4P11A

Native crystal structure of mltf pseudomonas aeruginosa
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
428
structure length
428
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Native crystal structure of MltF Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 152
structure length 428
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A02
4F3SA 4FEBA 2F97A 1I6AA 3C34A 3C9HA 4BDLA 3OO9A 4NF8A 4OXVA 3LR1A 3K1NA 2XXQA 4ELOA 1UIUA 4XTCQ 3MUQA 1MY4A 3CVGA 2WKYA 4EQ9A 4KCCA 1M5FA 2W7YA 1A8FA 4PFUA 3TMGA 3TEPA 3PU5A 4I9DA 4OVJA 5DVJA 4GXAA 3H06B 3FVKA 3VE1B 4GIZA 4LQ5A 1P1QA 1LFGA 4F1YA 1SW5A 4WEPA 1MY2A 4FEDA 2ZYMA 3O9PA 1P1UA 4L17A 4RY1A 3VFJA 2X7QA 1VR5A 4R75A 2H25A 4Z0IA 4F3PA 4IY6A 4TQUQ 4KQPA 3P7IA 5I58B 3HN0A 3K6VA 2DWJA 3KFMA 4DXUA 5DVFA 3IOWA 4NTLA 2ZYNA 5FHOA 3QSLA 1B7ZA 4BDQA 4R72A 3HHGA 3U8QA 3O6HA 3EHSA 3TYHA 1NKXA 3T9UA 4YZZA 2H9BA 1H3DA 4Q8RA 2XXRA 5CMKA 4G8HA 4QFNA 3B6WA 3MQ9A 4GFRA 1P1WA 3H3GA 3FASA 3G3FA 3FATA 3FXUA 4U2RA 3B6TA 4X48A 1B5JA 4YB7A 1QJMA 2QJEA 3R26A 2DWHA 2G93A 4JB7A 2IA4A 2DE3A 3TKDA 1Y3QA 4F18A 1JQFA 4KYDA 3LSFB 1KWHA 2F6PA 1A8EA 3CIJA 3C35A 3TAJA 1N7XA 2AYSA 2A5TB 4LONB 4G77A 5L8DA 2F5XA 2UVHA 3BFTA 3B7DA 3E3KA 4Q5TA 4GL8A 3IB0A 4I8CA 4RJZA 4TLLB 1OMPA 1YAEA 2VHAA 3U1OA 1MM7A 3D4CA 1IXHA 1MQIA 2DE4A 1SVXB 4QRZA 1LFHA 1ZU0A 1MQDA 2QPQA 3PMVA 4KR5A 4AQ4A 4YKKA 3GXAA 1XVXA 5EYFA 2V84A 2O1MA 1POY1 1GV8A 2CMOA 2XXTA 3S9EA 3M3FA 2I0BA 5ICQA 5I56A 3PPPA 3ONMA 4E0XA 3FIRA 2V3TA 3W9WA 2VGQA 1AL3A 3DLNA 3FJGA 1H76A 1BIYA 4ONYA 3CFZA 1MXVA 2QS4A 3IO6A 3UN6A 1US5A 1LAHE 2Y7RA 3USDA 2I6EA 2VD2A 1POTA 3U92A 4MBPA 5DVIA 4EF1A 1Q35A 4RA1A 4PE5B 1MPCA 2B3FA 4NF5A 1ZLQA 