4WEPA

Apo yehz from escerichia coli
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
ASPVKVGSKIDTEGALLGNIILQVLESHGVPTVNKVQLGTTPVVRGAITSGELDIYPEYTGNGAFFFKDENDAAWKNAQQGYEKVKKLDSEHNKLIWLTPAPANNTWTIAVRQDVAEKNKLTSLADLSRYLQEGGTFKLAASAEFIERADALPAFEKAYGFKLGQDQLLSLAGGDTAVTIKAAAQQTSGVNAAMAYGTDGPVAALGLQTLSDPQGVQPIYAPAPVVRESVLREYPQMAQWLQPVFASLDAKTLQQLNASIAVEGLDAKKVAADYLKQKGWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title YehZYXW of Escherichia coli Is a Low-Affinity, Non-Osmoregulatory Betaine-Specific ABC Transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative osmoprotectant uptake system substrate-binding prot
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli str. k-12 substr. mg1655
total genus 105
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4wepA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4wepA02
4N07A 1FQCA 5CC2A 4GRKA 3DP6A 1A7LA 1B7ZA 1SD3A 3SERA 5DYHA 3KSJA 2ONSA 5I2KB 4IY6A 3G3KA 1AOVA 4NF5A 4F3BA 1R9LA 1P1OA 3G3GA 3W15C 3ZKLA 4MFIA 1EU8A 4M1VA 4H6DA 1EZPA 4YZZA 4EXKA 2F35A 1S9TA 1I6QA 4YKKA 3LSWA 2UVHA 4TLLB 3PUWE 3L6HA 3U92A 3K6WA 3QIMA 3CFLA 2PYYA 3O6HA 4H0WA 3D4GA 4F1VA 2HXWA 1MQJA 1FTMA 3H7MA 4C0RA 2PX1A 1OVBA 3F11A 4Z7EA 3KEIA 3ZKKA 1RYOA 3VXCA 3O97A 3I6VA 2Y7IA 3TTNA 5AA2D 3WAFA 5EHMA 3H6TA 4FATA 1URGA 1DSNA 4ZEDA 4X48A 3IK6B 3T9HB 2I3WA 2ANJA 3TDJA 1B7UA 1JQFA 2XXUA 3U93A 1NFTA 4UACA 4EQ7A 1MY4A 1JETA 2AL5A 5CMBA 4IO4A 4ZE9A 3UGWA 4Q30B 4NWCA 2QRYA 1OMPA 2P1SA 4DCYA 3TCFA 3IOTA 4ZEBA 4DXBA 3N94A 1US5A 2OJTA 4LA9A 3THIA 4N13A 4ZS9A 3QUFA 1J1NA 3H6UA 1QUIA 2XXRA 4JDFA 4RK9A 3CG3A 1SBPA 4FORA 1B46A 1LCTA 4AQ4A 1H43A 1UTBB 4R73A 4O3CA 2H9BA 3BBRA 2ABHA 1UIUA 5AA3A 1MY1A 4YB6A 3VVDA 4PFYA 3OOAA 3PPRA 1SW4A 3FVNA 4TOZA 5I2KA 3RTWB 1Y4TA 4I62A 1MXZA 1QKAA 