4QRZA

Crystal structure of sugar transporter atu4361 from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltotriose
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter from Agrobacterium Radiobacter, Target Efi-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 139
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA02
4C1UA 4H6DA 1LCFA 1N7WA 3FV1A 4QSEA 4KYEA 1NMUA 4U1OA 1B4HA 3PPRA 2V25A 5H8QA 3QIMA 5JTYB 1A54A 4KR5A 1M5DA 1N3WA 3KOTA 3VLVA 4IGRA 5F1QA 3G7WA 3SEXA 1B5JA 2REJA 3QUFA 1HSJA 4FIMA 3UA8A 2DS9A 4G4PA 3EN3A 4RA1A 1IZ1A 2I3WA 4UACA 2HZKA 2VP1A 4POXA 3Q25A 3JYRA 3PUXE 3GZGA 2XXXA 4X1DA 2AL4A 1A8FA 4ELPA 3FD3A 1F9BA 4DIGA 4R6HA 4U4SA 1MDP1 5CM6A 5AA1A 4YICA 2DE3A 2Q88A 4KI0E 3VDFA 3I5OA 3I3VA 4QFKA 2OK2A 2THIA 1NNKA 1I6AA 1PB8A 2REGA 1MS7A 1IEJA 3Q29A 3MQ9A 4MLQA 3TFLA 1SBPA 3ZSFA 2BJJX 3FXQA 4PETA 1B5HA 4PFYA 3IAZA 4PFTA 4OWDA 4YMBA 5DT6A 4LA9A 5CC2A 3T9HB 1OQHA 3P7IA 3M3FA 1DTZA 3RT8A 3TCGA 4OEUA 5ITPA 1UTBB 4KCCA 1B7ZA 2QS1A 1A7LA 3ZS6A 3VV5A 3D4GA 4LONB 3OSRA 4E0WA 2V93A 3C31A 4R9FA 1B58A 1MQGA 3WAFA 4F1VA 1B05A 4GWOA 3CI8A 2M8CA 3K02A 3G3JA 2F35A 4G8HA 4P0IA 3IOVA 5I59A 4EQ9A 5I59B 2Y7PA 4LZ7A 2Z8DA 3O6HA 4PP0A 4WXJA 3KN7A 3QXMA 4AQ4A 3H6TA 5LOMA 1MG1A 1P1NA 2GRVA 2DWHA 3KSXA 1SDXA 3O29A 5ICQA 4R73A 4DDDA 1HSEA 3QUJA 3IL1B 3ONMA 3O2AA 3MP1A 4BLAA 2ONKE 3N6UA 4MFIA 1LB9A 1QKBA 1I69A 1OMPA 1JQFA 3QSLA 4H67A 1XOCA 4G68C 4F39A 4YKPA 3O6GA 4NF8A 3SEVA 1JETA 4EDPA 4N07A 2Z22A 3PGFA 3A3UA 5CI5A 2IEEA 4NF8B 4NF6A 4R72A 1FW0A 1YTVA 2F7BA 3IJOB 4P11A 1OQGA 3GBAA 1M5EA 3ILTB 5HPQA 4NF6B 4TLMB 3MVYA 3K2DA 4FECA 3OD7A 3M8UA 4ESXA 4RPNA 1LAFE 3SKPA 3MJNA 1MXZA 3TTRA 3BKIB 4I8CA 4QFLA 4MLVA 4KPTA 4GD5A 3LR1A 4THIA 4XKQA 4O3BA 3USDA 5CMBA 3Q26A 1QVSA 4FEBA 1A99A 3JV9A 5DVIA 2F8DA 2H98A 1SW2A 2ZNSA 3K01A 1IXHA 3UP9A 4X48A 1P1WA 2Y7IA 2VHAA 4ZEBA 4R2FA 1Y3PA 1AL3A 1A55A 2QS3A 4XIGQ 5HM4B 5FHOA 