4U23A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form f
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u23A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u23A02
4DLDA 2GFEA 1CB6A 4OEUA 1EZ9A 3CG1A 4KD5A 3G3IA 3BBRA 3KZGA 1A54A 4NF8B 4OMBA 4F3PA 4U21A 2GHAA 5CMKA 1PBPA 2W7YA 4DCXA 1N84A 5ICTA 1QJMA 3RTFB 3PU5A 4F3GA 1O64A 4TLLB 3RQTA 1FW0A 3RLFE 5I84A 4XXUA 1MM7A 1S9TA 1MY4A 5B70A 2UYEA 4GLIA 4IO4A 1B32A 2B65A 3MP1A 1J1NA 2QPQA 3TMGA 1Y3NA 2LAOA 3FASA 1B0HA 4FEDA 2OLBA 3OSQA 2Y7RA 4FE8A 2GHBA 2UYFA 3TYHA 5L9MA 2DVCA 4O3BA 1B58A 1PB8A 4QHQA 3VVFA 3F11A 3K0VA 4H8IA 1ZKBA 2NXOA 2ZXTA 3FGSA 1KWHA 3Q28A 2VD2A 4G77A 3K1PA 5AA2A 4X48A 1P1QA 4GXSB 3O66A 3RN8A 1LAHE 1UQWA 2Q89A 2E0SA 4XKNA 5DEXB 2Y7PA 5AA1A 4OFOA 1LFIA 3FATA 1H76A 1N3WA 3DELB 2QJEA 2DE4A 3K1MA 3PPNA 2DWHA 1MY1A 4NMYA 1HSJA 3KSXA 3EQ1A 4BDOA 1T0KA 1I69A 1LLSA 1QUJA 4ZECA 4MLQA 3PPQA 1AH5A 3VFJA 2Y7IA 1P1OA 3JYRA 1LAXA 1JETA 5M2VA 1TFAA 2QSXA 3K6UA 2HEUA 3N94A 3OSRA 5H8FA 2XXYA 3IB2A 2QS3A 4L17A 1NNFA 3S4UA 3SEYA 1L5TA 4ELRA 3ODBA 4ZEIA 3IORA 1NFTA 3O6IA 2XX7A 1PB7A 4F1VA 1AIVA 4BDQA 2H4IA 3K4UA 3IR1A 4WEPA 5JK4A 4AB5A 3MQ9A 4OENA 1MY3A 2ZYKA 3T93B 1D3KA 2F34A 4GIZA 1H45A 2O7UA 1P1WA 1A99A 3I6VA 3IOUA 3IO6A 3R6UA 4U2RA 4ELQA 2OWSA 1P99A 2ZYOA 4RK2A 5AA2D 5K2YA 2REJA 1PDAA 1A55A 2XXIA 1TWYA 1A40A 2F36A 1F9BA 4FAJA 1XT8A 4NE4A 3H06B 2Q9TA 2Z22A 3MW0A 1S50A 4QFNA 3H6UA 1N76A 2ZNTA 1B3GA 2PYYA 3AXFA 4XIGQ 1JQFA 2Q88A 2PVUA 5LOMA 4I8CA 3LSLA 4N07A 4E0XA 1BP5A 1B9JA 1USYE 1Y3PA 3ILTB 4QFOA 4DIGA 1Q1KA 4YB7A 3MPLA 5CMBA 3IJXB 4HW8A 1FQFA 4K3FA 2Q2CA 1FQDA 2IA4A 1LFGA 2D5WA 3QK6A 4ISUA 2XD2A 1AL3A 2AL5A 1B3HA 3G3KA 2I58A 1LBBA 2OBGA 4IO3A 2R71A 3T9UA 2ALUA 5FTIA 3TTNA 4LZ5A 1N0TA 1Y1ZA 2H98A 2UVJA 3VLUA 2HZLA 1MM6A 5KDTB 1UTBB 1ZJLA 2I3VA 4MH5A 2G93A 3T66A 5I2KA 3KSJA 2CMOA 1PBQA 2VGQA 2Q2AA 3O6HA 1URSA 3MZ9A 2AL4A 2AYSA 4ELOA 3JZJA 3PUZE 3SEWA 1NH8A 3CVGA 1SW1A 3KN7A 1M5BA 4R73A 3N6UA 1NNKA 2HAVA 5FTHA 4G68B 2VP1A 2H9BA 2F8DA 4HCYA 3OOAA 4RPOA 2GRVA 2V3QA 2ZMBA 4YKKA 2ZNUA 4KYDA 1DMBA 1IEJA 