4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
4LATA 1LGBC 5JK4A 2FYIA 4H6DA 1HSLA 2XXUA 2CMOA 3FD3A 2CZLA 2O68A 3BBRA 4EXKA 3FATA 3KGCA 3O29A 3BKIB 1LFHA 3KZGA 3FXUA 2RKMA 5L9SA 4U1ZA 1US5A 2RC8A 3PV0E 4G68C 3KBRA 5DTBA 5H8HB 1SW5A 4H0WA 3U72A 4EQ7A 1QULA 1DTGA 3O6HA 5ICQA 4M4GA 1Z7ME 3KOTA 3CR9A 3F11A 2XXVA 3OMBA 4NF4B 3TAJA 2THIA 3MUQA 3K01A 2O69A 5A5XA 3T9UA 1R9LA 2F36A 1B6HA 1J1NA 3DLNA 1TFDA 5BWJA 4H5FA 2DXRA 1URGA 3IB1A 2H98A 3KN3A 1XVYA 4FEDA 3G3IA 3K1MA 4UA8A 3S9LC 1H76A 2XD2A 1VSOA 4G2ZA 4LONB 4IB2A 5KCJA 1A8FA 3CSGA 1QUIA 3S9EA 3CIJA 3PUVE 1ZLQA 3SEVA 3C35A 2DWHA 4JSDA 2R6GE 5F1QA 5H8QA 4QFOA 2O51A 2XXHA 4POWA 4R75A 4OVJA 3FV2A 3KJ7A 4QSDA 2DVZA 1B7HA 1GR2A 3JV9A 4IY5A 1I6BA 1SYIA 3CSBA 2IA4A 2I6EA 1N76A 2XX8A 3HSTA 1IXCA 2OJTA 2Z22A 2ZNSA 4U21A 2ZYNA 4OQOA 3MPKA 2VGQA 4DXUA 5I2NA 5JEIA 2ESNA 2QL3A 3IOVA 3N94A 1IZ1A 1QKBA 4OMBA 3W9WA 1LLSA 1LB9A 1MXVA 4JWYA 1DOTA 3DP6A 1JW1A 1B0HA 4QFLA 2VOZA 3E9XA 1DPEA 2G29A 4IY6A 3VXCA 3V8XB 1MPDA 1URSA 3VLWA 5HBCA 4R2BA 5CBSA 1I69A 1OQHA 1IIWA 4OFJA 1QUKA 2F6GA 4NF6B 4FE8A 4ECFA 3ILTB 5ITPA 1S7YA 3IJXB 3SKPA 5FHMA 4R2FA 4F2OA 4BDLA 3PMVA 4GF8A 1PBPA 2XXIA 1MY1A 2OBGA 4YB5A 3H03A 1D3KA 3TTLA 2GFEA 2OLBA 1IQ7A 2ZYOA 2V3UA 1H3DA 4NWCA 1UTBB 4DZ1A 4QF9A 1LCTA 1XOCA 4WXJA 3CG1A 3RT6B 3K2DA 3L6HA 1OLAA 4O3BA 3I3VA 4IO4A 1H43A 2UYEA 4OXVA 2AIXA 4MBPA 3LSFB 4ZE8A 5AE4A 4G8MA 5K2YA 1LFIA 2O6AA 4LZ7A 4EQ9A 4MF3A 3PUWE 4K3FA 1A8EA 3A3CA 1NNKA 4GIZA 4GL8A 5I56A 1S50A 1MDQA 4RYAA 2PT1A 4GOTA 4THIA 1UIUA 2Y7WA 4MH5A 1M5BA 1LAHE 2ONSA 3GBBA 3O66A 2RC7A 2E1SA 2XXTA 3PMWA 1O7TA 3UORA 5FHOA 4NF4A 5ELVA 3RLFE 4HCYA 1UTHB 3O9PA 2I49A 1ZU0A 5L9MA 3FVGA 3OSQA 3KJTA 1CB6A 3FJ7A 4XTCQ 5TU0A 2ABHA 3RGYA 4IGTA 3IR1A 4RK2A 2B3BA 3V89B 2QS3A 3L6GA 5I84A 1B1XA 5TPAB 4F3SA 1AMFA 4GXSB 2AYSA 3U94A 4GWOA 5JTYB 2Y84A 4PP0A 4OFLA 4IO7A 4Q30B 4OZ9A 4OWDA 1D9VA 1ZBMA 2OWSA 1GGGA 4ELOA 4YB6A 4NF5B 3KG2A 2PBWA 3IOWA 3TQLA 1JNFA 4E0XA 4BDQA 3SEXA 3PPPA 3O6GA 2WKYA 3MWBA 3MVYA 3MQ9A 1OVTA 2DWJA 1AH5A 1DMBA 5L8DA 