4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
1NNPA 2DWHA 3KG2A 1DPEA 4LONB 4Z0IA 3GBAA 1PB7A 3BFTA 2LAOA 4ELQA 5H8QB 4OXVA 3S4UA 1JEVA 3H3GA 1XS5A 3IOTA 1O63A 4ONYA 4OETA 1Y1MA 3FGSA 3OOAA 3L6HA 4EF1A 2CZLA 3PD9A 4F3GA 3CIJA 3M3KA 3ILUB 4MLVA 3TQLA 1I69A 3FJ7A 4DXCA 1Y9UA 3IL1B 3K1PA 4IO6A 3T93B 4GF8A 3CR9A 3T9VA 3MW0A 1Y3QA 2Q8JA 1P99A 1R9QA 3EHSA 3TAJA 2F6GA 3FXQA 3IOUA 5L9MA 3ODBA 1LFIA 2QSXA 3KOTA 2PYYA 1B51A 3OEKA 2H98A 4JWXA 1MY0A 4R6KA 5EYFA 5I56A 4OFJA 1P1UA 3IJXB 1TWYA 2F35A 3TCHA 2Q89A 1PC3A 4I9DA 5M2VA 1NNKA 3VVEA 4Q5TA 1B3EA 2QL3A 3SEWA 4FECA 1ATGA 4YMAA 1PEBA 2AL5A 1B46A 4F1UA 1JW1A 1H45A 2X7PA 4DIGA 4PQJA 2D3IA 4JXIA 4G68B 1UTHB 3U8QA 3IK6B 5AA2D 5B70A 3F11A 4WEDA 5JEIA 5TP9B 2XXRA 1XHYA 1UIUA 3FVGA 2QS4A 3T22A 4TLLB 2VHAA 3FVOA 4M4GA 5KCJA 5CI5A 1JW5A 1P1OA 3FV2A 4XTCQ 2ZXTA 4XKNA 2HAVA 3MVYA 2AYSA 4LATA 2H4IA 1YTVA 1FTJA 4KCDA 4QFNA 3O6IA 3R6UA 1A8EA 2HCAA 3C35A 1TXFA 5JK4A 3M8UA 1F9BA 1LSTA 3SEVA 3CG3A 4F3PA 3OO6A 4GWOA 1PDAA 3K6WA 4N6PA 2QRYA 1SYIA 3IORA 3KZGA 3TPAA 5IAIA 1MPBA 4MH5A 1SD3A 4H5GA 1URSA 1AL3A 1EH3A 4QFKA 2XXPA 1PBQA 4R74A 4G8MA 4R6HA 1M5BA 4N13A 2ZYOA 1B0HA 4DCYA 2B3BA 1SW4A 2ALUA 2Q2AA 2XXUA 1MPCA 3RLFE 4OTEA 1MDQA 3UORA 1AH5A 3ZKKA 1TFAA 3C32A 3IAZA 1D4NA 1QW0A 2XX9A 2I0BA 2DYXA 1Y3NA 2Z22A 1OVTA 4NF6B 4GL8A 3QUJA 4AB5A 1RYOA 3TCGA 1FQBA 3SETA 4EQBA 1ZTYA 4OQOA 1Y4TA 2XXVA 3CSBA 3TEPA 4KPTA 4O3CA 1S7YA 1Y4CA 1N7WA 3G3GA 1AIVA 4R2FA 3G7WA 3OXNA 4U2RA 1RYXA 3C34A 3K1MA 1MY2A 4DE8A 4YB7A 3MC2A 4F3SA 3H06B 1FQCA 2NVUB 4YKJA 3U92A 4F19A 1P1NA 4FIMA 2QPQA 5KDTB 1A54A 1N0TA 3FD3A 3MVXA 3GZGA 3LBSA 5HM4B 3LSXA 4QSCA 4Q8RA 5DVIA 4L17A 3B6WA 2ONSA 4QFPA 4YB6A 1IQ7A 1NNTA 1YCJA 2Z23A 4HTGA 3VV5A 1USYH 3PPNA 4I8CA 4NF8B 2I4BA 2ZYMA 2THIA 3IB2A 1JETA 4MFIA 4OYVA 2XD3A 2QJEA 5F7VA 1M5DA 4O3BA 1B3HA 3KGCA 5K2YA 4GQOA 5CMMA 3ZKLA 3VLVA 3DP4A 4OWDA 3MPKA 3OENA 2QMXA 4EQ9A 4ZDMA 1JEUA 3K01A 3BFUA 1ANFA 3A3CA 4R73A 1CE2A 2F7BA 2Y84A 3W9WA 5BWJA 4NTLA 2UVIA 3MVWA 2DVZA 1D9YA 1ZMGA 3H4ZA 5CMBA 2RC7A 3HN0A 