4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
4DCXA 3MW0A 3Q29A 4OWDA 1JW4A 3CG3A 1ZBMA 3IO6A 2Q89A 2XD3A 3W9VA 4DXUA 1SVXB 3TTNA 2H5YA 2XD2A 5I2NB 4IO2A 1YAEA 2AIXA 5H8HA 5ICQA 2V84A 1LAHE 3ZKKA 1QW0A 3FV2A 2IEEA 3PUYE 5JEIA 4ESXA 4I1DA 1MDQA 4QFOA 2PX1A 3U94A 2ABHA 4YU0A 4NMYA 1EZOA 3GBAA 3ODBA 2F7AA 1LAXA 3TCFA 3H6TA 4F1UA 4XKRA 3MQ9A 3K6XA 3R26A 2DVZA 1NKXA 3B6TA 1MXYA 1Z7NE 4KYDA 2F6PA 4HW8A 4F31B 3OEMA 4C0RA 1I69A 1IZ1A 1D9VA 2F34A 3HCQA 2I48A 4JXIA 4BDRA 4F3PA 1B5HA 5I84A 1WODA 4BDQA 1FTMA 3VV5A 5TPAA 3IL1B 1IEJA 1IXCA 2RF1A 1MXVA 2DP8A 1SI0A 3IX1A 3TEPA 1JW1A 2HEUA 4OEVA 4JB7A 5I59A 1Y1MA 2PYYA 4G4PA 3FVNA 1VFDA 1LGBC 3MVXA 4BDOA 4ZEBA 3T22A 4OYVA 1I6BA 2O7IA 5H8FB 3Q28A 4KPTA 4QSEA 4PQJA 3G3IA 1DTGA 1ZIUA 1NMUA 2ZYMA 4NF5A 1YPNA 4IO6A 1A40A 3TMGA 5HBCA 1UQWA 2Y84A 1SW2A 3ILUB 5H8SA 4U22A 3FXQA 3OO6A 2GFEA 3FJGA 4C1TA 4DXBA 2V3QA 1IIWA 2VD3A 5A5XB 4WXJA 1TFAA 3EQ1A 4GD5A 1HSLA 1EU8A 2XXUA 1QUKA 3P7IA 4XIGQ 3PD9A 1XVXA 4YB7A 1OQGA 1A55A 3K1PA 5I58B 4GVOA 2GRVA 3SERA 3MP1A 2DE4A 4ELOA 1B1XA 5H8QA 1A8FA 3KN7A 3OSRA 1UIVA 1US5A 1Y4TA 3U72A 2ZNSA 3C34A 3HHGA 1DPPA 3H7MA 1SDXA 4LZ5A 5AA4B 1N04A 1FTJA 2O6AA 2O69A 3M3LA 5I57B 3THIA 1LBCA 5BUUA 4H1XA 3TPAA 3KJTA 3PMXA 3MAMA 4ZEDA 3S4UA 3IB2A 3KJ7A 5FTHA 2I3WA 2ONSA 3D4CA 2H99A 4FORA 3VXCA 3EHUA 1OLCA 5KCJB 1LB8A 2F36A 3RQTA 4KI0E 5I2KB 1EZPA 2F6GA 2YPNA 3VFJA 3K6UA 3KOTA 2QPQA 3RY3A 4YKPA 5I56A 1MQIA 3M8UA 3PD8A 1Z7ME 1M5EA 3OSQA 5CMCA 3PMVA 2I3VA 4L17A 3HSTA 3Q27A 4ZZAA 1B7HA 3PU5A 3LSLA 1OMPA 4NWCA 2QS2A 1XHYA 2QSXA 3TELA 2HAVA 1PB9A 2YJPA 2OWTA 3K02A 3K0VA 5FTIA 3TQWA 1IQ7A 4TQUQ 2B3BA 4OFOA 2UVJA 1ZMGA 3U8QA 2PVUA 4MF3A 4RK2A 3V83A 2Y7KA 4ZDMA 1Q1KA 5B7DA 2R71A 1UIUA 3W15C 3KZGA 5DVJA 4GF8A 2X26A 2QMWA 4NF8B 5FHMA 2H25A 4EQ7A 2GHBA 5IAIA 2NOOA 4U1OA 1N76A 3LSFB 4AQ4A 1MS7A 2UVGA 3CRBA 