4QSEA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound glycerol
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of maltoside transporter ATU4361 from Agrobacterium Fabrum, target EFI-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 138
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qseA02
3GZGA 3C9HA 4NF6A 2F7BA 2PYYA 3PU5A 3Q29A 1VFEA 3IB2A 4Z0IA 1P1OA 3TMGA 5CBSA 1O64A 1ZJLA 2RINA 2OZZA 3IB1A 5H8HA 2PVUA 1TWYA 4H0WA 1AL3A 4N6PA 2Y7RA 3O29A 3VVEA 1VSOA 4IO6A 5DVJA 3U93A 4YU0A 4H65A 1HSLA 4X1BA 4RNSA 2FYIA 2P2AA 1NNKA 5TU0A 5HPQA 4R75A 4DCYA 5ITOA 4EXLA 1SD3A 1MDQA 4JB7A 2REJA 4THIA 2DSFA 2OBGA 4ZE9A 4OVJA 3LUYA 3R6UA 4AB6A 3RPWA 3C33A 5CM6A 3PUYE 2ZYOA 3MW0A 4H1XA 2VGQA 3MP1A 3OO8A 4ELOA 3W15C 2X7QA 4KQPA 1MRPA 2F6GA 2THIA 3RY3A 4JWOA 3EPEA 1LAFE 1M5FA 1L5TA 4U1OA 1I6AA 2NXOA 4FAJA 3CFXA 3MPKA 3H3GA 4F22A 4QFNA 2Y84A 1WVJA 2Q88A 3GXAA 3T9VA 3U1OA 4OFOA 1MH3A 4PFTA 2O69A 4LQ2A 4U4XA 1Y4CA 3MP8A 3UIFA 5H8QB 2DXRA 3LSXA 1KWHA 4YMBA 1NNTA 3TTRA 2XX8A 4NE4A 3AXFA 4KI0E 1MH4A 5ICTA 3MJNA 4BDQA 4AB5A 2H98A 3HPIA 3LSFB 2F5XA 3MC2A 2CZLA 3ZKLA 4ELQA 1DSNA 1MM7A 3TFLA 1BIYA 4DDDA 5L9SA 4GLIA 1FTLA 2Q9TA 1JEVA 1MXXA 3IOUA 5EHMA 4QF9A 1VFDA 3ODBA 5DVIA 2QS1A 1QUKA 5ISUA 2E1SA 2V3UA 2F34A 5H8SA 4IGTA 3QAXA 1A99A 1ZBMA 3MVZA 4ZEKA 1B7UA 3PPPA 1M5DA 1Y3PA 3VXCA 4Z7EA 4H67A 5CMKA 3I3VA 3FXRA 5CI5A 3TTNA 3L6GA 2IA4A 5EHSA 4BLAA 4I9DA 1NNPA 4FECA 1MQIA 1B9JA 1ATGA 3JYRA 3G3GA 1B0HA 3UGWA 1IXGA 1USYE 4U1ZA 5EYFA 2NWJA 2Z8EA 2RC7A 2ZYNA 2AL4A 4P11A 3PPNA 4RPOA 5AA3A 1P99A 2I4CA 3H06B 4G68A 4XKPA 3PMWA 4EDPA 1LFIA 3SEWA 4QSDA 1WDNA 1OLCA 4PQJA 5I59A 3H6UA 2DWIA 2ESNA 4C0RA 1MQJA 4IO5A 3OD7A 4UACA 4O3AA 2XXHA 3MQ9A 3IAZA 2VHAA 4U22A 3LR1A 1ZMGA 3OO6A 4JBZA 1B40A 5L9MA 4NF6B 3QIMA 1B1HA 3T9XB 3TCGA 4NF5A 3Q26A 4M1VA 1Y1ZA 2E0SA 3HSTA 3C31A 1URDA 3WAEA 1MXVA 2O1MA 3TUSA 5F7VA 3KN8A 2VOZA 3MVYA 1HSJA 3OMBA 3MVXA 1DMBA 3USDA 2XXWA 3LSWA 1URGA 3M3KA 1JVXA 3ONMA 4OTEA 2UYEA 3OELA 1US5A 1IIWA 3TPAA 1UTHB 3IR1A 4MLVA 2UXAA 2YJPA 1LAHE 2DE3A 3RTFB 5TPAA 3FV2A 4OETA 2UVIA 2ALUA 3K01A 3FXQA 3IJOB 3PD9A 