4NF4B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with dcka and glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4B02
4ZEFA 4WXJA 1GGGA 5CM6A 5I58B 3IOTA 1OVTA 1BP5A 2E1SA 3O29A 4F3BA 3UIFA 3IJOB 4NTLA 5DT6A 1MRPA 2DSFA 1R1NA 2RINA 5DYHA 4AQ4A 3IR1A 4OEUA 1QULA 3RUMA 2PT2A 2UVGA 1Y3QA 1ZMGA 5H8NA 1SBPA 4RY1A 3EN3A 2VD2A 3SEXA 4QFOA 3PUVE 1TFAA 2OWTA 5A5XB 1DTGA 4R9FA 4ECFA 4Z0IA 4PFTA 2V93A 3GBAA 4BLAA 1FQFA 2HZKA 4LZ8A 2H9BA 1MG1A 5I57B 1B9JA 2DOJA 3T96B 2Y7PA 4PFUA 1NNTA 1NFTA 3JV9A 2RC8A 3RY3A 2O69A 3MC2A 3IAZA 3KN7A 2QMWA 4HS7A 4YB7A 3T9XB 4RYAA 4NF6A 4H0WA 3CVGA 3KEIA 1Z7NE 1SW1A 3KG2A 2R9JA 2UVJA 3Q26A 3RTFB 4OETA 2RKMA 1AMFA 1QUJA 2ALUA 3ILUB 1S9TA 3HO7A 2HCAA 4OMBA 4G68C 3G3GA 3B6QA 4HTGA 3PPQA 1NH8A 3K2DA 3VVDA 3I5OA 4FEDA 1NNFA 4QFKA 3G3KA 3ZSFA 3C35A 3H6VA 4ELPA 3LSLA 4R72A 1ANFA 2A5SA 4O3AA 4E0WA 1QUIA 3IOWA 2ONKE 3ILTB 3PD8A 2O1LA 1DPEA 3IL1B 4NF5A 3UK4A 4Z7EA 5JEIA 4JDFA 1PEBA 4EXLA 1SD3A 1N76A 4U22A 1GV8A 4U23A 4LVQA 5KCJA 3ZKKA 3IB2A 1Z7ME 3O66A 3FZVA 4OFJA 3VE1B 3OOAA 4O3CA 1JEVA 3VLWA 4H5GA 5ELVA 3MVWA 1UTHA 3U1OA 1M5BA 4YB5A 1PBPA 3C36A 4HW8A 3SKPA 3IORA 4IO4A 1POTA 2GFEA 3DM0A 1ZLQA 2RCBA 5HBCA 2DE2A 3MAMA 1FTOA 5AA2B 2GHAA 2UXAA 1US5A 5TP9B 3O6HA 5I2NA 4U1ZA 3T9UA 5H8SA 4F39A 2W7YA 1B7UA 3T9HB 2I6EA 4OTEA 4YICA 4H1XA 3N6TA 3CRBA 1ZIUA 5HPQA 3RGYA 2IA4A 1FQCA 3CG1A 2F7BA 1MQIA 1NNKA 3U72A 1HSEA 4GVOA 1B3LA 1MY2A 3QXMA 3S9EA 4IGRA 1OQGA 2Y7KA 1OMPA 4PETA 3SDFA 1MDQA 1SDXA 3PGFA 1J1NA 3ZKLA 2PX1A 1P1QA 3O97A 3N94A 5CI5A 2HZLA 2F36A 1N3XA 3G7WA 1D9YA 2KLFA 4KD5A 1I6AA 2QL3A 2Z8EA 3C31A 3FJMA 4NF8A 2D21A 1H44A 1MH4A 3V8XB 4H8IA 1LB9A 2AL4A 4N13A 2AYSA 3UN6A 3OENA 3SEVA 1FTKA 2ZYKA 3TTLA 4G68A 4X1DA 3TKDA 1R6ZA 3CSGA 2E0SA 2OCUA 2F8DA 2XXVA 4WKMA 1SVXB 2I3VA 4RK2A 2I4CA 1H45A 2DQVA 4JBZA 1OLCA 4NWCA 3D4CA 3HV1A 3VXCA 4MF3A 1MXWA 1N0TA 1SI1A 2ESNA 3HHGA 1JW4A 1MPBA 4R6HA 3T93B 2F7AA 2XXQA 4F31B 3GZGA 5FHMA 1EZ9A 4GFRA 1XC1A 3A3UA 2R6GE 4ZEDA 4YKIA 3FIRA 1Y9UA 1UIVA 4QSDA 1MXYA 5I56B 1NKXA 4OWDA 1H76A 3W9VA 4U1OA 3USDA 