4X1DA

Ytterbium-bound human serum transferrin
Total Genus 201
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
201
sequence length
677
structure length
658
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title "Anion clamp" allows flexible protein to impose coordination geometry on metal ions
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 201
structure length 658
sequence length 677
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1dA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1dA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1dA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4x1dA03
2Y7WA 4TQUQ 4FE8A 2REGA 4GXAA 1LSTA 4GF8A 3TTLA 5AE4A 2GHAA 5AA4A 4BDOA 1UIUA 3M3FA 3IOUA 3KSXA 1I6QA 1H45A 1TFDA 1B4ZA 2E1SA 4YAHX 4KYSA 4X9TA 3S9LC 4TOZA 4EXKA 1GR2A 3TKDA 1DOTA 1Z7NE 2Y84A 2REJA 3FGSA 4BDMA 4FAJA 1HSJA 2PVUA 5B70A 1EZOA 1MQIA 2F8DA 3W9WA 1MXVA 3OSQA 4YU0A 2YPNA 3FJ7A 2CZLA 3MUQA 3S4UA 5CRYA 1MH3A 4XKRA 2PX1A 3C32A 4JBZA 4THIA 1IUDA 4OFLA 1UTHB 3KOSA 5F1QA 2LAOA 4U23A 3OO9A 5FHOA 4PE5B 2I58A 1MS7A 2DOJA 3B7DA 3DP4A 4OFJA 4TLMB 3TAJA 3UIFA 3GBAA 3O6IA 3SDFA 1NNTA 2PYYA 4U21A 1WODA 1B2HA 1LBCA 3RNNA 2H25A 5DVJA 2VD2A 1MXZA 4L17A 4GOTA 4IGTA 3E13X 2OJTA 5CMCA 1QUJA 2ZYOA 1BP5A 2O68A 3EPEA 1MQJA 1N3WA 2RC9A 3T93B 1IZ1A 1B5JA 4YB6A 3V89B 4X48A 1FCKA 3CSGA 1MXWA 1NFTA 2UVJA 4OEVA 1NNFA 2XXVA 3RTWB 4H8IA 3VV5A 1FTLA 1OLAA 2ZYNA 3QAXA 4KFQA 5CI5A 5ELVA 3LBSA 1US5A 1MY4A 2V84A 3GXAA 4FATA 1SBPA 3FZVA 4POXA 3H6UA 5JTYB 2CMOA 3K1NA 1B7UA 1B3EA 3PD8A 4QSCA 3FIRA 1B1XA 4DIGA 3CG1A 3C4MA 3QIMA 4NF8B 1FTJA 4LONB 3U72A 2ZYMA 1B40A 4FJPA 3UP9A 2G93A 4EF2A 2I0CA 2F97A 4PETA 4F3SA 2R71A 5DEXB 1IXHA 2Q9TA 3DP8A 3IL1B 4OMBA 2O84X 4U4SA 5AA2B 2F7AA 2HAVA 1JVYA 1B5IA 4QSDA 2XXUA 4RY1A 5JK4A 4MLVA 4NMYA 3V83A 1P1OA 1JW1A 2XX9A 4EQ9A 3SETA 3TCHA 3B6QA 5I2NB 3H6WA 2THIA 1EZPA 1PC3A 4UA8A 3G3FA 1A55A 3D4GA 3MVYA 3C9HA 4LZ5A 2QS2A 3K1MA 1IXIA 3OELA 