4E0WA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Kainate induces various domain closures in AMPA and kainate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 254
sequence length 254
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA02
1FTLA 1IUDA 2DWAA 4HTGA 3S9NC 1P99A 5ITPA 2UVIA 1N76A 1DTGA 1M5EA 5DVJA 5ICTA 4F2OA 2XXTA 1B51A 2F6GA 4RK9A 3FXRA 3CIJA 3G3FA 1QVSA 2VD3A 1JW1A 3HN0A 3G3GA 1WDNA 1LSTA 3GZGA 3FATA 4OYVA 1EZ9A 4HS7A 2B3FA 4BLAA 3LUYA 5FHMA 2GFEA 4JSDA 3GXAA 2DWHA 3FVGA 1WODA 2RKMA 4RJZA 1B4HA 1DSNA 1MPBA 2R71A 3MPLA 5DVIA 3TEPA 4ZEBA 3FXQA 3IOTA 5I56A 3PMWA 4OWDA 4U21A 1R9QA 5DYHA 5CM6A 2F7AA 1N3WA 2PYYA 3C9HA 4JBZA 3TZAA 4FEDA 3TQWA 1CB6A 1R6ZA 1SW2A 3Q29A 4C0RA 4KFQA 3UA8A 3ONMA 5CMBA 1VE4A 3SESA 3ILUB 3P7IA 4NMYA 5TPAB 1MXXA 2E0SA 3GBAA 3A3UA 4NE4A 2OBGA 4WXJA 1PEBA 5KDTB 1DOTA 3K02A 3OO7A 1SVXB 2A5TA 5H8NB 4R9FA 3UK4A 1GTKA 1MY3A 4MBPA 1URGA 4R6YA 4GL8A 1P1OA 4MLQA 2ZNTA 3RT8A 1MXZA 4Q0CA 1UQWA 2DE2A 4FATA 2QS2A 2P0SA 3OENA 4R2BA 4F19A 3BKIB 2O51A 1J1NA 4BDMA 1SDXA 3BBRA 1QKBA 1Z7ME 4QFKA 1VR5A 3FV2A 3H06B 1QULA 3VXBA 2RCAA 3RGYA 1NL5A 1UIVA 3BFTA 3V89B 1M5CA 1OVTA 1LAGE 1NNTA 1B58A 1LCFA 1OLCA 3FZVA 2DE4A 2E1SA 4U22A 2I4BA 5HBCA 2F6PA 3MP8A 1UTBB 4OFLA 3TODA 3CG1A 3K6XA 2H5YA 4MF3A 2DXYA 1FQAA 1B9JA 3RT6B 1FQCA 2M8CA 4N13A 4X1DA 4U4SA 2ZYMA 3RQTA 3K2DA 4YKJA 3RPWA 3ECRA 1B52A 1Y4CA 4H65A 3ZKLA 3QIMA 1AIVA 4ESWA 1B2HA 3MZ9A 5H8QA 4ZEDA 3KSXA 1DTZA 4LZ5A 4RPOA 1Z7NE 1HSEA 3PPNA 3V5AA 4QFNA 1SQYA 5I59B 1PBPA 1IXHA 4I9DA 1RYXA 2AL5A 1QJMA 4IO6A 4GOTA 4ISUA 3H6TA 3S4UA 2RC9A 3TMGA 3PPPA 4LATA 2I0CA 4GWOA 1R1NA 5DEXB 4LUBA 4ELQA 1FQBA 3C32A 1TWYA 3C4MA 5EHSA 4OXVA 1R9LA 3UIFA 4DXUA 4F3BA 3H7MA 1A54A 1H3DA 1POTA 4NF5B 1PBQA 4I1DA 4GXSB 4R2FA 4ZDMA 2DP8A 4H5FA 3FUZA 3H6WA 3IX1A 1ZMGA 3DELB 1I6AA 3OD7A 2REJA 5HPQA 2ANJA 3HSTA 4NF4A 4O3CA 2XXYA 2OJTA 3KZGA 4KCCA 4WKMA 5CI5A 1ZU0A 2I58A 1H45A 1NNKA 4OETA 4Q30B 2DXRA 4R75A 4KR5A 4FECA 3E4RA 1A55A 3QXMA 2R6GE 4LA9A 3H03A 1I69A 4F22A 4EQ7A 4QSCA 1H44A 1YAEA 3K00A 4GLIA 1FTJA 3GLBA 4PE5B 2ZYNA 3TTNA 3O6HA 