4WEPA

Apo yehz from escerichia coli
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
ASPVKVGSKIDTEGALLGNIILQVLESHGVPTVNKVQLGTTPVVRGAITSGELDIYPEYTGNGAFFFKDENDAAWKNAQQGYEKVKKLDSEHNKLIWLTPAPANNTWTIAVRQDVAEKNKLTSLADLSRYLQEGGTFKLAASAEFIERADALPAFEKAYGFKLGQDQLLSLAGGDTAVTIKAAAQQTSGVNAAMAYGTDGPVAALGLQTLSDPQGVQPIYAPAPVVRESVLREYPQMAQWLQPVFASLDAKTLQQLNASIAVEGLDAKKVAADYLKQKGWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title YehZYXW of Escherichia coli Is a Low-Affinity, Non-Osmoregulatory Betaine-Specific ABC Transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative osmoprotectant uptake system substrate-binding prot
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli str. k-12 substr. mg1655
total genus 105
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4wepA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4wepA02
2I4BA 4XKRA 1PB7A 3MZ9A 2X7PA 3FASA 3KJ7A 1FTLA 2THIA 3N6TA 1XOCA 3TTKA 1MY3A 3LSXA 2FYIA 4IO5A 2OWTA 5B7DA 2VOZA 5DVJA 1ELJA 3H6WA 3OEKA 1LAGE 2F78A 2REJA 3QYTA 3A3UA 1XT8A 1MQDA 3UIFA 1P99A 5I58A 4HS7A 3O6GA 4YAHX 3KOTA 3OMBA 2F5XA 3VFJA 4XKQA 4NF5A 3U8QA 2O7UA 1IITA 3RTFB 3CFLA 4RK2A 1MQGA 2I0BA 3KZGA 4C1TA 2FNCA 4YMBA 3T9XB 3T9HB 1I6AA 4DCYA 5CC2A 4Q8RA 4R6HA 4ELOA 4IO4A 4EQ9A 3P7IA 4DDDA 1SW4A 1II5A 4GL0A 1B05A 4ZEDA 4H8JA 4POWA 3U92A 2ZNTA 1ZU0A 1GV8A 2V25A 1XHYA 3ODBA 2LAOA 1GTKA 1XVXA 2G93A 1A55A 4LZ8A 2NXOA 4R6KA 4Q0CA 3E13X 4EXLA 1JVYA 3DP4A 1N3WA 5L8DA 2RC7A 1TFDA 4O3CA 3WAEA 1FQEA 3VXBA 3EHUA 4ISUA 5FHOA 4JDFA 1GGGA 2IEEA 4G8NA 3SEXA 4BDLA 1QUKA 2I6EA 4ZEBA 4I9DA 1R1NA 1B1HA 3T66A 2F6PA 5JTYB 4R9GA 3Q29A 1IXHA 5FTIA 1FQBA 4ELQA 3PMXA 1B32A 4HTGA 3RT8A 1S50A 4RYAA 4OZ9A 4OERA 2P1SA 3PUVE 4MLVA 3U1OA 2F35A 3FJ7A 2UVIA 4WEPA 4G77A 4OFOA 4XKPA 4XXUA 2DVCA 4FATA 