5DVFA 3QUFA 1LFGA 3MVWA 1SW4A 3EHUA 1UTHA 5HBCA 3KGCA 1MH4A 4QSEA 2XXIA 3BKIB 3IJXB 2OBGA 3RPWA 3ONMA 3MVZA 1N7WA 3VXCA 4P0IA 1YPNA 1WDNA 2V93A 1MXUA 4GRKA 4OEUA 1SI1A 2Y7KA 3KN8A 3TZAA 4IO7A 4Z0IA 1ZU0A 1F9BA 3PPOA 1N84A 1EH3A 4EUOA 2IA4A 2HXWA 4LZ8A 3G3IA 1M5DA 3W9VA 2HEUA 3LSXA 2DYXA 4EDPA 3FVOA 1TWYA 3PD9A 1LAHE 3Q27A 1H44A 4Q0CA 4WEDA 1DSNA 3VLWA 3IR1A 4YMBA 2F35A 1ZMGA 1IITA 4Z7EA 1Y4CA 4IGRA 4NE4A 3C31A 3CG3A 1MPDA 4G8HA 1URGA 2DWIA 5JTYA 3THIA 3SEUA 1A8EA 3SERA 3ZKLA 3UK4A 4G8MA 1P1QA 3TELA 4ESWA 1PBQA 1JW4A 4P0GA 4NF8A 1M5CA 3RN8A 2D21A 2OZZA 5TPAB 3G3GA 2O6AA 4O3AA 1OQGA 4OETA 1BLFA 1MM7A 2DQVA 1MPBA 3H4ZA 1P1UA 1H43A 3VVFA 2Q8JA 1UIVA 5DEXA 4H65A 4RK2A 3KBRA 2OLBA 1MDQA 4R9FA 3W15C 5AA2A 1SYHA 3DLNA 1FQEA 4IO5A 4XKPA 1EZ9A 2DWJA 5L9OA 1NMUA 4YKKA 3T22A 4P11A 5I2NA 3CRBA 1S50A 2V3QA 3OO8A 4H0WA 2H99A 5H8FA 2PT1A 4Q5TA 3TCFA 4ZECA 4U22A 5AA2D 3JYRA 4E0WA 3CIJA 1B7ZA 4XIGQ 3RUMA 3K6UA 3R26A 3TFLA 1B0LA 1GV8A 1QKBA 3H03A 4YB5A 3C34A 2QS3A 1AOVA 3Q25A 1B3HA 3FJMA 3EN3A 2DE3A 4LVQA 2F7BA 3LUYA 5EYFA 5CC2A 4ZEFA 3HHGA 3IJOB 1JQFA 3KJTA 3O28A 1QUIA 3TEPA 4ISUA 1OMPA 3IORA 2H98A 3T66A 2Z22A 3L6HA 4KPTA 2XD3A 3PV0E 2Q88A 3TQWA 4U4XA 2DP8A 3LSWA 1HSEA 5H8QB 1NNKA 2I49A 2QL3A 4OHNA 4OQOA 2I4CA 3MPKA 1SW1A 5I58A 3O66A 3HPIA 3U8QA 2W7YA 1Y20A 3IX1A 4OYVA 3G3KA 2O7UA 4OENA 3VVDA 4R2BA 5KZTA 2OK2A 3A09A 5TPAA 4R73A 1ZTYA 3K4UA 2DVZA 1P1NA 1AL3A 1MQGA 1QVSA 3MW0A 4ZEIA 4LZ7A 3TTNA 4JWYA 5B7DA 1I69A 2DE2A 2ZMBA 2B3FA 2DWHA 4R6HA 3TODA 4N13A 1LB9A 2ONKE 1IEJA 2B3BA 3IB0A 4ZZEA 1J1NA 2QS4A 3PPRA 3JZJA 2ESNA 4GXSB 4NF4A 3K02A 5DVIA 5L9SA 4KI0E 1PB9A 4R6KA 1POY1 3DELB 3MQ9A 4U1ZA 3OO6A 1JVXA 4AB5A 4MFIA 3RT8A 3PUYE 2O1LA 4RNSA 2DE4A 3OEMA 2NVUB 3FV1A 4JDFA 1PDAA 3N26A 3OENA 2M8CA 2XXYA 1VE4A 4C1UA 4ZZAA 1LLSA 3IAZA 3VLVA 1A54A 2RC7A 4QFNA 2QJEA 4YICA 1LAGE 4OVJA 1Y9UA 4WKMA 1N76A 1FTKA 3TTMA 1QW0A 1JEVA 3SEYA 2Q2AA 3KN3A 3U92A 3FD3A 4E0XA 1D9VA 4N6PA 4DDDA 1B52A 3C35A 1NL5A 