUUA 4OFJA 2W7YA 1OVBA 3FZVA 2DWHA 1LAXA 1SW4A 4U22A 1YCJA 1T0KA 3IR1A 1P1QA 4IO6A 1IXHA 2Y7RA 4IGRA 1XOCA 3M3FA 3Q27A 2XXUA 3S9NC 3IOTA 3FVGA 1QVSA 3U72A 4OXVA 3G3GA 2I0CA 1ANFA 2Z8EA 5AA4A 3EPEA 2H4IA 4IY6A 1B2HA 3FASA 3FJMA 3K6VA 3VXBA 3T9XB 4OERA 2O68A 1ZU0A 3U1OA 2ESNA 5CM6A 1LFGA 5AA3A 4DCXA 2XXQA 1NH8A 3IK6B 2F35A 1FTJA 5KDTA 2XXIA 2Z8DA 2B3FA 1I6QA 2RINA 5H8FB 2IEEA 4TOZA 4R74A 4ONYA 3KJTA 3RTWB 1J1NA 2R6GE 2F7CA 2M8CA 4OEUA 3O2AA 2RKMA 3UK4A 2H98A 1MXZA 3Q29A 2I4CA 1SD3A 2ZYMA 1PB8A 4ELQA 3UP9A 2GH9A 3QAXA 5LOMA 2XXHA 4C1TA 2REJA 3RPWA 1UIVA 2F8DA 1MY1A 4JSDA 1XVYA 3MC2A 5CI5A 3E9XA 2RC7A 2PYYA 3IOVA 2RCAA 3VDFA 3FXUA 1LB9A 3U93A 5TU0A 3O6GA 5I2KB 3M3KA 5TPAA 4M1VA 1B3FA 1D9VA 2OCUA 4XKNA 2O1MA 3MJNA 1B5IA 3C31A 5HBCA 2ONKE 2UYEA 4EF2A 3TELA 2V3UA 1B5JA 1B6HA 4E0XA 4R9GA 3K1PA 4R2BA 1P1UA 4OTEA 4KYSA 4R6YA 4LONB 3M8UA 4EXLA 2I58A 4F3SA 4LATA 3E4RA 2THIA 3GLBA 2O84X 2Z22A 4POWA 1NL5A 3TKDA 1L5TA 3MPKA 2RC9A 4Q8RA 2UVHA 4LZ7A 1M5BA 4LQ5A 2F36A 5AA2A 1P99A 2F97A 5DTBA 1EU8A 1HSLA 5AE4A 3EHSA 2P0SA 4GXSB 1NFTA 4KCDA 1FCKA 1MM7A 2DWAA 4FEBA 2UVIA 2HAUA 3RGYA 5I58A 1MG1A 3S9MC 3TZAA 3A3CA 4O3BA 5M2VA 5H8HA 4KYDA 1A99A 2ANJA 5TP9B 4U1OA 4OEVA 4FIMA 2AL4A 2RCBA 3FXRA 2F78A 1QJMA 4ZE8A 1BIYA 2UVGA 3OEKA 2HZKA 2DYXA 2F7AA 1WVJA 3C36A 2XX7A 3LSWA 1UQWA 2A5TB 2Q2AA 3TTRA 1TWYA 3W9WA 1LCTA 1FTLA 4IO3A 4GXAA 3UA8A 2HCAA 1Y4TA 3DM0A 4ESXA 4Z0IA 2OBGA 1AIVA 3MAMA 1N7WA 4RK9A 1IEJA 3VVDA 3S2VA 3TUSA 3OOAA 3KN7A 2F7BA 3GBAA 4EXKA 1B40A 3QK6A 3KGCA 3PD9A 2P1SA 4YU0A 4N07A 2V3TA 5I57B 5DVJA 1LB8A 3C9HA 1DMBA 4QRZA 5K2YA 5DVFA 4YMBA 4G4PA 3MWBA 2Q89A 4X1DA 1WODA 3C34A 3R26A 4FAJA 2AYSA 4ZZAA 3SEUA 4WEPA 3GZGA 1B0LA 3PUWE 3H03A 1II5A 4PFWA 