4P11A

Native crystal structure of mltf pseudomonas aeruginosa
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
428
structure length
428
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Native crystal structure of MltF Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 152
structure length 428
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A02
1MQHA 2UYFA 4H6DA 4AB6A 3MAMA 2RINA 4RXLA 2IEEA 4JWXA 5CM6A 3K4UA 3G3GA 4O3BA 4NF6B 2DVCA 2PBWA 3K1PA 1LCFA 3HN0A 1PC3A 3S9MC 3B6WA 4BLAA 2XXPA 5I2KB 2A5TB 3MVYA 3H6UA 3KOSA 4I62A 4EF1A 2AIXA 4OEVA 2H4IA 2DWIA 4KQPA 4R9FA 2XD2A 1YCJA 3F11A 4FEBA 1BLFA 4M4GA 2PYYA 4C0RA 1SQYA 2OZZA 2XXVA 3EPEA 1XHYA 3S4UA 4JWYA 2DXYA 2ONSA 4RYAA 3KSJA 2ANJA 1ZBMA 3AXFA 3E3KA 1B05A 4O3CA 1BIYA 5BUUA 1DPPA 2WKYA 2F7CA 2I48A 4JDFA 5AE4A 4C1TA 1QJMA 1FQCA 2XXQA 3HSTA 3VVFA 2FA7A 4RJZA 1OMPA 5FTHA 2PX1A 1FQDA 4KYDA 5A5XB 1PB7A 1Z7NE 3HV1A 5KZTA 2V84A 3V89B 1B7HA 3T9HB 2ALUA 4UACA 3V5AA 3WAFA 2XXIA 3MWBA 1S9TA 2R6GE 3ODBA 3R6UA 1DOTA 1N76A 5I2NA 1QUIA 3S2VA 3FJGA 5CMMA 2FYIA 4ZZEA 4C1UA 3KG2A 2XXTA 1B1HA 4U4SA 2DE2A 4DIGA 1DPEA 4F1YA 3IOTA 4QFLA 4R2FA 1MQJA 3C4MA 3OOAA 1IIWA 3VLVA 1MY4A 1NKXA 2O1MA 3MUQA 3KBRA 3BFTA 4LZ8A 3TQLA 3CSBA 4FE8A 4RY1A 2H5YA 2Z8EA 3HO7A 2ZYKA 3KEIA 4ZDMA 3MVXA 2VGQA 1XOCA 3SESA 3RN8A 3IJXB 2XXUA 1LAFE 3RNNA 2Q2AA 5ITPA 2I3VA 3U92A 4FECA 3T22A 3GXAA 1L5TA 5I59A 5EYFA 4RK9A 1LAXA 4OEUA 4JBZA 5TPAA 3EF7A 3C9HA 4ELOA 4N6PA 2QJEA 1S50A 4RPNA 2OBGA 3FV1A 1USYH 2OWTA 2B65A 4R6KA 4I9DA 1QKBA 5F1QA 1FQEA 3CRBA 1Q35A 3PMXA 1XT8A 5DEXB 1FCKA 1MH3A 3TELA 4IGTA 3O9PA 1MPCA 3FVGA 2Z8DA 1POY1 3UA8A 3K1MA 1ZLQA 1LBBA 1AIVA 3VXCA 4TLLB 4YKJA 1N3WA 3S9EA 1P1OA 3ZSFA 2F6PA 4YB7A 1MY1A 1B0HA 4KYEA 4XKPA 3B6QA 2P1SA 4WXJA 4GFRA 4LVQA 4DLDA 4HS7A 2XXWA 1MXWA 1ZIUA 4NF4B 3O6HA 3ZS6A 2DE3A 2RCAA 5H8NA 3K6XA 2I0BA 4DCXA 4IO2A 3SEVA 4OVJA 1A7LA 4XIGQ 3PMWA 5TP9B 2Z8FA 1JW1A 