2HAVA 3VE1B 4POWA 5LOMA 2DP8A 4ZZEA 3K1NA 4ND9A 5BUUA 1LSTA 2ZNSA 4MBPA 3K4UA 4ELPA 4JDFA 4F3PA 1Q1KA 4KR5A 5L8DA 5KCJB 3ZKKA 2CMOA 2B3BA 4BDMA 3S4UA 3CFLA 1J1NA 4R9FA 1UQWA 3H03A 3MAMA 3CG3A 3RUMA 3H6TA 4IO4A 4EQBA 2O1LA 4KPTA 3TQWA 4I8CA 4FEBA 1ZTYA 1B52A 4KYDA 4KCCA 4G77A 1NMUA 3OO9A 3MPLA 2QS4A 1A8EA 5CMBA 1JW5A 1LBBA 2QS3A 4GWOA 3CI8A 1IZ1A 1P1QA 3O28A 4NF8A 2REGA 2DE2A 5H8NA 2I58A 4TLLB 4M4GA 1PB9A 3FGSA 4ELRA 3BBRA 4GFRA 4R6YA 2RCAA 3IJXB 1MXYA 1Y4TA 2QSXA 1DPPA 1MXWA 3SKPA 1MS7A 3N94A 3ILUB 2UVHA 1FQAA 2OWSA 1CB6A 1IEJA 1N7WA 1QUJA 3HHGA 1MXUA 2HFBA 5AE4A 2AL5A 5A5XA 2H99A 3N26A 1A40A 1OVBA 1F9BA 1Y3QA 1OLAA 3H6WA 1B32A 3L6HA 4YICA 3D4GA 4G68B 1GTKA 2WKYA 3C35A 4N07A 2ANJA 3S2VA 4LP2B 2Y7IA 4XXUA 2H25A 3RNNA 1B4HA 4PFWA 3DLNA 3PUXE 4NEDA 3K1PA 4XKNA 2I4BA 4E0XA 1IUDA 3T9HB 3VLUA 4TLMB 3DP8A 5FHMA 2HZLA 3UK4A 1RYOA 4G2ZA 2ONKE 4QFKA 2D5WA 3TTLA 3S9NC 1SI0A 4R6KA 1QKAA 1B3FA 4F2QA 2Z8FA 1A7LA 2XXIA 3EHSA 4BDOA 4FORA 1VR5A 3ZSFA 1JNFA 1SYIA 3OSRA 4OZ9A 2QJEA 1EU8A 3K00A 3QUFA 4LZ5A 2DYXA 2G29A 4IY5A 2P1SA 4FEDA 1H3DA 1BKAA 1FTOA 1B5HA 3BFUA 4F3SA 5KZTA 4JWYA 2FA7A 3CG1A 4G8MA 2RC8A 3IO4A 2UVGA 3FJMA 2D21A 1H43A 3G7WA 1N3XA 3SEYA 4YB5A 3CSBA 1RKMA 4GD5A 3U94A 5BWJA 1LB8A 1TT1A 4U2RA 4OERA 4DIGA 4PFUA 1ZU0A 2B65A 4X1DA 5IAIA 5TPAB 3H7MA 4KHZE 1NKXA 2RC9A 3K6UA 4R72A 1LBCA 4NWCA 3JV9A 3TDJA 2Z23A 4HS7A 1EZ9A 2P0SA 1FQBA 4ZEDA 2XHDA 3UA8A 2Z22A 4GF8A 1MPBA 3C32A 2XD3A 4LZ7A 3VVDA 1ZIUA 4LVQA 3FVKA 2O7IA 4F19A 1JVYA 2OLBA 4DXUA 4G68C 2PT1A 1FTKA 3VLVA 4QHQA 3C36A 3A3CA 2XX9A 3PPQA 4KD5A 4U21A 4YAHX 1ELJA 2YPNA 3ECRA 4ECFA 3SETA 4TOZA 1R9LA 3A09A 4FE8A 4EUOA 4F2OA 3RGYA 1OVTA 3MUQA 3SEUA 1LLSA 3K0VA 4PETA 1QVSA 3RQTA 1Y3NA 5DTBA 4QSCA 2GHBA 4H8IA 3GBBA 4TQUQ 1SW2A 3JZJA 3MZBA 2ZYKA 4LQ5A 1IQ7A 3FASA 3MZ1A 5H8NB 4C1TA 2RCBA 3M3LA 3PMXA 1QW0A 1SVXB 2OJTA 1B3HA 5AA2A 1H44A 4ISUA 1GVCA 3EQ1A 2G93A 2F78A 3V8XB 3TTKA 3IOTA 1T0KA 1AH5A 3KBRA 4H5FA 1B1XA 1UTBA 4RA1A 4U4SA 5A5XB 4I62A 5H8FA 4K3FA 5DT6A 2KLFA 2VD2A 2GRVA 2Y7KA 3DP6A 1B51A 4OFJA 5J1DA 1TXFA 3G3HA 1MPDA 4F39A 1MPCA 5I58A 4OHNA 2NVUB 