4ECFA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport system, periplasmic component (lvis_0633) from lactobacillus brevis atcc 367 at 1.55 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
AGESITAVGSTALQPLVEAAGEQYTGEHLGTFINVQGGGTGTGLSQIQEGAVQIGNSDLFAGEQKGINARQLVDHRVAVVGITPIVNKKVGVKNLSTNQLIKIFTGQITNWKEVGGADQSIVLINRAQGSGTRATFEQFGLANHRSKTAQEQDSSGMVRSIVATTPGAISYVAFSYVNKTVQALSLNHVAPTEVNVTTNDWRIWSYEHLYTKGHPTGLTKAFITYVQSPAIQNTLVRQLGYLSPDQMLVERDANGHITKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an ABC-type phosphate transport system, periplasmic component (LVIS_0633) from Lactobacillus brevis ATCC 367 at 1.55 A resolution
rcsb
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Lactobacillus brevis
molecule keywords ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
total genus 88
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA02
1QUKA 2PBWA 4F3SA 3DP6A 4G68B 3K01A 3KN3A 4R6KA 4RK9A 4OFLA 5ITOA 2B65A 4OYVA 4XIGQ 3L6HA 4Q30B 3K2DA 1FTMA 1BP5A 1A7LA 3OD7A 3IB2A 3KOTA 1SDXA 1PBPA 3RN8A 2OWSA 4Z7EA 2Q2AA 3TMGA 1KWHA 4FE8A 1MY0A 3MZBA 3W15C 3O2AA 3QK6A 4PETA 4R75A 1HSEA 1GTKA 3OMBA 1T0KA 2ZXTA 4PFTA 4P11A 5ELVA 2OWTA 1II5A 3K00A 1PBQA 4AB6A 3OSQA 3KBRA 4JWXA 3KGCA 2VD3A 3TEPA 1NNTA 1ZBMA 2ESNA 1QJMA 5I2NB 1HSJA 3PU5A 1B51A 3UK4A 3UGWA 2VGQA 3DP4A 2IEEA 4NF6A 3K02A 4EDPA 2DWJA 1Y3QA 1MQGA 1B46A 3H6VA 3RNNA 1P1NA 3S9LC 4QSCA 4X9TA 3DLNA 2XHDA 1MPDA 4JSDA 5CI5A 3O29A 4QFKA 3VXCA 5L9SA 3B6TA 2OK2A 1I69A 5H8FA 2HZKA 5HBCA 2ZYKA 2Q88A 4H5FA 4TLLB 2AIXA 1B3EA 3CSBA 2OJTA 3KSXA 4EQ7A 1B1HA 3G7WA 3O6IA 3CRBA 1YCJA 5FHNA 4GL0A 2NXOA 3K1MA 4F18A 2QJEA 1OLAA 4WEPA 1OVBA 4U4SA 4U21A 5JK4A 4F39A 5DEXA 3A3UA 1LFGA 4XKQA 1M5CA 4F1VA 1MPBA 4DIGA 2Z23A 1O63A 2DE4A 3C9HA 2DE2A 3RT6B 5H8QB 4JBZA 3SEUA 