3TKDA 5HM4B 1PBQA 2ALUA 2NWJA 4GVOA 3PUZE 4I8CA 3HHFA 3PPNA 3TTRA 3H6WA 4OESA 5AA2B 3K6WA 1B3GA 3MBPA 1UIVA 1JQFA 1IEJA 1XVXA 4E0WA 3TTMA 4Z0IA 4N07A 4PQJA 3OEMA 1D9YA 2F78A 4RXLA 1SVXB 4O3CA 2LAOA 1VFDA 4RJZA 3OELA 2IEEA 1UTBA 3HO7A 3OENA 5KZTA 3MVWA 1R9QA 3MJNA 2Y7RA 3TUSA 2XHDA 4OYVA 4U2RA 4DDDA 1UQWA 5FTHA 4PETA 5AA4B 4U4SA 3N5LA 1ZMGA 1B5JA 1EZPA 4R6YA 1B5IA 3TCHA 1OQGA 2KLFA 4P0GA 3CFLA 4YKKA 1MXWA 4PE5B 1MY3A 3B7DA 1WODA 3LBSA 4TLMB 2Q2AA 4X48A 3TCFA 4ZZAA 2XXQA 2X7QA 1MS7A 4ZEDA 4XKPA 1MQJA 1HSJA 4EQBA 1B46A 3PD8A 4ELRA 4LQ2A 3CVGA 3RPWA 3GLBA 3SEUA 2O1MA 4RNSA 4QFNA 5DEXB 4YKPA 3Q29A 5TP9A 5DVFA 3M8UA 3ECRA 2O7IA 2I4BA 2HQ0A 4G4PA 3B6WA 2H25A 4IO5A 5TPAA 2OWTA 2ONKE 3KSJA 4N13A 5I58A 3LUYA 1ZIUA 1P1UA 4HS7A 4JSOA 3K0VA 2Z8DA 4IO2A 2Q2CA 3HPIA 4F1VA 3TEPA 2XXRA 2NVUB 3S9MC 5I57A 3K00A 1EH3A 2O84X 2O1LA 1P1WA 3IL1B 4HCWA 5CMCA 4NF5A 2PYYA 3W15C 2DWAA 1BLFA 3K6VA 1I6AA 1FTMA 3PUXE 3LSLA 1EZOA 3IK6B 4OEVA 3PMXA 2R71A 3H6TA 4GD5A 1FTOA 1YPNA 4YKIA 2QJEA 3QAXA 4ZEKA 3C33A 3A3UA 4KHZE 4ESXA 5AA2A 2A5TB 1XS5A 2I58A 4FECA 3D4GA 2PX1A 1P1OA 4LVQA 2ONRA 1L5TA 1LCFA 1B0LA 1IITA 3PPOA 4KCCA 3IORA 3PD9A 1YCJA 4F19A 2RCBA 1MY0A 2X7PA 3T93B 3PGFA 3UK4A 3FXRA 4NE4A 3ODBA 1PC3A 4DXCA 3VLVA 3WAEA 5B7DA 2F7BA 3B6TA 4JDFA 5CMKA 1MM6A 1ZKBA 2PMSA 4JWOA 3MPLA 5AA1A 3KN7A 3H7MA 1Y20A 3W9VA 3MVZA 1WVJA 2UXAA 4ONYA 1D4NA 4BLAA 1QJMA 4FORA 5CMBA 1F9BA 2XX7A 4ZEFA 2OCUA 3VDFA 4UACA 5IAIA 3USDA 1BTJA 1A54A 3UN6A 2GHBA 4LZ8A 1TXFA 5ISUA 2I4CA 2Q88A 1OLCA 1FQFA 3G3GA 3ZSFA 1A40A 1Q35A 4YMBA 4C0RA 4OETA 4R74A 3G7WA 3MZ9A 3QXMA 4DE8A 4H67A 5I2KB 4R6KA 3E4RA 4WEPA 1JETA 3FVNA 1JEVA 2ZXTA 1O64A 1N3WA 2Q8JA 5IKBA 1NL5A 2YJPA 5EHSA 4LUBA 4FJPA 4I9DA 1JW4A 1FW0A 4GL0A 2DP8A 3OO8A 4G68B 3C36A 2O7UA 3N26A 2RCAA 5EHMA 2F7CA 4QSCA 4OENA 3K4UA 4C1TA 2QS4A 2I3WA 1BKAA 2D3IA 1GTKA 1PB8A 2F6PA 3E3KA 3KOSA 2XXPA 3V5AA 1VR5A 4F3GA 1MRPA 5H8NB 2OZZA 3OSRA 3LSWA 3S9NC 2YLNA 1EZ9A 4NMYA 3EHTA 2V3QA 1R1NA 4NF8B 3U1OA 4YU0A 4XXUA 5H8HA 4P11A 1PEBA 2QPQA 3T22A 4F39A 2HAVA 