4OMBA

Phosphate binding protein
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
AIDPALPEYQKASGVSGNLSSVGSDTLANLMTMWAEEYKRLYPNVNIQIQAAGSSTAPPALTEGTANLGPMSRKMKDVELQAFEQKYGYKPTAVPVAVDALAIFVHKDNPIKGLTMQQVDAIFSATRLCGSKQDVKTWGDLGLTGDWAKKPVQLFGRNSVSGTYGYFKEEALCKGDFRPNVNEQPGSASVVQSVSQSLNGIGYSGIGYKTASVKTVALAKKEGAAFVEDNEQNALNGTYPLSRFLYVYVNKAPNKPLDPLEAQFLKLVLSKTGQQVVVKDGYIPLPAKVAEKAIKELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title The Pseudomonas aeruginosa phosphate transport protein PstS plays a phosphate-independent role in biofilm formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate binding protein
total genus 94
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ombA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ombA01
4NF5B 4LUBA 1LB8A 1B7HA 2PYYA 4PFYA 2X7PA 1D3KA 1DPEA 1B6HA 4OYVA 1XC1A 3VE1B 3OXNA 4F19A 4R73A 3L6HA 2ZYNA 2ONKE 3H4ZA 1SVXB 5CMCA 4JXIA 4OXVA 4GXSB 1OIBA 1S9TA 2RF1A 1JETA 4U22A 1MPBA 4HCWA 1H43A 3FD3A 5I56B 1PBQA 5I57B 1NL5A 1URGA 3W9WA 4XTCQ 4YICA 2A5TB 3VLUA 5ITOA 2IA4A 3VXCA 4HCYA 1L5TA 4JWOA 2QS1A 4GL8A 4XXUA 1MH3A 3FV1A 2I48A 5AE4A 2F7AA 2I6EA 2QL3A 1AIVA 2O7UA 2XXRA 3K02A 4F39A 1H76A 1P99A 2DVCA 3LR1A 2DWAA 4C1UA 2F7CA 5I59A 3F11A 3USDA 4RJZA 2ABHA 2Z23A 4JWYA 1OVTA 1VR5A 2G29A 2YJPA 3TTLA 4JWXA 2HEUA 1LCTA 3VLWA 1GV8A 3D4GA 2QPQA 3KFMA 2XXIA 1BIYA 3O28A 4IY5A 3OD7A 2XXWA 1SDXA 3RN8A 3FXUA 5EYFA 5B70A 4Q5TA 1B5JA 1B3EA 3PU5A 4EF1A 2Y7RA 1Z7ME 4OHNA 4RPOA 1B5HA 3CG3A 1FTMA 1B1HA 1CE2A 2D5WA 4RPNA 1MXZA 2ONSA 4YB6A 4NF4A 2DWHA 2DP8A 5I2KB 1OQGA 1M5CA 1MH4A 1AOVA 3PUVE 3PPRA 4KYDA 1XT8A 3FJGA 3FJ7A 4DXBA 4BDRA 4YB5A 4ZEDA 4QHQA 2THIA 1JW1A 4OFJA 2X7QA 3LSLA 2UYFA 3DP6A 4JSOA 4IB2A 4NF6B 3OO7A 1M5DA 5TP9B 3G3HA 1Y4TA 3K6UA 3LUYA 5ICQA 