4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
4WEDA 1FQCA 1MXYA 1LBCA 2DOJA 1I6BA 3TAJA 2F35A 1MQHA 4ELPA 4ZEFA 1JVXA 5H8SA 4IO6A 2OBGA 4FJPA 4QSDA 4RJZA 1AMFA 2UYFA 4U22A 4QFOA 1JQFA 3TUSA 1JNFA 1DMBA 2D21A 4YKPA 4GF8A 3IORA 5HPQA 1H76A 5DVFA 3DP6A 1A8EA 1SDXA 3JYRA 4OFLA 2F97A 1A40A 1POTA 3FVKA 4EDPA 3CFZA 4OERA 4KQPA 3PPNA 2XXWA 4IO7A 3JV9A 3E3KA 2F5XA 2Z8DA 1IITA 2YJPA 2RINA 3KJTA 3SEWA 4IB2A 4I8CA 3HN0A 3K00A 4UACA 4OFJA 1LFIA 4MLQA 2VP1A 2I0CA 4XXUA 5IAIA 2ONRA 4JBZA 1R9LA 3T9XB 4G68C 4HCWA 1B3EA 2G29A 4GOTA 1MQJA 4I9DA 5H8NA 3TCHA 2A5SA 5TP9B 4X48A 2UXAA 3SEUA 3MVWA 5AA2B 1Q35A 3IOTA 1Y3QA 5LOMA 4LVQA 5DVJA 4OXVA 4C1TA 2XXRA 2F34A 3LC8A 1JETA 4NF8A 5EYFA 2QPQA 1MM7A 2V84A 3PU5A 1JW5A 1JW1A 3G3GA 3LBSA 1D9YA 1TFAA 3H4ZA 1SI0A 1GGGA 3MPLA 3UIFA 1XT8A 1LB8A 3T22A 4F3PA 4LA9A 4ZE8A 3U93A 3RNNA 3FV1A 3HPIA 4Q8RA 4OQOA 1NL5A 1NNPA 2V25A 5H8QB 2ZNUA 1M5DA 4OTEA 4G8MA 2Z8FA 3K1NA 2QRYA 1UQWA 5ISUA 1B6HA 4DXCA 4N07A 4GIZA 3USDA 4BDOA 2XX9A 3PPOA 3Q29A 3BKIB 2P1SA 3S9NC 1MQGA 4F2OA 2P2AA 4OHNA 1AL3A 4U1OA 4MBPA 2F78A 1ELJA 3T9UA 4Q5TA 2ZXTA 4GQOA 1N0TA 3PUXE 3MP8A 1HSEA 3MVXA 2RC7A 3Q26A 2HEUA 4BLAA 2QS4A 1B3FA 1URDA 3C36A 3S2VA 1DTZA 2H99A 3G3JA 2XX7A 2GFEA 3B6TA 3FATA 5AE4A 4OFOA 1LAXA 3QAXA 2HXWA 3S9EA 4EUOA 4R2FA 1USYH 3PD9A 3Q28A 1DSNA 1WDNA 5FHOA 1JEVA 3C35A 4ZEIA 3K1MA 4HCYA 5CBRA 3PGFA 2IA4A 1AOVA 1OVTA 1NNKA 4R72A 2RC8A 4F1YA 4IGRA 1H3DA 4XKPA 4X1BA 5ITOA 1SW1A 2I4CA 4FEBA 3CG1A 3SEYA 1NNTA 4YKIA 2F7CA 3FJGA 3GZGA 4TQUQ 3PPRA 5FHNA 5F7VA 2F8DA 3E9XA 4XTCQ 3TCGA 3CFLA 1SI1A 3B7DA 5ICTA 4E0WA 3U92A 3A09A 4U4SA 2NUVA 2XD2A 1II5A 1A99A 2XXIA 3VXBA 2YPNA 5ITPA 3SEXA 4EQBA 3PUZE 4YU0A 2B65A 2OLBA 4ZEDA 3A3CA 3RPWA 4PFYA 3H6UA 3QUJA 2Q9TA 2RKMA 2VD2A 3EF7A 1R6ZA 5L9MA 5CC2A 2DWJA 2G93A 1A7LA 4UA8A 5DTBA 5KCJA 5B7DA 3C32A 5I58A 1IIWA 5TP9A 3ZSFA 4ISUA 3RLFE 1IXHA 5AA2A 1D4NA 3MZBA 2I3WA 4C0RA 4PE5B 1L5TA 1US5A 2ALUA 4P0GA 4R2BA 3EQ1A 1MH4A 3U1OA 3EN3A 3FZVA 2DSFA 4P11A 3S9MC 3ZKLA 1B4ZA 2DP8A 2THIA 1LBBA 1MQIA 3MVZA 1SD3A 