3E9XA 2HQ0A 1S7YA 1YTVA 2Y7IA 3D4CA 2D5WA 3BFTA 3TDJA 4QFOA 4RK9A 3I3VA 3MVXA 3R7XA 2V3TA 2YJPA 5L9MA 5KCJA 3ZS6A 3SEXA 3T9UA 3VE1B 1MG1A 1MQHA 5CBRA 3KG2A 5H8QA 2O1MA 1OLCA 4C1TA 1URDA 2Z8EA 3IOTA 5L8DA 4JXIA 2XHDA 4DE8A 4NF6A 3RGYA 4HCYA 2Z8FA 4F2QA 2RKMA 4R6YA 5ITPA 2QSXA 3MBPA 4MLQA 5I57B 2F36A 2I0BA 1R9QA 1B0HA 4FEDA 3PPPA 4NWDA 4DXCA 4EQBA 4DCXA 3VFJA 2O51A 1NH7A 1RYXA 4OWDA 2ABHA 1BTJA 1FQCA 1ATGA 1POTA 4LA9A 2R6GE 1PB8A 4LATA 5H8FB 1ZLQA 5CMKA 3K00A 1LAFE 1S9TA 4HCWA 1P1WA 3S2VA 5EHSA 1UTBB 4GWOA 3P7IA 2A5TA 2FA7A 1OVBA 2F6PA 4MBPA 1QKAA 5I2KB 5HM4B 2XX7A 1MPCA 5A5XB 2HAUA 3MP1A 3B6WA 3T9XB 1QUKA 2AIXA 1XC1A 2UXAA 1LAXA 4RPOA 4NEDA 2F7CA 3A3UA 4PFTA 4ELOA 1LBBA 3O2AA 4IB2A 1ZJLA 1T0KA 1YCJA 2GHBA 4BDNA 2P2AA 4YKJA 1MM6A 3GBBA 4ELPA 1LFIA 4X1BA 3M3LA 3VLUA 3FJGA 1YAEA 3FVNA 2VP1A 4AQ4A 4DCYA 1D9YA 3S9MC 3S9NC 1EU8A 1D4NA 5M2VA 1AIVA 1NKXA 1USYE 1RYOA 2I48A 1ELJA 1II5A 3H3GA 1PBPA 4F22A 2IEEA 4EQ7A 1B5HA 3KZGA 5DT6A 1B4HA 2F34A 3KN7A 4BDLA 4MH5A 3CI8A 2YLNA 4DZ1A 5I58B 3PUZE 4QF9A 4O3CA 4F3BA 4H8JA 4ZS9A 1LCFA 3B6TA 1I6AA 3PUVE 4KD5A 1Q1KA 4F3GA 1M5BA 5FTIA 4ELRA 4U2RA 3G3HA 2O69A 3FV2A 5I56B 4GL0A 4TLLB 1OVTA 3Q29A 3OSRA 3IOWA 4Q30B 4IO4A 2UVIA 1SYIA 1DTZA 4R72A 1NNPA 1OIBA 2VGQA 3S9EA 3OXNA 3DP6A 2ZNUA 5ICTA 1FTMA 3QYTA 5I57A 1MRPA 5I59B 3T96B 4NF4B 2H4IA 3UGWA 2Q2CA 4HTGA 4NWCA 3K1PA 1M5EA 4UACA 1R9LA 3MZ9A 3A3CA 2NWJA 1N0TA 1QULA 4FIMA 1UTBA 3G7WA 3LC8A 3TYHA 3CFLA 1IXGA 5FHMA 3TQLA 4ECFA 3OO7A 1B51A 5I2KA 1GTKA 3O97A 4FECA 5A5XA 1SW5A 2Z8DA 4F1UA 5BUUA 1JETA 2PMSA 3MP6A 4RYAA 1IIWA 3OEKA 4IY6A 4GIZA 5KDTB 4AB6A 2QMXA 4HS7A 2HCAA 2RINA 4ZEKA 5IKBA 3LSLA 4JB7A 1LB8A 1SQYA 5K2XA 3U93A 1Y3NA 1QJMA 1N3XA 3UORA 3ODBA 1SD3A 4WXJA 4JSDA 3USDA 1SVXB 4ESXA 5KCJB 4ONYA 2XXWA 2DVCA 2XXXA 4H67A 4GVOA 2FNCA 4IO2A 1SW2A 4PFUA 3OMBA 3OOAA 4QHQA 4H5FA 3K6VA 4OESA 3PU5A 3IB2A 4NF6B 4FEBA 1D3KA 3QK6A 1B46A 3KOTA 2ZYKA 3JV9A 3V5AA 2RC8A 4G77A 4ZE9A 2RCAA 2AL5A 2I4BA 3IO4A 