4U21A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form e
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A02
3SEYA 3L6HA 5I84A 3HO7A 4JWXA 1SD3A 5ITPA 3W9WA 4IO6A 3PUXE 3VV5A 2XXYA 3KZGA 5H8SA 4XXUA 5TPAA 3U1OA 3PPRA 4DE8A 2RC9A 4IO3A 2PT1A 3VDFA 4LZ5A 3TZAA 4OFOA 3TTKA 3C36A 4POWA 3UIFA 3K6XA 1QJMA 4QSCA 4GIZA 3KJTA 1ZMGA 4ZS9A 3K6UA 3H06B 1CE2A 2O84X 2DS9A 4F18A 3N94A 2H4IA 3V8XB 4E0WA 3UN6A 1HSEA 1ELJA 3M8UA 4F39A 5JEIA 5KZTA 1IEJA 3USDA 2O7IA 3CFZA 3OO6A 3KSXA 1NH7A 1MQJA 5I58A 3CVGA 4H65A 3RQTA 3G3JA 2O69A 5CMBA 2O51A 3G7WA 3LBSA 4O3BA 4YB5A 4HCYA 1Y9UA 2QL3A 2GFEA 1P1OA 4THIA 2O7UA 1JQFA 1LAHE 4PQJA 2QS2A 3ECRA 4UACA 2LAOA 2Y7WA 1QW0A 1A54A 3A09A 4YB6A 4YICA 4R74A 5CM6A 4N13A 4N07A 3PV0E 1D4NA 4EQ9A 1GR2A 1DPEA 1MY4A 3O2AA 3H3GA 3TYHA 2GHAA 3K02A 2HQ0A 3WAFA 1M5DA 2V3UA 3RTWB 1MQDA 3B6TA 2FA7A 4GLIA 4U2RA 1N76A 4R2BA 4YU0A 1LAFE 1LFGA 2X7QA 5LOMA 1LCFA 4Q30B 1BIYA 2UYEA 3TMGA 3VXBA 5H8FA 4C0RA 2DWHA 4MLQA 1FTLA 4M1VA 1P99A 1URSA 5I58B 1MY3A 1OLCA 3KN7A 2XXHA 3FXQA 4LVQA 3WAEA 4U1OA 4X1BA 4QFPA 4I1DA 3VXCA 3GBAA 5I2NA 2ZYNA 1MM7A 1PEBA 1NNKA 3TFLA 5J1DA 2ZYOA 4JSOA 3CG3A 1GTKA 1NNPA 3MP8A 4JB7A 3T22A 3U8QA 3LC8A 2Q2CA 3IB1A 1B4HA 3MZ9A 3E9XA 4PETA 2XXRA 4POXA 1P1NA 4IO2A 2Y7KA 3IOTA 1POTA 3PPOA 2XXXA 1NH8A 3K01A 1QKAA 3ILTB 1IIWA 1Y3NA 4NF4B 3IK6B 3FGSA 4NF6A 1XT8A 3OEKA 3M3FA 4F1VA 1O7TA 3ZKKA 5H8FB 2HEUA 1RKMA 4OHNA 1SI1A 3M3LA 1MH4A 2QJEA 1SW5A 5FTIA 1MXZA 4DLDA 1Z7NE 3K6WA 4YMBA 3IAZA 3DLNA 1VSOA 5L9OA 5I2NB 1Y20A 4F22A 2DQVA 3TTRA 2DVCA 3FJGA 1NNFA 5DVIA 3LSLA 1AIVA 3BKIB 4QSEA 1MS7A 4GRKA 5CMMA 1ZKBA 2IEEA 4G77A 4F2OA 3QAXA 1O64A 3RUMA 3H03A 4F31B 1I6QA 1LAXA 3VVDA 1B9JA 2I0BA 2GH9A 1A8EA 3LSXA 3CIJA 1XVXA 3MBPA 4UA8A 1MQGA 3N6UA 3TAJA 4P0IA 3VLWA 1HSLA 4Q5TA 3HPIA 5CI5A 3GXAA 3LR1A 3OO9A 2O6AA 2ONRA 3RNNA 4F3GA 1ZLQA 2UVIA 1FTKA 1MH3A 