4UA8A

Eur_01830 (maltotriose-binding protein) complexed with maltotriose
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GKETITVMGPAEDLDDAQGAWLKTECEAFAKANPDFNIEFKYVTSSESDAKDVVTKDPKAAADVYMFANDQLEPLIKANAIAKLGGDTAEYVKSSNSEAMAATVTYDGDIYAVPYTSNTWFMYYDKRVFSEDDVKSLDTMLTKGKVSFPFDNGWYLNAFYAANGCTIFGDGTDKAAGYDFSGDKGTAVTNYIVDLFANPNFVMDNNEGSLGLAGLKDGSINAYFNGNWNYDKVKEALGEENVGVAALPTINIGGKDCQLKAFLGSKAIGVNPNCKNQEVAVKLAAFLGSEDAQLAHFKLRGQAPVNKDLATNEEVAADPVAAAMAKVSSDCSVAQPIIDMSGYWDAATPFGDAFQNGAEGQITKDNAAQKTEDFNTQLNDSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular details of a starch utilization pathway in the human gut symbiont Eubacterium rectale.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbohydrate ABC transporter substrate-binding protein, CUT1
molecule tags Transport protein
source organism Eubacterium rectale dsm 17629
total genus 136
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ua8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ua8A01
2QS4A 1IXCA 1MDP1 4BDLA 1M5BA 2Z23A 4ISUA 1J1NA 4QF9A 5AA4A 2F78A 3TEPA 3KN8A 3FVGA 4OFJA 5EYFA 2ALUA 2ZNSA 4R9GA 2XXHA 3KBRA 2QS1A 2ZYOA 3FJ7A 3T66A 3MP6A 1YCJA 2HXWA 1SW1A 1MS7A 3TAJA 2QRYA 1QKAA 3OOAA 3OENA 3IX1A 1MG1A 1AH5A 3TDJA 3G3KA 1BIYA 4F29A 1SW2A 2I0CA 4GXSB 3TUSA 3O9PA 5I58B 1WDNA 1Y20A 3T96B 3HPIA 3VLWA 3IOWA 1MM7A 3FGSA 3H7MA 1JEUA 4H6DA 4H67A 4BDQA 1O64A 4IY6A 5HM4B 1MH4A 2YLNA 2I4BA 2F7CA 3BKIB 4JWYA 3PMWA 4ESXA 1XS5A 3K1MA 5F7VA 3O66A 4NF6B 3IK6B 3OO8A 1MXWA 4AB5A 1LFGA 4KI0E 1A40A 4U1OA 4DXCA 3K00A 2PT2A 4MF3A 5H8FB 2DQVA 2PT1A 1P1NA 5I59B 1Y9UA 4R74A 3Q25A 3ZKKA 2ZXTA 4FORA 4HCWA 2Y7WA 3OO9A 1B3EA 4LATA 1S7YA 4LA9A 1USYE 3M8UA 3OD7A 3PMXA 4NF5B 1UTHA 3B6WA 1TT1A 4OEUA 3V5AA 3M3KA 3M3LA 1B05A 2XXQA 1LAHE 1PDAA 3FVNA 4RPNA 5ICQA 2OWTA 4QSDA 3HHGA 1UTBA 1URDA 3S9LC 4E0XA 2AL5A 4OWDA 3I5OA 4RY1A 3CFZA 4XXUA 3H6WA 1B3LA 1FQDA 2AYSA 4ND9A 1URSA 3B6TA 4O3CA 1LFHA 1D9VA 4OTEA 2AIXA 2VP1A 4N07A 2NXOA 3G3IA 3DLNA 2V93A 4P0IA 1HSJA 4NE4A 1MPDA 1N0TA 2CZLA 2XX7A 3C4MA 