4N6PA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meclofenamic acid at 1.4 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structre of C-LOBE OF BOVINE LACTOFERRIN COMPLEXED WITH MECLOFENAMIC ACID AT 1.4 A RESOLUTION
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2013-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4n6pA02
2RC7A 1BLFA 1B3HA 1IXCA 4KI0E 4YKPA 5FHMA 3PUYE 4N13A 3OEKA 2DYXA 3M3FA 1OVTA 5I56A 3TZAA 1B5IA 3U1OA 5J1DA 3PPNA 3DELB 3MUQA 3HHFA 1LAFE 3IO4A 1QKAA 4ELOA 4QSCA 3LUYA 2ALUA 4HCYA 2I48A 4H5GA 1PBPA 2ESNA 3FVGA 1Q1KA 3MP1A 3TQLA 2XHDA 2QS3A 2NXOA 2GH9A 4XKRA 1XT8A 4OQOA 5ICTA 3U72A 2A5SA 3WAFA 2D5WA 3KJ7A 4X1BA 3FJ7A 2DE3A 3K00A 2VD2A 2B3BA 3LBSA 3L6GA 3PUXE 4DE8A 3CI8A 4F1VA 1XC1A 3LC8A 2QSXA 5H8QB 3FZVA 2D21A 2F7AA 1MXVA 2H4IA 4G8MA 2DWAA 1URDA 1YTVA 4OEUA 3CVGA 1VSOA 1Y3NA 3IB1A 4O3CA 2F6PA 3GXAA 4BDMA 4MLQA 1P1QA 3JZJA 2F97A 4PP0A 5K2YA 1OIBA 1B5HA 1B6HA 4ZZAA 1MQDA 1DPPA 2ZNSA 4DCYA 4ZECA 3V8XB 1LCFA 4PFWA 4DXUA 2X7QA 1AMFA 3C34A 3KFMA 3K1PA 4FAJA 1PB8A 4OESA 4H1XA 3EHSA 4NF6A 3VLVA 1PB7A 2V93A 4ZEBA 2ZYKA 3IAZA 4GRKA 1T0KA 4XKPA 3RY3A 3U92A 2OBGA 4O3BA 4F3SA 2F5XA 3D4CA 4NMYA 1BIYA 3UN6A 3PPRA 2I3VA 4ZEKA 1II5A 2DS9A 4OEVA 4YB5A 1L5TA 4RK2A 4IB2A 2XXXA 2QPQA 2Q88A 4QF9A 4POWA 3FXUA 1B0LA 4OZ9A 4HTGA 4KHZE 4K3FA 5DEXA 2I58A 3CRBA 3IB2A 4WXJA 1B9JA 4YB6A 5AA2D 1ZJLA 3HO7A 4P11A 2H9BA 1AIVA 3OO6A 4LZ7A 3ONMA 3DM0A 1OVBA 4PFYA 4GL8A 1B7ZA 1FQDA 1NFTA 2O69A 4R73A 3MVZA 3K02A 3Q27A 1QJMA 3IR1A 1POTA 4G68A 3GZGA 1OLCA 1N0TA 1B3FA 2OJTA 3PGFA 3E4RA 2O84X 3IL1B 3HSTA 3GBBA 4HS7A 4ISUA 3CFXA 4EQ7A 3EPEA 4I9DA 2ONRA 4F3PA 4GFRA 3IO6A 2Y7RA 3FXRA 1MQIA 1DSNA 4ELRA 