4OYVA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with leucine
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
424
structure length
424
Chain Sequence
PTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGAAADASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with leucine
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 143
structure length 424
sequence length 424
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oyvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oyvA02
3RUMA 4MBPA 5F7VA 2A5TB 2CMOA 4FJPA 3AXFA 3T9XB 1Q35A 4XKPA 2YJPA 3V8XB 4EXLA 2DE3A 4ZE9A 3V5AA 3V83A 1S7YA 3IAZA 1LBCA 4ZEIA 2XX9A 1XS5A 1IZ1A 3EN3A 2R6GE 3MPLA 5F1QA 4WKMA 1SW2A 3FVGA 3GBAA 4HTGA 2XXXA 4Z0IA 3CFXA 3IOWA 3SEYA 4OMBA 1MXVA 3O28A 2IEEA 5KDTA 3MW0A 3G3HA 4BDNA 3C32A 2Q88A 4F18A 4AB6A 3RPWA 1PB7A 4P11A 4G8NA 2ZNUA 5TPAA 1M5DA 2PX1A 4LZ5A 3WAFA 1MXUA 3GBBA 4NF5A 5H8FB 4YZZA 3OSQA 4HS7A 5FTHA 2F6PA 3FGSA 1AOVA 1B1XA 4F22A 3BBRA 5HM4B 4U1OA 3MZBA 4R73A 3TZAA 3S9EA 3C9HA 3RT6B 2OWSA 3H6TA 5KZTA 2I4BA 5CM6A 1D9VA 1GR2A 2RF1A 3HHGA 3ZKLA 3E3KA 2HAVA 3N6UA 3FJGA 4O3CA 3W15C 1I6AA 3MVZA 2UVHA 3L6GA 3CSBA 3KN7A 3SKPA 2M8CA 1T0KA 1BTJA 1MQGA 4I1DA 3TPAA 5B7DA 1LFHA 3OO9A 4BDMA 5AA2B 1LAFE 3L6HA 1B46A 2I4CA 1SW1A 4G8MA 1L5TA 2XX7A 1BKAA 2PYYA 1B5IA 1MXXA 4X1BA 1OMPA 2DS9A 5JTYA 4LZ8A 3OENA 3K02A 1DTGA 1JW4A 1XVYA 2B65A 3B6TA 1AIVA 5H8NB 1Y1ZA 4YKKA 3SESA 3USDA 4ELOA 3KFMA 1ZTYA 5I57A 4IO2A 1A55A 3S2VA 1GVCA 4RY1A 3EHTA 1PBPA 5I84A 1OVBA 1MRPA 5A5XB 5FHOA 1VR5A 1B05A 5H8HB 1MQHA 2F35A 3U8QA 3KG2A 3T9UA 4NF8B 1D3KA 1JW1A 2HQ0A 1A54A 1PB9A 3IB1A 5ITOA 5TU0A 5CMMA 4NF4B 3IL1B 3VXBA 2XXIA 2B3BA 5ICTA 4EF1A 1N04A 2DYXA 1M5FA 1SDXA 3VVDA 