4N6PA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meclofenamic acid at 1.4 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structre of C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH MECLOFENAMIC ACID AT 1.4 A RESOLUTION
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA02
3MPLA 3IOWA 1MXYA 5KCJB 1NMUA 4GFRA 2X7QA 1R9LA 4PP0A 3OELA 1ZKBA 2Y7RA 1OQGA 3MW0A 3UA8A 4H8IA 3VDFA 4G4PA 3RT6B 4QSDA 4P0IA 3CIJA 1GTKA 3O29A 1M5DA 5HBCA 2DQVA 3PUYE 3E4RA 4OYVA 1T0KA 4QHQA 4DXBA 1B32A 5CMBA 1LCTA 4IGTA 5H8QB 4G8HA 4HS7A 3LR1A 3TAJA 1OLAA 1NNFA 1CE2A 1N76A 4H6DA 1VSOA 1MY1A 4NWCA 1B4ZA 1JVXA 2DS9A 5H8FA 4ND9A 2O1MA 3KN8A 1PB9A 3IB0A 1NNPA 2DWIA 1QJMA 4JSOA 4HW8A 1I6AA 1SI1A 3U8QA 5B7DA 2H5YA 1XS5A 3K02A 2ZNTA 3Q27A 3BKIB 3IOTA 2QS3A 1ATGA 3IB1A 1PC3A 1LB8A 1S7YA 3RTWB 5L9SA 1Q1KA 3N26A 3UORA 2VOZA 2ONRA 4WEPA 4DCXA 2HZLA 4NE4A 3H06B 4PQJA 2NVUB 2V25A 2ZMBA 4IO3A 2DXYA 4BDOA 4BLAA 1A8EA 3D4GA 4YKPA 2HCAA 1Y1MA 3G7WA 4JDFA 3MP1A 1S9TA 1MDP1 1R6ZA 3MVYA 4TLLB 4RK2A 5I57B 4QSCA 4WKMA 3W9WA 4Q30B 5H8FB 4GQOA 3O9PA 4RYAA 4U1ZA 1FQDA 4HCYA 3G3FA 4LVQA 5DYHA 3S9LC 2XXHA 2V3QA 1RYXA 1LFGA 3E9XA 4ESWA 2I4BA 4EQ7A 5ITOA 1URDA 2RCBA 3N6UA 1UTHA 3H4ZA 1CB6A 5HPQA 1A8FA 2OBGA 3PUZE 3H3GA 4PETA 1B6HA 4HTGA 1O7TA 4R75A 2XXRA 4OXVA 4ZECA 2R71A 1ZLQA 3N94A 1GGGA 3CR9A 3K01A 3RPWA 1R1NA 3SEVA 1P1UA 2F6PA 5JTYA 4R6KA 2QS4A 3MPKA 4KFQA 4GRKA 4OFOA 3V5AA 2FA7A 2REJA 1PDAA 2REGA 3BFTA 2LAOA 4NF4A 1J1NA 4R6HA 3ZS6A 4KI0E 4C1UA 4GXAA 4BDNA 3F11A 2H25A 3A09A 4R72A 4I8CA 1MQHA 1TXFA 1MXWA 1DSNA 2XXIA 3HHFA 3FASA 4F2OA 1IQ7A 3IR1A 2XX7A 1WDNA 2NWJA 3I6VA 1OLCA 2THIA 3H6VA 2PYYA 4GLIA 2DYXA 1JW1A 2DVZA 5KDTA 