1A8FA 1MH3A 4R74A 3C35A 5I59B 3UK4A 3PPNA 1ZKBA 1Y20A 5H8NB 2FA7A 4UA8A 3U72A 4YZZA 3CG1A 1IXIA 3TELA 3O66A 4EF2A 5I56B 5KDTA 2HXWA 1IXGA 3TEPA 2XXHA 2Q2AA 2Y7IA 2I3WA 3N6UA 3FATA 2XXXA 4L17A 5B70A 4BLAA 3HO7A 1JNFA 3OO9A 4H65A 4KPTA 3IB0A 1S9TA 3CR9A 1H76A 1MS7A 4XKNA 2Y84A 4THIA 3TODA 4BDRA 1R9LA 1LFIA 3UORA 4YKKA 4F31B 2O1MA 2H25A 4OHNA 5HPQA 4AQ4A 5I2NA 3IR1A 3SETA 2V84A 3GLBA 4OWDA 2HAUA 3R7XA 2XX7A 3FUZA 4H8IA 1LSTA 2V3UA 3S9LC 3PPPA 3FGSA 1MH4A 3QUJA 3KN3A 3VDFA 5F7VA 1B4ZA 2O1LA 5KZTA 1MM6A 1B5HA 2Z23A 1TFAA 2PX1A 3N94A 2QS4A 5I58B 3B6QA 1N7XA 3H6TA 1CE2A 2YLNA 1N3XA 2W7YA 2GHBA 2Q2CA 1LBCA 4QFKA 2Q88A 2D5WA 1OMPA 4NF5B 1N76A 3I5OA 3RPWA 1PB9A 3O97A 1MY1A 3FZVA 5ICQA 1H3DA 4OFLA 5KCJB 1LAHE 4R2BA 4NWCA 3RT6B 3C36A 4Q5TA 1LFGA 4RA1A 3O9PA 5A5XA 2OWSA 4BDNA 3F11A 4JWXA 2F7CA 3TFLA 1N84A 1D3KA 3Q27A 1POTA 2KLFA 3THIA 3O2AA 3H3GA 5FHNA 1SYHA 3K4UA 4OMBA 4BDMA 3EHSA 5TPAA 4QSCA 2DE4A 4QFPA 4NTLA 2HCAA 2ABHA 1TWYA 3SERA 3BKIB 4OVJA 4LQ2A 3BFUA 4EQ7A 5L9SA 1Q35A 3IORA 4ECFA 4P11A 4KR5A 4P0GA 3PGFA 1FTJA 3OO8A 1M5DA 2OZZA 3VE1B 4ZECA 1B3LA 4ONYA 4JBZA 4QFOA 2F6GA 4KI0E 4OQOA 2DP8A 2R6GE 2ZNUA 3T9VA 2QS2A 1MXUA 3OO6A 2R71A 3EPEA 3KFMA 4OFJA 5AA2D 3FD3A 4ZE9A 5DEXB 4KQPA 1TT1A 5JTYA 1BP5A 4DLDA 4LONB 4OEVA 1SI0A 1MRPA 1NMUA 1MG1A 3O28A 1B3GA 3QSLA 2E1SA 3MVWA 2ZYKA 3E9XA 4G8HA 5AE4A 2RCAA 3TZAA 4BDOA 3KSJA 2Q8JA 3MZ1A 3FXRA 3CSGA 3FIRA 3O29A 3R6UA 1SBPA 2ESNA 3KSXA 1YCJA 4TOZA 3MWBA 1MPBA 1B7ZA 4ZDMA 3SKPA 1IEJA 2GRVA 2UXAA 4I1DA 1IZ1A 4LQ5A 1Z7ME 3IO4A 1US4A 2Y7RA 1SVXB 3SEYA 1USYE 5I56A 1SW5A 4IO3A 2HZLA 4QFLA 1IIWA 3T22A 3MPLA 2AIXA 3MQ9A 2F34A 1ZMGA 1NH7A 4HCWA 2QRYA 4KHZE 1B5IA 5CM6A 4OTEA 4F29A 2OLBA 4OEUA 1D9YA 5I2NB 1LGBC 3EN3A 4U1OA 3CG3A 4F3PA 4YMAA 4GRKA 3K02A 3G3GA 1Y9UA 2HZKA 3IO6A 2GHAA 