1H76A 3A09A 4PQJA 1SBPA 5EHSA 5BWJA 4M1VA 1MY2A 1QW0A 3MVYA 4EXKA 3KZGA 1MDP1 2V3QA 5KDTA 3MAMA 4LUBA 2H99A 3H6TA 4GF8A 5DTBA 1HSJA 3HV1A 2FYIA 4F1YA 2PBWA 3IJOB 4C1TA 1Y3QA 1PBQA 3R6UA 1SW2A 2DQVA 3MZ1A 3EHUA 3OSQA 3PMWA 2V3TA 3RQTA 4KYEA 4H0WA 1IIWA 1MRPA 4OFLA 4QFPA 1M5EA 2F35A 5TU0A 1A8EA 2XX9A 5KDTB 3TMGA 3TYHA 2F78A 1ZIUA 3RTFB 3RT8A 3S2VA 1NNKA 4N07A 4EDPA 4P0GA 1A55A 4FEDA 3T9XB 3TCHA 4FEBA 2NWJA 3M3KA 3LSLA 1B4ZA 3S9LC 4OXVA 3RNNA 5ICQA 1M5CA 4EQBA 5B7DA 3N26A 1IZ1A 3PPQA 3RGYA 2Z8DA 1S50A 4L17A 1FTJA 1OMPA 3K6WA 3N5LA 1PEBA 1XHYA 4ND9A 1HSEA 1MY4A 4Q5TA 5HM4B 1PC3A 2D3IA 3KN8A 1Y4TA 1EZOA 4F19A 4KR5A 5JK4A 3CG1A 3PD8A 2V84A 2XXIA 1S9TA 1A99A 3OMBA 4HW8A 2ONKE 3OO8A 5DVJA 3LR1A 1D3KA 3MZBA 3ECRA 3FD3A 3E13X 1R1NA 2YPNA 1B1HA 2Y7WA 2DE4A 3S9NC 4WEDA 2REJA 2Y7IA 1NKXA 2HQ0A 1O7TA 5CM6A 1JW4A 5L9OA 3UIFA 4WEPA 4I1DA 4H67A 1LGBC 1O63A 4G8HA 2Z23A 2UVJA 2ABHA 3MVXA 4MLVA 4ESXA 3BKIB 2X7PA 5H8HA 5AA1A 1IXHA 3JYRA 4O3AA 4R6HA 2H25A 4RA1A 5I84A 1JVYA 2CMOA 5AA3A 3HN0A 3RN8A 3TAJA 1O64A 4ZZEA 1LAGE 3ILUB 3TFLA 5I57A 2REGA 3IORA 3TCGA 2ZXTA 1URGA 1MQHA 3MPLA 4MF3A 4R6YA 3MP6A 1TWYA 2GHBA 4G4PA 1OQHA 3OENA 2XXYA 1Y1ZA 2I6EA 1B2HA 2YJPA 4ZEDA 2OWSA 3RLFE 4F22A 3TELA 1US4A 4PFUA 4ONYA 1FQAA 5EHMA 1DOTA 3SEWA 3RTWB 1VFEA 1I6QA 3MJNA 5CMMA 1TFDA 5FHNA 4F39A 3O66A 2E1SA 1QKBA 2AL4A 4R75A 4X1DA 3CSBA 2A5TA 1B7UA 5FHOA 1NNTA 1LCTA 3B7DA 4JWXA 1IXIA 1LBCA 5CMCA 1MY3A 4JWYA 4F3BA 2PYYA 3TCFA 1MXXA 4GQOA 4FE8A 2VHAA 3FASA 3FIRA 4QFKA 4H8IA 3TPAA 1UIVA 3CG3A 3BFTA 1WDNA 4RXLA 4Q8RA 1S7YA 1QUIA 5I56B 3OXNA 3B6TA 2IA4A 4F29A 4QRZA 4N6PA 2F7CA 4U23A 1KWHA 1LLSA 1VFDA 3A3CA 4EQ9A 4Z0IA 5M2VA 3O9PA 3OD7A 1MPDA 3W9VA 2O68A 