2UVJA 3LC8A 4FEBA 1AH5A 2PVUA 4G8MA 4IY6A 3TFLA 5L9OA 2PX1A 3KSXA 3G3GA 4FATA 3O97A 5DVFA 3K00A 5BWJA 3EHSA 3ONMA 2FNCA 1B7UA 1TFAA 1MDQA 4IO2A 5TP9B 4NF6A 3EF7A 1NNTA 4EQ9A 3HSTA 1XC1A 1IUDA 2NXOA 3EN3A 1IIWA 3IOUA 5KDTB 1ZMGA 4MLVA 5I58B 3OXNA 4ZZAA 2VP1A 3S2VA 3C36A 3G3JA 3N6TA 4LZ5A 2QPQA 1H44A 2XXTA 4ECFA 1P1NA 4U4SA 2DE2A 2ZXTA 5I2NA 1RYOA 1Y3NA 2Q2AA 3PMXA 4LP2B 2B3BA 2I58A 3SEUA 5AA3A 2PMSA 4U21A 1SQYA 4JBZA 5H8NA 3S9EA 1OMPA 2F35A 3V8XB 1QW0A 2G93A 3MBPA 3VLUA 1FTMA 3JV9A 3H6TA 2UVIA 4JB7A 4YU0A 3TQWA 3IO4A 5I84A 1WODA 3QSLA 4KD5A 1MM7A 1N04A 1Y1ZA 2P0SA 4ZS9A 4LZ8A 2F34A 4Z0IA 4Q5TA 2DE3A 3DM0A 1B46A 1HSEA 1OQHA 3C9HA 3DP6A 1SW2A 1SBPA 4FIMA 2X7PA 4DZ1A 2XD2A 3L6HA 4P11A 4MLQA 2X26A 4OQOA 3SEXA 2Y7KA 4YICA 3I3VA 2F5XA 1D3KA 3SDFA 2O69A 4I62A 2HXWA 3EPEA 2XXVA 1JETA 2Q88A 3TMGA 3EHTA 3GBAA 1M5EA 3HCQA 1PBQA 3FJGA 4EXLA 4ELOA 3N5LA 1P1WA 4MH5A 2XX9A 3EQ1A 1H3DA 3RN8A 3MP8A 5H8QA 4H5GA 3THIA 1JW5A 3IO6A 1UIVA 2F78A 5CBRA 1AIVA 1PB7A 2OCUA 2D21A 5EYFA 3S4UA 1B0HA 1US5A 4FEDA 3KOTA 3H6WA 2Y7PA 4G68A 3VVEA 2DWHA 3FV2A 1SYIA 4H1XA 2NUVA 4QFLA 3T22A 3KBRA 1B1HA 1LCFA 4MBPA 1QKAA 3QK6A 5ICQA 2AYSA 3E3KA 2ALUA 4H8JA 4ZEDA 1MQGA 1NKXA 3T9HB 3UN6A 2XHDA 4IGRA 1LGBC 3UIFA 1O63A 1MRPA 1JVYA 2I48A 1M5BA 4QSEA 1Q35A 1SD3A 4GWOA 3FATA 4G2ZA 3Q26A 3FVOA 2V3TA 1XHYA 2VHAA 1JEUA 3C33A 1Y3QA 2RC8A 3GBBA 1I6QA 4OVJA 1MPCA 4C0RA 4F3SA 3I5OA 1B7ZA 3FJ7A 4F3BA 4R2FA 1BIYA 3G3IA 3VFJA 3C31A 2QJEA 5I57A 1NFTA 1OVBA 1QKBA 3BBRA 1GR2A 3CG3A 3KG2A 4G68B 1EZ9A 3TDJA 2IA4A 1MPDA 2XXWA 2H9BA 2KLFA 4UA8A 3OOAA 4R6YA 3QUJA 1II5A 1B1XA 1MG1A 1NNKA 4IO4A 3LSFB 4DIGA 4R9GA 4F1VA 3ILTB 4LUBA 3VLVA 1M5CA 1B3FA 1RKMA 3S9MC 