4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
3BBRA 1GGGA 5CM6A 5ITPA 4OERA 3CSGA 3EN3A 1JVXA 5ITOA 2Y84A 5I58A 1OLAA 1FTKA 3OEKA 1ATGA 1UTHB 2NVUB 3H06B 4R6YA 1JEVA 2O1MA 3G3IA 1MPBA 3TELA 5I58B 2NOOA 3H6TA 4H65A 3OENA 4MBPA 4RK9A 1P1UA 1WVJA 4EQ7A 4NF5A 3TYHA 3FXUA 1URDA 4YKJA 1A54A 3MZ1A 5ELVA 5BWJA 4NWCA 1XHYA 2XXYA 2B3FA 2ONKE 2GH9A 4DZ1A 2Y7IA 3RPWA 4C1UA 4GFRA 2DSFA 3T22A 1XVYA 3OOAA 2H25A 4F1VA 2YJPA 1Z7NE 2E0SA 1SW5A 1JQFA 3N6TA 1XVXA 4IY6A 2F35A 2VHAA 3K6WA 2GFEA 4RA1A 3C4MA 4RNSA 1EZPA 3LR1A 2H9BA 3PV0E 3K6XA 2X7PA 4LONB 4I8CA 1O7TA 2I3WA 2YPNA 4IO6A 1MQDA 1O63A 5AA2D 1I6BA 3MZ9A 4R72A 4TOZA 1VR5A 4NF4A 4N6PA 2DE3A 4KPTA 3ZKLA 4ZE9A 4P11A 2B65A 1EH3A 2XX8A 2QL3A 2XXUA 2ZYOA 2DVCA 2CMOA 3CFXA 4NF8B 3FZVA 1LFHA 1MY4A 2H4IA 1QW0A 1CE2A 2DE4A 2F34A 5L8DA 2E1SA 1PB7A 4U1ZA 3FVNA 3IB1A 4R9GA 2V3TA 1SYIA 1O64A 1GR2A 5AA1A 3GXAA 1FQEA 3S9MC 1NNPA 1A55A 1B40A 1B5JA 4KD5A 2A5TA 3MP1A 5DYHA 4YB7A 3K02A 2F7BA 1VE4A 3C36A 1B2HA 3FXRA 3TTNA 1S9TA 4FE8A 1B52A 4Z0IA 3G3HA 2H99A 2A5TB 1Y9UA 3T9VA 4YKKA 3RTWB 3L6HA 2REGA 2Z8DA 3C31A 3UORA 2QRYA 2QSXA 3V89B 4GRKA 4GF8A 2OJTA 5F7VA 3FVOA 3FJGA 3I6VA 4JDFA 3LC8A 1XS5A 3SERA 2PMSA 4ELPA 5I2KA 3U72A 2DWIA 3PPQA 3K6VA 5DVIA 3FIRA 3KN3A 5TPAA 4FORA 1QJMA 4EF2A 3UK4A 4YMBA 4DE8A 1R9LA 4N07A 3FV2A 3MVWA 3OMBA 3CFZA 4GL8A 1MDQA 4G4PA 3VE1B 4P0GA 3PUWE 3QUJA 3Q25A 5TPAB 4MLQA 1NH7A 4ZZEA 4MH5A 2I58A 4XKQA 4AB6A 4OFOA 4YMAA 1B3HA 4YAHX 4K3FA 1MQIA 3RT6B 4R75A 1PB9A 4XXUA 1SW4A 3IB0A 4O3AA 1LAHE 3N6UA 5IKBA 4WEPA 4NTLA 3TEPA 5CI5A 5AA4B 4OMBA 1FQCA 4QSCA 1IXCA 1ZJLA 1IUDA 5ICTA 1LB9A 3JV9A 1Y1MA 4H6DA 1I6AA 5F1QA 4IB2A 4L17A 4OXVA 4H8JA 4F29A 5B7DA 5CMBA 2DE2A 2PX1A 1D9YA 3GBBA 1MXWA 3IK6B 3TTKA 1SW2A 3LSFB 1SQYA 1B0HA 3HN0A 2RKMA 1FTJA 2G93A 5HBCA 5CBSA 4PE5B 1IXGA 2OZZA 4BDLA 2A5SA 1MQHA 4GXSB 3FXQA 3PU5A 