4ECFA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport system, periplasmic component (lvis_0633) from lactobacillus brevis atcc 367 at 1.55 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
AGESITAVGSTALQPLVEAAGEQYTGEHLGTFINVQGGGTGTGLSQIQEGAVQIGNSDLFAGEQKGINARQLVDHRVAVVGITPIVNKKVGVKNLSTNQLIKIFTGQITNWKEVGGADQSIVLINRAQGSGTRATFEQFGLANHRSKTAQEQDSSGMVRSIVATTPGAISYVAFSYVNKTVQALSLNHVAPTEVNVTTNDWRIWSYEHLYTKGHPTGLTKAFITYVQSPAIQNTLVRQLGYLSPDQMLVERDANGHITKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
publication title Crystal structure of an ABC-type phosphate transport system, periplasmic component (LVIS_0633) from Lactobacillus brevis ATCC 367 at 1.55 A resolution
rcsb
source organism Lactobacillus brevis
total genus 88
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA02
3H6VA 3P7IA 2QS1A 1H45A 5LOMA 1PB9A 2OZZA 5L9SA 1MQGA 2YPNA 3I5OA 2RC7A 1MY0A 2Z23A 5DTBA 2O69A 3C4MA 4C1UA 4ZE8A 1AOVA 3KG2A 2DE3A 2HCAA 4YKKA 1CE2A 4XTCQ 4EQBA 1GVCA 4MBPA 1MY1A 5L9MA 3H6TA 1B0LA 5HPQA 4Q30B 4GIZA 4ELRA 1URGA 2ZYKA 4LQ5A 4Z7EA 3PPOA 2YJPA 2P2AA 3U94A 4JWOA 1DSNA 3E3KA 3GXAA 2XX8A 1LCTA 3LSLA 4PETA 4F1UA 2D5WA 1QVSA 1M5BA 1N04A 2Z8DA 1JW5A 3OMBA 2O1LA 1SW1A 2ZYNA 2DQVA 1NH7A 3S4UA 4Q5TA 4OERA 5I59B 3Q27A 4OWDA 4NF5A 3Q28A 4QSEA 4H5FA 3FGSA 4N07A 1F9BA 4ONYA 3HHFA 4DCXA 1N84A 1PBPA 2X26A 3IB0A 3DM0A 4DXBA 2F6PA 3IOWA 1SQYA 3LSWA 3MAMA 2A5TB 4F39A 4R2BA 5AA3A 3ILUB 2UVGA 3LSXA 3R26A 3AXFA 3OO7A 4NF8A 4IB2A 4LQ2A 3GBAA 1EU8A 5TU0A 3TAJA 3Q29A 1B6HA 4ZE9A 4N13A 3PGFA 2Y7RA 4GLIA 3KZGA 5AA4B 1URDA 3FJGA 3ZS6A 4KYDA 3LC8A 1QULA 1Y20A 1TT1A 4YKPA 4Q0CA 1B7HA 2V84A 2HZLA 1IEJA 4LZ8A 3SDFA 4JDFA 2HZKA 4RA1A 3CVGA 3FATA 5ITOA 1UTBB 2PVUA 1US5A 3D4GA 3S9MC 2GFEA 3UK4A 4WXJA 1P1WA 1SYIA 1US4A 1FQDA 1B51A 1B58A 1YCJA 1N3WA 1SW5A 1S50A 1B5IA 3FJ7A 1JW1A 4NF6B 4I1DA 2I48A 4KCDA 1WODA 1FQEA 4ZEBA 2FNCA 1JEUA 1TFDA 4H5GA 4ND9A 3C35A 5ISUA 2XHDA 4OQOA 3IX1A 1LCFA 1N0TA 5IAIA 3RUMA 3FD3A 3IJXB 4QHQA 2XD2A 2Q8JA 