4OWDA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with cysteine
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
428
structure length
428
Chain Sequence
PTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with cysteine
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
total genus 150
structure length 428
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4owdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4owdA02
3G3JA 4L17A 5AA4B 4PFWA 3V5AA 5I56A 5ITPA 2O84X 4QSEA 2Q88A 1N76A 5FHOA 4KYDA 3QUJA 3K2DA 1DPEA 3H06B 2VP1A 3SEXA 1B52A 1PB8A 2HXWA 4X1BA 5CMKA 2A5TA 1FTLA 1URDA 3PPRA 1USYE 3FV1A 3MP6A 2DE4A 2XX8A 3K00A 4GL0A 3C34A 3ONMA 3IOWA 5I57B 4QFPA 4LUBA 2GFEA 2R71A 1Y20A 1GV8A 3PMVA 4DCXA 3VXBA 1PB9A 2F78A 2ONSA 1BIYA 4OYVA 1OLCA 4NF8A 1SW1A 2DSFA 2F6GA 3SETA 4PFYA 1XC1A 1AMFA 1M5DA 1MS7A 1MG1A 1ZIUA 3M3KA 5TP9B 4OETA 4HTGA 3A3UA 3B7DA 4MF3A 3OENA 3MAMA 3R26A 1UIUA 4AQ4A 1UIVA 1VFEA 1P99A 5CBSA 4G68A 1B1HA 2XXWA 1A99A 2H4IA 4H8IA 1F9BA 2P1SA 4GRKA 4X48A 1OIBA 4RXLA 4ECFA 1MPCA 1XHYA 5KCJA 3H6UA 1S7YA 1ATGA 1JW1A 4LP2B 5H8NA 1B2HA 3H6VA 3G3IA 1SW4A 3KSXA 4TOZA 4F1VA 2PVUA 4BLAA 1T0KA 3OO8A 2IA4A 3IJOB 2CZLA 5AA1A 3RQTA 4ELQA 4FEBA 2NUVA 1P1WA 2Z8EA 3IJXB 4ZZAA 2P0SA 3V89B 1RKMA 2Z8DA 3HHGA 3T9UA 1PDAA 5TPAA 4M1VA 2I6EA 5CC2A 3T66A 3U1OA 4XKPA 5A5XB 3A09A 1LFGA 1B4ZA 5DYHA 3HSTA 4BDOA 3USDA 4YU0A 5EYFA 4BDMA 3E4RA 1II5A 3N5LA 3CSGA 3ECRA 2DWHA 2F7BA 3PPPA 1SD3A 4ZEIA 1NH7A 2GRVA 2H99A 4P11A 5H8HA 1MXVA 3TTLA 4WEPA 4EF2A 1DTGA 4BDLA 1IXIA 3O9PA 3TTMA 2IEEA 4OESA 2O1LA 2OCUA 5B70A 2RC9A 4F1UA 3UIFA 1FTJA 1FQDA 1MH4A 3BFTA 2XXIA 4X1DA 2GH9A 3TCHA 2NVUB 4O3CA 1A7LA 4G8HA 1NMUA 2I4CA 1B40A 5BWJA 1QKBA 2DWIA 4E0XA 4F3GA 1OMPA 4JXIA 2XXUA 2UVHA 2X7PA 2DE2A 5IKBA 3VV5A 4EQ7A 1YCJA 1LB9A 3O66A 1P1NA 2B3BA 2G93A 1TFDA 1MY2A 4RK9A 3TCFA 2X7QA 5JK4A 2DYXA 1MQIA 4H8JA 3UA8A 1GR2A 1UTHA 4NWDA 1LCFA 2X26A 5HPQA 