4DZ1A

Crystal structure of dals, an atp binding cassette transporter for d-alanine from salmonella enterica
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
IVEGRTLNVAVSPASPPMLFKSADGKLQGIDLELFSSYCQSRHCKLNITEYAWDGMLGAVASGQADVAFSGISITDKRKKVIDFSEPYYINSFYLVSMANHKITLNNLNELNKYSIGYPRGMAYSDLIKNDLEPKGYYSLSKVKLYPTYNETMADLKNGNLDLAFIEEPVYFTFKNKKKMPIESRYVFKNVDQLGIAFKKGSPVRDDFNLWLKEQGPQKISGIVDSWMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords DalS D-Alanine transporter
publication title Characterization of DalS, an ATP-binding Cassette Transporter for D-Alanine, and Its Role in Pathogenesis in Salmonella enterica.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica
total genus 75
structure length 229
sequence length 229
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dz1A02
3PUXE 5IAIA 3A3CA 1TWYA 2X7QA 1SI0A 3PUVE 4IB2A 3MP6A 2AYSA 4AB5A 4DDDA 1FQFA 3EHTA 1DPPA 2QPQA 3U1OA 2DYXA 3UP9A 2B3BA 3RQTA 1GV8A 1B7ZA 1P1UA 3Q29A 1QKBA 3LSLA 2ZYNA 4OXVA 4G68B 1XS5A 3EPEA 2G93A 2NXOA 2V25A 4JWXA 2VP1A 1PBPA 4NF8A 1R9QA 4F1VA 2PT2A 2DVZA 2PT1A 3QIMA 4P0GA 2D5WA 4EUOA 2O51A 2E1SA 4POXA 4LA9A 3TAJA 1A8FA 2IA4A 3PU5A 1IXHA 4R72A 4GD5A 3HV1A 1A8EA 1Y3PA 4QRZA 4YKKA 2THIA 3S9EA 2I0CA 5FTIA 4YB6A 4OFLA 4F18A 3FVOA 1N76A 1Q35A 1JVYA 2ONSA 4F19A 5DYHA 1B05A 5TP9A 3S9NC 4F39A 2XXPA 3K2DA 3PUYE 1IEJA 3K6XA 3V8XB 5DEXB 1JW4A 3SEVA 3MZBA 1QW0A 1SW1A 1LCTA 1FTJA 3IOTA 3SKPA 1NNPA 1RYOA 1OLAA 4GL0A 1QUKA 2QL3A 3CR9A 2XXIA 3C34A 2VHAA 3PMXA 5CC2A 3RTWB 2QSXA 4QSEA 1POY1 4NWDA 4U23A 4R74A 3RN8A 2RC7A 1UTHB 3ODBA 4RK9A 4FEBA 4N13A 4LQ5A 4EQBA 2RCBA 1LBBA 1LAFE 2FYIA 4MH5A 3EQ1A 5I2NA 3PMWA 3KZGA 2WKYA 1TXFA 5JK4A 4ESXA 2ZXTA 1DMBA 4EDPA 3VVEA 5KZTA 4R6KA 3MPKA 4BLAA 5AA2A 3N5LA 3Q28A 2REJA 1POTA 4MBPA 3OO6A 