2F5XA 1MH3A 3PV0E 5F7VA 3U93A 4F18A 1FQEA 3A09A 1QKAA 4YMBA 2V84A 1FCKA 1IEJA 2ONRA 3TTNA 1D3KA 5TPAA 3T9VA 1ZJLA 2X26A 1XS5A 4OFLA 2XXTA 1AIVA 4C1TA 3I3VA 1A54A 1MQJA 4G8HA 1QW0A 3Q28A 4BDNA 5JK4A 3WAEA 1IXCA 3T22A 4ELQA 1B32A 2F34A 4PFYA 2DWJA 2ZYMA 4M4GA 3W15C 3IOVA 2XHDA 4PP0A 1MPCA 1PBQA 2QSXA 2XXYA 2ANJA 3E13X 1Y4CA 1EZOA 1LLSA 2REGA 3MVXA 4XKQA 2OWSA 1GVCA 3MUQA 4RPNA 4RXLA 2Y7IA 1DMBA 3QUJA 3FVNA 1FTLA 1WVJA 1MPDA 1SYIA 1IIWA 1Y1ZA 3OEKA 3DELB 4YB6A 4OESA 1IXHA 4JB7A 4F3PA 1OLAA 3IB0A 4JWXA 2H5YA 3MZBA 1B51A 4G4PA 2XX8A 1A8FA 2I0CA 2H25A 4I1DA 4P0IA 3KN8A 1A99A 4LA9A 3FASA 1MXXA 3MZ1A 4X1BA 5DTBA 4QRZA 1UTBA 2G93A 4P11A 3KSJA 1NH7A 3MWBA 2BJJX 4R2FA 1P1NA 4NF6B 3QYTA 1WDNA 2FYIA 5I59B 3H06B 4YKPA 1Y1MA 4NF4A 1HSJA 5B70A 1CE2A 2VHAA 2PVUA 1M5DA 1MQHA 3C4MA 4ZS9A 4GL8A 4ESXA 4XKPA 4LUBA 4PE5B 2THIA 4GXSB 3H7MA 3D4GA 3FJ7A 1L5TA 3FXUA 4IO5A 2REJA 4C1UA 3T66A 1FTMA 2Y7RA 4ZDMA 2GH9A 4HCWA 1MY1A 3ONMA 3LSXA 5H8QA 4NF5B 2ZYNA 3MPKA 3RPWA 1B1HA 3BFUA 3O6IA 3QUFA 4X9TA 2P2AA 4XTCQ 5I2KA 4GLIA 4LP2B 4KYDA 3TMGA 2LAOA 5EYFA 1D9VA 4HCYA 4ISUA 3MVZA 2VGQA 4EF1A 1B0HA 5DVJA 4IY5A 4ND9A 1ELJA 4QFLA 1UTHB 2RCAA 2M8CA 1LAXA 3SERA 1GR2A 2IEEA 3N26A 3RT8A 1B4ZA 5LOMA 1LFGA 3MP8A 1BKAA 4WEPA 3K02A 4H6DA 1SW5A 2ZXTA 4H5FA 2DXYA 1DTZA 1O63A 2V3UA 2DWIA 4POXA 2O7IA 1JQFA 3R6UA 4N6PA 4EUOA 3RQTA 2VOZA 4Q8RA 4EDPA 5ICQA 3G3JA 4DXCA 4KYEA 5I58A 3K1NA 1YTVA 4G2ZA 5AA2D 1B7ZA 1QVSA 3Q27A 4GXAA 3PMXA 3G3FA 5CMMA 2XXXA 4H67A 2R71A 2ZMBA 1QJMA 2Z8FA 4EQBA 5DVIA 1PB7A 3FGSA 3IB1A 3BBRA 2Q2AA 3PMWA 1MY4A 3UA8A 1M5FA 3DP4A 1PB8A 5L9SA 4EXKA 1BTJA 1SW2A 2O84X 1XHYA 3OELA 4WEDA 1LGBC 4UACA 3AXFA 3SETA 1Y4TA 3K6VA 4MBPA 5FHOA 1NMUA 4F1UA 3QAXA 2QPQA 3SEUA 2HAVA 3TEPA 3ECRA 3TQLA 1B6HA 1M5EA 3QK6A 3V83A 3VFJA 5FTIA 2X7QA 5I57A 2PYYA 1JVXA 3IO4A 4Q5TA 2UYFA 1LAHE 3VLUA 4AB5A 3M3LA 1LFHA 2G29A 1HSLA 4LATA 3TDJA 1LBBA 4Q30B 3N5LA 2NUVA 3DP6A 2DWHA 5EHMA 3C34A 4ZEKA 2O51A 2HQ0A 4E0XA 3K0VA 4UA8A 4ELRA 3MBPA 5ICTA 1FQAA 2NXOA 3MP6A 5HM4B 4FJPA 5ITPA 1P1UA 1D4NA 1I6BA 4U21A 4O3BA 2YLNA 