2Q88A 1H44A 3IB1A 3PV0E 3TKDA 1XC1A 1IXHA 3IO4A 3H06B 5AA2A 1XVXA 4XKNA 1JW5A 4JSDA 3KJTA 4YKIA 3C36A 4MFIA 1POTA 4IY6A 5DT6A 3W9VA 4IB2A 3G3KA 1N04A 5JK4A 2QPQA 4ELPA 5L9MA 4GLIA 3LSWA 1US5A 5BWJA 3USDA 4F3SA 3PPRA 3PPPA 3EHTA 1GV8A 2O68A 1HSEA 3C31A 5HPQA 1WODA 2QSXA 2NVUB 4R9GA 4YICA 3FJMA 4H5FA 2YJPA 2F34A 1ZKBA 2THIA 3CSGA 1M5FA 2GFEA 1MDQA 2O69A 3H6TA 3IOUA 1B3FA 1B40A 2QRYA 3U1OA 5JTYB 4EXKA 3K6UA 2O51A 2XXHA 3GBBA 1P99A 1FQFA 3E9XA 2VD2A 4BDMA 5IAIA 2DVZA 3KZGA 1SYHA 4EUOA 4PQJA 2R9JA 5I57A 3WAEA 3TQWA 5H8FA 1SDXA 2G93A 1LSTA 5I56B 2HAUA 4JXIA 1SW4A 4Q8RA 3C35A 1BP5A 1VFEA 1OIBA 4LQ5A 3B7DA 5K2YA 4X9TA 1OQHA 4I1DA 1B32A 3CR9A 4G68C 3MJNA 4MLQA 4POXA 3K0VA 4LA9A 3TTLA 3GLBA 4EF2A 1LFIA 2PMSA 4MLVA 2W7YA 3PUWE 4TQUQ 4YAHX 2I49A 3M3FA 4YB6A 2AYSA 1I6QA 1MS7A 2ZXTA 4P11A 5IKBA 1FW0A 4N07A 1JETA 1DSNA 4OFOA 2ZMBA 4NF5B 3BKIB 3MW0A 3LUYA 1GR2A 2OLBA 4F1VA 2RC9A 1NNFA 4U2RA 1TFDA 3PUVE 1B52A 1KWHA 4JSOA 3LSFB 2DOJA 4DXUA 3K2DA 4G68A 2ESNA 2V3UA 3CG3A 4OQOA 5DVJA 5I2KA 5ITOA 2A5TA 3FXQA 4Q5TA 3MP6A 3RTFB 1IUDA 3M8UA 3MBPA 3CG1A 1JEUA 4PFWA 4OMBA 1M5DA 5ISUA 4IGRA 1YTVA 1TFAA 1MM7A 1Y3QA 1LCTA 1HSJA 2B3BA 3Q25A 2REGA 4OTEA 3K6WA 1MXUA 3CVGA 1JVYA 1GVCA 1UIUA 3KJ7A 4F22A 1EZPA 3O2AA 3B6TA 4NTLA 5LOMA 5L9SA 3FXUA 3N94A 3KN3A 4N13A 3FUZA 4XTCQ 5J1DA 1CB6A 2Q9TA 4F29A 5A5XA 1OQGA 4DDDA 4YKKA 3DM0A 3T9VA 2F35A 4U21A 2GRVA 1VE4A 1DMBA 1SW2A 2H9BA 1QUKA 3IB2A 3QYTA 1EH3A 2FNCA 2X26A 4XKQA 4NWCA 5ICTA 3MP8A 3QUFA 2BJJX 4H67A 1D9VA 4BDNA 1M5EA 1A8FA 4GVOA 1H3DA 1NNTA 2O7IA 3FATA 3ILUB 4G8HA 4GQOA 3H7MA 2AL4A 1Y1ZA 1LFHA 4LQ2A 5CBRA 3K1NA 4U23A 1H45A 3O66A 4YKPA 1IZ1A 1HSLA 3THIA 2KLFA 3HPIA 2HFBA 5CI5A 1P1WA 4ECFA 3KOTA 4YZZA 4H5GA 1B5IA 1GGGA 2RC7A 3TDJA 3OO7A 4F3BA 3OSRA 2OWSA 3PGFA 1AMFA 3VFJA 4DXCA 2HEUA 2UVIA 3Q29A 3U93A 2M8CA 3H3GA 1AOVA 2A5SA 1EZOA 3VLUA 1NNKA 2D3IA 2V3TA 4WEDA 4ESWA 3OEMA 4G77A 4KYSA 1SI0A 3KN8A 