4RXLA

Crystal structure of molybdenum abc transporter solute binding protein vc_a0726 from vibrio cholerae, target efi-510913, in complex with tungstate
Total Genus 74

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
TLHIYAASSMTNAVNALVADYSQQHDVKLVTVYGGSSSLARQIEAGAPADLFISANEEWANYLVEKGLVKPNKVVTLAANSLVLIRPTAQPVASFELQDAAAWQTALADSRLAVAQVDAVPAGMYAKQALQHAGVWPELESRLAQTNNVRLALALVERGESPLGIVYKTDALLSDKVTIVTAFSAQSHQPIRYPLAQLNDKAASAEWVAYLRSDAAQQILQRFGFESVS
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (26-31)AH1 (35-48)S2 (53-58)AH8 (192-197)AH4 (124-131)S10 (216-221)S3 (75-77)AH9 (226-236)TIV1 (78-81)AH3 (81-90)S7 (167-170)S8 (187-191)TVIII3 (183-186)TIV3 (164-167)AH7 (173-182)TVIII1 (91-94)EMPTYS5 (106-111)TI5 (140-143)AH6 (159-164)TI3 (111-114)AH5 (145-157)TI4 (120-123)S6 (136-139)TI6 (198-201)TI7 (208-211)TI8 (209-212)AH2 (60-69)S9 (201-206)S4 (98-103)TI1 (94-97)TIV2 (141-144)TII'1 (131-134)3H1 (32-34)Updating...
connected with : NaN
publication title Crystal Structure of Molybdate Transporter Vc_A0726 from Vibrio Cholerae, Target EFI-510913
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Vibrio cholerae
molecule keywords Molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding p
total genus 74
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4rxlA02
4P11A 1MXWA 1DMBA 5H8QA 1B6HA 4I9DA 1R1NA 2ZYKA 2AL5A 2FA7A 3T22A 3E13X 2ZMBA 4ZEFA 4X48A 1MQHA 2DSFA 3T9VA 4POWA 4F3PA 1UIUA 3M8UA 4R6KA 3C36A 3CSBA 5H8SA 4Q8RA 4ECFA 4F1UA 4EXKA 3FASA 3K6XA 2I6EA 1P1NA 2D3IA 2PYYA 1ZJLA 2R6GE 5IKBA 1M5FA 4U4SA 3PMVA 1SI1A 2DOJA 4AB5A 4LQ2A 2O84X 3P7IA 4G68B 1MXYA 4YB7A 3PMXA 2AIXA 4LQ5A 3IB2A 4DXUA 3HCQA 4XKRA 2Y7KA 1H45A 2ESNA 2UYEA 3KN8A 2ONRA 1AIVA 1PBQA 1P1QA 