3RLFE 2IA4A 4ELOA 4IGTA 3HHGA 3TZAA 4H5GA 1ZKBA 3MP8A 4QFPA 5H8QA 2UYEA 5I57A 3N26A 3V83A 2PVUA 5H8HB 1IQ7A 5DT6A 4XKRA 1RKMA 4Z7EA 1VFEA 3OO8A 1Y1ZA 2F5XA 2DWAA 3O97A 1QKBA 4LZ7A 1D9VA 4GWOA 5H8QB 2O51A 4OWDA 4JWXA 1M5FA 3RTFB 4NWDA 4JB7A 2Q9TA 3PMVA 1M5DA 4EDPA 4C1TA 1LFIA 3UN6A 2IEEA 3SESA 1FQFA 4F31B 4GD5A 2QMWA 4YZZA 1L5TA 4ZEIA 4HW8A 1M5CA 3OSQA 3CVGA 1FQAA 3QSLA 4Q8RA 2ONRA 1IIWA 4IO5A 4H67A 1B4ZA 5FHOA 4OEVA 1YTVA 3RN8A 3K1NA 4H0WA 5EYFA 3SEWA 5H8FB 3DELB 4LZ8A 2DXYA 1Y3QA 3PPRA 3WAFA 5JTYA 3H3GA 1DPEA 5EHSA 3VV5A 1VFDA 2RCBA 4ESWA 3CIJA 4JWYA 4EUOA 1XOCA 2Z8FA 3THIA 4F19A 4QHQA 1B9JA 3V8XB 4LA9A 1EZ9A 1PBPA 5JTYB 1MY0A 2G29A 3LSWA 1RYXA 1SW1A 5LOMA 2XXVA 1MH4A 1SDXA 4E0XA 1I69A 3BFTA 3U92A 2RC7A 1AIVA 3TKDA 1AMFA 3EHTA 4G68A 2AL5A 5K2XA 3SKPA 3PUYE 4GLIA 1QVSA 2FYIA 3V5AA 3KN8A 4KQPA 4I9DA 1H45A 4UACA 3EQ1A 2QS3A 4TQUQ 1LGBC 4G68B 4KYSA 3HV1A 1SVXB 4NF6A 5FHNA 3IORA 1S7YA 2Q89A 3ECRA 3RY3A 4AQ4A 1JEUA 4RPNA 3ZKKA 3MVXA 1FQBA 4DXUA 2XXWA 1N04A 4F3PA 1LFGA 4UA8A 3OD7A 5TP9A 4NF6B 3CG3A 3ZSFA 4DIGA 1VSOA 2QS1A 1N3XA 2ZYMA 1TT1A 1B4HA 3TQWA 4ZZAA 3TUSA 1US4A 1H43A 3S2VA 3Q28A 2OBGA 2DWJA 2CZLA 5TP9B 1DPPA 1TFAA 1B1HA 1LSTA 4AB5A 2HFBA 2QJEA 4FEBA 4OFLA 5TU0A 2O6AA 4N13A 5ISUA 3IOWA 2UVGA 4FJPA 3JZJA 4XKNA 3TQLA 2ALUA 3E13X 2D3IA 1MY3A 4ECFA 5I59B 2I49A 4POXA 3PPOA 3PUXE 4QFLA 1N3WA 5DVJA 4F1UA 1LBCA 4ZE8A 3VFJA 4QSEA 2THIA 1NNKA 1JW4A 3TCHA 3PD9A 5I56A 2F97A 2W7YA 4NF8A 3O6GA 1IZ1A 1HSJA 1P1QA 4PP0A 5DEXA 3LBSA 1B3LA 2F7CA 4GIZA 3VVFA 1ZIUA 4Q30B 3TODA 4EQ9A 5A5XA 1LBBA 4QF9A 2Y7WA 4BDRA 3IOUA 3HHFA 4QSDA 2GHBA 3VLWA 4H1XA 5I56B 2O68A 3TAJA 1BLFA 1FW0A 3PPPA 1P1NA 4LQ5A 5DEXB 4EXLA 4GQOA 1OVTA 3D4CA 3ODBA 5A5XB 1SD3A 1JW1A 2UVJA 2ZNSA 1ZMGA 1ZTYA 3VLVA 3SEUA 2F7AA 1MS7A 2ONSA 1LCFA 1MM6A 4BDNA 4OYVA 2DYXA 5DVFA 1N0TA 3DM0A 3SETA 3T9XB 1A40A 1FTLA 