4N13A

Crystal structure of psts (bb_0215) from borrelia burgdorferi
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
EKIVSIGGSTTVSPILDEMILRYDKINNNTKVTYDAQGSSVGINGLFNKIYKIAISSRDLTKEEIEQGAKETVFAYDALIFITSPEIKITNITEENLAKILNGEIQNWKQVGGPDAKINFINRDSSSGSYSSIKDLLLNKIFKTHEEAQFRQDGIVVKSNGEVIEKTSLTPHSIGYIGLGYAKNSIEKGLNILSVNSTYPTKETINSNKYTIKRNLIIVTNYEDKSVTQFIDFMTSSTGQDIVEEQGFLGIKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Sequence, biophysical, and structural analyses of the PstS lipoprotein (BB0215) from Borrelia burgdorferi reveal a likely binding component of an ABC-type phosphate transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding pro
molecule tags Transport protein
source organism Borrelia burgdorferi
total genus 87
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n13A01
3TEPA 2I4BA 3E13X 3SDFA 1B7UA 2XD2A 2BJJX 3TPAA 4G8MA 4QSCA 2H5YA 1MDP1 3VVEA 2GFEA 3O2AA 4F39A 1EZPA 2VD2A 4DIGA 1B3GA 1B5JA 2XHDA 1Y20A 5FTHA 4KD5A 3S9EA 3E4RA 2D5WA 5BWJA 3MP8A 2LAOA 5KDTB 4ZE8A 3C31A 3FJMA 3TQLA 5JEIA 4YMAA 3PPQA 1FQFA 2ZYNA 5L9OA 2OWTA 5DTBA 4YB7A 3TYHA 2DVZA 4KCCA 2DWAA 2ONKE 5TU0A 3N26A 4PQJA 4KQPA 5AA3A 3PPNA 1Y1MA 3E9XA 3P7IA 1IXHA 2B3BA 1S50A 2XXUA 1N3WA 4EQ7A 3KOSA 2YPNA 3C4MA 4ECFA 3T9XB 4BDOA 4LZ8A 3U92A 3BFTA 1BP5A 3ODBA 1N84A 5AA4B 1B4HA 2A5TB 3DP8A 1M5FA 4XXUA 5TPAA 3PD9A 2HEUA 4HTGA 4C1TA 1UTBA 4XKRA 3CVGA 3CFLA 1OMPA 3IOWA 5ICTA 2OJTA 1FCKA 2ANJA 3G3GA 1EU8A 3Q28A 3G3FA 2ZNUA 1MM7A 3G3HA 1A99A 4ZECA 2OCUA 2O51A 1ZTYA 1HSJA 4R2FA 4RXLA 3U93A 4H67A 4F18A 3JZJA 1EZ9A 3TTLA 2XXPA 4U1OA 3D4CA 1LCFA 1JNFA 3MQ9A 1Z7NE 4NF8B 3AXFA 1A7LA 2H98A 3LSWA 2XX7A 4IO5A 1B5HA 4LATA 5DVFA 2Z8DA 3T66A 3OEMA 3HSTA 1B51A 3IB1A 3C36A 1FQCA 4KYSA 1H43A 3FXRA 3R6UA 1NFTA 5DVIA 4U21A 2I3VA 3OO7A 