4IY5A 3SESA 4EF1A 3FXQA 2HZKA 1DPPA 3EHTA 5CMMA 3UN6A 2DXYA 2XXHA 2H5YA 1A99A 1FQBA 5I56A 2KLFA 3O6GA 2XXRA 4R75A 3V8XB 4RJZA 5TP9B 3MZ1A 1GVCA 3N5LA 3U1OA 2PBWA 5F7VA 1MY1A 3IOVA 1ZBMA 3M8UA 3I5OA 2GH9A 3ILTB 5EHMA 3U94A 2A5TB 4NTLA 4GL8A 5I59A 5LOMA 3H6TA 2QRYA 4GFRA 3QXMA 3CFXA 4QFPA 5IAIA 2X26A 3O29A 3VXBA 1MXXA 3C33A 4DLDA 1H76A 3KJ7A 3PMXA 3K6WA 4KR5A 1Z7ME 3H7MA 4KYEA 2F6GA 2RF1A 1Y3PA 4I9DA 5H8SA 3IB1A 3HO7A 4RXLA 3EHSA 1B6HA 1MXYA 3HHFA 1FQDA 1URSA 2XXTA 1I6BA 1MQDA 4ND9A 3CR9A 2HFBA 4ZEDA 3TMGA 4JWOA 4XKNA 1LFHA 1MY3A 2GFEA 2B65A 4XXUA 4YKPA 4PFWA 1GGGA 4LQ2A 3TCGA 1P99A 5I84A 3EF7A 4QFKA 2ZXTA 3PPQA 1M5FA 3BFUA 3ECRA 3TUSA 5KDTA 3GZGA 4ZDMA 2QMWA 1CE2A 2E0SA 5CBSA 3F11A 2OWSA 1VFEA 1UQWA 3CVGA 4XKQA 4LQ5A 5TU0A 3FVGA 5FTHA 3HCQA 3Q28A 2F5XA 4F31B 3E4RA 1B1HA 5J1DA 4R9GA 4U1OA 3CFZA 2A5SA 1VSOA 2X7PA 4PP0A 2VHAA 1Q35A 4ZEBA 3TTKA 1VFDA 4BLAA 2XXQA 2Y7RA 4YKIA 1AH5A 2I3VA 3WAEA 3AXFA 4ZE8A 4F2OA 3H6VA 4K3FA 3K0VA 3FATA 3GLBA 2AL4A 5HPQA 2ALUA 1XS5A 1DTGA 3ZKKA 2UYFA 3O6HA 4KHZE 5AA3A 5H8HB 3MP8A 3RTFB 1L5TA 2HZLA 3OD7A 2RCBA 2NUVA 5TP9A 2H9BA 4F39A 1WVJA 1BKAA 3QSLA 3PMWA 1MY0A 3N94A 3MZBA 4HW8A 1DMBA 3KFMA 2OCUA 3MC2A 4KYDA 1XVXA 2PT2A 3C36A 1JEUA 4MF3A 1TXFA 1Y1MA 5ICQA 3PPNA 2QS1A 3MJNA 3KSJA 1NH8A 2DSFA 4GQOA 4G8NA 3E3KA 4F3PA 2V3UA 3L6GA 1ANFA 4OERA 2ZNTA 3FUZA 4IO3A 4DXBA 4F29A 2VOZA 2P1SA 3O9PA 4IO6A 3IK6B 3MAMA 4EXLA 4M4GA 1XOCA 5AA1A 5H8NB 3DM0A 1KWHA 2OWTA 2Y7PA 3HN0A 4KQPA 4I1DA 2DXRA 1SDXA 4I62A 4NF5B 4OXVA 4F1VA 2D3IA 4G68B 1FW0A 2AYSA 4YB7A 3VDFA 1Y1ZA 3IO6A 2DS9A 1MDP1 4PFYA 3RQTA 2ONRA 2XXPA 4JWXA 2X7QA 4BDRA 5BWJA 5DTBA 3PUXE 1R6ZA 4O3BA 3K6XA 3RLFE 3R6UA 4YMAA 2Z23A 1B3FA 5FHNA 2I3WA 4OTEA 5K2YA 2I6EA 2UVGA 1IXCA 4OFOA 4LUBA 1B9JA 1TFAA 2V25A 5DYHA 3SEWA 5AA4B 3ILUB 1LCTA 1BIYA 3MPLA 4R2FA 4F19A 4R74A 4RPNA 1PB7A 1B3LA 2VD3A 4H6DA 2NXOA 4OZ9A 1SI0A 4G68C 4F18A 4H1XA 3FXUA 1FTOA 3CSBA 2XX8A 2Q89A 3ZSFA 1JNFA 3HSTA 4LP2B 1B58A 3Q26A 