4Z7EA

Soluble binding domain of lmo1422 abc-transporter
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
EITIAGKLGAEPEILINMYKLVIEDETDLKVNVKPNMGKTSFVFNALKSGDIDIYPEFTGTVLETFLKENAKTHDPEEVYTQARDGLAKDFDMTYLKPMKYNNTYALAVSPEFAKENNLEKISDLGPVSDQVKAGFTLEFKDRSDGYKGIQDKYGLTFSNLKTMEPKLRYNAIKSGDINLLDAYSTDSELAQYKLKVLEDDQQLFPPYQGAPLMLTKTLDKYPELKKPLNKLAGKITDDEMRKMNYEVNVNGKSAYTVAKDYLKDQGIIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of the Substrate-Binding Domain from Listeria monocytogenes Bile-Resistance Determinant BilE
doi rcsb
molecule keywords Lmo1422 protein
molecule tags Transport protein
source organism Listeria monocytogenes egd-e
total genus 98
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4z7eA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4z7eA02
3FVOA 1YCJA 1NKXA 2FA7A 4I62A 5TPAA 5AE4A 1MY3A 5H8HB 4KYEA 2DE4A 4OHNA 4LZ8A 4RJZA 1TXFA 4LZ5A 2O84X 3KFMA 5ICTA 3IOWA 1P1WA 4QFNA 3JV9A 1ZTYA 2REJA 3UK4A 4ESXA 3PPOA 5L9OA 4JDFA 1MY1A 4IY5A 4FAJA 4YKJA 4GFRA 3EHTA 4X1BA 2REGA 4NF6A 4ZS9A 1M5CA 3FUZA 3MPKA 4F39A 2O1LA 1DOTA 3D4CA 1LLSA 2AIXA 1A8EA 4UA8A 2FYIA 4PFWA 4BDRA 2V84A 1JEVA 3I3VA 3FJGA 1DTGA 3QUJA 3G7WA 5B70A 3TEPA 2HAUA 1URGA 2I6EA 1SDXA 3FIRA 2HAVA 3LC8A 2ZYOA 3QYTA 1HSEA 3WAFA 1FTKA 1ZIUA 3Q27A 4XKQA 4GL0A 4NF5A 2UYFA 4FEDA 3SEVA 2F36A 5AA4A 3SKPA 2XXWA 3EQ1A 3D4GA 1QVSA 3T9VA 4OMBA 1M5DA 3EHUA 4R9FA 5HBCA 4Q8RA 2Y7KA 4ZEIA 4GQOA 4ZEDA 4HCWA 2DSFA 2W7YA 1SYHA 4YB5A 3CSBA 1VFEA 1B4HA 1Y3QA 5KDTA 1B1HA 4DXBA 1B58A 3KN3A 4FJPA 4EQ7A 1HSLA 3PPQA 1URSA 5JTYB 4KD5A 3TTRA 3KBRA 3OO8A 2ONKE 2RKMA 3U93A 2QRYA 4R73A 4OYVA 5A5XA 2Z8EA 4G4PA 3PUXE 4LQ5A 3SEXA 1MDQA 3PUVE 4IO7A 3T66A 1XT8A 3U72A 1MQDA 2D5WA 3Q28A 3E3KA 3RTFB 1LBBA 3SEYA 5CMCA 2GHAA 5DT6A 3CSGA 1PEBA 1A99A 