2RF1A 4PFYA 3QIMA 4PP0A 4UACA 1AMFA 1NMUA 2P2AA 3GLBA 1DSNA 2DE3A 3FUZA 1MXXA 1WODA 1QUKA 3SKPA 5ITPA 3CFXA 4YMBA 3PU5A 2UYEA 4YU0A 1QKAA 3MVXA 1EZOA 5AA2B 3FVNA 1MY1A 3QK6A 3USDA 3MVYA 5AE4A 2DQVA 3EHUA 3U94A 1NKXA 3JV9A 4ZEDA 4OVJA 3PPRA 1FTLA 2FYIA 2NVUB 3HHGA 2QMXA 3TUSA 1MXZA 2Y7KA 1NH7A 3CI8A 1H76A 3UN6A 4QSEA 4TLMB 4EQ9A 3IL1B 1QUIA 4THIA 2D21A 1MXWA 4R74A 4LA9A 5I59A 4RYAA 4FAJA 1DTGA 1GTKA 5KCJB 3TKDA 4PFTA 5DYHA 4IO4A 1DPPA 2M8CA 3PUZE 1RKMA 3MC2A 1Y9UA 5K2XA 2XXYA 3MW0A 1PBQA 3I6VA 2RCAA 4GXAA 3BFUA 3ZKKA 2F7BA 3FJGA 4Z0IA 3LBSA 2HCAA 2FA7A 4FIMA 4R2BA 4Q8RA 5I57B 3GZGA 3KOTA 3DP4A 4YB5A 2PT2A 3KBRA 1ZMGA 1B40A 2QPQA 4YZZA 2XXXA 5DVJA 4POWA 2DWJA 2G29A 1N76A 2RKMA 2Z8FA 5IKBA 3Q27A 4JWYA 2Q2CA 2DVCA 4FJPA 1NNFA 3IB0A 4AQ4A 5B7DA 5A5XA 4OERA 4AB5A 1D4NA 1I6BA 3T22A 1IZ1A 4Q30B 2O84X 5I2KB 3EQ1A 1NNKA 1SW4A 4OXVA 4NWDA 4ZEKA 3CIJA 4POXA 1FQEA 4BDQA 1FTKA 4LZ7A 5I2NA 3UK4A 2XXRA 3DLNA 4GLIA 3FXUA 4YKIA 2I58A 3K4UA 2V3UA 4N13A 1B1HA 3SERA 4G8HA 3KEIA 4PETA 4IY6A 3T9UA 4UA8A 3TMGA 3GBBA 3O6GA 1BIYA 2XXTA 4OFOA 5B70A 3ONMA 4ZS9A 5TP9B 3K6UA 3K00A 1B7ZA 1J1NA 2H99A 1MY3A 4U2RA 4KHZE 4ONYA 3TFLA 2ZYMA 1URDA 2PYYA 3PUXE 4FORA 4JBZA 3VE1B 1MQIA 2R9JA 3KSXA 1B4ZA 3FIRA 4KYEA 5AA2D 2F7AA 1S7YA 1SYIA 3O97A 1AIVA 4FECA 3LSLA 4HCWA 3VLWA 4XTCQ 1JW5A 3IOVA 3MVWA 2DYXA 4R9FA 4I1DA 4EDPA 3KN7A 4DDDA 1TXFA 4TQUQ 5HM4B 3O6HA 1JETA 4IGRA 4DCXA 1Y3PA 3QUFA 4MFIA 3TELA 4C0RA 3VDFA 5BUUA 4NF5A 4QSDA 2ZNTA 1CB6A 4XIGQ 3PMVA 2R71A 1Y4CA 2DSFA 3IR1A 3B6TA 4TLLB 2ABHA 2I49A 3B6WA 3S9LC 3ILUB 4U4XA 3D4GA 4N07A 2QS4A 2F36A 1QVSA 2XXWA 2DOJA 4QFKA 1QKBA 4Q0CA 2V25A 4GRKA 1MH3A 4DXUA 1B6HA 3IAZA 4X9TA 4F1VA 5LOMA 3ZS6A 2QRYA 4RK2A 3G7WA 2A5SA 2THIA 4AB6A 4H65A 2NUVA 5H8NA 4GOTA 3K6VA 3FGSA 4P0GA 3BKIB 1M5DA 