1M5FA 2XX9A 2PX1A 1II5A 2M8CA 1B51A 3CIJA 3CSGA 3PPRA 4F1UA 4U1OA 1MPBA 1HSLA 2RCBA 1ZMGA 5CI5A 1NKXA 3SDFA 1B1HA 3HCQA 1MH3A 1QULA 4F39A 3KN3A 4Q30B 3TCGA 4F31B 4R2FA 3DLNA 3DP4A 3H6VA 1B3FA 2DVZA 3A09A 3KBRA 2VD3A 3UP9A 4YZZA 3RUMA 2XXXA 3I5OA 3B6TA 4O3CA 3M3KA 4R74A 4X9TA 4ECFA 4M1VA 4PP0A 3OEKA 3IB1A 1XHYA 1VE4A 3K00A 4PFYA 4IGTA 2PBWA 3LSWA 3CSBA 4M4GA 1URGA 4GRKA 3QXMA 2DWJA 4P0IA 3MPKA 4LATA 5H8HB 1MH4A 3C4MA 1H43A 4OESA 4JB7A 3ZKKA 2F35A 3FJ7A 3KG2A 1SQYA 3UA8A 3FXQA 3T9VA 1LSTA 5DEXA 3TTKA 5L9OA 3FV2A 3TQWA 1XOCA 3FJGA 4YMAA 4AB6A 4ZEDA 2FYIA 2I0CA 1OMPA 4FORA 3TAJA 1DOTA 2DOJA 1JVXA 1AOVA 1OLAA 2DSFA 5JTYA 1Y20A 3R26A 4NF5B 4P11A 1FTLA 3U94A 4LONB 4TOZA 3KJTA 1URDA 1P1NA 3TTLA 3QAXA 4TLMB 2I4CA 3EHUA 1UTHA 1YTVA 3BFUA 4H0WA 3M3FA 1Z7NE 3V5AA 4UACA 3EN3A 1WODA 3SESA 1A8FA 4YAHX 4YKJA 3OMBA 1NNPA 3VXCA 3FVNA 4QSDA 4F3SA 2F97A 4H5GA 1UIVA 3QIMA 2B3BA 1NH7A 1MPCA 4GWOA 3PMXA 1B4ZA 3SEVA 3SKPA 2YLNA 3V83A 3W9VA 3P7IA 3EHSA 2RKMA 1SW5A 2XHDA 3U8QA 4POXA 3K01A 4KI0E 3S9NC 1IXHA 1R9LA 4KR5A 4U22A 1EZPA 1R9QA 4GQOA 1GV8A 1GR2A 1D9VA 3RNNA 3O29A 5TPAB 2CZLA 3KOTA 3FVGA 5H8QA 3SERA 2X7QA 3DP6A 1MDP1 1JW4A 2O7IA 1N7WA 2ABHA 1IITA 3OD7A 3ZS6A 5HPQA 1LB8A 3HSTA 1N04A 3KGCA 1POY1 2DWIA 4IGRA 3RTWB 2XXVA 2DYXA 2E1SA 1OVTA 1DSNA 3MZBA 1UIUA 2G29A 3OELA 4RY1A 3SEUA 5CRYA 1MXYA 3WAFA 2RF1A 1AMFA 1FTKA 1QKAA 4WXJA 2OJTA 2DE2A 3PPPA 3G3FA 3O97A 1TFDA 3H7MA 5JTYB 1MG1A 4EQBA 4E0WA 1OIBA 3E4RA 3ONMA 3UN6A 3GBAA 3C31A 5DTBA 4FATA 1BKAA 1MY0A 1XVXA 2RCAA 5CMCA 2ONRA 1UTHB 2UVGA 5TP9B 2HFBA 3E13X 4IO7A 2P2AA 4GF8A 2O69A 4MLVA 3V89B 2DS9A 1ZBMA 4PETA 2YPNA 3MVZA 4I62A 4THIA 5KDTA 4HS7A 2OCUA 1UTBA 4DXCA 5AA3A 5BUUA 3G7WA 2DWAA 1QUIA 3GZGA 3CFXA 4G68C 2OK2A 2ZYMA 2WKYA 3PUXE 2XXPA 2D21A 4RNSA 4G68A 1Y4TA 4DCYA 2F7CA 1LBCA 5CMMA 3JV9A 3PUYE 1FQEA 1LB9A 2THIA 1TT1A 1FQBA 5H8QB 4F1YA 1B0LA 2O51A 3PUVE 3IL1B 4LP2B 4ZDMA 4KHZE 2UXAA 3GBBA 1O7TA 1EZOA 3TUSA 5EHMA 4QSEA 5I56B 4DZ1A 4IO6A 3OO9A 2Z23A 3TELA 1B5IA 3GXAA 4G8NA 4GL8A 4I9DA 1US4A 4RXLA 5JEIA 2V93A 4C1UA 3IAZA 2P0SA 4GFRA 