1BTJA 5F7VA 3N6UA 3CIJA 4JWOA 2QS4A 3H6UA 5AA4A 3CFLA 4IO3A 4GXAA 4POXA 4IY6A 1B4HA 5DVIA 1P1WA 3C35A 1AH5A 2QJEA 3OSRA 4G68C 2Q8JA 3QUJA 4IY5A 1ELJA 2AL5A 5CBSA 2ANJA 2RINA 4E0WA 4DXCA 1LFIA 3K1NA 3PD9A 3VLWA 4Q0CA 1B46A 2F8DA 3PMXA 4IO6A 3SEVA 1LBBA 4M4GA 1TXFA 4OENA 1XS5A 3ILTB 1US5A 3U8QA 3VVEA 3IX1A 3KJTA 3FV1A 3TQWA 4TLLB 4IGTA 3H3GA 2HZLA 3UORA 3UP9A 2QMWA 2HEUA 3T93B 3HHGA 5H8SA 1FQBA 1D9YA 1GTKA 2DVCA 4RYAA 4TLMB 3K01A 5ITOA 3F11A 3VXCA 1NH8A 3FJGA 4OERA 1H45A 3UA8A 2O7IA 4OFOA 3MBPA 3H4ZA 2UVGA 2GHAA 2AYSA 2P1SA 3W9WA 4F1UA 2DP8A 3E9XA 5CMBA 4YAHX 3T96B 2DXRA 1SQYA 1QUJA 2PX1A 4BDNA 4GL0A 4BDRA 4JSOA 2X26A 2I49A 4GWOA 4F2OA 4WKMA 4NF6B 4RY1A 4OFJA 4TOZA 5TP9A 2H5YA 2Y7KA 2PVUA 4JDFA 5I59A 4GVOA 1P1OA 3O2AA 3QAXA 4BLAA 4XIGQ 5TPAA 1FQCA 3GBAA 3IOVA 1LB8A 1JETA 2DOJA 4UA8A 2Q89A 1DTGA 3WAEA 2R9JA 3MPKA 2Y84A 1UTHA 1SW5A 3OO9A 2OZZA 4KD5A 4JXIA 2GFEA 5AE4A 2I0CA 1QULA 2PMSA 1B40A 5DEXB 4IO7A 3KOSA 3DP8A 4OVJA 1MM6A 3C9HA 1UTBA 4R2BA 2XX8A 1BP5A 3CFZA 2M8CA 3RUMA 1ZU0A 2I4CA 4DLDA 3PUWE 2XXUA 5A5XA 2QMXA 4LZ8A 3TKDA 1FTKA 4YKJA 1B52A 3T66A 4XKQA 4YMBA 4H5FA 1TT1A 1MQJA 2DSFA 2QS1A 1GR2A 4TQUQ 3H7MA 4RPNA 4G68B 3KSXA 5JEIA 3UK4A 4ZEIA 2P2AA 2Q2CA 2Q9TA 4AB5A 3UGWA 3VE1B 2OK2A 2QS2A 5ELVA 3RT6B 1UTBB 3I5OA 3MC2A 4ESWA 4OETA 4ZEFA 4FIMA 1ZMGA 1XVYA 5EYFA 2CZLA 3KBRA 1A7LA 1CB6A 1YCJA 3PUZE 1MS7A 5FTHA 1H3DA 1CE2A 4NF4A 3EQ1A 2VOZA 4OHNA 1M5FA 3DP4A 3L6HA 5CI5A 3CR9A 2UVHA 4U22A 2V3UA 4F2QA 2HCAA 5I2KA 1EZ9A 3OEMA 5L8DA 5CBRA 3O29A 3A3UA 1I69A 3K2DA 4IO2A 3U93A 1MY0A 3U94A 1MDQA 4GIZA 1OQGA 3KEIA 1N7XA 4DXBA 3EF7A 3O28A 3EHTA 4KCCA 1Y4CA 1N04A 1ZLQA 4BDLA 3FATA 3H6WA 1A54A 4OWDA 1POY1 3K0VA 1IUDA 