3FASA 2FYIA 3H06B 4YZZA 1AMFA 1FQAA 3RT6B 3LSFB 5H8HA 1HSLA 1PEBA 3I6VA 1B05A 2G29A 4GLIA 1H3DA 1Y4TA 1XVYA 1N7XA 1A7LA 2XD2A 3SKPA 3RY3A 3N6TA 4G4PA 2UYEA 4POWA 1Y3QA 3TTRA 1A40A 5CM6A 4H5GA 4BDQA 3UA8A 4F1YA 1DPEA 1ZKBA 1LGBC 4C0RA 3SEVA 3K01A 3MWBA 1VR5A 3LR1A 3T9HB 1B3GA 2ZNSA 4XTCQ 4N07A 5ITOA 1B7HA 1R1NA 3PUWE 3T9VA 4M1VA 4GD5A 3BBRA 1IQ7A 5CMBA 4ELQA 3KEIA 3TPAA 5JEIA 2UVHA 1XHYA 1TT1A 2P0SA 1MY2A 2F78A 1O64A 2QPQA 2NOOA 4QFLA 1CB6A 3QUJA 5ISUA 5H8NA 3VVEA 2GRVA 1O63A 3PGFA 4JSOA 4Q8RA 4I8CA 2O7IA 4NF5A 3G3JA 4G68A 2DWAA 2ANJA 2BJJX 4KCDA 1ZIUA 1B32A 1N04A 3FVKA 3K2DA 3M3KA 3PMVA 1OQHA 2WKYA 1FQFA 3WAFA 2R9JA 4X1DA 3EQ1A 3FXRA 1USYH 1US4A 3N6UA 1RKMA 4DXUA 4RA1A 4PQJA 1A8FA 4KCCA 1XT8A 4QRZA 1JW5A 4G2ZA 3HV1A 4WEPA 1O7TA 4FORA 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7WA 2XWOA 4TQUQ 4FE8A 1LBVA 2REGA 4GXAA 1LSTA 4GF8A 3TTLA 5AE4A 2GHAA 5AA4A 4MX6A 4BDOA 1UIUA 3M3FA 1FRPA 3IOUA 3KSXA 1I6QA 1H45A 1TFDA 3NOHA 1B4ZA 2E1SA 4YAHX 4KYSA 4X9TA 3S9LC 4TOZA 4EXKA 1GR2A 3TKDA 1DOTA 4N81A 1Z7NE 2Y84A 2REJA 3FGSA 4N17A 4BDMA 4FAJA 1HSJA 4GBWA 4GWYA 2PVUA 5B70A 2ZZWA 1EZOA 5F24A 1MQIA 2F8DA 3W9WA 1MXVA 3OSQA 4YU0A 2YPNA 3FJ7A 2CZLA 3MUQA 5I7IA 4PAFA 3S4UA 5CRYA 1MH3A 4XKRA 2PX1A 3C32A 1K9YA 4JBZA 4THIA 1IUDA 5LTCA 4OFLA 1UTHB 3KOSA 4I3EA 4OVTA 5F1QA 4DI3D 2LAOA 4U23A 3OO9A 5FHOA 4PE5B 2I58A 1MS7A 2DOJA 3B7DA 3DP4A 4OFJA 2QVRA 1LBYA 4TLMB 3TAJA 3UIFA 3GBAA 2WBDA 3O6IA 3SDFA 1NNTA 2PYYA 4U21A 1WODA 1B2HA 4PDHA 1LBCA 3RNNA 2H25A 5DVJA 2VD2A 1DK4A 1MXZA 4L17A 4GOTA 4IGTA 3E13X 2OJTA 1G0IA 5CMCA 1QUJA 2ZYOA 1BP5A 2O68A 3EPEA 1MQJA 1N3WA 2RC9A 3T93B 4O7IA 1IZ1A 3QMFA 1B5JA 4YB6A 3V89B 4X48A 1FCKA 3CSGA 1MXWA 1NFTA 2UVJA 4OEVA 1NNFA 2XXVA 3RTWB 4H8IA 3VV5A 2QVUA 1FTLA 1OLAA 4NAPA 2ZYNA 3QAXA 4KFQA 5CI5A 5ELVA 3LBSA 1US5A 4NN3A 1MY4A 2V84A 4PAIA 4XFEA 3GXAA 4FATA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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