3TZAA 4R9FA 1US4A 4AQ4A 1GV8A 2HAVA 3RQTA 1F9BA 1NKXA 2F36A 3HHGA 2VD2A 3FZVA 4E0WA 3THIA 2PT2A 1B3GA 4JWXA 2QS3A 4JWOA 4JWYA 5I59A 3RTFB 3IO4A 2XXPA 2M8CA 3IX1A 1N7XA 1H76A 4LZ8A 2Q8JA 2H9BA 4NWCA 1IXHA 1PB7A 1FTLA 1B5IA 3TPAA 2ZYNA 5CMKA 2F78A 4M4GA 3QIMA 3TFLA 4BDMA 2Z22A 2YJPA 4OENA 4MBPA 3IB1A 5FHMA 4U22A 3G3GA 3RY3A 2O1LA 1DSNA 2HQ0A 2OBGA 1MG1A 2E0SA 1MY4A 3KN7A 1BKAA 3I5OA 1TXFA 1XVYA 3USDA 3PU5A 1MQGA 2UXAA 1WVJA 3QXMA 1LCTA 2QL3A 3TTRA 1SI0A 3PUVE 3KOTA 4QF9A 5AA2B 3SEYA 1AMFA 4F1VA 4IO5A 1H43A 5B7DA 4BDRA 3T96B 5FHOA 2OWTA 1JW4A 3RUMA 4DCYA 1XC1A 3EN3A 1Y3QA 5J1DA 5L9MA 1LB9A 3PD8A 2F6GA 1NNKA 1B4HA 2XXVA 2V93A 3DP8A 4G4PA 1OVTA 4F29A 4NF4B 2D21A 2CMOA 3RNNA 5L9SA 1RKMA 4GQOA 2QSXA 1B40A 5H8HA 4EDPA 3FJ7A 3UA8A 2BJJX 2R71A 2QS4A 3C9HA 4YKKA 2ONSA 4O3AA 1VR5A 3I6VA 1HSLA 1ATGA 5H8QB 5JTYA 1BTJA 1WODA 1Y1MA 1GR2A 4F2QA 3LSFB 4BDOA 1US5A 3L6GA 1MS7A 1ZMGA 4IO3A 1EZOA 2QPQA 2XD2A 4H5FA 1XS5A 1JEVA 3D4CA 1B9JA 3N6UA 1MDP1 1N7WA 1YAEA 4QRZA 3VXCA 3K01A 5CMCA 3O6GA 3FVOA 2Y84A 3VXBA 4ZEIA 1EU8A 4X9TA 3TYHA 1FQAA 1MQIA 2Z8EA 3BKIB 1SDXA 4R6HA 4N6PA 2Y7PA 2RC9A 4C1UA 5FHNA 4BDLA 2QMXA 2HZKA 4DXBA 3K02A 1B3LA 2DP8A 1IITA 2RINA 5CM6A 4JB7A 4QSEA 2H99A 3Q29A 1S50A 3RGYA 5FTHA 2UVJA 3MBPA 1M5CA 1B46A 1MXVA 2O7UA 2O69A 4KHZE 3AXFA 1LCFA 3PPOA 4TQUQ 1P1UA 4TOZA 1D3KA 1I6BA 2Q2CA 2UVGA 4OFOA 2ZNUA 3N6TA 4OWDA 3IR1A 1MH4A 4R74A 1IXGA 1MY0A 1PEBA 4YB5A 4I8CA 1NL5A 2AL4A 2P0SA 3PMWA 3FXUA 3K2DA 3GBAA 3IAZA 5I59B 3G3JA 2NVUB 3V83A 4XKPA 1LFIA 4QFLA 4Z7EA 2QS1A 5CBSA 2B65A 1VFEA 3OO7A 2P1SA 2O51A 1JVYA 3N5LA 3IO6A 4OETA 3MW0A 1QKBA 4MFIA 5IAIA 3N94A 1SW1A 3SEXA 3FGSA 3I3VA 4YICA 4QFKA 1MY3A 4NF5A 3LSXA 4G8HA 3U94A 5EYFA 3L6HA 3K1PA 2XX7A 5CMMA 1B4ZA 1Y20A 1Z7NE 4OXVA 