4ZEDA 2V25A 4EF2A 1B6HA 5DVFA 4PE5B 5CBSA 4I62A 4HCWA 2XXQA 5H8NA 4Z0IA 4BDMA 1VR5A 2OK2A 3CSBA 1B58A 1B5IA 5I57B 5H8QB 2DXYA 3S9LC 4XIGQ 2XX7A 1POY1 4PFTA 4ND9A 4RNSA 4KFQA 5AA4A 4H8JA 4QFKA 4YMAA 5HPQA 2PX1A 3VLUA 4EQ7A 1AMFA 1N3XA 3G3FA 3Q29A 1EH3A 2XXTA 4BDLA 2DE2A 2OCUA 4KR5A 4RXLA 3SETA 5CBRA 1P1WA 4K3FA 1N7XA 1R1NA 2HZKA 3MQ9A 1N84A 4TOZA 1RYOA 3MVXA 4R2FA 1JVXA 4H67A 1QVSA 3KN8A 5FHNA 1IXIA 4PP0A 3AXFA 2Q2AA 1GV8A 4E0XA 1TFDA 1LAGE 3MP6A 3VLVA 2B65A 3TKDA 4R72A 2RC8A 3PPQA 2QS1A 3O6GA 1JETA 2ABHA 2WKYA 3B6QA 4LQ5A 1PDAA 3G3HA 3A3UA 5AA4B 4JSDA 4ZEBA 1ZIUA 2Z8EA 3ODBA 2CMOA 1VE4A 3TCGA 1B0LA 3ZKLA 1JEVA 4NF5A 2XXIA 2F8DA 5FHMA 1II5A 3FVOA 2XD2A 5EHMA 4R75A 4KQPA 3O97A 3H4ZA 3PMVA 1H45A 1XS5A 4QRZA 4P0GA 5AE4A 1J1NA 3RT6B 3PD8A 1SBPA 1OVTA 4NE4A 3EQ1A 3RLFE 3CR9A 2ZNSA 5K2XA 2R6GE 4ZZAA 1A40A 1FW0A 4H6DA 3H6VA 4FIMA 4F2QA 2D5WA 4RA1A 2HFBA 3PUVE 1R9LA 3C31A 2DWJA 4WEPA 1B46A 3I6VA 2D3IA 1H43A 1US5A 2HXWA 3D4GA 2XXWA 3N26A 4IB2A 3TCHA 4ZDMA 3MAMA 4I8CA 1UTHB 4PFUA 3IX1A 3W9VA 3FJMA 3Q27A 5ISUA 4ZZEA 4NF5B 2QRYA 3KG2A 3RY3A 4AB6A 1LBCA 3N6TA 1LFHA 2DVZA 4OVJA 2OZZA 3TQLA 2O68A 4OXVA 3OEMA 4EUOA 2Y7RA 1EZOA 4QHQA 5L8DA 2GHBA 3QXMA 1SI0A 3TUSA 1M5EA 1ZTYA 4DCXA 1YTVA 2QMXA 2F6PA 2XHDA 2I4CA 3R6UA 3MVZA 1LB8A 1A99A 1FQCA 2XX9A 4NMYA 3O6IA 4BDNA 1NNTA 1B3GA 2AYSA 4QF9A 4FE8A 4ESXA 2QS3A 3FVNA 1FTOA 3HHGA 3PUZE 5AA2A 3LUYA 3K6VA 4U22A 4XKRA 3U72A 1JW1A 3VVFA 3CRBA 3OXNA 4G8NA 4KCDA 3MVWA 3TODA 3QYTA 1USYE 4NF4A 4R6KA 3HHFA 2F34A 2I3WA 4GXSB 2W7YA 2VD3A 4IY5A 2H98A 5TP9B 3MP1A 4LQ2A 1B3LA 3S4UA 2Q9TA 4YB7A 4KYEA 5H8HB 2F7BA 5DYHA 4TLLB 1A7LA 3MZBA 1AL3A 4WKMA 2PMSA 4GL0A 3SEWA 1IQ7A 5FHOA 3EHSA 2DWIA 3B6WA 1DOTA 1SW1A 4EXKA 1JEUA 4Q8RA 1US4A 4JWYA 1OIBA 5A5XA 5IAIA 1A8FA 1AH5A 2F7CA 2O1MA 4DXCA 3IR1A 4QSDA 2UVJA 5L9SA 3EHTA 1B1XA 2VP1A 2G29A 4F3SA 4XKNA 1B3FA 4LATA 