4O3CA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.50 a resolution
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA02
2I3VA 4NF6A 3RNNA 2V3TA 4Q8RA 2UVJA 1IZ1A 1B0HA 5FHOA 2OWSA 1MRPA 3MWBA 1RYXA 2NWJA 5I59B 4R6YA 4RA1A 4UACA 4H6DA 1B58A 1IXIA 4JSOA 3GXAA 1RKMA 2F34A 3CRBA 1DTZA 4R2BA 5FHMA 4QRZA 1Y1MA 4ZEKA 1UTBB 2ZYKA 3CFXA 4GLIA 4PQJA 4YKIA 5I56B 3I3VA 4NF5B 3ZS6A 5AA3A 3UORA 3IOWA 4GQOA 4LA9A 2XXQA 2E0SA 5KZTA 5H8HB 1I69A 4QFOA 1EZOA 1B6HA 1AMFA 3BKIB 3FJ7A 2XX8A 3PU5A 3PUZE 2CMOA 4I8CA 3O28A 1B3LA 2A5SA 5I2NA 4XXUA 4I9DA 3WAEA 3FVGA 1MQDA 5L8DA 4DIGA 5I57A 3DLNA 3VLWA 3U1OA 3HHFA 2XXUA 4M4GA 1MXZA 3DP4A 1IQ7A 4H8IA 4QSDA 3ZSFA 3SEVA 1N3WA 4LQ5A 5FHNA 1IITA 2ZYNA 5I56A 1D9YA 2ZYOA 1WVJA 4NF5A 3CR9A 2QSXA 3K1NA 1MDP1 4YB5A 3SESA 1PC3A 3IO4A 1ZKBA 4UA8A 4U22A 5ICTA 4PFTA 2R6GE 5HPQA 4YICA 2X26A 3CG1A 4H8JA 5JEIA 3C9HA 3I6VA 4Q30B 5KDTB 3FJMA 4ZZAA 3IAZA 3H6VA 4LP2B 4IGTA 3Q29A 5CBRA 3SEWA 2DSFA 4RNSA 1YCJA 2V3UA 2UVHA 4JBZA 3MUQA 3IO6A 4OMBA 5DVFA 3QAXA 3RUMA 2UVGA 4X48A 1PBQA 3EHTA 2XXPA 3T9VA 2F8DA 2Q2CA 4I1DA 1LLSA 3QYTA 4IO2A 1S7YA 2OWTA 3L6GA 3OD7A 1US5A 2O84X 3M8UA 3S4UA 3TYHA 4IY6A 1B7ZA 3MP8A 4OENA 3MAMA 4OXVA 2AL4A 1UTHA 1M5EA 4WEDA 2V25A 4PFUA 4QF9A 2GHAA 2PVUA 3T66A 1N7XA 2OZZA 1MQIA 1JW5A 1PB8A 2DYXA 3V83A 2QPQA 3KJTA 1B32A 4JWXA 1D9VA 4EQBA 4GVOA 5EHMA 4AB6A 1Z7NE 1H44A 2QJEA 2ONSA 2QS2A 3MBPA 3MP6A 5CMMA 4EF1A 4U4SA 2XD3A 2GRVA 5ISUA 2Y7IA 3TCGA 1MY0A 3R26A 4OQOA 4DE8A 4YMAA 4R75A 3ONMA 1TFAA 4BDMA 3U72A 1LGBC 1JW4A 1O64A 2FNCA 1I6AA 2F7CA 1Y3QA 1YPNA 4ONYA 3D4GA 5H8QB 5AA2D 2GFEA 3FV1A 5EHSA 5H8FB 5JTYB 4ESXA 4GRKA 2P2AA 2RC7A 1SYIA 4FATA 1MXVA 4EQ9A 2F5XA 1NL5A 3C34A 3FVOA 2DWHA 1QJMA 3B7DA 1IXHA 1R6ZA 3PPNA 1ZLQA 4OEUA 4ZZEA 5DTBA 5I58A 3IL1B 4F2QA 2O68A 2PX1A 2W7YA 4JXIA 1GV8A 4NWCA 4Z7EA 3GZGA 4LZ8A 2I48A 2PMSA 1ZIUA 2V84A 4DXCA 4R2FA 1P1UA 1LCTA 3C33A 2Y7RA 4YB7A 2QL3A 3L6HA 1JW1A 4DDDA 3UIFA 4YB6A 2Z23A 2ZNUA 1N04A 3N6UA 1QUKA 3VLVA 3HV1A 4POWA 4OVJA 2RCAA 5DT6A 1FTJA 3JYRA 3DP8A 1DPEA 4EXKA 2O51A 1A99A 5I2KB 