2HZLA 4GIZA 5KDTB 4NF8B 1EZ9A 3VVEA 2UYEA 1MPBA 4XXUA 4U4XA 3C33A 3QXMA 5TU0A 3D4GA 5EHSA 3S9LC 5CC2A 1JQFA 1SW1A 1LGBC 5FHNA 3SERA 2YPNA 4QFNA 2ZNTA 1IXIA 1B5HA 4DE8A 1JW4A 2RF1A 1MQIA 1B58A 5CBSA 3T9UA 2Y7IA 1R6ZA 3PMVA 3QSLA 4IO3A 4NF4A 1SYIA 3UGWA 2R71A 3HCQA 4HW8A 1IQ7A 2V25A 1MPDA 5TP9A 1B2HA 2Y84A 4DXBA 3V8XB 1M5CA 2F7BA 4OERA 4R6YA 1B4HA 1UTBB 1NH7A 1LFGA 2IA4A 3UP9A 1MDP1 2B3FA 4K3FA 1QVSA 1O64A 2HCAA 2Y7KA 3BFUA 1UQWA 3IX1A 3KGCA 4KR5A 3IJOB 3PPOA 1B3GA 4OFJA 3FVOA 2D5WA 4NWDA 5KCJB 2I4CA 4EDPA 4OYVA 5CMBA 4QRZA 3E13X 5DTBA 3UN6A 5AA4A 5F7VA 4R74A 1OVBA 4IY5A 2GH9A 3S9NC 3TYHA 1B46A 2RKMA 3VLWA 4BDQA 5B7DA 4FIMA 5I58A 4M1VA 1UIVA 2HZKA 4QSCA 2I6EA 2QMXA 4Q30B 3N6TA 3SKPA 5JTYA 4X48A 3UK4A 1ATGA 3TUSA 3O97A 4QHQA 4FORA 4KPTA 1S7YA 4P0IA 2GHBA 4YMBA 2I3WA 1FQAA 1AL3A 3PU5A 3Q28A 1ELJA 1EU8A 2V3QA 3FGSA 4MF3A 5FHMA 4QF9A 1B7UA 1WDNA 1URDA 1JNFA 1Y20A 4POWA 3G3FA 2NUVA 5DVFA 1URGA 1XVYA 3TMGA 2ZNSA 4F19A 5B70A 1XS5A 2ONKE 3LR1A 2Y7WA 3K02A 3K00A 1ZMGA 5I84A 3SDFA 2HXWA 4MBPA 3SEYA 1UTHB 4IO7A 3TODA 4H0WA 3R7XA 2Q2CA 3CI8A 3PUXE 4TOZA 4F31B 4BDRA 4KI0E 4GWOA 1FTOA 1Y3PA 1I6BA 2DQVA 4NF5A 1MXXA 5ELVA 4R75A 2NWJA 3G3HA 5AA2B 3TTKA 3I3VA 3IL1B 1MRPA 3PPNA 1LB8A 2VD3A 3A3CA 3UIFA 3IAZA 1VSOA 3TCFA 3DP6A 1PB8A 3CFLA 1TXFA 3OO8A 1N7WA 3OO6A 3MPLA 5DYHA 1O63A 3MC2A 2F8DA 1N0TA 5CMCA 5M2VA 3DELB 3MZ1A 3DP8A 2XD3A 3U94A 4PFYA 3HHFA 5CMKA 3TCGA 3EHUA 1MXZA 4G4PA 3TCHA 3RT8A 5EHMA 3MPKA 4AQ4A 4FATA 3OMBA 2ONRA 1P1UA 4QFOA 4NEDA 4OHNA 4YU0A 5FTIA 1USYE 5K2XA 4OETA 1ZTYA 4NF6A 4ZE9A 3O29A 3O28A 4ISUA 4G8NA 2VOZA 1N84A 3H4ZA 3OSQA 3FJ7A 4RNSA 3FVNA 2XX8A 1GTKA 4EXLA 3QUJA 4H65A 1MY2A 1T0KA 1PEBA 3KN7A 1R1NA 3ONMA 1DTZA 3VXBA 4KFQA 1B4ZA 1IXCA 3TZAA 4F18A 4NE4A 1IXGA 3MQ9A 3O6IA 1B1XA 1SD3A 3G7WA 4H8JA 4PFUA 2H25A 3TTRA 2Q8JA 4KD5A 3KSXA 3W15C 2O7UA 3LC8A 2Y7RA 4GXSB 5H8SA 3A09A 4EQ9A 3V83A 3DP4A 3VE1B 2Z22A 2DWHA 5H8HB 