1Q1KA 3ONMA 1DTGA 3IJOB 1A7LA 1SI0A 3EN3A 3VXCA 2NWJA 2O7UA 1H3DA 5JTYA 1B3LA 4RNSA 2NOOA 5I59A 1VSOA 4ZEIA 1FTKA 4ZEBA 1B3GA 1IZ1A 1Y20A 1MQHA 5ICTA 4Q30B 4F29A 3FATA 3C36A 1IITA 1URDA 2GRVA 3MZ1A 1GVCA 4BDOA 4U1ZA 4E0WA 2E0SA 2P2AA 2QMWA 2UXAA 1KWHA 2RINA 2OZZA 4LQ5A 1MXWA 2YLNA 3O97A 4ND9A 2HQ0A 5CMCA 2REJA 5TPAA 4EXKA 2G93A 3PPRA 1P1QA 4XIGQ 3KFMA 1NH7A 1Q35A 4XKRA 1FTLA 1N04A 2IEEA 3H6TA 3LSWA 1MY4A 5FTIA 1DTZA 3M3FA 2VGQA 4JSDA 5ITOA 5I2NA 4I62A 3KN3A 1FCKA 4H6DA 4KI0E 2A5TB 1FTOA 3SEUA 4M1VA 5HPQA 4C0RA 4X48A 1JQFA 1FQAA 4NF5B 4G77A 1US5A 2NXOA 4R9GA 1MQJA 3TDJA 1ZLQA 2XD2A 1OIBA 3HHGA 4OHNA 2ONKE 3CG1A 2ABHA 1JNFA 3KSJA 2O69A 5I57A 2GHAA 3TUSA 2R6GE 3S9MC 3RQTA 2RC9A 5I58A 3O6HA 3FXUA 4QFLA 3UA8A 5H8FB 1WVJA 2O84X 1B3FA 1GV8A 3E4RA 2B65A 3MP1A 4KR5A 1XC1A 2O7IA 1QKBA 4G68C 3DP6A 4MLQA 2P1SA 3PMWA 3DELB 3H6UA 3OSQA 3VFJA 1MH3A 3S9NC 3HO7A 3OSRA 5CC2A 4FEBA 1NMUA 2Q9TA 3S9EA 3PUXE 2DE3A 1QUJA 3C31A 4IO2A 2V3TA 1BIYA 3QK6A 3QUFA 3UIFA 5BUUA 3N5LA 4WXJA 3G3IA 4XKQA 4OEUA 2BJJX 3DP8A 4NWCA 2REGA 2UVGA 1SI1A 3E9XA 4ZECA 3G3HA 1SW1A 4WEPA 4P0IA 1UTBA 1MXXA 4YZZA 1ZU0A 4C1UA 4EDPA 2R71A 2ZNSA 1MXVA 3MUQA 1TFDA 1S9TA 5EHMA 2P0SA 1BTJA 4R6YA 4R75A 3Q26A 1IUDA 1AOVA 2Z8DA 2OK2A 1B5HA 5DEXA 3QIMA 4FEDA 1H76A 3HSTA 3D4GA 1IXGA 3RGYA 4G68A 3L6GA 1MQIA 1B6HA 3P7IA 4RK9A 2Z8FA 3CVGA 3OD7A 4GLIA 3A3UA 3W9VA 5DVFA 1XVYA 3QYTA 4I1DA 2PBWA 1DOTA 5CM6A 5DTBA 3RPWA 1LCFA 4IGTA 1XVXA 2F6PA 1LAHE 1FQEA 3K0VA 1LFGA 3CSGA 5H8HA 1MS7A 3B6QA 1JVXA 2HAUA 4QRZA 3TTMA 3G3JA 2DE2A 1A55A 1S50A 3V5AA 4GFRA 4ZEFA 4THIA 4G2ZA 1UQWA 1JW4A 1MXUA 3S9LC 3VXBA 1POTA 1NL5A 2XXXA 3PV0E 3VLWA 3I6VA 4IY5A 1IXHA 1B05A 1VR5A 4F2OA 2PT1A 4P0GA 3JZJA 3K6VA 4F31B 4MF3A 3EQ1A 4XKPA 1VE4A 3QAXA 4IO3A 4H8IA 2F5XA 2IA4A 1IXCA 3RN8A 1QUIA 2RF1A 4PETA 4H8JA 1USYE 1MY3A 3MP6A 3SERA 3KOSA 2Y7WA 5K2XA 4NF6A 3GBBA 3KEIA 3PPQA 1D3KA 3FVNA 5FHNA 3G3KA 5FHOA 1BKAA 2Y7KA 3LR1A 2H9BA 3U93A 3GXAA 1QULA 2I4CA 2Q2CA 3U1OA 2E1SA 2ESNA 2OWTA 4FAJA 3HV1A 1J1NA 1B32A 2RC8A 4F1VA 1WODA 4HCYA 