3OSQA 4ZS9A 1I69A 3JV9A 3B6WA 3SERA 4R75A 3O28A 3MVXA 2F8DA 1H44A 1MDP1 2Y84A 4YB5A 3EPEA 2R9JA 3T9XB 3HCQA 2YJPA 1B58A 5ELVA 2NWJA 1AIVA 3SEVA 1D4NA 3HO7A 2KLFA 4AB6A 1URGA 4R6HA 5DTBA 2Z22A 3PUYE 5K2XA 1IXHA 2QS1A 3QUFA 4F3PA 3RLFE 5H8FB 3IOUA 3H6WA 2PYYA 1B0LA 4YB6A 3FIRA 3FXUA 3K6UA 1LBCA 2I0BA 3OSRA 3PD8A 2UYEA 3FGSA 1LAFE 2HCAA 3RTFB 3PUVE 4THIA 2RF1A 4NF6A 5LOMA 3KZGA 4NF4A 5I2NA 2Q9TA 5DVJA 1US5A 1JQFA 4QF9A 1B5HA 3PD9A 1FQAA 3W15C 1MDQA 4DXUA 2Y7RA 1MH3A 3TELA 2YLNA 4DXCA 3O2AA 5I58B 5I59A 1D9VA 2REJA 4N6PA 2GHBA 1IIWA 4Z0IA 3ILUB 1FQEA 1Q35A 3MBPA 4JDFA 3K02A 2PMSA 2AYSA 1LAXA 1QUIA 4G68C 2PT1A 1EZPA 1B9JA 1Z7NE 1GVCA 2VGQA 4Z7EA 5F1QA 1FQBA 4IB2A 3D4CA 1O63A 3B6TA 4IGTA 5CMBA 5ISUA 4ZEFA 4GWOA 3E3KA 3BBRA 3TMGA 4U4SA 3QYTA 1IXCA 2HZLA 4IO3A 2QL3A 4NEDA 4OHNA 3LR1A 1RYOA 1LB8A 1MQJA 2OLBA 4EQBA 1MRPA 3S9NC 2M8CA 2ONKE 3R7XA 5JEIA 4IGRA 3GBAA 2XD3A 4GXAA 2E0SA 3ZS6A 4EXLA 3CVGA 1JNFA 1OQGA 2Z23A 4LZ8A 3UN6A 1B7HA 3N94A 1CB6A 3K01A 4QSCA 3QSLA 4EUOA 5CMMA 4RK2A 2R6GE 3N6UA 4ELRA 1B3FA 4YMBA 3M3LA 2XXTA 4DZ1A 4OMBA 3IB1A 3IOTA 3PMXA 3HV1A 4POXA 1ZLQA 2HFBA 5CM6A 1D9YA 2OJTA 4GFRA 3MPLA 3E13X 4ELPA 3K6XA 1DPPA 4UA8A 4YKPA 3DP6A 1NH8A 3EN3A 3LUYA 3A3CA 1LCTA 3K0VA 4ZEKA 3VVEA 3Q27A 3EQ1A 1US4A 3MP8A 3C4MA 3M8UA 3PUZE 2F7AA 3EHUA 4Q0CA 3MW0A 3TZAA 1B05A 4OWDA 1SW2A 4FATA 4O3BA 1MY4A 4YICA 3H03A 4DCYA 1AL3A 5TP9A 3VFJA 1VSOA 1MM7A 1FQCA 2HAVA 3OXNA 1JEVA 1R9QA 3VLUA 3MVYA 1QW0A 2O51A 3T9HB 3B6QA 4LVQA 1M5BA 2ESNA 5L9SA 4QRZA 4YMAA 4I62A 3MVWA 3THIA 1FTMA 3Q29A 4I9DA 4M4GA 5I56B 4WKMA 3TTNA 2RCAA 1ZMGA 3KFMA 3MWBA 4PETA 3PMWA 3TFLA 1OVTA 4OEVA 3CFXA 4IO5A 2YPNA 4H5FA 5H8QA 2ZNTA 3C36A 1HSLA 2B3FA 3KN3A 1WODA 2XX9A 3MPKA 2VHAA 4KD5A 5KDTA 1B3EA 1R6ZA 4C0RA 1WDNA 5ITOA 2A5TB 2HZKA 3T22A 1NNFA 3FXQA 1J1NA 3KBRA 4C1TA 4ZEDA 1DSNA 3KN7A 4ONYA 1TXFA 1OVBA 4F19A 5AA2A 3RT8A 4LONB 3MVZA 3TTRA 3JYRA 3OO9A 3LC8A 2O68A 4ESWA 3CFLA 5L8DA 