4O3AA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.80 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3aA02
5F7VA 5I56B 4DCXA 2XXPA 3M3FA 1BLFA 2DSFA 1ZU0A 3PMXA 2HCAA 2ALUA 2DWJA 4X48A 4YB6A 1KWHA 1RKMA 1JW1A 1GGGA 3Q25A 3DP4A 4RXLA 3PPRA 5H8HA 4MH5A 1QJMA 4OMBA 2I0BA 2VHAA 2O68A 5FHOA 2ZYMA 3KOTA 4GL8A 4ZEBA 2DE2A 4QSDA 3VLVA 3O97A 1J1NA 5L9SA 3U92A 2F6GA 1SI1A 1R6ZA 1T0KA 5HBCA 1B32A 1B3FA 5H8HB 3LR1A 3WAEA 4WKMA 1SI0A 1LCFA 2F78A 4LZ5A 4R2FA 3VDFA 2RC8A 4XKPA 4RA1A 1B3GA 5ELVA 3N26A 3TTNA 3M3KA 2R71A 2HZKA 4GWOA 3IJOB 1A99A 4F2QA 4IB2A 4R72A 5JK4A 2G93A 1NMUA 1LFIA 3P7IA 4EQBA 3DM0A 4LQ5A 3KN3A 4XKQA 5CMBA 2PX1A 5H8SA 3EPEA 4YKPA 3LSLA 2I58A 3OO6A 4H0WA 3G3HA 3KZGA 1LB9A 2FA7A 2HAVA 3SESA 3LSWA 4XXUA 4YZZA 4BDOA 5FHMA 5FTIA 4NWDA 4JWXA 2AYSA 1PC3A 1R9QA 3O6IA 3CG3A 4KFQA 1Y4CA 4I9DA 2I4CA 3SEWA 3EQ1A 3GXAA 1MQJA 3TTRA 1D4NA 3TKDA 3O28A 1LCTA 1A8FA 1SBPA 4NF6A 4LA9A 2QPQA 4XTCQ 3TAJA 4YB5A 4G8MA 1UIVA 4DDDA 4AB5A 3R6UA 4H8JA 2DVCA 3M8UA 3OMBA 3C35A 1LAXA 1N3XA 4Q8RA 4N07A 2I3WA 4RY1A 4KI0E 1B9JA 4NTLA 4YICA 3TTLA 1N7XA 4NF6B 2H9BA 4F2OA 2VD3A 2HFBA 3V83A 1PB9A 1IIWA 4HCWA 3T9VA 1JEVA 5CBRA 5L9OA 3GBBA 1PB8A 3OO8A 4L17A 5ITOA 3JYRA 3DELB 1NNKA 3TDJA 1MY2A 5FHNA 3PMWA 4FJPA 4RNSA 4EF2A 2KLFA 2YJPA 2DQVA 4H5FA 2FNCA 4R9FA 1LAHE 3HN0A 3K4UA 2O1LA 4OERA 1OVBA 3K1PA 4U2RA 4DE8A 2Z8DA 3K6WA 2QMWA 2UYFA 1QW0A 1VFDA 3IB0A 3U8QA 4R2BA 1B58A 2XXUA 4KR5A 2B3FA 3C34A 4F3SA 1MQHA 4RK2A 4PFYA 1LAGE 1DPEA 4FAJA 3BBRA 1MQGA 3CRBA 3FV1A 3IOUA 4OFJA 1D9VA 4DZ1A 4EF1A 4HS7A 1Y1ZA 1EH3A 5M2VA 1OLCA 1PBPA 5TU0A 1GVCA 1N84A 4F39A 3R7XA 4G68A 4ELRA 4F1VA 3L6GA 3TTKA 4MLQA 1EZOA 1FTLA 4OFLA 1UIUA 5CRYA 1FQEA 4KCCA 3C4MA 1MRPA 4NEDA 4XIGQ 4JXIA 2PT1A 3EF7A 4GXAA 4EUOA 1IUDA 3O29A 4R75A 1ATGA 2ZNTA 2VP1A 2DE3A 3FXQA 2F35A 1B6HA 1P1NA 1FW0A 4G68B 2O6AA 3C9HA 5H8FA 1DTGA 3K1MA 4OYVA 3CSGA 4I1DA 2XXTA 1O7TA 3FVKA 5AE4A 4TLMB 2OLBA 4YAHX 3OENA 5CMMA 2OBGA 1AOVA 3KSXA 1DSNA 5CM6A 5I59A 4POWA 3BKIB 1M5EA 3B7DA 3PUZE 5I58A 2DYXA 3QYTA 1SD3A 3RUMA 4ZEFA 5H8FB 1IXIA 