1FQFA 3JZJA 4U4XA 1B9JA 2H98A 2XX8A 1QUIA 2NWJA 1MRPA 2AYSA 2ZMBA 3USDA 1FTOA 1ATGA 3OO7A 1MPBA 3N94A 4OEUA 2H9BA 1PB8A 2ZNTA 2Q9TA 1M5FA 3KOSA 4JSDA 2O51A 2Z8FA 4GLIA 5ITPA 3ONMA 3FUZA 3SEYA 1L5TA 2RKMA 1M5CA 1HSEA 3DELB 1PDAA 3N6TA 4XTCQ 1POY1 1B05A 4BDMA 2D5WA 2XXYA 4OQOA 5H8NB 5LOMA 4RPOA 3IOTA 4H6DA 3QAXA 4DLDA 2Z23A 3PGFA 2Y7WA 2DYXA 4F19A 1RYXA 1PB7A 1B4ZA 3OMBA 1B40A 4HS7A 1B3GA 2O68A 3IOVA 4K3FA 2A5TB 1RYOA 1JVXA 3CIJA 4F18A 3K4UA 3PPOA 4O3BA 4QFKA 1Q35A 3VVFA 3LUYA 4RY1A 1USYH 2THIA 1II5A 4ECFA 1POTA 5AA2B 1Y1ZA 1LFHA 3H6UA 1B7UA 3BFTA 2F35A 2V25A 2B65A 2NXOA 1CE2A 3HV1A 3O6IA 4X9TA 2A5SA 5L8DA 1TFDA 3HHFA 4NF4B 4YKIA 4ELRA 4G77A 2WKYA 3QK6A 2IA4A 3K1NA 4G68C 2XXVA 5JTYB 4N13A 1MY0A 1B2HA 4IGTA 2ZYKA 2XXWA 3RLFE 3FJ7A 1FTLA 1PC3A 5CMKA 3KBRA 3LBSA 3H03A 4ZE9A 1Y3NA 1B0LA 2B3FA 3O28A 3ZKLA 3G3GA 3L6HA 3MP8A 2DE3A 4YB5A 3SKPA 1I6QA 3RTFB 4KFQA 5CBRA 4F1VA 4G68B 4FE8A 1VR5A 3PPPA 4GXAA 1TXFA 2DXYA 3GZGA 1FQCA 2HQ0A 4YICA 2DXRA 2PMSA 5ICTA 3VDFA 1LCTA 1SW1A 4F39A 3FZVA 1D3KA 4U1ZA 1UTHA 4DCYA 4F3BA 3QUJA 4GXSB 5DVIA 1H44A 3IO4A 3KEIA 3HO7A 3S9LC 2V3TA 1BLFA 5TP9A 2QRYA 1GVCA 2G29A 3Q25A 1AOVA 3T66A 3Q26A 1P1UA 3IB0A 4O3AA 4RA1A 1BIYA 3CI8A 2XXXA 3RPWA 5KDTB 2Q8JA 2X7PA 1ZLQA 1OVTA 2DWIA 3OEKA 3FD3A 3TUSA 4E0XA 1B3HA 3BFUA 3K2DA 4G8MA 3AXFA 4F22A 3CSGA 2PBWA 3E3KA 3TZAA 4U2RA 1EH3A 5H8FA 4DDDA 4QHQA 2GHAA 3C33A 1JW5A 1SW4A 3IAZA 3I3VA 3CFXA 4G2ZA 1LFIA 3OO8A 1MH4A 1BP5A 4JWYA 4KYEA 4YZZA 4R75A 5F1QA 2VGQA 4NEDA 1XS5A 4R2BA 4IGRA 5I59B 1AH5A 1RKMA 4RXLA 1FQBA 5CC2A 2Z8EA 3R6UA 2LAOA 1IUDA 3EHSA 5HPQA 2UVIA 2HAUA 4YKKA 3UIFA 1GR2A 3PPQA 3O9PA 3UN6A 1IXGA 5L9SA 3C36A 3R7XA 4NF5B 4OTEA 2XXHA 3RGYA 2QL3A 5I58A 2AL5A 3K01A 4IO4A 3LSWA 1P1QA 5EHMA 3M3KA 1Y4CA 1YCJA 4PP0A 4EUOA 2KLFA 4PE5B 3MWBA 3VVEA 2FYIA 3F11A 3TTRA 3S9EA 2HCAA 4EXLA 1Y3QA 4JWOA 2HZLA 