2M8CA 1GR2A 2F6GA 4XKNA 2VHAA 3N6TA 1Y4CA 1GV8A 4O3CA 1MG1A 2F97A 2R6GE 4HCYA 3PMWA 1B7ZA 2I4BA 5ICQA 4Z0IA 2I0CA 2VP1A 4GOTA 3M3FA 1MXUA 2B65A 4POXA 3TDJA 3ZKLA 3CG1A 4F3BA 3K6XA 1Y9UA 4DZ1A 3IO6A 4WEPA 5H8QB 3IB1A 3OXNA 3TYHA 5I58B 4GVOA 1A55A 4DCYA 4F3SA 4RPNA 3KSJA 3HN0A 3UN6A 5KZTA 2RINA 4FAJA 4YB7A 1I69A 4U1OA 2H25A 4NF4B 2I3VA 3TTMA 1B5JA 3CR9A 5H8FB 2F7BA 2E1SA 1QKAA 3VVEA 5H8NA 1UIVA 3R6UA 3K2DA 4OFOA 4DLDA 2BJJX 3EF7A 2ZNTA 4ESXA 2CZLA 3U92A 4OESA 1B3LA 1M5CA 2VGQA 3HO7A 1B1XA 4IO4A 3F11A 1B9JA 1QKBA 1XOCA 1JQFA 1BIYA 4DE8A 3EHSA 3VVFA 1JW4A 4XKPA 3TQWA 1NNTA 4NF6A 4FJPA 3RT6B 3D4CA 3TTKA 1UQWA 3VXBA 2XXPA 2ZMBA 3QUJA 1XVYA 1ATGA 3FUZA 4R75A 4Q8RA 4THIA 1MM6A 4KFQA 3MVXA 4OZ9A 1Y3PA 3KOSA 5I2NA 4F31B 2GHAA 1B7UA 2UVIA 2V3TA 2I4CA 3QK6A 3SKPA 4EQ7A 2NVUB 1D4NA 5HM4B 2VD3A 3K01A 3KEIA 5TP9A 2RKMA 5AA1A 3RPWA 2HAVA 3TCHA 5BWJA 3B7DA 2KLFA 4G8NA 1FQBA 5I57A 3CFXA 4RYAA 1MS7A 4OEUA 3EHUA 1I6AA 3V8XB 4H65A 4R9FA 4IY6A 2H4IA 2R9JA 1OLAA 3PUWE 3V89B 3TCGA 3OSRA 1B52A 3EHTA 5CBSA 4IY5A 5DYHA 3KN7A 1MM7A 3T9UA 5I58A 4OYVA 2DYXA 1L5TA 2I0BA 2REJA 4QRZA 1H44A 4PFUA 4GL0A 1D9YA 2XXIA 1ZLQA 3KJ7A 3MZBA 1A8EA 2LAOA 3THIA 2H9BA 4RNSA 2OK2A 4ZEDA 1IIWA 1HSJA 2OWTA 4GXAA 2I49A 3DP6A 1USYH 3C36A 4O3BA 1DMBA 3IK6B 3PU5A 4JSDA 1NFTA 4ZEIA 1BP5A 4KYEA 2F78A 2DP8A 4PFYA 4DDDA 4QFKA 1SI0A 4U2RA 4BDNA 4X48A 3IB2A 3VE1B 2Q88A 4MFIA 3FVOA 3KJTA 4ZEKA 4XIGQ 5FHMA 1LB9A 4BDQA 2NUVA 3FVGA 5FHOA 4UA8A 5DVFA 1NMUA 4IO6A 5CBRA 4PFTA 1JETA 1TFAA 2X7QA 3IR1A 1OQHA 4C0RA 2I6EA 4OMBA 4O3AA 3G3GA 1YTVA 2QL3A 3IOVA 3L6HA 5KCJB 3L6GA 1KWHA 4H1XA 1MPCA 3FJMA 1POY1 2PMSA 2ZYOA 2D3IA 1A7LA 4GL8A 2F7AA 4U21A 1B4ZA 2DE4A 4I9DA 5H8SA 3VXCA 1ZIUA 3TODA 2Y7IA 3GLBA 4R2FA 1Q1KA 1HSLA 4KCCA 1R9LA 3QUFA 3FXQA 5AA2A 4QSCA 3MC2A 4E0XA 5KDTA 1BLFA 3N5LA 5BUUA 3MWBA 3GZGA 1POTA 1P1NA 1BKAA 3M3KA 1VFEA 2XXWA 3PUYE 3SETA 3H4ZA 1RKMA 5K2XA 3BKIB 4EF2A 4JBZA 4OXVA 2XXVA 1FCKA 1VFDA 2DWIA 3K6WA 1ZBMA 3H6UA 4PP0A 2THIA 3I6VA 4F2OA 4K3FA 3IAZA 4YU0A 