4THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus with covalently bound 4-amino-2,5-dimethylpyrimidine
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA02
4C1UA 2VD2A 5F7VA 3N94A 4YAHX 3RTFB 5TU0A 5TP9B 2ZYKA 5ISUA 4BLAA 1BP5A 4F1UA 1UIVA 3K1NA 3IK6B 3RPWA 4XKPA 3PUWE 4MH5A 4MLQA 1MH4A 3GZGA 3OO8A 4L17A 3GBBA 3VVDA 5DVFA 2CMOA 4RXLA 5ICTA 4H5FA 1OMPA 1P1NA 5F1QA 2G29A 5CC2A 3SEYA 1HSLA 3PD9A 1D4NA 1QVSA 3ZKLA 3S9MC 1AL3A 3OO7A 3LR1A 3RN8A 3CSBA 1NH7A 2YLNA 1Z7ME 2HZLA 3H6TA 2D3IA 2ZNUA 1I6AA 1MM7A 1OVBA 1P1WA 2DXYA 1JVYA 2R6GE 1SYHA 4F1VA 3T66A 3C33A 4PETA 3G7WA 2DWAA 3HCQA 2DYXA 1B05A 1B1XA 2DWHA 4AB5A 1L5TA 4LZ8A 4R2BA 1HSEA 1S7YA 1B40A 1MY2A 4DLDA 3QUJA 2PMSA 4YICA 4M1VA 4ONYA 3MQ9A 4KYDA 4DCYA 3M3FA 2O69A 5AE4A 3BFUA 3LSWA 4QSEA 2DVCA 1XVYA 4YKIA 4TLLB 3T22A 1A54A 3T9VA 1BKAA 3VLVA 4QSCA 5I56B 2XXRA 1OLCA 3UA8A 2RC7A 4FEDA 4H5GA 3RNNA 1WDNA 1FQDA 4FEBA 1PB9A 3FGSA 4BDNA 3THIA 4PE5B 3VLWA 1B9JA 1NFTA 2PT1A 2VOZA 1N7XA 1UQWA 3G3JA 1MXXA 1JW5A 4YB6A 3IO6A 3S2VA 4KR5A 3CVGA 2G93A 2QMWA 3PPOA 4JSDA 5AA1A 3KGCA 3PU5A 3TFLA 1MQIA 1MY0A 1B51A 1MXZA 3OEKA 1RYOA 4FECA 1QULA 2UVJA 3SERA 1VR5A 1XHYA 4GLIA 4H65A 3M8UA 1DPEA 1UTHA 2ZYNA 4O3BA 4YMBA 4GVOA 2DXRA 3EQ1A 2A5TB 2UVHA 2E0SA 4MFIA 1ZLQA 1R9QA 3CIJA 2O51A 2VP1A 3FJGA 2AYSA 2DOJA 3TEPA 5CBSA 5K2YA 4U1ZA 3PMXA 5CBRA 3R7XA 3SEXA 3RGYA 5DT6A 1QUKA 2A5SA 3IOVA 5CMMA 2GHBA 1FQBA 1B52A 4EF1A 1JVXA 3KN3A 3MC2A 1XS5A 3CSGA 1LBBA 1O64A 1URGA 3H4ZA 4OQOA 3PUYE 4OVJA 4F2QA 1ELJA 2XXYA 4OEUA 1FTOA 3OOAA 2DE4A 3ZS6A 1A8EA 1II5A 4KYSA 3K6XA 3UIFA 1TFAA 3IX1A 1R1NA 4JWXA 3H6UA 2R9JA 2F8DA 3PUXE 3AXFA 4XIGQ 1JW1A 4IO2A 4KI0E 3C32A 2H99A 4I9DA 1B1HA 4RK9A 4MBPA 4IGRA 3D4GA 2VD3A 5HBCA 1USYE 2ZYMA 5AA2A 3U72A 3MUQA 3VFJA 4IB2A 3FIRA 1B2HA 1D9YA 1F9BA 1UTBB 3N6UA 1DMBA 5EHSA 4NTLA 2I58A 4NE4A 5KCJA 3FATA 3FXUA 4QF9A 1SW2A 3LSLA 3O97A 3KG2A 1SD3A 1WODA 3V8XB 1DTGA 1LB9A 2Y7RA 2XXHA 3G3HA 4U1OA 5TPAA 5AA4B 3CG3A 3FJ7A 2QJEA 1MXVA 2HCAA 1FTMA 4LZ7A 1B3HA 1B5HA 2XX8A 4RA1A 3MVWA 4NF6A 4NF4A 2QMXA 1A7LA 3PD8A 2RC9A 1LFGA 