4NF6A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and ppda
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
287
structure length
278
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 278
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf6A02
1Q1KA 5H8NB 1Y3NA 3QYTA 1ATGA 3FJ7A 3N26A 1B3EA 4YICA 3RLFE 1B3LA 1JW5A 3G3IA 1MQHA 2O1LA 1H43A 4KCCA 3OOAA 3MP6A 4H8JA 2ONRA 3TCHA 3Q25A 4IO7A 1NH8A 3KZGA 2NVUB 4PFTA 1LAHE 4U4SA 4IO5A 4EF2A 1FTOA 3FVNA 4G68A 2XXYA 3ZKLA 2THIA 3MVXA 4WEPA 3O9PA 2F34A 3MVYA 4BDOA 2GHBA 1QVSA 3MBPA 5AA4A 1L5TA 3D4GA 3LSFB 1Y9UA 2GHAA 1P1NA 1JQFA 3N5LA 2RC9A 2PVUA 1M5BA 3B6TA 2O1MA 3B7DA 4KHZE 4PFYA 3OEKA 4F3PA 1LBCA 1MXVA 3HO7A 1XOCA 3S9NC 3BBRA 4TLLB 4DDDA 3CG1A 4E0WA 2ABHA 1A40A 3S4UA 1HSJA 3SETA 1YPNA 2VOZA 4KR5A 4JB7A 1N7WA 4RPNA 4YB5A 2R6GE 2X7QA 2DE2A 3FATA 1NNPA 3U1OA 4GWOA 1AH5A 4LATA 3CFLA 1I69A 5LOMA 3JV9A 4LQ5A 5FTHA 3KBRA 3EHUA 2RC8A 2CMOA 4L17A 4QFKA 5I2KB 1TFDA 1QJMA 3OSQA 3M3FA 4GF8A 3GXAA 2F97A 3SESA 1WVJA 1ANFA 3ODBA 4R2FA 2IEEA 4NF8B 3TUSA 4C1UA 4RJZA 5TPAA 1B4HA 3UA8A 4EXKA 1T0KA 3ILUB 3LSWA 2FYIA 3OO8A 3GBAA 1TWYA 1MH3A 3D4CA 1NMUA 4JSOA 1UQWA 4IB2A 3RY3A 5DT6A 2OK2A 4XKPA 1B2HA 5H8HA 1BIYA 2CZLA 3T66A 4IGTA 1LB8A 1IIWA 5B7DA 1B4ZA 2O69A 4OFLA 2WKYA 5TP9A 3ZSFA 2P0SA 1US5A 4YB7A 4OYVA 1LFHA 3CR9A 3P7IA 1BKAA 1P1UA 2FNCA 1IXIA 1SD3A 3A3CA 5AA2B 1LBBA 2ZYNA 3T9XB 5ICTA 4RPOA 3FGSA 4OESA 2HCAA 4OXVA 4ZS9A 3G3GA 3VVEA 3VE1B 4BDQA 2H99A 4GXSB 1EZ9A 4ECFA 4EQ9A 1A55A 5J1DA 3R7XA 4N13A 1FTMA 4HW8A 1A99A 5HPQA 4IO4A 3TFLA 1R1NA 5A5XA 3TQWA 1FQAA 5K2XA 1UTHB 3H6WA 2AIXA 3FJGA 4NE4A 3FASA 2V3QA 1BTJA 2PX1A 1IITA 5KCJA 4BDMA 1N84A 3QSLA 3VVFA 3BFTA 3PMWA 2I3VA 4NF4A 2ONKE 1PB7A 2QPQA 4ZZAA 3IOWA 1Y1ZA 4P0IA 4N6PA 1B5HA 1MQGA 2H98A 1NH7A 1SDXA 2G93A 2O7UA 1P1OA 3O6IA 4YKJA 1B58A 2DS9A 3FVOA 3U93A 4DE8A 5KDTA 1LCTA 1Q35A 4DXBA 5I2NA 4JSDA 4M1VA 1ZIUA 4R74A 4F2OA 3FXRA 3IK6B 4OMBA 1QKAA 4RK2A 5CMKA 4C1TA 3CVGA 4KPTA 4NF5B 1MPCA 4FE8A 4OZ9A 4GLIA 3W9VA 2Z8DA 3EN3A 5HBCA 5DEXA 1MXWA 2RINA 3EF7A 1DTZA 1H44A 2ZNTA 3VLVA 1S9TA 2HAUA 2ESNA 