1BTJA 3HCQA 3N5LA 4RPOA 3UP9A 2UYEA 1NH7A 2Y7WA 1H43A 2F7CA 1USYE 4YB7A 5KDTA 3EHUA 5HPQA 2O7IA 4F31B 3IX1A 1LLSA 4POXA 2FA7A 4JDFA 3DM0A 3RQTA 1WDNA 2A5TB 3EF7A 1ANFA 3MAMA 1R6ZA 5K2YA 4M4GA 3PPOA 5HM4B 4KPTA 1MPCA 4ZEIA 5I57B 1DTGA 2CMOA 2GH9A 1USYH 3VLVA 3V83A 3MBPA 3SERA 4H0WA 4FIMA 5L9MA 2UVHA 4GVOA 1H44A 4NWDA 1LFHA 1Y4TA 2Y7IA 1MH3A 2F6GA 1AOVA 2XXUA 3MPKA 1IEJA 1FW0A 4R6YA 3UA8A 4OEUA 1DPEA 5ISUA 2REGA 2E1SA 2HZLA 3IJOB 2V3TA 4FORA 1EU8A 2H25A 4OMBA 3U8QA 4RY1A 4GL8A 5KCJB 2DP8A 1N04A 3R6UA 3H6UA 2O6AA 1Y20A 5IKBA 5H8HB 1IXGA 4JSOA 3H06B 3WAFA 2DVZA 4POWA 4NEDA 3FUZA 1MY2A 4MH5A 3OXNA 5I58B 4GFRA 2I6EA 4F1UA 2Y7RA 3O28A 3FATA 3W9VA 4MFIA 3I3VA 4KFQA 2BJJX 1R1NA 2QS3A 3GXAA 2QSXA 5TPAB 2DQVA 2PVUA 4DDDA 1SI0A 3BKIB 1B3FA 5DT6A 4PE5B 1LB9A 1B3GA 4EUOA 4YZZA 4MF3A 1JW4A 3L6GA 1MQHA 1TT1A 3QSLA 3IOVA 5TP9B 2Q89A 4HS7A 5M2VA 4RNSA 2DSFA 4OWDA 2ZYMA 3N6TA 4H5GA 1MQIA 5BWJA 3OO9A 3CI8A 4PFUA 1A54A 1S7YA 2VP1A 4ISUA 3PUWE 1UIUA 4NF8A 2W7YA 1MG1A 4JB7A 1FQFA 4QFPA 4R73A 2AL4A 5CMKA 1FTLA 1FQEA 5CMBA 4YB6A 3OO6A 1URDA 1CE2A 1EZPA 3I6VA 2F78A 3MVYA 1QKBA 2Z8DA 2H9BA 2Q8JA 4NF4A 2HAUA 1JNFA 4H1XA 4ZDMA 4BDLA 1AMFA 5I59A 1XVXA 4OFJA 3K4UA 2XD3A 4KCCA 4OHNA 4BDMA 3M3FA 4EQBA 1VFEA 3V5AA 3OO7A 1N7XA 2THIA 1CB6A 1NKXA 3B6QA 4R74A 1POTA 5B70A 1B52A 3EN3A 3PD9A 5TU0A 4DXBA 2I0CA 3RGYA 2ALUA 3HV1A 4ZZEA 1EZOA 3ODBA 5I84A 2O7UA 1MY1A 4WXJA 4FEBA 3FJMA 4YKPA 2V93A 3QYTA 3VDFA 4DCYA 2B3BA 3MC2A 1B40A 1QUIA 2Q2CA 4JWOA 3ECRA 5AA4B 1PDAA 1MXWA 3V8XB 3G3IA 1A8EA 1Q35A 1MH4A 3HHGA 2I48A 2G93A 1LSTA 3LSXA 1UTHA 1HSLA 1A8FA 4P0GA 2UVIA 3T9XB 1B2HA 1JETA 4XKPA 1XHYA 5H8NB 3QAXA 4TOZA 1JQFA 3KN8A 2Z8FA 1UQWA 4Q0CA 4ONYA 4KYSA 1ZMGA 3CFXA 2F34A 3GZGA 4NF5B 4PFYA 3EHTA 1LAGE 2UXAA 2DE3A 3FXUA 3ILUB 4U4XA 5I2KA 5AA2B 3MP6A 4I9DA 