3VV5A 5I56B 3MP1A 2I4CA 4GIZA 2X7PA 3VVFA 5ITOA 1XS5A 4H1XA 2Z8DA 4FIMA 3TFLA 1A7LA 4XIGQ 1S50A 1TT1A 3LC8A 1Y1ZA 3PPOA 3HCQA 1MY1A 1FTOA 3MUQA 3FGSA 4LP2B 3ZKKA 2Z8EA 4WEPA 1GGGA 4G8HA 3TCHA 2OLBA 2F78A 1OVBA 4O3AA 2A5TB 3QSLA 4RYAA 5H8FA 4G2ZA 2HQ0A 4DCYA 3S2VA 2XXUA 4F1UA 5AA3A 3SEUA 4GFRA 1O7TA 4QFPA 5L9OA 2XXQA 1NH7A 2F34A 1OQGA 1D9YA 2RCBA 3FIRA 4ZEFA 4BDNA 1A40A 3T96B 3PD9A 1RKMA 4JDFA 2YPNA 1O64A 1URDA 3K4UA 3IO6A 1EZPA 4QRZA 4YB7A 4OVJA 2AL4A 2OZZA 1ELJA 3OO8A 3MVXA 2Y84A 1PB7A 4OEUA 3I6VA 1US5A 5CBRA 1B3GA 4RPNA 4OMBA 3R7XA 3U94A 3LSWA 4FEBA 2XX7A 1MXVA 4U1ZA 4LZ7A 5J1DA 1M5BA 1Y4TA 3W9WA 3QYTA 3SEXA 5HM4B 4HCWA 3S9LC 2VD2A 2Q89A 3DP8A 4L17A 1CE2A 2B3BA 1JNFA 2DE3A 3IL1B 4GVOA 3THIA 2IA4A 3TDJA 4RXLA 1O63A 3KSJA 1OIBA 2ZMBA 5H8QB 4G68A 3ZSFA 4M4GA 2DS9A 3RY3A 1MDP1 2DVCA 1UTHA 1JEUA 3EHUA 1UIUA 3IK6B 1NFTA 2Q9TA 1JEVA 5DVFA 1QUKA 3TELA 1I6BA 5FHNA 3U8QA 2CZLA 2ZXTA 1B5JA 5FTHA 2GRVA 3TTRA 2OWTA 5CMKA 1MPDA 3E13X 2O69A 1N3XA 1B5IA 1N0TA 1QW0A 1NNFA 2NXOA 1LGBC 3D4CA 1POY1 1IXCA 1RYOA 3R26A 2Y7IA 2F35A 5DTBA 3C35A 4OTEA 2ZNUA 4JB7A 1MS7A 2QJEA 4GF8A 5ELVA 1OQHA 3LSFB 5CMCA 1VFEA 2XXXA 2P1SA 2QS4A 2UYFA 1MQJA 4YB6A 2UXAA 3AXFA 3OSRA 2BJJX 1JW5A 3M3KA 3Q25A 4OHNA 2NUVA 4O3BA 5F7VA 1IXGA 3FVOA 2RC7A 3T66A 3MJNA 4NF4B 3CFXA 4QHQA 1S9TA 2OCUA 4GL0A 4LVQA 5AE4A 1MPCA 5H8SA 2UVHA 1FQDA 3FASA 3K6VA 5I2NA 4GXAA 4KQPA 1Y3NA 3T22A 2DWJA 4AB5A 4KI0E 2WKYA 2AYSA 1SYIA 3H3GA 1Y20A 2O84X 3M8UA 4PFWA 5BUUA 1LBBA 1FQFA 4YB5A 3EHTA 3TAJA 1XC1A 2W7YA 3B6QA 1Y3PA 1AL3A 3OO9A 2UVJA 4F18A 2HAVA 3VXCA 3PU5A 3FJMA 2XX9A 1PC3A 4I8CA 3JZJA 1MXUA 1IXIA 1MQHA 3KG2A 3E9XA 4JXIA 2DSFA 4ZS9A 3U93A 3SEYA 1SW1A 1GV8A 2I3WA 3BFUA 2H99A 5TU0A 2XXIA 1TFAA 3SDFA 1FTMA 3K1MA 5L9SA 2PT1A 2I6EA 3Q26A 3MP6A 5EYFA 3VE1B 1NNPA 3PPRA 1OLAA 3FJGA 4YZZA 4YICA 4QFOA 5I57A 3O9PA 2O7IA 4PETA 4ONYA 3DM0A 3PUWE 5I84A 1PB9A 2P2AA 2HZLA 4JWYA 3FVKA 4EQBA 4OQOA 3N26A 2O7UA 1ZLQA 1IIWA 1PDAA 4XKRA 2X26A 5H8FB 2PMSA 1B0LA 1LAXA 3FXUA 3WAEA 4Q8RA 1D4NA 2O6AA 2F97A 2HXWA 3VVEA 4ZE8A 3S9MC 2ABHA 3USDA 3TTMA 3IJOB 1B7UA 2XD2A 3IAZA 