4C0RA

Molecular and structural basis of glutathione import in gram-positive bacteria via gsht and the cystine abc importer tcybc of streptococcus mutans.
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
MDKTVTLATVGTTNPFSYEKKGKLTGYDIEVAKEVFKASDKYDVKYQKTEWTSIFSGLDSDKYQIGANNISYTKERANKYLYSNPTASNPLVLVVPKDSDIKSYNDIAGHSTQVVQGNTTVPMLQKFNKNHENNQVKLNFTSEDLAHQIRNVSDGKYDFKIFEKISAETIIKEQGLDNLKVIDLPSDQKPYVYFIFAQDQKDLQKFVNKRLKKLYENGTLEKLSKKYLGGSYLPDKKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords PUTATIVE AMINO ACID BINDING PROTEIN
publication title Molecular and Structural Basis of Glutathione Import in Gram-Positive Bacteria Via Gsht and the Cystine Abc Importer Tcybc of Streptococcus Mutans.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus mutans
total genus 79
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4c0rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4c0rA02
4LONB 1PB8A 1PDAA 4OVJA 2I4CA 4H5FA 4YKPA 3UIFA 1OQHA 2XXTA 4TLMB 3KOTA 4EQ7A 1IZ1A 1KWHA 2F5XA 4EF1A 3CG1A 2XXIA 2X7PA 2AIXA 3N26A 1MDQA 3Q29A 3CG3A 4OHNA 4O3AA 3HO7A 3H6TA 1QJMA 4U21A 5K2XA 3KN3A 3TYHA 3K0VA 3KOSA 3N6UA 1YAEA 1MXVA 3TCHA 1Z7NE 3O28A 1OVBA 2F78A 1OLAA 5F7VA 4YICA 2O1MA 2HFBA 1B58A 2XD3A 3R26A 2XX7A 1ZBMA 4H8JA 3WAFA 3PUWE 1I6AA 3N5LA 3VLVA 1H76A 2THIA 1D3KA 2Y7PA 4I1DA 3HN0A 3LSXA 1QKAA 1FQDA 1NNFA 1B1HA 3V8XB 4YKKA 1ATGA 4F2QA 4NF4A 4G68B 3CRBA 5KCJA 1QKBA 4H6DA 1MY0A 4QHQA 1N76A 3VV5A 2I6EA 1FQBA 1B52A 2Z8DA 3QSLA 4LQ5A 4BDQA 2V3QA 2VP1A 4ESXA 3ZSFA 5H8NA 3K2DA 4OWDA 1LFHA 1B7UA 2Y84A 1A99A 3OO9A 3FJMA 3MPLA 4IO6A 2ZNSA 3S2VA 1EZ9A 2NUVA 3RT8A 1B5JA 1R9QA 5DT6A 5DVIA 3VXBA 1SI0A 4MH5A 1MY2A 3ZKKA 2RC8A 2E0SA 4NF6A 3OD7A 4OFLA 2ONRA 1FTLA 2I0BA 2Y7RA 5TPAB 4R2BA 1MQJA 5BWJA 2DS9A 3AXFA 5HBCA 1IEJA 4U1ZA 4ZEKA 