4F3PA 3DP4A 3G3JA 3RY3A 5I56B 1MY4A 1L5TA 3EHUA 1EU8A 1FTOA 2DE2A 4RNSA 4ELOA 3IORA 5DEXA 5JEIA 4YAHX 1FQFA 3K1NA 5A5XB 5ELVA 2I58A 2F97A 2OK2A 1B7HA 3JYRA 1SYIA 2A5TB 4NTLA 3TMGA 3QUJA 2P1SA 3VLVA 4F3SA 1OVBA 2GH9A 5ISUA 1H44A 1N7WA 4U2RA 4FIMA 5L9MA 4EQ9A 1B7ZA 4RA1A 3K6UA 5ITOA 1B0HA 3KG2A 5KDTA 3G3FA 1LCFA 2I3VA 3TYHA 1JW5A 3PUZE 1VSOA 5FTIA 1I69A 3JZJA 3U93A 1B9JA 3IJXB 4TOZA 3K0VA 4RXLA 2Y7PA 3QYTA 4BDRA 1ZJLA 4EXLA 2D5WA 2HZLA 1QJMA 1IITA 3FUZA 1IXIA 3Q29A 3V8XB 2H99A 4NF8B 1POTA 4YB6A 2OBGA 4XKRA 1P1OA 3FXQA 2I3WA 3U8QA 5IKBA 1MQHA 4OEVA 1N7XA 4FATA 5I2NB 4H0WA 2Z22A 3MZ1A 1SI1A 4PE5B 2REJA 3T9UA 3UK4A 4ELRA 4YMBA 1P1WA 3MUQA 1FTJA 2Q88A 4FE8A 1LLSA 1JW4A 3RUMA 1Y3PA 3TCFA 3PGFA 5B7DA 1N76A 1RYXA 3BBRA 5TP9B 4ZECA 3VVFA 3ILUB 1KWHA 5CC2A 2DWHA 1MQIA 1IQ7A 4X1BA 1IXHA 1M5CA 2I48A 3O2AA 5K2YA 1MPCA 3MC2A 4YU0A 3W15C 3MAMA 2UYEA 3ONMA 4RJZA 1SDXA 2Z8DA 1MY2A 4YKIA 5DVIA 4X48A 1R9LA 3WAEA 5K2XA 1VE4A 1LBBA 2H9BA 2HEUA 1H43A 2ZYMA 4C0RA 4RYAA 4F18A 2UVGA 5KCJB 5TPAB 4H8JA 1IXGA 5I2KA 3QK6A 4FEBA 2VOZA 3USDA 2NUVA 2H5YA 2QPQA 2OJTA 2OZZA 1IIWA 5FHNA 3FZVA 1VR5A 3F11A 1Z7ME 1NNKA 4AQ4A 1H45A 2FA7A 5AA4B 2DXYA 2NOOA 4FECA 3FXUA 4G8MA 1XVYA 3TTNA 3K01A 1B0LA 3K2DA 1AOVA 1LAXA 1MQGA 1MXYA 4QFOA 1Q1KA 4G77A 1Y3QA 4KHZE 4GVOA 4KCDA 1AL3A 1LFIA 1LBCA 3L6GA 4I1DA 1PB9A 4QRZA 5DVJA 4X9TA 3KZGA 1MDQA 2X7QA 1SI0A 3CSGA 3R26A 4LZ8A 1N3WA 1LAGE 4F2OA 4NMYA 2I0BA 2DXRA 4IO5A 3OSRA 5AA2A 1B5IA 1SYHA 5I84A 1OQGA 4NWCA 3DP8A 3GBBA 3FVOA 4JDFA 3VV5A 1I6AA 2XD2A 2XXWA 3KGCA 4YB5A 4R6KA 3N5LA 1WVJA 3V83A 4G68A 5HBCA 5L9OA 1B1HA 3KSJA 3FIRA 4ZE9A 3C33A 5H8QA 3TTRA 2HCAA 3A3UA 3TKDA 2P0SA 1USYH 4G8NA 1B52A 1B4ZA 1HSLA 3VVEA 3I3VA 3UORA 3KN7A 3IR1A 2Q2AA 1GR2A 1EZ9A 3N6UA 4QSCA 4U4SA 3ZSFA 5H8NB 2B3BA 4GRKA 1QUJA 4NF4B 2B65A 4Z0IA 1YPNA 3MZ9A 1SVXB 4GF8A 5I57A 3LSLA 1MQJA 3FJMA 1ZBMA 2W7YA 3C31A 4F22A 2GHBA 3IOVA 2WKYA 1BP5A 1DPEA 1US4A 1ZU0A 3CG3A 4R73A 4IB2A 2RC8A 1YAEA 4F1VA 4OVJA 3ODBA 4THIA 2ZYKA 4U23A 1XVXA 4EF1A 2XXPA 4QFLA 4GL0A 5CI5A 3OMBA 