1WDNA 5JTYA 3QSLA 2X26A 5AA2B 4YKPA 3L6GA 1B7UA 1H44A 1YAEA 1VFEA 1TWYA 2I58A 3JV9A 3QUFA 2REGA 3MJNA 2HAUA 3IB2A 3TTNA 1PC3A 1MY0A 1JW4A 3KN3A 3MPKA 3PPPA 4H0WA 3O29A 4G2ZA 3F11A 1I6BA 4FEBA 1SW4A 2ALUA 4RK9A 2XXVA 3CI8A 1FTMA 2Z8DA 3KEIA 4F3PA 3ZSFA 2D21A 1YCJA 4LA9A 4BDRA 2DYXA 3R26A 1LLSA 4LZ7A 3UP9A 2RCAA 1A55A 4RPNA 2UVGA 3K1NA 5A5XB 4C1TA 1ANFA 5I57A 5H8QA 1OQGA 2UXAA 3UORA 3PUWE 4GD5A 4IO4A 3FUZA 2F35A 1Q35A 2ZYKA 2HCAA 1FCKA 5JTYB 4FECA 4MF3A 2GRVA 4OERA 5EYFA 4KPTA 1USYH 3RT8A 3IOUA 4N6PA 3HV1A 5KCJA 1XC1A 5FTHA 1SVXB 1JW5A 3Q25A 1I6AA 1EU8A 4KYDA 1L5TA 2Y7PA 4EDPA 3FD3A 1MXXA 2I48A 1ATGA 4EXLA 1UQWA 1MXWA 3PGFA 4NTLA 3B7DA 4L17A 1I69A 1D9VA 4ESWA 2DOJA 1DTGA 3PU5A 1IXCA 5DVJA 4YAHX 3FZVA 5ICTA 5KDTA 1DPPA 3KJ7A 1MRPA 3E3KA 1FQAA 3K1MA 4DXUA 3OSRA 4KHZE 3PMWA 1Y1MA 1PBPA 4IGRA 3TTMA 4LZ8A 4FEDA 1QULA 2I49A 2VOZA 2XX8A 4XKPA 2UVHA 1SYHA 5CMCA 2THIA 3H6UA 2F7AA 4HW8A 3OO7A 2H9BA 5F1QA 2QMWA 3FJ7A 4BDOA 1OVBA 3QIMA 4YZZA 3MUQA 1UIUA 2IA4A 2O1LA 1FQBA 5I59B 4OETA 5KCJB 2RCBA 4Q0CA 3FVKA 3P7IA 2F36A 3FIRA 2NVUB 3QK6A 2UYFA 5M2VA 3OSQA 3G3GA 5AA3A 2V3QA 3CFLA 1URDA 3G3IA 2Q88A 3H6TA 3DP8A 3S9MC 3TTLA 2ANJA 1XOCA 4FJPA 1B7ZA 3HN0A 3KFMA 1B4ZA 3V83A 4X1DA 5KDTB 1TFAA 1IXGA 3JZJA 4KYSA 3BFTA 3T96B 2OJTA 2ZYMA 3SESA 4R9FA 2B3BA 3U94A 2A5SA 4GWOA 4OWDA 5AA2D 4IY6A 2XXPA 2OLBA 3TQWA 3K0VA 3A3CA 3SEXA 3TELA 3IO6A 4KD5A 3D4CA 3FXRA 5DT6A 3T9XB 1R6ZA 2VD2A 1UTHA 1KWHA 3OO8A 2V3TA 3OENA 2NUVA 1N7WA 2HAVA 2DP8A 3T9VA 2FNCA 4FATA 1SYIA 1LB9A 1F9BA 3SKPA 3MPLA 4OEUA 4ELOA 4DIGA 2B3FA 4F3BA 4EQBA 3I3VA 4ECFA 1T0KA 4GL8A 3QUJA 2Z8FA 4PFWA 1LCTA 2OWTA 2Y7IA 5L9MA 1M5BA 1QUJA 4YKJA 3C35A 1UIVA 5JK4A 3T9HB 4IO7A 1GGGA 3S9EA 2DE3A 5B7DA 2Q8JA 4JDFA 4O3AA 1MQIA 2X7PA 2V84A 2R9JA 4ZE8A 2RF1A 3SEVA 1TT1A 1FQEA 4XKQA 3V89B 1BLFA 3THIA 1LBBA 1Y3QA 1Y4CA 4OZ9A 3KSJA 5F7VA 4LP2B 4ZEKA 