3USDA 4YAHX 2FA7A 4BDQA 1O7TA 3H6VA 4IO7A 4F39A 3TTLA 1MH4A 4EF2A 3FJGA 1B1HA 1MPDA 4U4SA 3PGFA 4KQPA 2OCUA 4QHQA 4LQ2A 5FTHA 2A5SA 4BDNA 1CB6A 3MAMA 3TTRA 4KYEA 1EZPA 1B52A 4NF4A 5I2KB 4DCXA 5J1DA 1LFHA 3E13X 4F1YA 4FATA 1T0KA 1OLAA 4TOZA 4KYDA 4DZ1A 1NFTA 3V89B 3Q29A 2HEUA 4G4PA 3DM0A 1Y1ZA 4Q0CA 2VD2A 3GLBA 1MM6A 1VFDA 2O6AA 2ONRA 4U4XA 4OFLA 4LZ5A 1N7XA 4ZE9A 3O28A 1PB8A 4IO5A 2DWAA 3FV1A 3Q25A 4YMBA 1SVXB 2HZLA 3QSLA 5HBCA 4ECFA 3FXRA 3KJTA 3O9PA 1GGGA 4ZZAA 4QSDA 5ISUA 4P11A 1N84A 4DDDA 3TELA 1ZKBA 5I59B 3RTFB 4NEDA 4OEVA 1M5EA 5ELVA 1OMPA 1MG1A 3TCFA 3HHFA 2I6EA 2NUVA 3AXFA 3VLUA 4LA9A 1B7ZA 4JWYA 5KZTA 5AA2A 2UVJA 2RCAA 1M5FA 2YJPA 1ZBMA 3PUWE 4LP2B 3EHUA 3IB1A 2F34A 3HCQA 3RUMA 4OMBA 5AA3A 4GVOA 2KLFA 4H65A 5AA4B 5H8NA 2UYFA 2OJTA 3CFZA 3KSXA 4KYSA 5TPAB 5F1QA 3RT8A 2F7CA 1L5TA 3MVZA 1HSEA 3A09A 4ZS9A 2I0CA 2UYEA 1LAXA 1N3WA 4POXA 2DE4A 3PUYE 3FZVA 4EQ7A 2AL4A 4DXUA 1B58A 2DS9A 2I58A 3S2VA 3SEXA 2H25A 3OO9A 3T9UA 3IB0A 1SW2A 5I2NB 1B7UA 1B5IA 2FYIA 1B2HA 3K2DA 3H7MA 4Z7EA 2O68A 4K3FA 5ICQA 1R1NA 2ZNTA 3MJNA 1MM7A 1FTMA 2DWIA 1URGA 1ZIUA 3C4MA 3H6WA 2DWJA 3LUYA 4ESWA 1N3XA 5I57B 3MZ9A 1FQDA 2XX7A 2GHBA 4NF5A 5I58B 2Y7RA 4X1BA 4ZZEA 3MPLA 2OLBA 4GOTA 3KJ7A 1B9JA 5A5XA 1NNFA 2H99A 2AIXA 3TKDA 3MP8A 1SW5A 3RT6B 4NMYA 3O6GA 3PMXA 4LUBA 4OVJA 5H8FA 3LSLA 1B40A 1H43A 5H8QA 3PUVE 1P1WA 1SYHA 2O51A 4X9TA 3FIRA 2PMSA 5DVJA 1HSLA 2XXTA 4XXUA 5L9OA 3BBRA 1LGBC 1ZJLA 3PPOA 1QVSA 4U21A 3CFLA 1B4HA 4NE4A 4PFUA 3O2AA 2GFEA 4YKPA 3SEYA 1A99A 4ISUA 2DOJA 2VD3A 4IB2A 3VDFA 3QXMA 1XT8A 5I56B 1B0LA 4JB7A 3R26A 4YKIA 3TTKA 3B6TA 4QSEA 3IX1A 1LAGE 3KN7A 1N76A 3PMVA 3U72A 3ZSFA 2I49A 1WDNA 2V25A 4RPNA 2M8CA 1EZ9A 3W15C 2VOZA 2XXYA 3ILTB 1BLFA 1Z7ME 5FHMA 1TT1A 4QFOA 4PFTA 1UTBB 1QKAA 2RCBA 3D4CA 4PFWA 4C1TA 4E0XA 1FQFA 5AA1A 5CMKA 5DEXB 5AE4A 3C33A 4H5FA 3PD8A 4RA1A 3LSFB 3K6XA 5H8SA 3TZAA 5KCJB 4KFQA 2Q88A 4WKMA 3OEMA 3Q27A 1A40A 2XXHA 1UTHA 3G3FA 4QF9A 1SBPA 4AQ4A 5TP9A 2F7AA 3DLNA 3PUZE 4JDFA 3U94A 1DMBA 1US4A 1PBPA 1LB9A 3ECRA 4FE8A 4JSOA 