4ZZEA 1VFEA 1ATGA 4NF4A 2H25A 4KR5A 1D9YA 4NMYA 1TFDA 2PX1A 4GWOA 1LAXA 4X48A 3IK6B 2Y7IA 5H8FA 2OLBA 3PMXA 1N7WA 4LQ2A 4EF1A 1FW0A 3LR1A 4BDLA 4M4GA 4X1DA 3SEWA 2NWJA 2RC7A 1ZLQA 3MP1A 2Q89A 2ZYKA 4LUBA 3U1OA 2D3IA 5TPAB 1FTOA 1UTBB 3UA8A 3W15C 1MQGA 4H8JA 2O1MA 5I58A 4ELOA 1OQHA 2PVUA 3IORA 2OK2A 1Q35A 1F9BA 1M5CA 2F6PA 4F22A 1TWYA 3M3KA 5K2YA 2XD3A 1B3FA 4G68A 2F7CA 4U1ZA 1II5A 4IGTA 2OZZA 1USYE 4OENA 5KDTA 3T96B 4F1UA 2YJPA 1IXCA 3FJ7A 4G8NA 3UIFA 5FHOA 3TCHA 5HPQA 5ELVA 4YKKA 3V5AA 1H45A 1OVTA 4OEVA 1URSA 2PT1A 3MP6A 4LONB 2REGA 1SDXA 3VXCA 3T9VA 3H4ZA 2UYFA 3VVFA 5L9MA 1US5A 4OETA 4R75A 4NF6A 3JYRA 4F29A 4MLQA 1OQGA 1ZJLA 4G77A 3S2VA 3K1PA 1B3EA 3C34A 4U4SA 1MH4A 2ALUA 4M1VA 3FXQA 4H6DA 2QJEA 1IQ7A 1Y3QA 3CR9A 1N04A 2V84A 1PBPA 1MY0A 4OEUA 3OXNA 2XXVA 2QS2A 4EF2A 4ELQA 1D3KA 1XVYA 5CMKA 4IY5A 1MQHA 1VR5A 2VHAA 4MLVA 4YKJA 4YKPA 2W7YA 1B7HA 4JB7A 3MPKA 4N6PA 4XKNA 4H5FA 1URGA 1MDQA 3FZVA 5CBSA 2F97A 1SYHA 4EQBA 1XHYA 1JVXA 5CRYA 2HZLA 3PMWA 1ANFA 1LFHA 1UTHA 4F2QA 5H8QB 4QFPA 4U23A 4ZZAA 3K6XA 4FEBA 4QFLA 5JTYA 2Y7PA 3WAEA 1GGGA 1JW1A 1UQWA 2ONRA 3O6IA 4R9GA 1MY4A 1S9TA 5H8HA 1QW0A 1XT8A 2H9BA 4GQOA 4TOZA 3O28A 4R6HA 1US4A 4XKPA 1FQAA 2X26A 4ELPA 3TCGA 1A8FA 3MUQA 1MQJA 3B7DA 5CMMA 3K2DA 4QF9A 3M3LA 4WKMA 3S9NC 4RNSA 1MXUA 4ZEIA 5A5XB 3ILTB 4DXBA 5L9SA 1SQYA 3KGCA 1B05A 1MG1A 5F7VA 3G3KA 1LBCA 3WAFA 2OBGA 1GR2A 4BDRA 1LFGA 4P11A 2PMSA 1B1XA 4WEDA 4LVQA 2I0BA 5I2NB 4BDMA 4OFLA 3H6TA 1FTMA 1I6QA 1FQDA 3TTNA 2AL5A 2HXWA 1OVBA 2Z8EA 2P0SA 3K0VA 2I3WA 2O6AA 4EXLA 1IEJA 2P1SA 4MBPA 3SEVA 3QAXA 1SD3A 3LSFB 1HSEA 2Z23A 1NH8A 3W9VA 3TCFA 4EUOA 3C9HA 2I4CA 3A09A 4DZ1A 2B65A 5I57A 1SW1A 4OWDA 3DELB 3RGYA 1MPCA 3CG3A 1EH3A 2CZLA 4FE8A 1QUJA 2G93A 3QUJA 1SI1A 5HBCA 2H4IA 3HHFA 4JSDA 3UORA 3Q26A 4O3BA 