4U21A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form e
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A02
4X9TA 3H6UA 1OIBA 4YICA 2V3UA 3GXAA 1BLFA 2Y7WA 3D4CA 3U8QA 4QFPA 3O97A 1TFAA 3N5LA 3OEMA 1JNFA 1LCTA 1MXZA 3D4GA 1QUJA 5KCJB 4LATA 1US5A 1YTVA 5F7VA 3H4ZA 3Q25A 4XKPA 3FATA 1EZPA 3RUMA 1MY4A 1UTHA 3TTNA 1QUKA 3RGYA 2ONKE 2HXWA 3EN3A 4OHNA 1B6HA 2XX9A 4F3PA 4PFUA 3PU5A 1LFGA 5AE4A 4IO3A 3O29A 4P11A 2VP1A 1N76A 4BDLA 4I8CA 3PUWE 4OMBA 3T9VA 3IK6B 5AA2B 1SDXA 4QRZA 4ZS9A 4R72A 2G29A 3K02A 4XKQA 1UIUA 4TQUQ 5FTHA 3ILUB 3EF7A 2R6GE 4GWOA 5K2XA 3L6HA 4RPOA 3H06B 4JB7A 1YPNA 4F39A 2Y7KA 4LQ5A 3TPAA 4F31B 1SD3A 1MQIA 5FHNA 5CBRA 1P1OA 1PBQA 3R7XA 2DSFA 1B52A 4R9FA 3RPWA 1NNKA 2UYEA 2ZYMA 4RY1A 5H8NA 4GRKA 4LZ7A 4H65A 1ZIUA 1N3WA 4EQ7A 5ICTA 2O1MA 3KJ7A 4RYAA 2F7CA 4YZZA 2H25A 1DPEA 2FYIA 4F1YA 3K1PA 5CMCA 4LZ8A 4YKKA 1FTLA 1L5TA 4DXCA 5H8HA 1TWYA 5CM6A 1N04A 2O69A 4ESWA 1Y1MA 3OD7A 1NMUA 4IGTA 3RN8A 4HCWA 1DSNA 1O64A 4AB6A 2IEEA 1FTMA 4XTCQ 4NMYA 4O3CA 5ITPA 3E4RA 3G3IA 4UA8A 4MLVA 3FZVA 4FIMA 4DZ1A 5I2NA 1XVYA 4FEDA 3VLWA 3THIA 2FA7A 2OCUA 1FTOA 4EXKA 2ZXTA 4C0RA 1OVBA 3V83A 2B3BA 3M3KA 3IB1A 2A5TB 3A09A 1Z7NE 1J1NA 4KYSA 2QRYA 3BFTA 3CFLA 2Y7RA 3OO9A 1MPBA 4EUOA 1M5CA 4OESA 4QHQA 2GH9A 1MPCA 2ONSA 2RC8A 3DM0A 2HZLA 1MS7A 1TT1A 2ANJA 2F35A 3PV0E 2ZYNA 1LSTA 3CVGA 1SI1A 5IKBA 1I6QA 1A55A 1LGBC 2V3TA 3LBSA 1P1UA 3UGWA 4ZE8A 1GVCA 5DVJA 4JWXA 1NNTA 4YB7A 3LSLA 2DXYA 1B40A 1LAHE 3PPNA 3HPIA 1B9JA 5AA3A 3IO4A 4PQJA 1ZMGA 5J1DA 3HHGA 3USDA 1MQHA 2XXXA 4YB6A 1QUIA 4WKMA 4FATA 3ZKLA 3LSWA 1BP5A 5KDTA 3N6UA 2ZNTA 3RTFB 1NH8A 3FGSA 2PT1A 3TTKA 2I58A 3KN3A 1N0TA 1JEVA 3VXCA 1UTBA 4ZEDA 3CI8A 4OWDA 1NFTA 5K2YA 4QFOA 1QVSA 5I2KA 3H6WA 4G4PA 1GR2A 4JSDA 1D9VA 3DP6A 1PEBA 2O7IA 3QK6A 4ELRA 3T9HB 5DT6A 3IOWA 3OSQA 4LUBA 1VE4A 3V5AA 3M8UA 2XXTA 4HTGA 1N7XA 1SYIA 2M8CA 3PUVE 4ZDMA 4OEVA 4H8IA 2RF1A 3ZSFA 3EHSA 1Y4TA 2WKYA 3FXUA 5KCJA 4H0WA 3TCHA 3PD9A 3VFJA 3QUJA 4NWCA 3C35A 2UVGA 1A54A 3MZ9A 5DVFA 3E13X 3QUFA 4EF1A 3FVGA 1URGA 3N94A 1JVXA 4JXIA 2H99A 