3H6UA 4RY1A 3FGSA 2DXRA 3CFXA 3O6GA 3V89B 1IXCA 2R6GE 4RK9A 1MY2A 1S50A 1Y20A 4GD5A 2HAUA 4OWDA 4TQUQ 4NF5A 1SDXA 5AA4A 3M8UA 3M3FA 2XX8A 5AA1A 4N6PA 2HEUA 4IB2A 2DE4A 5HM4B 1N84A 1B0LA 1MXVA 2F97A 2ONSA 3O6HA 3CSBA 3A3CA 3IORA 2ANJA 4QFNA 4YKJA 4C1TA 1UIUA 5L9MA 4DCYA 1A7LA 1ZJLA 3IL1B 3IK6B 2OZZA 1DTGA 4KCDA 2ZYNA 1POTA 3M3KA 3FVNA 2Q8JA 4F22A 2HAVA 3MUQA 3MZ9A 5DEXB 3R7XA 2M8CA 2H4IA 1LAXA 4EF2A 4OMBA 2RINA 3CG1A 5FHNA 3O6IA 3SEWA 3U94A 1Y9UA 1Y4TA 4YB5A 4U23A 4OTEA 1B7HA 4NF5B 3FV1A 5FHMA 5AA4B 3OSRA 1PEBA 3DLNA 3KJ7A 2Z22A 1SYHA 3O28A 4RXLA 3B6WA 4NF8B 3IJOB 3TUSA 5FHOA 1R9QA 1N3WA 4G8NA 3OO7A 1FTKA 3TQLA 2Z8EA 3SERA 1N3XA 1D9YA 3QYTA 3SETA 3TCFA 3PMWA 1WVJA 2DSFA 3OD7A 5CC2A 2XXYA 1IXGA 4IO5A 2XXXA 3HPIA 2H99A 4POXA 4ELPA 3OO6A 3T9XB 3PPQA 1LBCA 2D3IA 4JWYA 5TP9A 4O3AA 4ZEFA 3PPPA 5AA2B 3U93A 5KZTA 3RNNA 4ZZEA 4EXKA 3PMVA 1DPEA 4XTCQ 1BKAA 1SI0A 3K4UA 2I49A 5I56B 3RGYA 4ZDMA 3VV5A 4F3GA 5I58A 4BDLA 1MXXA 2O1LA 3PUVE 3TYHA 4PFYA 4Q0CA 3OENA 3FXQA 4IO6A 5H8HA 4EUOA 1FCKA 3TTKA 4PFWA 3IB2A 1D9VA 3PUXE 5AA2D 2QS1A 1P1QA 1YPNA 2V93A 4DXUA 2VD2A 1VE4A 4QFPA 3B6TA 3FIRA 4X1BA 3KSJA 3UP9A 1B3EA 3TKDA 1SW5A 4E0XA 4ZE9A 1YTVA 1MY3A 2A5TB 4BDQA 2QS2A 4PFUA 1SW4A 2RC7A 4OENA 4XKQA 4LQ2A 4KCCA 4RNSA 1EZPA 2XXUA 4FECA 1H76A 2RKMA 3EHUA 1LLSA 2ZYOA 1FW0A 3DP4A 1DMBA 4G68C 3VE1B 5F7VA 3UGWA 1FQCA 4P0GA 5I2KB 3FXUA 1H43A 1DPPA 3OSQA 3K6WA 5H8HB 1VFDA 4NTLA 3TEPA 5CBSA 4GF8A 1B52A 1Z7ME 4F1UA 3MP6A 2OK2A 1MQIA 3TTNA 1QUJA 1Y3PA 1N0TA 1YAEA 4RJZA 1A55A 2O7UA 1B9JA 3RLFE 3MQ9A 1O64A 1GV8A 3R6UA 5BUUA 4IY5A 1FQBA 1DOTA 3WAFA 4XKNA 4ZEBA 3AXFA 2UVHA 1B40A 1MH3A 4FE8A 2PT2A 3RY3A 1OVTA 1TT1A 2F7AA 2GHBA 1AMFA 