4XXUA 4QFLA 1NNPA 2UXAA 2Z22A 4QFNA 4DZ1A 3GLBA 5B70A 1LFHA 4U4XA 2DXYA 3K1MA 1M5DA 1USYE 3IK6B 1LAHE 4RNSA 4U1ZA 1DMBA 3O97A 4YB7A 2F6GA 1RKMA 4DCXA 1IXGA 3Q28A 4KCDA 1B0HA 1N7WA 4ZDMA 4NWCA 4P0IA 2PT2A 3TTRA 4U1OA 1R9LA 3T9VA 4LP2B 1N3XA 2YLNA 4YZZA 3KN3A 1LFGA 3Q25A 3SESA 1B05A 1I6BA 2FA7A 1LSTA 2XXPA 3ZKLA 3FVKA 3HPIA 1GVCA 2KLFA 1B3EA 3C31A 3SKPA 3G3HA 3VVDA 1Y9UA 3M8UA 1B7HA 4R9GA 3TTMA 3N94A 5JTYA 4BDQA 2ZNTA 2LAOA 5KCJA 4HCWA 1MM7A 1P1NA 2PT1A 1PB9A 3MP8A 4IO5A 3G7WA 1B3GA 1MPBA 2Z8EA 4KFQA 1H44A 2NUVA 1RYOA 1PDAA 1GGGA 1JVXA 1SW4A 2P0SA 1N84A 2ZYNA 5H8HB 4I62A 1YAEA 3KSJA 5H8NA 4MBPA 1AOVA 2HFBA 4XKNA 4RK9A 1SI0A 4MH5A 1JEUA 4NTLA 1MG1A 2I0BA 3EN3A 2F34A 3USDA 3SETA 4LZ5A 3Q26A 2DVZA 3H03A 1MH4A 3LSFB 2NVUB 3RPWA 5I57B 3K6UA 2ONSA 4EUOA 1Q35A 3MWBA 1B58A 3ODBA 4UACA 4X48A 2RCBA 5H8NB 1B3LA 2R6GE 1MPCA 1P1UA 3TEPA 4NF5A 4FORA 5LOMA 2VD3A 2QL3A 1FTMA 2G29A 3CSGA 4KYSA 3SERA 1R6ZA 3KGCA 2GRVA 5AA2A 1WODA 2R71A 4RPOA 3FJMA 1GV8A 3MW0A 2A5TB 5H8QA 1XVXA 1B5JA 2THIA 4PE5B 1Z7NE 3PU5A 4PFTA 1M5BA 4NF5B 2XD2A 4R74A 1N3WA 3VFJA 3PV0E 2XXQA 1SD3A 2O1MA 3R26A 3FVOA 4ECFA 4GXSB 4YICA 3C36A 5AA2B 1UQWA 1J1NA 1NMUA 1URSA 3C33A 3I6VA 3TTKA 3FVNA 3MQ9A 1MY1A 3QUFA 1Y20A 1A40A 3PUVE 4KPTA 3FV2A 1D4NA 5AA4B 2O6AA 4X9TA 1LAXA 4Q30B 3QK6A 1MXYA 5H8FA 3LSWA 4QFOA 5IAIA 4ELQA 2E0SA 1MXZA 3IOWA 1SVXB 1FTLA 1H43A 1LB9A 3ZS6A 4QHQA 5DVFA 1FCKA 3MVWA 2WKYA 4LATA 3QYTA 5CRYA 1MXUA 5BUUA 2AIXA 2O7UA 5I58A 4OTEA 2IEEA 5H8FB 4R72A 4I8CA 3MZ9A 1Y3PA 3G3GA 4ZS9A 2B65A 1DPEA 3QXMA 4H8JA 3PMVA 2RCAA 1A8FA 2XXVA 5IKBA 5FTIA 3S9EA 1SYHA 3B6WA 3E3KA 5HBCA 5K2XA 2I3WA 3O6GA 4GOTA 2OWTA 2RC8A 4DDDA 3VXBA 4IO4A 4JSDA 1JW5A 1NH7A 1IQ7A 