1LFIA 2KLFA 5DEXB 1FQDA 3RGYA 2PBWA 1NL5A 5ELVA 5I2KA 5BUUA 2RINA 4BDQA 4RJZA 3MZ1A 1Q1KA 4MLVA 1MXVA 1UTBA 2I0CA 1MPCA 1N0TA 1EZ9A 4GOTA 5TP9A 2QPQA 3MVYA 3FATA 2Z23A 5H8HA 1XVYA 4Z7EA 4ONYA 2RC7A 1IITA 1DTZA 2BJJX 5IKBA 4EF1A 5I56A 4AQ4A 2ZNTA 3UA8A 5BWJA 1D9YA 1NFTA 2DSFA 4WXJA 3C32A 3FV1A 3K00A 3BFUA 1H3DA 4G68C 2REJA 1DSNA 4PFYA 4AB5A 3T93B 5HBCA 3W15C 2PT2A 4F1YA 5TPAB 3SDFA 2P0SA 3Q26A 4WEDA 1MPBA 1ZBMA 3SEUA 1B1HA 4GVOA 3DP4A 1VFDA 3VVEA 3IORA 3O28A 4HS7A 4MBPA 5I2KB 1B5HA 4MH5A 1M5CA 5ICQA 1MM6A 4U4XA 1B51A 1O63A 3O6HA 1NMUA 4G68A 1B5JA 4MFIA 3VE1B 2ZMBA 2E0SA 1P1QA 4OTEA 1UTBB 2HZLA 4RPOA 3MWBA 5CC2A 2ZNUA 1FQFA 2F97A 4F1UA 4XTCQ 1B2HA 3EPEA 4R6YA 2F5XA 3EF7A 1B05A 2NXOA 2I4BA 4QFLA 2OBGA 2F6GA 1LGBC 3CSGA 1QKBA 2E1SA 4NWCA 5I56B 3PMXA 4RK2A 4DCYA 1B3EA 2VHAA 1Y4TA 1B40A 3C9HA 4GQOA 4OFJA 1MG1A 3C33A 2DWAA 1JVYA 2ESNA 3HSTA 3RN8A 3FASA 3Q28A 1QUIA 2H5YA 3M3KA 4H5FA 3K2DA 3IB0A 4C1UA 4ISUA 4G68B 2VGQA 4FAJA 4X48A 3TEPA 2OWSA 4LUBA 1QUKA 3ONMA 4FORA 4H1XA 4OYVA 1SQYA 3KOSA 4U4SA 5CMKA 3ZS6A 1PB7A 3DM0A 3DELB 1EZPA 2Q89A 3HCQA 3K4UA 1PB9A 5DTBA 4OESA 3CG1A 4DZ1A 1B52A 3EHUA 3JYRA 1Z7ME 4G8HA 4U1ZA 3TDJA 2QS4A 3MW0A 2A5TA 1MDP1 1YPNA 3TPAA 4BLAA 1URGA 3GZGA 2F78A 1BKAA 3FXUA 3O9PA 3IJOB 4ELPA 1CB6A 3I5OA 4HTGA 4DXBA 4DDDA 2AL4A 2ONKE 3E13X 3OELA 4TLMB 2Z22A 3H6WA 4U21A 1FTJA 1MQHA 1P1UA 5I59A 3G3KA 3KBRA 3U93A 5ITOA 3SERA 4F29A 3RPWA 4KCCA 4ZEIA 4RYAA 1Y3PA 4RY1A 3E4RA 1WVJA 3TCFA 2AL5A 2P2AA 2R71A 4NF6B 2P1SA 1Y1ZA 3T66A 4QFOA 1XHYA 3FVGA 1H76A 3IO4A 3PPNA 4GXAA 1AOVA 1SDXA 3OD7A 3T9UA 2YLNA 3MC2A 4G8MA 2NWJA 4YKKA 3V5AA 3O66A 3OMBA 3PUYE 4NF8A 2A5TB 5AA1A 4JWOA 1MDQA 2DXRA 4OMBA 2I3VA 4I9DA 4X9TA 2V93A 5B70A 1NKXA 1MPDA 3S2VA 3IOWA 1JNFA 2YPNA 3LSFB 4JXIA 4OEVA 4OQOA 4OENA 4OFLA 2H99A 4ZECA 3PD9A 2RKMA 1GVCA 5TU0A 3LSWA 3R7XA 1MXYA 3CFXA 4GFRA 1B7HA 1BP5A 