4JWOA 4RYAA 4R2BA 4LVQA 2F5XA 3W9VA 2NWJA 5HM4B 4G8NA 5I58B 2GHBA 3GBAA 3P7IA 3SDFA 5KDTA 3MW0A 3T66A 4ZEFA 3MP8A 3PD9A 4LZ5A 3DP8A 2Y7PA 2O7IA 2O1LA 1UQWA 4RY1A 5H8SA 3MAMA 4ZS9A 1JNFA 3E13X 1XVXA 4ZDMA 1A40A 2XXVA 3PPRA 1ANFA 2KLFA 1NNKA 3CG1A 1IZ1A 1H45A 5L8DA 1JEVA 1IIWA 1SW5A 2UVIA 4ELQA 2UXAA 3PUWE 2I0BA 2V3QA 3MQ9A 4ZZAA 1CE2A 1MH4A 2ESNA 3V5AA 3TTLA 4PETA 3I3VA 4ELRA 4OVJA 1GTKA 4IY6A 4NMYA 1XVYA 3TMGA 4N6PA 2DWIA 3T9VA 1ZIUA 3O29A 4R9FA 3SEWA 5H8NB 1BTJA 2QS1A 4TLMB 2H4IA 4YU0A 5TU0A 1Q1KA 3GZGA 3K02A 3TKDA 1B5HA 1LGBC 3OEMA 4M4GA 4X1DA 1Y4TA 1S7YA 1L5TA 3HCQA 2DXRA 1D9YA 1DOTA 4DXUA 4FAJA 2V93A 2R9JA 5CMBA 4YB5A 2OJTA 2YPNA 3ILTB 1BKAA 3MVYA 1N84A 5H8FA 4FJPA 4U4SA 4IO5A 4P11A 2Z22A 2AL4A 4Z0IA 4FORA 4PFUA 1MDP1 4BDMA 2I49A 1MH3A 3C35A 1NL5A 4OZ9A 3QUJA 4U2RA 4ZZEA 1B5JA 2QRYA 3ILUB 1B3LA 5JEIA 4LP2B 4EQ7A 1UIVA 4GXSB 4QHQA 4QSDA 3MPLA 1MQJA 2UYFA 1Y1ZA 2DP8A 2FNCA 2XXXA 1TFDA 4JDFA 3VE1B 5AA4B 1Y4CA 1XC1A 4R6YA 1FQBA 3VLUA 4JB7A 2F8DA 3VFJA 2AL5A 4KHZE 1MQHA 4H5FA 1VSOA 1P1QA 2VD2A 1QUIA 4H8JA 4GFRA 1RYXA 3FJ7A 4G4PA 4XXUA 2YJPA 3OSRA 1ATGA 3LUYA 3C4MA 4KI0E 4F1YA 1B40A 3ZKLA 2QS3A 4LUBA 4N07A 4LATA 4XKNA 1VE4A 3CRBA 1OVBA 2DQVA 3Q27A 1ZLQA 1I6QA 1Y20A 1N0TA 3GBBA 1OLCA 1H44A 3L6HA 3PPOA 3D4GA 2ZYKA 5I2NB 3EHUA 2PX1A 3B6QA 1ZTYA 3OXNA 1B32A 3V89B 2XD3A 1URDA 3QUFA 4GWOA 4F2QA 1NNFA 3TZAA 1WODA 4PFWA 1B3HA 3THIA 3H7MA 4NTLA 2PYYA 2G29A 2ANJA 2Q89A 5I56B 1D3KA 4MLVA 4XKRA 4HCWA 5KDTB 3SESA 4F31B 1R1NA 1FQCA 3G3IA 2F7AA 4KR5A 4U1ZA 4ZE8A 2DWJA 2B65A 1MQDA 2FA7A 3RLFE 1JW5A 2I3VA 1B46A 3FJGA 2F78A 3K4UA 5EYFA 3KEIA 1MY3A 3W9WA 1I69A 1RKMA 1OIBA 1Z7ME 1H3DA 2A5TA 4OWDA 3FZVA 1DPEA 3ZSFA 1URSA 1I6AA 3FV2A 3B7DA 4G77A 5A5XB 3G3GA 4FIMA 1MY2A 5I57B 3K6UA 1P1OA 5L9MA 4DZ1A 4YB7A 4G8MA 