4ZDMA 5H8QA 1OQGA 3MPKA 3N26A 4R9GA 3IOUA 3MUQA 4NF4A 1ZKBA 3Q25A 1A55A 2XD3A 2QSXA 2ZYOA 1XS5A 4R75A 1PDAA 4POXA 3T96B 3IJOB 1ZLQA 2CZLA 3Q27A 2Y7KA 5DEXA 4GXAA 2GHBA 1MS7A 5JK4A 4XIGQ 4EXKA 4O3BA 2Y7WA 2PYYA 3R7XA 1B0LA 4ONYA 1H45A 1JW4A 5AA3A 2XXQA 1FTMA 2I6EA 3C31A 2HZKA 3ILUB 3K6XA 4F29A 4DIGA 3VVFA 3KN3A 1B52A 5HM4B 2ZNTA 2OWSA 1XVYA 2DYXA 1OVBA 4PP0A 3C4MA 2ONKE 3MQ9A 3H7MA 3SEVA 1B3GA 1DPEA 4ELOA 3VLVA 1POY1 1QKBA 4JXIA 4BDLA 2F7AA 4DXBA 1EZPA 2QS1A 3ODBA 4ZECA 2NWJA 1MXZA 3IAZA 2ANJA 3OO9A 4IO4A 1QKAA 3LSWA 1PB7A 2F36A 1NH8A 4NWCA 3MW0A 4GRKA 4PFWA 4H67A 5DYHA 1NKXA 2PX1A 1Z7NE 4TOZA 5FTHA 3BFTA 1FTKA 3S4UA 3O28A 1FQDA 5CMKA 3H6TA 5I56B 3KN7A 1B1HA 1NH7A 3IB0A 5BWJA 3GLBA 3KSXA 4H0WA 4L17A 3K4UA 1XC1A 4RY1A 2W7YA 3CFXA 1QULA 3V83A 3IK6B 3R26A 1Y1ZA 3RY3A 3TQLA 3JZJA 1QJMA 4YB7A 3D4CA 1B7ZA 3IB1A 4Z0IA 1JEUA 1R1NA 4ZE9A 2UVIA 3O6GA 2V3QA 5EHMA 3S9LC 3TKDA 1TFDA 3RN8A 2Z22A 1M5BA 3KOTA 2X26A 1B2HA 3K2DA 3IR1A 2UVGA 3FIRA 2V3UA 3PV0E 4DXUA 4F19A 4O3CA 1T0KA 3B6WA 1MXVA 2X7PA 5FTIA 1S7YA 3CIJA 1Q1KA 1FTOA 4AB6A 2DE4A 2O69A 4KCCA 3QXMA 2P0SA 3FJMA 4U1ZA 4QRZA 3RGYA 3M3KA 3TZAA 1PC3A 4PETA 4LQ2A 3RUMA 2O1LA 4GVOA 3TCFA 2V3TA 2DXYA 3ECRA 1O63A 1CB6A 2XHDA 4H8IA 3QSLA 4FE8A 1B3HA 1B7UA 5H8FB 5HBCA 4LQ5A 3EHTA 1MY3A 3H03A 3FASA 5DT6A 3PUVE 2REJA 2H9BA 4LZ7A 4K3FA 3G3HA 1FQAA 4NMYA 4NF6B 3MP6A 4YKKA 4KYSA 2E1SA 2VHAA 1XHYA 2O51A 4KYEA 4KI0E 2NXOA 1URGA 1GVCA 3TTMA 5BUUA 3FVGA 2F6GA 3K0VA 2Q2CA 4G8HA 3OMBA 3TYHA 3CVGA 1B7HA 4U21A 3TDJA 4H65A 4TLMB 3FD3A 1MPBA 4NEDA 1MXXA 3MWBA 1ATGA 3RTWB 4KFQA 2DWIA 2XXXA 3TODA 3KFMA 4ZZAA 1A8FA 5JEIA 3U94A 1ZIUA 2D5WA 3GBAA 1LGBC 2Q89A 2F6PA 4YB5A 4F22A 2UVHA 2GHAA 2I0BA 4YB6A 1MRPA 2H4IA 2HFBA 2GH9A 1YTVA 2R71A 3MBPA 3OOAA 4LUBA 4RPOA 1BP5A 3DP4A 2E0SA 5I56A 3PPQA 4WXJA 4RYAA 1UTHB 2AL4A 2AIXA 4THIA 4QHQA 1NFTA 2QMXA 3THIA 3GBBA 2ZYNA 2B3BA 4YKJA 1VSOA 1B46A 4KCDA 1EZ9A 2Y7IA 3I3VA 2PBWA 4Q0CA 1B3LA 2VGQA 2HZLA 3TPAA 3W9VA 4Q30B 1GV8A 3OD7A 2F7BA 2XXVA 3CSBA 3UA8A 1SW4A 4G77A 1DTGA 2M8CA 4KD5A 