3H7MA 3KSJA 2G29A 4Q0CA 3FVNA 3VVEA 1MH3A 2XXTA 3LSLA 2VD3A 2X26A 1B3FA 1O64A 1FTJA 2OWSA 4F31B 1MXWA 1H45A 2QMWA 2ESNA 3IO4A 4XKRA 2ALUA 4YB7A 2Q8JA 3H4ZA 1O63A 4H65A 4NTLA 4ND9A 1UIVA 3FZVA 4F3GA 4R74A 5KDTB 5TP9A 5DYHA 4ZEDA 3PUWE 5TP9B 3RY3A 1PBPA 1R6ZA 5L8DA 3CIJA 3DM0A 4GXAA 2QMXA 4HCYA 4O3AA 3B6QA 1LAGE 1D3KA 4RYAA 4EUOA 1OLCA 4IO7A 4QSCA 1GV8A 1FTLA 1Y4TA 5DEXA 3KEIA 1D4NA 4GRKA 3C35A 1B3EA 1KWHA 5DEXB 4HW8A 4QFOA 3HO7A 3OEKA 3VLWA 1ELJA 3TCFA 2I48A 3N5LA 1P99A 3FXUA 3TEPA 1LB8A 3MZBA 1ZTYA 3VXCA 3MBPA 4WEPA 3H6VA 3MP8A 3G3FA 4IO2A 4ELRA 1AH5A 4ELQA 2XX8A 1B46A 4BDLA 1QULA 3KBRA 4ISUA 1FQAA 1EZPA 4IY5A 5H8SA 1UIUA 2RC8A 5AA2A 2Q89A 2B3BA 1J1NA 4QHQA 5I58A 2QL3A 3RNNA 5CMKA 3FVGA 2GHBA 3RLFE 1EZ9A 5B70A 4ZE8A 5HBCA 2DE4A 2F78A 2YPNA 5AA4B 5K2XA 3PV0E 4DXUA 4OETA 1GVCA 1D9VA 4JSDA 1M5FA 3HV1A 4OFJA 4X1BA 2I49A 1MQJA 3OEMA 1QUJA 3KN8A 3LSFB 2F6GA 4FATA 3TELA 3SESA 3EQ1A 1L5TA 2OJTA 3U92A 4HCWA 5BUUA 4ZZEA 3IB1A 4HTGA 3O6IA 3H6UA 3K6XA 2Y7WA 3PMXA 1I6QA 5L9SA 1DPEA 1MPCA 4TOZA 1B2HA 3UORA 1B7UA 3VLUA 1DSNA 3OO7A 4LQ5A 5I2NB 4JWYA 4U1ZA 4H1XA 5AA3A 1SI0A 3C32A 4AB6A 4LZ5A 4AB5A 1P1QA 3K1MA 5M2VA 4JWXA 1PDAA 4X9TA 1ATGA 2XXQA 2VGQA 3M3KA 2A5TB 4L17A 3LUYA 1NL5A 2XXRA 2I6EA 3B7DA 3FXRA 2HQ0A 3TTLA 4EF2A 1B5IA 2XX7A 3CR9A 3RTWB 2V3QA 1HSLA 5H8QB 3OO6A 1N04A 2OWTA 1B51A 1ZMGA 4LATA 4F3SA 3ECRA 5ISUA 4H5GA 2HZLA 1NFTA 4EXLA 4IO6A 3W15C 1NNFA 3DP4A 3UK4A 3VVDA 4F18A 5CMMA 3T9VA 3H6WA 3TKDA 4FE8A 2OLBA 1XVYA 3G3IA 3IB2A 4GVOA 3GXAA 3MVZA 5KZTA 2DWAA 1M5BA 2GH9A 3JZJA 5CBSA 4OYVA 5I2KA 4ZE9A 4LQ2A 1QUKA 3UN6A 2AIXA 2FA7A 1USYE 4IO3A 1QJMA 1YPNA 2DP8A 5TPAA 1R1NA 3BBRA 1DOTA 3MC2A 2DVCA 3QYTA 1QKAA 3PU5A 2DVZA 5FTHA 4Q8RA 3F11A 3ZKLA 4I1DA 3SEUA 2NVUB 2ONSA 5H8HA 3FV2A 4F1UA 2G93A 1XT8A 3SETA 5H8HB 2DQVA 1P1OA 4N13A 4ZDMA 3SEWA 4OENA 3CSGA 1FQBA 1EZOA 4ZEFA 2FYIA 4MH5A 5FTIA 1DPPA 4F19A 2RCAA 1VSOA 1BTJA 1B3LA 