3CRBA 2VD3A 1P1QA 2GHAA 4GFRA 5M2VA 3RLFE 3C33A 2ZXTA 3KZGA 3N5LA 2ZNSA 3VLUA 1LAFE 4G68C 3FASA 3HV1A 4JWOA 2FNCA 5DT6A 1L5TA 2O1LA 1N0TA 3OSRA 2XX9A 5IAIA 5F1QA 1UIVA 2F78A 3CSBA 2HZKA 3F11A 1B0HA 4GVOA 1B9JA 3TTRA 2XXIA 2I6EA 1D9VA 1H3DA 1NL5A 4NF5B 3RY3A 1P1WA 1AH5A 4X1BA 4F1YA 3FVGA 4ZEBA 2ZYOA 3S9MC 1XVXA 2V93A 4QFNA 3PGFA 4BDNA 3K1MA 4RK9A 4KYDA 4R72A 1ZU0A 4FATA 4LZ5A 1OIBA 3TTKA 3K02A 5TP9A 4FEDA 3RNNA 3RTWB 4QRZA 5J1DA 2ESNA 3MVZA 3EHSA 3S4UA 5H8NB 2GRVA 3IO6A 2HQ0A 3LUYA 3W9WA 4F3SA 3FD3A 4OTEA 3FVKA 1UIUA 3KJ7A 1P1OA 3TTMA 3CSGA 4ESXA 1B58A 4NF4B 4QHQA 4ND9A 3T9HB 1B0LA 2UVIA 3G3JA 3FVOA 1OLCA 1O64A 1QJMA 1WDNA 3EN3A 3SEUA 2X7QA 3DP6A 1O7TA 4GL8A 5ISUA 3TZAA 3HCQA 5H8FB 4IB2A 2UVJA 3C35A 1T0KA 2QS1A 3TQWA 4PFWA 1XS5A 3IOTA 3ZSFA 3GXAA 4H0WA 3RTFB 4PE5B 1BTJA 3RT6B 2DE4A 1WVJA 1LB8A 2F5XA 2QSXA 5DEXA 1LSTA 3PD8A 4E0WA 2WKYA 4DE8A 1KWHA 1XOCA 1BKAA 3O29A 2B3FA 4XKQA 5I58B 4F31B 3VV5A 3HPIA 4RPOA 1NNTA 1B46A 4JWXA 2RC8A 2Y7RA 4OESA 4GF8A 3H3GA 1VE4A 1PB8A 1Y3NA 2GH9A 3EHTA 4HCYA 4OQOA 4PFUA 4G68B 4KI0E 3IJOB 3B6QA 2F8DA 5KZTA 2AYSA 4OHNA 4QFOA 5I56A 1P1UA 3KFMA 4ZDMA 5EYFA 1M5BA 2VP1A 4NTLA 1VFDA 4IO6A 3HO7A 4KFQA 1LGBC 4JSOA 4F3BA 2YLNA 2O7UA 3DM0A 1MS7A 3MWBA 1PC3A 3IOUA 3T93B 3QSLA 4NF6B 1LAGE 2XXQA 4RJZA 2DWHA 3QXMA 4F3GA 2UVGA 4JXIA 4OZ9A 1SI0A 3V83A 3ECRA 4P0IA 1TT1A 3OENA 3M8UA 1A55A 5CBRA 2DE2A 1ZKBA 2OWSA 2O68A 3UGWA 2UXAA 1MY2A 3A3UA 1R1NA 2DS9A 3VLVA 3CG1A 4WEPA 3THIA 4GL0A 2QS3A 3Q29A 4F3PA 4HS7A 4LP2B 2AL4A 5L8DA 3RT8A 5AA4A 3N94A 4IO2A 2A5TA 2Q2AA 3KG2A 4C1UA 1MQDA 1MPBA 3RQTA 2QL3A 1OLAA 1UTHB 1USYH 3FV1A 4WXJA 3U72A 4I9DA 1Z7ME 5CC2A 1LLSA 1B5IA 1LAHE 4EXKA 5JTYB 5EHMA 1B32A 4RY1A 3H6UA 3KN8A 3H7MA 2RINA 5I59B 1A40A 1I69A 3OO8A 5H8HB 3RPWA 3K6WA 2CMOA 2F6GA 3CFZA 3OO6A 