1B5HA 3F11A 1M5DA 1FTKA 3EQ1A 5AA2A 2D3IA 1ANFA 1SD3A 4H5GA 1LAHE 2H4IA 1EZOA 2XXRA 3FVNA 2HEUA 2GH9A 2QL3A 2ESNA 2NWJA 3SERA 3O97A 4C1TA 1B1XA 3EN3A 4ZEKA 5AA1A 1P1WA 2O68A 2HAUA 4ZE9A 2UYEA 5KCJA 3FJ7A 5FTIA 3WAFA 4ESXA 4NF6A 4FAJA 2ALUA 3DP6A 1MXWA 2THIA 4XXUA 3CSGA 1WVJA 2QPQA 2PBWA 3JV9A 2HCAA 1IQ7A 1QUIA 4R72A 3FV1A 4I62A 2YLNA 1A8EA 4RK2A 4AB6A 4G77A 3SKPA 3N5LA 2QS1A 4G68B 3DP4A 4OFJA 4NWCA 3B6TA 4DCXA 4R6HA 3IOWA 3OELA 1JW4A 2F7BA 2DVZA 3PMVA 5BWJA 3H4ZA 1UTHB 1TFDA 2V3TA 3PPQA 3MVYA 3G3JA 1LLSA 3OEKA 1US4A 2REGA 3PMXA 1JQFA 4TLMB 3CI8A 1EU8A 2F36A 3K01A 4DLDA 2NOOA 3QUJA 3T9HB 3CRBA 4ELPA 2D5WA 1DPEA 1JVXA 3IOVA 4QFLA 1MRPA 1Q1KA 5AA4A 3MVWA 4RNSA 3EHSA 2FNCA 3K6WA 2O1LA 1B46A 3OMBA 2H98A 5DT6A 3KN7A 1IITA 1MDQA 3IB2A 1H76A 2LAOA 4G8MA 2V84A 1Y3QA 1B7ZA 1MM6A 3MC2A 4DE8A 2V93A 2AIXA 1OMPA 3L6GA 4FE8A 3Q27A 2G29A 4R73A 1SW5A 3PD8A 4MLVA 1LFGA 4DXBA 1N7WA 3R6UA 1FCKA 1N04A 5F1QA 1URSA 4OESA 3IR1A 3K6UA 3DLNA 4YKPA 2X7QA 5IKBA 3LSXA 2DQVA 1S7YA 4THIA 5I2NB 5KZTA 3V83A 4OFOA 1ATGA 4U4XA 2YJPA 4IGTA 5B70A 4OZ9A 1TXFA 2PVUA 3HPIA 3TTKA 2I0BA 4E0XA 2DYXA 2QS3A 5A5XA 4N07A 4R6KA 2PT2A 2RC8A 1B3HA 4ND9A 3MWBA 1D9VA 3MW0A 3IJXB 1B0HA 2Z22A 2F5XA 5AA2D 4BDQA 4IB2A 3N6TA 3RN8A 3M3FA 2H25A 4GRKA 2UVGA 4EUOA 3UORA 3CFLA 4YU0A 3D4GA 3N94A 3ODBA 2OWSA 3K1NA 4IO4A 1XOCA 3KJ7A 4F31B 3MAMA 3ZS6A 2F8DA 1B40A 3A3CA 3U92A 4OEVA 1F9BA 4DDDA 1NMUA 5EHMA 1YCJA 5JTYA 4IO2A 2XD3A 1P1NA 3KOTA 4DZ1A 4F39A 3RUMA 4P0GA 5I57B 4HCYA 4NF8A 1XVXA 3RTWB 1LFIA 1B3LA 4H6DA 5TP9A 5H8HA 3TKDA 1IZ1A 4F2QA 1JETA 3G3KA 1MQGA 5I58A 4IO5A 3OXNA 4MH5A 1VFDA 4FJPA 3SEVA 3MQ9A 3HV1A 4K3FA 1I6QA 1AMFA 1XVYA 2ZYOA 3T93B 4N6PA 3O28A 4QF9A 3VVDA 1BP5A 1FW0A 3QK6A 2V25A 2VGQA 2Y7WA 5AA2B 4DIGA 4RY1A 3EF7A 4GQOA 4JSOA 3C33A 1QKAA 4MFIA 4EXLA 4F3GA 3FD3A 1B1HA 3PUXE 2B65A 1GR2A 3TPAA 4QSDA 3O6IA 4G4PA 3Q28A 4KPTA 5K2XA 1T0KA 4P0IA 5KCJB 4NF6B 1Y1MA 4QSEA 3B7DA 1MH4A 3EPEA 2DOJA 1LCTA 4F1YA 1II5A 2Q88A 4H8JA 2VP1A 1NH8A 2CMOA 3G3HA 3PUYE 4AQ4A 4EQ9A 3SETA 3QUFA 1ZKBA 5L8DA 3HO7A 4H0WA 3MZBA 4ECFA 3W15C 1SBPA 1FQEA 4NEDA 