1OIBA 2O51A 3FATA 4KPTA 2X7PA 3JYRA 3ECRA 3K6VA 3R26A 5TP9B 3I6VA 2ESNA 4H0WA 3FD3A 3GLBA 4PFUA 2AL5A 4JXIA 1B5HA 3O6GA 2NOOA 5CMBA 4ECFA 4GWOA 2Y84A 4YMAA 3OO9A 2AYSA 3IO4A 1N3WA 4G8NA 1B3GA 3A3UA 3O29A 2I4CA 4AB6A 4G8HA 3TTKA 1P1OA 1TT1A 4HS7A 3KEIA 4KQPA 1SW2A 5I57A 2PMSA 2XXXA 3VDFA 2DE3A 2PT2A 4XIGQ 2I3VA 3IR1A 4IY6A 2B3BA 4F29A 1MXYA 4RK9A 1H76A 2O1MA 3DP4A 1AMFA 4N6PA 4DCYA 4WXJA 3FASA 1GGGA 3KJ7A 2OJTA 5IAIA 4LATA 4YAHX 2V3UA 1IXGA 1LCTA 1EU8A 3MQ9A 1LB8A 2QJEA 1ZLQA 1OLAA 2LAOA 1I6BA 2Z8FA 3B7DA 3FGSA 3TTNA 3SESA 3LR1A 3MVZA 3E4RA 2DOJA 4NMYA 1US5A 2Q8JA 1MY2A 2QSXA 3DM0A 3ZSFA 5I56A 3S9MC 1BIYA 4GIZA 3TCHA 4YB7A 2IEEA 3MJNA 1XS5A 2O6AA 4JSDA 1MY0A 4TLLB 4QHQA 5ITOA 3CI8A 4H6DA 4DLDA 2F35A 2QMXA 2H5YA 2DYXA 3MWBA 2F8DA 4TLMB 3K00A 4QFKA 3OENA 5ITPA 2XXVA 1QKBA 1UQWA 1USYE 3TCFA 4E0XA 1UTBB 3VLUA 4MBPA 3R6UA 1SD3A 5J1DA 3UN6A 5I2NB 4ZE9A 2QL3A 2VGQA 1IZ1A 4IO2A 2DQVA 5H8NA 3SETA 1M5BA 2P2AA 4IO4A 3P7IA 3PUWE 3MVYA 4OETA 1B3FA 1MPCA 1B32A 4FATA 3EF7A 1LFGA 3ONMA 3VV5A 4N07A 3C32A 4MF3A 2VP1A 4H1XA 3TQWA 3OEKA 3MPLA 3MVWA 1LAXA 1UTHA 4P11A 2ZYNA 5FHOA 2A5SA 3FXRA 1MXVA 1WDNA 4F3SA 1OMPA 4U1OA 4LP2B 1J1NA 4F1VA 2Y7IA 1VR5A 1L5TA 4H65A 3IB0A 4NF4A 1DMBA 4XXUA 5H8FB 1MXWA 3KJTA 3OELA 4WEPA 1MQGA 4OVJA 3PMXA 4U4XA 2E0SA 3VFJA 3MP6A 3RTWB 5DYHA 5DVIA 3B6WA 2UVGA 1JNFA 3O97A 4Q30B 1Y4CA 1D4NA 1Q35A 3K4UA 4G2ZA 1MY4A 3K1PA 4BDLA 2A5TA 1PDAA 4OFOA 5I58B 1D9YA 3PUZE 4TOZA 3TQLA 3HPIA 3VE1B 3H6VA 4LA9A 1M5EA 3VLWA 4KYSA 5HM4B 2O7IA 4RPNA 5KZTA 1SVXB 1SI0A 3F11A 1IXCA 4ZEBA 5KCJA 2ZYKA 3R7XA 2I48A 3SDFA 2DWAA 1MRPA 3GXAA 4EF1A 3H6WA 3H4ZA 2X26A 4U23A 4ELQA 3W9WA 2UXAA 4OENA 2O7UA 1B3LA 1B5JA 4EQ9A 3SEUA 2PX1A 1LAGE 5CBRA 1A54A 4LQ2A 4GL8A 3RT8A 1B3EA 5AA2A 4L17A 1DTZA 4KR5A 3TODA 1Y1ZA 2RCBA 