1IXIA 3R7XA 2OK2A 3LSWA 3MVYA 3U8QA 3K00A 3O28A 4KI0E 3PPNA 4YKKA 3PUWE 1DPPA 1MDP1 2A5TB 2F97A 1Y3NA 3HSTA 3KJ7A 3SEWA 3VXBA 4OEVA 2Y84A 3RLFE 1MY3A 4IO3A 3CR9A 1DSNA 3OO7A 1SYHA 3E3KA 3O2AA 2B3FA 3TUSA 1N04A 2ABHA 4NMYA 4QSEA 5AE4A 3B6WA 4GF8A 2ZYOA 2H4IA 2QS1A 3EQ1A 2NWJA 4G77A 1DOTA 3IX1A 3H6TA 4DXUA 5CMKA 3VDFA 1FQBA 3HPIA 4H8JA 4DZ1A 4DLDA 4QF9A 4GRKA 3TCHA 3I6VA 4YAHX 4YZZA 5AA4A 1N7WA 2DP8A 4XIGQ 1P1OA 4GIZA 3OO9A 1URDA 3TCFA 1RYOA 5AA2A 5DVFA 2YPNA 3QSLA 4OXVA 1TXFA 4DIGA 1S50A 2QJEA 3IO6A 4F3SA 2Q2CA 4GD5A 4JWYA 4OENA 1B1XA 3S9LC 4TOZA 1B3EA 1II5A 2I58A 3FATA 2XXHA 3L6HA 3V5AA 4RA1A 4R6YA 4ONYA 5BWJA 3UP9A 4IO6A 3KSXA 2Q89A 3KFMA 1B3FA 3MJNA 4MLVA 4YU0A 5H8HA 3S4UA 2Z22A 1OVBA 3H6UA 3FVGA 1URSA 1GTKA 3OO8A 1LCTA 4NF4B 3KJTA 1A7LA 4KHZE 4F1YA 4DCXA 3SESA 4XKRA 3CIJA 1VSOA 2HEUA 3FD3A 4LQ2A 1MXVA 1MXUA 4R6KA 5JTYA 1XT8A 1N3WA 1MQGA 4F2QA 5H8NB 3EHSA 3FV1A 1MQDA 5H8QB 4POWA 1N7XA 3RTWB 4U2RA 2OBGA 3FVKA 4LONB 3C33A 3H4ZA 3HHFA 4KCDA 4JSDA 1FW0A 2PMSA 4MFIA 3L6GA 2UVIA 4JSOA 4U4XA 3EHUA 2UYEA 2B65A 1B05A 3LBSA 3ODBA 2NVUB 2DS9A 3MW0A 3TFLA 1WODA 3S9MC 2NOOA 5I84A 3EHTA 3PUXE 1VR5A 5AA3A 2I3WA 3K6UA 3GXAA 1B40A 2D5WA 2O6AA 4G8NA 4ZECA 3P7IA 1PC3A 4KFQA 3VV5A 2DYXA 4ELOA 4ZZAA 3FXRA 4Q0CA 2UVHA 5AA1A 4ZEIA 2RF1A 4DXBA 1AOVA 2Q8JA 2HFBA 2O68A 4YMAA 2AL5A 5KDTA 2QRYA 3UORA 5CC2A 1FTJA 4RJZA 1O7TA 3IJXB 2QS2A 2VD3A 3ZS6A 3TODA 1IQ7A 1QUKA 5CRYA 3KZGA 1R9QA 5FTHA 2QS4A 4TQUQ 2I4BA 3F11A 4FE8A 3N6UA 1LCFA 2YJPA 2P1SA 4X48A 4IO7A 4TLMB 5DEXA 2QS3A 3W9WA 4C0RA 1XVXA 3FV2A 3KBRA 3CFXA 3M3KA 3K6WA 2ONSA 3RN8A 3RNNA 1OQHA 5KCJB 1LAGE 1BIYA 4EQ7A 3CFLA 2XX7A 4U4SA 1VFEA 3VVFA 1JW1A 2XD2A 2ZNTA 1CB6A 1SI0A 4R2BA 2GRVA 5CMCA 3GLBA 1VFDA 3K4UA 3IOUA 3IK6B 2ZNSA 4LZ5A 4FAJA 3VVEA 1EZPA 4FATA 3OEMA 3A3CA 4OFOA 1POY1 1B5HA 4FEBA 3JYRA 2Y7WA 1AH5A 1RYXA 3HN0A 3OSQA 5I2NB 2XXUA 1YCJA 1A40A 4F1VA 3B6TA 3TQWA 2V25A 5H8FA 2X7PA 5I59A 1R9LA 4DCYA 3V89B 4NWDA 5TU0A 1URGA 4OQOA 1T0KA 4QHQA 3R26A 4ZZEA 3K6XA 4ESWA 1MS7A 2OJTA 1A8EA 4I9DA 1B5JA 2XXRA 1TT1A 3CI8A 3G3IA 