4NF5B

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and d-ap5
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
279
structure length
273
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDICVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 273
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf5B02
1B05A 5JEIA 3S9MC 1R1NA 2XHDA 3O97A 3T9VA 1QUKA 1LFHA 3CFLA 3EN3A 2VP1A 1SW2A 1BLFA 1VR5A 2Q8JA 3M3LA 4NE4A 1LGBC 5TU0A 4PFTA 3TEPA 3EHUA 2QRYA 2G29A 1NNPA 5DEXB 3K6XA 3AXFA 2HAVA 4NF6B 1USYE 3K1PA 4M1VA 1I6BA 4MF3A 5L9SA 3RPWA 4L17A 3K2DA 3KSXA 3V5AA 3FVNA 5FHMA 4WEDA 1N84A 1Z7ME 5AA2A 4DE8A 1BTJA 2DOJA 4G68A 4OZ9A 4F1VA 4OFJA 3WAEA 1P99A 1QKBA 1FCKA 3ECRA 4GL0A 1TFAA 4QFNA 2VGQA 4HCYA 1B51A 3R7XA 3N26A 1NFTA 2A5TA 2NOOA 5DVIA 3QYTA 4E0XA 3VE1B 4ZZAA 3KJTA 1PEBA 3CVGA 4XKQA 4NWCA 3GBAA 2HZLA 2D3IA 1YTVA 3OSRA 4F39A 3FJ7A 2LAOA 1MQGA 4FATA 1UTBB 4PFUA 3OO8A 4Q0CA 1R9QA 3A09A 2A5SA 1H76A 3UA8A 2Z8FA 3KJ7A 3HN0A 2THIA 1B0LA 3VFJA 3R6UA 1N7XA 3QUFA 2ABHA 1P1OA 4F3PA 1OMPA 3Q26A 2I4BA 1LAFE 4F29A 4BDQA 5HM4B 4LATA 1OQHA 3MAMA 3E9XA 4UA8A 1PB7A 2ONKE 4ESWA 2H98A 4I1DA 2VHAA 1LB9A 2ZMBA 3PPNA 3GZGA 2AYSA 3U1OA 3FJGA 3MPKA 1IQ7A 1MPBA 4H6DA 4FEDA 2PT1A 4EQBA 2PX1A 4F1YA 4OQOA 5I56A 2QS1A 3TCGA 1DSNA 5TP9A 3PPRA 1RYOA 1UIUA 3KSJA 3SKPA 4G68B 4LZ5A 3MVXA 5B70A 3TCHA 2O1LA 2HEUA 2QJEA 2V3TA 3DP6A 2PT2A 5L8DA 2ESNA 4ND9A 5ISUA 3D4CA 4FAJA 1I6AA 3HPIA 3OO7A 4P0GA 4H67A 2QL3A 3EQ1A 1MY3A 2A5TB 1N76A 1OIBA 4I8CA 3MZ1A 2Y84A 1QJMA 1UTHA 3IOWA 4IO2A 4OYVA 3IK6B 1HSJA 2M8CA 4DCXA 3BBRA 5I2KB 4ZE8A 3E13X 2ONRA 1OLAA 4KHZE 3H06B 1A8EA 4F3SA 2IA4A 2ZNTA 1FQEA 2Q2AA 3QUJA 3K6UA 3FUZA 3OEKA 2NVUB 4RPOA 2Y7KA 5JK4A 3K0VA 4I62A 4GOTA 3VXBA 4U4SA 4R73A 1Y1ZA 2O68A 4NMYA 4GIZA 5CMMA 2REGA 1LAHE 1MXVA 3TKDA 3KFMA 3TZAA 2HXWA 1MY0A 5BWJA 3B6WA 1XVYA 5I58B 4FE8A 4KR5A 2XXPA 4BDRA 3B7DA 5HBCA 4BDOA 4AB6A 2F7CA 4LA9A 3QK6A 5CBSA 4G4PA 4POWA 2O51A 5F7VA 4JB7A 4QHQA 4R6YA 2DE2A 4U1ZA 2XXYA 4EQ9A 5H8FA 4RK2A 1B4HA 1ZKBA 1FTMA 1LCTA 5AE4A 3MVZA 3E3KA 1LB8A 3P7IA 3C9HA 1S50A 1JW1A 4BDMA 3FGSA 1B5IA 1S9TA 4LONB 