4R2FA

Crystal structure of sugar transporter achl_0255 from arthrobacter chlorophenolicus a6, target efi-510633, with bound laminaribiose
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
GAIKFWDMPWATPAYNDAAKKIAEGFSGANSKATYQIIQWNNFYQTFSSAIASKTGPAVSTGGGFQAFQFEEQGQIAYADKVIEKLKSNGQFDDFLPGVVEPFKTSKGYVAVPWQLDIRPLWYRKSLFEKAGVGVPTDWASLLEAGKKLKGVGAVGFATGSGAGNNIGNHLMIMMMLNNGGGVFTKDGELDVLNDRNVEAVEFLLELVSNGVIDPAAVSYTTDNLNAQWKDSKAAYGMLTLGVPERVGDTSGDIVVASPIAGPHGDKAALIFPNNIMMYTNTPSQEASEEFVVYYLGKLKELWQQKLMNALPVFKSITEMPEFTADPNNVKIVNEYVPIAKTFASQGTALSANLAALDGGQALNQFTQTVLTGKTDAKSALTAFDTGLKSVLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of sugar transporter ACHL_0255 from Arthrobacter chlorophenolicus, target EFI-510633
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Arthrobacter chlorophenolicus
molecule keywords Extracellular solute-binding protein family 1
total genus 135
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2fA02
1PDAA 1JVXA 4FAJA 2O1MA 1JEVA 2F5XA 3H6UA 3SDFA 2Z22A 1QKAA 3FVGA 1URGA 4E0XA 2F7BA 3SEXA 3FATA 2ZYNA 3DP6A 2Y84A 3CVGA 3AXFA 2XX7A 1AMFA 5KCJB 1B2HA 1MH3A 4EQ7A 5J1DA 3MP1A 1UIUA 3VVEA 4ZECA 1SBPA 1N3WA 4LVQA 2I3VA 5L8DA 4C1TA 4R74A 4OQOA 4HCYA 3GBBA 1N84A 1Y20A 3CFLA 1N0TA 4DCXA 3FVNA 3FXQA 4L17A 1BKAA 3VXCA 5I84A 3EHSA 4RA1A 4GQOA 2DP8A 4EQ9A 4YU0A 5KCJA 1MPCA 3G3KA 1XVYA 4YICA 2X26A 1S7YA 4YKJA 4GFRA 2G93A 3TTNA 1A8FA 4BLAA 3HN0A 3MC2A 2B65A 4PE5B 2DWJA 4RY1A 5ELVA 1CE2A 1LAHE 2DWHA 3FV1A 1FQEA 1XHYA 5KDTB 3PUWE 2F7CA 2DE2A 4OYVA 4P0IA 3E4RA 5DVJA 2QMXA 3U1OA 2UVHA 1MPDA 4QHQA 4NF5A 4XTCQ 4ELRA 3C33A 4QFLA 4F19A 1VR5A 2F8DA 3S4UA 3MW0A 1F9BA 3KGCA 1NNPA 4GD5A 4U2RA 5KDTA 1B7UA 1IUDA 1M5BA 2PT2A 1BIYA 2F7AA 3FJ7A 3RPWA 2QS3A 3OO7A 3TMGA 5IAIA 2BJJX 2I0BA 3UP9A 3RLFE 2V84A 1US4A 4KD5A 2QMWA 