4LZ7A 1PBPA 3OO6A 3PPOA 4NF8B 2UXAA 1PB7A 1MXWA 4F3BA 5J1DA 3LSWA 4GIZA 1MY3A 2DE3A 2B65A 3WAFA 4F39A 3M3FA 1EZ9A 2Q2CA 3DM0A 1LAGE 1IUDA 4EDPA 4KCCA 3EF7A 1LFIA 1MQGA 4DIGA 4H65A 4G68B 1M5EA 3FXRA 2DVCA 3WAEA 2PX1A 4R72A 3K4UA 2V93A 4K3FA 1P1QA 2G29A 1FQFA 4GOTA 4FEDA 3FVKA 1MXXA 4YKIA 2AIXA 3BKIB 1POTA 1A8FA 5KCJB 4OFJA 4FAJA 5H8NB 3EHSA 2XXHA 2I49A 3VXCA 4G8MA 1QJMA 4NTLA 2WKYA 2VD2A 2A5SA 2QSXA 3I6VA 4BDRA 4JWYA 5TPAB 3CRBA 3L6GA 4YZZA 3VLWA 3N6TA 3TYHA 4OXVA 2NXOA 1A54A 3OELA 4GQOA 2DP8A 3V83A 3RUMA 1IITA 1Z7ME 3TAJA 1Y4CA 1XS5A 3OEKA 5I2KA 3TQLA 3CIJA 2XD2A 1NFTA 1ZU0A 1DTZA 4PFUA 5H8HB 2OK2A 3TKDA 4KYEA 1S50A 5CBRA 3TQWA 5TU0A 2DWJA 1H76A 1FCKA 1MPBA 1QKAA 5DEXA 1BP5A 1UTBA 3Q25A 1RYXA 3PUWE 1YTVA 4F2QA 1LBBA 3FJGA 5AA2D 1B3HA 2I3WA 4HS7A 4H67A 2VD3A 2XXRA 1Y3QA 3RTWB 4JBZA 1PBQA 3T96B 3C32A 1JVYA 1SBPA 1ZBMA 1L5TA 3VE1B 3K1NA 1O7TA 1XVXA 2FA7A 5BUUA 1UTHB 4H6DA 1D3KA 4KFQA 4QFNA 3RPWA 1R9LA 2H9BA 4U1ZA 1IZ1A 3LBSA 3ZKLA 4GD5A 4DDDA 4R9FA 3S4UA 4OQOA 2DOJA 4PP0A 4QSDA 1IQ7A 2Q8JA 1N7WA 3KG2A 1LLSA 2RC8A 1Y9UA 5JTYA 5K2YA 1Q1KA 4RPOA 1Y1MA 3KEIA 1FTOA 1VE4A 3QAXA 3C9HA 4EXKA 1TFAA 3PGFA 4DXBA 1I6BA 3I3VA 3QXMA 4XXUA 3HHFA 1MXUA 1QULA 4G8NA 4PQJA 3UGWA 4FE8A 1XT8A 2XXXA 3U72A 3HN0A 1TWYA 4EQ9A 4C1UA 1ZKBA 4NF5B 2Y7IA 4H0WA 4XKRA 4OERA 3KGCA 2E1SA 4NF6B 3KSJA 2THIA 4R2FA 5L9MA 3UP9A 4NF4B 5I2NB 4R73A 5HBCA 1Y3NA 2FNCA 4LQ2A 4QHQA 3FVNA 4OTEA 1LFHA 1B5JA 4YAHX 3K6WA 1SI1A 3RT6B 4I1DA 1PEBA 2ZYKA 1NKXA 2QMWA 1SW5A 4OENA 5I59B 1ZTYA 3RNNA 3FV2A 1SQYA 3O97A 1BKAA 4KI0E 4U22A 2V3UA 4WXJA 4TLMB 4PFTA 3RN8A 1JW4A 4ZECA 1P1OA 1QUJA 5CI5A 5FTIA 4H5GA 2V3TA 5AA4A 2UVIA 4G2ZA 3GBBA 1JETA 3JZJA 1B46A 2HAUA 3SKPA 3MJNA 1M5CA 5CMCA 3QK6A 4NWCA 1FW0A 4MBPA 1MXYA 2ZNUA 1B6HA 3OEMA 3W9WA 4ZE8A 5M2VA 3DELB 3VVDA 1QVSA 1VFDA 4R9GA 4F18A 4UACA 5DVIA 4POWA 4Q8RA 3TEPA 5AA3A 1B51A 1PC3A 3TUSA 1MQDA 1O64A 3Q28A 2F34A 3IL1B 3D4GA 1JW5A 3PUXE 