4OVJA 3C34A 4MLVA 4GF8A 3A3CA 2F5XA 3MPLA 5DEXA 2H25A 4Q8RA 3V89B 2PT2A 5H8HA 1WVJA 3CFLA 5AA2A 4FORA 4KR5A 1DSNA 3G7WA 4F2QA 4DCYA 4BDQA 2O68A 1N3XA 4Q0CA 1MG1A 3THIA 4F18A 3OO9A 3RQTA 1QJMA 1UQWA 2Z8DA 4U2RA 1B0LA 4GL0A 3CVGA 4GD5A 3K1PA 3TEPA 5AA4A 4DXUA 1MQGA 3G3JA 5CRYA 1A8FA 2OCUA 1GR2A 2ZNSA 3U8QA 4OFOA 4G77A 4XKNA 3SESA 4G8HA 1FTJA 4POWA 4HW8A 3MUQA 5I58B 3CFZA 4RK9A 4F22A 3RGYA 3CSGA 3O6IA 1POY1 3H6VA 4AB6A 2Q89A 2RC8A 3N6TA 3T9XB 1Q35A 4KCDA 3MZ1A 4BDNA 1B7UA 1Y3QA 4GVOA 2Q88A 2ZYOA 3G3GA 3T22A 4YMBA 3IJOB 3TUSA 3U94A 2ZYMA 3QYTA 1B9JA 1SI1A 1HSLA 3LSWA 3JV9A 2GH9A 1UIVA 3B6WA 1LGBC 2DWJA 5DVIA 3Q29A 4FAJA 3U93A 5J1DA 1JW5A 3DLNA 1MS7A 4F1VA 3EPEA 3TFLA 4ELOA 1P1WA 2V93A 1PC3A 2HQ0A 5ELVA 3DP8A 1UTHB 3Q26A 3MZBA 2M8CA 3SERA 1NNKA 1ZJLA 3QUFA 3B7DA 2I58A 4OMBA 3QXMA 3FVGA 5H8SA 2UVGA 1OLCA 1SW1A 2KLFA 1USYH 4BLAA 3JZJA 2ONRA 4LZ7A 5K2YA 3VXBA 3TTRA 2QMWA 4ESWA 1IEJA 5M2VA 3EHSA 5BWJA 1LB9A 1XVXA 1I6AA 4OZ9A 1ZKBA 3HSTA 3MVZA 2UVHA 1TXFA 4P0GA 2GHAA 1N0TA 4I8CA 3IOWA 3K0VA 4HS7A 2Y7PA 3UA8A 5FHOA 1MY4A 4YKIA 1B7ZA 4NF8A 2HFBA 2VD3A 2V3QA 5H8QB 1EU8A 4IO7A 2RINA 1ZLQA 5ISUA 4RYAA 2H4IA 2F6PA 5CMMA 2Q8JA 2DE3A 3ILTB 4EQ9A 1LSTA 1A54A 4PFUA 1WDNA 4BDLA 4H8JA 5K2XA 1SW2A 2XHDA 3KSXA 1JQFA 4LQ2A 1MY3A 4DIGA 4QFKA 1SYIA 5JK4A 4M4GA 4WXJA 1RYOA 1A55A 5F1QA 4G68B 5JTYA 3Q25A 1DTZA 2ZNUA 5H8FB 3MJNA 4M1VA 5HPQA 3SEYA 2VP1A 1ZU0A 3SEWA 5TU0A 4HTGA 3OOAA 1VSOA 2F8DA 1ATGA 2RCAA 4QFNA 3VV5A 2WKYA 1DMBA 1N84A 1IXHA 4GQOA 2OLBA 4X1DA 1EH3A 4EUOA 5DYHA 3TYHA 2NOOA 3T9UA 1SBPA 1SI0A 4XKQA 3IAZA 2NWJA 1LCFA 4LZ8A 4GIZA 4YU0A 4ELRA 1P1NA 1YPNA 3SETA 3QUJA 3H03A 3EHTA 1LAFE 4U4XA 4KYEA 5I2NB 1BTJA 5L8DA 3CIJA 2V3UA 2Q9TA 4RXLA 4WEDA 1JW4A 1B0HA 4P0IA 3PPNA 2R71A 4KQPA 1OVBA 5ICTA 3SDFA 3KOTA 