1RYOA 3OO6A 3GZGA 2Y84A 1QKBA 4OFJA 4OMBA 4JWYA 4F2QA 1WODA 4GOTA 3LSXA 1B7UA 4FORA 1FW0A 3K0VA 3K2DA 3IB1A 4ISUA 3SDFA 1WVJA 1SBPA 3O28A 2XX7A 4F29A 1SD3A 1UQWA 4EDPA 1JNFA 1OLAA 4NF8B 3ILUB 3EHTA 2O7UA 3OO7A 1OVTA 1ZKBA 2XXIA 3S9MC 3G7WA 3OENA 5DT6A 1JW4A 5DYHA 3CSBA 4IO4A 4MFIA 1B58A 2O68A 4QFKA 2XXHA 4YMAA 3MP1A 2FYIA 4H5FA 3MW0A 3VVEA 1FTKA 1PEBA 4QSCA 3RN8A 2P1SA 3FZVA 1URGA 2O1LA 3M3KA 1B0HA 1D9YA 4ZE9A 1AIVA 3FJMA 4QFPA 1IXCA 4QFOA 1N04A 1O64A 2XD2A 3RPWA 1A55A 1FTMA 4MH5A 1SI1A 3OD7A 1XVYA 4LVQA 2DVCA 4LZ8A 3T66A 3RTFB 3PD9A 1AH5A 2CZLA 4RNSA 3V5AA 4LATA 3O66A 1HSEA 4ESXA 4G68C 3O6IA 1LAFE 1OQGA 4XIGQ 3OEKA 1A7LA 4H8JA 5L9SA 4MLVA 2OK2A 3V83A 5JK4A 2RF1A 4PP0A 4LA9A 3KN3A 4GLIA 1EZOA 5FHNA 1RKMA 2I0CA 2ZNTA 3MP8A 1B2HA 3EN3A 3MVZA 1DTGA 3IOVA 2QS2A 1CB6A 3MJNA 1IIWA 2D5WA 2R71A 4YKPA 3BFUA 3RT6B 1XT8A 2F6GA 4U22A 2Y7IA 2UVIA 3TODA 4ZECA 4O3AA 5M2VA 2ZMBA 1DSNA 1I69A 2O69A 3H7MA 5ICTA 3L6HA 3OO8A 2O7IA 3O29A 2Y7WA 3K1PA 5AA2D 1P99A 3T93B 3FUZA 2OCUA 2GH9A 1L5TA 2UYEA 4XKPA 1HSJA 3TCGA 3N26A 1N3WA 1TWYA 4BDMA 4F22A 1URSA 4R74A 1BKAA 4LP2B 4WEDA 5A5XA 2Q89A 3TFLA 3SETA 3SEUA 2H4IA 2RCBA 1B4HA 2RC8A 2IEEA 4N6PA 4F19A 2OWTA 4OYVA 3PPNA 5I56B 4NE4A 2I4CA 2GHAA 4OEVA 2DP8A 4ZEDA 4F3BA 1N3XA 3CI8A 1MPBA 2V93A 5H8HA 2ONKE 5DEXA 4U4XA 3HSTA 4NWDA 1VFDA 4U1OA 1GR2A 4RYAA 4OESA 1VSOA 2XXVA 3MZ1A 1J1NA 3H6WA 3CG3A 4THIA 2YPNA 4R6KA 3UA8A 4XKRA 3RTWB 2ALUA 2HXWA 1CE2A 2THIA 3VLVA 1F9BA 2RCAA 3KN7A 4ZEIA 3TUSA 3DP6A 3N6UA 4ZZEA 4NF5B 3TTLA 2Q9TA 1TFDA 2DVZA 1UIVA 3M8UA 4Z7EA 4I1DA 2HAUA 2Z23A 3K01A 3ZKLA 3QK6A 2Q88A 4N07A 4QSDA 4ZZAA 3MVXA 4BDOA 2XXYA 4H8IA 1B46A 1M5DA 4R2FA 1MQHA 1R9LA 5B70A 3H03A 3CSGA 4IY5A 