2ABHA 4BDQA 3UGWA 1LBCA 5B7DA 5I2NA 1H76A 5H8NB 3HHFA 3I6VA 3KEIA 4GQOA 5DEXA 4GWOA 1MY1A 4F29A 4H8JA 1QW0A 4POXA 4F3PA 4GD5A 1LGBC 3LSFB 4YZZA 2AIXA 4YMAA 2Q2CA 1B3FA 5JTYA 1SW1A 3ONMA 3EHTA 2AL5A 4ZE9A 1EZOA 2GHAA 1Z7NE 1JETA 1BLFA 3PMWA 2RINA 3G3FA 1LFHA 2AL4A 1Y20A 5ITOA 3JZJA 3H3GA 1HSJA 5CMBA 1XVXA 2RF1A 2QS4A 3TKDA 3OD7A 4JWYA 2D5WA 3B6QA 2GFEA 1FW0A 2O84X 3QK6A 1T0KA 1D3KA 3MVZA 4U2RA 4IO7A 2Y7IA 2ZNSA 4GFRA 3FVNA 1MXUA 1J1NA 3SETA 4LVQA 2F78A 3EHUA 4QFOA 3DELB 2OJTA 3MP6A 1Q1KA 4AQ4A 2H4IA 1B7HA 4NEDA 4JSOA 3N6TA 5H8FA 4ZEIA 1Y3PA 5EYFA 3O29A 2ZNTA 2F6PA 1DPPA 1Y9UA 2PVUA 4G77A 1BTJA 1N0TA 4EXLA 5CMKA 2NVUB 5L9SA 2XXQA 2HZKA 3IO4A 1ZBMA 1P99A 1R9LA 4OZ9A 1MG1A 1ZJLA 4G68C 1B4ZA 1B7UA 3RT8A 1D9VA 3O6GA 5A5XA 4R9GA 3U94A 4LA9A 3KSXA 4Q30B 2XX9A 3DP6A 4YB5A 2RCBA 3VLUA 4NF5A 3MVXA 1RYXA 1SQYA 5DVIA 2I6EA 4G68B 2F6GA 4OERA 3E3KA 3KSJA 4XKQA 4OXVA 4YKJA 4WKMA 3H6VA 1PDAA 2CZLA 3K0VA 5I56A 5L8DA 1JEUA 5ITPA 4THIA 3U1OA 1DSNA 2I48A 3L6GA 3VDFA 1US5A 3C34A 5AA2D 4P0GA 1FQEA 4BDRA 1CB6A 1B0LA 5I59B 4Z7EA 3IB1A 2UXAA 3A3CA 2DSFA 1TXFA 4YKKA 4FJPA 4QFNA 5JK4A 1ZTYA 5DVJA 1SVXB 3TDJA 1MQDA 2I3VA 5CRYA 3K6VA 1NMUA 4IO6A 4MF3A 3MZ9A 1RKMA 3FASA 1NH8A 3Q27A 1OIBA 2REGA 4FATA 4KCCA 3K1MA 1USYH 3MZBA 2DQVA 1LCFA 2XD3A 5FHNA 2A5TA 3L6HA 3OENA 2UYFA 1IQ7A 4HCYA 4XKRA 2GRVA 4TQUQ 4PFYA 3PMVA 3Q25A 4DXBA 4ELPA 3T9UA 4OFLA 4NWDA 4OFJA 4AB6A 5I2KB 4DE8A 3FVKA 4XXUA 5HPQA 5ELVA 4HS7A 4U4XA 4RPNA 4TLMB 1XC1A 1B5IA 3K4UA 1DTZA 2R71A 3PPRA 2Z8DA 4GOTA 2HAVA 1EH3A 1A99A 2O6AA 3MP1A 3U92A 4XTCQ 3T93B 1GTKA 1MRPA 3ODBA 4ZECA 1SW4A 2RC8A 2IEEA 4YU0A 2F7BA 4TOZA 3CRBA 3S9EA 3OEMA 5HM4B 2B65A 1MY4A 4WEPA 2HEUA 2ZMBA 4R6KA 4R74A 5EHMA 1MY3A 1N84A 3TUSA 5K2XA 4DXUA 5H8QB 1MQHA 3CR9A 4KCDA 1UTBA 4ZDMA 4DZ1A 3MW0A 2XXIA 3USDA 1TWYA 4KD5A 1MDP1 3K2DA 3TTMA 1I6QA 3P7IA 2O1MA 1IITA 3CI8A 1URDA 1LB8A 4M4GA 2NXOA 3V5AA 3IOTA 2I4CA 5AA4A 1AOVA 3PPNA 3C9HA 3TCFA 2QPQA 2X26A 3K6UA 1LFIA 3B6WA 4GRKA 4DIGA 1H44A 1Y1ZA 1OQGA 2Y7KA 4QSDA 4DXCA 3CFLA 3CG1A 3KBRA 2DWJA 1MH3A 3I5OA 3HO7A 3O28A 5CMCA 