4GRKA 2ANJA 3KG2A 5I56A 3FGSA 4ISUA 4IY6A 2OWTA 2A5TA 1MQDA 3TCGA 3V83A 2Q2CA 1O7TA 3IK6B 2H98A 4GWOA 5FHNA 1QUIA 3ZKKA 3KBRA 3Q28A 1QUJA 1LAXA 2YLNA 1DPPA 1LLSA 4OETA 4NMYA 1A8EA 1H3DA 1NH8A 4GFRA 2GRVA 1MM6A 2FA7A 3T9VA 2DYXA 1FW0A 4H5GA 4F29A 5KZTA 2AIXA 1KWHA 4F31B 2XXUA 2BJJX 1LFGA 3S2VA 3MAMA 1NNFA 1Y4CA 3FXQA 4DZ1A 5L9MA 4F3BA 4QF9A 4ELPA 3GBBA 3BFTA 2E1SA 1S50A 3K6WA 5H8NA 4MFIA 3TCHA 1I69A 1MPCA 2XX7A 3CRBA 4ZDMA 1Y3NA 1XOCA 3U1OA 1D4NA 4UA8A 1D9YA 1SW5A 1JVXA 3DM0A 1IUDA 3OEKA 4YKJA 2DQVA 4G68C 4WKMA 4OTEA 3MZ9A 3DP4A 4F1YA 3FXRA 2GHBA 2W7YA 3VDFA 1MPDA 3O29A 1B52A 1GGGA 1N3WA 4NF4B 3PPOA 4DLDA 3TTMA 3MP8A 3P7IA 2A5SA 1MDQA 1I6BA 3C4MA 4OEUA 1RYXA 2I3WA 2DXYA 4YKKA 1MY2A 3H7MA 4ZEKA 3C33A 2Y7KA 4OESA 3O6HA 4QFLA 3B6TA 4NF6A 5TP9A 3K00A 1YCJA 2P1SA 5DVJA 1ZTYA 3LC8A 3LSXA 3MVXA 1A99A 1QULA 4IGRA 1IXCA 1TT1A 3PUWE 5IAIA 2LAOA 4JBZA 3N6UA 3OELA 3BFUA 4R9FA 1PB8A 1XS5A 1MXUA 1FTLA 2QSXA 5H8HB 5CM6A 4LATA 3K01A 3DELB 3K4UA 3VVEA 4GXAA 3ECRA 3HPIA 4H6DA 3KJ7A 3N26A 4R9GA 1IZ1A 4ESXA 2PX1A 2H9BA 1TFAA 4QFPA 3FASA 4GLIA 3H6TA 4KCCA 2F34A 3FJMA 1BP5A 4FATA 2F78A 3RNNA 3QAXA 4YMAA 3PMVA 4C0RA 3I3VA 3K1NA 2DSFA 4EDPA 4GOTA 4YB7A 5AA4B 3OSQA 4F1UA 3RLFE 4Z0IA 1B3GA 2FYIA 1OQHA 1OMPA 1IQ7A 4ZS9A 3MQ9A 3N94A 1TFDA 3FUZA 4NTLA 3IO4A 1MM7A 5KDTA 1LFHA 3TTKA 3UK4A 3W15C 3G3KA 1IIWA 3H6WA 5L9SA 2OJTA 5AA2D 4DCXA 4R6KA 3WAFA 2CMOA 3S9MC 4XKRA 1SYHA 1H45A 4ZEBA 3KOSA 3MWBA 4PETA 2XXVA 3OENA 3TDJA 4ZEFA 5HBCA 1EZOA 1MRPA 3H6UA 4F3SA 4H5FA 2O51A 3OSRA 4IGTA 5CI5A 1FQAA 1WODA 1TWYA 1P1OA 3ZSFA 5EHSA 4KD5A 2B65A 3U72A 2AYSA 4L17A 1J1NA 3GZGA 1B32A 2UVIA 3KSJA 4ELQA 3RPWA 3ONMA 1B3FA 5L9OA 1R1NA 2I49A 1AL3A 2HAUA 1QW0A 4G8MA 1D9VA 5AA3A 2D21A 3VVFA 3S9NC 1NNTA 3WAEA 4C1TA 5I84A 5CBRA 2D3IA 3ODBA 