5I58B 3PGFA 1LCFA 3FATA 4IO6A 1OLAA 4PFWA 4RA1A 2GHBA 3UIFA 5I59B 1Z7NE 3M3FA 4EUOA 4DIGA 2HAUA 4DE8A 4MLVA 2X7PA 3UN6A 1O63A 5I2NB 3VVFA 1ANFA 3PMWA 4OMBA 4YB5A 5CBRA 3PUYE 4LUBA 3N5LA 3KSXA 3T9UA 2V3TA 3RGYA 3I3VA 1O64A 1QJMA 2QS1A 3O66A 3K0VA 3OMBA 2OLBA 4GL0A 4JXIA 1I6BA 3TELA 4G4PA 4GOTA 4U1ZA 3U1OA 2ZYMA 4WXJA 3S4UA 1NNTA 2DE2A 3U72A 3PMXA 3GZGA 3VV5A 1PBPA 1IXCA 5I57B 3HHGA 4F22A 3K6UA 3RUMA 2IEEA 4HCYA 3FXUA 3SEXA 3KOSA 1FTLA 3TCHA 3SKPA 3QXMA 4WKMA 5F1QA 4NWDA 5CBSA 1MPBA 3MPKA 5FTHA 3PPNA 1S7YA 1B5HA 3M3LA 1HSJA 2DWJA 5FTIA 3C4MA 3FVOA 3G3IA 3JZJA 4I9DA 4LZ8A 2XXPA 3FVGA 1DMBA 4BDNA 2I49A 2XHDA 2FA7A 4HTGA 1TXFA 4GD5A 4BDOA 4H67A 4H8JA 4HS7A 4ZEIA 2GRVA 4LP2B 1VR5A 1LAXA 3H06B 4OERA 3H3GA 4NF4B 4PP0A 1F9BA 5TPAB 5AA4A 2ALUA 2PT2A 2F97A 3CVGA 1UQWA 3M8UA 3KG2A 5L8DA 4OFLA 5CM6A 2RC9A 3G3HA 3TODA 4UA8A 3IL1B 5AA1A 5EYFA 1POTA 3LBSA 4FEDA 5JK4A 1N0TA 1AMFA 1AIVA 1LBCA 2XX9A 4OQOA 2VGQA 3BFTA 4RK2A 1EZOA 2I0BA 3RLFE 3ODBA 3MQ9A 3MZ9A 3TCGA 1VSOA 5CMMA 5I2NA 2Q8JA 3U94A 5H8NA 3OEKA 3MWBA 4R2FA 4OXVA 3CIJA 4IO2A 1MH4A 3V8XB 1PB9A 1GVCA 3C9HA 3MVWA 2P2AA 1LLSA 3OXNA 2YLNA 3O9PA 3OSRA 4QFKA 1YAEA 3GBBA 4KFQA 4LONB 3MJNA 1M5DA 3IX1A 2F5XA 1QUKA 2ZNUA 3PPPA 1FTKA 3ZS6A 1USYH 3K6XA 1XS5A 3OEMA 3G3FA 3TAJA 4DXUA 1BIYA 3N26A 1H45A 1DOTA 3PUZE 2D5WA 1LBBA 3LSLA 3K4UA 2Q2CA 2F8DA 5CMKA 2R71A 1IEJA 2UVJA 1AH5A 2Y7KA 3E13X 2OK2A 1FQAA 3L6GA 1SYHA 1PC3A 4ND9A 2DWAA 3QK6A 2KLFA 3OO9A 3LUYA 3FXQA 4KHZE 4IO3A 4NF4A 2VHAA 1MPCA 4R6YA 1POY1 3OO8A 5DVIA 4ZE8A 2Z22A 5H8FA 4ELOA 2NVUB 2NWJA 2RKMA 1LGBC 1UIVA 3ONMA 1ZMGA 3G7WA 3JYRA 4ISUA 3EHUA 4QFNA 1MY3A 3KBRA 3FGSA 3PMVA 4NF8B 3E9XA 3UK4A 4LQ5A 1PB7A 2O7UA 1B1XA 2Y7RA 3CFXA 1NNPA 3HV1A 3S9LC 1EH3A 2QMWA 1FTOA 4YAHX 3SEUA 4KI0E 2Y84A 3DELB 4M4GA 3VE1B 1B4HA 1LAHE 