1I6AA 3UP9A 3E4RA 3HCQA 3TTKA 3VLWA 3MZ9A 2RCAA 4ZEBA 2OK2A 1OIBA 3L6GA 2A5TB 4KHZE 4FEDA 1LCTA 4G4PA 1O7TA 1BTJA 1MQDA 1MY4A 3V8XB 4N13A 3IOVA 2H25A 4RA1A 1I69A 4JWYA 3HO7A 5H8FA 4F2QA 3OENA 3IJXB 1I6QA 4ECFA 2PT1A 3FVOA 4EXLA 4O3AA 1LFHA 2ONSA 4JWOA 3G3FA 4RXLA 4OESA 3VXCA 4NF6A 3MP1A 4F39A 2HCAA 2DWHA 4OZ9A 1B58A 1VFEA 1UTBB 4GXSB 1YCJA 4U23A 1MY1A 4RPNA 3TTLA 3FXUA 5TPAB 5CRYA 2OJTA 2AL5A 3B6QA 3TEPA 4ESWA 3OXNA 5J1DA 3QUFA 3O6IA 3C33A 1LFGA 1F9BA 4FATA 1RYXA 1LAFE 2DWAA 3N5LA 1PBPA 2QJEA 3H3GA 3LR1A 3CSGA 3OEKA 4QFLA 4LZ8A 1ZMGA 4ND9A 2I49A 1GR2A 1B32A 2REGA 4FECA 1N76A 3FJ7A 4AQ4A 1ANFA 1MPCA 4H5GA 5L9OA 4WKMA 5AA4B 3N6UA 3FV2A 3KGCA 1N7XA 4ZS9A 1IUDA 1Y4TA 5H8NB 3OO8A 3F11A 3A3UA 1MY0A 4RK2A 1MXUA 5JTYB 4PQJA 3G3IA 3O6HA 1B9JA 3W15C 1P1NA 1Y3NA 1LAGE 1VE4A 1OMPA 5ICQA 3ILTB 4FORA 1CE2A 4NF8B 5KZTA 4R74A 1M5EA 3T9VA 4JSDA 4QSEA 3K1PA 2H5YA 3DM0A 1IEJA 4I1DA 1TXFA 2ABHA 3T66A 2DQVA 1QUIA 1Y9UA 4BDQA 4LONB 3H6VA 3G3KA 3PD8A 1MXWA 1TT1A 3KEIA 2NOOA 1UTHA 3UK4A 5M2VA 3SKPA 3I5OA 3KOSA 2O7UA 3DLNA 4OMBA 1HSJA 1B4HA 3T93B 2BJJX 3V5AA 4Z7EA 1ZU0A 1Y1MA 2WKYA 3L6HA 1M5CA 1B5HA 3FUZA 4TLLB 3K01A 4GL8A 3MAMA 3KZGA 4YICA 2R9JA 1P1OA 5K2YA 1XOCA 1N84A 3PPPA 3VVDA 2Q88A 3IO4A 3VFJA 3T9HB 3O2AA 2Y7RA 3G7WA 2X7QA 1NNFA 2QS2A 1IXCA 5I2NB 4NE4A 2FA7A 2DE3A 1ZTYA 5AA2D 3DELB 4IGTA 5B70A 2O7IA 1VFDA 3HV1A 1LAHE 5A5XB 2HQ0A 4FIMA 5I59B 1IXIA 4DE8A 3FXQA 2AYSA 4JB7A 3RT6B 5CMMA 3AXFA 1IXGA 1ZJLA 1NMUA 3UGWA 4KPTA 4U4XA 1B5IA 1P1UA 3PMXA 4G68B 4IO2A 2RCBA 3PUWE 4WEPA 3PMVA 1FTJA 4LZ5A 3EPEA 2QS3A 1UTBA 1QW0A 1OQHA 4N6PA 5CMCA 2XX8A 4OENA 3IOWA 4F31B 5CI5A 2Q2AA 5TPAA 2OCUA 3VDFA 4R6YA 4F3GA 4ZZEA 2OZZA 3O97A 3O9PA 4HW8A 3VLUA 3OEMA 3N94A 1SQYA 3EHSA 4IY5A 5F1QA 4EQ9A 4BDMA 2PMSA 3MZ1A 1B51A 4X9TA 1SW2A 2Q8JA 3ZKKA 1LSTA 1A54A 3H6WA 5I2KB 1B05A 2XXHA 5AA4A 4DCXA 1Y20A 3CRBA 1MG1A 3HHFA 4XKRA 4H8JA 5KCJB 4YZZA 5I58B 3DP8A 2DVZA 5JTYA 2D3IA 4GFRA 4QFNA 4QFKA 4F3BA 3LSLA 2DE2A 4H6DA 1QVSA 3ONMA 5FHMA 1USYE 4QFPA 1S9TA 1YAEA 2DVCA 3TFLA 4OEUA 3QYTA 