3IX1A 2GHBA 4NE4A 3OSQA 3A3CA 3N6TA 2HAUA 2DOJA 2OWTA 2I49A 2OBGA 3IOWA 1OLCA 1OVTA 3TAJA 4F3SA 1LFHA 1HSJA 3JV9A 2F6GA 4ECFA 3E3KA 3K4UA 2DSFA 2I3WA 3M3FA 1Y1MA 4BDOA 1I6QA 1M5DA 4BDNA 3CR9A 2ZNSA 4LZ5A 2HCAA 4XKQA 4DZ1A 3C31A 3ZKKA 4MFIA 4XIGQ 2F34A 4ZEBA 4G8NA 4R72A 3Q26A 4GF8A 3IO6A 5FHOA 2UXAA 4HW8A 4G4PA 2F36A 5BUUA 3TCGA 3E9XA 2XD3A 3T66A 3FXUA 1FQCA 5I58B 5AA2B 3O2AA 4XKPA 3TCFA 4E0WA 2IEEA 3B6TA 2OJTA 5EHMA 2Q2AA 1JEUA 2O69A 1RKMA 2DS9A 3RTWB 1B3GA 3TQWA 4R6KA 4OENA 3U72A 5I58A 4YAHX 3MPKA 3QK6A 4BDQA 3P7IA 2V25A 1MQJA 3S2VA 2QS1A 3T9UA 1FTJA 3MZBA 1IXGA 3N94A 2O7IA 4ISUA 1A7LA 2V93A 2ZNTA 4IO2A 4P11A 2F97A 2QJEA 3PPNA 1N3XA 1IXCA 1M5FA 3TFLA 5TP9B 3IJXB 4QSCA 4GWOA 4F1VA 3TYHA 4OEUA 3ZKLA 1OLAA 4ZEDA 4R9FA 1GTKA 5ITOA 4OTEA 4LP2B 1FTMA 3JYRA 3UN6A 1Y3PA 5CRYA 2RC9A 5DEXB 1SW1A 3QSLA 4KQPA 5HM4B 3OOAA 1EZPA 2ONKE 4K3FA 2G29A 4X48A 5TP9A 3O29A 3MP6A 3T96B 3R6UA 4POXA 3PPOA 3MZ9A 4GOTA 3OO9A 1QUKA 3IOUA 1H3DA 2P0SA 5HPQA 1Y9UA 5I2NA 4TQUQ 3F11A 1B7HA 4YKIA 4U4SA 4KCCA 5TU0A 3KOSA 5DEXA 2HXWA 5JK4A 1ZKBA 3H6WA 3PV0E 4IO5A 1IITA 3BFUA 4H0WA 2XX9A 2E1SA 4IB2A 5F7VA 3UA8A 1LFIA 3EHTA 2DXRA 1QW0A 1VSOA 4X1DA 2NUVA 3ILUB 4GIZA 3LSWA 1EU8A 1FW0A 4WXJA 5AA3A 2ZYKA 3FVOA 3KJ7A 3WAEA 1UTHB 2Z23A 4MF3A 3QUJA 3PUYE 3CIJA 4LZ7A 2ONSA 3V89B 1UQWA 3MBPA 1H45A 5DVFA 1S9TA 3VVDA 2HEUA 1MXYA 2KLFA 3H06B 2GFEA 2Y7WA 4R6HA 5CC2A 1MQIA 4N13A 4ZEIA 3OO8A 2F35A 4O3AA 2O1LA 4Q0CA 1UTHA 4I9DA 1URSA 1Q35A 3A3UA 3IB1A 2H4IA 3T22A 1D9VA 3QXMA 3B7DA 4GRKA 3QUFA 3S9LC 3RQTA 4IO7A 3OXNA 3LBSA 3SEUA 5AE4A 4IO4A 5CBSA 3H7MA 3PUVE 4ELPA 1RYXA 2X7QA 2A5TB 4OFLA 3RGYA 1B40A 5DVIA 3FXRA 3TEPA 2VOZA 3L6GA 1P1UA 2DVZA 4NF6A 4KYEA 4FORA 1LAFE 3PD8A 1TFAA 2OK2A 3TQLA 1Z7NE 4U1OA 4RXLA 5I2KB 3EPEA 4GXSB 4G68C 4WKMA 3O6GA 3HO7A 4GL0A 1NMUA 2A5TA 4F29A 