4OESA 3JZJA 4X1DA 1J1NA 4ZS9A 4WEPA 4BDOA 4PFTA 1FQBA 3EHSA 1M5BA 5H8QB 1A99A 4HCWA 1B7ZA 2CZLA 2UVGA 4G68B 4OXVA 1B3LA 1TT1A 1RYXA 3ZKKA 1N7XA 3R26A 4HTGA 3OO9A 1B0LA 4QFPA 3CIJA 1LLSA 2Z23A 3D4CA 4LP2B 3FIRA 3ILTB 2X7PA 1YAEA 1NL5A 1PBQA 2Q89A 4NMYA 1MXYA 1B6HA 3CFXA 2P0SA 2ZYNA 3JV9A 5KDTA 3RPWA 4WKMA 4NF8A 3ECRA 2E1SA 4RK2A 4E0WA 3MP1A 3IOVA 3T66A 2OCUA 2V93A 1TWYA 1BKAA 2VP1A 3P7IA 2XX9A 3TEPA 2NXOA 3CFZA 3TAJA 2QMWA 4F2QA 4JWOA 1FTKA 1ANFA 4BDLA 4LATA 2PVUA 1NFTA 2UVJA 4TLMB 1AH5A 2O84X 1R9LA 3EN3A 4LUBA 2XHDA 1A54A 4F39A 4XKRA 4ZEIA 3OEKA 5DEXA 1O7TA 1UTBA 2Y7PA 1WVJA 1NH8A 2ZNUA 5JEIA 3N5LA 3FXRA 1MG1A 1P1NA 4IO5A 1H76A 3U72A 1LBCA 3C32A 3FASA 4OENA 3RTWB 2DS9A 5HM4B 3I6VA 4O3AA 4R73A 1ZU0A 3HHGA 3FD3A 1B5JA 1Y1MA 1I69A 5KCJA 3MVWA 5L8DA 1IITA 2DYXA 1A40A 3L6GA 1SW5A 2DE4A 1D4NA 3A3UA 1LAGE 1F9BA 1YPNA 4ZZAA 1US4A 2P2AA 1ZJLA 2O6AA 3H6VA 4LONB 1NNPA 1DTGA 2VHAA 1MQDA 3FV2A 2QS1A 5L9OA 3MZ9A 5I2NB 2F97A 2O1LA 3MZBA 5CRYA 2DP8A 4ELRA 1MXVA 4G2ZA 4EQ7A 4R2BA 3PUZE 2RCBA 1VFDA 2REJA 5DVIA 3TTNA 4GOTA 3M3KA 4ONYA 1P1QA 4Q0CA 3RQTA 4YMAA 3SEWA 3TFLA 4EQBA 4OWDA 2I0CA 1BTJA 2DWJA 4KCDA 4KHZE 4GD5A 3LBSA 3RY3A 4U22A 2DWAA 4P0GA 3L6HA 1UTHA 1LAHE 2H99A 2YLNA 1SBPA 5I59B 2ABHA 2LAOA 4OZ9A 1B9JA 3PPQA 1Z7ME 5TPAB 1MH4A 5AA2D 4Z7EA 3RGYA 3QAXA 1PDAA 3G3IA 4ZEKA 3OD7A 1N3XA 2I4BA 4GXAA 2DSFA 2OK2A 3W9WA 3QK6A 1SVXB 3GZGA 3RUMA 4LZ7A 4L17A 1D3KA 2CMOA 1NMUA 3QIMA 3SEUA 3H03A 3UORA 5I56A 4QFKA 1OLAA 4ESXA 4UA8A 1MQGA 3IORA 4I8CA 1PB9A 1JEVA 3TTMA 1B51A 1URSA 1I6AA 1II5A 4ZEDA 4FJPA 1QUJA 4R72A 4PETA 1H43A 4DCYA 3SETA 2E0SA 1PBPA 1CE2A 4AB5A 3BBRA 1Y4TA 4ND9A 3IB0A 3IK6B 3MVZA 3FVKA 5AA4B 5AA1A 4PE5B 4G8MA 4GF8A 3VVDA 4IO6A 4THIA 3G3JA 4IO4A 3PUYE 2QS2A 2UVHA 3U8QA 4MH5A 4X1BA 3C34A 4F3GA 1QULA 4HCYA 2GHAA 1FTLA 5H8NB 2QS4A 5I58B 1MY3A 4QSDA 1Y9UA 2UXAA 2XXRA 2DXRA 2F78A 3KFMA 2NOOA 2F7AA 4H8IA 4DZ1A 3T9XB 1R9QA 1MM6A 