1ZMGA 1XHYA 2F6PA 4OQOA 1B1XA 1DMBA 1DOTA 5CM6A 4Z7EA 2XD3A 3S2VA 4GD5A 3AXFA 2GFEA 4HTGA 3FV1A 2XHDA 1GV8A 5CMMA 4JWXA 5J1DA 4IY5A 1JVYA 3MZBA 4MLVA 3KOTA 3MWBA 5I58A 3UN6A 5KZTA 2Y7IA 3LR1A 3QUFA 4MBPA 1ZTYA 2M8CA 5H8HA 1UQWA 4OERA 1NKXA 3O6HA 3CG1A 2YPNA 3FD3A 3UIFA 1LGBC 4ZE8A 4PFYA 3K6VA 4BDOA 3HN0A 1QULA 4LUBA 2DWJA 4NF6A 5BUUA 4GOTA 3M3FA 4F1YA 3H06B 2IA4A 1LB9A 3JV9A 2X7PA 3TPAA 4F31B 3S4UA 1CB6A 4N13A 1FTLA 4H5GA 5L8DA 3CRBA 5H8FA 3G3GA 4QHQA 4DE8A 4XIGQ 5EHSA 5I59A 4R2BA 4I8CA 2Q9TA 3N6TA 2O7IA 2QS3A 2Y7RA 1D3KA 2F5XA 4NF5A 2F8DA 1BLFA 4O3BA 1LAFE 4ELPA 3UP9A 3VXBA 5DT6A 3KJTA 1GTKA 3PPQA 2VGQA 1B2HA 5F1QA 3FJGA 1Y1MA 3TTMA 1NNPA 3OEKA 4U21A 2RF1A 1NMUA 3G7WA 4MH5A 4IO3A 3VE1B 1RYOA 3IB2A 3RTWB 3IB1A 3BFUA 2HQ0A 2HFBA 1A54A 2THIA 3A3CA 4GLIA 4EF2A 2QSXA 2Z8FA 5ICTA 3SETA 5I56A 4WEPA 3PPNA 1MY1A 2Q8JA 3WAFA 3MVXA 2ZMBA 2RC9A 1Y1ZA 3FV2A 3QXMA 2UXAA 3CIJA 5JTYA 1TXFA 3MP1A 1HSEA 5A5XA 1MPBA 4YKPA 5FTHA 3ZKLA 5ITPA 3LBSA 2UVJA 4FJPA 1AMFA 2A5TA 4UA8A 3MW0A 3PUWE 4I62A 2PYYA 3E9XA 2HAVA 4DXUA 2E0SA 4YICA 1MM6A 3TTLA 4NWDA 4R2FA 3OO6A 4G8HA 1PC3A 4TLMB 4EQ7A 3DM0A 2F7BA 3BFTA 1CE2A 4F2QA 2Q89A 1A99A 5JK4A 3H6UA 2O68A 1DTGA 2A5SA 1O63A 3OELA 2ABHA 1EZOA 5IAIA 1B5HA 4M4GA 2ONKE 1JW1A 3PMVA 4GFRA 2DWIA 4ZEIA 1OLCA 3B7DA 4R9FA 4DIGA 1AIVA 4LONB 1VFEA 2XXXA 4NF8A 3KOSA 3U72A 3PPRA 5FHMA 1DSNA 4R72A 2G93A 4H1XA 4OYVA 1IZ1A 4RK2A 3B6QA 1GVCA 5I2NA 2DP8A 1UIUA 4KFQA 4ZEDA 4MLQA 4EUOA 2QMXA 1SBPA 1XT8A 3PPPA 3H4ZA 4ZZAA 4OFOA 4RK9A 1B46A 5AE4A 3K02A 1EH3A 3GLBA 2OLBA 1NH7A 3H03A 1JQFA 1MXVA 1P1QA 1TFDA 3ILTB 3TODA 2PX1A 4R75A 3C36A 5CMKA 4KR5A 3K6WA 4F3BA 1A8EA 5CMCA 5TP9A 3MVWA 4MFIA 3A09A 1O7TA 2Y84A 2D3IA 3U94A 5B70A 3H3GA 3CFLA 2B3FA 4KQPA 2XXVA 2PVUA 1B40A 4ELQA 1OVTA 2RC7A 5FHOA 1MRPA 2XXTA 2REGA 4IO4A 3MVYA 3RNNA 3LSWA 1N04A 5CBSA 1ZIUA 3MPLA 4JBZA 3W9WA 2DWAA 3EF7A 2QJEA 3SEUA 4U4XA 5I57B 3O6IA 4PP0A 4POWA 3QSLA 5KCJA 1P1UA 2DVZA 5TPAA 3QAXA 4R6HA 1FQBA 3GXAA 1B7UA 1R6ZA 4JSOA 2GRVA 3T9XB 3S9MC 1LSTA 3HV1A 4LVQA 3IB0A 3MVZA 