1YCJA 2PBWA 1SD3A 4NMYA 3G3IA 4ZZEA 2RCAA 3MAMA 3Q29A 4M4GA 1PEBA 4R2BA 1NH8A 1FQAA 2D3IA 3V5AA 4LQ2A 4DXUA 5I2KA 1LAGE 4R2FA 1FCKA 4F2QA 3PU5A 4JXIA 4FATA 1MY1A 3H03A 3GXAA 1B3EA 2Z8FA 4RPOA 1DSNA 4OETA 1YPNA 2XXPA 5FTIA 5B70A 4U4XA 1M5CA 3VE1B 2Y7KA 4JWYA 3KZGA 1ATGA 1D3KA 1SW5A 4AB6A 3BKIB 4R6YA 3IL1B 1EZ9A 4FECA 4OXVA 2D5WA 3KSXA 4NF5B 3MVWA 4NF8A 1H76A 3LUYA 1A40A 3DM0A 4C0RA 1ZMGA 5ICTA 3VLWA 4DXCA 2FNCA 2NWJA 5AA4A 2QS2A 3LC8A 4G8MA 1IEJA 2Q9TA 4QFNA 2W7YA 1H43A 1VE4A 3BBRA 3C32A 1AIVA 1SVXB 4IGRA 3T9HB 3MUQA 3CG3A 4AB5A 4YB5A 2V3TA 4TLMB 1Y3NA 1ZIUA 4LONB 3E13X 2Q88A 4G68B 2WKYA 1MM7A 3K1MA 3SKPA 2UVGA 4KR5A 3C35A 4PP0A 1FQBA 2ZMBA 1SYIA 1N04A 1PB9A 3D4GA 3SEVA 3T9XB 1PB8A 4YB6A 1NKXA 2HFBA 3EF7A 3G3HA 3MPLA 4R73A 1ZBMA 1POTA 3UK4A 1QUJA 2Q89A 4G68A 2XX8A 4ZDMA 2F78A 2Q2CA 1B0HA 4QSDA 1R6ZA 3M3KA 1DOTA 3N6UA 1L5TA 2ABHA 1MH4A 1TT1A 4G2ZA 3C9HA 3DP4A 4ONYA 2R71A 2I0CA 4N6PA 3VLUA 4QRZA 4H8IA 3FUZA 4NTLA 3C34A 4RK9A 1B1XA 1A99A 3Q27A 1B7ZA 1MY4A 4H5GA 2R9JA 3EQ1A 3ILTB 2GHAA 2QSXA 4IGTA 3TZAA 3QIMA 1MXVA 2HZLA 5JEIA 1OIBA 5K2YA 3UORA 3IB0A 4X9TA 4XKNA 2DE4A 2ALUA 2OWSA 4YMAA 3A09A 4RYAA 1MY0A 3DP8A 1PB7A 2GH9A 2XXQA 1ELJA 2Y7PA 3Q25A 3N5LA 1DPPA 4JB7A 4QSEA 3S9EA 1GVCA 3GLBA 2VP1A 4MLVA 2RKMA 3G3GA 4POWA 1LBBA 2AYSA 2H9BA 4Q8RA 4ZS9A 4QF9A 4IY6A 4OHNA 2RCBA 2P2AA 2DWAA 3BFTA 3TUSA 1T0KA 3RT6B 3PD9A 3EHUA 2RF1A 1RYOA 4LQ5A 2AIXA 1LAXA 3RUMA 1MM6A 4OMBA 1O7TA 2REGA 4Q30B 4Z0IA 3IOVA 3H4ZA 1B3FA 3IO4A 1B58A 2VHAA 2O84X 5M2VA 4F3PA 4F2OA 4JDFA 1SQYA 2A5SA 3PPRA 1Y4CA 1I6BA 1USYH 4ZZAA 3K6UA 3Q28A 3ZSFA 2PYYA 1KWHA 4OZ9A 3K00A 5L9OA 5I2NB 4DIGA 1XC1A 1LFGA 1N7WA 3USDA 3V8XB 1JNFA 1CB6A 3HPIA 1O63A 1NNTA 3QYTA 4RK2A 3CI8A 2UYEA 2NVUB 1B05A 4JSDA 2PX1A 4LATA 5I57A 4XXUA 4Q5TA 1NL5A 5H8NA 4TOZA 2R6GE 3FASA 3SEWA 1M5EA 5FHNA 