3V8XB 4OXVA 2HAUA 2LAOA 2PYYA 1MY3A 4QFNA 3E13X 1WVJA 3E9XA 1Y3QA 1ANFA 4RY1A 4NE4A 1MRPA 5KCJA 1FCKA 3TPAA 1BIYA 3D4CA 2NWJA 1A8EA 3THIA 3PUVE 1FTKA 3C33A 3U8QA 3K6WA 4RK9A 3K6VA 3T9UA 1MXVA 3KOSA 1USYH 3T66A 4F2OA 1FTOA 4H5FA 2O69A 3T22A 3TQWA 4ELOA 2ZNUA 3WAEA 1BKAA 4JDFA 1B32A 3MPLA 4FORA 2R71A 1SW1A 4ECFA 4F3BA 3DP6A 5JEIA 4IO4A 3V89B 4OTEA 2I0CA 5IKBA 1OVTA 4DLDA 1ZKBA 1CE2A 4BDMA 1D9YA 1H76A 1NNPA 2ONRA 2O68A 1GTKA 2GHAA 4XTCQ 2H9BA 4NF4A 1Q35A 3L6GA 4UA8A 2XX9A 4P0GA 2ZMBA 1VE4A 2O1LA 1M5CA 5ELVA 4RPOA 2V84A 2QPQA 3VXBA 2UYEA 3IJXB 3IR1A 1Y3NA 1JVXA 2Z23A 1II5A 4PFUA 3R7XA 4GIZA 3OSQA 3CFZA 4QFPA 3MPKA 3T93B 4EF1A 5ITOA 3MW0A 2PBWA 1S7YA 3O28A 5CBRA 3FASA 2RINA 1ZU0A 2XXYA 2RC9A 3AXFA 3RPWA 1B40A 5F7VA 1B0HA 3EHSA 4OZ9A 3EPEA 1VR5A 4DXBA 4OVJA 2E1SA 1JW5A 2Y7KA 3IOWA 1JW4A 5H8NA 3ZKKA 4KYSA 1PB9A 1H43A 1B3HA 1NH7A 4MBPA 1Y1MA 1Q1KA 1LBCA 3OO8A 3PPPA 2V3UA 1IXIA 2F7CA 1IXGA 1MQIA 3KJ7A 4F1YA 3RTFB 1EH3A 1MDQA 1Z7ME 3SERA 2OZZA 2HCAA 4ESWA 3E4RA 2RCBA 1R9QA 1MY1A 2KLFA 4GFRA 5TU0A 2WKYA 3B6TA 3MZ1A 1XC1A 3H06B 4DCYA 1NKXA 2I58A 1MXUA 1H44A 3KJTA 3K00A 4RXLA 3LSXA 5AE4A 3O9PA 4YAHX 2PT2A 4KYDA 3U93A 1S50A 3Q27A 1B1XA 5IAIA 2Z8FA 1I6BA 4KQPA 1LBBA 3TUSA 3S4UA 2E0SA 1UQWA 3C9HA 2RC7A 5BWJA 4GL0A 2HAVA 1IIWA 4WEDA 4LP2B 1SQYA 1AMFA 3PUZE 2D3IA 3TDJA 1N84A 4YKJA 3C34A 5AA2B 2DXRA 1H3DA 1LFGA 4QRZA 2I0BA 3MAMA 2PT1A 3CG3A 5I58B 2Q2CA 3S9MC 3HPIA 4XKPA 1AOVA 1BP5A 1LAHE 3FVKA 3DLNA 4WKMA 2UXAA 4ZECA 1MY4A 4H0WA 3OO9A 3H3GA 4NWCA 5L9OA 4U21A 1MY0A 5FHNA 3L6HA 4GOTA 4RNSA 1AIVA 1O7TA 4DCXA 1PEBA 4GLIA 1LLSA 1P1UA 3RN8A 3VFJA 3K1NA 1JW1A 2XD2A 4ZS9A 4C0RA 1URSA 1FQFA 3K0VA 3PPQA 4LZ8A 4XXUA 1RYOA 5I57A 5I56A 5DVFA 3PD9A 4M1VA 3PMWA 3A3CA 3CFLA 1MM7A 4H8JA 1DMBA 1IUDA 2QSXA 4U2RA 4QSDA 4GL8A 4G2ZA 2I4BA 4IY6A 1B3GA 4Z0IA 3KN3A 1MH4A 4RJZA 5L9MA 3K1PA 1A40A 3KGCA 2Y84A 1PBQA 2HFBA 4G68A 4G8NA 2O7IA 1CB6A 1XHYA 