3SEYA 4OERA 3RLFE 2F36A 3IJXB 3MAMA 5CM6A 4FAJA 4ZDMA 5I59A 3LSWA 1ATGA 3BKIB 3W15C 1D4NA 5CMBA 3MPKA 3T9XB 3LSLA 4NMYA 3UK4A 5CBRA 2XHDA 3U72A 3H6VA 4G2ZA 1IEJA 1MXZA 1LSTA 2DS9A 4POWA 5IKBA 4H67A 1NMUA 2ZXTA 5KDTA 1M5EA 4GVOA 3IO4A 3IORA 3UIFA 3PPRA 3IR1A 3QIMA 1B3HA 5L9OA 2PVUA 4RPOA 3UP9A 4DDDA 4M4GA 1MXUA 4GXSB 3LBSA 4YAHX 4YKIA 3G3GA 4R9FA 2DXRA 3MBPA 2RKMA 1LB9A 5I57A 2XX9A 3VXBA 4NF4A 2DE2A 3H6UA 4DXBA 1TT1A 1UTHA 3TELA 3HHFA 1NNTA 1B40A 4EUOA 5TP9A 4FECA 3I6VA 1B05A 4RPNA 2DWIA 2X7PA 1QUIA 3KGCA 1R6ZA 4R2BA 3M3LA 2HFBA 2REJA 2BJJX 3KSJA 2X26A 2Y7KA 3H6TA 1WDNA 1NL5A 4GWOA 4U4SA 4H5GA 2Z8DA 3SKPA 3IJOB 4EQBA 1QVSA 3G3JA 4XKQA 1USYH 4GF8A 1Y4CA 2PBWA 4Q30B 4DLDA 2OLBA 3D4GA 3C31A 3OEMA 2UYFA 2V25A 4IGTA 4K3FA 1PB9A 4IO2A 1SQYA 1EH3A 2ZYKA 2UVGA 4C1TA 4YB5A 1QW0A 1H44A 3PUXE 3CG1A 4R6HA 5B7DA 2O84X 1IZ1A 2QS1A 3WAEA 1P1OA 1IXGA 3EQ1A 4HCYA 2Z8EA 4IO6A 1B5IA 4U1ZA 5H8QB 1OIBA 3TTKA 1MS7A 2ESNA 2A5SA 3PPOA 2RC7A 2D21A 3KJTA 4H0WA 4OQOA 3AXFA 3QUFA 3WAFA 1MRPA 4FIMA 1IUDA 1PB7A 4F39A 1NH7A 3KSXA 4OTEA 3ECRA 1R1NA 2UVJA 1ANFA 4HW8A 5A5XB 2O51A 5TPAA 5J1DA 1FTOA 4ELQA 4FE8A 1UTBA 1GVCA 2NWJA 1LCTA 4QF9A 3VLUA 2ZNUA 5AE4A 1Y20A 1Y9UA 3Q26A 5ISUA 1Z7ME 3CR9A 4TOZA 3RUMA 1AOVA 2H99A 1IQ7A 1N0TA 3I3VA 3KJ7A 1SI0A 5H8HB 3G3KA 5DEXB 4OENA 1JETA 4YICA 3FXRA 3GBAA 1B3LA 2R6GE 3OSRA 2I3VA 2NUVA 1VE4A 4LZ5A 1FQAA 3VV5A 3PUWE 3HO7A 3VXCA 3FVOA 1R9QA 1MH3A 3RT8A 3S4UA 4DIGA 3OELA 2AL4A 5AA4A 2F7CA 2NVUB 1TXFA 2DYXA 3IB2A 1MY3A 1SW2A 2NOOA 2XXXA 2ONSA 3MZBA 2ZNSA 4JSDA 3F11A 2M8CA 3FD3A 3HPIA 4OFLA 3W9VA 3KN8A 2PX1A 1MPDA 4EXLA 3VVDA 4ZS9A 3TCFA 3TTNA 1PBQA 3ZKKA 1NFTA 4KPTA 1FQDA 5ITOA 4AB6A 1B52A 3BBRA 3IX1A 1FTJA 