2RF1A 4XXUA 1XHYA 3H7MA 1SVXB 2Q2AA 4E0XA 4ZE8A 2PVUA 4KD5A 3IJOB 3TAJA 5I84A 3CG1A 1IUDA 1Q1KA 4PETA 1PDAA 3TQLA 1H44A 4OMBA 1MY2A 4EF2A 1FQEA 4R72A 3V5AA 3SEUA 1JVXA 3PPPA 3SEWA 3VVEA 1VE4A 4RJZA 1FW0A 1YTVA 3C34A 4L17A 5JEIA 4R73A 1Z7ME 4U23A 1NNTA 1A99A 1OLCA 3IJXB 5F7VA 4ZZAA 1USYH 4NF6A 2DE2A 1B05A 4XKNA 1BIYA 1B2HA 2Y7WA 3O28A 2YPNA 5DYHA 1RYOA 2UYFA 2OZZA 2RCAA 1PBPA 3PUXE 1UTBA 3KGCA 3OEMA 2ANJA 3W9VA 1N84A 2F34A 2A5TA 4IY5A 2GH9A 3FVNA 4GXSB 3BBRA 3OXNA 3IOUA 3B6TA 1S7YA 3G3HA 3FVKA 1B58A 4DZ1A 2NWJA 4NTLA 4IGTA 3KOSA 4IO7A 3WAEA 4H8JA 4HTGA 5DT6A 3RN8A 2ONKE 3GBBA 4GLIA 2DWHA 1B0HA 4PFTA 3EF7A 1VFDA 5ISUA 3CRBA 4GWOA 1LBCA 4FEDA 3CIJA 3MVWA 5I2NA 1NNFA 1NMUA 1MPDA 3T66A 4JSOA 1FTJA 5CMBA 1MPBA 3DLNA 1XT8A 2KLFA 2XXQA 3IB0A 5DTBA 1SW4A 4YB6A 3LSWA 4U21A 2F7AA 1ANFA 3IL1B 3KFMA 4H6DA 1YPNA 4Q0CA 4XKQA 4IGRA 3TKDA 2ZNTA 4U1OA 3IOTA 2I58A 1POY1 3S4UA 2PT1A 2XD3A 3MQ9A 1B7HA 4KYSA 4ZE9A 4KQPA 4QFOA 3UGWA 4EXLA 3PUZE 4JDFA 5AA1A 5JK4A 1S9TA 3VLVA 4O3CA 2GFEA 1N0TA 4F18A 1QVSA 2V3QA 2VD3A 4YMAA 2XXUA 3PPNA 4NF8B 3LC8A 2XXIA 2F35A 1JEUA 1PB8A 3OO8A 5FTIA 3UP9A 4KYEA 4M1VA 1I6QA 1ZU0A 4MF3A 4DCXA 2A5SA 4NF5B 5M2VA 3EHUA 3T9UA 3V8XB 2OWSA 2Z8DA 3F11A 3VDFA 1B7UA 1DPEA 2H98A 4H1XA 4RY1A 3VLUA 3TMGA 4G2ZA 4KYDA 2DWIA 4HCWA 1B1HA 5H8NA 3FXRA 3GXAA 4LUBA 4R75A 5EHMA 3C35A 2V3UA 4IY6A 4PFUA 2OLBA 1MRPA 1CE2A 1JQFA 2FYIA 4R2FA 4F3SA 2NUVA 3MPLA 4ZDMA 5L9OA 3MP6A 3A3CA 1PB9A 1VSOA 2X26A 4NF6B 1LGBC 3WAFA 1Q35A 2HZLA 4F31B 1FQDA 3Q26A 4XIGQ 2OK2A 1FTMA 3EHTA 3VLWA 4FAJA 5F1QA 1A7LA 2RCBA 3DELB 4H65A 3KBRA 3PUWE 3S9NC 2I3VA 1TFDA 3Q28A 1R9QA 1ZIUA 1N3WA 3QSLA 1B3EA 4FECA 5AA4A 5TPAB 1MY1A 3U72A 3VV5A 5I2KA 3H6TA 2DVCA 4TLLB 2DYXA 3H6UA 3SESA 3H4ZA 1UTHA 3SEVA 1B0LA 4LVQA 