2DVZA 1B3GA 2VGQA 4ELQA 1GGGA 5H8NA 3TELA 4H1XA 3DM0A 1M5BA 5I84A 1URSA 2OLBA 4NF8B 3UP9A 4RYAA 5IKBA 1NNTA 3BBRA 4EQBA 4XKNA 2B3FA 1ANFA 4KQPA 1CE2A 2VHAA 2ANJA 4LQ5A 4ZEDA 4NWCA 2HXWA 4GXSB 4KFQA 1P1UA 1SDXA 3T96B 5H8SA 4N6PA 4BDLA 4F1YA 3CFZA 2Q9TA 2DWIA 1B3LA 4F22A 4Q0CA 3SEUA 3TAJA 4E0XA 4GIZA 3MZ1A 2ONSA 2PYYA 5CI5A 3O6HA 4ZEKA 4IGTA 3QIMA 1IIWA 4U23A 4ELRA 1JNFA 3KOSA 4ZZEA 5FTIA 1M5DA 2F34A 4MLVA 4G8NA 2XXWA 3TTLA 2F5XA 3D4CA 4U4SA 3MPKA 2DE3A 3FD3A 1NNPA 1B0HA 2HQ0A 1O63A 3H03A 2P0SA 1N04A 1FQFA 4F39A 1JEVA 3TCHA 3BKIB 3VVEA 1NL5A 4Q8RA 4R72A 1VFDA 4RNSA 3WAFA 4F3GA 3V89B 1B32A 3C31A 4HCWA 4LONB 4G8HA 3MWBA 4POWA 1MS7A 3UORA 4P11A 1B6HA 2V3UA 2ZXTA 4IY6A 1PBQA 2QS3A 3RUMA 2XD2A 1N7WA 3O66A 5KDTB 3LUYA 3Q29A 3GBAA 3IL1B 3S9NC 3MPLA 2Z22A 1QKBA 2ONRA 5TP9A 2H25A 1QKAA 3W15C 2F7CA 3A3UA 4NMYA 3TQLA 4IY5A 5AA2B 3RTWB 4X9TA 4YKPA 2OWSA 3QXMA 2NWJA 2O7UA 1WVJA 4DCXA 3IJXB 3H06B 3KZGA 3MVYA 2O7IA 2QS1A 3OELA 3K6WA 4ECFA 1I69A 1P1QA 2PBWA 4G68A 1B46A 2V93A 1XOCA 3K02A 4OEVA 1LAGE 1N76A 1EU8A 1LSTA 1Y1MA 2V3TA 3IB0A 4LQ2A 3W9WA 3G3KA 1MPDA 5TPAB 3OSRA 5DYHA 3ECRA 4FE8A 3LC8A 2OWTA 4QRZA 1FTLA 1AH5A 2HFBA 3FV1A 2UVIA 3EN3A 1UIUA 1AIVA 1YTVA 4PQJA 3O2AA 4BDMA 2OK2A 3W9VA 4EUOA 3SEWA 4NF6B 3G3IA 5I59A 5FHOA 3PV0E 1SBPA 4JBZA 4IO3A 1Y4TA 1IXHA 1NNFA 2H9BA 4ZEFA 3S9LC 2QSXA 1YAEA 4PFUA 5FTHA 3EF7A 2P2AA 3UN6A 1MDQA 4C0RA 3HHGA 2Y7PA 1O7TA 4RK2A 1FQAA 3C36A 4OMBA 4JXIA 2Y7WA 1P1OA 4I1DA 1N3XA 2DP8A 4OTEA 4N13A 5M2VA 5I58B 5JEIA 5JTYB 3JV9A 5H8HB 1PB7A 2W7YA 3U93A 2Q2AA 3DLNA 3M3KA 3TTNA 4OFOA 5J1DA 4K3FA 1DOTA 2HAUA 3IOUA 3F11A 3C35A 2UYEA 4F31B 1VSOA 3VE1B 4H6DA 5CM6A 4LZ5A 3IR1A 1MPCA 3SEVA 3FXQA 1VFEA 5I2KA 2UVGA 3LSXA 5DTBA 4H0WA 3T9HB 1QJMA 1ZKBA 3N5LA 4X1BA 1Q35A 1IZ1A 2ONKE 1IUDA 1NNKA 4OWDA 1SW5A 4ZZAA 4EXKA 1JQFA 3OO6A 3C4MA 3E9XA 3MBPA 2ALUA 1ZMGA 3H7MA 4R75A 3H6WA 5H8FB 1BIYA 1Y3NA 1H45A 2X7QA 3EPEA 3PPQA 3PGFA 5I57B 4UACA 3RQTA 3PUZE 3PUVE 3FVOA 1I6BA 2F97A 4JB7A 1B4HA 4OESA 1IXCA 1KWHA 4BDOA 3HSTA 2Z23A 2PX1A 2QRYA 2WKYA 3KJ7A 1JW4A 3VXBA 4G4PA 