3EF7A 3GBBA 3SEVA 4RK9A 3N5LA 4QFLA 1B7HA 1XC1A 5IAIA 4G8NA 1DTZA 4PQJA 1BP5A 4JWXA 4EF2A 1OVBA 1XHYA 1DMBA 2F78A 1N84A 1EZ9A 4PFTA 2VOZA 2QSXA 4JBZA 5DTBA 2GFEA 4PFYA 5KDTB 1QKAA 1B1XA 1SW1A 2GHBA 4O3CA 2OZZA 3DM0A 1II5A 4UACA 3MWBA 1S9TA 1YPNA 3K6UA 1H43A 4IGRA 3C32A 3A09A 1DPPA 4U23A 4TLMB 1XOCA 5EHSA 3N6TA 2Z22A 1JW1A 4M1VA 3EHUA 4OFOA 5I57B 3TQWA 1DOTA 2FA7A 2RINA 3KOSA 3O97A 1AMFA 4NF4B 3RGYA 3CRBA 1QUJA 3HCQA 2XXUA 1UTHB 5CBSA 4P0GA 3K4UA 5TP9B 3ODBA 3Q29A 4PFWA 4OEUA 1Y3PA 5KCJA 3QXMA 3GLBA 2YJPA 5FTHA 1B5HA 4DXCA 4JSOA 3VDFA 4BDRA 4GQOA 1S7YA 1NH8A 4F2OA 2NXOA 3C36A 3JV9A 2ANJA 3VVFA 3ZSFA 1A40A 1GGGA 2Q8JA 1B6HA 1SDXA 3S2VA 1S50A 4EXKA 3Q27A 5JTYA 1IITA 2AIXA 1MY0A 1MQGA 4IB2A 3TDJA 3TTMA 2VP1A 1MY1A 2PT1A 2ZYOA 2QMXA 2QL3A 1QUKA 3S9LC 1US4A 4LQ2A 4YKJA 5I2NA 1LB8A 3R7XA 1B9JA 1ZTYA 3O2AA 2D3IA 5H8NA 4UA8A 4NF6A 4X1DA 5H8FA 1GTKA 4HTGA 3Q25A 4YB6A 4POXA 5AA3A 4NEDA 2REGA 1Z7NE 3SESA 4P11A 1QULA 3MVYA 1BLFA 3ILTB 3KEIA 3TPAA 3B6QA 1JVXA 1LBBA 1SYHA 5FHMA 3PD8A 3G3IA 2H5YA 4JWOA 1MM6A 4KYSA 1SYIA 3OMBA 5I2KA 3E4RA 4PETA 5TPAB 1Y4TA 2RC9A 4OWDA 3E9XA 1LGBC 1M5BA 1UTBB 1ELJA 4ZEBA 2E1SA 5K2YA 1LAGE 1B3FA 1B3GA 3OSQA 1OLCA 1FQFA 2LAOA 3JYRA 5FTIA 4ZE8A 4OHNA 3L6GA 2XXWA 1ZJLA 3QAXA 1FQEA 4ELPA 4ND9A 1VFEA 5F1QA 4GD5A 3A3CA 2F35A 1JEVA 2I4BA 4GRKA 1B32A 2HQ0A 3LC8A 2I3WA 2O6AA 4YU0A 1MQJA 4G8MA 2VD3A 4F31B 4QSEA 5HBCA 3MZ9A 4G68A 4ESWA 1FQCA 5AA4B 3RQTA 1JEUA 1PDAA 3OXNA 5BWJA 4DCXA 5AA2A 1XS5A 4JDFA 3THIA 4MLQA 1JW5A 2P2AA 3KG2A 2PYYA 5HPQA 1LBCA 4F1VA 3E13X 2ONRA 3A3UA 3FXQA 4QHQA 2QS3A 4RXLA 2QRYA 4KD5A 5F7VA 3IOTA 1URDA 1FTLA 4GL0A 4ZEKA 3K00A 1MDQA 4FATA 1MXWA 3FVGA 1NNKA 3T9HB 2B65A 3O6GA 2PMSA 