3RN8A 1I69A 3LR1A 2RC8A 4G8HA 2Q8JA 4KCCA 4GF8A 1M5DA 3G3FA 1SVXB 3B6WA 3OSRA 1B4HA 3KOTA 1MY3A 4C1UA 2DE3A 2ZMBA 4PQJA 2Y84A 4R6KA 4Z7EA 4YKKA 1SW1A 3ZS6A 1A40A 1QUJA 3DLNA 3TCFA 4DLDA 3PGFA 3IL1B 3PPPA 3WAEA 4R9FA 4EQBA 4I8CA 1MDQA 5I2KA 5CRYA 4NEDA 4GQOA 4U4SA 3A09A 1HSJA 4GRKA 2OZZA 3LSLA 1BP5A 2QS2A 4BDOA 3S9EA 2XXYA 4JWYA 4EQ7A 2PBWA 3RNNA 3TODA 1N84A 1VFEA 2ZYKA 4GL0A 3KSXA 1SI1A 3K2DA 1MDP1 5DT6A 4PP0A 1Y4CA 5CMCA 1Y3PA 1LBCA 4P0IA 1PDAA 5F7VA 4H8IA 3FGSA 4BDNA 4LZ5A 1EZPA 2B3BA 2OWSA 2HFBA 3PPQA 4BDLA 2QMWA 4H65A 4QSEA 2I0BA 3O6IA 1Y9UA 1FQCA 3PMWA 1KWHA 1OQHA 2VD3A 2DE2A 2XXVA 3FUZA 3H4ZA 1GTKA 4NWDA 3IO4A 4YAHX 5ITOA 1Y1ZA 1ELJA 4XTCQ 1RYOA 4JBZA 2XD2A 2PT1A 5EYFA 1BKAA 2VP1A 3CR9A 4F1VA 5ELVA 5L9MA 3FD3A 4PETA 3K4UA 2X7QA 5CMKA 2ALUA 2AL5A 4ISUA 2DVCA 1PB7A 1B1HA 1USYH 4P11A 3VLVA 4G77A 4KI0E 4QFPA 3PUVE 5TP9A 2YJPA 3EHTA 4TQUQ 2DP8A 5CMMA 4AQ4A 4UA8A 2XXXA 2R71A 3K6WA 2V3QA 2A5SA 5IAIA 1MQDA 2RF1A 4OZ9A 4WEDA 2DOJA 2D5WA 1QUKA 3QYTA 1Q1KA 4FORA 5K2XA 1LFHA 2A5TA 3OO7A 4XKQA 4F2QA 3G3KA 1SW5A 4ZEIA 1NNTA 1H43A 5H8QA 3VLUA 4EQ9A 1DSNA 3TTKA 5FTIA 4BDMA 3MP1A 4HW8A 4XXUA 4N6PA 2PMSA 4PFTA 4EUOA 4R2FA 3IO6A 3PUXE 1QULA 5I57A 4HTGA 3EHUA 4IGTA 1URSA 2GHAA 3V83A 1NKXA 3KN3A 4UACA 4R6HA 5DVIA 1MRPA 1LCFA 5ITPA 3H7MA 2UYFA 1A55A 3TFLA 4ZEFA 3K0VA 3MW0A 4DDDA 4GFRA 4JSOA 4POXA 4THIA 3SEWA 1MXXA 5FHOA 4G68B 2PT2A 2YPNA 4TLMB 1B7UA 3ONMA 3MVXA 3ILTB 4NF6B 3LC8A 5F1QA 4NF4B 4DXUA 5JTYB 1P1OA 5A5XB 3O9PA 2O7UA 4JXIA 3TTNA 4NMYA 3MZ1A 1B9JA 2UVJA 5JK4A 4XKPA 3PMVA 4OYVA 3CSGA 3CIJA 3VLWA 3OEMA 4GVOA 2DSFA 1B32A 1DPEA 4DE8A 1QKAA 4NF8B 4LUBA 3CI8A 3H3GA 3TCHA 3DP4A 2O1LA 3ZSFA 1JVYA 3E13X 3MVYA 1N76A 2F34A 5I59B 4BDRA 1HSEA 3I6VA 