5CBSA 2X26A 3P7IA 1A8FA 2Q8JA 1AIVA 2KLFA 4BDOA 2O1LA 3MVYA 1CE2A 2FNCA 4NF5A 1VR5A 4KI0E 4RXLA 5AA2A 3RLFE 2F6PA 2NOOA 5CRYA 1NL5A 4XKRA 3KOSA 3SERA 4BDRA 1MY0A 3KFMA 4FEBA 1H76A 1ELJA 4I9DA 4G68C 1AH5A 1GGGA 2Z8EA 5JEIA 3MVWA 2ZNUA 3K6UA 2ALUA 4JWOA 2BJJX 2V84A 2D3IA 2XXPA 3MP6A 1B58A 5TPAA 3SKPA 1YCJA 5I84A 4F1UA 2H98A 1H44A 3MPKA 4PFYA 3H7MA 2F36A 2E1SA 1EU8A 3U94A 1TXFA 1Q35A 3FJMA 4FAJA 3CSGA 2DWJA 4OFJA 1HSJA 3IJOB 1ATGA 5DTBA 1JETA 2HQ0A 2YLNA 4U4SA 2ESNA 2F97A 1MY2A 2OZZA 4ISUA 3G3JA 1VSOA 4NEDA 4L17A 1IEJA 4G8MA 4YB5A 1B3LA 4LP2B 3PUYE 3IORA 2RC7A 1WODA 1MPDA 3I5OA 4IB2A 3HV1A 3PPQA 4YMBA 3PPOA 2O6AA 4ZZAA 2I4CA 1P1QA 4ZEIA 3O6IA 2Y7IA 5H8FB 1OVTA 2AL5A 1YAEA 3TQLA 1GTKA 4Q5TA 4EQBA 3MAMA 1PBPA 3TKDA 1DOTA 1B5HA 4DDDA 3H6VA 5LOMA 2DWHA 3FD3A 4GF8A 3TODA 2B65A 1RYOA 1URSA 3K6WA 1P99A 5I56B 1B3FA 4X48A 2QS2A 3K1NA 1EZOA 5AA2D 1MXUA 4F18A 3TFLA 4GL8A 2RCAA 3U92A 4U23A 5I58B 5IAIA 1B7HA 3FVNA 1FCKA 1LCFA 1B1XA 1QJMA 3TTMA 4X1BA 2NXOA 4H67A 3O2AA 4EXLA 3IB0A 3PUXE 4ZECA 3MP8A 4OQOA 4OERA 5L8DA 3RY3A 4ESXA 1XOCA 5BUUA 2QS4A 3FIRA 2R71A 4ELQA 5CI5A 4ZE9A 4GD5A 3GBBA 4Q30B 4KR5A 3U1OA 3WAFA 4F22A 1N7WA 3W9WA 1ZTYA 4H8JA 4NTLA 1B3EA 3C31A 3S2VA 5AA4B 3LUYA 1GV8A 3H6TA 3TCFA 3KSXA 4U1ZA 3C32A 4OVJA 2YJPA 4JBZA 3FUZA 4DXUA 5M2VA 5CMBA 3MP1A 4LQ2A 3SEWA 4U21A 1IXCA 3M3LA 1IIWA 4DIGA 4Z0IA 3SETA 1DTZA 5EHMA 1MH4A 1MXVA 3IR1A 1JVYA 4QF9A 3TZAA 3KZGA 2H4IA 3ODBA 1ZJLA 1P1NA 3SESA 4ZEKA 2VHAA 3KOTA 3OO7A 1SBPA 3VLVA 5TP9A 2XX8A 1B4HA 2GHAA 2AL4A 4QSEA 4DXBA 1HSEA 2QSXA 2ABHA 3TTLA 1MH3A 3N26A 3WAEA 2Q89A 1S50A 4WEDA 3GBAA 4BDMA 2Q2AA 4RPNA 2UVIA 2DP8A 4TLLB 4GOTA 1FQEA 1FQBA 2H9BA 4E0XA 2UYFA 3E9XA 4LZ5A 2HZKA 4G68B 2F7AA 4N13A 3QXMA 3FXRA 4GLIA 2XD2A 1LBCA 2VD3A 1B0HA 2ONRA 3I3VA 4R6KA 1MRPA 5B70A 1ZKBA 4XKNA 1IZ1A 3TCGA 3K0VA 2GFEA 4IY6A 1QKAA 4F3BA 2Z8DA 2PT2A 1XS5A 3CFXA 1WVJA 3KSJA 1R1NA 4RNSA 4NF4B 1MG1A 5CMKA 3K4UA 3IX1A 4JSOA 5L9MA 1FQAA 5AA1A 4NF6A 3K2DA 1B1HA 1II5A 4OYVA 2Q88A 1JW1A 3OMBA 3MZ1A 5I57B 4I1DA 2OWSA 2CMOA 3KEIA 3B6TA 2QPQA 