1MY2A 4F1YA 4X9TA 1II5A 1Y4CA 1MY0A 3G3FA 1IITA 5DTBA 4F39A 3HHFA 4EUOA 2DSFA 3M8UA 5EYFA 1N3WA 4KCDA 3R6UA 1LAHE 1OQHA 3VXCA 5CRYA 4F3GA 4OENA 1P1OA 4MLQA 4NWCA 1JVYA 3UORA 3PPNA 4MLVA 2XXWA 4KPTA 2I58A 2BJJX 3UIFA 1OVTA 1TWYA 2H4IA 3Q26A 4KD5A 1EU8A 3IOUA 3KBRA 4C1UA 3U94A 3S9NC 3B7DA 4TOZA 5DEXB 2OK2A 4POWA 2HZLA 2F7BA 2XD2A 4XKQA 2V25A 4FECA 4PE5B 4BDOA 2DP8A 3LSWA 3TTNA 4U4XA 3K1NA 3TKDA 3TELA 4FAJA 1N76A 2UVJA 3TODA 3A3CA 3FJ7A 4R2BA 1UTHB 2H98A 4H8JA 4H65A 4YKJA 2DVZA 2GHAA 1LFGA 1IQ7A 1F9BA 4OTEA 3PGFA 4KR5A 2DWIA 3ECRA 1P99A 2DE4A 3MUQA 5HBCA 3IOVA 5ITPA 4NF6B 5J1DA 2RINA 4BLAA 4LATA 3K6WA 3MVYA 1A7LA 4K3FA 3OEMA 3CFZA 4DXUA 4IO3A 4RYAA 1MPCA 3U1OA 1B0LA 1PBQA 4LA9A 1MY3A 3OO8A 3D4CA 4R2FA 2HFBA 1B6HA 4FORA 3LR1A 3EF7A 3W9VA 3EHUA 2O69A 3PUYE 3DP8A 1SYHA 4DXBA 2ZNSA 4KI0E 3CFLA 3SEVA 1DPPA 3TTRA 1MH4A 3U72A 3C31A 5DVJA 3PPOA 4GD5A 1YAEA 1B5JA 1QVSA 2I48A 4R74A 3OO6A 1US5A 2UYFA 5AA2D 2I3WA 5TP9B 3IJXB 1CB6A 1FQFA 4UACA 5ICQA 1PEBA 4OHNA 4PFWA 3K1MA 3RQTA 4KHZE 4QSDA 2F7CA 4Q30B 1B3GA 1O63A 1MY1A 1Y3PA 3O6GA 4PQJA 2Y7KA 2O7IA 3DM0A 5AA3A 3K1PA 3FZVA 1AH5A 3G3IA 3MP8A 1AL3A 1POY1 3SERA 5H8QA 3Q28A 3K0VA 2O68A 2GHBA 2E1SA 2VHAA 1M5CA 1RYOA 1S9TA 3FXUA 3CIJA 4R6HA 1XVXA 4QFOA 3IO6A 2NUVA 2REGA 5DT6A 2YLNA 1B3HA 4OFLA 4LUBA 1IXHA 4DCXA 3DP6A 2Z8FA 2GFEA 4ELQA 3RNNA 2VD3A 3MAMA 4X1DA 3RTFB 1HSJA 3TQLA 1P1WA 1B51A 5DVIA 1S50A 3OMBA 1NNPA 1A40A 3FVKA 3C4MA 1R9QA 4POXA 1I6BA 1YTVA 3FVOA 3RN8A 2IA4A 4EQ9A 1FQDA 1MM7A 1Q1KA 4Q0CA 3LSFB 4GL8A 4HCWA 1ZU0A 1YCJA 2Y84A 2D3IA 3DLNA 3OO7A 1ZIUA 1FCKA 1H76A 4EDPA 4HW8A 4G68C 3RTWB 1MPDA 3LUYA 2ONSA 3CRBA 3KZGA 3TCGA 2XXRA 3GXAA 2O51A 2AIXA 4DIGA 1J1NA 3M3LA 4GLIA 1N0TA 1Y3NA 2V3UA 2I49A 3ILTB 