4X1BA

Human serum transferrin with ferric ion bound at the c-lobe only
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
677
structure length
650
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title "Anion clamp" allows flexible protein to impose coordination geometry on metal ions
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 197
structure length 650
sequence length 677
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1bA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1bA03
4XKRA 4F29A 2DYXA 2V25A 3IOVA 4EXLA 1HSEA 2A5TA 4HW8A 3A3CA 3D4CA 2DOJA 4YKKA 3GXAA 1LFHA 5CM6A 4GVOA 2QS3A 2E0SA 4DLDA 3LC8A 2Z8EA 5HBCA 2HFBA 3EN3A 3ILUB 4H1XA 3KBRA 3IO4A 2A5SA 3TTMA 4F18A 1N04A 5TPAA 1MM7A 2F78A 1P1WA 3V89B 1JQFA 2W7YA 1IITA 1A99A 2Z22A 3SETA 1B5JA 1IEJA 3KN3A 1DPPA 1N7XA 1QULA 2P0SA 2ZXTA 4F19A 1NMUA 3PPNA 1O63A 4HS7A 4O3AA 3T66A 2Z8FA 3GBBA 2VHAA 1O7TA 2UVGA 3MVZA 4F2QA 2I58A 5HM4B 3T9VA 2XX8A 1MXXA 2XXQA 4DCXA 4ZEDA 4JB7A 1LSTA 3EHUA 4FE8A 1B7UA 2ZYKA 4LQ5A 2AIXA 3FZVA 4QRZA 2Y7WA 3PUVE 3C31A 1TXFA 1OVBA 2ZNSA 4U2RA 4I9DA 3IJOB 1FQEA 1H43A 3E9XA 2Q2AA 3H06B 4MFIA 1NNTA 1ELJA 4H6DA 3B6TA 4WEPA 2I3WA 5I58A 1IXIA 5A5XB 1LFIA 3KOSA 4Z7EA 3UP9A 3K2DA 5AA2D 3TQLA 4OEVA 2OLBA 4ZZAA 5DEXA 2ESNA 3D4GA 2ZYOA 3RN8A 2VP1A 3V5AA 3RT6B 2NUVA 1LLSA 2Y7PA 2VD2A 4OVJA 1EZOA 4IGTA 5CBRA 5L9OA 4JBZA 3CVGA 1B7ZA 2F5XA 3S4UA 3FVKA 5EYFA 3E3KA 4P0GA 2O51A 3EF7A 1OQGA 2DP8A 2XHDA 2Z23A 1OMPA 5J1DA 3TTLA 5CI5A 5CMBA 1A55A 2XXTA 5JEIA 3QAXA 4C0RA 1JW5A 3H03A 3SEXA 4KD5A 4LZ5A 4H5GA 3CG1A 4K3FA 1KWHA 3PMXA 4DCYA 4OFOA 2NVUB 1S50A 4GIZA 1B3HA 2PYYA 1LCTA 5JTYB 1ZIUA 1XOCA 4C1UA 3CSBA 4X1DA 2ZNUA 2DWAA 2UVJA 1FTMA 3CFXA 1FTJA 4G8HA 3BBRA 1DTGA 1N3XA 3MPKA 4DXBA 1GGGA 4KYEA 5FHOA 2DS9A 1B3LA 3K0VA 1Y4TA 4G8NA 1LBBA 4I62A 4WKMA 3SEYA 2QL3A 2WKYA 3K1MA 5EHMA 3FVGA 4IO5A 5KDTA 3S9NC 4R9FA 4R2FA 3HHGA 2XXHA 3BFUA 2KLFA 3MZ9A 4IO7A 3P7IA 1CB6A 4ZEFA 