2F78A 1N76A 1M5BA 4RY1A 1B46A 3P7IA 5HM4B 1BKAA 4QFKA 4IO3A 2H5YA 2O7UA 4IY5A 4NEDA 2Z22A 2OWTA 1B5IA 2QS2A 1AOVA 3K2DA 2ZXTA 3RGYA 3OXNA 4LP2B 3G3GA 1MH3A 4OZ9A 4E0WA 5CMMA 4R2BA 5H8NA 1GV8A 3N94A 1B3FA 3N5LA 3TTRA 2OK2A 1UQWA 4U2RA 4DDDA 2RCAA 3TFLA 3MBPA 3VDFA 3ILTB 4F18A 1AH5A 1EU8A 4G8NA 3M3FA 4G8HA 2X7QA 1LCTA 3GLBA 3GZGA 3OEMA 3O2AA 4QRZA 5FHMA 1CB6A 5H8NB 2UXAA 4FEDA 3ONMA 3MC2A 1Y20A 1HSEA 2O84X 1IXHA 3DLNA 4BLAA 4HS7A 3SEVA 3OELA 3H6VA 4DCYA 3QUFA 3RT8A 3SEXA 1YPNA 5AA4A 3IL1B 4XKPA 1NKXA 2HZKA 1Y3NA 4U1OA 1OQHA 3DP4A 3FUZA 3FVKA 3B7DA 2AIXA 2P0SA 5HPQA 3FD3A 3MPKA 2Z8EA 3C9HA 5AA2B 1PDAA 4BDQA 2ZMBA 3M3LA 3TTMA 2HXWA 4R74A 3MPLA 3IX1A 3U94A 3K4UA 4TLLB 2XXQA 3O6IA 2I6EA 4U21A 4HCYA 1N84A 1SYHA 3ILUB 1URSA 3IO6A 5CMCA 4X1BA 1IITA 4R6HA 1XT8A 4DLDA 3MW0A 3MWBA 4DXCA 4MF3A 2V3UA 1H44A 2ESNA 4DCXA 1B51A 3Q29A 5KCJA 3T93B 3M8UA 5AE4A 4KR5A 4OTEA 3KBRA 1MXUA 4KHZE 1UIUA 2XX9A 5H8HA 2ZYNA 1DOTA 2ZNTA 4M4GA 3QXMA 3PMXA 2GHAA 5KCJB 3IO4A 1JW5A 4X9TA 3G3FA 1MY1A 4JBZA 2HCAA 2I0CA 1A8EA 1JVYA 2Q8JA 1SI1A 2I48A 1KWHA 2XD2A 1PEBA 3IJXB 3RNNA 3UIFA 2HQ0A 1Q35A 1USYH 2V93A 2VD2A 2PYYA 3OO7A 5BUUA 4WXJA 1A7LA 3MAMA 3PMWA 2XD3A 3C33A 4LQ2A 4RXLA 1H3DA 4H8IA 2AYSA 5H8FA 2NUVA 5K2YA 3KG2A 5I2NA 3AXFA 3VVEA 2I3VA 2PT2A 1I6QA 1N7XA 1OIBA 4TLMB 4POWA 1LAGE 3C35A 3S4UA 4YB6A 4IO2A 4MLVA 4KCDA 1B58A 3T96B 4LZ5A 5J1DA 1MM7A 5I2NB 3E4RA 4PETA 3U1OA 1A99A 1Y4TA 3VXCA 4ZECA 1A8FA 3K00A 2QS4A 1Y4CA 3O66A 4ZEKA 2OCUA 4OENA 3T9HB 4GVOA 4YKPA 4R6KA 4G2ZA 1DTGA 1TXFA 1Y3PA 3ZS6A 1EZOA 3G3KA 1MY2A 3RQTA 1MXZA 1R6ZA 3T66A 3PGFA 2DOJA 1OVBA 2R71A 1N7WA 3E9XA 2VD3A 1URGA 4FAJA 3IJOB 3IAZA 4MFIA 1R1NA 1YAEA 1GVCA 2HEUA 3OSRA 2P2AA 5KDTB 2R9JA 1BP5A 1NFTA 2V84A 5AA3A 4NE4A 2D5WA 3I3VA 2Q88A 4ONYA 4PFUA 1QULA 1POY1 2HZLA 2ZNUA 1ZBMA 1B32A 1IXIA 1BIYA 3MUQA 4QFNA 2ANJA 1MQGA 