2CMOA 4F3BA 3FASA 2HFBA 4RXLA 1LLSA 4KHZE 5H8HB 3T66A 1SDXA 2I3VA 2YPNA 3OMBA 3EHTA 3WAFA 2PX1A 3I5OA 3HPIA 4HS7A 4OZ9A 4G8NA 4H1XA 3M3LA 3SESA 1H44A 1R6ZA 2V84A 4PE5B 4RY1A 4O3AA 1D9VA 2XXIA 5TU0A 3N6TA 2DSFA 5EHSA 4R72A 3VVFA 2I3WA 3C9HA 3K4UA 4YKKA 2DXRA 4JWOA 4OENA 4GRKA 3PPPA 2XXQA 1YAEA 3KBRA 1NKXA 4OFOA 3EF7A 5DYHA 2G29A 3T9HB 4HCWA 1QJMA 4KCCA 1OLCA 3E3KA 4GIZA 1EZOA 4OESA 5L9SA 1MY1A 2RKMA 4IGRA 2ZYNA 2QS3A 1DPPA 1B5JA 3TYHA 2X7QA 3UP9A 2FNCA 4FJPA 3TMGA 3LC8A 3TQWA 2H5YA 4BLAA 4UACA 3K6UA 2I48A 2O1LA 4PFYA 2WKYA 2XHDA 4U23A 3RNNA 4IO4A 3Q28A 2GH9A 1RKMA 1VFEA 4NWDA 1LAFE 1I6QA 2F8DA 3N26A 5CRYA 1MQGA 3V83A 1FW0A 4AB6A 2HZKA 4TLMB 4ESXA 2ZMBA 2Y7PA 4LZ7A 4FORA 4PP0A 2V3QA 5B7DA 3R7XA 1UIVA 1OQGA 3K00A 4DLDA 3IOVA 2DQVA 3N6UA 1JVYA 4YICA 3PU5A 4BDLA 4NF4B 5KDTA 1MQDA 5CBSA 4IY6A 3IO4A 3BKIB 1B7HA 3IR1A 2OWSA 1OVBA 4EXLA 1DSNA 4ELPA 1I6AA 4JBZA 4ZEDA 1HSJA 3UK4A 5I2KA 4H67A 1YPNA 4NF8A 3WAEA 3FVKA 3TTNA 4GXSB 2OBGA 3I3VA 2XX8A 4GL0A 4LVQA 1II5A 1IIWA 3IO6A 5LOMA 4UA8A 4R2BA 3CFXA 1XOCA 1R9LA 3VVDA 2V93A 1PB9A 4GD5A 4X1DA 2VP1A 3H03A 2O1MA 1B4ZA 3OELA 1AMFA 2F36A 1LBCA 3O29A 3B7DA 2V3UA 4ELRA 2B3FA 3UN6A 1MXYA 3FJMA 2F97A 1Z7NE 4G8HA 5JTYB 3MZBA 2D21A 4RJZA 2Y7IA 3K1NA 4U22A 3V8XB 3EPEA 4F2QA 3T96B 4BDRA 4RK2A 4ZE8A 2D5WA 1BP5A 1IEJA 3MWBA 4H0WA 1B1XA 4N07A 2W7YA 4KD5A 3RTWB 5AA2B 3JV9A 4OERA 4EUOA 3MQ9A 4POWA 3TFLA 3THIA 2X26A 4TQUQ 4BDMA 2HXWA 2ZNUA 4HW8A 4RYAA 2DXYA 5H8NB 2Z8EA 1QUKA 1M5CA 1SQYA 5CBRA 3CI8A 1MDP1 2QS1A 3OO7A 1GR2A 1MXZA 5L8DA 3O66A 4DXBA 1ELJA 1IXIA 4R9FA 1POY1 3K02A 3N94A 1O64A 3MBPA 3SDFA 5AA4A 2DVCA 5DT6A 2UVHA 4RPOA 3TODA 1MRPA 4F22A 2DP8A 4ZEKA 1LCTA 3KN8A 1EU8A 5I84A 4F18A 1GTKA 2QS2A 2F78A 3RY3A 3ZS6A 1Y3PA 1LBBA 3OO8A 1OQHA 2R9JA 3JYRA 3UGWA 4U1OA 2PVUA 2A5TA 4LZ8A 2ZYKA 2XXWA 1A8FA 3FUZA 4MBPA 4YU0A 5IKBA 1I6BA 1LB8A 3IOWA 4GXAA 2PT2A 3VE1B 1NH8A 3T9XB 4YB5A 3SKPA 2ANJA 5ITPA 4ELOA 3CRBA 5A5XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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