3FUZA 3K1PA 1LFHA 2I4CA 1N76A 5F1QA 1H76A 3UA8A 4U23A 3SERA 4YMBA 1UIVA 4GD5A 1D4NA 2DVCA 1B52A 5ITPA 2RF1A 2DE2A 3S9EA 1URDA 1OIBA 2F7BA 1P1NA 5TPAB 3K6VA 1POY1 3IORA 4R9GA 5EYFA 1GR2A 3M3KA 3FVKA 2DE4A 1P99A 4ELOA 5AA1A 3O97A 4F18A 4KPTA 4XKNA 3BFUA 4FJPA 2UYEA 3VXCA 1Q1KA 3C36A 2O1LA 5L9OA 2D5WA 2DOJA 1TFDA 4YKPA 2H5YA 4PETA 1TXFA 4C0RA 5I2KA 1GTKA 2DWIA 1URSA 3U94A 3PUWE 4MLQA 1Y3PA 5HM4B 1LB9A 1B1HA 1JETA 1QUIA 3ILUB 4Q0CA 1IIWA 1MG1A 3IOVA 1A8EA 3FIRA 4OERA 4FEBA 3S9MC 3SDFA 3IX1A 1TT1A 1Y20A 4OFOA 3K01A 3LC8A 1S50A 3H6TA 3H7MA 2Q88A 4X1DA 3C31A 4AB5A 2HCAA 3MZBA 3ILTB 3T93B 5TPAA 2QMWA 3VDFA 1ANFA 1M5DA 1II5A 1LAHE 3Q28A 3S9NC 1NKXA 1PBPA 4YU0A 2PT1A 1DOTA 4NWDA 4N6PA 4XIGQ 1H45A 4JSDA 1SBPA 1SYHA 3IB0A 4MLVA 1BTJA 2ABHA 2ZYMA 4YKJA 5LOMA 1P1QA 1MXUA 2KLFA 4JWYA 4HTGA 4ELQA 2VD2A 3A3UA 4BDLA 1FTLA 1MXWA 1XHYA 2FA7A 1IUDA 3M3LA 1Y4TA 2OLBA 1US4A 3QUFA 2DXYA 5CMKA 5ITOA 1EU8A 4U1ZA 4FIMA 5ELVA 3W15C 3BBRA 1OMPA 3KN8A 3RLFE 1B3EA 3RGYA 4TLMB 3C4MA 4IO7A 1MPCA 4LZ5A 5F7VA 3GBAA 4U1OA 4I62A 4F29A 4QSCA 3PPQA 4R73A 3U8QA 5K2YA 4RYAA 4GIZA 2XXXA 3MZ1A 1Y1ZA 3RT8A 1OLCA 2DP8A 4GL8A 4KYEA 4U21A 2PYYA 3M3FA 1A40A 1BP5A 1XVXA 4BLAA 4ZDMA 2X7QA 4H5GA 3KFMA 4YKKA 5I59A 3MC2A 1VFDA 5AA4B 4G77A 4IO3A 3OSRA 1XOCA 1B7HA 3IJOB 3RTFB 3TODA 3VE1B 1QVSA 1B3FA 4F3PA 3FV2A 1FQEA 1XC1A 2RCBA 2ONKE 5K2XA 1NNKA 1UTBA 4G4PA 3OO6A 4ELRA 4DXUA 4WEPA 4F2OA 3O6IA 4OWDA 4GF8A 1OLAA 2PT2A 3UP9A 4LATA 3FZVA 1B1XA 1URGA 3OXNA 5H8HA 3R7XA 4OEVA 3TTLA 4F3SA 2XHDA 3DM0A 3N5LA 1P1OA 1HSLA 4GWOA 3DELB 3OELA 2O7IA 1B40A 4NMYA 5DEXB 2V93A 1QKBA 2WKYA 1BKAA 2CZLA 3W9VA 1MY4A 4RJZA 1FTOA 3KSXA 3RY3A 3TTKA 5AA4A 3H3GA 1BLFA 2IEEA 3PD9A 3N6TA 1JEVA 4F22A 4THIA 1M5CA 4KYSA 4HW8A 4GFRA 4NEDA 2A5TB 1SW4A 5FTHA 4QFKA 5H8NB 4JWOA 3OENA 1YTVA 4LONB 3ODBA 2XXYA 4KQPA 3CG3A 3MVWA 4R9FA 3C35A 3MJNA 4FE8A 2ANJA 1OQHA 3FVNA 2I0CA 5AA2B 4BDRA 1JNFA 3G3KA 1B3HA 2AYSA 1QULA 3G7WA 1GVCA 3KEIA 3U93A 1O7TA 5I84A 1NNFA 4XTCQ 4GL0A 5DVIA 3T9HB 3KSJA 3PV0E 1JEUA 2F78A 1VFEA 1D3KA 3MQ9A 5KDTA 3E4RA 4O3CA 3OOAA 