3Q28A 4YU0A 3FV1A 4RYAA 3TYHA 2V25A 2VHAA 3E3KA 4GLIA 4U1OA 3VVDA 1PB8A 1SD3A 2R6GE 3FVOA 3ZKLA 3KOSA 2YJPA 1XS5A 4F29A 1Z7ME 1EH3A 4LZ5A 3U94A 1NH8A 2H4IA 1US5A 3KEIA 3T93B 4DLDA 4H6DA 3FVGA 1P1WA 4R72A 1D3KA 4G68A 5FTHA 3USDA 4KYDA 2UYFA 4OENA 1B7HA 1MY4A 5JEIA 3B6WA 5H8SA 3EHSA 1FTKA 5FHMA 1QVSA 3OOAA 4ZE8A 3IORA 4P0IA 5CM6A 1IXIA 3LR1A 2DVCA 3CSGA 3TTNA 2P2AA 3FJGA 3OELA 1R9LA 5BUUA 2F36A 1URSA 4OERA 4G2ZA 1IUDA 3HO7A 3C35A 1B5HA 1F9BA 4MLQA 2ZYNA 5I56B 4EF1A 3H3GA 3Q27A 4KQPA 2P1SA 2Q9TA 1SVXB 1MY3A 2GHBA 3TQWA 4G4PA 5I2NA 3H03A 2XX8A 4KCDA 4MBPA 5B7DA 2HQ0A 4X1BA 3LBSA 1ZIUA 3U72A 2F7BA 4OZ9A 3G3JA 2RINA 4QFNA 3TTMA 1RYXA 4LP2B 1SYIA 3HHFA 4ELQA 4IY5A 4F1YA 2RKMA 3IB1A 4BDRA 2QPQA 2O84X 3MQ9A 2D21A 3KZGA 3MWBA 4JWYA 3IOUA 4ELRA 4RPNA 1TFDA 1LBCA 2FYIA 3IO6A 1QW0A 1SI1A 3B7DA 2NOOA 4UA8A 3OEKA 2ZNUA 4AQ4A 2X7QA 5DVFA 1IXHA 1WVJA 3TCFA 1B6HA 3TZAA 2V84A 4OESA 1H45A 1RKMA 3GBAA 3QIMA 1NL5A 4EXLA 1MM6A 1LFIA 4OVJA 3JYRA 5KDTB 3TAJA 3K6UA 3TTKA 3TTRA 2XXPA 4LQ2A 3BFUA 4U23A 3RPWA 3PPNA 3TPAA 1QULA 2I4CA 3IO4A 2F6PA 5CMMA 4RA1A 5H8QA 3UIFA 3I5OA 1NMUA 4GRKA 3N94A 1UTBB 4IO4A 4U1ZA 5K2XA 4LQ5A 2DOJA 3MVXA 2YPNA 1OVTA 4ZE9A 4ZEBA 3EQ1A 1RYOA 2A5TA 2RC7A 1PC3A 3T9UA 2KLFA 5ICTA 1MXXA 2GFEA 3HN0A 4G77A 1Y4CA 4R9GA 4R9FA 1IQ7A 2GRVA 3IAZA 4ZZAA 4I62A 1JVXA 2I3VA 3GBBA 3PGFA 4BDQA 4Q8RA 1AIVA 3A3CA 3TCGA 3IJXB 3S4UA 3IL1B 2UVGA 4O3BA 1MXUA 2FNCA 3ONMA 1O64A 3PD8A 1PEBA 4ESXA 2XXWA 4YMBA 2I4BA 3UORA 4RJZA 4OEVA 4G8HA 1YPNA 4JXIA 1OMPA 4YKIA 1FQDA 2YLNA 4I8CA 3H6TA 3K1PA 4N6PA 1JW1A 2QMXA 4ELOA 4PQJA 5CRYA 1VSOA 4OXVA 4ELPA 3FD3A 1Q1KA 5DYHA 5H8HA 4GXAA 3A09A 3VLWA 3FXRA 1B0HA 3JZJA 1B9JA 4K3FA 2D5WA 3SEWA 3N26A 3Q29A 4H8JA 5I58A 3ZS6A 1PB9A 3PPQA 5EHMA 2AL5A 4NE4A 3PMXA 3TELA 3CFLA 4G8NA 1MRPA 3KFMA 4OQOA 2DS9A 