3Q27A 4ZECA 3LSLA 3JYRA 1B3EA 2X7QA 3EQ1A 4F2OA 1VR5A 1JVXA 2RC8A 2XXYA 3GBAA 3IO6A 4RPOA 3VV5A 4U1ZA 1A8EA 3O6GA 5FHOA 4KCCA 4F3PA 1QKAA 1OVTA 1SI1A 1QW0A 2QL3A 1IEJA 3H6WA 4FAJA 3M3LA 1Q1KA 1LB9A 2ZYMA 4E0XA 4ELQA 2AL5A 4ZEFA 2PT1A 2H98A 3OXNA 1RKMA 3IR1A 2F5XA 3DLNA 3Q26A 3ZKLA 2G29A 4H1XA 3RLFE 1OLCA 1A55A 2HQ0A 5HBCA 5H8HA 4R6HA 1D9YA 4U1OA 5I57B 3IOWA 5H8QA 3OELA 2ZYOA 5H8FB 2HAVA 4ZEBA 5AA3A 2D21A 3FZVA 1MY0A 5ICQA 4Z0IA 4LZ5A 2QS3A 4RA1A 4ZE8A 3OENA 3SEXA 3RT6B 1FTMA 4QSEA 2OJTA 3K01A 2PT2A 3PD9A 3N6UA 1FTJA 2I58A 3E4RA 3LSXA 1Y3NA 4PP0A 2XX7A 3T96B 4GRKA 4FEDA 2F6GA 3TPAA 4F1UA 4GL8A 1B3HA 2F36A 4OFLA 2XXXA 4YB5A 3VDFA 3I5OA 3T93B 1Y4CA 4GL0A 3K6VA 3N26A 1RYOA 4JB7A 3PD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MQHA 2UYFA 4H6DA 4AB6A 3MAMA 2RINA 2WYKA 4RXLA 2IEEA 4JWXA 5CM6A 3K4UA 3G3GA 4O3BA 2QVRA 5IZ1A 4PE3A 4NF6B 2DVCA 2PBWA 4NHBA 3K1PA 1LCFA 3HN0A 1PC3A 3S9MC 1FSAA 3B6WA 4BLAA 2XXPA 5I2KB 2FVZA 2A5TB 1FBGA 3H6UA 1FPFA 3MVYA 1FBPA 3KOSA 4I62A 4EF1A 2AIXA 4OEVA 2H4IA 2DWIA 4KQPA 4R9FA 2XD2A 1YCJA 3F11A 4FEBA 1BLFA 4M4GA 2PYYA 4C0RA 1SQYA 2OZZA 2XXVA 3EPEA 2P3VA 1XHYA 3S4UA 4JWYA 2DXYA 2ONSA 4RYAA 4I3YA 3KSJA 2XWKA 2ANJA 1ZBMA 3T1BA 3AXFA 3E3KA 1FBEA 1B05A 4O3CA 1BIYA 5BUUA 4AS4A 1DPPA 1NUZA 2WKYA 2F7CA 2I48A 4JVIA 4JDFA 5AE4A 1FTAA 4C1TA 1QJMA 1FQCA 2JJKA 2XXQA 3HSTA 3VVFA 2FA7A 4RJZA 1OMPA 5FTHA 2KR0A 2PX1A 1FQDA 4KYDA 5A5XB 1PB7A 1Z7NE 3HV1A 5KZTA 2V84A 3V89B 1B7HA 3U65A 3T9HB 1FBFA 2ALUA 4UACA 3V5AA 3WAFA 2XXIA 4AS5A 3MWBA 1S9TA 2R6GE 3ODBA 3R6UA 1DOTA 1N76A 5I2NA 1QUIA 3S2VA 3FJGA 5CMMA 2FYIA 4ZZEA 4C1UA 3KG2A 2XXTA 1B1HA 4U4SA 1QGXA 2DE2A 4DIGA 4LN5A 4P3LA 1DPEA 4F1YA 3IOTA 4QFLA 4H46A 4R2FA 1MQJA 4N91A 3C4MA 3OOAA 2FIEA 1IIWA 3VLVA 1MY4A 1NKXA 1NUYA 2O1MA 3MUQA 1DCUA 3KBRA 2XWVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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