3B7DA 2DSFA 4KD5A 5DT6A 1I69A 4WXJA 1OVBA 4RPOA 1OLAA 2O69A 4F2QA 5HBCA 4PFYA 3M8UA 2B3BA 4R9FA 2D21A 1QUIA 2G29A 5AA3A 1S7YA 4G68A 1YAEA 2DE3A 2DWIA 5FHMA 1A8EA 2A5SA 1SQYA 3ZKLA 2V93A 2F7BA 3K00A 4LUBA 3K6XA 4F3BA 1IUDA 1JW5A 4TQUQ 4YU0A 2XXWA 4U21A 4QRZA 3ZKKA 4NF4B 1MY0A 3TCFA 1JVXA 4QSDA 1AIVA 4AB6A 2DVZA 2PT2A 3RGYA 1KWHA 5A5XB 4K3FA 4YKPA 3U93A 3TUSA 3OENA 4BDQA 1POY1 3MVZA 5KCJA 5CMMA 1JW4A 1L5TA 4E0XA 4HW8A 1FTMA 3N5LA 3TYHA 4F18A 4DXCA 3TTNA 2P0SA 1OQGA 1Y4CA 2UVJA 1YTVA 5TPAB 4YB7A 3DM0A 4KCCA 4IO7A 3TDJA 3MUQA 4ESWA 1PDAA 4DXUA 5M2VA 3PUZE 3IAZA 3SESA 4DCXA 4H5GA 4KYEA 1R6ZA 2PMSA 2XXTA 3DELB 1EZOA 1M5FA 1SW1A 1VE4A 3QK6A 4YKJA 5AA2B 2XXUA 4XTCQ 3TMGA 4GVOA 5AA4B 1T0KA 1DPEA 2OCUA 2HFBA 3MAMA 3ONMA 4GWOA 3VLUA 1ZBMA 4MBPA 1B58A 3MZBA 5DEXA 1DTGA 2XX9A 1B1XA 2DOJA 4YKIA 4ESXA 2HAVA 3FJMA 2PYYA 3PPRA 5CRYA 3G3FA 3M3LA 1B0HA 3IOVA 3KN7A 2X26A 3K6UA 4WEDA 1PB8A 2RINA 4ZEIA 4LATA 3DP6A 1ATGA 1N04A 3LSLA 5DVFA 1NNTA 3I3VA 1SW2A 4N13A 5HM4B 3OELA 5L9OA 2QMWA 4NE4A 4RPNA 2V3QA 3K6WA 2F8DA 4TLLB 3O6HA 3W15C 4IGRA 4DXBA 1DMBA 3V5AA 1RYOA 3PMWA 5BWJA 3OSQA 5ISUA 4IGTA 4NMYA 2I48A 1URGA 3TTRA 3VVEA 4EXKA 2Q89A 1MXXA 4KYDA 5H8FA 1QW0A 4R6YA 2RC9A 3AXFA 1PBPA 3RUMA 1MXWA 2F36A 1NKXA 1MXYA 2UVHA 3KN8A 4U4XA 4PFWA 3V8XB 1UTBB 2D3IA 2AL4A 2NVUB 4MH5A 3VLVA 3K0VA 3SDFA 3TTLA 1ZIUA 2V3TA 2GFEA 2REGA 4OYVA 3S9EA 3K01A 3W9WA 4LZ5A 3IX1A 2NWJA 1HSEA 3K6VA 2ZNSA 4FEDA 2XHDA 1HSJA 4PFTA 4G68B 1A40A 3IJOB 1NNKA 3TCHA 3T96B 3PUXE 1P1OA 3ZSFA 3FVKA 3B6TA 2Z8FA 4R73A 4IY6A 2RC8A 2ZYMA 3PUWE 3TAJA 2OK2A 2XD3A 1LLSA 3PUYE 3KG2A 1MQIA 1LCTA 5CMBA 3IB2A 3DP8A 2VGQA 1UQWA 1QVSA 3A09A 2B3FA 2PBWA 1O63A 3SEUA 4FJPA 4NF4A 4F1YA 4OENA 4OXVA 5CI5A 4ZS9A 1BIYA 2AYSA 1H44A 5I2KB 1B7UA 2YJPA 3EQ1A 3E3KA 1MPCA 3ECRA 1B51A 5I57A 