2V84A 1PB7A 2QS2A 4G2ZA 2YPNA 2PT1A 5DVFA 1IXIA 3TKDA 1FCKA 3FVKA 5F7VA 2UVJA 1B58A 1HSEA 3TQLA 1B3HA 1LBCA 4ZZEA 2DE2A 5HM4B 1NH7A 3VLVA 4O3CA 2ZMBA 2OBGA 1XVYA 4TLLB 3CFXA 5CMBA 2RCBA 1URDA 2XD2A 3TELA 3OO6A 4R2BA 3RTWB 3CSBA 4NF8B 3PMWA 2F36A 5KCJA 3KGCA 5A5XB 4R74A 3R7XA 5EHMA 4MLQA 2XXXA 4WEPA 1R9LA 1USYE 1ZBMA 1UTBB 3SEVA 1B05A 4KPTA 1MXYA 4O3AA 2RC7A 3TAJA 2I4BA 4BDMA 4YZZA 4X9TA 2Z8EA 3UN6A 1SD3A 3LBSA 1O63A 4FIMA 3PGFA 2ESNA 3IB1A 3TCFA 1LFIA 4POXA 1F9BA 3T9HB 4OFLA 1AH5A 2NVUB 5CBSA 2QJEA 1FTKA 5LOMA 3PUYE 3HV1A 1IXGA 3FZVA 5JTYB 5TPAB 3A3UA 3RT6B 4OEVA 2Y7IA 3JYRA 2F7BA 2O69A 2I0BA 2Y7WA 4NF5A 4YAHX 3RT8A 2AL4A 3IX1A 3K6XA 4LA9A 4H0WA 2P0SA 4IO6A 2HCAA 1LAHE 3RY3A 3PPQA 3S9LC 2O1LA 4FE8A 3ZKLA 1P1UA 2F97A 4OWDA 3KN8A 4NWCA 3PUZE 1ZMGA 1PB9A 4RA1A 4BDOA 1POTA 3H06B 3V8XB 5I2NA 4MF3A 4IO5A 3E3KA 1JNFA 2Y84A 2F35A 3FV2A 3GXAA 4XIGQ 2XXPA 2GFEA 4DXCA 3I5OA 5I57A 4UACA 3C35A 3MVWA 4G4PA 1MQHA 2DS9A 4KHZE 1NKXA 1DTGA 4KYSA 2QMXA 4K3FA 5ITPA 2VOZA 4ZE9A 1B4ZA 1II5A 4Q30B 2HZLA 1JEVA 2DVZA 3KN3A 4MBPA 3C31A 2AL5A 4P11A 2PMSA 2UYEA 2QS4A 4RNSA 1N76A 1EZ9A 1MDP1 3PMXA 5B7DA 3K1MA 4R6YA 1YTVA 1MXWA 3GBAA 1N7WA 3K2DA 2OWSA 3HN0A 3R6UA 5I59B 3OEMA 4F3GA 1MY1A 3QSLA 2XXQA 1QUKA 4PFTA 3T96B 3PD8A 3N5LA 3S9EA 2IEEA 2Q2AA 3PPPA 1Y9UA 1CB6A 1PEBA 4QSEA 3L6GA 3IR1A 2ALUA 5H8NB 3FATA 4H1XA 2H5YA 1N7XA 4OERA 3EHUA 2QS3A 3RUMA 3KZGA 3Q27A 4I62A 3T66A 1PDAA 2DE4A 2PBWA 2V25A 4F3PA 2NUVA 2DOJA 2XD3A 3E13X 2VD2A 2XXHA 5I2KA 3PV0E 3TZAA 1T0KA 1HSJA 1LAGE 2QRYA 3TPAA 1ZIUA 3M3LA 4FEBA 2RC9A 1VFDA 3K6VA 3MVYA 3M3FA 4Z7EA 4TOZA 4N13A 4DDDA 5FTIA 1JVYA 4QFOA 4QRZA 2R6GE 3H3GA 1B40A 5CC2A 3AXFA 3GLBA 4NEDA 4U4SA 4ECFA 3BKIB 3MW0A 5FTHA 3MP6A 4E0WA 5FHMA 4QSDA 4AB5A 3O97A 2Z8FA 3IL1B 4IO3A 3TODA 4MH5A 