3T22A 3RLFE 4HCYA 4GL8A 1GGGA 2B3BA 1SYIA 5AA1A 1B7HA 3BFUA 3QIMA 3W15C 4GFRA 3MVXA 3IR1A 5ICTA 3GZGA 1B6HA 5CMCA 1BKAA 5KDTB 5FHOA 4KYSA 4WXJA 3PPRA 2CZLA 1IXHA 3G3GA 1N84A 1BP5A 1VFDA 1IUDA 2PX1A 3O9PA 4F1VA 3CI8A 1O7TA 3MW0A 2AYSA 1ZU0A 3O66A 1PC3A 4ZEIA 4NF8B 5H8FA 2F35A 1GTKA 3K01A 4F39A 1ANFA 1JVXA 4RK9A 4BDMA 1JETA 3FVGA 1YTVA 4O3CA 5IAIA 2NWJA 1B40A 1UIUA 4DE8A 5AA4A 5H8QB 4G2ZA 4YU0A 3RPWA 3JV9A 4RK2A 4DLDA 4XKRA 1VSOA 3S9EA 2Q9TA 4FIMA 1B3HA 3T93B 4JWXA 4OMBA 4R9GA 4QSDA 3BFTA 3O29A 3G3JA 2H98A 1I6BA 2V3UA 1MS7A 3TTNA 1QULA 5M2VA 1A7LA 5B70A 3MJNA 1HSJA 4LUBA 4NF5B 1ZIUA 3EHSA 2H9BA 1EZOA 4ESWA 3TEPA 3KFMA 2ONSA 1B1XA 3UK4A 5CM6A 2ZNUA 1B51A 4ELQA 1JQFA 4NEDA 5CBRA 1OLCA 2DVCA 2PT1A 1JEVA 5ITOA 1QVSA 4KR5A 5I2NA 5ISUA 2O84X 4NMYA 2YLNA 5JEIA 1B3GA 1FTOA 3K6VA 4X1DA 3S4UA 4YB7A 2DXRA 4ZS9A 2DVZA 2RF1A 1Q1KA 3M8UA 2XX9A 3MWBA 4Z7EA 4AB5A 1SD3A 2ZMBA 1NMUA 5HM4B 2DWJA 4U4XA 4M1VA 1FTKA 4Z0IA 5DTBA 4DIGA 1LB8A 4FEBA 2OLBA 1LAXA 2R6GE 2UVHA 1I69A 4H5GA 4QSCA 3ODBA 1A8EA 3U92A 1NNTA 3W9WA 3RQTA 1AMFA 1Y1MA 3C9HA 1CE2A 2Y7WA 3H6UA 1XVXA 3K1PA 2UYEA 1Y3QA 3SEVA 2XXWA 4R9FA 4YZZA 3IJOB 3CFZA 3TZAA 4OQOA 1QUIA 2FA7A 3VLUA 3N94A 1JNFA 3M3FA 2QS3A 2UVGA 2Z22A 3O6GA 4LZ5A 4KD5A 2F97A 3EHUA 3VLWA 5AA2D 4OETA 4IY5A 2RCBA 1MRPA 4C0RA 3C33A 2QMWA 4ZZEA 1SW4A 3LSLA 1M5DA 1URGA 1LAHE 5L9OA 4IO5A 1FQFA 5EYFA 2I4BA 2QS4A 3Q26A 2ANJA 4QFKA 3PPQA 4RY1A 4X48A 4JDFA 3PUZE 4LP2B 2F7AA 4KHZE 4PFWA 3G3IA 3LC8A 2NXOA 5I57A 1QUJA 2HZLA 5I58B 2X7QA 4DCXA 3WAEA 3HHFA 4F2OA 4RXLA 3RY3A 5DYHA 5I56B 3EHTA 1UTHB 4NTLA 4GQOA 2YJPA 3S9MC 3EPEA 4MF3A 1XC1A 5EHMA 3E13X 4C1UA 1DTZA 1NH8A 3TMGA 2DSFA 3A3UA 3DP4A 5AA2B 2Y7KA 3K02A 5FTIA 3H03A 4K3FA 3O2AA 2Z8FA 1MM6A 3MUQA 4I9DA 2YPNA 5KCJB 3ECRA 3IO6A 2O6AA 1MY4A 3OSRA 3MP1A 1D4NA 3K6XA 3FXRA 