2RCBA 5H8SA 3GLBA 2Q9TA 3CG3A 2AL4A 4OHNA 2ABHA 2PX1A 2HXWA 2QMXA 2I48A 1B51A 1A8EA 4XKPA 4G4PA 2PVUA 3VXCA 3JV9A 1LB9A 2I4BA 3U8QA 4ECFA 3C4MA 2F8DA 1PB8A 4KYSA 4F3SA 4Z0IA 3C34A 3PUXE 1NNKA 1Z7ME 2DXYA 4KCCA 1AOVA 1UTHB 1US4A 5CC2A 4GF8A 3GZGA 1J1NA 1MY4A 4GL0A 1MXZA 2DQVA 2O69A 5EHSA 1AIVA 1O64A 2ONRA 5FTHA 4F1VA 4JSOA 1QKBA 2R6GE 4LZ7A 5K2XA 3MW0A 4G68A 4ND9A 3UK4A 2P1SA 3T93B 5JK4A 1SVXB 2Y7KA 4U4XA 4G2ZA 2V3TA 3U93A 4NMYA 4P11A 1LAXA 4TLLB 4ZECA 1P99A 1FTKA 4EF2A 1VFEA 4NWDA 2XX7A 3ZSFA 4F3GA 1RKMA 3IAZA 2H5YA 4QFNA 3ODBA 4FAJA 3W9VA 3FJMA 4E0WA 5FTIA 5AA4A 1BIYA 1R9QA 4Q8RA 3H6WA 1FQFA 5AA2B 1FTOA 4JDFA 3EHSA 4PE5B 1VSOA 1DOTA 3TMGA 4PFWA 1NL5A 3MP8A 1JNFA 1XS5A 3M8UA 4IO6A 3IOUA 3FXQA 1PB7A 2F35A 3PU5A 4RXLA 3G3GA 3B6QA 2GHAA 4NE4A 4Q5TA 4OTEA 4POWA 2PT2A 3FXUA 2RC7A 3T22A 1OQHA 4OWDA 2F7CA 3I5OA 5HPQA 4OFJA 4YB7A 2XXYA 1XHYA 1EZ9A 2PT1A 4R72A 3G3JA 3HCQA 3IX1A 3MBPA 1USYE 3N6UA 3OO6A 1JVYA 2DE2A 2DSFA 2LAOA 4KFQA 2RKMA 3M3FA 2I6EA 1ZKBA 2O1LA 4H5FA 3PMWA 3RUMA 1BP5A 3KZGA 3O66A 2DVZA 3U1OA 2V3UA 1TWYA 3OEKA 3FD3A 3QUJA 2YLNA 1HSJA 4N07A 4EXKA 5DVJA 1JW4A 4E0XA 2F6PA 1USYH 3U94A 2H9BA 4XXUA 3R6UA 1B0HA 3TPAA 3VXBA 1N0TA 1UIVA 2I0CA 3TUSA 2XD3A 5CRYA 5I2KB 2DXRA 3H6VA 1DMBA 2V93A 3HPIA 3TELA 1UTBA 3I3VA 4ZE9A 4BDOA 4R9GA 3OSRA 2R9JA 1VFDA 1MPDA 1Y1MA 4JWOA 3PUYE 3TCHA 1I6AA 2YJPA 3W15C 4FIMA 4IO2A 1QVSA 3TTNA 4ONYA 4F1UA 1SYHA 1MDP1 3THIA 3KOTA 3VVEA 2E1SA 3K01A 1LGBC 2QS1A 1N76A 5DVFA 3HO7A 1IUDA 4NWCA 1GTKA 1MDQA 4GLIA 1B6HA 4GWOA 5TU0A 3OOAA 1YAEA 2Q89A 4GL8A 1NKXA 4OENA 3K02A 4QHQA 2QSXA 3FJ7A 4QFLA 3MZ1A 3O6HA 1MY3A 3I6VA 5F7VA 3HHFA 2HZKA 2ONSA 5FHMA 3TTKA 4OETA 1M5CA 1MQDA 3FV2A 3EPEA 4GFRA 1Y9UA 2IA4A 2B65A 1LFGA 3ZKKA 5LOMA 3OELA 4ISUA 3KN8A 5ISUA 1QKAA 1WODA 3O6GA 3TDJA 4YKJA 2NOOA 5DVIA 3RT8A 2XXVA 3MVXA 5CMCA 3UGWA 3VVDA 3S9EA 3M3LA 1MY0A 4H65A 4H0WA 3IL1B 4QFOA 5CMMA 4X9TA 5ITPA 4QSCA 1ANFA 3RTFB 1Y3PA 5I57B 4DE8A 3MVWA 