2XXYA 5CMMA 2AL5A 3B6QA 3Q26A 1N7WA 3LSXA 2VD2A 4RPNA 2H99A 3SETA 1AOVA 1TWYA 3O97A 5FTIA 4KYDA 2QS2A 3CG3A 4C1UA 3ILUB 3U92A 3AXFA 4G8NA 1MXXA 1B05A 3M3KA 4N6PA 4NEDA 3QSLA 5ICTA 1ZTYA 4KD5A 3SEYA 3MAMA 5DVIA 3FJMA 5H8FB 4ZE9A 5L9OA 1MXUA 1PDAA 3RY3A 4X1BA 5J1DA 3RTFB 1N04A 1Y4CA 3C31A 3N6UA 2QMWA 2XD3A 2V84A 3C32A 4YMAA 2QRYA 4U22A 3UA8A 3SDFA 4IO6A 3I6VA 3Q27A 4ESWA 4YAHX 2DQVA 2UVIA 2D21A 4JWXA 1EU8A 4XKNA 2QS1A 3MZ1A 3RT8A 3C34A 4F31B 1SDXA 4U4XA 1N0TA 4PFTA 5BUUA 3MVXA 4IGRA 1JEUA 1KWHA 4ISUA 4OERA 4KFQA 4NF6A 1LAFE 2QSXA 1MDP1 3K6UA 2YPNA 1XT8A 1GVCA 5K2XA 1QW0A 4OTEA 5CC2A 4RPOA 3RUMA 3RQTA 1FQDA 3EHSA 1FTJA 4TOZA 5DYHA 4AQ4A 4GXAA 1POY1 2H5YA 2DYXA 3JYRA 4G68A 3LR1A 1T0KA 1Y4TA 3Q28A 1GV8A 1IXIA 5A5XB 1P1NA 3OO9A 3EPEA 2I0CA 1QUJA 5ITOA 4LP2B 2AL4A 3DM0A 3ZKLA 2ANJA 4R9GA 1B32A 5EYFA 2F8DA 3O2AA 1FQBA 2OK2A 2Y7PA 4GFRA 3IO4A 1SYHA 1SW1A 4F1YA 2UVGA 4Q5TA 3IO6A 4QRZA 4X9TA 4H8IA 4DCYA 1CE2A 4ZDMA 1OMPA 2DE2A 4ZEBA 4QFKA 4F3PA 1Y1MA 1FTKA 2HEUA 2V93A 5H8QB 3PUYE 4H1XA 2HZKA 3TMGA 1XC1A 4HW8A 2HCAA 3I5OA 2UYFA 4OEUA 5I59B 4BDOA 1FQAA 4F29A 1P1QA 4R6HA 2XXXA 3H06B 4KYEA 4R72A 1UTHA 3VV5A 5I2NB 5LOMA 5AA3A 3K6XA 1MY2A 1RKMA 2GH9A 3OO6A 3C4MA 2PT2A 1HSEA 1MPBA 3GBAA 1Y1ZA 4KR5A 2BJJX 5M2VA 1B1HA 4DIGA 4JB7A 2ZYMA 1NNPA 5CM6A 3SESA 1M5EA 3CFZA 3PU5A 4H5GA 2REJA 5H8FA 4F3BA 3T9XB 3HV1A 1R6ZA 3O6IA 5JTYA 1QKAA 3T9VA 3SERA 2ZYKA 1I6QA 1IXHA 4TLLB 3IJOB 3KEIA 3FXQA 4G77A 4KPTA 1N7XA 1IUDA 1B3HA 1B52A 2RF1A 4EDPA 3S2VA 3KFMA 2FA7A 1LAGE 2REGA 3A09A 3DELB 1AIVA 4KQPA 3H6UA 4L17A 3ZKKA 2DE4A 3G3KA 1B4HA 4WEDA 3E13X 4YZZA 1BP5A 3MP6A 3Q25A 3M3LA 1MM7A 3EN3A 1MQHA 1B4ZA 3VVFA 4WKMA 5I56B 4HTGA 3FGSA 4F22A 1M5CA 1H44A 3G3FA 2M8CA 2HXWA 5KDTB 1LBCA 1SI0A 3TYHA 2F5XA 3QUFA 3G3HA 3TODA 3G3JA 4OFOA 3C9HA 1LB8A 1N3XA 4DCXA 3VXBA 1B7UA 3HN0A 1RYXA 1BIYA 3M3FA 4QFPA 1MXZA 4XIGQ 5AA4A 2NOOA 1MY4A 1B9JA 2G93A 4MLVA 3DP4A 1B5HA 2V25A 3RTWB 3FASA 4X1DA 4JBZA 4ND9A 3MP1A 4Q8RA 3MC2A 3T9HB 2R9JA 1A7LA 2XXWA 3WAFA 2B3FA 4DXBA 1S9TA 2F7AA 2I0BA 4YKJA 