2P0SA 4OENA 3EQ1A 2VD2A 1OLCA 3O97A 4LZ7A 2RF1A 2XX9A 2V3UA 2ESNA 3OD7A 2QSXA 3TQLA 3E13X 3KN8A 1N7XA 3S2VA 4GRKA 2DSFA 4FORA 5JK4A 5CM6A 1LAHE 5AE4A 4DXUA 3SEWA 2F5XA 3K02A 1AIVA 2QMXA 5DEXB 1SYHA 1NH8A 1PBQA 1USYE 3MVWA 1ZTYA 3S9NC 3T22A 1Q35A 3TPAA 4F1VA 2V3QA 1GGGA 2I58A 2PT1A 1B40A 2DWJA 3G3FA 1FTLA 4KPTA 1IUDA 2F7CA 5H8NB 4WEDA 5KCJA 4OHNA 1EZOA 3MUQA 4NTLA 4XKQA 4L17A 1ZJLA 1OVTA 3DLNA 3FZVA 1ELJA 1XT8A 1PB8A 3BFTA 2E0SA 3RLFE 4ELOA 2IEEA 4GD5A 2RC9A 2OJTA 4IO3A 1IXIA 1Y1ZA 4U4SA 2XXYA 4R74A 4X1DA 3OEKA 4I8CA 3VDFA 5TPAB 4JWYA 4HCWA 4RK9A 1MQJA 2QS2A 2PBWA 4MH5A 1B0HA 3PD9A 5EYFA 1MY3A 4H8JA 1B3GA 1J1NA 5I2NB 3KSXA 4H6DA 2DWAA 5DT6A 4X9TA 1P1OA 5TP9B 1FTKA 3FXUA 1MDP1 2ZNSA 1B3FA 2PT2A 1IXGA 5I57B 1TWYA 4OETA 5CMMA 3K1MA 2XX7A 2O7IA 1Z7ME 1Y3QA 3PPPA 4P11A 1JVYA 3V83A 4KQPA 3HSTA 4XKRA 4NWDA 2FYIA 4NWCA 2ABHA 4DXCA 1MDQA 1FTOA 3UA8A 3GBBA 1B2HA 5DEXA 3FVNA 1UTHB 4M4GA 4EXLA 4YMBA 1SW4A 2AL5A 3QXMA 4C1TA 4G68A 3T9XB 1RYXA 4QFOA 3TTNA 2DOJA 2RCBA 4LZ5A 1MXVA 3IOTA 5ICTA 2HXWA 3UGWA 4ELQA 1OVBA 4R6HA 2Q2CA 1TXFA 3RN8A 3MBPA 2H5YA 3OEMA 4E0WA 5L8DA 4GWOA 1B46A 3MW0A 3RTFB 1B5HA 1LAXA 3HHGA 3TCFA 3KGCA 2UYFA 5H8HA 3TEPA 3IO4A 3N6UA 1JVXA 3TELA 3T66A 2OLBA 3BFUA 4JXIA 5A5XA 2UXAA 3O28A 1IQ7A 4KR5A 4F1YA 4AQ4A 2F8DA 1QJMA 4MLVA 2F35A 2GHBA 4N6PA 1UIUA 3EPEA 1FQCA 1QW0A 4G77A 1B32A 4JWXA 5TPAA 2ZNUA 3OO9A 3K6UA 1MXYA 4POWA 1ANFA 1SDXA 1MH3A 2V25A 4NMYA 3OO8A 4BDMA 3MJNA 3G7WA 2AIXA 2Q89A 4G2ZA 4U1ZA 1XVXA 3VLWA 3MQ9A 3KN3A 1H76A 4U23A 3E4RA 5CRYA 4BDRA 1MY2A 3H03A 1N76A 3H7MA 3DP4A 4YKJA 2UVJA 4ZECA 1LB8A 2PX1A 1MPDA 2B3FA 3C33A 2DE2A 4F3PA 1FQFA 4KHZE 5AA2B 3JYRA 3FV2A 1VE4A 3PMXA 3SEXA 5KDTB 1UTHA 4KD5A 3PMVA 2DWHA 1MXXA 3ILTB 1URSA 5JTYA 3ZSFA 2O7UA 4EXKA 3PUXE 1LFHA 2HQ0A 1LFGA 2H98A 4GQOA 3TKDA 1I6BA 2DS9A 1Y3NA 3K6VA 2O51A 4FEDA 3K00A 4PE5B 3K1NA 3VVDA 2NOOA 3MZ1A 4IO7A 4QFLA 2GRVA 1A99A 3CRBA 4YMAA 4RXLA 1P1QA 1H3DA 3PV0E 3RT8A 2ALUA 4IGRA 1XS5A 4BDLA 1FTMA 1NNFA 3IORA 1DTGA 1DPEA 4TLMB 