2UVHA 4M4GA 1I6AA 2NUVA 2QS1A 2NVUB 3CG1A 3TKDA 2O1MA 3MZ1A 1Y20A 3T9VA 3TTMA 3K6WA 3TCHA 3N6UA 4HTGA 5KZTA 1OVBA 2PT1A 4R9GA 5H8QB 4DXCA 4Z7EA 4Q8RA 1O64A 3PPRA 1LFGA 1DSNA 1B58A 4I9DA 2I0BA 3IR1A 5AA3A 4GIZA 4EQBA 1T0KA 3IORA 2E0SA 1QULA 4LATA 4H0WA 3BKIB 4YB6A 2Y7IA 3GXAA 2XXQA 4P0IA 1MY4A 3VLWA 4OHNA 5DEXB 4E0WA 4F2QA 1AMFA 2DE2A 3DP6A 3WAEA 3RTWB 1GTKA 2DOJA 1N3WA 4FIMA 1B51A 4KYSA 3KN3A 3VXBA 1UTBA 2P2AA 2PT2A 3C35A 1ANFA 2REJA 2DWAA 3L6GA 4LP2B 2UYFA 4XKPA 3IJXB 5JK4A 3MPKA 1SW5A 1D9YA 3MVWA 4BDLA 4R6KA 2ZYNA 1R6ZA 1B7ZA 4EF1A 3O97A 3DP8A 3O29A 3KN8A 2DSFA 1FQEA 1VE4A 3H3GA 4H8IA 3H6WA 3G3FA 3K00A 3PUZE 2QMXA 1YTVA 1PEBA 3RT6B 2QS4A 1AL3A 1P1OA 4RK9A 4NF6B 4FEDA 4GFRA 1F9BA 1VSOA 1SYIA 2V93A 4IO5A 3WAFA 4JBZA 4G8NA 4LONB 1S7YA 4YMAA 4AB5A 5CBSA 1B52A 4DZ1A 4FJPA 1KWHA 4LUBA 4U23A 3MC2A 5TU0A 4DE8A 4QSCA 4GOTA 1MXWA 2UYEA 4KCDA 3RUMA 2ONKE 3KGCA 2DWHA 5J1DA 3TCGA 1NH7A 1JEUA 4LVQA 5IKBA 3IK6B 2ANJA 3T9XB 3U1OA 4JSOA 3V8XB 2Q2AA 2DVCA 2RC8A 4GL8A 2Y7PA 3DLNA 4Z0IA 3EF7A 2FA7A 2YLNA 3B7DA 1JVYA 4GL0A 3DM0A 3SEVA 3VLUA 2XX9A 2O1LA 4WEPA 1PBPA 3IOWA 4RPNA 3S2VA 3TFLA 4EDPA 3T9UA 1J1NA 3MUQA 4BLAA 3EN3A 1JQFA 1S9TA 3KSJA 5L9MA 2DQVA 2ONRA 1JEVA 3TDJA 5ELVA 2RCAA 4Q30B 1LB9A 2F97A 3IOUA 4R6YA 4TLLB 5DT6A 4JDFA 1FTKA 2D21A 3SDFA 3C9HA 4F1YA 4ONYA 1A99A 1N7XA 1NNFA 5JTYA 3O2AA 3I5OA 4ZEIA 2F5XA 2V3UA 4UACA 4ELQA 1LSTA 2VOZA 3IJOB 2F7BA 3TTKA 1M5DA 4LA9A 4LQ5A 3W9WA 4F3GA 1H45A 3KFMA 1MY3A 1Y9UA 1XOCA 4OXVA 3FV1A 1US4A 1JNFA 2RINA 4POXA 5CM6A 5I2NA 3H6VA 4ZECA 2DWJA 4OESA 2G93A 3ZS6A 3A3UA 1URGA 1B6HA 1SYHA 4YAHX 2OLBA 3FVGA 1MXXA 3OXNA 1QVSA 4H5GA 3PUXE 3HN0A 1MXZA 3LSXA 3OD7A 1SBPA 2R6GE 4R9FA 3CVGA 3FGSA 4ZZEA 4GWOA 4IB2A 4UA8A 3FASA 1WDNA 1MQHA 4XKQA 5FHOA 5H8HB 1MDP1 1BKAA 3QUFA 4MLVA 3UORA 1B5JA 3EPEA 4MH5A 4F29A 1GV8A 2Z8DA 4ISUA 3VVDA 1DMBA 