2RC9A 3TYHA 2E0SA 1MM7A 1MQDA 2XXQA 5DYHA 1EZ9A 1N3XA 1FQCA 3S9LC 4F2QA 3DP4A 3HCQA 4QFKA 1QULA 3R26A 1B32A 1PC3A 3TELA 3PUZE 3C9HA 1WDNA 4KD5A 1POTA 3EPEA 3MJNA 1H3DA 4THIA 4PFWA 3MZBA 3KN7A 2F7BA 1NKXA 1HSLA 4K3FA 4H6DA 3SEVA 3QYTA 3KBRA 2XHDA 5L9OA 3FJGA 4XIGQ 3BFUA 3FJ7A 4IO6A 1B7ZA 2ZYOA 2I0BA 5F1QA 4ND9A 4C1TA 3H3GA 1B3HA 1LAGE 4OENA 5I56A 3FVOA 4PETA 1FQFA 5FTIA 3FVKA 3H03A 3I6VA 2HEUA 1VFDA 3UP9A 3LSXA 2QL3A 3G3FA 4RK9A 2B3FA 2Y84A 3SDFA 2DS9A 2XXHA 3KN8A 5I58A 1UQWA 3O6GA 4NF8B 4H1XA 4RJZA 3PD8A 1ZBMA 2THIA 1LLSA 2RINA 4KCDA 4GVOA 4ELOA 3FV1A 5HBCA 1SW1A 4H5GA 3HO7A 1UIVA 4MBPA 4BDNA 4IO4A 1PB7A 2DVCA 3OO6A 2LAOA 3G3HA 1Y9UA 2DVZA 4KQPA 1JW5A 3FV2A 4AB5A 1MXWA 4TLMB 3HHFA 4R2BA 3Q26A 5AA4A 2O51A 3K01A 2PX1A 5TU0A 3T66A 1OLAA 1B4ZA 1PB9A 3K1MA 5DEXB 3TDJA 1LB8A 1I6AA 1R9LA 2D21A 4PP0A 2HCAA 2OWTA 2X7QA 2DE2A 2QS3A 2NVUB 3Q29A 4MLQA 2XXYA 3W15C 2XXWA 3O66A 4ZZEA 3KGCA 1MY3A 4BDQA 2AIXA 3MPLA 2QS1A 1FTJA 3T96B 1SI0A 4YMAA 3PMXA 1XC1A 1A7LA 4OXVA 1B46A 1B51A 1I6BA 3SEUA 4ONYA 2X7PA 4Q8RA 1Y3PA 4YAHX 4H5FA 2PBWA 4YKIA 4ZEBA 3CR9A 1JQFA 2O68A 3MVXA 3ZKKA 1SW5A 5EHSA 3MUQA 1S7YA 1F9BA 1USYH 2QJEA 3A3CA 4KYDA 4P0GA 1CB6A 2F5XA 1IXIA 4OFLA 1SVXB 1MM6A 4DLDA 3MC2A 3VLUA 5B7DA 2OLBA 4MFIA 3JYRA 4JDFA 2G93A 2OBGA 1R9QA 3F11A 1XT8A 5I2KB 4POXA 4GXSB 5BWJA 3O28A 3TUSA 3JZJA 4DCXA 2A5TA 3FXQA 3RNNA 5JTYB 1O7TA 4WEPA 4RK2A 2PYYA 3M3FA 3IL1B 3VE1B 1Y3QA 2IA4A 2Z8FA 4G68A 3O6HA 3TQWA 3PMWA 2OK2A 3TEPA 3DLNA 1B05A 2XX7A 3OEKA 4QFNA 2AYSA 1DPPA 1OQHA 4RA1A 3C36A 3HSTA 4OEUA 5DVIA 1R6ZA 2I0CA 3OENA 1TFDA 3TAJA 3C34A 4LA9A 3GZGA 5L9SA 2QMXA 4WXJA 1DMBA 4IY5A 1D4NA 1QKBA 4NF4A 1M5EA 2DWAA 3SEXA 4C1UA 3LC8A 5FHOA 3E3KA 5FHMA 3DP8A 4OETA 4DCYA 4IO2A 2QMWA 3QSLA 2CZLA 4F3SA 1PDAA 5CMMA 3LR1A 2XXIA 3A3UA 5I57A 4TOZA 4X1DA 4PFTA 3RQTA 4MH5A 4NF5B 1A40A 2XXVA 5JK4A 4YKJA 3VV5A 5ICQA 3EHUA 5A5XB 2YPNA 5H8SA 1N84A 2Z22A 4GIZA 3CRBA 1AMFA 1B7UA 4M1VA 3UK4A 2DE4A 1VFEA 1NNPA 4G8HA 2V3QA 4FORA 1D9YA 1OMPA 3VVDA 2F8DA 1Y1ZA 3U72A 3UORA 2I48A 3S9MC 1Y3NA 4HW8A 3V89B 2Z23A 