3EQ1A 1M5DA 2CZLA 1MPBA 5L9SA 3DP8A 4LA9A 4KHZE 1PB9A 4IY6A 5ICTA 3S9LC 1I6BA 1WDNA 1D9VA 1FQBA 1FTLA 4QF9A 4ZEIA 3MJNA 1M5BA 1B4HA 3PPRA 5BWJA 2DVCA 3U72A 2XXWA 1N7WA 1UIUA 1ATGA 1EZPA 4F39A 2GFEA 4ZDMA 1P1NA 4ELPA 3PUWE 1Y3QA 4XKNA 1MM6A 1H44A 5I2NB 4ZZEA 2QPQA 1B3FA 4R6HA 1XC1A 3T9HB 3MAMA 1DSNA 4NF4A 3IB2A 1ZJLA 3F11A 3RGYA 1PBPA 4R2BA 1D9YA 2O1MA 5H8HB 4U22A 1R1NA 1FQCA 1LBCA 3VLUA 2RINA 1LB8A 1H3DA 1SD3A 2UVHA 2QRYA 3A3UA 3T9UA 1NH7A 1FW0A 5DYHA 4YMBA 2HAVA 3C33A 3KFMA 3FJGA 4PFTA 3PMVA 1WVJA 4FEBA 2F6GA 3DELB 3DP4A 1UTHA 1GR2A 4DXCA 3T96B 4ELQA 3FGSA 4RPOA 2QMWA 4OESA 2P2AA 1MH4A 4ELOA 3B6WA 4JWYA 1SW2A 1MXUA 3G3FA 2RC9A 2B3FA 3IB1A 3BFTA 1NH8A 4QFKA 3S9MC 3QSLA 1A54A 1BTJA 2D21A 4LP2B 3KEIA 3TZAA 3H4ZA 3M3KA 1P1OA 3CR9A 4Q30B 4IY5A 4F31B 1Y4CA 2AYSA 4MH5A 3MP6A 3IOWA 4QFPA 5I56A 2I3VA 4YMAA 4NF5B 1FQDA 2H25A 3KJ7A 3VFJA 1B4ZA 4FJPA 1SBPA 3IB0A 1SW4A 3O29A 3O28A 5CBSA 1SYIA 4NF8B 4DXUA 3VV5A 5AA1A 4RJZA 2X7QA 1MQHA 1EU8A 2XXRA 5AA2A 4GRKA 3FUZA 3MWBA 3Q28A 3HSTA 1B58A 3KJTA 2UVIA 4NEDA 4H67A 4KCDA 3MP1A 1LCFA 3K1NA 4FORA 5M2VA 3G7WA 1B52A 2PMSA 2V84A 4R74A 5TP9B 3HV1A 1SQYA 3Q25A 2D3IA 1JEVA 4UACA 4HCYA 3VE1B 2NWJA 1OIBA 5ICQA 4FECA 1MXWA 1B5IA 3CI8A 1BLFA 4LZ8A 4EF1A 3RY3A 4H8JA 3Q26A 3RNNA 3CRBA 4P0IA 3PV0E 4POXA 1P1UA 3E4RA 5KCJB 4YAHX 3G3IA 1MQIA 4G8MA 4ESXA 1B9JA 3TCGA 1VE4A 3H6UA 4LONB 5AA3A 2XXUA 1B32A 3FVOA 4MLVA 1URSA 1DTZA 1URGA 1MY1A 1TFAA 3V83A 3OXNA 4F3PA 4WXJA 2XXPA 3C36A 1Q1KA 4F2OA 3O6IA 1GVCA 3OSQA 1RYOA 3IJXB 3TEPA 4PFUA 3PPPA 4G77A 3RTWB 4NF6B 3DLNA 2UXAA 4ZS9A 4AB5A 2OCUA 1II5A 3KGCA 3SEWA 2OZZA 2THIA 1NNFA 1URDA 1UQWA 3OO7A 5I2KA 2OK2A 5H8QB 1MQJA 4X1BA 1MS7A 4BLAA 3VDFA 5H8FB 3V8XB 4DIGA 4TOZA 3MZBA 4KQPA 2XD2A 2Y84A 3N94A 3PUZE 3H6TA 3G3KA 3WAFA 4U23A 5I59B 3MPLA 2DWJA 2HQ0A 3PD9A 1Y3NA 2Z8DA 2O68A 3PD8A 3A09A 1MG1A 3ZKLA 4KPTA 3OO8A 2REJA 3ONMA 4MBPA 3CIJA 1N3WA 2XXXA 3TAJA 1MY2A 1MRPA 2O7UA 5IAIA 2RC8A 