1NH7A 4OWDA 4F31B 1A55A 4H8IA 4U4SA 1URDA 3MVXA 3V5AA 4DIGA 2I49A 1LBCA 3UP9A 1MY3A 1NNFA 1GR2A 2E1SA 2QS4A 4H5GA 1P1UA 1S9TA 4F29A 5I59B 2REGA 1PB7A 3T93B 5KZTA 4U1OA 3PUYE 1B5JA 1I69A 4GF8A 5I58B 3R26A 5LOMA 2RF1A 2GRVA 1USYH 1QVSA 3TYHA 2PBWA 1IXHA 5CMKA 3HO7A 3A09A 2F8DA 2DXYA 4EXKA 4LZ7A 3IO6A 3CI8A 5DVJA 3MUQA 3U72A 1H43A 3SEYA 3S9NC 2NUVA 1D3KA 2Y7KA 1NNTA 1US4A 4YKJA 4IGRA 3TPAA 2G29A 2Q9TA 4FEBA 2XX8A 1MDQA 2DWHA 2QRYA 3O9PA 3MZBA 4NMYA 1YAEA 2A5TA 2V93A 1XVYA 3TQWA 4R6HA 1B3EA 4EXLA 4F1YA 4GIZA 4AB6A 3G3JA 4OQOA 4O3AA 2E0SA 1MY4A 1UQWA 1LSTA 5DEXA 3S9MC 1SW5A 4HCYA 3K02A 4JSOA 4Q0CA 2A5TB 3USDA 3IJXB 3B6TA 1ZBMA 4BLAA 3IB2A 2W7YA 3H7MA 3K6XA 1MPCA 1US5A 1SYHA 2WKYA 3RT6B 1A40A 1JEUA 1MXVA 5DEXB 4U1ZA 3MZ1A 4IO4A 3K2DA 2D21A 3W15C 1M5CA 1B5IA 1I6QA 3CFZA 1BIYA 3KG2A 1D9YA 1FQDA 2RKMA 3N6UA 3RY3A 1N04A 4IO2A 4ND9A 3E4RA 4LATA 4KCDA 3KFMA 4U22A 2XXQA 2H99A 1AIVA 3SDFA 3IOVA 1FQCA 3K6UA 3IK6B 4Q5TA 4TOZA 2NOOA 2QSXA 3IR1A 5EYFA 2O51A 1YTVA 3KJ7A 2I4BA 3ZKLA 2UVJA 1IITA 2PYYA 4LP2B 1M5DA 2A5SA 1UTHA 3K1NA 2REJA 4ZDMA 3EHTA 4R9GA 1AL3A 1MY0A 4G77A 1MPBA 3KN8A 3B6QA 3FGSA 2OJTA 1H76A 3FJMA 4LVQA 3ZKKA 2VGQA 5JTYA 3U93A 2RINA 2QS2A 1O64A 3TODA 2P0SA 4C1UA 4Q30B 1POY1 4P0GA 3PUVE 5ISUA 4PQJA 5F1QA 5CBSA 3OEMA 2I3VA 1LFHA 1UTHB 1FQBA 4JWYA 1OMPA 5J1DA 1EZ9A 4ECFA 1JW5A 3MJNA 2Y7WA 1JETA 1EZPA 4MBPA 2V3TA 5JEIA 1ZTYA 1OLAA 4XKRA 1M5FA 3PPPA 1URSA 5JTYB 3QXMA 2R9JA 5TP9A 4LQ2A 1MXYA 1MXZA 1MDP1 2ANJA 1NFTA 1A7LA 3K6VA 1Y1MA 2AL4A 3KEIA 1YPNA 2B3BA 4PFUA 2OK2A 3OSRA 3HV1A 1ZIUA 3FASA 3G3GA 3E3KA 5B70A 2IA4A 1N3WA 4JWOA 5TP9B 1TWYA 3ONMA 1MH4A 1ZKBA 1B1HA 4U23A 4BDLA 2HQ0A 1VSOA 2UVHA 1LBBA 4THIA 1Y4TA 3OD7A 5CMCA 3CFXA 3N94A 3RGYA 1TFAA 3IX1A 1B1XA 2Y7PA 4RK9A 1B3HA 4G4PA 1XHYA 3QAXA 4BDNA 1O63A 4QFOA 5TPAA 3TCGA 3OOAA 3H6WA 3MP8A 4F18A 1QUJA 4IO7A 1PEBA 1SDXA 4F1UA 2OCUA 1VE4A 3OXNA 3H6VA 2UVIA 3IOTA 3TTMA 3Q29A 3QSLA 3G3KA 4C1TA 2RC9A 3TQLA 3RPWA 4YKIA 4U4XA 5I84A 3N6TA 4ELPA 3KJTA 2P2AA 4WXJA 3DP8A 5TPAB 3MZ9A 1IXGA 4ZZEA 4PETA 4E0WA 2V3UA 