1LSTA 2QJEA 3S9LC 1Y4TA 1HSEA 4LUBA 2Y84A 3VV5A 4P0IA 2OCUA 3K0VA 2Q9TA 2ZYMA 3O9PA 2CMOA 3T9VA 4YZZA 1QUJA 4LONB 3VLVA 1P1UA 2HEUA 3BBRA 4ISUA 3LR1A 2NWJA 2W7YA 4IGTA 1AH5A 1IXHA 3N26A 1A54A 2XXXA 3C34A 5JEIA 5M2VA 4OFLA 3FXRA 3B6TA 1BTJA 3ZKKA 3OELA 2DXRA 1Z7NE 4FE8A 3QSLA 1B3EA 1FTJA 3DELB 3KFMA 4YKIA 2D21A 1B4HA 2QMWA 4H0WA 4R72A 1B05A 3JZJA 3UP9A 4ELPA 3PUZE 4WKMA 1DPPA 4PQJA 1Y1MA 4RK2A 4KYSA 1S7YA 5CMKA 4TQUQ 5CC2A 4R9GA 3U8QA 2XXRA 3CFZA 5ITPA 1VR5A 1JNFA 1YPNA 4F3GA 4OEVA 1I6QA 1A40A 4OTEA 3G3IA 4X1BA 4YB6A 3MP6A 3QIMA 2QS3A 3H06B 3T9HB 4GF8A 1MY4A 2VOZA 4RY1A 1RYOA 1OMPA 3LUYA 2O68A 4HW8A 3UIFA 4LA9A 4H67A 1FW0A 3MPLA 3KOTA 2UYEA 5CMBA 4ESWA 3WAFA 1OIBA 3A09A 4JSOA 3MVYA 5AA2D 1O63A 3RGYA 2XXQA 5HBCA 1MXZA 1OQGA 4G68C 3WAEA 3U72A 3A3CA 2O1MA 1LFIA 4FATA 2RCAA 3IL1B 4QFPA 3I3VA 1PDAA 3ECRA 4G68B 2XXTA 3U1OA 4LVQA 4XXUA 1AMFA 5I2KA 4NE4A 3OOAA 1IZ1A 2DXYA 1AL3A 1LLSA 3ODBA 4F2QA 5I56A 4LP2B 1WDNA 2I3WA 3CSGA 3KBRA 1R6ZA 3MZ9A 5J1DA 2O84X 3TUSA 3A3UA 2QS4A 4R6KA 2QPQA 5H8HB 1GTKA 3SEVA 4F18A 4GXSB 5DVIA 1NNPA 4IO2A 2XXHA 1WVJA 5A5XB 3FIRA 3T93B 1M5EA 1B1HA 4LATA 5F7VA 3FASA 3U93A 1N7WA 4OVJA 3QAXA 3TTRA 2Z8FA 2Y7KA 1M5DA 2UVHA 3CI8A 3JV9A 3G3KA 2DVCA 3T96B 5EHMA 3W15C 3VFJA 1IITA 4G4PA 3K4UA 2O6AA 4U4XA 3PPRA 1R9QA 1D3KA 4RJZA 1SVXB 3O6GA 4I62A 2AL4A 2FA7A 3C32A 1PB7A 2R71A 4TLLB 1NKXA 1LBCA 1SI1A 2OBGA 3V5AA 4G8MA 1JEVA 5CI5A 5I59A 3H3GA 2ANJA 1VSOA 2HAUA 5DVJA 3TZAA 3EN3A 3PUVE 1S9TA 1EH3A 2YLNA 3Q25A 4R73A 4NEDA 3B6WA 3W9WA 2A5SA 3OENA 4EDPA 2ONSA 3M8UA 3H6WA 5IKBA 2A5TA 2HFBA 3Q26A 4FEBA 4YAHX 5JTYB 2REGA 2AYSA 1SBPA 2XXUA 1MQDA 4RPOA 3O6IA 3O66A 1LGBC 2ZXTA 3RQTA 4IO5A 4ZZEA 3CSBA 4PFWA 2QRYA 1B3HA 4YB5A 1XC1A 1ZU0A 1SW2A 4EF1A 5AA4A 1MRPA 1N3XA 3SERA 3PD8A 1MXWA 1A8FA 3G3JA 1P99A 2P1SA 1ZKBA 2ONRA 4YICA 2RC8A 1MH4A 4FECA 2DVZA 2PYYA 4F22A 1CB6A 1UTBA 3ONMA 5FHNA 2X7PA 2F36A 1EZ9A 2Y7WA 4QSDA 3W9VA 3TFLA 3HCQA 3S9EA 1EZPA 4EUOA 3HPIA 1T0KA 5I84A 1MQIA 3M3LA 4ZEFA 3TMGA 1PC3A 4ZDMA 