1XOCA 4RK9A 4L17A 2VD3A 1MY3A 3KJTA 1B7HA 2RF1A 1H45A 3N6UA 3VV5A 3FJ7A 1BTJA 1B6HA 2V84A 1POY1 3FIRA 2O84X 4UA8A 1OIBA 4LATA 3LSLA 2ZNUA 4AQ4A 1R9QA 1B3GA 2RKMA 5I57A 3QYTA 2A5TA 2QS2A 1MXZA 2R6GE 4BDRA 4H5GA 1XVYA 3QXMA 3KG2A 2F97A 3PMVA 4OMBA 2ABHA 3KZGA 1LFHA 4N13A 4QFPA 3RTWB 5B70A 4E0WA 1LAXA 3QK6A 4LONB 5H8HB 1PDAA 4F3BA 4F29A 4C1UA 1ANFA 2HQ0A 3VVFA 3EHUA 5AA4A 1R6ZA 3ZS6A 2XXPA 4ZEBA 2Q89A 4GL8A 4YMAA 2F6PA 1D9VA 3FATA 2Q2CA 5I2NA 5K2YA 2Y7PA 1N76A 1LAGE 3TKDA 2PMSA 3Q27A 4LZ8A 1I6BA 4R2BA 4NF4A 5ICQA 1Y1MA 5HM4B 2R9JA 4ZEFA 3O97A 4OENA 3TCFA 1I69A 1FQCA 1OQHA 4WEDA 1IITA 2ONSA 4JXIA 3G3IA 4OEVA 3EN3A 4FJPA 1O63A 4F1UA 2V25A 1A54A 1N3WA 3FZVA 2HEUA 4ZE8A 2UVJA 2QMWA 1B58A 1D3KA 3TODA 1PBPA 1N0TA 4QSEA 5I2KA 3WAFA 3KGCA 1S50A 3KJ7A 1PB8A 3KFMA 3DM0A 2GH9A 1VE4A 4OQOA 2PBWA 4PE5B 3GLBA 1RYXA 3EHTA 2I3VA 1A55A 1JETA 4ZDMA 4WEPA 4X48A 5JTYA 3HCQA 3KN7A 5CMMA 3EF7A 4NWDA 3S9EA 1NNFA 3W9WA 1MY0A 3TEPA 3HV1A 1SDXA 3T66A 5AA2B 1LCFA 3PV0E 1IXCA 4WKMA 2B3FA 1Z7ME 3OSQA 2ZXTA 5CBRA 4GVOA 2I48A 2F7CA 1IXIA 2QRYA 4BDNA 1FTJA 1MY1A 4MLQA 1SYHA 2PT2A 3UORA 1XVXA 1NH8A 4ESWA 4F1YA 5FTHA 3QUJA 5JK4A 1II5A 3DP4A 3TELA 5H8FB 4NMYA 1NFTA 2QPQA 2I49A 4EF2A 5IKBA 4IY6A 3T22A 3E9XA 1B3LA 4G8NA 5I58B 4HW8A 4QFOA 1URSA 2XXRA 3HN0A 3PUWE 3PGFA 1SW4A 3SESA 4MF3A 3Q25A 3SDFA 2DOJA 4JSOA 1B5JA 1B2HA 1GGGA 4RXLA 3CFZA 1DTZA 5I57B 1AOVA 1XHYA 2A5TB 5I59B 1US4A 4HCWA 1SBPA 2F7AA 1LFGA 4F31B 4ZEIA 1QULA 1N84A 1P1UA 1WODA 3P7IA 1SI1A 2AYSA 4DCXA 2FNCA 3K6WA 3H4ZA 1D9YA 4I1DA 3V83A 3OOAA 4NF5B 5I56A 2O6AA 3TAJA 3CR9A 1EZPA 2I6EA 4RPNA 3H6VA 4R9GA 5AA4B 1LB9A 1NH7A 3K6XA 4ZS9A 1YAEA 1I6QA 2F36A 3RT6B 5I2NB 3FVNA 2I0BA 2NUVA 1PBQA 2H9BA 1MDP1 4O3BA 3RLFE 2GFEA 2HAUA 4NF4B 2YLNA 5L9OA 5JEIA 3O2AA 3OEKA 5F1QA 4RYAA 3MBPA 1M5CA 3IX1A 1FCKA 3I6VA 4IO2A 4XTCQ 4R74A 3MZ9A 2XXTA 4U23A 4DXBA 4GXSB 2R71A 4RK2A 5ELVA 3M8UA 4DLDA 2I0CA 1FQDA 3K02A 3IB0A 5I2KB 1QUIA 3SERA 2XXVA 2A5SA 2DWJA 3TZAA 1YTVA 1R1NA 1UTHA 2O7UA 4Q0CA 4KFQA 3FXUA 2Q2AA 2OWTA 1MQHA 4RJZA 1S9TA 1EZOA 4OXVA 3A3UA 3HO7A 3K1MA 1B4ZA 3TTMA 2H4IA 2BJJX 1POTA 3E3KA 