2Y84A 1IQ7A 3R6UA 4F1VA 4F18A 4MLVA 1YPNA 3LUYA 4NF5B 2OWTA 5CMBA 4LATA 4POWA 1URSA 1IZ1A 1B1XA 4E0XA 1FW0A 1TWYA 3OO6A 3GXAA 1H43A 3CR9A 1FCKA 2UVJA 4HTGA 4MFIA 3UORA 5H8HB 3K02A 2GRVA 4NF4B 1SYHA 4JWXA 4DZ1A 4GL0A 4X1DA 2R6GE 3BBRA 1B40A 1WODA 3TTNA 1O64A 5KDTB 2VOZA 5DEXB 3W9WA 4FAJA 4YAHX 3M3FA 2ESNA 2FNCA 3RQTA 2QMWA 2NVUB 5EHSA 4H5FA 3FGSA 2QL3A 4G2ZA 1KWHA 1Y4CA 2IEEA 2I48A 5I2NA 3LSXA 3CG3A 2I4BA 2LAOA 1SBPA 1QUJA 1LCFA 4ESXA 2Z23A 5A5XA 5I59A 1SYIA 3MC2A 2HAUA 1D3KA 1OLAA 5L8DA 2O6AA 3OSQA 1SVXB 2O1MA 4EQ7A 2DXRA 3SESA 3VVEA 1MM6A 3SDFA 3D4GA 5I57B 3KG2A 5AA1A 4P0IA 1GTKA 1XVXA 4OWDA 5CM6A 4G68A 3IL1B 3O66A 1S50A 1Y3PA 4IO5A 4G8NA 1PB9A 3TQWA 1ZBMA 1OLCA 5I84A 3M3LA 4RNSA 2RF1A 3IB2A 4R73A 1EU8A 4F1UA 3TELA 4M4GA 2HAVA 1SW5A 4YMBA 3HSTA 4JSOA 4ELRA 3K6WA 4HS7A 4R9FA 3ZS6A 1N3XA 4R6HA 2VD3A 4DCYA 3SETA 1QUKA 3MJNA 3K6VA 4LP2B 1N04A 2XXUA 1MH3A 3UN6A 4IY6A 4KYDA 4IO3A 3I6VA 1BIYA 4MF3A 5I2KA 1PB8A 2B3FA 3V89B 3H06B 3FXRA 4C1UA 1PBQA 2ZMBA 4QF9A 3M8UA 1MDQA 3IX1A 3MVYA 2XXYA 1UIUA 2ZNSA 3QK6A 3N6TA 3EHUA 2YLNA 4NTLA 4YMAA 1HSLA 4PFTA 4DDDA 3C34A 3VE1B 2ZYKA 1FTLA 1M5FA 1RYOA 3C9HA 4GD5A 4JDFA 4NF5A 3CI8A 1P99A 5CBSA 1B0HA 4H1XA 1LB9A 4XKQA 3O29A 1UIVA 4EF2A 1EH3A 1MY2A 4BDRA 1MPDA 2I3VA 1AIVA 4DLDA 1PEBA 5L9SA 2CMOA 3PUYE 5H8HA 1DOTA 5IKBA 2XXPA 2PVUA 2Z8EA 4I62A 3KJ7A 1RKMA 3TMGA 5KDTA 4AB5A 1JVYA 1BLFA 4OVJA 1R9QA 4U2RA 3KBRA 3RTFB 3OO7A 5K2XA 2Y7PA 3BFUA 1US4A 5ELVA 1B5JA 4M1VA 2RC9A 3KSJA 2V93A 3KN8A 3FVNA 2UYEA 3IO6A 1J1NA 3P7IA 1Z7ME 4ELQA 1D9VA 1LLSA 2FYIA 2H98A 1BKAA 1WVJA 3U72A 4BDNA 2O68A 5I57A 4KR5A 1DPPA 1P1WA 4RK9A 3HHGA 2I58A 3LSFB 4XKNA 5TU0A 1N3WA 4NWDA 4QSCA 2KLFA 1AH5A 1VR5A 1P1QA 4ZEKA 2ZYMA 1EZOA 4MH5A 3WAEA 4OETA 1FQFA 4PFUA 2PT2A 1FQEA 1FQBA 1MDP1 2A5TA 3OSRA 4R6KA 3U8QA 3PMWA 2DS9A 3WAFA 4GLIA 3K6UA 3OELA 4GWOA 1H44A 3QIMA 4EF1A 2XXTA 4OYVA 5DVIA 4OEVA 3E13X 3TTRA 3SERA 2O84X 4F3SA 1N7WA 3VV5A 3RT8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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