3VE1B 1M5BA 4GRKA 1I6BA 3UIFA 5K2YA 4XKNA 4H1XA 2R6GE 4ZECA 4GQOA 3MWBA 4F22A 3MQ9A 3CG1A 1JW4A 2THIA 1XVXA 4ZZAA 2H98A 3W9VA 3HPIA 2OWSA 3LSFB 4IY5A 1JVYA 4K3FA 3KOSA 2D5WA 3G3FA 1MXWA 1Y3QA 2DWAA 3W9WA 4H6DA 4YMAA 1URGA 1QUIA 5AA1A 2F97A 1B46A 2O69A 2YPNA 2RC7A 1A8EA 3IL1B 2FYIA 2DOJA 1BTJA 3K01A 4RJZA 2ZNSA 2QJEA 3PUWE 3RQTA 5AA3A 4ZE9A 1MPDA 2Z22A 4NF8A 3MBPA 3IAZA 4M1VA 4JBZA 1QKAA 3I3VA 4O3CA 1N76A 1SQYA 3THIA 2I6EA 1HSLA 4X9TA 4F3GA 3RLFE 1F9BA 2XX7A 1B0HA 3RNNA 2M8CA 1POTA 1MM7A 3VV5A 4G8HA 4LUBA 2XXWA 4X1BA 3PV0E 1CB6A 5EHSA 4F19A 2UYEA 1DOTA 3MPKA 2PT2A 4POXA 1MY1A 2GHBA 2XXIA 5ICQA 3TZAA 3MVYA 2H25A 4NF8B 3UK4A 3JZJA 1ZMGA 3OO9A 4WEPA 4ZEKA 2VOZA 3RTFB 2B65A 1EU8A 3MPLA 1PDAA 1ZLQA 3FVNA 4RPNA 1B4ZA 4MLVA 2ZMBA 2YLNA 3C32A 5DT6A 3S9LC 4QHQA 1B4HA 1SYIA 4NF4A 4OEVA 3OO7A 4OESA 1MH3A 1DPPA 4AQ4A 2Q2CA 3I5OA 3MC2A 1B51A 1R9LA 4IO3A 4M4GA 5KCJA 1MXUA 1MQIA 5EHMA 1BP5A 3FZVA 4QFLA 3PGFA 1N7WA 4NE4A 4GD5A 2HAUA 1P1QA 4JB7A 4LONB 2ZYNA 3PD8A 4DCYA 4IY6A 4JDFA 5CI5A 3WAFA 1FTJA 4YKKA 1H44A 4EDPA 3MP6A 1MM6A 2DP8A 1B52A 4NF4B 3S2VA 1P1WA 3ODBA 3JV9A 1XOCA 1LLSA 2X26A 2ESNA 2CZLA 1H45A 1GV8A 3IORA 2V25A 5KCJB 2O7IA 4BDMA 3VXBA 2GH9A 2XD3A 2GHAA 4E0XA 3C36A 4X1DA 2DE4A 1NKXA 1LAFE 5L8DA 2F36A 3HCQA 3UORA 4QFKA 4FIMA 5AA2D 1OIBA 3ILTB 3VVFA 2O84X 1NL5A 1I6AA 3SETA 4TQUQ 3AXFA 1YCJA 3A3CA 2RCBA 3TCHA 2DWIA 4KPTA 2XXHA 3KGCA 1FTOA 4FE8A 4KHZE 2ZNUA 1VR5A 4KD5A 4DXUA 1FTMA 3CSBA 2PVUA 5DYHA 2D3IA 3H4ZA 4N13A 1JQFA 1DMBA 1FQFA 3PPNA 3H6UA 1MXXA 3U1OA 4OTEA 2ONRA 4G8NA 4QSCA 2DVZA 3OEKA 1S50A 1Y9UA 3T9HB 4I8CA 3SEXA 1Z7ME 3G7WA 3V8XB 4EQ9A 4O3BA 1MG1A 3ILUB 4FORA 2I0CA 1FCKA 1B2HA 1Q1KA 4FEDA 2Y7IA 3B6WA 4QSEA 1AH5A 5DVIA 3QIMA 2CMOA 3IOWA 3FXUA 4IO5A 3TELA 4ONYA 4KYEA 3OELA 4OENA 4I62A 1PBQA 4GVOA 3S4UA 3E9XA 3FD3A 3FIRA 3T9UA 3Q28A 1HSEA 1JNFA 4GXSB 2ZYKA 3SEUA 5I2NA 2X7QA 4FECA 1AMFA 1B05A 1IXCA 2Q89A 1NH8A 1H3DA 3EN3A 4KQPA 4FATA 4HW8A 3RT8A 3UGWA 1WVJA 3HSTA 3D4GA 1Q35A 3D4CA 3PMVA 3Q27A 2AL5A 2XXYA 3HHGA 2O7UA 5AA4A 4TLLB 3K00A 5I2NB 2ONKE 1LB8A 