3OEMA 3PUVE 3O28A 4ECFA 1LB8A 4P0GA 4RPOA 4F1UA 3HHFA 3IOTA 1ATGA 1ANFA 4IGRA 3CVGA 4ONYA 4O3AA 1FQCA 1MY0A 3T9HB 1QW0A 4IO6A 3LUYA 3RN8A 4F19A 1S9TA 5CRYA 4XTCQ 1NNTA 1UTHB 3GBAA 2UVHA 3KFMA 4LZ5A 1LCTA 3GZGA 4Q5TA 4OENA 3D4GA 5L9SA 2CMOA 2DOJA 3O97A 4XKQA 1JETA 2Q2CA 1PBPA 5M2VA 2ANJA 2IEEA 1UTBB 4G4PA 4ZEBA 3IO6A 3SEXA 5CMBA 4M1VA 1MXZA 2XX9A 1B3HA 3RGYA 3U1OA 2O84X 1A8FA 5H8HB 2UYFA 2DYXA 2R71A 1B51A 1BTJA 1SW4A 2OWSA 2I49A 3ZS6A 3CFXA 3MBPA 1MQDA 4AB6A 3RT8A 3T22A 1H76A 3K1PA 1OLAA 2O69A 2ZNTA 3E3KA 3MQ9A 2O1MA 2O6AA 3QIMA 1QKBA 3S9NC 3UA8A 2GHAA 3SEWA 1OMPA 1IEJA 4R6YA 3N94A 4OETA 5DEXB 2QL3A 2UVIA 4L17A 3C34A 4XKPA 3CR9A 4OMBA 4ZS9A 3EHTA 3O6GA 2KLFA 4F3GA 2DSFA 3OO7A 4WEDA 4ZZEA 1FQAA 1II5A 3VDFA 3PD8A 3MPKA 5H8NA 4NF4A 4U22A 4LP2B 4YKJA 4XKNA 1Z7NE 3IJOB 1POY1 3SKPA 4H65A 4EXKA 3TQLA 4JXIA 4KYDA 4PFWA 3IL1B 2F7AA 4KCCA 3L6HA 5KDTB 3MJNA 4Q0CA 5AA2D 4BLAA 3VFJA 1DPPA 2E1SA 1B3FA 2V3QA 1NH8A 4JWOA 3C32A 3KEIA 2OCUA 4N6PA 5H8SA 5AA1A 3FASA 3O29A 1YTVA 3Q26A 2RCAA 2QS2A 4DXBA 4Q8RA 4POXA 4IGTA 2ONRA 1B58A 4F39A 1SW5A 2I6EA 1B4HA 2XXRA 2Z8EA 1WODA 4PFUA 1FQEA 1VFDA 5HPQA 1FTKA 1FW0A 4C1UA 1JVXA 2RKMA 2O7UA 3RTFB 1MH3A 2DVCA 4LQ2A 2V25A 3T93B 4DLDA 3KSXA 1MY3A 1QUIA 5TU0A 1NFTA 3W9VA 3C35A 4DCXA 2RCBA 5JTYB 4YZZA 3E4RA 4EDPA 1D9YA 1JNFA 4DZ1A 2X26A 1A7LA 1FTMA 2F36A 1I6QA 2O1LA 4OXVA 3FVKA 3TFLA 1S50A 1M5EA 1QVSA 3VVDA 1ZKBA 3IO4A 3OXNA 1A55A 4X1DA 2ZYNA 3P7IA 4ZEFA 1Y4TA 5DVFA 4QFPA 1B3GA 2DE3A 2V84A 1OIBA 2NWJA 4JB7A 2XXYA 4FAJA 2FYIA 5LOMA 1UIVA 1B6HA 3IOUA 4ZEKA 3TTKA 3ECRA 1D4NA 3PV0E 3PUXE 3THIA 1SQYA 1N84A 4Q30B 2G29A 4C1TA 2ONSA 3CI8A 3RT6B 2V3TA 2XX8A 3G3HA 3KJ7A 4BDMA 3CSBA 1GGGA 1MXUA 3EN3A 4IO7A 1ELJA 5EHMA 1Q35A 1RKMA 4KYSA 4TLLB 3HO7A 1P99A 1PB8A 4PFTA 2F35A 4QSEA 1Y4CA 3K4UA 3MP8A 3TZAA 1B5JA 3SERA 3SEVA 1NL5A 4HCYA 3SDFA 2BJJX 1BKAA 5I2KB 1N3XA 3TQWA 3VLUA 4HS7A 2PBWA 3FATA 5CBRA 3H6VA 2H4IA 2NVUB 4OFLA 2QMWA 4OESA 1XOCA 4H8IA 4WXJA 2AL4A 3U92A 1TWYA 3UGWA 2RINA 3Q27A 2ZNUA 4OHNA 1DTZA 1EZPA 3N26A 1PEBA 4G68C 