3LSFB 1XHYA 5FHMA 5H8NB 1SYHA 3F11A 5I2KA 1MH4A 3PV0E 1UTBA 2QJEA 3QAXA 3U94A 4TOZA 3QUJA 4G8MA 2A5TA 2ZYMA 2DWIA 1WDNA 4BDRA 1IQ7A 4F3BA 1DTGA 4QF9A 3PMWA 1LGBC 4NF6B 5JTYA 4E0XA 3FVNA 3MZBA 4OERA 3FJ7A 2Q8JA 4MLVA 1LSTA 4YKIA 2VD2A 1YPNA 2PYYA 1II5A 1DPPA 3FGSA 1DSNA 1SW2A 3IOWA 3MVWA 5FTHA 3RGYA 1EH3A 2I3VA 4GD5A 3VVFA 1SW1A 1H45A 2RC7A 4OFOA 1IIWA 3H3GA 4JWOA 1B32A 1NNKA 4R73A 3CIJA 1EU8A 4Q8RA 1B7ZA 2D5WA 2FYIA 1RYOA 3T9UA 1LBBA 4OFJA 3U93A 1UQWA 4LZ8A 1D9VA 4PFTA 4LZ7A 5L8DA 3THIA 5J1DA 4PQJA 3PD9A 1WVJA 1ELJA 5CMMA 1MY3A 4ECFA 3K4UA 5DVJA 5A5XA 3TKDA 2I0CA 4GWOA 3LBSA 5IKBA 1BIYA 2ZNTA 2A5SA 4PFUA 2NOOA 1S9TA 4KYEA 5F1QA 3LR1A 5CRYA 3KBRA 4RNSA 3E9XA 5TP9A 3VVEA 3CR9A 3SEUA 3Q27A 4G68C 2XHDA 5ICQA 1VE4A 4F3GA 2HZKA 2REJA 4QFLA 4GIZA 5DEXB 3UORA 2V93A 3MC2A 4MBPA 4FECA 2ZYKA 5ELVA 1QUKA 3GBAA 3MZ9A 3RTWB 4FORA 4GVOA 4IGRA 1D9YA 3IAZA 4F1UA 1SQYA 1VFEA 4GOTA 3OOAA 3PUXE 4ELRA 4LVQA 4P0GA 1GR2A 2HCAA 5CI5A 2GHBA 4TLLB 4G8NA 1EZPA 4R6HA 5DVFA 4KQPA 1JVYA 3KJ7A 4JSDA 2CMOA 2W7YA 3TTLA 2XXUA 2RCAA 3OO6A 1UIVA 3MQ9A 5CMBA 4G68A 4G8HA 1XOCA 4IO2A 3IOUA 1R6ZA 3TELA 4ISUA 1GVCA 3B6WA 4IO7A 5ITPA 4UACA 2PBWA 4KCDA 2UYFA 3PUVE 4PFYA 1TXFA 4F29A 3T9XB 1PEBA 1HSLA 5B7DA 5H8HA 3BKIB 4L17A 3Q25A 3T9HB 2F7CA 3K00A 1LAGE 1B05A 3FJGA 3N6TA 2I3WA 2QRYA 4YAHX 3IB1A 1P99A 3SDFA 4H0WA 3RTFB 3C4MA 3SEXA 1LAFE 5TPAA 2HQ0A 2XXXA 2QS2A 1S50A 2QPQA 2Q88A 2QSXA 2OWTA 3QYTA 1FTJA 1Y3PA 3KG2A 1IXIA 3H6WA 4N07A 2UXAA 3CSGA 3MPKA 3FVKA 2ESNA 4LA9A 4HTGA 3IL1B 3KGCA 1A55A 3FXQA 1H44A 4ONYA 3FATA 3FXUA 2XXVA 2GRVA 3MVYA 4KPTA 2H99A 4HW8A 3OELA 2R9JA 4RYAA 4JWYA 3G3KA 2B65A 1AOVA 1AH5A 2NVUB 2D21A 4DCYA 1B46A 4XIGQ 3U72A 3VVDA 4WEDA 3PMXA 1ZTYA 4U23A 3U1OA 2I48A 4NF8A 1TWYA 2PT2A 3HPIA 2G29A 4YMBA 1J1NA 2F8DA 2IA4A 2ABHA 3ZKLA 1F9BA 