5I57A 3IO4A 3S9EA 3BFUA 4FECA 4ELOA 5KZTA 2F7CA 1XVYA 4U23A 3O6HA 4GXSB 2AL4A 4AB5A 2RINA 4RA1A 1P1UA 3HPIA 3KJTA 3DP4A 4GL8A 3G3FA 1M5FA 4JSOA 2O69A 5FTHA 3MQ9A 2P2AA 2W7YA 2V3QA 3ZSFA 2HQ0A 1B4HA 1NNPA 3T9VA 1WVJA 3OMBA 4IY5A 3IX1A 2ZXTA 2LAOA 4JSDA 4ZEBA 4F1YA 3DLNA 3IO6A 3GXAA 2AL5A 4QFLA 2Q89A 4U2RA 3VDFA 1MY0A 2BJJX 4YB7A 4KQPA 2Y7KA 3H3GA 2ZYMA 3FD3A 1H3DA 2I4BA 1ANFA 1SYHA 4BDQA 5ICQA 2O7IA 1B3GA 5CRYA 4DLDA 1A55A 1N0TA 3W9VA 4IO2A 2ANJA 3PV0E 2ONRA 2Y7PA 3PPQA 5EHSA 3FVOA 5AE4A 1B0HA 2RCBA 2F97A 1N3XA 3C35A 3KOTA 4IO6A 1ELJA 2O1MA 2I48A 4FJPA 2D21A 3R6UA 1B32A 5A5XA 1N3WA 3MZ9A 4EF1A 4OZ9A 2OWTA 4HW8A 4OEUA 3CG1A 4YKKA 3K6VA 4MFIA 1B7ZA 2UVJA 3SESA 3TPAA 3CSBA 2D5WA 4RYAA 3O6GA 2XXYA 1SDXA 3EHTA 3TTKA 1IXGA 2ALUA 3V8XB 1OQHA 3IK6B 5DT6A 3G3HA 1YPNA 1MQHA 4LA9A 3L6HA 2QRYA 1H43A 4XTCQ 1VR5A 1A8EA 5H8QB 2O6AA 1GGGA 3LSFB 5ICTA 4R74A 2XXVA 5KDTB 3ODBA 4LQ5A 2O7UA 1TT1A 4ZZEA 3FJMA 2QPQA 2ZNSA 2PT2A 2ZMBA 5IAIA 5AA2B 4I8CA 1H45A 4ZDMA 1POY1 3KOSA 3F11A 2Q2AA 2RKMA 2CMOA 4R6KA 4IO4A 3G7WA 4U21A 5HM4B 3IB2A 2QS2A 3TCGA 4ESXA 3ZKKA 3IB0A 1MPDA 3VLVA 1SVXB 1MM6A 3CFZA 4NMYA 3K1PA 2RC7A 2FYIA 3SEUA 1N84A 3CG3A 2VOZA 2OBGA 3H7MA 4G77A 5F7VA 3SDFA 1CE2A 4KHZE 1EU8A 1JVXA 2Y7WA 4R6YA 2F6PA 2REGA 2ABHA 2OZZA 1I6AA 2XX7A 5H8FA 1QUKA 1MY1A 3G3KA 5I84A 4NE4A 1USYH 4QFOA 3IOVA 4ZE9A 2D3IA 4YKJA 1I6QA 4MLQA 3OOAA 1Y4TA 1R1NA 5FHNA 2OWSA 1HSEA 4QFKA 4R2BA 4RY1A 1NNKA 4RJZA 1EH3A 5B7DA 4OVJA 4FORA 2F5XA 3MUQA 4XIGQ 1DOTA 4XKNA 4F2OA 3FATA 2UYFA 1FTKA 1A40A 4HCWA 1N04A 5H8SA 5I58A 2DVZA 5I2KB 4JWXA 3RY3A 3UORA 2HEUA 3N26A 3CR9A 3QIMA 1B3LA 3OD7A 2GHAA 1SI0A 2XXQA 3MZ1A 4KCDA 3IORA 2QS3A 3IR1A 3E9XA 5DEXB 4KR5A 1UTBB 4NF5A 4TLLB 3K1MA 3OO7A 4G4PA 2NOOA 1BLFA 1EZOA 4LATA 3RGYA 3FVGA 3MZBA 2F35A 2ZYOA 4PE5B 3FUZA 1S9TA 2F36A 4BDNA 3IAZA 4H1XA 3Q26A 2DS9A 3P7IA 4LZ5A 2H5YA 4XKQA 3I5OA 4JWOA 4E0WA 4P0GA 3S2VA 4F22A 1Y1ZA 3UK4A 3GZGA 4Q30B 4X9TA 