3I5OA 1SI1A 5AA2D 1B7HA 2BJJX 4YB6A 3KZGA 3C33A 2F35A 3VV5A 4DCYA 5I59A 4RJZA 3DELB 1MY2A 1QUIA 2Y7RA 3GBBA 1UTHB 3TYHA 2CZLA 2F8DA 2I4CA 2OJTA 3T93B 1T0KA 4IGTA 4PE5B 2DE3A 3OEMA 4F2QA 1PC3A 5ITOA 4FECA 2QS4A 3K6WA 2H25A 5DVJA 2AL4A 1MS7A 1LBBA 1SD3A 3K02A 3LSXA 1US5A 4Q5TA 5FTHA 1VFDA 5KZTA 4OENA 1B40A 1PB8A 4OESA 3L6HA 4U4XA 5J1DA 1MXYA 4GQOA 1P1QA 1FQDA 4UACA 3EF7A 4H1XA 1LBCA 1NL5A 3LUYA 4NEDA 2F78A 1EU8A 1RKMA 1GR2A 1SYHA 1XT8A 3PUZE 4XIGQ 4X9TA 4H0WA 3RY3A 3U8QA 3H3GA 1IITA 1OVTA 4GWOA 2Q89A 3Q28A 5DYHA 5I57A 1N0TA 3U92A 3O6IA 3HO7A 1MQIA 1URGA 1R9LA 1QVSA 5L9MA 1ZIUA 4JDFA 3T9UA 3TTKA 4XKRA 5CMKA 3PUXE 3TDJA 5CRYA 2PMSA 1LSTA 1B2HA 4EUOA 2YPNA 3IX1A 3H03A 3SEVA 2I0CA 3PPPA 4ELQA 2XXVA 4TOZA 5I59B 3ILUB 4ZEIA 4BDNA 3SEUA 4K3FA 4OWDA 2DXRA 3CR9A 3QSLA 1OQGA 3N5LA 4KD5A 4BDLA 3MWBA 3O9PA 3SEYA 2RCAA 4LZ8A 1B32A 1DMBA 3TFLA 2Z8DA 2I3WA 2QMXA 5FTIA 4HW8A 1A8FA 1TFDA 4ZE9A 1PBPA 3RN8A 5KDTB 1MXZA 2ZNUA 2UYFA 4MH5A 3O6GA 3CG1A 4ESXA 4R6HA 2B3FA 3IOUA 4NTLA 4DLDA 4RY1A 2YLNA 3QIMA 4IGRA 1MQJA 1ELJA 2QS2A 4G68C 4QFOA 2W7YA 1Y9UA 1A40A 1IUDA 3T9HB 3QXMA 4G77A 4LUBA 4LZ7A 1QW0A 4C1TA 3H6UA 1IXHA 4IY5A 3OSQA 2UVHA 4WXJA 1F9BA 4WEPA 4IY6A 1DPEA 4TQUQ 4YAHX 3FD3A 4GVOA 3THIA 3CFZA 3T9XB 3CRBA 4G8MA 4NF5A 3VVDA 1B7UA 3CFXA 1O7TA 1B5JA 2R9JA 1M5DA 3TTRA 4OERA 3SERA 3U93A 5I57B 2GHAA 2DWHA 2RF1A 3IO6A 2E1SA 3MVWA 1IZ1A 1MXUA 2O69A 1MPDA 4JWYA 4ONYA 1IIWA 4F22A 3IJXB 1XC1A 1IXIA 3C35A 4OEVA 4IO7A 3PMXA 4GF8A 2Y7WA 3RGYA 1FQFA 4NF4A 3KG2A 4WKMA 4H5GA 3RNNA 3SETA 5AA4A 3F11A 1O63A 1QUJA 5ELVA 4AB5A 1IEJA 5EYFA 2I0BA 3V89B 4ZEDA 3SEWA 5AA1A 3G3IA 4U2RA 1EH3A 4THIA 2O84X 2OZZA 3GLBA 2KLFA 2I3VA 3K00A 4R9GA 1WVJA 3KN7A 1B52A 3KN3A 3L6GA 3GXAA 3G7WA 3SEXA 1BKAA 3PPQA 3RTFB 3ZS6A 3FV1A 2XXQA 2V3UA 3M3KA 4OVJA 4HTGA 1TXFA 2B65A 2OWTA 3PUYE 3UIFA 4IO4A 5JTYA 3PUWE 5AA2B 1A7LA 3FVGA 4G8HA 1YCJA 2R71A 2QS3A 3SESA 3OXNA 4GL8A 3K01A 1XVXA 2DSFA 2FYIA 5H8HA 3DM0A 4YKIA 4X1DA 1LAGE 2DVZA 3MP1A 3CIJA 5M2VA 4R74A 2Z22A 3K1MA 1VFEA 2UVGA 1KWHA 1ZU0A 3UN6A 1AL3A 2DWJA 1P1WA 1JEVA 4YB5A 2RC9A 4KPTA 4ZDMA 2D5WA 4FEBA 3G3KA 2UVIA 