2D5WA 3I6VA 1LSTA 2DYXA 4OHNA 4RK2A 1SYIA 3C4MA 4KD5A 5DVJA 4KFQA 3U94A 1ZLQA 4NEDA 5JTYA 4YB5A 4QF9A 3PMVA 4U4XA 3KZGA 2ZYNA 4OERA 1LAXA 1N3XA 4IO5A 2HEUA 3K6UA 3U72A 1S9TA 3OELA 1URDA 1XS5A 4NMYA 1US4A 3TODA 3IK6B 3VVFA 3FVOA 1IITA 1LGBC 3O66A 3R26A 3N26A 1B7HA 2ZYKA 3RT6B 3FJGA 5I2KB 3MVXA 5ICTA 2GFEA 3HN0A 5TPAB 3T96B 4FAJA 1T0KA 3ILUB 4Q30B 2UYFA 1FTMA 3FJMA 2XD3A 3TAJA 3OXNA 2HXWA 4KCDA 3LBSA 1TWYA 4EXKA 4R6YA 4N6PA 2CMOA 1PB7A 2DE2A 2OCUA 4BDRA 1ZBMA 2Q9TA 4R75A 4C1TA 1IXCA 1UTBA 1B1HA 3IOTA 3IB0A 5EYFA 2H99A 1POY1 5A5XA 3S9EA 2B65A 2AYSA 1RKMA 5CMCA 4JWOA 5A5XB 1US5A 4R6KA 4DXCA 2A5SA 1QW0A 4G77A 2NXOA 2FNCA 3ODBA 4R9GA 5I84A 3IX1A 4GXSB 1YAEA 2RF1A 3H03A 2F36A 4YKIA 4TLLB 2R6GE 2VD2A 4BDQA 2XXWA 2ZYMA 5K2YA 2O7UA 2IA4A 5KCJB 2P2AA 3CRBA 4ZZAA 1PC3A 4E0XA 4YB6A 2DXYA 2XXPA 3IO6A 3IOUA 2UVJA 2QJEA 2QS4A 1MPBA 1R9LA 2XXIA 1GGGA 5AA2D 1Z7NE 4OFLA 2F34A 4Z7EA 1EU8A 1OLAA 2I4CA 2H4IA 1MQDA 5FHMA 4ONYA 4PFWA 3OENA 3QK6A 3TQLA 4F29A 4YKKA 3HHFA 4JXIA 1SW5A 4M4GA 4PE5B 4LVQA 3Q28A 3B6WA 2O84X 3TZAA 1YCJA 2I3VA 3E3KA 4FEDA 4IB2A 3BFTA 2OBGA 2ZXTA 3G3GA 2YLNA 1JEUA 2O1MA 1JVYA 4F22A 3S9NC 3LC8A 2QS2A 1GR2A 3C36A 1LCTA 2UVHA 3TTMA 2ABHA 2Z8EA 2F7AA 1SVXB 3V83A 4ZEKA 2VOZA 3W9WA 4NF4B 3EHUA 3HHGA 3IORA 1WODA 1Y4CA 1ZIUA 3CSBA 2F97A 2XXVA 2AL5A 4K3FA 3EF7A 4EQBA 3HSTA 1FQDA 3G3HA 4GQOA 2O6AA 1IQ7A 4H8IA 4YMAA 4YU0A 3A09A 4IGTA 5H8FA 4NF5A 5H8FB 1SD3A 1NH8A 4NF5B 3TCHA 1FQCA 2PVUA 3N94A 3UIFA 4G8MA 2F6PA 3R6UA 3FATA 1MM6A 2P1SA 3U1OA 3PPOA 3MWBA 1B4ZA 4DZ1A 3GLBA 1QUIA 5H8NB 3TTKA 2ANJA 5KDTA 4NWDA 3K4UA 3M3LA 1B6HA 1BLFA 4R2BA 3UGWA 2ZNTA 5EHSA 1FQEA 4F3PA 4OESA 4OMBA 3T9XB 1MQHA 1MPDA 2W7YA 4I9DA 3MVWA 4KHZE 3QAXA 4ZEIA 1OVBA 3W9VA 5JK4A 2UVGA 4U22A 2V3TA 2F5XA 1MXXA 4HS7A 3G3KA 3BFUA 1Y20A 2B3FA 1Y1ZA 4GF8A 3MUQA 3FUZA 4MF3A 3CFXA 1LFIA 3RGYA 5EHMA 1N0TA 1DTGA 4Q5TA 1JNFA 2PX1A 3S2VA 3FJ7A 1RYXA 2DOJA 1MXYA 