4POXA 4Q0CA 4O3BA 2RINA 4EXKA 1EZ9A 5EHSA 3S9EA 5CBSA 3MC2A 4ONYA 2DP8A 3H3GA 2F7CA 4NWCA 5K2XA 3T22A 3OSRA 3KSXA 1SW1A 1Y20A 4KHZE 4O3AA 4ELPA 4IB2A 3HCQA 3L6HA 4GLIA 5TU0A 1POY1 3K1MA 2I0CA 1BLFA 5ICQA 3IOTA 2HZKA 4R75A 1LFHA 2B3FA 4U2RA 3FV2A 4U21A 3U94A 3HHGA 1B46A 4X48A 4EF2A 2OLBA 4ZZEA 3MW0A 3KG2A 4G68B 1MDP1 2XD2A 2V3QA 1N76A 5L9SA 4GOTA 3A3CA 1O64A 4FORA 4MFIA 4Z0IA 1FTMA 2Z23A 3CFLA 1R1NA 1USYH 3M3KA 4GXAA 3VVFA 2P1SA 4F1YA 3I5OA 5I2KA 3FZVA 3T9HB 5IKBA 5CRYA 1EZOA 3MBPA 3OSQA 3B6TA 5B7DA 1MH3A 2I4BA 2Q9TA 2RC9A 3T96B 1QULA 3PU5A 1TFDA 1S7YA 3IB1A 1B7HA 2XXTA 4NF8A 4BDQA 3MZBA 5DTBA 2GFEA 3SERA 2YPNA 1BTJA 2DXYA 3GBAA 2OWSA 3KN8A 1XC1A 5CM6A 4GXSB 1JETA 3VVDA 4YMBA 1LAHE 1MXUA 3EPEA 5I59B 4ZZAA 4XKPA 2OK2A 2H98A 3RN8A 2E1SA 3EHSA 1NNPA 2VHAA 1B40A 4QFLA 2P0SA 1B0LA 4OESA 1GV8A 4JB7A 1CE2A 1A40A 3O6HA 1H43A 5L9MA 4R6KA 1R9QA 3RUMA 1B3HA 1Y9UA 4F3BA 1LBCA 1S9TA 1AH5A 3LBSA 1A7LA 3N5LA 4IO5A 2F6GA 1URDA 1LSTA 3MZ1A 3S9NC 3GZGA 4JWOA 1FQAA 1OVBA 2AL4A 2Y7WA 1Y3NA 4YB6A 4F22A 5H8HA 2QS2A 2THIA 1FQFA 5H8QB 1B9JA 2XX7A 3W9VA 5DEXB 1II5A 4PFTA 3K2DA 2O68A 3N6TA 2Z8DA 3G3IA 1N7WA 3MP1A 3VXCA 1B51A 4MLQA 4EDPA 3LSWA 2ONSA 3N26A 4M4GA 2XXPA 3TFLA 3ILTB 1SBPA 4EQBA 3HO7A 2I0BA 4ESWA 1Q1KA 3RPWA 2X7QA 2F97A 3UORA 5H8SA 1A55A 4GRKA 5TPAB 2QS1A 3FJMA 3IB2A 3QUFA 3IK6B 3FVKA 2DWIA 2ZYMA 2DWJA 1R9LA 3TTMA 3CRBA 1EH3A 4LVQA 1NNTA 1QJMA 4HCYA 4LONB 5FHNA 5DVFA 3IOUA 4IGRA 4U22A 3RNNA 3KSJA 1QKAA 2ZXTA 4ELRA 4FECA 2Y7RA 1IXIA 4QF9A 3C4MA 4U4SA 1FTOA 1XHYA 1FW0A 5LOMA 2RC8A 2QMWA 4F2QA 3OO7A 4NF6B 4QSCA 3M3LA 3HHFA 4YZZA 1IITA 2PYYA 4I8CA 1DPEA 4IGTA 4R6YA 2Q88A 4KYDA 4F31B 2NVUB 2VD2A 2PT1A 3SEWA 1VFDA 1P1QA 3G3GA 2KLFA 1B2HA 1OQGA 1D3KA 4IO3A 1MS7A 2Z22A 3FVGA 1FQEA 3LSXA 1B52A 1QW0A 3QIMA 