3R26A 3U92A 1B58A 1NFTA 1O7TA 2I58A 5TPAA 1MQJA 2UVJA 3IB0A 4IO3A 2DXYA 4U22A 3OSRA 1A99A 2XX9A 5CC2A 3F11A 1MXVA 1JEVA 1AL3A 3MP1A 3MZ1A 4LZ7A 3SEYA 3E4RA 3QUFA 4RK2A 4YAHX 4NF4B 1D9YA 3T9HB 3V89B 5KZTA 3G3KA 3KSJA 1LCTA 1TWYA 4H8IA 4IO7A 1LB8A 4GQOA 5A5XB 3IOTA 2QS4A 3QXMA 3FXQA 5JTYB 3C32A 2O69A 4LVQA 5DTBA 5DVJA 3TUSA 3OEMA 3R7XA 1SW5A 3SEXA 1XOCA 2Z22A 1A55A 2DYXA 2M8CA 1MDQA 3S2VA 3TTLA 3KJ7A 2HFBA 1B7ZA 1YAEA 4FJPA 1M5EA 4C0RA 2D3IA 3U1OA 1SYHA 3T96B 3SDFA 3ZSFA 1VE4A 2G29A 3SESA 1QUJA 4TQUQ 2VD2A 1DPPA 2RF1A 4OFOA 4OETA 1FQAA 2X26A 1BIYA 5AE4A 4ZEKA 5F1QA 4YB5A 3MVZA 1MDP1 3O97A 1GGGA 2ZYOA 5AA2D 3T22A 3IR1A 1JW5A 4HCYA 4YMAA 4PFWA 2I3WA 1DSNA 3Q25A 4HTGA 3WAEA 2XXYA 3O6GA 4KR5A 1QKAA 2VOZA 4IGRA 1H3DA 4N13A 2PT1A 3MP8A 2R71A 3O6HA 3CG3A 4R2BA 3RTWB 5AA4A 3FJ7A 3PUXE 1LAXA 1LAHE 3LUYA 4GIZA 4H65A 2ZNTA 1VR5A 2AYSA 1P1QA 2ZMBA 3TQLA 3KN7A 4DCXA 2REJA 4NMYA 3CR9A 2QS2A 2OZZA 4DXCA 2XXRA 3FGSA 3W9WA 1SBPA 4ZS9A 2XXIA 3D4GA 3MZ9A 1XT8A 1B3HA 1LBBA 4QFOA 1B5IA 3KJTA 5IAIA 4KI0E 4O3CA 5AA2A 3E9XA 4QSEA 2RCBA 3BBRA 1N7WA 3FVKA 4BLAA 3MJNA 4F3BA 4GF8A 3FZVA 1M5DA 1IXCA 1N3WA 4XTCQ 2PYYA 3G3FA 3T66A 5LOMA 3PUYE 4KHZE 1URGA 1Y1ZA 4IO5A 1FQCA 2H99A 4NF6B 1B3LA 2HCAA 3PUZE 4BDNA 4DE8A 3ILTB 1M5BA 3FV2A 3H4ZA 1B7UA 4FATA 1P99A 1NNFA 4E0XA 4UACA 3VVFA 3DP8A 4GXSB 4TLMB 3ZKKA 2A5SA 1BLFA 1M5FA 3S9MC 5H8FB 1ZU0A 2R9JA 4ND9A 4O3AA 1JVYA 3TDJA 3C31A 1SW2A 1B32A 4MLVA 1J1NA 1I6AA 5I56A 4G68C 2PT2A 1H76A 4ZEDA 2LAOA 4C1TA 4EF2A 2PMSA 3LC8A 4M1VA 1Y1MA 3C4MA 3RTFB 2OBGA 2I49A 1ZKBA 3UN6A 1B0LA 3K6VA 4QF9A 1SW1A 5DEXB 2QMWA 2QRYA 3LSWA 1D4NA 3E13X 2OLBA 1SQYA 3K1NA 4NTLA 3TKDA 3LSFB 4H67A 4XKNA 2H98A 4DXUA 1N0TA 2I0BA 2RC8A 1GVCA 3VLUA 4AB5A 3TCHA 1S9TA 3LSLA 1POY1 4IGTA 2NWJA 4EQ9A 3CIJA 3PPRA 4FEDA 3TFLA 3CG1A 4XXUA 