1XVYA 1N3WA 1US5A 1Y4TA 4F31B 1A8FA 4Q5TA 4QFOA 5I84A 3HCQA 1FCKA 2V3TA 1XT8A 4XXUA 4X9TA 4R6KA 2VD3A 2O1LA 1AL3A 5HPQA 2OK2A 4P11A 3SESA 3OSQA 4AB6A 5LOMA 4R75A 2ZXTA 2F6PA 4G77A 4RPOA 2E1SA 1B5HA 4OEUA 3TTKA 3E4RA 2HAUA 3KSJA 4FJPA 3PD8A 4NF5A 4GXAA 3FZVA 2R71A 5I2KB 4UA8A 2LAOA 1LBCA 1OMPA 4OTEA 4JBZA 4F18A 3TPAA 3QUFA 2PMSA 5I59A 4WKMA 3V89B 4ZZAA 3SKPA 4GXSB 4H1XA 2F34A 1NH7A 3IB0A 3MP8A 4BLAA 3D4CA 2O51A 5TU0A 3ONMA 2O69A 3A3CA 4IB2A 2DXYA 3E3KA 1DOTA 5JTYB 1IXGA 3MZ1A 1MPDA 4ZECA 4JB7A 3C31A 2P2AA 1T0KA 3LSWA 3UP9A 1JW5A 2F7BA 3IJXB 4OZ9A 3QK6A 3KN8A 4DXUA 4EUOA 4M4GA 4IY6A 1N7XA 4H8IA 2FNCA 4Q30B 1GV8A 2M8CA 1A40A 1NFTA 1B3LA 3FIRA 3SEYA 1USYE 1MXYA 3RNNA 3VDFA 4OESA 1Z7ME 4U4SA 4H67A 3T9VA 3M3LA 1MQDA 4IO3A 2DE2A 3RN8A 1OQGA 2DE3A 3K6WA 2V84A 3IO4A 4NF4B 4FE8A 1P1OA 1MXZA 4OXVA 4ZEBA 2GFEA 4E0WA 1NL5A 1OVTA 2H5YA 2DE4A 4OYVA 2Y7IA 3S9LC 1O64A 2XXHA 4FEDA 1FW0A 2ZYOA 3A09A 4F22A 5K2YA 3FASA 4RPNA 1R9LA 5L9MA 4EDPA 3OMBA 4LQ2A 4RA1A 2GHAA 1USYH 3FV1A 4THIA 3EF7A 2PVUA 2Q89A 1M5FA 3L6HA 3K6UA 4R74A 2O68A 3TQLA 3MP6A 5CC2A 1SVXB 4POWA 1IITA 3TUSA 2OZZA 1CB6A 4XTCQ 1POY1 3OEKA 3VE1B 4ZDMA 1MPBA 3PU5A 5I58A 3OO8A 1N3XA 1XS5A 3ZS6A 1B3EA 2P0SA 4ZE9A 5I56A 2QMXA 4BDLA 1UTHA 1LB9A 1MPCA 2HXWA 2XXQA 3HV1A 4R2FA 1JW4A 3I3VA 2DWHA 3B7DA 5AE4A 5AA2A 3M3KA 1RKMA 2XXRA 4C1TA 4GRKA 1AIVA 1NNPA 3CVGA 4PP0A 1US4A 4EXKA 2DQVA 1P1WA 2OWSA 5KZTA 1B2HA 4QRZA 5FHNA 1YCJA 1FQCA 3L6GA 5H8FB 2XXPA 3BBRA 4F3PA 3TCFA 1HSEA 1N7WA 5CBSA 5H8SA 1LCFA 1B4ZA 5H8HB 3VXCA 1BLFA 4JXIA 5CMKA 5AA4B 3G3FA 2IEEA 2I49A 1N0TA 3C35A 2XXYA 3SERA 1URDA 4KI0E 1NKXA 4HCWA 3G7WA 1ZLQA 3O6IA 4MFIA 1H3DA 3TQWA 3PPPA 4NWCA 3OENA 3V5AA 3DP6A 3PMVA 4WEPA 2F36A 3TDJA 2QS1A 2REGA 3R6UA 3PUYE 2DWAA 2Q2AA 3CFXA 3SEWA 1MXXA 1LLSA 1IXCA 2VOZA 1P1UA 3KSXA 2OBGA 