4ND9A 2CMOA 4OETA 2Z22A 1NNKA 1D4NA 3S9NC 5KDTA 4NTLA 1P1WA 1MQJA 1UTHB 1ELJA 1R9QA 2F8DA 4XKNA 1DPEA 1N7WA 4PFUA 1OQHA 1FQDA 2XXTA 3O66A 1MG1A 1N0TA 3JYRA 5TP9B 3CR9A 2I58A 5DYHA 3MVYA 4NE4A 4R74A 5CRYA 4C1UA 1IXIA 1MM7A 1NL5A 3G3JA 4OVJA 1A8EA 3LR1A 5CMBA 3OOAA 4Q0CA 4XXUA 2P0SA 1MY1A 1NNTA 2H4IA 5TPAB 2R9JA 1M5BA 4OFLA 4JWXA 4YKJA 3T9HB 3H4ZA 5K2YA 3FIRA 3E4RA 4ESWA 2XXRA 3FATA 1B32A 1SI1A 2Y7RA 1H3DA 3FXUA 3G3HA 4O3CA 2I4CA 4I8CA 5A5XA 3PPNA 3OENA 4ZE8A 1MPCA 2XX7A 3B6WA 1NH8A 1H43A 2XXPA 4OENA 3V5AA 4AB6A 3ECRA 4GQOA 4R2FA 2ALUA 2HXWA 1DOTA 4FECA 5K2XA 1GGGA 1A54A 3RT8A 1A7LA 2ESNA 4ZEKA 4HCYA 3ILTB 4OZ9A 2RC9A 3I6VA 3SESA 4R6HA 3EHTA 1N84A 2FNCA 4IO3A 4OFJA 3C31A 1WVJA 2I6EA 1LAFE 4N07A 2OK2A 3SETA 3OO9A 1B4HA 4KHZE 4GRKA 2Q88A 1B3EA 2O7UA 2ZYOA 2DS9A 1P1NA 5AA4A 5AA1A 3PMWA 5I57A 3FVKA 1MM6A 4R73A 2F78A 3C32A 1B3FA 3VLVA 1MQDA 4X1BA 2GH9A 2X7QA 2BJJX 1B5IA 1N3XA 2OBGA 3CFZA 1R9LA 1FCKA 4P0GA 5KCJA 3TYHA 1R1NA 3UGWA 3MPLA 3MVZA 3FJMA 5DTBA 3PUVE 5I2KA 4EQ9A 3MBPA 3FVOA 4QFLA 3D4GA 4G8HA 4THIA 3CSBA 1S50A 4H5FA 1EZ9A 4KCCA 4QRZA 2VP1A 5DEXA 4F2OA 2OJTA 3CFLA 1ZKBA 1VFEA 4DIGA 4OERA 4P11A 2QS3A 4MLQA 1ZTYA 1B3LA 4LQ2A 3M3FA 4U4SA 3G7WA 3ZSFA 1SD3A 4IY5A 3U93A 2D3IA 4RJZA 4LZ7A 1SQYA 4YMBA 2REGA 3BBRA 3GBBA 2CZLA 5I56B 2W7YA 4H67A 1LLSA 2XXIA 4OMBA 3MJNA 4KQPA 1OLAA 1UTBB 2HZKA 4Q5TA 4NF8A 3KSXA 3MZBA 1TWYA 3UA8A 1OIBA 3PV0E 1FW0A 4FEBA 5DVFA 4F3SA 4NF6A 2RC7A 3GLBA 3KG2A 4EXKA 3RNNA 1NFTA 3A3CA 3C4MA 2F7CA 1O63A 1MQGA 3N5LA 1IITA 4KD5A 3U92A 5HM4B 5AE4A 2O84X 2XHDA 3K1MA 2Q2CA 4RNSA 1LAGE 3SEWA 3VE1B 3G3KA 4ZEFA 1LBBA 4QSDA 1XVYA 4MBPA 2ZXTA 3E13X 2OZZA 3O6HA 1ZJLA 3OELA 1MPDA 1O7TA 1IXHA 4PFYA 3UK4A 4PFWA 5ISUA 5CI5A 1MY2A 3MZ9A 2I0CA 3SEXA 5CMMA 3SEUA 5H8NA 4PETA 1HSJA 1URSA 4BDNA 1XT8A 3TODA 4FATA 4PFTA 1QKAA 5AA2D 3PUWE 1PBQA 3V89B 1P99A 4WEDA 