3MC2A 1HSLA 1ZMGA 4P0IA 4X1BA 1N76A 1N7WA 5L9MA 3IOUA 3TQLA 1FCKA 1ZBMA 2F34A 4R73A 4OETA 3FVNA 1TFAA 3DELB 4X9TA 3T9VA 4KHZE 1BTJA 4DE8A 4KCDA 1MG1A 1USYE 3RNNA 2OJTA 3TZAA 4JXIA 4R9GA 3PV0E 4NWCA 2E0SA 2V3QA 4F1UA 1P1NA 1LCFA 1PBPA 1I6QA 4Q0CA 3IK6B 4BLAA 2KLFA 1LLSA 1DPEA 3FV2A 5I58A 3PPQA 3SEXA 3VLWA 4ZEFA 3Q28A 5BUUA 4HS7A 2V3UA 4HCWA 3MVWA 2HCAA 2GRVA 2FNCA 4ECFA 3PUYE 4AB5A 3S9NC 4RK2A 2H98A 3TTRA 1T0KA 2B3BA 3T96B 1YCJA 3DP4A 1JVYA 1B51A 5EHMA 1EU8A 2F7BA 2F7AA 3HV1A 4N13A 3K02A 2DSFA 1MXYA 4G4PA 3V8XB 4F3GA 5JEIA 5CI5A 5KCJB 4LZ7A 3QYTA 3JZJA 4LUBA 1OQHA 5I84A 3ZS6A 1B4ZA 3IAZA 4BDNA 1EZPA 4KI0E 1B0LA 4EQ7A 2YLNA 2I49A 4ELRA 2DWAA 1B3EA 1LFIA 3DP8A 1NNFA 3H4ZA 3R6UA 3CFXA 5JTYB 5LOMA 3T22A 2A5TA 3I5OA 4KYEA 2HZLA 4YMBA 4E0WA 1NNPA 2Q2AA 2DOJA 3UGWA 3KOTA 3EPEA 2F8DA 2HZKA 4DCYA 5HM4B 4H6DA 3U94A 5CC2A 1D9VA 4KFQA 5CRYA 2I48A 5H8SA 1IXIA 1O63A 3MPLA 2Y7PA 5I2NB 4WKMA 2P0SA 4XKNA 1D3KA 5ITPA 3U93A 5H8NB 4DZ1A 3C33A 4NF6B 3PMWA 3SEWA 5H8FB 3PMXA 1MH4A 1Y1ZA 1YTVA 2UXAA 2HAVA 3QUJA 3FV1A 4IO7A 2OWSA 3KBRA 3C4MA 4WXJA 3PUZE 1M5CA 4FJPA 4H1XA 4O3BA 2ABHA 1O7TA 1MXXA 1H45A 4MF3A 4C1UA 2G29A 2PT2A 1ZIUA 3OOAA 4IO3A 3V89B 5I59B 5I2KB 3K6WA 3CFLA 2DQVA 4U21A 1LAXA 4OZ9A 2XX8A 3LUYA 3IL1B 3PUVE 3G3HA 1B1HA 1A99A 5ELVA 5K2XA 5AA1A 1SW4A 2OBGA 2QMWA 3K1MA 2XXPA 3FGSA 2R9JA 5CMMA 1Y1MA 3TCHA 2XD3A 1Q1KA 1PB8A 4R6YA 2I58A 3N94A 4IO5A 4I62A 1I6BA 2Z8FA 3FJ7A 5H8QA 1RYXA 4G68B 1MDP1 1FQBA 2AL5A 3KZGA 2HEUA 3K6XA 3SERA 3RY3A 1PC3A 5AA2B 3PGFA 5TU0A 2Q2CA 5KZTA 1A54A 4H65A 2DXYA 4XXUA 3MP6A 1Y3NA 3UORA 4C0RA 5CMCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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