3F11A 4ZEFA 2XD3A 4P0GA 4O3AA 4QSCA 1IXGA 4IO7A 1VE4A 2PT2A 1SI0A 2XXYA 4Z7EA 3ODBA 3UN6A 3PMVA 2X26A 1A8EA 5TPAB 2V3TA 4U4SA 5I2NA 3T96B 3I3VA 4U2RA 1XHYA 4OYVA 2QRYA 1DPEA 1Z7ME 3SEUA 4P0IA 4FEDA 4FIMA 2O1MA 2Y7WA 1OIBA 3O66A 1NNKA 4NEDA 2KLFA 1R1NA 3LC8A 4JB7A 5I58A 4YKPA 3FVNA 1H43A 4LQ2A 4DCYA 3K00A 5EHMA 2P0SA 1M5BA 1VFEA 1MDP1 1NH7A 4G77A 2GRVA 4JWOA 1MXWA 2ANJA 4PFUA 3TCFA 3T66A 4ESWA 3MP6A 3MZ1A 1WODA 2Q2AA 4IY6A 3QUJA 4ECFA 4F3BA 1RYXA 1URGA 3O6IA 3TAJA 2DWHA 3O9PA 3IX1A 1B2HA 5M2VA 5I2KB 2H5YA 1N3XA 1FQBA 1N7XA 4I9DA 3PU5A 4PP0A 3K6VA 3T9VA 5JTYB 1H45A 5H8HA 4RJZA 3G3KA 3HCQA 4KCCA 4NF8A 1KWHA 4PFTA 4QRZA 4QFNA 3PPQA 4F3SA 2H25A 2R9JA 4ZECA 2G29A 2FYIA 2LAOA 3HO7A 2F36A 4LZ7A 4ZS9A 4RK9A 4U1ZA 2RC8A 4QHQA 1NNTA 2XXHA 3QAXA 4R9GA 3E9XA 3TTMA 4GXSB 3IOTA 3PMXA 2R71A 3H6WA 2PT1A 1AMFA 5AE4A 4DDDA 2RC7A 2F34A 4YAHX 4GXAA 1USYE 4JSOA 1IEJA 3ONMA 3R26A 5DYHA 4WXJA 5L9SA 3RGYA 3MC2A 1OLAA 4IB2A 5I59B 3THIA 2Q2CA 3OD7A 2D5WA 5DEXA 1FQAA 3EHSA 2RC9A 1MQIA 2THIA 3CVGA 3VVFA 4JWXA 3CR9A 4F1UA 2G93A 4ZEBA 1CE2A 2DQVA 2Q8JA 2P1SA 4G8HA 2DE2A 3PD8A 1RKMA 1JEVA 1UTHA 3N6TA 1I69A 4IO4A 4F31B 2I3VA 4AQ4A 3FJMA 2V3QA 4JXIA 1LAGE 5H8SA 1FTMA 2NVUB 1MXZA 1QULA 2ONRA 2Z8DA 4NF6A 5IKBA 4NMYA 1A8FA 2UVGA 2QMWA 2XHDA 2QL3A 4KYSA 5KCJB 4LONB 2PMSA 3S9MC 2H9BA 3BFUA 4DE8A 3HPIA 4QSEA 5CBRA 2QSXA 3HV1A 2OCUA 3IB2A 1B40A 1URDA 4ISUA 4UA8A 2CZLA 5L9OA 3KGCA 1H3DA 3TUSA 1USYH 1UIUA 4IY5A 3IO4A 5CMCA 3UK4A 2OJTA 1P1QA 3SETA 2ONKE 1IUDA 2VGQA 2OLBA 4E0XA 3CG3A 1ZMGA 3H3GA 3H6UA 4OFJA 4GQOA 1MY4A 4OFOA 4JBZA 4F2OA 1VSOA 2F78A 4ZZEA 3TFLA 1B0HA 1UTBA 5L9MA 1MM6A 5AA4A 4BDRA 2F7AA 3VV5A 4EXKA 3PMWA 4YICA 2UYEA 1US4A 2QS2A 4H5GA 1EH3A 3E13X 5HPQA 3QYTA 1B3LA 