5H8FA 1H3DA 4ESWA 1IXIA 5DVFA 3MP1A 2WKYA 4Q5TA 1ZKBA 1NH8A 4LATA 3OMBA 4H8IA 5A5XA 1D9YA 1NNPA 1ELJA 3G7WA 3IOWA 5AA3A 2F7CA 2I0CA 4N07A 5I2NB 4TLMB 1A40A 4MH5A 4FATA 2NXOA 4OEVA 2DQVA 4EQBA 4KCDA 2DXYA 1EH3A 1B32A 5CRYA 3TQWA 4FE8A 4WKMA 3FJMA 4ZEDA 2I48A 2X7PA 5CC2A 2XX9A 4F39A 1N76A 4OVJA 3MVZA 3R26A 3C31A 3LR1A 1MPCA 5DEXA 4WEPA 4O3BA 1Y3PA 4PQJA 1FCKA 3MZ9A 2RKMA 5K2XA 3O9PA 1MM7A 2UVHA 3HV1A 3E4RA 2XXXA 4ELQA 4ZZEA 4ISUA 1EZPA 3S9LC 4ELPA 2CZLA 4G8NA 2NOOA 3ILUB 2AYSA 1A54A 1LFHA 3OD7A 4THIA 1SW5A 4RPOA 3CI8A 4U1ZA 1R6ZA 4GVOA 3PD9A 3FATA 4KR5A 1T0KA 3HN0A 3U8QA 3TTNA 1D4NA 1TFAA 4PFYA 3H3GA 1LBBA 4YMBA 1N3XA 1FQCA 1QJMA 4EQ9A 2F7BA 1RYXA 4JXIA 3KJ7A 1R9LA 2R9JA 4ND9A 2XXYA 1QUKA 1AOVA 4F2OA 3PPRA 4GIZA 4ESXA 3TDJA 2GHAA 4U2RA 1IXCA 4BLAA 4JBZA 3MP8A 4YKIA 3E3KA 2DE3A 5H8NB 3LSLA 4JSDA 4P0IA 1LFGA 1BP5A 5AA2D 3C33A 5DVIA 1Y9UA 5HBCA 1FQFA 1I6AA 5BUUA 2OJTA 1N04A 2D5WA 2UVIA 4LA9A 1D9VA 3U1OA 2F6PA 1B1XA 4WEDA 3MZBA 4GF8A 3K1MA 5CI5A 4OFLA 1DOTA 2DWJA 3HO7A 4P0GA 1P1WA 2FNCA 4C1TA 1B5HA 3RT6B 3KJTA 4GD5A 1NH7A 3PUYE 5AE4A 1Y3NA 2XX8A 3B6QA 4UACA 3T9HB 3MAMA 2QMWA 3IOVA 2E1SA 3W15C 3ILTB 3RT8A 3H6VA 2PBWA 1M5DA 1FTKA 4DIGA 3R7XA 4Z0IA 3ZKLA 5AA4B 3TUSA 5I2KB 1MXZA 4KFQA 3MPKA 5H8HB 4PP0A 3OSQA 3W9WA 3EQ1A 1UTHB 2Y7IA 1QUIA 5H8FB 1IIWA 3OO9A 2I4CA 3V89B 4QFNA 5JTYB 3BFTA 3ZS6A 3B7DA 5A5XB 2XHDA 4NMYA 1OQHA 3VVDA 1SQYA 1A55A 3EPEA 2ABHA 4RK2A 3TELA 1QW0A 3OENA 1MQDA 4H0WA 2HFBA 2V84A 3T9XB 1OVBA 3SKPA 1XOCA 2Y7RA 1GTKA 3O6IA 2XXTA 1DPPA 4K3FA 4IO4A 3K6VA 4ELRA 4GRKA 4R9GA 5DEXB 3MC2A 1B5JA 4ONYA 3S9EA 3O29A 3SERA 2HXWA 1ZBMA 4GOTA 4F22A 3M3KA 1AL3A 5HPQA 3CVGA 4Q30B 1Y4CA 3K1NA 3DM0A 3QUFA 4WXJA 4YKJA 3O2AA 4ZS9A 1LAXA 3OEKA 3PGFA 4IO6A 3ZSFA 2ALUA 1II5A 