1QKAA 4ZZAA 4DIGA 1SDXA 1B7HA 4JB7A 4E0WA 3TTMA 4TLMB 3K1MA 1RKMA 4RXLA 3SEVA 3WAFA 3V83A 2E0SA 2DXYA 3QUFA 3M3FA 4OETA 4YICA 1YPNA 3JV9A 2R9JA 4JWYA 2OJTA 1BTJA 2M8CA 2Z8DA 5K2XA 1LFHA 3G3HA 5DTBA 5AA1A 3G7WA 3LBSA 1JETA 1Q1KA 4O3BA 4NF6A 1VSOA 3RNNA 5L9MA 1LB8A 2O68A 5AA2A 1GR2A 1LCFA 3E4RA 3MPKA 3HSTA 2H9BA 4FEBA 2IA4A 1B40A 1NL5A 5AA4A 1N7WA 2VHAA 1LBBA 1AH5A 3M3KA 1H43A 2VD2A 4GIZA 3OO7A 4FE8A 1TXFA 2H98A 4IY5A 2QSXA 4EDPA 2A5TA 4RY1A 5I84A 1DOTA 3VLWA 1Y4TA 4G8MA 2ONRA 4FIMA 1LAXA 3O6IA 4H6DA 2DQVA 3GBBA 1A99A 3IOUA 4OESA 3S9NC 3FVOA 3FXUA 3G3KA 4H1XA 3EF7A 3FV1A 4QSEA 1B2HA 3H06B 1MY2A 1H45A 3G3IA 4O3AA 2VP1A 4GFRA 4X1DA 4DE8A 3QXMA 4JSOA 1MQJA 1ZLQA 3C9HA 4N6PA 4FECA 1Y1MA 3EHTA 3MW0A 1P1QA 2O84X 2B65A 4M1VA 3OEMA 3FJGA 2O6AA 2RCBA 4F3GA 4DZ1A 2I3VA 5H8FB 2X7QA 1SI1A 1WODA 2NUVA 1OLCA 1LB9A 2UYFA 1P1UA 3C4MA 1D9VA 2ONKE 1UIUA 2XXIA 3VV5A 2RKMA 1BKAA 4POXA 1B0LA 3D4GA 4GD5A 1FCKA 4F19A 1JEUA 4IO2A 1JQFA 1NNPA 4KYSA 1NH8A 5H8QB 4C0RA 5J1DA 3KGCA 4NEDA 2I4CA 3I6VA 2UYEA 1MM7A 3FVNA 3MJNA 1UTBA 3PD9A 1PC3A 1FW0A 1ZJLA 4FORA 2XXYA 3LR1A 1URDA 4XIGQ 4G4PA 4ND9A 2CMOA 3H7MA 3CFXA 2Y7WA 5FTHA 4X48A 3CI8A 1B52A 1OVTA 5EHMA 1Y3QA 1B46A 1M5CA 3ZS6A 1VR5A 1B3EA 4QF9A 3GBAA 3PV0E 3IJXB 4GXAA 2DXRA 3HHFA 1DTZA 2XXPA 3TQLA 3MP1A 1M5EA 4PP0A 4F39A 5IAIA 4I62A 1EH3A 4U2RA 1O64A 3S4UA 2H5YA 5BUUA 1URSA 4EQBA 4EUOA 5I57B 1EZPA 3C34A 5EHSA 5I2KA 3VXCA 1B3FA 4LZ7A 4LA9A 4G68C 3IK6B 4YB6A 4GF8A 4R72A 4P0IA 2QS1A 4PE5B 3LC8A 3RTWB 3QAXA 3HCQA 3G3JA 3W9VA 4R2FA 2ZXTA 3LSFB 4AB5A 4F2OA 3UP9A 4H67A 4NF6B 1LAFE 2Z22A 1RYXA 2OBGA 3FV2A 3OD7A 3L6GA 2F7AA 1Y3PA 3H03A 4U1ZA 5H8SA 4FAJA 4ZZEA 4RNSA 1FTKA 4LVQA 3VVDA 3MP6A 2PT1A 3PU5A 2XXQA 4PQJA 3ILUB 3Q28A 1M5BA 3S2VA 2A5TB 3MVYA 4M4GA 1Y1ZA 1FQCA 3S9MC 5K2YA 3TPAA 4IO6A 