1B46A 3TTLA 5BWJA 1DTZA 3DP4A 5B70A 4H65A 1NNPA 2A5TA 2UXAA 3S9MC 3E9XA 3MP6A 1B1HA 2OCUA 4WKMA 1JETA 3N26A 3TQLA 4U21A 4POWA 3QYTA 1XC1A 1CB6A 3FXRA 4TOZA 2P1SA 3T96B 5AA2A 2VD2A 2I4BA 1B0HA 1ZU0A 4QF9A 2M8CA 3HPIA 1AIVA 5L9OA 3B6QA 1URDA 4IY6A 4ELPA 4QFPA 3K6VA 4N6PA 3IB1A 4HCWA 4LZ8A 3QSLA 4IO7A 4ZS9A 5FHNA 1LCFA 4RYAA 5ITOA 4NF4A 2E1SA 2ZNUA 5F7VA 3T93B 3A09A 4R72A 1MXUA 1USYE 3LC8A 4TLMB 4QFNA 4MFIA 3H06B 4KR5A 2AL4A 1QUJA 4X48A 2OWSA 3O6GA 4I62A 2VHAA 4EF2A 5EYFA 3JV9A 1QJMA 4M1VA 4FAJA 2HFBA 1Y3PA 1TT1A 1FQAA 2I49A 1BTJA 3QXMA 4NWDA 1QKBA 2RCBA 5EHSA 4H8JA 3RN8A 3UP9A 1MH3A 3QIMA 2QJEA 1H76A 3TAJA 4G68A 5M2VA 4X1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OX3A 4DCXA 3MW0A 3Q29A 4OWDA 1JW4A 3CG3A 1ZBMA 3IO6A 3LUZA 2Q89A 2XD3A 3W9VA 4DXUA 1SVXB 3TTNA 2H5YA 2XD2A 1RDXA 5I2NB 4IO2A 1FTAA 1YAEA 2AIXA 5H8HA 5ICQA 2V84A 1LAHE 3ZKKA 1QW0A 3FV2A 2IEEA 1EYIA 3PUYE 4NG7A 5JEIA 4ESXA 4I1DA 1MDQA 3RPLB 4QFOA 1FBFA 2PX1A 3U94A 2ABHA 2FBPA 4YU0A 4O8MA 4NMYA 1EZOA 3GBAA 3ODBA 4P3LA 4KXPA 2F7AA 1LAXA 3TCFA 3H6TA 4F1UA 4XKRA 3MQ9A 3K6XA 3R26A 2DVZA 1NKXA 3B6TA 1MXYA 1Z7NE 4KYDA 2F6PA 4HW8A 4F31B 3OEMA 4GX3A 4C0RA 1I69A 1IZ1A 1D9VA 2F34A 3HCQA 2ZZVA 2B4MA 2I48A 4JXIA 4BDRA 4F3PA 1B5HA 5I84A 1WODA 4BDQA 1FTMA 3VV5A 5TPAA 3IL1B 1IEJA 1IXCA 2PCRA 2RF1A 1MXVA 2DP8A 1SI0A 3IX1A 3TEPA 1JW1A 2HEUA 4OEVA 4JB7A 5I59A 1Y1MA 2PYYA 4G4PA 3FVNA 1VFDA 1LGBC 2HHMA 3MVXA 4BDOA 4ZEBA 3SZPA 3T22A 4OYVA 1I6BA 2O7IA 5H8FB 3Q28A 4KPTA 1LBXA 4QSEA 4PQJA 3G3IA 1DTGA 1ZIUA 1NMUA 2ZYMA 4AS4A 1FPEA 4PAKA 4N6DA 1K9ZA 4NF5A 1YPNA 1LBWA 4IO6A 1A40A 3TMGA 5HBCA 1UQWA 2Y84A 1SW2A 3ILUB 5H8SA 1LBYA 1FBPA 1NV3A 3FBPA 3FXQA 4U22A 1NUXA 3OO6A 2GFEA 1LBZA 3FJGA 4C1TA 4PBQA 1EYKA 4DXBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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