2XHDA 3E13X 4OYVA 1QUIA 1ATGA 2DS9A 4ZEBA 2YJPA 4F3SA 3QYTA 2Q8JA 2I0CA 4ZE8A 3SKPA 1MM6A 4KPTA 4EQ9A 5H8QA 2XXTA 4PFWA 2XXPA 5A5XB 4EQ7A 2QS2A 4GL8A 1OQHA 3ILUB 4WEDA 4P0IA 3O6IA 4NF5B 3ZKKA 4F19A 4E0WA 2F36A 4FORA 3T9XB 3S4UA 1A40A 1IEJA 3TTKA 1GV8A 4HW8A 3TODA 5B70A 4ELOA 1LCTA 2RKMA 3FV2A 4RY1A 2M8CA 4HTGA 3SDFA 2O68A 4UA8A 3VV5A 1S50A 4GXAA 3QSLA 3KN8A 3OMBA 3I3VA 1XT8A 3RT6B 3OXNA 5LOMA 1IXGA 3HN0A 1S9TA 4FAJA 3V83A 2V3QA 3DP8A 4EDPA 4NF8A 3KJTA 2QL3A 2X7PA 5AA3A 1LAXA 3JYRA 1R6ZA 2YPNA 2Z8FA 4X48A 1US4A 4Z0IA 3SESA 3QAXA 4I62A 2Q89A 1OVTA 3QUFA 1PEBA 1GR2A 3MP8A 1ZIUA 2OCUA 4H67A 4R6HA 4QFPA 2KLFA 4H8IA 1B3EA 1ZU0A 1FTJA 2XXUA 5L9MA 1FTKA 2THIA 1M5CA 3IJOB 2FYIA 4JWOA 4U21A 2IA4A 1B58A 3IAZA 1YPNA 1M5FA 4G2ZA 1H3DA 1PB8A 3ILTB 1H43A 3RLFE 3KOTA 5BWJA 2F7AA 1IXIA 3K1PA 3KFMA 2ESNA 3MAMA 3FVGA 3KN7A 2V25A 4ISUA 3TMGA 3WAEA 2REJA 1MQGA 4ZS9A 1PBPA 2V84A 3RY3A 3OSQA 1OLAA 1POTA 2O1LA 4F2OA 2F35A 4R73A 2I49A 3CFXA 2RCAA 3DP4A 5KDTA 2B3BA 1LAHE 1QUJA 4GL0A 4QHQA 3VXCA 3M3LA 4QFLA 2I3WA 1UTHB 2I4BA 1GVCA 4DDDA 2Q88A 4IO4A 3PPPA 2ZYOA 3G3GA 2P1SA 4OHNA 3TZAA 4RJZA 4OENA 1SYIA 4RPOA 4R6YA 4U22A 3TYHA 4WXJA 4ESWA 4F18A 2GH9A 4C1TA 4ND9A 3TCGA 1YCJA 3GLBA 1FQCA 2BJJX 3LBSA 3K01A 4YB7A 1SI0A 4FIMA 4R2FA 2FNCA 2DE2A 3Q28A 5ICQA 1MQJA 4I8CA 3IORA 3B6TA 3FXRA 2FA7A 1MXYA 2D21A 1M5EA 2E1SA 1AMFA 1Y3QA 3IOWA 4OETA 1SI1A 1VE4A 5FHMA 4EF2A 2OZZA 2H98A 3K00A 2H5YA 4G8MA 3TQWA 4N07A 1LAFE 1TFDA 1PC3A 1A8FA 4PFTA 1EZPA 1LLSA 1B5JA 3O9PA 1MPBA 4QFKA 1NKXA 5I58A 4X1DA 4KHZE 3Q26A 1N3WA 5H8HA 1MXWA 3ZSFA 3IB2A 3TPAA 2NOOA 5KCJB 2XXVA 4R9FA 1POY1 2XXXA 5IAIA 4Q5TA 2LAOA 3EHSA 3BFTA 4GF8A 3OO9A 4LATA 2I0BA 2OBGA 3N26A 4LP2B 4O3AA 1B7ZA 3B7DA 3FUZA 3A09A 1A55A 4IO5A 3HV1A 4NF4B 3HPIA 4PP0A 2NUVA 3E4RA 3UK4A 4LUBA 3FZVA 5I2NB 3R26A 1Y4CA 1TT1A 4KYEA 3FJMA 2Y84A 5I57A 5KZTA 5DEXB 3R6UA 4ESXA 4F3BA 5L9OA 4JDFA 1EZ9A 3TTRA 5BUUA 3VVFA 2PT2A 4O3CA 3U8QA 2XX7A 2Z8EA 1FCKA 3MJNA 3GXAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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