1LB8A 5KCJB 3K6XA 4MH5A 1CB6A 4QFPA 1USYE 1NNPA 3G3IA 2XXTA 2HZKA 5CMBA 1T0KA 3K00A 1IXCA 4F1YA 1MDQA 4KD5A 4RPOA 3JZJA 2DS9A 4BDNA 4RK2A 2A5TA 1MQGA 3RT6B 3TTRA 2BJJX 3Q27A 5H8NA 2UXAA 4POXA 1XS5A 4G2ZA 3KZGA 3PMXA 3EF7A 1AIVA 1Z7ME 2Y7WA 3G3JA 1RYOA 1VE4A 4ZEIA 4RPNA 1B51A 2XXHA 3RPWA 1Y3NA 3USDA 2Q89A 4PFWA 5CM6A 3RTWB 4YAHX 2LAOA 3OMBA 2O1MA 4R6HA 4ESWA 1M5BA 2OBGA 1NH8A 1R9QA 1JVYA 1BIYA 2HFBA 4R6KA 2RKMA 1NFTA 5KCJA 4GXAA 3IOTA 1L5TA 3LR1A 4ELPA 2QS1A 2PBWA 4FORA 4WKMA 4E0XA 3MPKA 4IY5A 2ONRA 4LQ2A 3VVDA 4JDFA 2H25A 5TP9B 2F6PA 4ZE9A 4EF2A 3O6GA 1NMUA 1JVXA 1MH3A 2B3FA 5H8QA 3H6UA 3V8XB 3TUSA 3IR1A 5H8FA 3ZKLA 5JTYA 5J1DA 3E13X 4OHNA 1A54A 2DXRA 1XVYA 1PEBA 3TQWA 3G3HA 3TMGA 2F7AA 2UVIA 3PPRA 4NF8B 4PFYA 4F19A 3FGSA 3ZKKA 1B2HA 1N7WA 2P0SA 3T22A 2Y7PA 4LVQA 4QFLA 4DCXA 3OEKA 3TAJA 3T9UA 1OVTA 2D3IA 3QSLA 1XT8A 5BUUA 1B3GA 3H4ZA 2M8CA 1POTA 3KGCA 4MF3A 3T9XB 2DQVA 3H6WA 1O63A 3R6UA 1N0TA 1SDXA 1LFIA 4KI0E 3HSTA 3TTNA 1N3XA 4ZS9A 4NTLA 3A3CA 3LUYA 3TFLA 3TCFA 3P7IA 3B6WA 1LAGE 4OETA 2R71A 3HO7A 1ATGA 1Q35A 1PDAA 4NF6B 1IEJA 5ICQA 1PB7A 2O7UA 4HS7A 3CSGA 3MPLA 4Q5TA 1Y9UA 3VXBA 4EUOA 3THIA 3UN6A 3IOUA 1J1NA 3K02A 3TPAA 2YJPA 5HBCA 1NNTA 1HSEA 1MY1A 3E3KA 4EQ7A 3FATA 3FJGA 1CE2A 2RC8A 3HHGA 1EZPA 4N07A 1ZU0A 5A5XB 4M1VA 3DP6A 4IO4A 3TQLA 4LUBA 2V3QA 4DCYA 1B46A 2I0BA 1SQYA 4DLDA 4G68C 3LSXA 1R9LA 1OVBA 4KFQA 3VFJA 3QUJA 1MXYA 2RINA 2RC9A 3KN7A 2Y7KA 4IB2A 1TWYA 2O6AA 1FQDA 3N26A 5I2NB 2DWJA 4G68B 4H5FA 1B5JA 5FTIA 3PPPA 2OK2A 5I57B 2F97A 1IXGA 1MS7A 4ISUA 2R9JA 3PMWA 4Z0IA 1GGGA 3TKDA 4R72A 2UYFA 2F6GA 5B7DA 4RK9A 3HN0A 3SKPA 1H3DA 1MY2A 3GLBA 4PE5B 2H98A 4H0WA 5A5XA 2I4BA 3D4CA 5CBSA 3FXQA 5L9SA 1SD3A 3SETA 4U2RA 1I6QA 2NOOA 3E9XA 3LSWA 3PUVE 3VV5A 4QFNA 2HAUA 1AL3A 4F39A 2F36A 4FECA 2ALUA 4DZ1A 4LZ7A 2QS3A 3PMVA 2IA4A 4OESA 5IKBA 3K2DA 3BFTA 1HSJA 4E0WA 4HCYA 4X9TA 3KN3A 4G68A 2Q8JA 3TELA 3ECRA 3FXRA 2XXVA 2VD3A 3EHSA 4ECFA 3MVZA 2ZNSA 3O9PA 3OEMA 3RN8A 1SW2A 3EHUA 1Y4CA 2VOZA 1UIUA 4X1BA 1F9BA 3B6TA 3EN3A 1FQAA 5H8SA 3MVYA 1VSOA 3CFLA 3U92A 