3V89B 4GLIA 1QKBA 4PFUA 3OOAA 4YB5A 1CB6A 4F22A 4KFQA 2ALUA 2CZLA 2P2AA 3MC2A 4GQOA 1F9BA 2DS9A 2RF1A 2XX8A 4NF8A 1P1WA 2Q9TA 2QJEA 2WKYA 4NWDA 3Q25A 2DWAA 5TP9B 3H6VA 2I49A 4C1UA 5LOMA 4Z7EA 2QL3A 2ZYNA 1UTHB 1US5A 1HSLA 4LP2B 3L6HA 4U4SA 1SYIA 1B9JA 1NNFA 4N07A 5DYHA 3K2DA 3TQWA 2Y7KA 1IQ7A 3UA8A 4GOTA 3PPQA 3USDA 5H8QA 3OXNA 1VFDA 2BJJX 3A3CA 3RY3A 4R75A 1GVCA 4GXSB 3KEIA 3JZJA 3U94A 3IOWA 1D4NA 3CSBA 2O51A 4ZE8A 3CRBA 3H4ZA 5H8HA 4QHQA 1B6HA 1MDP1 3VVFA 1MXZA 1Y3NA 4ELRA 4QFNA 3HPIA 1P1NA 2XXVA 3LSWA 2ONSA 3DLNA 1B4HA 3C32A 4Q30B 2Y7PA 4F3SA 2GH9A 3JYRA 2AL5A 3PPOA 1UIVA 3Q26A 3CVGA 3RN8A 1NFTA 1MQHA 3T93B 2QS3A 1I6QA 5IKBA 5ICTA 5CMKA 4ZEKA 1O7TA 2ZMBA 1MXVA 3N26A 4ELPA 1MY4A 1AOVA 2I58A 2DWHA 3IB1A 3LUYA 3CFZA 4RJZA 4ZEFA 3RLFE 5ELVA 1FQFA 2PVUA 3B6WA 1DPPA 2I0CA 4GL8A 3UN6A 4KCDA 1EU8A 2HQ0A 1AL3A 2XXRA 3H6UA 5F1QA 1FQAA 4F1UA 1MPDA 1FTOA 4UACA 3HHGA 3KJTA 1BLFA 3GZGA 1XVYA 1N0TA 3K1NA 1WDNA 2DE2A 5DVIA 2QPQA 2H4IA 3ILTB 3BFTA 1A54A 3TCGA 1XC1A 3UGWA 3GXAA 4MFIA 3IOTA 1QJMA 3HV1A 1B5JA 3KOSA 4U23A 2UVGA 2QMXA 4JXIA 4WKMA 4MLQA 3HN0A 3QIMA 5TU0A 5JK4A 2ZYOA 2ANJA 1JEVA 4JSDA 2H99A 2DWJA 4JWOA 2O7IA 4PETA 4NF8B 1PBQA 1IXCA 1QULA 3RQTA 1QUJA 1XS5A 1R9QA 3FXQA 3IL1B 1SD3A 4Z0IA 2VD3A 4IB2A 1EZ9A 1A7LA 4F1VA 1OQHA 4HCYA 3CIJA 1OIBA 1DSNA 2XD2A 4G2ZA 3OSRA 3BBRA 3R26A 3T9UA 2HEUA 1ANFA 1I6BA 1PEBA 5ITPA 2NOOA 5CBRA 1B3HA 5TP9A 3MBPA 3C33A 4MF3A 5KDTB 1AMFA 4RK9A 1USYH 5I59A 1UTHA 1VFEA 3PD8A 3C31A 5H8NA 3SEWA 3KBRA 1ZTYA 3TKDA 3D4CA 4U22A 4I8CA 4H0WA 4H5FA 1MDQA 2YPNA 5H8HB 5ITOA 2DYXA 2F97A 4X1BA 3FVGA 1JW1A 5EYFA 1J1NA 5CMCA 3MP8A 2Z8EA 3MVXA 3PMVA 4EF1A 3K1PA 1Z7NE 5JEIA 1FQDA 1WVJA 4X9TA 5CBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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