1FQBA 3IOWA 3SETA 1MS7A 2XXXA 4IY6A 3AXFA 1Y9UA 2ANJA 2IA4A 4THIA 2XXTA 4R6HA 1L5TA 3FASA 1ZTYA 3KG2A 2F8DA 4X1DA 2XX7A 3M3KA 3T9VA 3QUJA 3S9NC 2ONSA 1N76A 1XC1A 2QS1A 4RXLA 4EXKA 1FTJA 3MW0A 1WODA 3RUMA 2E0SA 3MUQA 1Y3PA 2Y7KA 3CFZA 3K6XA 2ONKE 4F2OA 3C34A 1UTBA 4YKKA 2RC9A 3TODA 5I57A 3RT8A 1ZLQA 1ZJLA 4LATA 2NVUB 1GV8A 1N84A 3P7IA 1DTZA 4IO6A 2DXRA 3JV9A 5DVIA 3MVWA 2F97A 5FTIA 3G3GA 2DWHA 2ZNSA 3EPEA 3BFTA 5F7VA 3HSTA 3K0VA 4DZ1A 2P0SA 3O9PA 1N3XA 3SKPA 4X48A 4ZEFA 4YKJA 2XD2A 5KCJA 4QHQA 4LONB 2V3QA 4I1DA 1OQGA 5EYFA 3VE1B 3DELB 3H7MA 1DMBA 4FAJA 1I6BA 1US4A 5ICQA 2NUVA 2HEUA 1OLCA 4QFLA 1A40A 4E0WA 4R2FA 4LA9A 3RLFE 1TFAA 3VVEA 1B05A 1LAFE 1UIVA 2XXVA 1I6QA 3U93A 2DWIA 2ABHA 4LZ8A 3O66A 2CZLA 3C36A 5AA3A 4U2RA 4C1UA 2GHAA 3M8UA 1DOTA 4NF8B 3Q26A 2V3UA 4KD5A 3PPPA 1IITA 1TXFA 2Y84A 1IZ1A 1MM7A 1YTVA 4GWOA 1MXYA 3S9EA 3M3LA 1VFDA 5TP9A 2O51A 1OIBA 3CVGA 3FIRA 2Z8EA 2O1LA 4Z0IA 5CBRA 3K6WA 4IO2A 5I59B 2HAVA 2Y7PA 5CMCA 4GOTA 4N07A 4QSDA 1NNKA 4YICA 4XKRA 3RY3A 2RCAA 1FCKA 2WKYA 1R9QA 4ESWA 5L9OA 5CBSA 1Y3NA 2DWAA 2F5XA 3SEVA 1IIWA 5A5XA 2X7PA 2F35A 1AH5A 4PP0A 3H6WA 5ITPA 5JTYA 4GD5A 2O1MA 5J1DA 3PV0E 2XXQA 1JEUA 4Q5TA 1B5JA 2QL3A 2XXHA 3VV5A 3G3HA 3PMWA 1PB7A 2H5YA 3MPLA 4OTEA 1Z7NE 4NWCA 2ONRA 1BKAA 1UTHB 1ELJA 1P1OA 5AA1A 4BDOA 3GLBA 4QRZA 3THIA 1ATGA 2B3FA 2HXWA 3D4CA 3VFJA 1EZ9A 5FHOA 3N6UA 3OENA 1XVYA 1NNPA 1MXZA 1LCFA 4ECFA 4FECA 3C33A 3HPIA 4KYEA 4WKMA 1FTOA 3PUVE 5EHSA 4F22A 3OO8A 4IB2A 4HCWA 4L17A 5I2KB 4F2QA 4F19A 1P1UA 1MQDA 4WEDA 5L8DA 5H8NA 1B4HA 4F3GA 3PMVA 1D9VA 4F3PA 2PX1A 3FVNA 2OCUA 4LUBA 3VXBA 2O68A 4HW8A 1S50A 3IK6B 1SW4A 1GR2A 1B4ZA 1OQHA 2F7AA 4ZECA 4G8MA 4NF5A 1B1XA 1LGBC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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