1SW1A 3LSLA 3KG2A 1QW0A 1FQCA 2NUVA 1USYH 2NVUB 4BDOA 4PP0A 1OQGA 2THIA 4F3BA 1B9JA 4G8HA 1ZTYA 2HAVA 2AL5A 3TCHA 4ND9A 5L9MA 3K6UA 4MFIA 2B3BA 2QRYA 2VGQA 1UQWA 3O6HA 3MW0A 1MM7A 4ZEBA 1UTHB 2XD2A 4XKRA 3KBRA 2OJTA 3W9WA 5AE4A 3CI8A 4GXSB 4IO5A 3VLUA 4OFLA 4C1UA 1LBCA 4ZEDA 1B7UA 1ELJA 1MM6A 2G93A 3O29A 4O3BA 4BDQA 2XXRA 2H99A 4KR5A 1I6BA 2DE3A 4KCCA 1B5IA 3FXUA 1EZ9A 3IK6B 4P0GA 2Z8FA 1FQFA 3QK6A 3T96B 5CRYA 1B4ZA 2Z8EA 1H43A 1NH7A 3MP1A 2Z8DA 3I5OA 4AQ4A 1S9TA 2Q2AA 2XX9A 5BWJA 2QMXA 4OTEA 4F1VA 2VP1A 5I58B 2QS4A 3K1MA 1QKAA 5DEXA 4C1TA 5CMCA 3PD8A 1FQBA 1EH3A 2XXWA 2ZMBA 5B70A 3TDJA 3KOSA 4IGRA 3CIJA 1MH4A 4N13A 1MY3A 3FD3A 4MBPA 3H03A 3OO7A 1WODA 4ZECA 2I3WA 1SVXB 1R1NA 1LSTA 3G3FA 1QUJA 3TZAA 1YAEA 2H9BA 3TEPA 2E1SA 4QSEA 3VVFA 4YZZA 3QXMA 1B05A 2ZNTA 4EDPA 1MQJA 4KCDA 3F11A 3LBSA 3OO8A 5AA2A 4P11A 1FCKA 2ESNA 3AXFA 1ZJLA 4H67A 3O2AA 3S9LC 5DVJA 4FAJA 4L17A 3H06B 3QIMA 1DPPA 1A8FA 3K6WA 1A7LA 4WXJA 3PPOA 1MPBA 3A09A 3CSBA 1LBBA 3HPIA 3V5AA 4G8NA 2VHAA 1AH5A 5TU0A 1B5HA 3SEUA 4G8MA 4IO6A 1AOVA 4O3AA 3B6QA 3TTMA 1FW0A 3HCQA 1LAXA 3G3GA 2AIXA 2HQ0A 3N94A 3OSQA 4KYDA 3SEXA 2X7PA 5CC2A 1N84A 2YLNA 5IAIA 3WAFA 2HXWA 1VR5A 2GH9A 3V89B 2H4IA 2REGA 2GHBA 4TQUQ 3PUXE 2O69A 3UGWA 4H65A 2XX7A 3K4UA 2HZLA 4H1XA 2HEUA 3IJXB 1MXXA 2I6EA 2I49A 5JK4A 3JV9A 2I58A 2Y84A 4NF4B 3UK4A 3GBBA 3PGFA 4HCWA 3RQTA 3Q25A 4RY1A 4XKPA 1A55A 4U4XA 3MVXA 3MZ9A 3EPEA 4GOTA 5M2VA 4DXBA 4XKQA 3CFZA 3PUYE 4TLLB 2G29A 1PB9A 3S2VA 5TP9A 4RXLA 1FTKA 2Q9TA 3SEYA 2ZXTA 1DMBA 1MPDA 1LAFE 1MQHA 3OO9A 4NE4A 5DYHA 1KWHA 3C32A 3CVGA 4OFJA 2YPNA 4QHQA 3FASA 4ZEFA 4EXLA 1SI0A 3K0VA 3EQ1A 4F31B 4ZE8A 4FEDA 1JQFA 2NXOA 4NF8A 1DSNA 4JB7A 1P1WA 4F1UA 4F3GA 2XXIA 1SW5A 2P1SA 4R74A 2REJA 4NF4A 2DWAA 5CI5A 1LCFA 3IB1A 1B0LA 3LSFB 4KHZE 1ZBMA 1LFGA 4P0IA 2Z22A 2D21A 3O66A 1B4HA 1FTMA 4OZ9A 3VVEA 3KOTA 4K3FA 3Q26A 1ZMGA 1M5FA 4TOZA 1DTGA 1SI1A 2OCUA 2B65A 2FYIA 4OYVA 2DVZA 3KJ7A 1WDNA 3IB2A 2F35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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