4GL8A 4N13A 5JK4A 5I59B 5B70A 1OIBA 4ZEKA 5IAIA 2UYEA 3K1MA 5M2VA 3O66A 4ONYA 3A3UA 5DT6A 3Q28A 3VXBA 4FAJA 3T9UA 1MPBA 4JWXA 3KFMA 1FTLA 1IXHA 5EHMA 2ZYMA 1QUKA 1F9BA 1NL5A 4WEDA 1LBBA 3KJTA 1PB8A 3FJMA 5CM6A 2GFEA 4JSDA 4OETA 4X48A 2OWTA 3UK4A 4YMBA 4RPOA 1B5HA 4GXSB 2D5WA 4BDMA 1US4A 2PBWA 5CMKA 1LAHE 2B3FA 4OEUA 2I6EA 2HQ0A 1LSTA 3VLWA 2XXQA 4EDPA 5FTHA 2UXAA 3DP8A 4F2QA 2O7IA 1MY0A 4X1DA 3FUZA 3LUYA 3L6GA 4K3FA 3FZVA 2I3VA 5DTBA 4Z7EA 4Q8RA 3R26A 2VD3A 3MZBA 3D4CA 1TWYA 1D4NA 3PGFA 3IOVA 4THIA 3JYRA 2DWJA 2F8DA 3HHGA 1LB9A 1XVYA 3GLBA 4DLDA 1ELJA 1MS7A 3T9VA 1EZOA 3ODBA 4GVOA 3OO9A 5H8SA 3K0VA 4HCWA 1B51A 3SESA 2AIXA 1I69A 4F1YA 4M1VA 4NWDA 5ELVA 3PPNA 4E0WA 5LOMA 3QIMA 3TZAA 4R2BA 3LSXA 3SEYA 1ZU0A 1IEJA 2Z8FA 2YJPA 2QL3A 1ANFA 1UTBB 1M5FA 2ABHA 2O6AA 4DDDA 4LA9A 3Q25A 3ZKLA 4R74A 4R9FA 2B65A 4R73A 4OFLA 5IKBA 3S9NC 3TODA 3TCGA 4MF3A 4F39A 4YZZA 5TPAB 1ZBMA 1VR5A 4KYDA 3K2DA 3MVZA 2Y7WA 3RT8A 4BDRA 4POWA 3MC2A 4NEDA 2AL5A 3V83A 3VVFA 5CRYA 2HFBA 4QRZA 4OHNA 3MVXA 1HSLA 2QRYA 2YLNA 1B05A 3KEIA 2F7BA 4EQBA 5TU0A 4H0WA 5DEXA 3H7MA 3JZJA 4LATA 1FQAA 3HV1A 1MM6A 4KYEA 1URSA 3CVGA 1B58A 3CI8A 3KN3A 3U1OA 3DELB 3C4MA 3IX1A 5CMCA 1P1OA 3KOSA 4YAHX 4YMAA 4NF8A 1QUIA 1NH7A 1B3GA 4KR5A 3IAZA 2PT1A 1FTOA 4U1OA 4U4XA 1XT8A 1MH4A 4LZ7A 4EF1A 1EH3A 2OJTA 4KPTA 2UVGA 2FYIA 2BJJX 4F18A 2Q89A 1GVCA 3RUMA 3VXCA 2I0CA 3FVKA 2G29A 2ESNA 3OMBA 3T96B 4ELQA 5ISUA 1MXZA 2XD3A 3OO8A 3C32A 3HO7A 3MAMA 5AA2A 4I1DA 4XIGQ 2QMXA 3MJNA 3MWBA 1QULA 3PU5A 4F29A 3E13X 4ISUA 3W9VA 2ZNUA 3QAXA 3LSLA 5I56A 1N7WA 2WKYA 1JEVA 3VVDA 3G3HA 1L5TA 1DTZA 3TCHA 2V84A 3MZ1A 3TPAA 4O3BA 2YPNA 4AB5A 1PBPA 1Y4CA 5AE4A 3TTMA 1YCJA 