2X26A 3EPEA 4U23A 2RF1A 4EF1A 1ELJA 3OO9A 3FJ7A 3H6UA 1YCJA 3D4GA 2I4CA 1UTBB 1PC3A 3JYRA 1NH8A 3EF7A 3KJTA 4YICA 1GTKA 1MXYA 4KI0E 5I59A 4XIGQ 1AL3A 3M3KA 3FV1A 2DS9A 2OLBA 2O69A 1USYE 3H7MA 4KFQA 4ELQA 3QIMA 4WEDA 3MP6A 4R9FA 1MXVA 3BFUA 4R2FA 3R6UA 2XXTA 1F9BA 4OQOA 3EHUA 1B7ZA 4NF5B 4R73A 3HSTA 3TDJA 4ELRA 1T0KA 3UA8A 3FVGA 4U4SA 1MPCA 3PPNA 4RJZA 2VGQA 3IOVA 2DP8A 4LATA 4F3GA 1J1NA 4JSDA 3T9UA 1B05A 1FTMA 4H5FA 4WKMA 2QMXA 4P0IA 3U8QA 3TCGA 2VP1A 5DTBA 1H76A 3DP8A 1XC1A 3H03A 1DSNA 4BDOA 3IOTA 3W9VA 2HAUA 2WKYA 4HTGA 4KCCA 1QKAA 2XXXA 1MQJA 5L9SA 3E3KA 3A3CA 1US5A 4NF4B 3IB2A 1WODA 3Q27A 2RC8A 3C34A 3VXBA 3HPIA 2F36A 4O3CA 2F6GA 3LUYA 3UGWA 2Q2CA 2Y7PA 4PQJA 1P99A 1UIVA 4YU0A 3O9PA 5FTIA 3G3JA 2I0BA 2UVIA 1FQDA 3K6UA 4PFWA 3IR1A 1P1WA 4F39A 2XXPA 1B3GA 3S9LC 2D21A 4RPOA 3U93A 1LLSA 3KN7A 4F1YA 5FTHA 3O29A 2ABHA 4IGRA 5CRYA 2Y7RA 3PUVE 4KYDA 3CRBA 4HCWA 4F3SA 4F3BA 1S50A 2XXHA 5JEIA 1PBQA 1OQGA 1FCKA 3DP6A 5ICQA 4ZDMA 3KFMA 3KOTA 2RINA 2F8DA 1BTJA 5CBRA 1B1XA 2NWJA 2XXRA 5I84A 1LAXA 3VVDA 1MRPA 1P1OA 1WDNA 1ZU0A 1JNFA 1MXXA 3KGCA 4GXAA 4YB5A 1HSLA 1LAFE 5AA2A 3B6TA 3MVZA 3K0VA 4JXIA 4OFJA 3K01A 5I2KB 3MVYA 4DXBA 2M8CA 1NNTA 4RYAA 2FA7A 3K1MA 4U4XA 3TMGA 4OETA 2V3QA 4ZS9A 5IAIA 3WAEA 4YKIA 3W9WA 4IO4A 3PD8A 4LVQA 3CG1A 2Y7KA 4ESXA 3S9NC 1MG1A 2YLNA 3QAXA 1M5EA 3MQ9A 2V25A 5M2VA 3Q26A 3H4ZA 1OMPA 5KZTA 2XX7A 4EXKA 1MDP1 4I62A 3G7WA 3CSBA 1NL5A 2DXRA 3USDA 1B7HA 2REJA 1QUKA 3PUZE 2Z23A 2I4BA 3SDFA 1SBPA 4QFOA 3I5OA 3EHSA 3FASA 4M1VA 5CC2A 3FJMA 4PFTA 5EHMA 4PFYA 1B5HA 2H98A 1D4NA 1B6HA 4F22A 4BDMA 3A3UA 4JWOA 2PBWA 3HO7A 3TPAA 1ZLQA 4JSOA 1B3EA 5L9OA 3HCQA 4F2OA 4IO7A 3KSXA 3H6WA 4ZEFA 4FIMA 3QK6A 3KZGA 1PB8A 4OHNA 3UP9A 4NMYA 4Q5TA 1IEJA 3GBAA 3MJNA 4XTCQ 2VOZA 1POTA 2PT1A 3O6HA 2RC9A 4ND9A 4X48A 3KSJA 2P1SA 1MPDA 2XXIA 4FATA 1Q1KA 1QUIA 3TCFA 4G68C 