3O6GA 5JEIA 3IO4A 4TOZA 4TQUQ 4IGRA 4KYDA 3G3IA 4U2RA 4C1UA 2QMXA 3KJTA 1EH3A 4JWXA 2GHAA 5CBSA 4POXA 5AA4B 3VLVA 1B3FA 1HSLA 4XKPA 2V3UA 5CC2A 1B05A 5CMMA 3OSQA 3C36A 3ILTB 3UGWA 3IORA 2F7CA 3O2AA 4F1VA 3CG3A 3HHFA 1A8FA 5I2KA 1P1QA 1B6HA 5LOMA 3U72A 1B4ZA 4BDRA 3HHGA 4X1BA 4UACA 1XT8A 4R9GA 1B32A 3KGCA 5M2VA 1MQIA 1MM7A 4KCDA 3KOSA 2XHDA 1DMBA 4IY5A 3W9VA 5K2YA 2R9JA 5JK4A 3B6WA 1MXYA 1SI1A 2Y7RA 3LR1A 4POWA 4KHZE 3MZ1A 1H43A 3H6VA 3O29A 2ZNSA 4DXCA 3PGFA 1JVYA 4OENA 2Y7PA 4M1VA 5ICQA 4H67A 4YMBA 4WEDA 4EF2A 4GD5A 3V8XB 1Y9UA 1ZJLA 3MBPA 4ZZEA 1M5FA 1QUJA 2ONKE 2QRYA 4EXKA 3IB1A 5A5XB 2A5SA 3TCFA 3KN8A 3G7WA 2PX1A 3O66A 4ZECA 1BKAA 4OERA 2VOZA 1KWHA 3I5OA 3TUSA 2DWIA 1MY0A 3VLUA 5CRYA 4BDOA 2Q8JA 4G68C 2G93A 1MQDA 1P1UA 1LB8A 3GBBA 4FORA 4NTLA 3H6UA 3TCGA 1MH3A 1N84A 3C34A 3VDFA 5TPAA 1B3EA 5IAIA 2NVUB 2ONSA 5JTYB 4PFUA 1AOVA 3S9EA 1USYH 5KDTA 2RINA 2XXWA 3U1OA 4LQ2A 2O1MA 3TYHA 3KFMA 2D21A 2FYIA 3OO6A 4NF8B 5H8NA 3K0VA 4PP0A 2FA7A 5TP9B 1GVCA 4ZEIA 5H8HB 3CSBA 1SW4A 3KN3A 1HSJA 4KYSA 4ELOA 1BLFA 1ZIUA 4ZZAA 4F29A 1MY2A 3K1PA 2Q2AA 5I58B 3QAXA 4LQ5A 2Y7KA 1DPPA 1USYE 3CVGA 3E3KA 1BTJA 3N6UA 4IO7A 3VFJA 1N7XA 2HZKA 2OK2A 2IEEA 4XKNA 3PUZE 5B7DA 4XTCQ 1NKXA 4KD5A 1ZBMA 3TTLA 1L5TA 2I48A 4YAHX 4YKIA 2XXHA 2I49A 3L6HA 2HFBA 4P11A 1LAFE 4E0WA 2Q2CA 4LONB 4KYEA 4YMAA 2VHAA 3T9XB 4Z7EA 2GHBA 1ZTYA 5ISUA 2XXVA 1AH5A 1UTBA 3T9VA 1Q35A 2I3VA 3I3VA 3MVZA 4PFYA 1SYHA 3OEMA 3M3LA 3SEWA 1MY4A 1D3KA 4BDLA 3IB0A 3RLFE 1B7HA 4Q5TA 3CFZA 5FHOA 3PV0E 1VSOA 2V3QA 1YTVA 3IOUA 2ONRA 3LSLA 3VLWA 3T9UA 1A99A 3UP9A 3MPKA 4X9TA 3RTFB 1IEJA 5I59A 4HW8A 4UA8A 4PQJA 4PFTA 3A09A 4Z0IA 3LBSA 4LZ8A 2KLFA 4IO3A 4U23A 3JYRA 2H9BA 4RA1A 3CR9A 1MG1A 1YPNA 3TQLA 2XXPA 3UN6A 4XKQA 1LBCA 4EF1A 2QSXA 2ZYKA 5DEXA 4R74A 4JWOA 2Z23A 3KBRA 4EDPA 1BIYA 2XX8A 3OOAA 4X48A 4G8NA 4IY6A 4F3SA 4H8IA 2RF1A 3PUVE 4TLLB 1XHYA 1LFHA 2Z8FA 3RNNA 4U1OA 3C31A 4F3PA 2QMWA 1LB9A 5I2KB 1SI0A 4ELRA 4NWDA 3KEIA 4NF5A 5L9MA 4YKKA 1PB8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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