1Q35A 5JTYB 1GR2A 4QFLA 3I5OA 1QKBA 3F11A 2V3TA 3FVGA 1PEBA 4XIGQ 3BKIB 4QRZA 3IORA 1PC3A 1FW0A 2LAOA 2VP1A 5KCJA 3B6TA 5B7DA 4ESXA 2H5YA 4BDLA 4NF8B 4EQ9A 1MQDA 2ZMBA 4HTGA 3PPOA 5KDTA 3DELB 4PP0A 1O7TA 3VFJA 3OXNA 1XC1A 2OK2A 3R7XA 3TCHA 1TFDA 3RT8A 4JWXA 3FD3A 1MY4A 1XS5A 2HXWA 4DZ1A 1JQFA 3LC8A 4EXKA 4PFYA 1N7XA 3T9UA 3S9LC 5ITPA 1B5IA 3RN8A 3G3KA 3MVWA 4ZECA 3FJGA 5CRYA 3HHFA 3KEIA 3VDFA 3O66A 1UIVA 2XD2A 4EQ7A 2NOOA 1QJMA 4OESA 4R73A 1P1WA 2XX7A 1LGBC 3IK6B 4OFLA 1H76A 5DVFA 2UYFA 2M8CA 3CRBA 4GQOA 5FHOA 2D3IA 3CIJA 3KSXA 5TP9A 1ZKBA 3IOWA 5K2XA 1LCTA 3G3JA 4OEUA 2XXYA 3U72A 3N6TA 1M5BA 4MFIA 5I56B 2HZKA 3OO7A 4H6DA 1FQFA 4XKRA 5FHNA 3MWBA 4R2FA 1XT8A 4KYSA 5FTIA 1PB7A 1B3EA 3O9PA 3TQLA 3O6HA 1FQEA 1JW1A 1A8FA 1SW5A 5DEXA 4YKPA 3UN6A 1HSEA 4X9TA 4YZZA 2V93A 1USYH 3PUVE 4FATA 4POXA 1B46A 4G8HA 2XXQA 2HCAA 2DXYA 1SQYA 3FUZA 4ONYA 3THIA 1EH3A 1P1NA 3QSLA 2OCUA 4JSDA 2O51A 3KSJA 2DQVA 1S7YA 4F3GA 2X7PA 3KOTA 4YB6A 3SEXA 3D4CA 1TFAA 3K2DA 1OQGA 5AA2D 4Q30B 4ZZAA 2Y7WA 2W7YA 3KN3A 1IXHA 3T96B 4LA9A 4P0IA 1AMFA 1BLFA 2GHAA 4GOTA 2DS9A 2Q8JA 4OYVA 3V5AA 4KYEA 1JEUA 4KCDA 4OWDA 4YB7A 3PD8A 3IO6A 3G3FA 2DVCA 3BFTA 1BP5A 3ILTB 3VXBA 3E4RA 4O3CA 1N04A 3W9VA 4MH5A 4GL0A 4F1VA 2I3WA 4IGRA 4G4PA 4XKQA 3TYHA 4IB2A 2QL3A 1YCJA 3C4MA 5I84A 4WXJA 4R6HA 1CE2A 3O6GA 1DPEA 3U8QA 4FIMA 2F35A 5KDTB 2F8DA 1NL5A 1B7ZA 1UIUA 3FVOA 5H8QA 3B7DA 1Y9UA 3VLWA 2XXXA 4Q8RA 4YKKA 3N5LA 4H8JA 3SEVA 4NTLA 4EF1A 3PUZE 2XXUA 1AIVA 2AIXA 2ZYMA 1FTMA 3O6IA 3U92A 1B05A 3IOVA 1MY2A 1UTBB 4LUBA 2X26A 1M5EA 2ZNTA 1DTGA 1MM6A 2PX1A 4IO7A 2IEEA 3V89B 5AA1A 1ZLQA 1OMPA 3OEMA 2V3QA 4P0GA 2DE4A 1MG1A 3B6WA 4GRKA 4HCYA 3UP9A 2DVZA 3C34A 3IL1B 2QMXA 5CMCA 3OENA 4RY1A 3CVGA 4DE8A 5M2VA 4IO3A 3PPRA 1D4NA 3CSGA 4GIZA 2ONRA 5HBCA 3GBAA 3S9MC 3MP6A 5TP9B 3Q28A 3FV1A 3K6VA 3KOSA 1GV8A 1SW1A 1MQGA 4F18A 2Z8DA 1DOTA 4YKJA 4GXAA 3T93B 2DWHA 2O68A 1YPNA 3M3FA 5DYHA 3LBSA 1JW4A 2DWAA 4Q5TA 3B6QA 1Z7NE 5DEXB 4DXCA 5CC2A 3E13X 4YKIA 3R26A 1Y20A 1B0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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