3S9EA 4JWOA 1M5FA 2ZYNA 2O7UA 3LC8A 5H8NA 3E4RA 1MQDA 4EQ7A 2X7QA 3QAXA 3Q27A 4U21A 1QULA 4OFOA 5K2XA 1MY4A 3BFTA 2DWIA 1FQBA 1B1HA 2OLBA 4EF1A 4YKKA 1H45A 1SVXB 1SBPA 4JWXA 3OENA 1MXWA 3G3JA 4KYSA 4F18A 4H8IA 3LSWA 1B3GA 4RA1A 4P0IA 2O6AA 1B6HA 3VLUA 1MH4A 2GRVA 4RNSA 4QRZA 3C32A 3FASA 3R26A 2HZKA 1AOVA 2GFEA 1A99A 3SDFA 4XKNA 3VVFA 1GV8A 1FW0A 2ZNSA 2G93A 3PGFA 3EPEA 5I56B 5H8QA 2YJPA 5TPAA 4U22A 5TP9B 1B3FA 3K4UA 4OEUA 2B3BA 4NWDA 1H44A 1CB6A 4E0WA 1N7WA 1B1XA 1ATGA 1NKXA 1B0HA 1L5TA 2Q88A 2DXYA 4BLAA 4LP2B 1JW5A 3ZKKA 2P1SA 1QKAA 3A3UA 3PMVA 2RC8A 4MFIA 3W15C 3OO6A 3KEIA 4R9FA 2I49A 4KQPA 4JBZA 4XTCQ 5DT6A 3MZ9A 3MP8A 1D3KA 3O6HA 4OFLA 1MDP1 4HS7A 4F31B 2QSXA 1JEUA 2XXHA 2DWAA 1MM6A 3BFUA 3KN8A 2Z8EA 1H43A 2UVJA 3PMWA 2NWJA 3PUVE 2XXIA 4ZEKA 1FTLA 4GFRA 1B7ZA 2HCAA 4KFQA 3OELA 1TWYA 3MC2A 2ONSA 3IL1B 3HV1A 4ECFA 2V3QA 4NF6A 2F7BA 4XKPA 4LQ5A 3C36A 1ZBMA 3CI8A 1HSLA 1JW4A 5EHMA 3OO9A 1ZJLA 3FZVA 3HHFA 5CBRA 3DP4A 3HSTA 3PD9A 3T66A 1Y3QA 5H8FB 2FA7A 2I58A 3VLWA 4O3BA 2DS9A 1NH7A 4C0RA 1FQAA 3H6TA 2XX7A 4TLMB 2H9BA 5ITPA 4QSDA 4YU0A 5H8QB 5KCJA 4DDDA 3UGWA 3G3GA 5A5XA 1MG1A 3ZKLA 1N3XA 1LLSA 1Y20A 4G2ZA 2PYYA 2OCUA 1RYXA 4F2OA 4EDPA 1FTOA 1NNKA 3O28A 2UYEA 3MP6A 3Q25A 4ISUA 4DIGA 5DTBA 1I69A 3DP8A 3FVKA 2XXUA 3RUMA 3B6QA 1NNFA 1AIVA 1JVXA 3UP9A 2Q9TA 2ALUA 1Z7NE 2DYXA 3KOSA 4R6KA 1USYH 1WDNA 3C4MA 3CG3A 1MXXA 3S9NC 1US4A 1IXGA 4HCWA 4YB7A 2DE4A 1B4ZA 2QPQA 3RT6B 1YAEA 3H7MA 1SW4A 2OK2A 4ELPA 1POY1 1CE2A 3EHTA 3TPAA 5LOMA 4NF8A 2I48A 3VVEA 4DXCA 1DTGA 2HAUA 1SW5A 3Q29A 1MM7A 1WODA 2PVUA 2H99A 2Q2CA 4I9DA 1J1NA 1NMUA 4R72A 1UIVA 2VD2A 3D4GA 1SDXA 3MZBA 3H4ZA 3CSGA 2XX8A 2REJA 4EXKA 2ZYOA 3FATA 4F3BA 1UQWA 1A54A 3JZJA 3T96B 4EF2A 3TCFA 1JNFA 2AIXA 4GD5A 3S4UA 3LSLA 3KOTA 1N04A 4IO5A 1TT1A 5IAIA 2IEEA 3O2AA 2HQ0A 5KCJB 4O3AA 3JYRA 5I84A 5A5XB 4QSEA 3MJNA 2OWSA 1OLCA 2R6GE 3ILTB 3MBPA 1URDA 3TTLA 4IB2A 1BP5A 1B9JA 3C31A 1VE4A 2XX9A 3T22A 5I2KA 1VSOA 1Y1MA 1FTJA 4QFKA 3M8UA 2VD3A 2PBWA 4YMAA 2V25A 2XD2A 1MY1A 3EHSA 3B6TA 3PV0E 3TMGA 3K1NA 3PD8A 3UORA 3VXCA 1P1UA 5HPQA 1FTKA 5BUUA 3LSFB 5ICQA 3MW0A 