3O9PA 2UVJA 5I2KB 4F2OA 3RT8A 1YAEA 3I5OA 2XXTA 3U94A 2X26A 3OO7A 1SQYA 1AOVA 3VXCA 3TELA 1SYIA 3S9MC 2O84X 3KGCA 4E0WA 2DWAA 5DVJA 3SEUA 1LFIA 2XX8A 4ZEIA 1MQIA 1HSJA 1H76A 2H98A 1US5A 3K1NA 3RT6B 1MY0A 1SYHA 1B5IA 1PB7A 2F7CA 1LBCA 1IXGA 2F36A 3O97A 4GQOA 3G3KA 1FQAA 3FVKA 4BDLA 3T93B 4IGRA 1B4ZA 4I62A 4I1DA 2M8CA 1YTVA 3R7XA 4YICA 1A54A 5TPAA 3ZKKA 3OMBA 5FHOA 4PE5B 2D21A 1JEUA 4OESA 4QF9A 1ZU0A 1LSTA 3VV5A 4GXAA 3MVZA 4PP0A 1MRPA 2UYEA 5H8HA 3K1MA 1DTGA 1LB8A 1LCFA 2XD2A 1B7HA 1LAXA 1O7TA 3FJMA 4GRKA 4NF6A 5L9SA 1B1XA 3IOUA 4ZEDA 2Z8EA 3HHFA 5JTYA 1UIUA 1JW1A 4HCYA 4F3GA 2VGQA 1PDAA 1FTLA 1BLFA 4ND9A 1XHYA 3S4UA 3IO6A 2ZMBA 3GLBA 3TYHA 2Z8DA 4EXKA 3TEPA 1M5DA 3ECRA 1PEBA 4YZZA 1T0KA 4ZE9A 4IO7A 4HTGA 4E0XA 2ZYMA 4KYDA 2F97A 3PPPA 4F3PA 4NF4B 1Z7NE 4F22A 1FQDA 1WDNA 4MF3A 1N3XA 1URGA 5AA3A 3N6TA 4M1VA 2OBGA 4IO3A 2NOOA 3IOWA 5F7VA 1SD3A 1B0LA 4I9DA 5IKBA 4OHNA 1O64A 3M3KA 3IO4A 3SEXA 1SW2A 1FCKA 4YKPA 1MY4A 5I59A 3RUMA 1AIVA 5DT6A 3TPAA 4R9GA 1II5A 4OMBA 3OD7A 4EF2A 4BDQA 2OWSA 3GXAA 4JSDA 1Y1MA 3MZ9A 2V84A 2UVGA 4BDRA 3FIRA 1BP5A 2OK2A 1B3EA 4H67A 1PBQA 4TQUQ 1Y9UA 4O3AA 2H99A 3UORA 4BDOA 4KQPA 2A5SA 4JBZA 2HAVA 3PMVA 2IEEA 3CFXA 5HPQA 4C1TA 4L17A 3FXRA 2HAUA 3CVGA 4RPNA 3VDFA 3FXUA 3T96B 5EHMA 1D9VA 3S2VA 5J1DA 1QVSA 2E0SA 1NNTA 4OYVA 3OSQA 1MPCA 1NH8A 3G3JA 3M3LA 2REGA 3WAEA 2DE4A 5AA2D 1UTBA 3LR1A 1SI1A 2F34A 3FXQA 2QMXA 3K0VA 4KYEA 3O66A 1O63A 2PBWA 3LSWA 2RINA 4PFTA 3LC8A 4NF8B 3G3HA 3T9XB 4QFKA 3KOSA 3USDA 3RY3A 4XTCQ 4U4XA 5DEXA 3IORA 3LSXA 2Z8FA 2ZNUA 1MS7A 3VVDA 2H25A 1EU8A 3WAFA 5BWJA 2Q2AA 1IITA 2BJJX 3KSJA 3H6UA 4NF5A 2RKMA 1DTZA 2ONRA 1Y3QA 1JVXA 5DVFA 1DSNA 4GOTA 4IO6A 4NWCA 5CMCA 4XIGQ 4KYSA 3R26A 5TP9B 2P2AA 1FW0A 4H65A 2Y7KA 4Q8RA 3G7WA 5CMMA 3IB0A 2XXWA 3KJTA 1JQFA 2PMSA 