2O84X 4H0WA 3C34A 4U22A 4DXCA 3VLUA 2OZZA 4NTLA 2OBGA 1MS7A 4KYEA 2HCAA 1ZBMA 1MQJA 1MG1A 3D4GA 3K6XA 4G68B 1ANFA 1MQDA 3LSXA 3O29A 1QUKA 4OERA 1NKXA 1DTZA 3LBSA 3MPKA 3MVWA 3OOAA 1B32A 4IO6A 1LCTA 3IJOB 1SYIA 1B7HA 4PFYA 3C35A 3H4ZA 3TYHA 4NE4A 4YB6A 3O2AA 4O3BA 1P1NA 1XOCA 2Y7RA 1NNFA 1MDQA 1B3FA 4NWDA 2H99A 1BIYA 3PPPA 3H06B 2A5TA 1FTKA 4LP2B 2ALUA 1H44A 2D21A 2F6GA 1SQYA 4OXVA 3H03A 1JNFA 3OXNA 3KOSA 1NFTA 3W9WA 2XXVA 5I56B 5FTIA 2UXAA 2I6EA 2HAUA 3G3GA 5K2XA 5CC2A 3FXQA 4PETA 3DP4A 1NL5A 3M3FA 1POTA 2VP1A 2Y7PA 4XKNA 1MXYA 2ESNA 3JYRA 4KYDA 2NWJA 1D4NA 1MH3A 3KN8A 4H8IA 2XXUA 4RXLA 3B6QA 2DOJA 4F2QA 3UP9A 2DXYA 5L8DA 4ONYA 3PUWE 4C1TA 5JEIA 4RK2A 2DXRA 3K6UA 4Q5TA 3S4UA 1HSLA 2REJA 1QKBA 4ZEKA 1BP5A 4OETA 4ESXA 2I0BA 5H8FA 1LB8A 3PD9A 5CI5A 4JDFA 4H67A 2NXOA 1PDAA 2ZYMA 4TLLB 2HXWA 5BWJA 2ZYNA 1XC1A 3ILUB 3FXRA 5KDTB 1B7ZA 1SVXB 4XXUA 3E4RA 3C33A 1I6QA 4U21A 3WAEA 1HSEA 4OWDA 2Z22A 1N7WA 1YPNA 2ZXTA 3ZKKA 4ELPA 1FW0A 3I6VA 2B3FA 3JV9A 4YB7A 4NF5B 3QUFA 2HZKA 1LGBC 1P1UA 3U93A 3K01A 4MF3A 2ZYOA 2XXQA 3N26A 4MFIA 2ZNTA 5DVFA 2FA7A 4IO5A 1Y9UA 2ZMBA 5I2NB 4R9FA 1GTKA 3FUZA 3FV1A 5IAIA 4G2ZA 5FHMA 1GV8A 1ATGA 3PUZE 4L17A 1TT1A 3BKIB 5AA2A 3S9LC 3G3JA 2HEUA 4ND9A 3QXMA 1LFIA 1B4HA 1JQFA 5EHSA 3MP1A 2AYSA 1FTJA 1B7UA 3T9HB 5I58B 3IB0A 3VVEA 1LLSA 1LCFA 3ZS6A 3A3UA 1B9JA 5H8NA 1XT8A 2VD2A 3KSXA 3MJNA 1Z7NE 1IXCA 2DWAA 4GWOA 3TMGA 4N07A 2W7YA 3CG1A 3QSLA 4OZ9A 5I2KA 4BDQA 3SEXA 2XX8A 4QFLA 1ZKBA 1TFAA 3I5OA 2PVUA 1ZJLA 4WEDA 4OEUA 5A5XA 3OELA 1FQCA 4EQBA 1IXIA 3VLWA 2NOOA 1TFDA 2XXTA 4GL0A 5B70A 1N84A 4DLDA 2X7PA 1DMBA 4H6DA 3GZGA 1OQGA 3HN0A 2AL4A 5I57B 3ZSFA 3M3KA 1QKAA 3JZJA 3V89B 3B6WA 4XKRA 2QS4A 4NF4A 1WVJA 4G4PA 2Z23A 4E0WA 