2XXPA 4FIMA 3EF7A 1JW5A 1PB9A 2CMOA 1IZ1A 3H6WA 1ZKBA 3TZAA 1B3HA 3E4RA 2FA7A 4NF8B 2PT1A 4P0GA 2I0BA 1LAFE 3G3HA 4QFNA 5A5XA 1I69A 3K1MA 4GOTA 3M3FA 1Y3PA 1USYE 4G68B 3OMBA 4IGTA 1M5CA 1ZTYA 1US4A 1FQDA 1ZU0A 3TTMA 3TTRA 1EH3A 4JWOA 2B3BA 5L9MA 3PUZE 1MXZA 3TCGA 2DVZA 3VLVA 4F19A 1JETA 3B7DA 1JVYA 5AA4B 3LSFB 2RC7A 4KR5A 1B58A 4KYSA 4R74A 1JNFA 3OXNA 5BUUA 2F78A 3M8UA 2P0SA 5EHSA 3CSBA 2H99A 2ZNUA 1O64A 4NE4A 2QMXA 3FXQA 4GL0A 2Z8DA 4FECA 2XX9A 2F6GA 5CBSA 4F29A 4FORA 1OIBA 2DWAA 5FHNA 4OYVA 3C9HA 5H8HB 4H65A 4IO2A 4F3GA 5TPAB 3LR1A 3THIA 4EQ9A 3KGCA 3BFTA 1TFDA 3PU5A 3TPAA 1KWHA 2I49A 4JXIA 4EF2A 1NNPA 1TWYA 3C32A 1UQWA 4K3FA 1PDAA 4XKNA 1IXGA 3K01A 5K2XA 4GWOA 1A55A 1ATGA 1SW4A 1XVYA 2O1MA 5JTYB 2DVCA 3MQ9A 3PD9A 1LBCA 1YPNA 4BDQA 3DP8A 5IAIA 2XD3A 2AIXA 4I8CA 3RT6B 4ZE8A 3DLNA 1JEUA 1S7YA 3MPLA 4PQJA 3EPEA 3OD7A 4OZ9A 1H3DA 1B4HA 5K2YA 1LFIA 1B5IA 2VP1A 5TP9A 2O7UA 4R73A 3TTKA 3JZJA 4GQOA 4OERA 4RK9A 2GHBA 3Q25A 1MY0A 3UGWA 3MP1A 4BDLA 1B52A 1H43A 3CFZA 4F2OA 4L17A 2HAUA 4BDRA 3U94A 2DXRA 2RC9A 4F22A 4YKJA 4PFWA 2F7CA 4M1VA 5KZTA 1UTBB 4OVJA 1IUDA 1B3GA 4I62A 5B7DA 5CMBA 4NEDA 3H3GA 2Q9TA 2A5TA 4RPOA 4OHNA 1B7HA 2V3TA 1LSTA 5F1QA 3KN3A 3TAJA 4MH5A 5J1DA 3K1PA 1P1WA 4QSCA 1LB8A 3FUZA 3O6GA 1VE4A 4LZ7A 1RKMA 3SEYA 4IY6A 5CBRA 5L9OA 3GBBA 1B2HA 1B0LA 5KDTB 2F35A 4AB6A 2HXWA 4R75A 5IKBA 3KOTA 2H98A 4N07A 3BKIB 1UIUA 4ZE9A 1YAEA 2XXWA 2XXIA 3KOSA 3Q29A 1QKBA 2D3IA 3OO6A 3MZ9A 1SQYA 2OZZA 4BDOA 1ZBMA 5DEXB 2PBWA 4QFPA 2OLBA 1AL3A 1MM7A 3PMVA 5L8DA 4KPTA 3S2VA 1Q1KA 3OSRA 5I2KB 1USYH 4DE8A 4ZEBA 4BDMA 1BLFA 3WAFA 4XXUA 5M2VA 1EU8A 3FJGA 2Q88A 3LUYA 3PPOA 4G8MA 4MLQA 3CG3A 3TELA 1B46A 2F6PA 3S9NC 4R9GA 1IITA 4THIA 1N84A 3QIMA 4KQPA 3E9XA 1F9BA 3PPPA 3O9PA 5ISUA 5I56A 1P99A 1XOCA 5ITOA 2CZLA 3LC8A 3H03A 2WKYA 1Q35A 2DE4A 3PPRA 4KCCA 1NL5A 2DE3A 2FNCA 3TYHA 1Y20A 4RNSA 3U92A 4LQ5A 1MM6A 3HCQA 2I48A 4IB2A 4TLLB 2Z23A 5H8FB 3PUYE 4DDDA 2V3QA 3FVOA 1I6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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