1Y1MA 3C35A 3EPEA 4FJPA 4R6HA 2V84A 3TDJA 2HQ0A 4EUOA 4EQ7A 1FTMA 1DTZA 2ONKE 5CC2A 4IY5A 3UGWA 1JEUA 1LAFE 4OERA 4OXVA 1SD3A 1D9YA 2PT1A 2B3FA 1ZIUA 3U93A 4QF9A 4H8JA 3O2AA 2V3TA 1FTJA 1MDQA 5F7VA 4FECA 2QMWA 2H5YA 3K6VA 4EXLA 5KCJB 3T96B 4X1BA 3T22A 2QS1A 2ONSA 2ESNA 1DPPA 1Y9UA 1ATGA 3LSFB 4FIMA 4F2QA 5H8HA 1I6QA 5I57B 1B7ZA 4LA9A 3W9WA 1VFDA 2RC9A 3M3LA 4ZZEA 1ZU0A 1MXXA 3C32A 3N5LA 2X26A 3VXBA 4EQ9A 1ZTYA 1JVYA 2IEEA 2RINA 3ZKLA 5H8SA 3N26A 3C34A 1B7UA 4MBPA 4ZS9A 4NEDA 3OO7A 4OWDA 3V8XB 4NF5A 2H99A 3MVWA 2I48A 3KN8A 4LUBA 1OLCA 3DM0A 1SVXB 4GOTA 3UIFA 2Y84A 3C9HA 4Q0CA 1MQDA 2A5SA 3H6WA 1H44A 3C33A 2QS2A 1IQ7A 4KYEA 4NTLA 3N6TA 4JBZA 4EF1A 3W15C 4R6YA 3KOSA 2O68A 1MQGA 5J1DA 3VV5A 5CM6A 2I6EA 4GXAA 1TXFA 1OQGA 3MZ1A 4LQ5A 3R7XA 4OYVA 4MF3A 4R72A 3D4GA 3M8UA 1SW2A 4LVQA 3ECRA 3IOWA 3CI8A 4Q5TA 4LZ8A 4IO5A 1B2HA 2DQVA 1FTOA 4EF2A 2F78A 3ILUB 1GVCA 5BWJA 4HTGA 4BDMA 2V3UA 4G8MA 4JWOA 3G3JA 4F22A 1H3DA 5TPAA 3MP8A 5DYHA 4O3AA 5AA4B 1I6BA 3A3CA 1I6AA 5AE4A 5DT6A 3FZVA 4JWYA 4U23A 3CR9A 2XXTA 3PD8A 4OFLA 3UK4A 4YU0A 2Y7KA 2PMSA 3LR1A 2A5TB 4JWXA 4OZ9A 4QSCA 3OENA 1MQJA 5I59B 4RA1A 3OO6A 4P0GA 5CBRA 3PMVA 3S9MC 4LQ2A 3IOTA 1DTGA 2PT2A 4BDRA 4JSOA 5I2NB 4R75A 1YCJA 3T9HB 4XKPA 4H5FA 2V25A 1VR5A 3C36A 3MAMA 3KJ7A 4F18A 1B1XA 1POTA 3MVYA 3O6GA 2ZNSA 2FA7A 1SBPA 4FEBA 1LAGE 3S9LC 4YB5A 1A7LA 4ZE9A 5TP9A 1IXIA 4OETA 3HV1A 1YPNA 2H25A 1IUDA 3TQLA 4G2ZA 2I0BA 2RC8A 1JNFA 3GLBA 1HSEA 3K6XA 3O28A 4DE8A 4F2OA 1DPEA 1M5DA 4YKPA 1NL5A 3TEPA 1B7HA 3RT8A 4YB6A 4U1ZA 3K02A 4ELPA 3USDA 3B6WA 4QRZA 4PQJA 4OEVA 4C1TA 3LBSA 1OQHA 5B7DA 2Z8EA 3TTRA 1SI1A 3QUJA 2XXHA 4N6PA 1PC3A 3FVOA 3HHFA 2XXRA 4R9FA 5IAIA 4F3BA 1RYOA 1IXCA 3ZSFA 1LGBC 2I49A 4YICA 4XKQA 3OO8A 3H03A 3U72A 4ONYA 1MXZA 5FHOA 1MXUA 3HPIA 3TZAA 3WAEA 4G4PA 3HN0A 2DP8A 1B05A 1MXWA 5FHNA 3CFZA 1B52A 3HO7A 4DXUA 1M5CA 4KYSA 5A5XB 4I1DA 3S9EA 5ELVA 5I56A 3IOVA 3UORA 1S7YA 2ZYNA 3S2VA 4H65A 1WVJA 1SYHA 4R9GA 2DE3A 1FQAA 1XC1A 4C0RA 4ESWA 4BLAA 3EHTA 3IO4A 5L8DA 2KLFA 5CBSA 2I3WA 1B4HA 4Z7EA 2AIXA 3TTMA 2XD3A 3L6HA 3FV1A 1GGGA 