3BKIB 3KJ7A 2O1MA 3OENA 3HN0A 4MLQA 5LOMA 3U92A 1LFGA 1S50A 1VR5A 1MPDA 2GFEA 3KN8A 1YPNA 3H6TA 5I58A 1MXXA 2XX7A 1OMPA 3RTFB 1PB8A 4K3FA 4G2ZA 2RC8A 1LAGE 2RF1A 1SW4A 3E3KA 5ICQA 4DE8A 4KFQA 1I6BA 4JSOA 1N7XA 1F9BA 3D4CA 4QSCA 2CMOA 4GIZA 4DXBA 5AA2B 3H3GA 1ELJA 3IB1A 4H5GA 2Y7RA 3KG2A 3FASA 4THIA 5EHSA 3EHSA 4RPOA 1PB9A 3N6UA 3EF7A 2OZZA 4QFOA 3K6WA 3UA8A 3Q26A 4JXIA 2HZLA 3ONMA 1HSLA 1OQGA 1PC3A 3FVNA 4U1OA 1D4NA 4AB6A 3O6HA 5DTBA 3T9HB 3FGSA 4YAHX 1M5FA 2D3IA 1XT8A 2OCUA 4XKPA 4LZ8A 1QULA 5KCJA 3CI8A 4I8CA 3OO8A 4KCCA 1B2HA 2I58A 5H8QA 3TTNA 1GVCA 1A7LA 4IY5A 3M3FA 1MXVA 4O3CA 1USYE 4UACA 3FUZA 3IL1B 1B4HA 2CZLA 4DCXA 4EXLA 2Y84A 3O6IA 3N26A 4WKMA 4ZECA 2ALUA 2ZNTA 5I84A 4WEPA 4LONB 4JWYA 1J1NA 3IOVA 2VOZA 1LFHA 2VD3A 3MC2A 3HPIA 5F1QA 2I6EA 3IJOB 1IQ7A 3CSBA 4RNSA 4HS7A 2DWHA 3JYRA 2YLNA 3FD3A 1R6ZA 3CIJA 2XXQA 3K01A 5FHMA 3E9XA 4GVOA 1OQHA 4ESWA 4Q0CA 5ELVA 4UA8A 5BUUA 1MXUA 5ISUA 3DELB 3C31A 4FEDA 3OOAA 2F7BA 1GGGA 2GRVA 3HO7A 2ABHA 2HFBA 2XX9A 3TTRA 1MM7A 2QMWA 1LLSA 5L9OA 4X1BA 2DOJA 3O2AA 1QUJA 3MWBA 4C0RA 5H8FB 4OTEA 4G68C 3AXFA 5AA4A 1LAHE 4P0IA 2XXRA 3PUZE 3TTKA 3KOTA 4GLIA 1UTBB 3CFLA 2O7UA 3QAXA 4H6DA 1EZ9A 4ELPA 2LAOA 3H4ZA 1N7WA 3IB2A 2OLBA 3VVFA 2X7PA 1SDXA 3C36A 2W7YA 2RCAA 4DXCA 1NKXA 3O6GA 4WXJA 3KBRA 3JZJA 2OWTA 3CSGA 5CM6A 4YKJA 1MXZA 4Q5TA 3HHGA 3PGFA 2P1SA 4FATA 3TTMA 3KSXA 3RPWA 3QYTA 4NF5B 2DE2A 1NMUA 3K1PA 5CMKA 5K2YA 2QS4A 3U93A 4F29A 4U21A 1M5EA 4DCYA 1N04A 4H8IA 4XKQA 1FTOA 3DP4A 3QSLA 4NEDA 5DVIA 2Q8JA 2O68A 2HCAA 2ZNSA 4LQ2A 2F6PA 2P0SA 4NE4A 4YMAA 2GH9A 3KFMA 1MY1A 3W15C 3U8QA 1B9JA 1B3GA 2UVHA 3IK6B 1R9LA 4GL8A 5I56A 1AMFA 4R2FA 1BIYA 2ONKE 3FVGA 3JV9A 4DIGA 4KPTA 4MFIA 2O6AA 3MVWA 4R75A 2XHDA 1ZKBA 4OFOA 4RK2A 3O28A 5CBSA 4YMBA 2HXWA 2I48A 4C1UA 1N3WA 