4MH5A 3PUXE 4BDRA 4DLDA 3H6VA 2B3BA 2H5YA 3FZVA 1QKBA 3KOTA 1MPBA 4O3BA 5H8FA 2THIA 4F1YA 5I56A 4F39A 1WODA 3KG2A 3QAXA 4JSOA 4RPNA 2LAOA 1US5A 2X7PA 5I59A 3SEYA 4EF1A 3T9VA 5CI5A 5F1QA 3CFXA 4FJPA 1B3LA 2VGQA 4O3CA 4RJZA 1AOVA 3LSFB 1O64A 2H25A 5CBRA 4IO6A 1POY1 4YZZA 3VDFA 3W9WA 4GLIA 3ECRA 3V83A 2I58A 4F22A 3L6HA 4Z7EA 2OCUA 3ONMA 4DDDA 1Y1ZA 2I48A 3RNNA 3HHGA 4F18A 1PBQA 4NWCA 4C1UA 4EXLA 1MQGA 1UTBA 2DXYA 3TTKA 4H6DA 4TLLB 4YKPA 1URDA 4LZ8A 2ZXTA 1SI0A 3CRBA 1II5A 4U22A 2HZKA 1P1WA 3U94A 2O6AA 1H44A 3IORA 4NF6B 2UVIA 1MS7A 4PFUA 2O51A 2XXIA 4KHZE 4ELOA 3DLNA 3TODA 4MBPA 4H65A 1PBPA 1I6AA 2Y7RA 1N76A 1B46A 3SESA 3RN8A 3H6TA 4BDMA 2AL4A 3OENA 1MQDA 5TPAB 3W9VA 3LR1A 4NWDA 3IOTA 2DE3A 4PQJA 1NNKA 1LCFA 4KYDA 4M1VA 1MRPA 3MWBA 2OLBA 1J1NA 3I3VA 1B3HA 4YMBA 3TTLA 1EH3A 4ZEKA 2QPQA 1XOCA 1B4HA 1MXZA 4I1DA 5AA1A 3HCQA 3OSRA 1USYE 1MQHA 1SI1A 3MVYA 4OFJA 5TPAA 4BDLA 1B5JA 4FIMA 1WDNA 1LB8A 1B51A 1IXIA 4UACA 3IK6B 4ZE9A 4R9GA 2QS4A 3R26A 5L9MA 3TPAA 4N07A 3LSLA 4FEDA 2VD2A 4R75A 3K01A 3VV5A 5CM6A 3C36A 5ITPA 5CMKA 3KN7A 2D21A 2REJA 3T93B 1TWYA 4NF8B 2QRYA 3DELB 3THIA 1P99A 3IB2A 3U92A 4H1XA 4H8JA 1A55A 5CMBA 5AA4B 4WEDA 2Z8DA 2O68A 2ESNA 3IR1A 4QFPA 1DTZA 4IY5A 3MP8A 1FTLA 5FHMA 2ZYMA 1PC3A 1B4ZA 4PETA 3SERA 1GR2A 1FTOA 3MQ9A 4GL8A 3KN8A 1AH5A 3PPQA 1B0LA 3HHFA 3K1NA 4PFWA 2CMOA 2UYFA 1XS5A 1TXFA 5JTYB 1MXWA 4LUBA 3UGWA 4OEVA 2XXRA 3JZJA 1Y4TA 4NEDA 2RINA 4YKKA 4WEPA 1B52A 2OZZA 1MXXA 1B5IA 4U23A 2Z8EA 5H8QB 3PMXA 1R9LA 1MDQA 1LBCA 1YTVA 1FQFA 1OVBA 1UIVA 5JTYA 3CG1A 1QJMA 1MY2A 2H99A 3K6WA 4KPTA 4YB7A 2CZLA 5H8QA 3LSXA 3M8UA 4OVJA 4KCDA 1WVJA 2P1SA 4UA8A 2PT1A 1LLSA 1EZOA 3H3GA 3K6VA 4KYSA 4OERA 1D9YA 4ESWA 2FA7A 2V3UA 4ZE8A 1HSLA 3TKDA 3FV2A 3PMVA 1B5HA 1VFEA 1FQDA 3O66A 4THIA 3I6VA 4EUOA 3S9MC 1Y3QA 3MVXA 1IIWA 2NOOA 