4GL0A 3CR9A 2Q2AA 3FGSA 4LUBA 5I57B 1DTZA 2XHDA 3F11A 3W15C 4GOTA 2UYFA 1ANFA 3O28A 5L9MA 3C32A 1LB8A 5JK4A 2O7IA 1TFDA 1QUJA 4FECA 3R7XA 2NXOA 2B3BA 4U22A 4O3BA 2FNCA 3VLUA 2KLFA 1DMBA 1JETA 3KEIA 3L6GA 3B6WA 1II5A 1SI0A 3OO6A 1NMUA 1RYOA 2LAOA 2DWHA 3LSXA 4OESA 1B0LA 4OEUA 2DQVA 4G8MA 3CFLA 4F2QA 2DVZA 3KOSA 3KJ7A 1NNFA 3FATA 2R6GE 5KDTA 4EQBA 3LSLA 5B70A 3RUMA 1B7UA 3S9EA 4OVJA 5CMKA 1OLCA 3CI8A 4ZEDA 2BJJX 4I1DA 4THIA 4KYEA 2OWSA 3SEYA 4ISUA 3B6QA 4ZEBA 1TWYA 1Z7ME 3QYTA 3K1PA 2AL4A 1D3KA 2QPQA 2UVHA 3A09A 4C0RA 4X1DA 3BKIB 2HAVA 3R26A 2ZYKA 4RK2A 2GRVA 1R9QA 1FTOA 4Q0CA 5H8SA 1UTHA 2F6PA 1UTBA 2O1LA 3TTLA 4G77A 3MZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BBRA 1GGGA 5CM6A 5ITPA 4OERA 3CSGA 3EN3A 1JVXA 2XWOA 5ITOA 1G0IA 2Y84A 5I58A 1FSAA 1OLAA 1FTKA 3OEKA 1ATGA 1UTHB 2NVUB 5ET6A 3H06B 4R6YA 1JEVA 1DBZA 2O1MA 1LBVA 3G3IA 1MPBA 1Q9DA 3TELA 5I58B 2NOOA 3H6TA 4H65A 3OENA 4MEVA 4MBPA 4RK9A 1P1UA 3LV0A 1WVJA 4EQ7A 4NF5A 4MIJA 3TYHA 3FXUA 1URDA 4YKJA 1K9YA 2WX9A 3B8BA 1A54A 3MZ1A 5ELVA 5BWJA 4MJOA 4NWCA 1FPGA 1XHYA 2XXYA 2B3FA 2ONKE 2GH9A 4DZ1A 2Y7IA 3RPWA 4C1UA 4GFRA 2DSFA 3T22A 1XVYA 4N8GA 3OOAA 2H25A 4F1VA 2YJPA 1IMAA 1Z7NE 2E0SA 1SW5A 1JQFA 3N6TA 1XVXA 4IY6A 2F35A 4MNIA 2VHAA 3K6WA 2GFEA 4RA1A 3C4MA 4RNSA 1EZPA 3LR1A 2CEYA 2H9BA 3PV0E 3K6XA 2X7PA 4PFIA 4LONB 4I8CA 5IGAA 1O7TA 2I3WA 2YPNA 4IO6A 1MQDA 1O63A 5AA2D 1I6BA 5ET5A 3MZ9A 2CZHA 2CZKA 4R72A 4TOZA 1VR5A 4NF4A 4N6PA 2DE3A 4KPTA 3ZKLA 4ZE9A 4P11A 2B65A 1EH3A 2XX8A 2QL3A 2XXUA 2ZYOA 2DVCA 2ZZWA 2CMOA 3CFXA 4NF8B 3FZVA 1LFHA 1MY4A 2H4IA 1QW0A 1CE2A 2DE4A 2F34A 5L8DA 2E1SA 1PB7A 2ZZVA 4U1ZA 3FVNA 3IB1A 4R9GA 2V3TA 1SYIA 1O64A 1GR2A 5AA1A 3GXAA 5EQ8A 1FQEA 3S9MC 1NNPA 1A55A 1B40A 1B5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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