3TQLA 5ITPA 3BBRA 1MM6A 1P1NA 1QKAA 4WEDA 1M5BA 3M8UA 1EH3A 1IXIA 3C32A 4KD5A 3H6VA 4H0WA 1KWHA 1LB9A 1M5CA 2I4BA 1USYH 5A5XA 1GR2A 4FECA 1B3FA 5I57A 3TDJA 1A99A 4RJZA 3A3UA 2V3TA 1CB6A 4OENA 2DXYA 4OEUA 4GF8A 4ECFA 3SERA 2HEUA 1TT1A 3MUQA 4IO2A 5KCJB 4G68A 3TQWA 1IXCA 5I2KA 5H8QB 4EF1A 4G8HA 1AL3A 2DS9A 3IJXB 1FQEA 2ZYOA 4U22A 5B7DA 2A5TB 3ZS6A 4ELOA 3G3FA 4OERA 2H5YA 3EN3A 3TUSA 1MG1A 4QFLA 1Y3NA 3UIFA 3TCGA 4RA1A 4AQ4A 3OELA 4X48A 2I4CA 3UK4A 3H03A 3TCFA 3U72A 1SBPA 4ISUA 4OFJA 4OETA 5HBCA 4ONYA 2B3FA 5AE4A 3C33A 5B70A 3LSFB 1MXWA 1P1WA 2H9BA 3SEYA 1B7UA 4FE8A 5CBRA 2R71A 2V3UA 3A09A 4F1UA 3CFZA 2GHAA 3IX1A 3PD8A 3K00A 3R6UA 3B6WA 2XXHA 4TOZA 3E4RA 3I6VA 4PQJA 4PFYA 1YCJA 1AH5A 4O3BA 5CI5A 3MBPA 1B58A 5M2VA 3IR1A 1H43A 2DSFA 4RXLA 1ZMGA 1B1HA 1UTHA 5FHNA 1XOCA 2NUVA 1A55A 1B0HA 3RNNA 3T9UA 4OQOA 3MVXA 3TFLA 3T22A 1US4A 3BFUA 5TPAB 1P99A 4IO4A 2HZKA 4Z7EA 4KCDA 1WVJA 2Q2CA 2AIXA 3PPNA 1NH7A 3OO9A 1B52A 1QJMA 1MXYA 2QJEA 4IGTA 3MZ1A 3IAZA 1JETA 3N94A 5H8HB 1VFEA 3TCHA 2Y7WA 4OEVA 1FTMA 5AA1A 4BDNA 2NVUB 2Q9TA 3KN7A 4NF6B 4F3SA 4NF4A 4Q30B 1MPBA 1S9TA 2F6GA 3RGYA 2DE3A 5JTYB 3VLWA 4QFPA 5FTHA 2XXUA 4R73A 1SVXB 3OEKA 3VXBA 3K6VA 1IUDA 3BFTA 2HQ0A 2XXYA 3MJNA 4DLDA 2Z23A 3S9LC 4R6HA 2O69A 3H6WA 1EZOA 1VFDA 3DM0A 3DP6A 3V83A 1HSEA 3QXMA 4F3BA 1EZPA 3LBSA 1FTKA 2R6GE 3FV1A 2Q88A 2F35A 4HW8A 3KN3A 3UGWA 4LZ7A 3Q25A 1B51A 3DLNA 3UN6A 3L6GA 4H1XA 1TFAA 3C9HA 5K2XA 4ZEKA 3VLVA 1OVTA 3CG3A 2DVCA 4POWA 1MDQA 3PV0E 5ICTA 2QS2A 3MP1A 3TODA 5H8NA 1ZJLA 2I3WA 2Y7IA 4ZEBA 4QFNA 4EQ9A 5ITOA 4X9TA 3H06B 3B6TA 4YKIA 3HSTA 5I59B 3F11A 4TLLB 2PVUA 3QK6A 1B6HA 1MQGA 3PPQA 5CRYA 2RC9A 3SETA 3FATA 1NFTA 1ZBMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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