2F8DA 1IEJA 5CBRA 2NUVA 4HCYA 4GQOA 1IUDA 5L9OA 3USDA 3VDFA 4YAHX 3MUQA 2UXAA 3IOVA 2QMWA 1SI1A 4FEDA 4UACA 1TT1A 1M5CA 4M4GA 1OVBA 1GV8A 3C31A 2W7YA 4ZEBA 3WAFA 1B40A 2R9JA 3VV5A 4DLDA 2XD3A 3K1MA 3CI8A 1GGGA 1MY4A 2DYXA 3IB1A 1LB9A 1VFDA 2M8CA 2O6AA 3O66A 2UVJA 1FCKA 3K01A 4POXA 3N94A 2I6EA 4MBPA 1MDP1 4I9DA 3S9LC 4XIGQ 4QFPA 2DVCA 1GR2A 3Q27A 1JNFA 5BWJA 2XXIA 3TTLA 3O29A 2X26A 3Q28A 1WODA 2YJPA 3CSGA 4H6DA 1D9VA 3TKDA 1FQCA 3TTNA 2XXUA 3O28A 3LSLA 4KCDA 5AA4B 2V93A 4YZZA 4XTCQ 3RTWB 4XXUA 2I58A 1SW1A 1FQFA 3KN7A 3C32A 4ZE8A 1POY1 1B5IA 4RXLA 1DTGA 1B46A 4OFOA 1Y3PA 2KLFA 3OO9A 4R73A 4G8NA 3R26A 5CMCA 2F6GA 3MAMA 2REGA 3UIFA 1MXXA 4GRKA 3OENA 3VFJA 3GBBA 2F36A 1N7XA 3DP4A 3T96B 1XC1A 1B6HA 2OLBA 2B3BA 2F7BA 3HV1A 1SYHA 1EZPA 4BDRA 3PUZE 4PQJA 4BLAA 4OENA 4JDFA 1SVXB 1M5FA 3PPNA 1EU8A 1FQEA 1VE4A 5AA3A 4YKKA 3IOTA 3W15C 2G29A 4YU0A 3OXNA 3FJMA 1A8EA 1N0TA 5ISUA 3UN6A 3KOTA 2ZYMA 5H8QA 4HS7A 3S2VA 4TQUQ 4QF9A 1IXGA 4F19A 4DXCA 4EQBA 3HHGA 3O2AA 3RNNA 4H1XA 2O7IA 1QUJA 3KJ7A 3RN8A 3E13X 5AA2D 3FVKA 1FW0A 4G77A 3SDFA 5CMMA 3L6GA 5H8HB 1Z7ME 3G3JA 1VFEA 5FHNA 3OO6A 3IO4A 1QW0A 3N6UA 3QUJA 5I59A 3K6WA 2F6PA 1PEBA 4LP2B 2VD2A 3JZJA 4F1UA 4Q30B 4F1YA 4QSCA 4Z7EA 1B1HA 3CIJA 4GL0A 3B6QA 3G3HA 5I57A 1P99A 3FZVA 4ZEIA 5L9MA 3IB0A 4DCXA 1XVXA 3PMXA 4F18A 5CM6A 5I84A 3N6TA 3TEPA 1DPPA 1MH4A 1MY0A 1NNTA 2ONSA 1OVTA 2O84X 3K1NA 4KFQA 4XKQA 2PBWA 1I6BA 1FTLA 3E3KA 1S7YA 1MDQA 1UIUA 2XX7A 1LFIA 1R9QA 1FQDA 2DWAA 4LVQA 1B5JA 3KJTA 2NWJA 3OELA 1DMBA 1LAXA 2ZNUA 3TDJA 3MP8A 3LC8A 4MLVA 1QUKA 3RPWA 1VSOA 3LUYA 2GFEA 4NF4B 2REJA 4POWA 1B51A 3CG3A 1YAEA 4IGRA 3EPEA 4R9FA 4JWOA 2I48A 1R9LA 1B9JA 4C0RA 3SEXA 2V3TA 4F29A 3GLBA 1B0HA 5H8NA 2VHAA 2D5WA 2UVIA 4WKMA 1IZ1A 4ELRA 3RUMA 1ZU0A 2DQVA 1JETA 5KDTB 2UVHA 2O51A 3PPOA 4U22A 3LBSA 4LZ8A 2HXWA 2QRYA 2VGQA 4OHNA 3PPQA 4FIMA 2NOOA 2I3WA 2OCUA 2QL3A 4Q5TA 3OSRA 1LFGA 1URSA 3C4MA 1SYIA 4OFJA 3SEVA 3F11A 4U1ZA 3T9UA 3IO6A 3ZS6A 4H65A 5DEXB 1UTBB 2Z22A 4LUBA 2RC7A 4MLQA 3MVWA 4WXJA 1MY3A 1JVYA 3FV1A 4X48A 3AXFA 1O64A 2OJTA 5CC2A 2GH9A 1J1NA 4H8IA 3HCQA 5ITOA 