1NNKA 3T93B 3CSBA 4RPNA 3O97A 1B58A 4R73A 2KLFA 1DTZA 1MY4A 1MXUA 1B5HA 4U23A 4PFYA 5I84A 1JW5A 3UGWA 3C32A 1POTA 1MXWA 3O28A 3N6TA 4QSCA 3K6XA 3DP6A 1GVCA 4HS7A 3FVNA 1A8EA 4QSDA 5L9OA 2I48A 2OK2A 4QFOA 1MPDA 5H8NB 3FJGA 2HEUA 1I6BA 2XXWA 1ZTYA 4YKIA 3HN0A 3SEVA 4ELPA 2ZNUA 4NTLA 1B3GA 1VFDA 2O6AA 4H0WA 2D21A 2E1SA 4OVJA 2VGQA 4ELRA 3KFMA 4YB7A 4QFNA 1PBPA 3EF7A 3I3VA 4HCWA 3QIMA 1B52A 4X48A 5AA1A 4OFLA 5KZTA 4ZS9A 3FJ7A 3N94A 1IXGA 4MF3A 1NMUA 2ONSA 2OLBA 4BLAA 3FV2A 1SDXA 5FTHA 3KEIA 3KJ7A 1NNPA 3TQWA 3CG3A 4C0RA 1R9LA 1N04A 3G7WA 5ICTA 1VR5A 4H5FA 1B51A 4KPTA 3T66A 1XC1A 5BWJA 3TQLA 1QUIA 4F31B 3GXAA 1CB6A 1B1XA 1ZBMA 2I3VA 4RA1A 2QL3A 4X1BA 3CG1A 1IXCA 4H6DA 2Q88A 2ONRA 2DWIA 3K02A 2XX9A 3FIRA 1IZ1A 2GFEA 3BBRA 3KN8A 5AA4B 1FQFA 1YTVA 3OO6A 3H6VA 4ZDMA 4H8JA 1B05A 3CFZA 3EQ1A 1IUDA 3KZGA 1B7HA 2P2AA 1DOTA 3O29A 3R7XA 3HCQA 4M4GA 2LAOA 2G93A 1Z7NE 3B6TA 1A7LA 3N26A 1DPPA 1QKBA 3UIFA 5H8FA 1H44A 4GLIA 3L6HA 4G8NA 1YPNA 3PMXA 1O63A 5AA2D 2YLNA 4JWXA 1D3KA 4QFKA 5FHMA 2DXYA 3FVKA 1LBBA 3JV9A 4I9DA 2QJEA 1R6ZA 1JEVA 1EZ9A 2XXRA 1B4ZA 4MLQA 4G68A 5EHSA 1PC3A 4F3BA 5J1DA 4OETA 4NF6A 1H76A 1RYXA 5IKBA 3ECRA 5JTYA 5A5XA 4RK2A 4DZ1A 5CMBA 1MH4A 4IB2A 3JYRA 2GHBA 2FA7A 2VHAA 1N7XA 3RTFB 3HV1A 4OQOA 1MH3A 3MP6A 4YKJA 4ECFA 4ND9A 1JVXA 3SEYA 4GWOA 1I6AA 3SKPA 3B6QA 4NF8A 4R75A 5TPAB 5L9SA 4KD5A 5ISUA 4GL8A 2H5YA 1URDA 1LLSA 2Z23A 2H99A 2BJJX 3KOSA 2VOZA 3ZKLA 3P7IA 3PPNA 3HO7A 1OQGA 3O6HA 4K3FA 3WAFA 3UORA 2X26A 1BTJA 4KYEA 1NH7A 1OLAA 3IB0A 1S7YA 2HQ0A 3OO8A 2ZYOA 3OMBA 3C33A 5JEIA 4GD5A 1H3DA 3MPLA 3TTLA 3H06B 2Y7KA 4G68C 1FTMA 1M5EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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