3T93B 2FNCA 2XXQA 1H3DA 4YKKA 4GD5A 3BKIB 2DVZA 4NE4A 4JWYA 4WEDA 3G3HA 4NF5B 1EZPA 5AA3A 3E13X 1KWHA 2G93A 3FVNA 4ZECA 5JTYA 3PMWA 5AA4B 4R72A 4RY1A 3G3JA 2QPQA 3ZKKA 2OCUA 3QXMA 1QUIA 2YJPA 3MZ9A 2D21A 4AB5A 4BDMA 1NH7A 1XVYA 4OTEA 3IORA 1MH4A 4DCXA 3CFZA 3A09A 2OZZA 3K0VA 4Q5TA 4LZ7A 2HZLA 5KDTB 1AIVA 3PUYE 2XD3A 3TPAA 3DLNA 2NWJA 4H67A 2DXRA 4FIMA 3KN7A 1N7XA 1B7ZA 1BP5A 5CMMA 1JW1A 3W15C 4NEDA 3K6UA 4HTGA 3T9XB 3CG1A 5M2VA 2ABHA 4NTLA 1FQBA 5A5XB 2Y7PA 3DP8A 1OVTA 1B6HA 4N13A 3RLFE 3O66A 2IA4A 2XXHA 1M5FA 1MG1A 2XX9A 4DIGA 1B1XA 3LSFB 5EYFA 5TP9A 3TELA 3OO6A 4IO6A 1UIVA 1B0HA 1FCKA 3HSTA 4GF8A 1LCFA 1SYIA 3CR9A 1DPPA 3O6IA 3FJ7A 2V3TA 2F7AA 1HSJA 3G3FA 3CVGA 3H03A 1P1UA 4I1DA 5ISUA 3IAZA 2V25A 4OERA 3H06B 1MQIA 1ATGA 1LGBC 4YKIA 5F7VA 4EUOA 4RXLA 3Q29A 3OXNA 2H25A 3C36A 5CI5A 4DXUA 4C1UA 1NL5A 3U8QA 4DDDA 4MH5A 3ZS6A 2R6GE 5L8DA 4KI0E 1NH8A 2D3IA 3IJOB 2I49A 3C34A 4BLAA 4G8MA 1NNFA 3OEMA 1OLCA 4LUBA 2F5XA 1YAEA 3OOAA 5I84A 1ZMGA 4ISUA 1N0TA 3ZKLA 4XTCQ 3QK6A 5I57B 4O3CA 3V8XB 3S2VA 2GRVA 1ZJLA 2HCAA 3K01A 4OWDA 1YPNA 2ZNUA 3T9UA 1XVXA 1SQYA 3V5AA 1MQJA 4PP0A 1YTVA 4WKMA 3TTLA 3CFXA 1LB9A 4F19A 4PQJA 1PBPA 3JZJA 4RK2A 3AXFA 1JW5A 4OQOA 3MUQA 2V93A 2XX8A 4DXCA 4KFQA 4JBZA 4PE5B 1ZBMA 1VE4A 4BDNA 4YKPA 3UGWA 1RKMA 3C33A 4F2OA 2DE2A 2F78A 1UTBA 2H99A 5K2YA 1MPDA 3MP8A 1N04A 1PB8A 4OFJA 5I56B 1BKAA 5I2NA 3M8UA 1A8FA 4X9TA 1GR2A 5FTIA 4OXVA 3Q25A 1NNKA 1QUJA 1JVYA 1R6ZA 3PD8A 3FXQA 4F3PA 1PC3A 2ZNTA 3KZGA 3K6XA 3V83A 5BWJA 3B6QA 3OD7A 4QSEA 3TYHA 1WODA 2ANJA 2I3WA 4PFYA 3KGCA 3M3FA 4C1TA 4H8IA 1RYOA 3ODBA 2F7BA 5AA2D 3GBBA 3K1NA 3C31A 1ANFA 1B05A 4XKNA 1FQCA 3VVEA 1MPBA 2XXYA 1WVJA 2VD3A 2CMOA 4EXLA 4H5GA 1MXXA 5H8NB 4U1ZA 1LFIA 2F6PA 3PMVA 3RY3A 1JQFA 5H8FA 3V89B 4NWDA 1Y3PA 3G3KA 3LSLA 