2NXOA 1Y1ZA 1JEUA 1M5EA 3UA8A 1B1XA 3O9PA 2Y7IA 1MXYA 3OD7A 5BUUA 3SKPA 3PPQA 2VOZA 1GV8A 4KI0E 4PP0A 3VLWA 2PBWA 2RF1A 2F34A 3FVNA 3LR1A 3GBAA 2AL5A 1DPEA 3HN0A 5K2YA 4RA1A 3OO9A 5H8NB 4LATA 3TCFA 2ANJA 1FCKA 2FYIA 4THIA 3K1PA 5I57A 3LSFB 3IK6B 1B1HA 4PETA 4F22A 1SW1A 3KG2A 4N13A 4X48A 2OWTA 1AL3A 5A5XA 1IIWA 1NNPA 1N84A 2HAUA 3UN6A 2H98A 4LVQA 4ZEKA 1QUIA 2QS2A 3QYTA 1B05A 3ZS6A 4JSDA 1SW5A 3IOTA 4PFYA 3VLVA 3SEUA 1XT8A 4IO3A 1S7YA 2DE3A 3K6UA 5ELVA 1B3GA 4QSDA 2XXIA 3QXMA 4OYVA 4TQUQ 3LSXA 3LSWA 1L5TA 4LQ2A 1B2HA 4IGRA 1QW0A 5I2NA 3T9XB 1A7LA 4OZ9A 1TT1A 4RK9A 1F9BA 2DWHA 4GOTA 3C32A 1XVXA 1UTBB 1D4NA 2X7PA 4O3CA 2A5TB 4OERA 5H8HA 3JZJA 2GH9A 4IB2A 3MUQA 1IZ1A 3KSXA 3LBSA 3CSGA 3LUYA 2FNCA 1YPNA 3K6WA 5JTYA 2Q2CA 3KN7A 2O84X 4QSEA 1NFTA 1PC3A 5DTBA 2OBGA 3E13X 4KR5A 1B46A 3FATA 3O97A 3MVYA 5TPAB 2I4CA 3G3HA 1CE2A 1A8FA 1SI0A 3PPOA 4MF3A 3MC2A 4OFLA 2GHBA 5F1QA 4UA8A 1Y20A 2F7BA 1IXGA 1PDAA 4M4GA 4U1ZA 4YB6A 4G68C 3BKIB 3OEMA 2Q88A 1ZMGA 3L6GA 4BDRA 1HSLA 3L6HA 3SESA 4EDPA 4R6KA 1LAHE 3DM0A 4GQOA 2I49A 2XX9A 3KSJA 1EH3A 1POTA 4LUBA 2OJTA 3TTRA 2H4IA 5FHNA 4FEDA 1B3EA 4YICA 4NF5A 3N6TA 3ECRA 3TODA 2IEEA 4NF8A 4ESWA 2BJJX 1XVYA 3QIMA 4R73A 3TQWA 3OENA 4JXIA 2HCAA 2D5WA 4HTGA 3QK6A 4C1TA 5I58B 3DP6A 1MPCA 3VVFA 1JVXA 4I8CA 3UORA 4RNSA 2ALUA 2FA7A 2QS4A 4OQOA 3JYRA 5TP9A 4KYDA 4OXVA 5DEXB 1Z7NE 2ZYMA 2UYFA 3CFZA 4FATA 5CMKA 2O7IA 1LAGE 3LSLA 1P1QA 4ZEBA 4GXSB 1OVTA 4EUOA 2O6AA 4I1DA 2Y7RA 5KCJA 3C35A 1RYXA 4NF4B 2F7AA 4MLQA 4BDLA 3SEVA 4EQ9A 4OMBA 4ELRA 2F97A 3Q27A 4EQBA 4ZE8A 5DT6A 4YU0A 2ONKE 4U21A 3ILTB 4R6YA 4YKIA 4RY1A 1Q35A 2DWIA 3C9HA 3FIRA 1A40A 1IXCA 2I0BA 4U4SA 1S9TA 1OLCA 2R71A 2ZYNA 4NF6A 2M8CA 2UYEA 1AMFA 4HCWA 4O3BA 3K6VA 2X26A 5I84A 3OMBA 1SI1A 2RCAA 1OLAA 2QJEA 4U1OA 3U92A 2YPNA 4F3BA 4AQ4A 3K6XA 1MQGA 5H8QA 2VD3A 3H3GA 4M1VA 4N6PA 1US5A 1IQ7A 4AB6A 5KDTB 3R26A 3SERA 1H45A 4YB5A 5H8FA 4XIGQ 3S2VA 1QUKA 1D3KA 1B7HA 2H99A 2Q8JA 