3PUVE 4O3AA 5BUUA 1LLSA 1N04A 1TXFA 4ZEFA 3H7MA 3MWBA 1I6QA 2Y7KA 4JWXA 2RCAA 2IA4A 3DLNA 2Q88A 1MQJA 4KD5A 1ELJA 2F7CA 3KSJA 2XD2A 5H8FA 3UORA 1MM7A 4GL8A 1JW1A 3OEMA 4NF8A 2V25A 1B32A 1CE2A 4ELPA 4PE5B 3PV0E 2DE4A 4OETA 2X7PA 1FTJA 4IO2A 5DVJA 3C33A 3QK6A 1DPEA 1USYE 3QIMA 2I4BA 4ZE9A 2QS1A 5FHMA 1M5EA 3TYHA 2VD3A 4R6YA 1OIBA 1MS7A 4QSDA 1B7UA 4R2BA 3CRBA 4DCYA 3KOSA 2O68A 2QMXA 3MQ9A 1QKBA 1Z7NE 1DOTA 1QUIA 5JTYA 1MQIA 2VP1A 1B52A 4LZ5A 4U1OA 2DWIA 1JEVA 2P2AA 3EQ1A 2XXRA 1IQ7A 1XHYA 3IORA 1Y3QA 5JK4A 1PBQA 3SKPA 4NWDA 5AA2A 5CRYA 4X1BA 1PC3A 5CMBA 4GD5A 5FHOA 5AE4A 3KEIA 1RYOA 3RQTA 4IO3A 5TU0A 4TLMB 3PD9A 5I56A 5HM4B 3MPLA 3TTMA 5L8DA 1M5DA 4G4PA 1H76A 3QXMA 2GRVA 4QFOA 4JXIA 4YKIA 5EYFA 3MZ1A 1OQHA 1TFAA 2H5YA 4BDNA 4JWYA 1P1QA 3O97A 4F3GA 3KSXA 4NF6A 4IY5A 1Y4TA 2HZKA 3G3KA 4Z0IA 3H03A 4ISUA 4G68B 2DWHA 1FQBA 4IY6A 1MY2A 4AB6A 4DXUA 1MPDA 4AB5A 5CBSA 1PB8A 2I4CA 1KWHA 5IAIA 1N3XA 4X9TA 1POTA 2ALUA 3I6VA 3KFMA 2E1SA 1SW4A 4G8HA 2V3UA 3DELB 3QUFA 4G68C 3Q29A 5IKBA 3O6GA 1MQDA 3TPAA 1SQYA 3TODA 1VR5A 3H6UA 4ELQA 3K2DA 2QSXA 4OVJA 3CFXA 3S9MC 4I62A 4F1VA 2XXVA 2HFBA 3SEWA 3SERA 4E0XA 2RCBA 4K3FA 3ONMA 3PU5A 5I58A 2ANJA 4ZEDA 2Q89A 1B05A 1YCJA 2I0CA 4LA9A 1ZMGA 1EZOA 2ZMBA 5B70A 1A7LA 3T9VA 4O3BA 2Y7WA 2Z8FA 3KG2A 2A5SA 3MVZA 3FUZA 4IO6A 3K6XA 1F9BA 2YLNA 4LZ7A 1IXCA 4ONYA 4QRZA 1AIVA 2DSFA 4FEBA 4NTLA 3T9HB 3RT8A 3A09A 5TPAB 4U4XA 3EHTA 1DSNA 1GTKA 1AL3A 3C35A 3EHSA 3M8UA 2E0SA 4DZ1A 3IB2A 2Y84A 2HAVA 2DE3A 1MXYA 2ZNSA 3FD3A 4EF1A 2DOJA 4YMAA 3RGYA 4GFRA 2BJJX 1MPBA 3PMVA 3U8QA 1Y4CA 2QS3A 1YTVA 3HHFA 5TP9B 4QHQA 2OBGA 1OMPA 4OERA 1GVCA 2V84A 4FECA 3K4UA 1H45A 3OD7A 3PUWE 4G8MA 1LAGE 1SBPA 4KQPA 3S9EA 4YB6A 4ESWA 5EHSA 4R6HA 4ZECA 2DWJA 3GZGA 4YKPA 3V8XB 3L6HA 1ZTYA 4RK9A 3K0VA 1O7TA 2HZLA 1XT8A 1US4A 5KZTA 3IAZA 3OMBA 2XXTA 5ITPA 2XX9A 4U21A 1BLFA 1B7HA 4FJPA 2A5TA 2OZZA 1SI0A 1PDAA 3V89B 3G7WA 3SEUA 2R71A 5A5XB 4NWCA 3H6VA 4HCWA 3QAXA 4GOTA 1D9YA 4QSEA 3TTKA 1QULA 4KYEA 5KCJB 2Q8JA 5H8SA 3ILTB 2Q2CA 2F7AA 4FORA 4N07A 1OLAA 2Y7IA 3HN0A 2HEUA 3K6UA 1LGBC 2DP8A 5ICQA 3TAJA 