1B0LA 5TPAB 4KFQA 3G3GA 4OZ9A 4N6PA 1B2HA 3MWBA 1EH3A 2PMSA 1JW4A 3Q27A 5I59B 1LFIA 4Z7EA 1MQJA 1T0KA 3S9EA 3VDFA 3C33A 3KG2A 4IO7A 3OOAA 4NF8A 4KYEA 3IB2A 4KCCA 2OJTA 4F2OA 5ISUA 3MVZA 5CC2A 1LB9A 1QW0A 3OSRA 1B5IA 2F78A 3QAXA 4Q0CA 1IXHA 3U93A 2V93A 1MDP1 4HS7A 2VD2A 2P0SA 5H8QB 5ELVA 2ZMBA 1SQYA 1BKAA 5KZTA 3O9PA 4R74A 3S4UA 3OO8A 4QSDA 3B6QA 4FJPA 3ILTB 4NE4A 2HAUA 2HFBA 3TMGA 1NH7A 1H43A 3VXBA 4N07A 5DEXA 2A5SA 2I49A 3MQ9A 1A99A 2P1SA 4M4GA 1Z7ME 1UTHB 3W9VA 4F29A 4MF3A 3BBRA 2R9JA 3OXNA 2UXAA 2O84X 1A8EA 4IGRA 1IITA 3T9XB 4GXAA 4ZEFA 4U22A 1OQGA 3UN6A 4KHZE 2VOZA 4DE8A 4U1OA 4GL0A 1FTKA 2UVHA 3RT8A 3V8XB 3T22A 3DELB 3KJTA 2XXUA 3IO6A 5ITOA 4O3BA 1IXGA 3CIJA 2PVUA 2DXRA 5HM4B 1Y4CA 2P2AA 2ZYKA 3PGFA 1M5DA 3N6TA 3HN0A 4U4XA 3UA8A 3B7DA 3PMVA 1FQDA 3CSBA 1Y20A 2RKMA 5H8FA 2DWIA 4GFRA 1Q1KA 2REJA 5JTYA 2DQVA 2O7UA 1LAFE 3PPPA 5H8NB 4AQ4A 4QFLA 1MXXA 1AL3A 2I3WA 2F6GA 1LAXA 3MBPA 1US4A 3G7WA 1LBBA 3S9NC 4JWYA 4UACA 3GLBA 1B5JA 2XXRA 3T93B 2RCBA 2V25A 3EQ1A 4NWDA 4G2ZA 4O3AA 4LVQA 4G77A 1OLCA 4R9GA 1S9TA 1IQ7A 1PB8A 4R6YA 2I6EA 5H8HB 2Q9TA 1SYHA 3BKIB 3RT6B 4KPTA 4EDPA 2Q2CA 5TP9B 4P0IA 3QIMA 3Q28A 3CG1A 5EYFA 1MDQA 2F34A 1FW0A 3FASA 1LFHA 4F1VA 3UIFA 5I2NB 4POWA 2UVJA 2DE3A 4YU0A 1ZU0A 4OTEA 3VVEA 4GQOA 3IAZA 1SW4A 1XVXA 4E0WA 2ZNSA 4F19A 1NNFA 2REGA 4I62A 3VVFA 5A5XA 1JEUA 3RTWB 3IOVA 1M5BA 4F3GA 2NWJA 3B6WA 3ZS6A 4ELPA 2DOJA 1P1WA 1H45A 1MXYA 4BLAA 2NUVA 1BIYA 3PPRA 2I4BA 1D3KA 4EQ9A 3K6VA 3C4MA 3TTRA 3LSFB 4PE5B 3ONMA 3L6GA 4OFOA 2Y7PA 1DTGA 1SW2A 3IJXB 4NF6B 3IOUA 3IOTA 3MW0A 2XD3A 3SEYA 1URDA 3K00A 4R2FA 1MY1A 4FECA 1MQGA 1I69A 1KWHA 3JV9A 4LONB 4IO5A 3EHTA 4G8NA 4EF2A 2DYXA 2H5YA 2W7YA 5KDTB 4XXUA 5I59A 4HCYA 3OELA 3AXFA 3CFZA 3T9UA 1RYXA 2HAVA 2VGQA 4QSCA 4YKPA 1AOVA 3CG3A 2I3VA 4R6HA 4FE8A 1UTBB 2GRVA 1IUDA 1XHYA 1ANFA 1B3GA 4ECFA 3ECRA 1RKMA 3G3KA 2D5WA 1POY1 1USYE 1O63A 2GHBA 1BTJA 1ZLQA 5H8QA 4R75A 4U2RA 3K6XA 5HPQA 4R73A 1M5FA 3R6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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