5I58B 2HXWA 4U4XA 4UA8A 3D4CA 1SW4A 3I3VA 5IKBA 4MFIA 1B40A 2I4BA 3BKIB 5KCJA 2NOOA 5K2XA 4N13A 1R6ZA 1LCTA 4R2BA 4OVJA 3LC8A 1SYIA 2Z8DA 4ZEFA 4POWA 1B5HA 5I57A 4NF6A 1LCFA 4KFQA 1QUKA 3KEIA 3PD9A 4XTCQ 5HBCA 5HM4B 2HCAA 1WDNA 3TCFA 2GH9A 2D3IA 2O1LA 4H6DA 4EXKA 4WKMA 4ND9A 1PEBA 3CRBA 5H8NA 4NWDA 3TPAA 3O9PA 3Q25A 3VVDA 5EYFA 3FD3A 2F6GA 5F1QA 4RJZA 3E3KA 4KCCA 2XXWA 2RC7A 4ZEKA 5FHMA 4DXBA 3H3GA 1RKMA 1MQHA 3QYTA 1VFEA 4HCWA 3MVXA 1Z7ME 3RT6B 1VSOA 2ANJA 1B3EA 1P1UA 4YMBA 3QUFA 1JEVA 1EU8A 3MP6A 5DVIA 1FCKA 2DXYA 1US5A 4NF4A 4PE5B 1YAEA 2O6AA 1MXVA 1LFHA 3PGFA 4QFPA 3MC2A 4EDPA 4BDLA 2F7AA 1FQCA 1Y3QA 2YJPA 1SDXA 1B6HA 3PPOA 5ITOA 4G8HA 3U92A 4X1DA 2QMXA 1OVBA 1ANFA 1QW0A 4XKRA 2R6GE 3K6WA 4YKIA 3G3HA 5AA2B 4ZZAA 4PFUA 2NUVA 1B3LA 3E9XA 3MBPA 4QFKA 3VLWA 5DVFA 4NWCA 3MWBA 4OFJA 2VOZA 1IZ1A 1USYH 1QVSA 2FNCA 3VLVA 2OWTA 2QS4A 2BJJX 3IB0A 5AA4A 3CG3A 4RPNA 2F6PA 5KZTA 2X7PA 4NF6B 4H1XA 3TKDA 5ICQA 3MUQA 3KFMA 3Q27A 1NMUA 4F19A 3H4ZA 4PFWA 3THIA 3Q29A 4ZE8A 3EF7A 3FUZA 2A5TA 3OXNA 1N3XA 1MQIA 5H8FB 1A8EA 5H8NB 5I59A 2Z8FA 1XS5A 4JXIA 1ELJA 2UVIA 1MY2A 1IIWA 3VE1B 1GTKA 5I2NA 2XX8A 3IK6B 3RGYA 1D4NA 1RYXA 1N7XA 1Y4CA 4GD5A 1PB9A 3FIRA 1O63A 4F29A 1R1NA 3B7DA 4IY6A 3FVKA 4TQUQ 4KPTA 3BFTA 3RPWA 4LZ7A 3OEMA 4KQPA 3H6TA 3HHGA 2O1MA 1NNTA 3DP8A 2Y7WA 2OZZA 1ZLQA 2QL3A 4NF4B 3LUYA 4QFLA 5L9SA 2HAUA 2F5XA 4NF8A 1B5JA 5TU0A 4AQ4A 1BLFA 2NWJA 3VVEA 1CE2A 1BTJA 3Q26A 4U4SA 1QKBA 4ESXA 4Q8RA 1JW5A 2QRYA 3CFLA 3IJOB 4WEDA 3K2DA 3FXUA 3K1NA 1B46A 1XVYA 3SETA 2DXRA 3TODA 4ZEBA 3L6GA 2REGA 1MPDA 2HZKA 3QSLA 4R6KA 3PMWA 4JSDA 3B6QA 2F7BA 4H67A 5ISUA 2XXUA 3PV0E 3IX1A 1EH3A 2Q8JA 5A5XA 4IO2A 2O84X 2P1SA 2NVUB 1MS7A 3TFLA 4Z0IA 5ITPA 2VHAA 4OHNA 5DVJA 2UVHA 3FXRA 4RYAA 3LSXA 3T9XB 3A3UA 5EHSA 4DDDA 4IB2A 3G3GA 1MRPA 4GL0A 2R9JA 2XXQA 4KCDA 3VDFA 4OQOA 4GVOA 5I2KB 3U1OA 1Q35A 3RY3A 3TCHA 3SEXA 5I58A 3FJMA 4JDFA 1BIYA 3PUWE 4RK9A 4OTEA 1JW1A 1IXGA 3MJNA 1SI0A 1M5EA 4BDNA 4PFTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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