1BTJA 3PUWE 5EHSA 3CFZA 4FJPA 2CMOA 2AL4A 1UQWA 4YKIA 1TFDA 3GXAA 4H65A 2I3WA 3U72A 4N07A 3H03A 2F6GA 1JQFA 3KN7A 1VFEA 4YB6A 3ZSFA 2A5TA 4ELRA 4OEVA 4U2RA 4O3CA 2DVCA 3HN0A 4KYSA 1B2HA 4OESA 3ILUB 2H98A 1UTHB 4LONB 2P2AA 4RPNA 2F36A 4KQPA 3K6XA 2R9JA 2DWAA 4GIZA 5I2KA 3SKPA 2XXPA 4X9TA 1IZ1A 2QSXA 1A40A 1LAFE 1AOVA 3K1PA 2I0BA 5K2YA 3U92A 5JTYB 1B4HA 4GL0A 1ZTYA 4WXJA 3QXMA 4LQ5A 5FTIA 4F19A 2O51A 2RC9A 1B5JA 2W7YA 4NF4B 3RQTA 2O84X 4RA1A 1A99A 4M4GA 1B5IA 3T93B 4XXUA 5I59A 5F1QA 4QFOA 3P7IA 2QMWA 3C35A 4MFIA 5A5XA 2HZKA 1P99A 2P1SA 1HSJA 1LFHA 2Z8DA 3FXRA 1EU8A 4XKPA 3C34A 3RTFB 5L8DA 1A54A 3TTRA 1USYE 3USDA 1USYH 3FVGA 1AL3A 2Y7IA 1H45A 3CSGA 3W15C 2ONKE 1XOCA 2UYFA 3PPOA 1B3HA 2Y84A 4JWOA 3ECRA 4OZ9A 1LFIA 5DVIA 4AQ4A 4DE8A 1Z7NE 3G3KA 2I4CA 4DXCA 3TELA 2GRVA 4H5FA 1B3LA 5J1DA 1IXIA 2V3UA 2RF1A 4I9DA 2GHAA 1JNFA 4UACA 2GH9A 3K1NA 4QF9A 4FORA 2OWSA 2NOOA 1N7XA 4PFTA 2DOJA 1BLFA 5A5XB 2Q9TA 5ITPA 2IEEA 5CMMA 4GOTA 1NH8A 4NF6B 3CFLA 1I6BA 3GZGA 2O68A 1SVXB 3Q29A 1MY4A 2DP8A 1URGA 2Q2CA 1POY1 4JXIA 5ICTA 3M3LA 4OERA 4ZEIA 4G77A 5K2XA 2ZYKA 3KZGA 4TLMB 3BFUA 3FD3A 3LSWA 3KGCA 1KWHA 4PE5B 4KHZE 5I2NB 1LAGE 5KCJA 4H67A 2VGQA 4ZE8A 3PPRA 4ESXA 1QVSA 3O2AA 1UTBA 3LBSA 1FQFA 1MQDA 4IO7A 2OLBA 3WAEA 3MVWA 4L17A 5H8NB 1FQEA 4YKKA 3K6UA 4NMYA 2E1SA 2CZLA 3B6QA 3CRBA 2F7CA 3PD8A 4F3PA 3T66A 4YB7A 1MQJA 3ZKKA 1SW1A 5DVJA 4U22A 2RCAA 4AB6A 2A5SA 3PD9A 1BP5A 1XVXA 1IITA 4F31B 5TPAA 3QUFA 3B7DA 2ZNSA 3TTLA 1FTJA 2E0SA 3OEKA 1JW4A 5CI5A 2Z23A 4TOZA 1ZIUA 4XKRA 3PV0E 3IJXB 3K6VA 4OFJA 4QFKA 3OEMA 5JEIA 1MXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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