4XKPA 1DPEA 4HS7A 4GF8A 3OXNA 2DP8A 3RT6B 4MLQA 4QSEA 2UVIA 3TAJA 4RJZA 4JSOA 2H4IA 3Q28A 1MY1A 4DZ1A 4XKQA 1TFDA 5I2NB 2UVJA 3CSBA 1Y3NA 3O97A 1FTMA 5L9SA 3PGFA 4R6YA 3TTRA 3CFLA 4KCCA 3C36A 1URSA 3UN6A 3C34A 4ZEDA 3IOVA 1BTJA 1MG1A 3DP8A 3H06B 4I8CA 4I62A 3ILTB 1Y9UA 1Y4CA 3IB2A 3V83A 1TFAA 1JW1A 3TTMA 1R1NA 4YKJA 3FUZA 5DEXA 3P7IA 2XX8A 1SDXA 1L5TA 1B0HA 1LCTA 2XD2A 3USDA 3K1MA 5TP9B 2P1SA 1MXWA 2OJTA 3KJTA 3EN3A 4OEVA 4KFQA 4U2RA 3W9VA 3H7MA 2ALUA 3JZJA 4EXLA 1TT1A 1B3FA 1S7YA 1SW5A 2HEUA 1QW0A 3TFLA 4KYDA 5EHSA 3PPOA 3B6TA 4BDOA 1ZJLA 4G4PA 2B3FA 3GBBA 5KDTA 1Y20A 5I59B 1SBPA 3C32A 3IOTA 1B4HA 2KLFA 4U22A 3O6HA 3RUMA 4Q0CA 4GLIA 3FV2A 2GH9A 2ONKE 2Q2CA 1RYXA 4O3BA 2H25A 4YB6A 3JYRA 2HAVA 2VGQA 1LFIA 5I57B 3FD3A 1M5BA 3KZGA 2DYXA 3EQ1A 4EQBA 3B6QA 3I6VA 5H8QA 3UA8A 4YMAA 4NWDA 3H4ZA 3T96B 3U8QA 1PBQA 2BJJX 3K1NA 3DM0A 4QFPA 3DELB 3OEMA 4IO4A 4DDDA 4FAJA 4ELOA 4R72A 2ZYNA 3MVZA 4F3SA 1Y1ZA 3UGWA 3KEIA 3GXAA 1MQGA 1MDP1 4QFNA 1O63A 1WODA 3GLBA 2VHAA 4DXBA 5JK4A 4PE5B 1P1NA 1POTA 3FVOA 2V25A 3G3HA 4EF2A 1MXUA 1FQAA 1MH3A 4BDNA 1UTBB 1VR5A 4XKNA 2A5TB 2RC9A 1N04A 3DLNA 3IORA 1B0LA 2WKYA 3TODA 1MQIA 1PB7A 4LATA 3TCGA 1JEUA 2OCUA 1M5EA 3HHGA 3ILUB 3IK6B 3MBPA 2D3IA 2X26A 2O7UA 1ZKBA 1P1QA 4F19A 4FATA 3OO7A 2F6GA 2AL4A 1DMBA 3R7XA 1MQHA 1H43A 3D4GA 1A54A 4ZEFA 4EQ9A 4TQUQ 2RKMA 4H65A 4GL0A 3VFJA 1LFGA 3LUYA 2QL3A 1FQEA 4P0IA 4POXA 3IX1A 3H6VA 1B9JA 3I5OA 4PETA 4X1BA 2I58A 4YB5A 4U1OA 1I6QA 4IGTA 1M5CA 2Z23A 2RINA 3MAMA 5A5XB 4AQ4A 1PBPA 3PPNA 3QXMA 3T66A 3S9NC 1SI1A 1ZMGA 4N6PA 4ZE8A 4ELPA 1B5IA 5AA3A 1PB9A 2O7IA 2G93A 1OIBA 3HSTA 2DOJA 2Z8EA 3KN7A 5BUUA 4N13A 4F1YA 4OENA 4ND9A 1Q35A 1MM7A 2AL5A 4DXCA 3SETA 4NE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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