1MXXA 2FNCA 2REJA 1SW5A 3I5OA 3S9NC 5BUUA 2ZMBA 4KYEA 3O2AA 3VVEA 2GH9A 1TWYA 2I58A 3K6VA 2F36A 1N04A 4XIGQ 1IITA 3RPWA 3MC2A 4RY1A 1B3HA 4KPTA 1VE4A 1WVJA 1P1QA 4F3SA 4ESWA 4GVOA 3O29A 2DSFA 1PEBA 2XXHA 5KDTA 4F1UA 3PU5A 3SEYA 4P0GA 1Y3QA 2DWIA 3HN0A 5CRYA 4LATA 3FASA 1MDQA 3IOVA 1XVYA 4C1TA 1YTVA 3IB0A 4ZZEA 2DVZA 5CMCA 1B0HA 4QSDA 4OETA 2PBWA 2REGA 1MXWA 4ZDMA 2A5TA 2ZNSA 4K3FA 3EF7A 1ZU0A 1DPPA 2X26A 1GR2A 5H8HA 1DTGA 3QAXA 3TYHA 2DE3A 4OESA 1D9YA 3B7DA 4BDRA 1N84A 3OD7A 2HFBA 4PE5B 4BDLA 4BLAA 4MH5A 1T0KA 3K1MA 3VFJA 2F34A 4PFUA 1A54A 4N6PA 1BKAA 2QS2A 1JEUA 2NXOA 4QFLA 2PT1A 4R74A 1M5BA 2O69A 2G93A 2QJEA 5BWJA 1OQHA 2ONKE 4IO7A 2O84X 3VLVA 3T9XB 5EHSA 4NF8A 1NL5A 5AA4B 3GLBA 5A5XA 1QULA 4RJZA 1B58A 1SI1A 1MY0A 3B6WA 1MDP1 2QPQA 3A3CA 4OEVA 4BDMA 4GQOA 5L9OA 3FIRA 3DM0A 2DQVA 4F2QA 2XXXA 4YKPA 2Q2AA 1JW4A 3EN3A 4PQJA 1MQGA 2F6PA 1H76A 3N6UA 4MLQA 1OQGA 1Q1KA 4IGRA 2XX7A 3MW0A 4TQUQ 1XVXA 3H6WA 4JB7A 1ELJA 1JEVA 4XKQA 3UP9A 3G3JA 3VXBA 1TT1A 2D21A 1ZLQA 3MUQA 4OYVA 3TKDA 1WODA 1N3XA 3MP1A 3HHFA 4GWOA 4QSCA 1LAFE 3FD3A 1JVXA 5H8NB 3IOUA 3V83A 1PB8A 1VFEA 2DS9A 2DXRA 4H65A 5LOMA 4XKNA 3M3KA 1B7HA 3O28A 2DE4A 1A99A 1LB8A 1NH8A 3T93B 2H98A 1B5IA 1MPDA 4F18A 2A5SA 3C35A 3C32A 4ZEFA 2F78A 1FQEA 2XXWA 1LB9A 2R9JA 4H8IA 2XXQA 2V84A 2UYFA 3PV0E 1Y3PA 4C1UA 4YMBA 3A09A 3OELA 4OHNA 2OWTA 1MM6A 5KZTA 2AYSA 3K2DA 4IY5A 4E0WA 3GBAA 3RT6B 1HSLA 1URDA 4GXSB 3CSBA 4R9FA 3TQWA 1IXIA 3ECRA 3V5AA 1XC1A 3KFMA 5I84A 2WKYA 1JW5A 3R7XA 3EHSA 2I6EA 4P11A 2H4IA 2AL4A 4LQ2A 3FJGA 5B7DA 3IO4A 3MVXA 4FECA 5J1DA 1SYIA 2I48A 4QRZA 5H8FB 3H03A 4TLMB 1S50A 5FHMA 3SEVA 3C31A 4F3PA 3E3KA 2IA4A 1B32A 3C36A 2V25A 1RYXA 1OVTA 1GTKA 4RXLA 1ATGA 3TTLA 5AA2B 5DEXB 5ICTA 5DVJA 4OEUA 1B3FA 4G8NA 3LC8A 1MRPA 1AL3A 3FZVA 3MBPA 3E4RA 4YICA 