5FTHA 3PUZE 5DT6A 3G3FA 1OMPA 1MDP1 3K1PA 1ANFA 1HSEA 4F3GA 2YPNA 4HTGA 3K0VA 5LOMA 1LSTA 4QFKA 4ELQA 3O97A 3VFJA 2DQVA 3CSGA 2I6EA 2VD3A 1XT8A 3PGFA 1SW2A 4NF4B 4U21A 1XVXA 1NH7A 2ZYOA 4KFQA 4OWDA 4GVOA 1IQ7A 3TCHA 2I4BA 3TTMA 3TTRA 2Y7IA 1SDXA 3RTFB 4FEBA 1R1NA 2Q8JA 2ONRA 4EDPA 3TELA 2F6PA 3CSBA 4GXAA 3OEMA 4NF4A 1NFTA 4DXBA 3FIRA 1JW5A 4OESA 5KZTA 4HCWA 1P1NA 3R7XA 5HBCA 4G77A 4DCYA 4I62A 1P1OA 3O9PA 5K2XA 1GV8A 1JVYA 2YJPA 5A5XB 4JBZA 1B1HA 5AA2A 3OD7A 3D4CA 4H5FA 1MG1A 4ESXA 1AL3A 2XXHA 2FYIA 3FVKA 2V3QA 3EN3A 3UIFA 2XXUA 5I57B 2DWIA 3C4MA 3SETA 4QFOA 1B6HA 2E0SA 4KI0E 5H8NB 3HV1A 3FJMA 4EQBA 1DPEA 5H8SA 1B9JA 3MJNA 5A5XA 4U1ZA 3KN3A 1S50A 1GGGA 1OQHA 3W15C 2GRVA 5H8FB 5I56B 3VLVA 1QULA 1P1QA 1BP5A 1NNFA 1JW1A 3O6IA 1JQFA 2HQ0A 5I59B 2RC8A 5IKBA 1QUIA 3FD3A 5L9SA 3OO6A 4JWOA 3HSTA 4ND9A 1DTGA 5DYHA 1ZU0A 4JWXA 3I5OA 3OEKA 5ICQA 3KSJA 1MXUA 3OMBA 3PPPA 2QL3A 1IZ1A 2IA4A 2NXOA 3U8QA 2XXVA 1QVSA 1JETA 1LB9A 3ODBA 2O7UA 2RC7A 3O6HA 1DMBA 2PVUA 2XXTA 3MVZA 5BWJA 1UTBB 4H67A 4XKRA 1TFDA 1A54A 1IXHA 1SW4A 2DYXA 3PMWA 1FTKA 1VFDA 3TDJA 1I69A 2XXXA 3GZGA 4P0GA 3B6WA 3S9NC 1MY3A 3OELA 1ZTYA 3MZ1A 5B7DA 3KBRA 3K02A 4F31B 2HAVA 3G7WA 4ZEFA 1Z7ME 3RY3A 3KFMA 3G3JA 2I4CA 4F1UA 1A8EA 1YAEA 2B3FA 4LA9A 3CFZA 1BTJA 2UVJA 4AQ4A 4HS7A 3KEIA 2DVCA 2ANJA 3K2DA 4EF2A 2M8CA 1JW4A 2XXYA 4F3BA 2XHDA 2XD2A 3ZS6A 3IAZA 3U93A 1BLFA 5ISUA 2H98A 1N7XA 4EXKA 1ZJLA 3KJTA 4G8HA 4PFYA 2ZNUA 5H8HB 3GBAA 5CMMA 1R9QA 3FGSA 2AL5A 5EYFA 2YLNA 3VXBA 4X1BA 4I8CA 3VVFA 4FE8A 4IO3A 1B32A 4RNSA 2XXWA 1LCTA 5CMCA 3N26A 4OFOA 4MLQA 5DTBA 3IJOB 1SYHA 1D4NA 3WAFA 2PMSA 5EHSA 3FJGA 1ZLQA 5H8HA 1LGBC 3M3LA 4PFTA 5AA2D 3B6QA 1Q1KA 1OQGA 4DE8A 3RT8A 3K6XA 3O28A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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