4G8HA 5EHSA 4HS7A 4P0GA 2Z22A 5F1QA 2NXOA 1R1NA 3OO6A 2WKYA 4EQ9A 1LBBA 3C9HA 5FTIA 3USDA 3IOUA 1O7TA 3FVKA 2Y7PA 3B6QA 1NNKA 1QUKA 3SEYA 1NL5A 4BLAA 2ONKE 4U22A 3DP8A 3N94A 4UACA 4ECFA 3R7XA 4BDOA 5CMCA 4FIMA 3PPNA 3K1PA 1II5A 2GH9A 1MPBA 1M5FA 3CFLA 2OWSA 3SESA 3MPKA 1DOTA 1IXCA 3O29A 3C31A 4H8IA 2B3BA 4QF9A 5H8QA 3CG3A 5ELVA 1XHYA 5K2YA 3O6HA 4TOZA 1DTZA 3LSFB 4F29A 3MP1A 1PEBA 4AB5A 3CIJA 1QUIA 4NF4A 4OFJA 2IA4A 3FV1A 3G3HA 3OSQA 3LBSA 5H8FA 2G29A 5B7DA 3IJOB 4NF5B 4R6YA 3MVZA 3VLUA 3RNNA 5FTHA 1ZMGA 3O2AA 1YAEA 3PPQA 4F19A 2G93A 1D9VA 3QYTA 4ZS9A 4QFNA 1H43A 1MQHA 3HV1A 3RTWB 4M1VA 4HTGA 3SEUA 4MF3A 4DIGA 3RY3A 1FQAA 4JB7A 3TTLA 3MP8A 2Q2AA 1LAGE 2V93A 4KI0E 4AB6A 4NF8B 5I2KB 1LAFE 2F34A 1SD3A 4ZZAA 1O64A 5B70A 2Z8EA 3E9XA 3UORA 2H99A 5I56B 4GFRA 5L9OA 2XD3A 4MLQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6VA 4GWZA 3P7IA 2QS1A 1H45A 5LOMA 1PB9A 2OZZA 5L9SA 1MQGA 2YPNA 4H46A 3I5OA 2RC7A 1MY0A 1NUWA 2Z23A 4GWUA 5DTBA 2O69A 3C4MA 4C1UA 4ZE8A 1AOVA 3KG2A 2DE3A 2HCAA 4YKKA 1CE2A 4XTCQ 4EQBA 2Q8MA 1GVCA 4MBPA 1MY1A 5L9MA 3H6TA 1B0LA 5HPQA 4Q30B 4GIZA 4PC9A 4ELRA 1URGA 2ZYKA 4LQ5A 4Z7EA 3PPOA 2YJPA 2P2AA 3U94A 4JWOA 1DSNA 3E3KA 2QFLA 3GXAA 2XX8A 5EYGA 1LCTA 3LSLA 4HE2A 4PETA 4DI4B 4F1UA 2D5WA 4N17A 1QVSA 1M5BA 1N04A 2Z8DA 1JW5A 3OMBA 2O1LA 1SW1A 2ZYNA 2DQVA 1NH7A 3S4UA 4Q5TA 1NV6A 4OERA 5I59B 4PAKA 3Q27A 4OWDA 4NF5A 3Q28A 4QSEA 4H5FA 5J16A 3FGSA 4N07A 1F9BA 4ONYA 3HHFA 4DCXA 1N84A 1PBPA 2X26A 3IB0A 3DM0A 4DXBA 2ZZWA 2F6PA 3IOWA 1SQYA 3PTYA 3LSWA 3MAMA 4LN5A 2A5TB 4F39A 4OVQA 4R2BA 1FPKA 5AA3A 3ILUB 2UVGA 3LSXA 3R26A 1BK4A 3AXFA 3OO7A 1K9ZA 4NF8A 5I7IA 4IB2A 4LQ2A 3GBAA 1EU8A 5TU0A 4IR8A 3TAJA 4FBPA 3Q29A 1B6HA 1NV3A 5ET7A 4ZE9A 2P3VA 4N13A 3PGFA 2Y7RA 4GLIA 3KZGA 5AA4B 1URDA 3FJGA 3ZS6A 4KYDA 3LC8A 4OVRA 4MHFA 1QULA 1Y20A 1TT1A 4YKPA 4N6DA 4Q0CA 1B7HA 2V84A 2HZLA 1IEJA 4LZ8A 3SDFA 4JDFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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