1N3XA 1CB6A 4GVOA 4KCCA 2F34A 5BUUA 2ZMBA 4POWA 4AQ4A 3IO6A 2NXOA 2ALUA 5F1QA 2XXIA 2BJJX 1Y1MA 1Z7ME 5EHMA 3U1OA 1POTA 3RGYA 4ZE8A 1UTHB 3K6WA 4M1VA 2O69A 2RCAA 2DS9A 3HV1A 1N84A 3MAMA 3S9LC 3BFUA 2Q2CA 3PGFA 5I58A 4R2BA 1FTLA 4R9GA 3THIA 5JEIA 1SI1A 3PPPA 5CMKA 1PBQA 1I6QA 4JSOA 3H7MA 3CG3A 3BFTA 4JWXA 2VOZA 4NF4B 2DVCA 1TFAA 1Y4TA 1MXZA 2GHBA 3HN0A 4E0WA 3UA8A 3C9HA 3IOVA 4F3GA 1AL3A 2UVHA 1GVCA 1PB9A 1B5IA 4OFLA 3BBRA 4RPOA 2PVUA 4BDOA 4QRZA 3TDJA 3PD9A 1PB7A 2I58A 2A5TB 3TCGA 4DZ1A 3DELB 1FTJA 1B4ZA 1XOCA 4H5FA 3K02A 1VSOA 4QSDA 1I6AA 3QAXA 1B7UA 2DWHA 4PETA 1AOVA 4F1UA 2YLNA 1H45A 3U92A 1IXHA 1P99A 5KCJB 1JW4A 4G77A 1OQHA 4HW8A 5ELVA 2QS4A 1T0KA 4ZEFA 1IIWA 1O7TA 4ND9A 4X1DA 1MM6A 4Z7EA 4MLVA 1IQ7A 5AA1A 4RYAA 1MQHA 3PPNA 2NUVA 1DSNA 3QSLA 2WKYA 2M8CA 4QFOA 3TUSA 1QUKA 5AA2B 3EN3A 1NFTA 2Q89A 3Q26A 2XXRA 1I69A 1IUDA 5JK4A 4FEBA 1TWYA 4G68A 2UVIA 3CIJA 4K3FA 2XXUA 3ILUB 3N6UA 3IL1B 3RT6B 3DP6A 2UVJA 4G68C 4OEUA 1JVXA 4F18A 3PV0E 3USDA 2G29A 2RF1A 2ZNSA 1NMUA 4OZ9A 1H44A 1O63A 4P0IA 2HEUA 3FXUA 4R2FA 2GH9A 1P1NA 4THIA 3O28A 2B65A 3IX1A 2R9JA 1D9VA 4R6HA 1UIUA 3KOTA 2H9BA 3LUYA 1S50A 4P0GA 2CZLA 4ELOA 2OWTA 4RNSA 2R71A 1RYXA 4ZDMA 3VLVA 2QS3A 2Q2AA 1MM7A 1FQDA 5I59A 4C0RA 3KOSA 3FV1A 3C35A 5I2KB 5FTHA 5CC2A 4R74A 2UYEA 3OMBA 5HPQA 1JEUA 3TKDA 3WAEA 3UP9A 1US4A 1IEJA 4ZEKA 2PBWA 1ZU0A 4YU0A 4NF8B 1ELJA 3O2AA 3RQTA 1ZKBA 4XKRA 2H4IA 3TMGA 4FE8A 4KCDA 3N94A 4QFPA 1SW4A 4DE8A 5DVJA 3VXBA 4TQUQ 1Z7NE 3TAJA 2HXWA 4RA1A 3H6TA 1LAFE 5FHMA 3O9PA 4UACA 2ONRA 3E9XA 5H8QA 1GTKA 3S4UA 2HQ0A 5DEXA 3UIFA 3TZAA 4H8JA 3H6UA 3L6GA 3PPRA 4OEVA 4YICA 1SW5A 3IJXB 2HFBA 3MVXA 2RC7A 2XHDA 1F9BA 2OBGA 4I9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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