4TQUQ 1NNFA 2YJPA 4I9DA 4YMAA 1URGA 3HSTA 1M5FA 4KPTA 4YB7A 5BWJA 3TELA 4QFKA 1MXXA 1B32A 3RLFE 3LSFB 4PQJA 3DELB 4KYEA 2VD2A 4KD5A 1F9BA 3FXRA 5AA3A 3S9EA 3RQTA 1XC1A 2D21A 4G2ZA 2PMSA 5AA2B 1T0KA 2FNCA 4OZ9A 1M5DA 1OQHA 3T9VA 3IAZA 2O51A 4EQBA 3OSQA 2F34A 2XXUA 2DE4A 4LQ5A 4NEDA 2Y7KA 4WKMA 3VXCA 1R1NA 1QUKA 4LZ7A 2VHAA 4G68B 2LAOA 3LC8A 3PU5A 3TCGA 1ZLQA 1R9QA 2V3UA 5H8QB 4DCYA 4K3FA 3SESA 2H25A 3KN3A 3D4CA 3C9HA 5DTBA 3Q28A 2HAUA 4ZDMA 1H3DA 2HZKA 2XXIA 3EQ1A 3HCQA 1I6BA 3E13X 4GIZA 1TFAA 5DYHA 3H6TA 2R6GE 2VD3A 3LSXA 4DDDA 4JSDA 4H5FA 4U1ZA 2P2AA 3R7XA 4FEDA 4E0WA 2F6GA 4GQOA 2DS9A 4QFNA 3RPWA 3R6UA 4GXAA 4ESWA 2R9JA 1US5A 4P11A 4IO2A 1FCKA 4YKKA 1PBQA 3I6VA 1Y3NA 3PD9A 3TCHA 4UACA 1JEVA 4BDNA 3EHSA 4GL8A 3SEYA 3V89B 3K6XA 1IUDA 2H98A 4PETA 1PB7A 2ESNA 3DP6A 2I4CA 4GWOA 4HW8A 1SD3A 3EPEA 3PUYE 3PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QS4A 1IXCA 1MDP1 4BDLA 1M5BA 2Z23A 4ISUA 1J1NA 4QF9A 5AA4A 2F78A 3TEPA 5DW8A 3KN8A 3FVGA 1NUWA 4OFJA 5EYFA 1LBZA 2ALUA 2ZNSA 4R9GA 2XXHA 3IFCA 3KBRA 2QS1A 2ZYOA 3FJ7A 3T66A 3MP6A 1YCJA 2HXWA 1SW1A 4AS4A 1EYJA 1MS7A 4NF0A 3TAJA 2QRYA 1QKAA 3OOAA 1NV6A 3OENA 3IX1A 1NV3A 4FBPA 1MG1A 4JVIA 1AH5A 3TDJA 3G3KA 1BIYA 4F29A 1SW2A 2I0CA 2KQZA 4GXSB 1FPDA 5ET6A 3TUSA 3O9PA 5I58B 1WDNA 1Y20A 3T96B 3HPIA 3VLWA 3IOWA 1MM7A 3FGSA 3H7MA 1JEUA 4H6DA 3KBZA 4H67A 4BDQA 1O64A 4IY6A 5HM4B 1MH4A 3LUZA 2YLNA 2I4BA 2F7CA 3BKIB 4JWYA 3PMWA 4ESXA 1XS5A 3K1MA 5F7VA 3O66A 4NF6B 4MAGA 3IK6B 1QGXA 3OO8A 1MXWA 4AB5A 4H46A 1LFGA 1FPBA 3RYDA 4KI0E 1A40A 4U1OA 4DXCA 4MMPA 3K00A 2PT2A 4MF3A 5H8FB 2DQVA 2PT1A 1P1NA 5I59B 1IMEA 2PCRA 2L5VA 1Y9UA 4R74A 4PF6A 1EYIA 3Q25A 3ZKKA 2ZXTA 4FORA 4HCWA 2Y7WA 3OO9A 1B3EA 4LATA 1S7YA 4G61A 4LA9A 4PGNA 1USYE 4GWSA 3M8UA 3OD7A 3PMXA 4NF5B 1UTHA 3B6WA 1TT1A 4PDHA 4OEUA 3V5AA 3M3KA 3M3LA 1B05A 2XXQA 1LAHE 2ZZXA 4NAPA 1PDAA 3FVNA 4RPNA 5ICQA 2OWTA 5IZ1A 5I3SA 4QSDA 3HHGA 1UTBA 1URDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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