1PB8A 2M8CA 1DMBA 1MY1A 1S50A 3RTFB 2AIXA 2NOOA 5HM4B 2H25A 2QSXA 1BTJA 1PBQA 1SW2A 1D3KA 1OMPA 3OOAA 4H5GA 2I6EA 5EHSA 3C4MA 2G93A 1OQHA 4LONB 4NWDA 4R9GA 3C34A 3EN3A 4ZE9A 4F19A 1B3HA 1MXUA 2YJPA 3IJXB 3DP6A 1M5FA 1R9QA 2PVUA 3KOTA 1TXFA 1LSTA 2ZXTA 3BBRA 4KI0E 1IZ1A 5K2YA 4ELQA 4IO5A 3FV2A 4P11A 2ONSA 4NF8B 1WODA 1IUDA 1N3WA 5DEXA 1IXHA 5H8NB 1ZU0A 1OLAA 3U92A 2DE4A 1RYXA 4M4GA 4TQUQ 3VFJA 4GF8A 1B0HA 4O3CA 2XD3A 1N04A 3GBBA 4ZEFA 1MY2A 3N5LA 2Y84A 4IGTA 3H7MA 3UGWA 3S9NC 4U23A 1S9TA 1S7YA 3ILUB 3IL1B 1B32A 4NEDA 1ZJLA 2FYIA 3K1PA 4QFNA 4H8IA 4R6HA 4YKIA 4R73A 4ELRA 3KGCA 2CZLA 3UK4A 3IOVA 4JBZA 3GLBA 2XXUA 4G4PA 1HSJA 2PYYA 5CRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SEYA 3L6HA 5I84A 3HO7A 4JWXA 1SD3A 5ITPA 3W9WA 4IO6A 3PUXE 3VV5A 2XXYA 3KZGA 5H8SA 4XXUA 5TPAA 4OVQA 3IFAA 3U1OA 3PPRA 4DE8A 2RC9A 2P3NA 4IO3A 2PT1A 3VDFA 4LZ5A 3TZAA 4OFOA 3TTKA 3C36A 4POWA 3UIFA 3K6XA 1QJMA 2Q8MA 4QSCA 4GIZA 3KJTA 1ZMGA 4ZS9A 3K6UA 3H06B 1CE2A 4I40A 2O84X 2DS9A 4F18A 3N94A 2H4IA 3V8XB 4E0WA 3UN6A 1HSEA 1D9QA 1ELJA 1FPFA 3M8UA 4F39A 5JEIA 4N8YA 5EQ8A 5KZTA 2CZKA 1IEJA 3USDA 2O7IA 2XXKA 4PAFA 3CFZA 3OO6A 3KSXA 1NH7A 1MQJA 5I58A 3CVGA 4H65A 3RQTA 2B4MA 3G3JA 2O69A 5CMBA 2O51A 3G7WA 3LBSA 4O3BA 4YB5A 4HCYA 1Y9UA 2QL3A 2GFEA 4MCOA 1P1OA 4THIA 2O7UA 1JQFA 1LAHE 4PQJA 4JVDA 2QS2A 3ECRA 4UACA 2LAOA 2Y7WA 5IZ3A 1QW0A 1A54A 3A09A 4YB6A 4YICA 4P9KA 4R74A 1LBVA 5CM6A 4N13A 4N07A 3PV0E 1D4NA 4EQ9A 4PF8A 1GR2A 1DPEA 1MY4A 3O2AA 3H3GA 4G61A 3TYHA 2GHAA 3K02A 2HQ0A 3WAFA 1M5DA 2V3UA 3RTWB 1MQDA 3B6TA 1Q9DA 3E79A 2FA7A 4GLIA 4U2RA 1N76A 4R2BA 4YU0A 1LAFE 4OVTA 1LFGA 2X7QA 5LOMA 1LCFA 4Q30B 1BIYA 2UYEA 1NV5A 3TMGA 3VXBA 5H8FA 4C0RA 2DWHA 4MLQA 4MHFA 1FTLA 4M1VA 1P99A 1URSA 2WBDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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