2R6GE 3FATA 4NF8A 2PBWA 1IXIA 1LFIA 2V3QA 3HN0A 3OO9A 3L6HA 5FHNA 5I84A 4ZEFA 4Z7EA 2HFBA 4YB6A 3IO4A 1P99A 1YTVA 3EPEA 2O7IA 1Y4TA 2DP8A 1A54A 3OD7A 3MAMA 2DXYA 4OMBA 4HW8A 3K1NA 1AL3A 4OYVA 2GHBA 3C32A 4R73A 2KLFA 1ZIUA 1TFAA 4GD5A 2VOZA 1MPDA 1MXVA 2Q8JA 2IA4A 5H8SA 3PPPA 3IJXB 1SVXB 2Q9TA 5AA2A 3MPLA 4NE4A 1YAEA 3MZ9A 4LQ5A 1SW5A 5FHMA 1JQFA 4ISUA 1M5EA 4H1XA 3OEKA 2NOOA 3MJNA 1MXYA 4U22A 5H8QA 4G2ZA 1H44A 4NEDA 3ZKLA 3I5OA 1Q1KA 3Q25A 4RA1A 4DXCA 1LBBA 4E0XA 3UP9A 4I62A 4I8CA 1VSOA 3RN8A 5ITOA 2Y7WA 3TODA 3SEXA 1QULA 1R9QA 2VGQA 5KCJA 3H6VA 4MH5A 1Y1ZA 2Y84A 3A3CA 3OOAA 1FTJA 3PUWE 4R6KA 3IB2A 3EF7A 2ONSA 2O69A 2XXHA 3TDJA 1XC1A 5CI5A 3O9PA 4F2OA 1JVYA 1YCJA 3N6TA 1BLFA 3MZ1A 4O3AA 2ZMBA 1DTZA 1SW2A 2IEEA 1R9LA 2V3TA 4NWCA 1B2HA 2Z22A 5FTIA 1DPEA 1B3HA 3QYTA 5CMCA 1R6ZA 1MM6A 2X7PA 4GIZA 1IIWA 4F19A 3H6WA 2HAUA 5CM6A 2REJA 3L6GA 4IO7A 1B52A 1DOTA 4L17A 3I3VA 3VXBA 1JEUA 1POY1 1GVCA 2NXOA 1POTA 2E1SA 3U8QA 5I2KA 4DLDA 2Q88A 4KCDA 3G3IA 3SETA 4JDFA 4RPNA 1RYOA 3VVDA 3H06B 4IO3A 1JEVA 4H5GA 2RCBA 1IITA 5EHSA 2DWIA 1LB9A 4Q5TA 5ICQA 3KSJA 3V89B 4OFJA 2UVHA 3PUYE 2I0CA 2AIXA 3KN3A 2F35A 4K3FA 1IXGA 3SEYA 1PEBA 3V8XB 1N7XA 4YAHX 3LC8A 3PUVE 3GBAA 4G4PA 3FV2A 1NNPA 3BBRA 1PDAA 1I6AA 3O66A 1CE2A 3VFJA 2HAVA 2RC9A 1A8EA 1B3LA 3PV0E 4ZE9A 1LCTA 2E0SA 5CMBA 3E3KA 1PB9A 5AA1A 4O3CA 3MZBA 3RUMA 1MRPA 1PB7A 3PPOA 4YICA 1YPNA 3IX1A 3OMBA 3SESA 1SBPA 4R6YA 4ESWA 4GXSB 2DXRA 5DEXB 4MF3A 3M3FA 3N6UA 3K01A 1FQBA 1GV8A 3R7XA 3OSQA 4DCYA 3R26A 3OELA 1ZBMA 1IUDA 5JK4A 1JW4A 1RYXA 4KPTA 2I48A 4ELRA 3MBPA 2F34A 4H8IA 1HSLA 4BLAA 3H03A 2QMWA 3TAJA 1O63A 1AOVA 5I56B 2XX8A 1N3XA 1ELJA 3LSXA 1DMBA 3KJTA 1P1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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