3SEWA 4R9FA 1TFAA 4BDNA 3FVKA 5I59A 5DVJA 3KN8A 5AA2D 3PPRA 3OOAA 2UVHA 1MXYA 3TFLA 3VFJA 1IXGA 3UGWA 1DSNA 1WDNA 3VLUA 1B3FA 3EF7A 5DEXA 2XX9A 2H4IA 1MG1A 4BDRA 3QYTA 4F18A 4GLIA 1M5DA 2Y7KA 2DS9A 4KI0E 2HZLA 2W7YA 2H9BA 4ZS9A 4AB6A 3RN8A 5B70A 1M5FA 5H8SA 2UVJA 3N6TA 3BFTA 4EF2A 2RINA 3K02A 4H65A 3KSXA 4I1DA 1MQDA 3K1NA 1NH7A 2Y7IA 4KYSA 4FEBA 4R73A 1MQGA 1DPPA 1SD3A 1II5A 4POXA 1NH8A 1SBPA 4GQOA 1OIBA 1B7ZA 4KCDA 3U93A 2Q9TA 4LZ5A 2NXOA 2HAUA 1NFTA 3T66A 3CFXA 4QHQA 3VVEA 1Y3QA 1USYH 1ZJLA 4EF1A 1B58A 1N84A 3CRBA 2A5SA 1B40A 3OXNA 2GHAA 1JW5A 3H4ZA 3OO7A 2I48A 3S4UA 3FJGA 1JVXA 1A99A 4Q0CA 1Q1KA 4ELPA 1FTLA 4ZEIA 1A55A 2A5TA 2ZMBA 1SW4A 4ZZEA 4RK9A 1SW2A 2ZNTA 3OD7A 4XKQA 3D4CA 1PB9A 3MZBA 2V3TA 4FIMA 5KDTA 1DTZA 2DOJA 1O63A 1B3EA 3IOTA 2D5WA 2DVCA 3JZJA 5F7VA 1B2HA 3VE1B 4H8JA 4DLDA 2F35A 5TP9B 3TTKA 4EUOA 5CBRA 1YTVA 4U23A 2P1SA 1QVSA 4EXLA 3K1PA 3R7XA 2DWIA 3RNNA 3FUZA 3CI8A 1LSTA 5I58B 3MW0A 1LFGA 3QIMA 1POTA 2Z8FA 1B3LA 5I57B 1Y3NA 1MH4A 3FV1A 3T96B 3QK6A 5CRYA 1Y3PA 3H3GA 3TDJA 3TQWA 1MH3A 1Z7NE 1SQYA 3O28A 1VE4A 4U1OA 1TT1A 4MLQA 1MPCA 1VFEA 5I2KA 4F2QA 3ZS6A 1NKXA 1NNFA 1SI1A 4YICA 4RA1A 2X26A 3ONMA 3R26A 4NWDA 3FZVA 3IB0A 4FATA 2Z23A 2P0SA 2DXYA 5FHNA 4YB7A 4FAJA 3R6UA 1ANFA 2F97A 3EHUA 2VP1A 3BFUA 4ELQA 3HCQA 1YAEA 4TQUQ 4BDMA 2RC9A 2Q89A 3P7IA 1LBBA 3TPAA 2HFBA 1NNTA 4LQ5A 1JVYA 1H45A 3TCGA 3U8QA 3UIFA 3TELA 3MP8A 5H8NA 4P0IA 1P99A 2I3VA 4MFIA 4M1VA 5KCJB 1US4A 3FIRA 3THIA 4Z7EA 3IB2A 1USYE 4NTLA 2ZNUA 4NF8A 1RYOA 1FQEA 2FNCA 1ATGA 3FVOA 3HHGA 2PVUA 2GRVA 2F34A 4AB5A 4OHNA 4IO3A 4XKRA 5DT6A 1NMUA 4JXIA 4PFWA 3PPQA 1FQCA 4I62A 2NUVA 4RY1A 4G8HA 2P2AA 3GXAA 3VVDA 3QUJA 3TZAA 1ELJA 2QMXA 1OVBA 1URDA 1XHYA 2DSFA 3UP9A 4GRKA 1B51A 3IOUA 2DE3A 2VD3A 3H6VA 4LA9A 1AL3A 4PFUA 1MQIA 5CI5A 2B65A 2VHAA 4PFYA 3LC8A 3IX1A 3DP8A 1LAXA 4ZECA 3EQ1A 2Z8EA 4F1UA 1PB7A 2E0SA 3IAZA 3OEKA 3GZGA 4QSEA 3TTNA 4O3AA 3V83A 1Y9UA 1FCKA 5HPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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