1IXHA 1EZ9A 1BLFA 2O1LA 2VD2A 2HQ0A 3IAZA 1NH7A 4EF2A 4ESXA 1XHYA 2RC8A 5I56B 5H8SA 1UTHA 5HPQA 3RT8A 1JVYA 2FYIA 1BP5A 1US4A 4G68C 5ITOA 4H5FA 3CRBA 4GXAA 2I0CA 3MZ1A 5ELVA 3V89B 5IAIA 2E0SA 4U23A 4XTCQ 2B3FA 3PD8A 2W7YA 5KDTB 4IGTA 1B3LA 4X1BA 4I1DA 1A8FA 1MQIA 4R2BA 2YPNA 3O6GA 4EDPA 2GHAA 2OBGA 1FCKA 4YMAA 1MM7A 4FJPA 2O51A 5ISUA 4X1DA 2HZLA 1FQFA 1ZKBA 3SETA 5HBCA 3C33A 4G77A 2A5TB 3W9VA 5H8HB 1Y9UA 4G68A 4DLDA 2ESNA 3KN7A 2QS3A 4F3GA 3VLWA 4ZECA 1PDAA 1B4ZA 2F6GA 1BTJA 2XXTA 1B3GA 5HM4B 2Z23A 3QSLA 3RTFB 3MP8A 3T22A 4EXLA 2HAVA 4X9TA 4WEPA 2CZLA 1NKXA 2V93A 4JWXA 1A8EA 1LFGA 3HPIA 3FV2A 4R75A 4Q8RA 2NUVA 3S2VA 1A40A 4KCDA 3O6IA 1QKBA 4KD5A 3K01A 5A5XB 2B65A 5AA2A 3MZBA 5DEXA 1A55A 5K2YA 5H8QB 4EQ9A 3KN8A 3MPLA 3CFZA 4OFOA 3R26A 2THIA 2ZYNA 3IJXB 3OSQA 3MVYA 1JNFA 5I56A 2DWHA 2OZZA 2DVCA 3Q28A 3HO7A 2ZNTA 1IIWA 2UVIA 2XX8A 3Q27A 5DVFA 2I3VA 2H99A 3K02A 1MXUA 1DPEA 3BFUA 4IB2A 2HZKA 2V3UA 1PBQA 3VDFA 5TU0A 5JEIA 3MVZA 1FTJA 4EF1A 2NOOA 2F7CA 4PETA 1Y1MA 2DP8A 4QF9A 1JW1A 2DXYA 4NE4A 3LSFB 3OO7A 4YKJA 4YU0A 3OO6A 1II5A 3EQ1A 1XOCA 3B6TA 3ILTB 4NTLA 4LZ5A 3T96B 2OCUA 2F7AA 4KR5A 4OTEA 3K1PA 1B52A 3UORA 5KCJA 4QFOA 3CR9A 4U2RA 4FE8A 4R6HA 4ELQA 3QYTA 3N6TA 4OFJA 2B3BA 4AB5A 2Q9TA 4FIMA 2Z8EA 3T9VA 5ICQA 3ILUB 2RCAA 4KCCA 1WDNA 5JTYB 3KGCA 4JWOA 4U21A 5IKBA 1MQDA 2O7IA 1B2HA 3TEPA 2Q89A 1YCJA 4MBPA 4Q5TA 1D4NA 3RY3A 4QSEA 2HEUA 3C34A 2RF1A 1CB6A 3QUJA 4RNSA 4ECFA 1IUDA 4O3BA 1TFAA 4BDQA 2ZYKA 2XD3A 4QHQA 1XT8A 3BKIB 4JWYA 1RKMA 3FVKA 3D4CA 4FEBA 4ONYA 4U4XA 1OIBA 5CI5A 3PUVE 4L17A 3IB1A 1NNKA 2ZYOA 2O6AA 3R6UA 2OWSA 1YPNA 1B51A 4DZ1A 4GL8A 2QS4A 5H8QA 3U8QA 4NEDA 1VFDA 3IORA 3S9EA 3S9MC 5DT6A 4H5GA 3KN3A 3SESA 3WAEA 1QUJA 1SW2A 2Z8FA 2M8CA 1QW0A 5TP9B 1IQ7A 1M5CA 4DXCA 1FQDA 3MAMA 2UVGA 4MF3A 3H6VA 