3FJGA 4YB7A 3TCFA 4G68C 1IZ1A 3T9XB 3KN7A 2XD2A 2ZYOA 5DTBA 1FTKA 3C33A 2Y7RA 1XT8A 3MVWA 3DLNA 2VD2A 1IEJA 1ANFA 4LZ8A 3G3IA 3BFUA 4NWCA 1RYXA 4OETA 1CE2A 1R1NA 3ZS6A 4GL0A 1GTKA 5AA4B 3K0VA 1LFGA 3RTWB 4QFNA 4UACA 4QF9A 4YU0A 2NXOA 1XS5A 3MP1A 2Z8FA 3FUZA 3PUXE 2F7AA 4PFWA 3VVEA 4DXBA 5CC2A 3VVDA 3GLBA 3LC8A 2UVGA 1Y20A 1SVXB 2IEEA 1FQAA 2LAOA 2X7PA 2Y84A 4DLDA 4QRZA 2RCAA 3TMGA 4KYDA 1OQGA 3KSJA 3F11A 3SEVA 1IQ7A 4OEUA 3S9EA 2OWTA 2UXAA 3PPQA 1DTZA 3O6HA 3ZSFA 5A5XA 3FV2A 2O1MA 1LGBC 5IKBA 4P11A 4MFIA 2QMXA 2H4IA 2ZXTA 4OVJA 3OSQA 1SW1A 4NF5A 3FXRA 5ITPA 3FJ7A 3MW0A 1OVTA 5BWJA 3IB1A 3VFJA 2XX9A 1QKBA 3FVOA 4PP0A 4RPOA 5A5XB 3M3LA 3CFLA 5DVFA 1QUKA 3QUFA 3N5LA 2NVUB 3UN6A 1SW2A 4H67A 4GOTA 3LUYA 1B3LA 2XXXA 3QK6A 5H8NA 4R6YA 4NF5B 2XXRA 3C31A 3CR9A 1VFEA 3PU5A 1UTBA 4OXVA 4R6KA 3LBSA 1B7HA 3I6VA 5ICTA 4N6PA 3O66A 3O6GA 3VLUA 4OFOA 3T22A 2HZLA 3H06B 3RN8A 3BFTA 4ZE8A 3CIJA 3TUSA 3MVZA 1B5HA 2ABHA 5I57A 5FTHA 3ECRA 3VLWA 2QS1A 4R74A 3GBAA 5H8NB 1ZJLA 4JSDA 4ELOA 4DXCA 4ESXA 1UTBB 2GFEA 5B7DA 4PFTA 4EQ7A 1XC1A 1N0TA 3KBRA 4ZEDA 1TFDA 2Q2AA 2XXVA 3LSXA 3QUJA 5IAIA 4IO6A 5I57B 1S7YA 3Q26A 5KDTA 1HSJA 5BUUA 1OQHA 4PE5B 4OZ9A 5AA2A 5I2KA 2NWJA 1USYE 2F5XA 4F3BA 2HXWA 2DXRA 4YMBA 3SKPA 2QS3A 3UA8A 5L9MA 5K2XA 3PPOA 4QFPA 4GLIA 3H3GA 4ZS9A 1Z7NE 1MQDA 4WEDA 1A54A 2OZZA 3CVGA 4GFRA 5HPQA 5KDTB 4IGTA 1B0LA 1Y3PA 5AA2B 5I2KB 1QULA 4Z7EA 1P1OA 4P0IA 4MF3A 4OHNA 2V3QA 4C0RA 1ELJA 1RYOA 2Z23A 4BDRA 1BKAA 4RYAA 2Z8EA 2Q88A 3A3UA 3DP6A 2ONSA 2V84A 3TEPA 2AIXA 2PMSA 1SW4A 1L5TA 3GZGA 1II5A 1NNPA 2F34A 4U21A 4BDQA 1WODA 2P1SA 3E13X 2Q8JA 3H6TA 3IO4A 3L6HA 1Y3NA 2I48A 1P99A 3PD9A 3EHSA 4H65A 4ELQA 1B7ZA 3O2AA 2QL3A 3MAMA 3FVGA 2XHDA 5H8QA 3V89B 1WDNA 4Z0IA 4ESWA 1MS7A 4G2ZA 3VXCA 2H5YA 4KYSA 1TXFA 5I56A 3T66A 1JVXA 1TT1A 3T96B 3FATA 1B7UA 2BJJX 2F7CA 5HM4B 3HHFA 3EHUA 4HTGA 4R73A 3U94A 3H03A 2F6PA 2HEUA 2F7BA 1B40A 3SERA 2DS9A 5H8QB 4ZEIA 4ISUA 4F3PA 4UA8A 3TFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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