4I62A 1MY2A 3PUYE 1VFDA 1SW4A 1URGA 4O3CA 4LUBA 3TYHA 2X7QA 2R9JA 1OIBA 4OEVA 5J1DA 3RQTA 3VE1B 5DTBA 1VFEA 3O97A 4JSOA 3KFMA 3OMBA 4FJPA 3SDFA 2ZYOA 4F2QA 2YJPA 1LFHA 1B0LA 3GBBA 3SEYA 3OOAA 3PD8A 5AA4A 4BDOA 5B7DA 5CRYA 1TT1A 4XKNA 1TFDA 4OQOA 4BDNA 2XXUA 2DSFA 4YZZA 1JEVA 3HCQA 2Y7RA 3FGSA 3PPNA 1XVXA 3DP8A 2XHDA 2P0SA 3LSWA 3TMGA 3RUMA 1NNTA 3S9LC 2XXHA 3MZ9A 2X7PA 3N6TA 2DWJA 3KG2A 1N76A 5I57B 1N7XA 4EQ7A 5I56B 2QRYA 4PQJA 2DWIA 2H25A 2CZLA 3MP6A 2NOOA 3FIRA 3CG1A 2PMSA 3CVGA 1UTHA 4DE8A 1SI1A 1UTHB 2RKMA 2D21A 4TQUQ 1POTA 3V5AA 1B9JA 5I2NA 1ZJLA 2NUVA 1Y9UA 4OFOA 4G68B 3EHTA 2Q2AA 3DELB 1B52A 2O51A 1TXFA 2UVIA 4POWA 1SYHA 4U23A 4JB7A 1WDNA 1TFAA 3TTNA 4JBZA 2A5TA 2H5YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C1UA 4H6DA 1LCFA 1N7WA 3FV1A 4QSEA 4KYEA 1NMUA 4U1OA 1B4HA 3PPRA 2V25A 5H8QA 3QIMA 5JTYB 1A54A 4KR5A 1M5DA 1N3WA 3KOTA 4GX6A 3VLVA 4IGRA 1FBCA 2L5VA 5F1QA 4N81A 3G7WA 1NUWA 3SEXA 1B5JA 2REJA 3HFUA 3QUFA 1HSJA 4FIMA 3UA8A 5IZ3B 2DS9A 4G4PA 1FJ9A 3EN3A 4RA1A 1IZ1A 3ISPA 2I3WA 4PDHA 4UACA 2HZKA 2VP1A 4POXA 3Q25A 3JYRA 3E78A 3KC0A 3PUXE 3GZGA 2XXXA 4PE3A 4X1DA 2AL4A 1A8FA 2B4MA 4ELPA 3FD3A 1F9BA 4DIGA 4R6HA 4U4SA 1MDP1 5CM6A 5ET5A 5AA1A 4YICA 2DE3A 1FBGA 2Q88A 1YXIA 4KI0E 1INPA 2CEYA 3VDFA 3I5OA 3I3VA 4QFKA 2OK2A 2THIA 1NNKA 1RDYA 1I6AA 1PB8A 2FIEA 2REGA 1MS7A 1IEJA 3Q29A 3MQ9A 4MLQA 3TFLA 1SBPA 3ZSFA 2BJJX 3FXQA 4PETA 1B5HA 4PFYA 3IAZA 1JP4A 4PFTA 4OWDA 4YMBA 5DT6A 4LA9A 5CC2A 3T9HB 1OQHA 3P7IA 2JJKA 1DTZA 3M3FA 3RT8A 2WBDA 3TCGA 2Q74A 4OEUA 5ITPA 1UTBB 4KCCA 1B7ZA 2QS1A 1A7LA 4P8BA 3ZS6A 3VV5A 2BJIA 1K9YA 3D4GA 4LONB 3OSRA 4E0WA 2V93A 4PGPA 3C31A 4R9FA 1B58A 1MQGA 3WAFA 4F1VA 1B05A 4GWOA 3CI8A 1IMBA 2M8CA 3K02A 3G3JA 2F35A 4G8HA 4P0IA 5EYHA 3IOVA 1FSAA 5I59A 4EQ9A 1LBZA 5I59B 2Y7PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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