3TFLA 2LAOA 3KZGA 4YKIA 2G29A 1MS7A 5ITPA 4FAJA 4HW8A 2XXIA 3TTKA 4OWDA 1UTHB 4DDDA 1URSA 3PD9A 4R72A 3ZSFA 4G2ZA 1B5JA 3CG1A 3CSGA 3FJMA 1FQBA 2RC7A 2H5YA 4U1OA 3PPQA 1SDXA 4LZ7A 4KYDA 4F29A 2V3QA 2XD2A 4F1YA 4QFPA 4P0IA 3Q26A 1O7TA 4OVJA 5FHOA 2R6GE 4I8CA 1NMUA 3TMGA 1NNFA 1ZJLA 1GV8A 5JTYA 2Y7WA 3TPAA 1Z7ME 1DTZA 3MP6A 1MG1A 1P1WA 4Z0IA 4XKPA 4U22A 1ZIUA 2VD3A 3FV1A 4XXUA 5DTBA 1MH3A 3VLUA 4G8HA 4H1XA 4F19A 3DLNA 1LFIA 1N3WA 4WEDA 1GGGA 1CE2A 4G68B 3IR1A 1H3DA 4Q0CA 1ZTYA 5L9SA 5L9MA 2YJPA 4KYSA 4ELRA 2RCBA 3TQLA 2BJJX 1B0LA 1I69A 3B6QA 1B1HA 3TTRA 2Y7PA 1SI0A 2HCAA 3RN8A 3A3UA 4F39A 1UTBA 1N7XA 4ZZAA 3P7IA 3KJ7A 4F2OA 3H4ZA 4U4SA 2X7QA 2UXAA 4GLIA 1IXGA 1HSEA 3KJTA 3TZAA 3IO6A 5TP9A 4NF6B 4E0XA 4ZEKA 3TTMA 2GFEA 1H44A 1FW0A 1M5FA 1N76A 3IJOB 2P0SA 2Q88A 3W9WA 1LSTA 1OLCA 4G8MA 4LVQA 2DOJA 5I58A 4RYAA 3FXRA 2E1SA 4DCXA 2Z8DA 4EQBA 2QL3A 4F31B 1Y1ZA 1SVXB 1R1NA 2ZXTA 5I59A 4HCWA 3IOWA 4JSDA 2QSXA 1MXVA 1Y20A 2AIXA 4R9GA 3GXAA 1LFHA 4NF5B 4OZ9A 1N7WA 2O1MA 1MXYA 3TUSA 2QMXA 2VP1A 1Y4CA 4NMYA 3UA8A 1QVSA 2ONRA 4O3AA 3DP4A 4XKRA 3RQTA 2CMOA 4OENA 2I4BA 1IZ1A 1Y3NA 2XXYA 4POWA 2PVUA 3OENA 2D3IA 3PUXE 5KCJB 1Q35A 3SDFA 3EHTA 4THIA 3HSTA 2VOZA 1SW1A 1TFDA 5F7VA 1B3EA 2PMSA 3LR1A 2XXVA 4ELPA 5I57A 2I4CA 4R6KA 1D9VA 3IB2A 1ZBMA 4JSOA 3Q25A 4AB6A 1P1NA 1B05A 5K2XA 3USDA 3KOTA 1KWHA 4KQPA 1MQHA 2F7BA 1B40A 1R9QA 1P99A 4JBZA 1USYE 1B6HA 3CI8A 3PPOA 2H25A 5B70A 3RNNA 1M5EA 3K00A 3Q29A 3HCQA 3FUZA 5AE4A 1D3KA 5FHNA 1LAGE 4RPNA 3AXFA 1B9JA 3T66A 2UYEA 1R6ZA 3FJ7A 4PFTA 5TPAA 4GIZA 4POXA 3DP8A 1I6AA 3K1NA 2O68A 3JV9A 1SQYA 3EPEA 4IO5A 4NF6A 4RPOA 4GFRA 3LSXA 2DYXA 5M2VA 1P1UA 4YB7A 2RINA 1L5TA 3SEWA 4GF8A 1MY2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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