5FHMA 4ND9A 3TODA 2UVGA 4OFOA 3U93A 2H25A 4FIMA 1NNTA 1B7UA 2I3VA 2PBWA 3CI8A 3FZVA 1AOVA 4IY6A 2I58A 4U1OA 3GLBA 4KYSA 2XXPA 4F3SA 3S9LC 4RNSA 3C33A 1KWHA 4ISUA 1URSA 3FJ7A 1YAEA 5JTYB 4N13A 2DXYA 4Q5TA 4TQUQ 4MH5A 3KN8A 4GLIA 3MC2A 3TDJA 4KPTA 1ZJLA 4OFLA 4JB7A 3U94A 3LSLA 1N7XA 1JEUA 1B5IA 1NL5A 1SYIA 1OLAA 2I0CA 2QS4A 3U92A 3G3GA 3DP8A 3H4ZA 1LGBC 3O29A 1BTJA 1IEJA 4N07A 2H98A 4IO7A 1LSTA 1B1XA 2DXRA 3PU5A 4F31B 2QJEA 5DVFA 4MLVA 3LSXA 1GTKA 3AXFA 3ILTB 4HCYA 2V84A 3C31A 4U4XA 3SEWA 5L9OA 3KJ7A 4P0IA 2V25A 1MXZA 1Y3PA 3MP1A 1LAHE 4RPNA 1AH5A 1HSJA 3PPNA 1XOCA 4GVOA 3O6IA 2Z8FA 5EHMA 3H6TA 3T93B 4O3AA 2XHDA 3S9MC 3FASA 2ZYNA 4F29A 3U8QA 1DMBA 4WEDA 3SEYA 2DQVA 3VVFA 4DE8A 2DWAA 4GF8A 1UQWA 2QMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G3JA 4L17A 5AA4B 4HE0A 4PFWA 3V5AA 5I56A 5ITPA 2O84X 3LV0A 4QSEA 2Q88A 1N76A 5FHOA 4KYDA 5I5PA 3QUJA 3K2DA 1DPEA 3H06B 5IGAA 2VP1A 5A5LA 3SEXA 1B52A 1PB8A 2HXWA 4X1BA 1G0HA 5CMKA 2A5TA 1LBYA 1FTLA 1URDA 3PPRA 1USYE 2XWVA 3FV1A 3MP6A 2DE4A 2XX8A 3K00A 4GL0A 3C34A 3ONMA 3IOWA 5I57B 4QFPA 4LUBA 2GFEA 2R71A 1Y20A 1GV8A 3PMVA 4IR8A 2FVZA 4DCXA 4GWWA 3VXBA 1PB9A 2F78A 2ONSA 1BIYA 4OYVA 1OLCA 4HE2A 4NF8A 1SW1A 2DSFA 2ZZWA 2F6GA 3SETA 4PFYA 1XC1A 5IZ1A 1AMFA 1M5DA 1MS7A 1MG1A 1ZIUA 3M3KA 5TP9B 4OETA 4HTGA 3A3UA 3B7DA 4MF3A 3OENA 3MAMA 3R26A 4NN3A 1UIUA 1NUWA 4AQ4A 1UIVA 1VFEA 1P99A 5CBSA 4G68A 3RYDA 1B1HA 2XXWA 1A99A 2H4IA 4FBPA 2P3VA 4H8IA 1F9BA 4P9KA 1NUXA 2P1SA 4GRKA 4X48A 1OIBA 4JVCA 4RXLA 4ECFA 1MPCA 2VT5A 1XHYA 5KCJA 3H6UA 1S7YA 1ATGA 1JW1A 4LP2B 5H8NA 1B2HA 3H6VA 3G3IA 4MHFA 1SW4A 3KSXA 4TOZA 4F1VA 2PVUA 4BLAA 1T0KA 3OO8A 2IA4A 5LTCA 3IJOB 2CZLA 5AA1A 3RQTA 4ELQA 4FEBA 2NUVA 1P1WA 2Z8EA 3IJXB 4ZZAA 2P0SA 3V89B 1NV6A 1RKMA 2KQZA 3LUZA 2Z8DA 3HHGA 1EYIA 3T9UA 1PDAA 5TPAA 4M1VA 2I6EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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