3BKIB 4MBPA 4PETA 1LCFA 4F3GA 1XOCA 2VOZA 4ZZEA 1XS5A 4GRKA 3TAJA 3IR1A 1Y4CA 4FIMA 4DXBA 1EZPA 2GHBA 5I58A 4C1UA 1P1NA 1ANFA 4MLQA 4NF8B 2UXAA 3ONMA 1HSEA 3FXRA 3IO4A 4OTEA 5DVFA 3IOVA 2DQVA 2X7PA 3ODBA 4ELOA 4YKJA 4H5FA 1B3LA 4P11A 1OVBA 4JSOA 3N6UA 4XXUA 5CMCA 3RT8A 3IOTA 2V84A 4NF5B 1B5HA 3FV2A 4RXLA 4R2FA 3TELA 5I2NA 2F36A 3OD7A 1Y3PA 4DZ1A 1LAXA 1GVCA 1SQYA 4EXLA 4Q8RA 4PFYA 4DXUA 3MVYA 4ZS9A 2X26A 3FVOA 1R6ZA 3PU5A 4G8NA 4TLLB 4OMBA 2HFBA 4AQ4A 1MH3A 3RTWB 1B3EA 1S7YA 1GGGA 3V83A 2F5XA 3PPOA 4IO3A 2F97A 3N6TA 4OETA 3KBRA 3HCQA 4NF4B 1PBQA 2NUVA 4LQ2A 5AA4B 5L9OA 1M5CA 1SW1A 2CMOA 3G3FA 1JQFA 4U23A 3IORA 5H8SA 1NNTA 2ZXTA 4YICA 1D9VA 1Q1KA 3TUSA 4Z7EA 3IB2A 4O3CA 2D21A 3IAZA 3H6VA 3H6WA 2RCBA 3VDFA 1M5EA 1SYIA 1M5BA 1XHYA 3TQLA 1ZTYA 3M3FA 3TTMA 4F19A 3UK4A 4OXVA 3VLVA 1Q35A 2RINA 1BIYA 2DVCA 1O64A 4ZECA 1A55A 3K6VA 1IXCA 5K2YA 1MDQA 3IB0A 4IO6A 5IKBA 5FHNA 1D9YA 5CMBA 4YZZA 1DOTA 3TQWA 4RYAA 2P0SA 3FXUA 5JTYB 3I6VA 2XXTA 1GTKA 3RLFE 1PB9A 2DP8A 4LVQA 4KYDA 2V93A 3U94A 1DPPA 2NXOA 5H8HB 4GXSB 4POXA 5CM6A 4JXIA 3HHGA 3TODA 1SI0A 1POTA 3O66A 3IB1A 5I2NB 4QFLA 3FJMA 1FQCA 4R2BA 2F7AA 3A3CA 1Y3NA 2O1MA 1MPCA 5AA3A 4GXAA 1B3HA 4Z0IA 1II5A 4M4GA 4ZEBA 3TTNA 5FHOA 5H8NB 3JV9A 2WKYA 4KCDA 4MLVA 2I6EA 4JSDA 2ZYMA 2Z23A 2GH9A 4YKPA 3WAFA 2H5YA 5B7DA 4QSCA 3RQTA 3KGCA 4H65A 3V8XB 2ZYKA 4N07A 4QF9A 1EZ9A 4F1UA 4X48A 1ZMGA 5KDTA 2QMWA 3OOAA 1JVYA 4X1BA 3MUQA 3CSBA 4N13A 4QFPA 1EZOA 5DEXA 2O7IA 3FIRA 1JETA 4U1OA 1B46A 4PP0A 2RC7A 5CC2A 1N3WA 2OBGA 4PQJA 2XXWA 3USDA 4GLIA 2ANJA 2F6PA 2H4IA 4ZEFA 1MRPA 2RKMA 4OHNA 5CI5A 1I6QA 5ICTA 3C34A 4RPNA 3N94A 1H3DA 1DTZA 4Q30B 1NH8A 3MQ9A 2XD3A 3G3HA 3U72A 3S2VA 2Y7IA 3I3VA 4FORA 2XXXA 5TPAB 4KI0E 3LBSA 2XXRA 2Y7PA 3DLNA 1LFIA 3FXQA 3MPLA 4RK9A 2FNCA 3O29A 2E0SA 1MQHA 1ZLQA 5EHSA 5F1QA 3OMBA 1YPNA 1B58A 1D4NA 1AMFA 4ELRA 4YMBA 1UTBA 3W9VA 1AH5A 1URSA 2F6GA 4N6PA 4R75A 4KCCA 4KYEA 1Y4TA 2AL5A 4FJPA 3W9WA 4PFWA 2F34A 4H8JA 3LR1A 3S9LC 1LFGA 2P2AA 3IJOB 3ZSFA 1PDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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