2QS1A 3C36A 1B4ZA 1Y1MA 3RY3A 1IIWA 2Q9TA 4RNSA 5CBSA 1FTOA 5CMKA 3R7XA 3UGWA 3N94A 1JW5A 2F8DA 1BLFA 3N5LA 5JK4A 1B52A 4OQOA 2VOZA 4FE8A 2WKYA 1B5HA 1O7TA 3MBPA 4YMBA 4XIGQ 3P7IA 5FHNA 4GF8A 1A99A 2X7QA 5I59A 1ELJA 5CMBA 2XXPA 2FNCA 2O7UA 4GFRA 1M5EA 3LSLA 4X48A 3KJTA 4F19A 2QMXA 2DWJA 1QW0A 3KSJA 4ZZAA 4U23A 4ZEDA 2E0SA 3KEIA 2Q89A 2OWTA 4RPOA 3VFJA 4BDLA 4JSDA 4GIZA 4TQUQ 3Q29A 4M1VA 3MQ9A 4GOTA 4OEVA 4YU0A 3MZ9A 3OSRA 4RPNA 3O6HA 3IR1A 3CSGA 3OEKA 3H6VA 3RLFE 1PC3A 3VLVA 1JETA 5AA1A 4C0RA 2V84A 3TEPA 4H1XA 2RKMA 5K2YA 3UA8A 4F3PA 1DOTA 1NMUA 1URSA 3FASA 2YPNA 1FQEA 4GVOA 3A09A 4I62A 4EF2A 4F29A 1FTLA 5KCJA 1Y3QA 5ELVA 3IK6B 4LQ5A 4EQ7A 3EQ1A 3KJ7A 4R6KA 4ELRA 2QS3A 4M4GA 3HSTA 3PPRA 3FIRA 4HCYA 3RT8A 2ZYKA 3T93B 1WDNA 2Z8EA 3IORA 3K4UA 2RCBA 4MH5A 1D9YA 2O1LA 4N6PA 4LVQA 2AL5A 1LB9A 1QJMA 3K2DA 4FEBA 1Y20A 1LAXA 4QFPA 4QF9A 1EZPA 3T22A 3QIMA 3FV2A 4KQPA 1OLCA 5TP9A 3VE1B 4IGTA 5LOMA 3TTKA 4R75A 2UVIA 3Q25A 4F1VA 4OVJA 1DSNA 3U92A 4OESA 3EPEA 1B58A 3TTLA 3MVXA 2RCAA 4ZDMA 4YKIA 3VDFA 4AB5A 1Y4TA 1LSTA 2F5XA 3BFTA 3TDJA 2PBWA 4THIA 1JEUA 1UIVA 1UQWA 1TXFA 4YMAA 4G68A 1QUIA 1UTBB 3KOTA 3G7WA 5AA4B 5BUUA 1LBBA 1QUJA 4N13A 1GGGA 3CI8A 1R9LA 1EZ9A 1SW5A 4H5FA 1JVXA 3QK6A 1B1HA 1SI1A 1NH8A 4Q8RA 4RA1A 2P2AA 3SDFA 2GH9A 4WEPA 1R6ZA 2Y7IA 4DZ1A 1SW4A 1SD3A 3O97A 3FD3A 4JWYA 2I0CA 4QFKA 4R72A 3TCHA 5H8QB 1SBPA 3Q27A 3GLBA 2DVCA 3PV0E 4R6YA 1ZLQA 1MPBA 2V93A 4IGRA 4TLMB 3MWBA 3SEWA 3PUXE 4XTCQ 2ABHA 4GRKA 5ISUA 3TQWA 3PUVE 3H7MA 1O64A 1B3EA 2QPQA 5I56A 3FATA 3KN3A 2QJEA 4KFQA 1PB8A 2A5SA 1VFDA 3DELB 2O6AA 4I8CA 4ZE8A 1EZOA 4FATA 2F97A 4YB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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