3O6IA 1FTOA 5I58B 4LQ2A 3T9HB 4G77A 3KOTA 4BDOA 2XXHA 1VR5A 1ZTYA 4QSEA 3VLUA 1HSLA 3AXFA 3M3LA 2Y7PA 2DWJA 4Z7EA 4JB7A 5TP9B 1ZKBA 3R7XA 1FQEA 3K6XA 2VP1A 5I59B 1QUKA 4QSDA 4U2RA 5CMKA 5TPAB 1P99A 3SEXA 2Q2AA 3VV5A 4AB6A 1AL3A 2ZYMA 1EH3A 3FXQA 2W7YA 2DWIA 1ANFA 1VE4A 1MH3A 1UTHB 3G3FA 1Z7ME 3P7IA 4LVQA 5CC2A 1FQFA 4NEDA 3ZKKA 2RKMA 4C0RA 4C1UA 1F9BA 3SEYA 2DWHA 3TDJA 3FGSA 4NWDA 3C32A 5A5XB 2UYEA 3V5AA 1JQFA 2RF1A 1JNFA 2HZKA 3G3JA 5DT6A 3HCQA 1B1XA 4JBZA 1MXWA 4NE4A 1BKAA 5F1QA 3B6QA 2V25A 1R9QA 2BJJX 4G8NA 3LSXA 1JEVA 2NOOA 3G3KA 3T9UA 2O1LA 2F36A 3C4MA 4EF2A 2XXRA 1SYIA 1SW1A 3IB0A 1NNFA 3O6HA 5L9SA 3D4GA 4AQ4A 2ZYOA 4RJZA 4R2FA 1FW0A 4U4SA 1WVJA 4EF1A 2ZNUA 2OCUA 5I2NA 4IGRA 4OMBA 3TODA 4FJPA 3W15C 4NF4B 1I6AA 1YPNA 4KQPA 4GLIA 2G93A 3H6VA 1D9VA 2B3FA 5DYHA 2I4BA 3IJXB 3TTNA 4YMAA 2UVIA 3S9MC 3VDFA 3K6VA 4ELPA 1XOCA 2F7BA 1OLAA 5ITPA 4YKKA 5I2KB 2XXWA 3TTLA 3OOAA 4FECA 3FUZA 4F3GA 1NL5A 3V83A 5I2NB 4YU0A 2FNCA 3T22A 4PETA 2XD3A 3N6TA 4LONB 3QSLA 1RYXA 4FATA 5L9MA 4NF8A 4ZE9A 2HAUA 2Z8FA 3KG2A 4XTCQ 3VVFA 3IOTA 2O51A 1B32A 4G2ZA 3ZSFA 1IITA 1QVSA 3TUSA 3BFUA 4H65A 4THIA 1EU8A 3PPPA 4MFIA 1SDXA 1IEJA 1JW1A 1TFAA 4DIGA 3IOUA 1UIUA 5HPQA 2UYFA 3OELA 2XX7A 4NF8B 1MQGA 1B51A 3BBRA 1USYH 2RC9A 3QIMA 5KZTA 4OYVA 2QRYA 5ISUA 4H6DA 4U21A 3KN7A 3V89B 3DLNA 4LA9A 1SI1A 4ZE8A 3G3IA 2ZMBA 4F31B 3SEUA 3I3VA 3DP6A 4EXLA 3H06B 3THIA 1EZPA 2XXTA 4R6KA 1DTZA 5JTYB 2DE2A 2VGQA 4R9FA 4KYDA 4F18A 3PPOA 2H98A 5KCJB 1Y1MA 3K4UA 3S4UA 4GD5A 4LQ5A 3SDFA 2OLBA 1N76A 3JV9A 1ATGA 3OO7A 4E0XA 4YKIA 2HAVA 2HXWA 1ZBMA 3Q29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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