5BUUA 5IKBA 2I4CA 1P1QA 3C36A 1VFEA 3PUXE 1IITA 3TQWA 4NE4A 4N6PA 3UIFA 4KFQA 4DE8A 2Z22A 5DEXB 3O66A 2PVUA 2XXYA 3O2AA 1QKAA 3PD9A 4U1OA 1EZPA 3W9VA 1B3LA 1M5FA 5AA2B 3IO6A 4H65A 4ND9A 1GTKA 1FQCA 2I0CA 2F6GA 3E4RA 1R6ZA 4RK2A 2RKMA 3C32A 2HAVA 3O9PA 1RKMA 3IOTA 4I1DA 3MC2A 1R9QA 3M3KA 3FIRA 3IORA 3EQ1A 3V5AA 2REJA 2DWIA 2E0SA 3I6VA 4EF2A 2ZNTA 5I58A 1I6QA 4LP2B 2OK2A 4FJPA 2DXRA 3KJTA 1FQBA 1XHYA 3O6GA 2UXAA 4EXKA 5CMKA 5KDTB 1B46A 4THIA 2FNCA 3IJXB 3T93B 2X26A 4QSCA 3OO8A 1ELJA 4H67A 4TLMB 4EQBA 3FVOA 4ONYA 1MXVA 1SW4A 1OLAA 4FECA 3UGWA 5DTBA 1B5IA 1B1XA 2O84X 3CG1A 3QIMA 4JDFA 4PFWA 3CI8A 3QK6A 4R75A 3IB2A 3OMBA 3MPKA 3UP9A 1MY0A 3U92A 3S4UA 3ZS6A 1N04A 2XX8A 2V3TA 3SEXA 2XXTA 3RTFB 1M5BA 1Z7NE 1FQFA 2I3VA 1M5EA 1UTHA 3IOVA 2VGQA 1NNPA 2G93A 2R9JA 1Y1ZA 3M8UA 1S7YA 1O64A 2NXOA 2B3BA 1Y20A 3SEUA 4RY1A 3ILUB 1FQEA 2VHAA 3IB0A 1US5A 1H44A 1FTOA 2HZKA 2H99A 2ZYKA 1URSA 2CZLA 4I9DA 2ZXTA 4JSDA 3KEIA 1Q1KA 4H8IA 4E0XA 4EXLA 2XX9A 3HCQA 5AA1A 3KN7A 3EF7A 2O7IA 1PBPA 3HHFA 4ZEIA 1UIUA 1BLFA 3TMGA 1MQJA 4OQOA 1A7LA 1QVSA 4R2FA 4ZE8A 3MP1A 4TQUQ 2O1MA 3D4CA 3TTNA 1ANFA 4OENA 3VVDA 4PQJA 1GVCA 4LZ5A 5H8QA 4F2OA 4NWDA 3VFJA 4U23A 1MXXA 3CR9A 1SQYA 3HO7A 4PE5B 4JB7A 3MBPA 4ZECA 5A5XA 3R26A 3B6QA 3C9HA 5JEIA 4R6HA 5KCJB 2REGA 3IOUA 1B2HA 3SKPA 3HHGA 1DOTA 4IO4A 1UTBA 4N07A 4AQ4A 4R72A 1US4A 2OZZA 4O3BA 1NFTA 4LVQA 4U21A 1JEUA 1A40A 1Y1MA 4EQ7A 3EN3A 1YAEA 1FQDA 4U1ZA 4LONB 4G68A 2B3FA 5DT6A 3A09A 5H8FA 3LSFB 1MQIA 3G3FA 4KI0E 3E9XA 4IO2A 3FVNA 1Y3PA 4LQ5A 2HXWA 4XKPA 1B4HA 1QKBA 5TPAA 1B51A 2O6AA 3BBRA 4X48A 1BKAA 1LBBA 3UORA 4YKPA 4X1BA 1AMFA 4PP0A 1VE4A 2P2AA 4FEDA 4G8NA 3G3IA 4ZZAA 1NMUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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