2B3BA 3K00A 3TKDA 4TLMB 5ITOA 3N5LA 1B40A 3USDA 3QUFA 5I59A 4WEDA 4YKPA 3W9WA 4RPNA 4R75A 4XTCQ 1T0KA 4BDQA 5I56B 1PEBA 3AXFA 3TFLA 1TFDA 1ZLQA 3FV1A 4BDNA 1ZBMA 3N26A 1LAFE 1B0LA 2GRVA 1AH5A 3RPWA 2CMOA 1JETA 4RK2A 1QUJA 1MXVA 3FXRA 1I6QA 3SDFA 1BKAA 1R6ZA 2VGQA 3O2AA 4EQ7A 4NTLA 1B5HA 3UIFA 2ZMBA 3Q29A 1POY1 3K4UA 4G68B 4XKQA 5B70A 1H76A 5KZTA 1FQAA 3IR1A 4GXAA 5L9MA 1JW1A 3PGFA 1R9LA 2OWSA 2G93A 3B7DA 2F36A 4OEUA 5H8NA 3R7XA 1YCJA 3CFLA 1ZU0A 3MQ9A 5IKBA 1IXHA 2V3QA 2ZNTA 4F1YA 1SDXA 2HZLA 1M5FA 4Q0CA 4BDMA 4IO4A 5AE4A 1PBQA 1I69A 5L8DA 2DE4A 4PQJA 5AA4B 2HEUA 4H8IA 3TYHA 5B7DA 4JWXA 3H7MA 1YTVA 4GD5A 3WAEA 4DZ1A 3RLFE 3EHTA 3FASA 3IO6A 3RQTA 3IORA 2G29A 1ZTYA 4YZZA 1MH3A 4DDDA 1VR5A 4RYAA 4L17A 1QJMA 2REGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XKRA 4F29A 4NF0A 4O94A 2DYXA 1FBGA 2V25A 3IOVA 4EXLA 1HSEA 2A5TA 5J16A 2HPGA 4HW8A 3A3CA 3D4CA 2DOJA 1EYJA 4YKKA 3GXAA 1LFHA 5CM6A 4GVOA 2QS3A 2XWKA 2E0SA 4DLDA 3LC8A 2Z8EA 5HBCA 2HFBA 3EN3A 3ILUB 1FPDA 1LBWA 4PFIA 4H1XA 3KBRA 5A5LA 3IO4A 2A5SA 4P56A 3TTMA 4F18A 1N04A 5TPAA 1MM7A 2F78A 5F24A 1P1WA 3V89B 1JQFA 2W7YA 1IITA 2PCRA 1A99A 2Z22A 3SETA 1B5JA 4MIJA 1IEJA 3KN3A 1DPPA 1N7XA 1QULA 2P0SA 2ZXTA 5T3JA 4F19A 3E79A 1NMUA 3MSTA 1O63A 3PPNA 4HS7A 4O3AA 3T66A 2Z8FA 4AS4A 3CHGA 3GBBA 2VHAA 1O7TA 2UVGA 2ZZXA 3MVZA 4F2QA 2I58A 5HM4B 3T9VA 2XX8A 4XEQA 1MXXA 4NN3A 2XXQA 4DCXA 3GYYA 4ZEDA 4N6KA 4JB7A 1LSTA 3EHUA 4FE8A 1B7UA 2ZYKA 4LQ5A 2AIXA 3FZVA 4QRZA 4MAGA 4MNCA 2Y7WA 3PUVE 3C31A 1TXFA 1OVBA 2ZNSA 4U2RA 4I9DA 3IJOB 1FQEA 1H43A 3E9XA 2Q2AA 3H06B 2FHYA 4MFIA 1NNTA 1ELJA 4H6DA 1NV5A 3B6TA 4WEPA 2I3WA 5I58A 1IXIA 5A5XB 1LBYA 1LFIA 3KOSA 4Z7EA 3UP9A 3K2DA 5AA2D 3TQLA 2VPNA 4OEVA 2OLBA 4ZZAA 5DEXA 2ESNA 3D4GA 2ZYOA 3RN8A 2VP1A 3V5AA 3RT6B 2NUVA 1LLSA 2Y7PA 2BJIA 2VD2A 4MEVA 1AWBA 1DCUA 1NUWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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