5I56A 2XXHA 3RTWB 3M3FA 5KZTA 4H67A 3S9MC 2VP1A 1FQBA 4OEUA 1LSTA 4NE4A 4FJPA 1URGA 1DTZA 1OQGA 3R6UA 4G8MA 5B70A 1SD3A 2IEEA 4LZ7A 4F1YA 3LBSA 2GRVA 5ELVA 4RNSA 3H06B 3UORA 1TT1A 1HSJA 4QHQA 4YKPA 1B3HA 4OFJA 3MUQA 2F97A 3MVXA 2IA4A 2H4IA 4FEBA 2O1MA 3QUJA 1LLSA 2B3BA 1SW2A 1LAFE 4HW8A 5LOMA 1AH5A 2XXWA 1OLAA 1LAHE 2ZYMA 1SBPA 1JETA 3CSGA 4PE5B 1MM6A 5KDTA 3S2VA 4GFRA 3Q25A 2HCAA 3FD3A 2LAOA 3TTMA 4RPNA 1SYIA 3T93B 4N13A 2I4BA 4NWDA 1A8EA 3VE1B 2XXRA 1KWHA 2VOZA 1MQJA 3QYTA 5I57A 2DWAA 1J1NA 2RC8A 2ZYOA 2QRYA 3G3FA 2F8DA 4QSCA 5L8DA 5I58A 5TU0A 5KCJA 3KEIA 4OZ9A 1NFTA 1ZLQA 4KPTA 3CG3A 4OYVA 4POXA 1XVXA 4HCYA 3JYRA 3K6WA 3TTKA 3CFZA 3FVGA 2ZXTA 1I69A 3HHFA 4QFPA 4G68C 4R2BA 5K2YA 2ZNSA 4LZ5A 4NEDA 3U93A 1M5EA 1QKAA 1UTBB 2Q89A 4XTCQ 1Y4TA 2W7YA 2O68A 4I1DA 1IQ7A 2A5TB 2P2AA 2VGQA 4UA8A 3ECRA 3HSTA 3TCFA 2DVZA 1O64A 4MLVA 3N26A 3UN6A 1PC3A 3PV0E 2G29A 3SDFA 4YZZA 3ODBA 3MZ1A 4MLQA 3SETA 1URDA 4I62A 5CBRA 5ICQA 5DVJA 3MJNA 4ZEKA 3TEPA 2DXRA 1MXUA 3FIRA 3HPIA 3OELA 4ZEBA 1SYHA 3BFUA 2YLNA 1DTGA 4X1BA 5TP9A 2V25A 3QK6A 3C4MA 2I3WA 2PMSA 1P1OA 5ICTA 3TTLA 1CB6A 3GLBA 3C32A 3K6UA 1IEJA 3KSJA 5ITOA 4ZECA 3O66A 3RLFE 4GXAA 1B52A 3MVYA 4FORA 3ZKKA 4BDNA 1QUJA 3A3UA 3IK6B 3FV1A 2H25A 1EZ9A 2GHBA 4GL0A 4GL8A 5I56B 2VHAA 1GGGA 3RPWA 3M3LA 5HM4B 1MDQA 1B7ZA 1Y1ZA 1MXXA 3PPQA 4F3GA 2O7IA 3B6WA 1OMPA 4H5GA 3UK4A 4FIMA 1A8FA 2OCUA 4HS7A 1JW1A 3O97A 4U4XA 5EHSA 1M5BA 4IO2A 2DS9A 3GZGA 4G77A 4PFWA 4DLDA 4C0RA 4RA1A 4G68A 3FJGA 3CR9A 3LUYA 2DE4A 2HEUA 1UIVA 3K00A 4EQ7A 4BDQA 4IB2A 3FV2A 3U92A 1O63A 3CFLA 4OESA 2X7QA 1OIBA 3ONMA 3MWBA 1L5TA 1WDNA 3KN3A 5KDTB 3FUZA 3JV9A 3D4GA 2QJEA 1IZ1A 2REGA 4EUOA 3VVFA 4F19A 1QULA 2I0BA 4RK9A 4AB6A 4NF8A 1JNFA 4DXCA 1TWYA 2RC7A 2Q9TA 1FTOA 