2UYEA 4QFLA 2XXWA 3V5AA 1HSLA 4H5FA 4R6KA 5H8FB 2D3IA 2HQ0A 4EDPA 1B3FA 2DXYA 3A3UA 1MXZA 1S50A 4NMYA 4R72A 3K00A 3ECRA 3H4ZA 4PFUA 3THIA 3PPRA 3I5OA 3FV2A 3MZBA 5I2NB 3SEYA 5F7VA 2H4IA 1RYXA 3K6VA 1MRPA 4F39A 3MP1A 1OQGA 1O63A 3PUYE 3E9XA 1D4NA 4MFIA 4H5GA 2UYFA 1BP5A 3R6UA 4LQ2A 4H67A 3PUXE 3B6WA 5JTYB 3VLWA 1IXHA 1Y1MA 1ZKBA 3UK4A 3C36A 1ZLQA 1II5A 3FXUA 4DIGA 3IJXB 2F78A 1NL5A 3CSBA 1A54A 2OWSA 4RY1A 2B3FA 5FTIA 4X1DA 3CFZA 4FATA 1CB6A 5K2YA 1RKMA 1Y20A 3IJOB 4I1DA 2I49A 2ZXTA 2QS4A 2ZYKA 2AL5A 5I56B 2D21A 2PYYA 4GXAA 2DXRA 1MXUA 3U92A 4OTEA 4P11A 4U23A 4UA8A 1LCFA 2F5XA 2H25A 4F2QA 5I2KA 4R9GA 4XKNA 4U2RA 4FAJA 2I0BA 2QJEA 4XKRA 1EH3A 3VLUA 4F3SA 3WAEA 3T93B 4YMBA 1MM6A 2PT1A 3JYRA 3LR1A 1PB9A 1AOVA 5L9SA 4PP0A 3U94A 3HPIA 5DVIA 3RTFB 3BKIB 4NF6B 1H3DA 3PGFA 1SW2A 2Q2AA 2OWTA 1JW4A 2PMSA 3PPPA 1NFTA 1XVYA 3ZKKA 4THIA 5CI5A 4MF3A 4F3BA 4KI0E 3KN8A 3DP6A 1MG1A 3TCGA 2AYSA 4OEUA 3DP8A 2AL4A 3TMGA 4WEDA 5DVFA 2XXXA 3FXQA 5EHMA 2H9BA 1LAFE 2FA7A 4F22A 5JEIA 5AA1A 3OO7A 4KYDA 1UIVA 2P1SA 1D3KA 3MPKA 4Q0CA 3M3KA 1AMFA 2F35A 1ZBMA 4RYAA 5DYHA 3IOUA 1UTBA 5I58B 3FIRA 3VXCA 2XX8A 3KN3A 3UGWA 3O6HA 4O3CA 4R75A 4ND9A 5H8QB 3IR1A 1UTHA 4PFWA 4QFNA 1NKXA 1P1WA 3H3GA 2DVZA 4GIZA 3T22A 2RF1A 3I3VA 1B0LA 4KYSA 1ZJLA 4AQ4A 1NNKA 2Y7PA 2ZYOA 4LONB 1B3HA 3G3FA 4OWDA 4ESXA 3TQLA 3UP9A 3FVGA 4F31B 2YPNA 4RNSA 4TOZA 2RKMA 2QS2A 2LAOA 2B65A 3DM0A 3IL1B 2XHDA 4ZZEA 4PETA 4JBZA 4ZEKA 3E4RA 3KGCA 2UVGA 3H6TA 1WDNA 5I59B 1B1XA 3C9HA 3VVDA 2NXOA 4G2ZA 4P0GA 4OEVA 1I6AA 5M2VA 3TCFA 3K1PA 1HSEA 4EXLA 3MZ9A 5DTBA 1LSTA 1N76A 3U72A 5I57B 3PD8A 3MJNA 3C34A 3RT6B 3VXBA 1N3WA 2XXPA 1OLCA 3MC2A 3W9WA 2Q9TA 1SW5A 4NEDA 4NF5A 3LSXA 4ELOA 4H0WA 3Q26A 4GVOA 3HSTA 3TTRA 4HTGA 3MW0A 3M3LA 3TELA 4I8CA 3IX1A 2A5TB 2Y7RA 5F1QA 1MY1A 2Z23A 4Q8RA 1B7ZA 5ELVA 1B3GA 1XS5A 4BDLA 1PBPA 1JVXA 1NNFA 2XXQA 3V83A 4EUOA 3TZAA 1URGA 2PT2A 2Z8EA 1A8FA 1URDA 4EQ7A 1FTKA 1USYH 2XXHA 4OQOA 4MH5A 3K02A 4RA1A 4ZDMA 3H06B 1R6ZA 3BFUA 1JEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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