4X1DA 3A09A 5I57B 3DP4A 3KG2A 3K0VA 1ZTYA 4LONB 5I58B 2F5XA 5KCJB 4YU0A 3DP6A 3H6WA 1HSEA 3Q27A 1POTA 4OTEA 3K4UA 3VFJA 1P99A 4DE8A 4LP2B 4RXLA 5BWJA 1USYE 3FXQA 3KZGA 4EF1A 3TCHA 4OQOA 4YAHX 1O7TA 2THIA 3EHSA 3OSRA 2PX1A 2B3FA 4QSDA 2REJA 3O6HA 3QAXA 5ITPA 3TCGA 4ELOA 4RYAA 2Q88A 5AA2A 4KCCA 1UQWA 1BLFA 3JZJA 4OHNA 1URSA 2Z8FA 3G3IA 4OERA 4R6YA 3OO6A 3G3KA 1GVCA 4DDDA 1B3FA 2O6AA 3KSXA 3H03A 4F3BA 1LAGE 3IORA 2I49A 2G93A 2H5YA 2V3TA 1LB8A 3OOAA 2Z23A 4NF4A 2QS2A 1B51A 3E9XA 2HAUA 5TP9B 5TPAA 1JW5A 3CFXA 3UIFA 1MH3A 1YCJA 4KI0E 3TODA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4P11A 1MXWA 4NN3A 1DMBA 5H8QA 1B6HA 4I9DA 1R1NA 2ZYKA 2AL5A 2FA7A 3T22A 3E13X 2ZMBA 4ZEFA 3CHGA 4X48A 1MQHA 2DSFA 3T9VA 4MCOA 4POWA 4F3PA 1UIUA 3M8UA 4R6KA 3C36A 3CSBA 5H8SA 4Q8RA 4ECFA 4F1UA 4EXKA 3FASA 3K6XA 2I6EA 1P1NA 2D3IA 2PYYA 5ET6A 1ZJLA 2R6GE 5IKBA 2F3DA 1M5FA 4U4SA 3PMVA 3KC0A 1FPDA 1SI1A 2DOJA 4AB5A 2ZZVA 4LQ2A 2O84X 3P7IA 4G68B 1MXYA 4YB7A 3PMXA 2AIXA 4LQ5A 3IB2A 3RPLA 4DXUA 3HCQA 4XKRA 2Y7KA 4P1EA 1H45A 2ESNA 2UYEA 3KN8A 2ONRA 2VPNA 1AIVA 1PBQA 1P1QA 3TZAA 2CEXA 4R9FA 1US4A 4AQ4A 1GV8A 2HAVA 3RQTA 5IGAA 1F9BA 1NKXA 2F36A 4N15A 3HHGA 2VD2A 3FZVA 4E0WA 3THIA 2PT2A 1B3GA 4JWXA 2QS3A 4JWOA 4JWYA 5I59A 3RTFB 3IO4A 2XXPA 2M8CA 3IX1A 1N7XA 1H76A 4LZ8A 2Q8JA 2H9BA 4NWCA 1IXHA 1FBHA 1PB7A 1FTLA 1B5IA 3TPAA 2ZYNA 5ESYA 5CMKA 2F78A 4M4GA 3QIMA 3TFLA 4BDMA 2Z22A 2YJPA 4OENA 4MBPA 2P3NA 3IB1A 5FHMA 4U22A 3G3GA 3RY3A 2O1LA 1DSNA 1EYJA 2HQ0A 2OBGA 1MG1A 4NHBA 2E0SA 1MY4A 3KN7A 1BKAA 3I5OA 1TXFA 1XVYA 3USDA 3PU5A 1MQGA 2UXAA 4GWYA 1WVJA 3QXMA 1LCTA 2QL3A 3TTRA 4PFRA 1SI0A 3PUVE 3KOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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