4ELOA

Ferric binding protein in apo form 1
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
TLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the ferric binding protein A
rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
total genus 110
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA02
2F78A 3QAXA 1LBCA 1NNKA 1US5A 4LQ2A 3RUMA 4ZE9A 2ZYKA 1M5BA 2XXYA 3B6QA 1N3WA 2I4CA 5ISUA 4GWOA 1B05A 1XC1A 2XXWA 2RCBA 4YAHX 3OO7A 1SW4A 1B3GA 1YCJA 3DM0A 3K1MA 1P1WA 3T9XB 4MBPA 3E13X 4RJZA 2NWJA 1XHYA 3TAJA 4XKPA 4I62A 3U72A 2PVUA 3W15C 5A5XB 2QS3A 2DQVA 1SD3A 2XXTA 2UXAA 4IO2A 1SBPA 5AA3A 3T66A 4QFPA 2O51A 4GLIA 1ANFA 4GRKA 1CB6A 4G8HA 1AH5A 3TTLA 1QUJA 2G93A 3T22A 4IO6A 5CMMA 3BFTA 4G8MA 3UK4A 4YKPA 4XKNA 1AIVA 1YAEA 4GXAA 4RXLA 5DTBA 2HFBA 2I3WA 1GR2A 1FW0A 1PC3A 4Q8RA 3MPLA 1VFEA 4U4SA 5H8HA 1EZOA 4PFUA 1LAXA 4R75A 4X48A 1SYIA 1QKBA 1A8FA 2RINA 3RN8A 2RCAA 1N84A 3U8QA 1MXZA 2V3UA 3H03A 2HCAA 3O6IA 1WVJA 2XXPA 1B1HA 1LSTA 2QMXA 3OSQA 3I5OA 3TCHA 2AL4A 3PUWE 4H5GA 4LZ5A 5I2NB 3UIFA 4DIGA 4R9FA 4F19A 4F2QA 1MY4A 1MY2A 3OSRA 2GFEA 4U1OA 3MVXA 4ESWA 3BBRA 3W9VA 2DYXA 1AOVA 4ZEFA 1TWYA 1UIUA 5DVFA 1A55A 3ILTB 5TPAB 4ELPA 3F11A 1NH7A 3BKIB 4RK9A 1YTVA 3FV2A 3T9UA 3FASA 4MH5A 1N7XA 4F1YA 1KWHA 5CI5A 3TFLA 1IXHA 4JWXA 1OQGA 3C32A 4N13A 3H4ZA 5FHMA 1LFGA 4LZ8A 3EQ1A 4LONB 5TU0A 5F7VA 5I2KA 5CMKA 3LR1A 5H8QB 3MUQA 2UVJA 4QFLA 5CM6A 5CC2A 4F3SA 4H8JA 4U1ZA 3MQ9A 1B5HA 2ALUA 1B46A 4ZEBA 1M5DA 4WXJA 3EHSA 5DEXA 3KOSA 1P1QA 3V89B 4FIMA 1ZJLA 4F3PA 2XXIA 3HHGA 3FXRA 3MWBA 4DDDA 2HXWA 3FGSA 1NNFA 4ZDMA 3MAMA 4M1VA 3MZ9A 1QW0A 3KGCA 4KYDA 3KN8A 3C35A 1NMUA 5J1DA 1ZBMA 4R2FA 1B4HA 3PPNA 2QSXA 2D5WA 4DXCA 3A3CA 2HAVA 2VD3A 1M5FA 4FE8A 4LZ7A 4DZ1A 5L9OA 1B2HA 1MPCA 4IB2A 5AA2A 2B3BA 4QSEA 1OIBA 3IR1A 2DP8A 1JEUA 1MQJA 2X26A 1TFAA 1S9TA 3TTMA 5I56B 3FUZA 3IOUA 1AMFA 1ZTYA 1JEVA 4EF2A 2F97A 3RY3A 3PUXE 5FHNA 3RTFB 3B7DA 3V8XB 1CE2A 1MDQA 3TUSA 3R26A 2O7IA 4Z0IA 3U94A 3I3VA 2QPQA 2OWTA 1BIYA 1DTZA 2VOZA 1WODA 2WKYA 3JV9A 4OTEA 4DXUA 1FTOA 2DE3A 2FNCA 4GOTA 1B0HA 1LB9A 3QK6A 3H6TA 5I57A 4FECA 2UYFA 1B51A 3H6WA 2P2AA 5A5XA 2VP1A 5AA4B 1LFHA 4TOZA 4ZZEA 2HAUA 1RYXA 2QL3A 2HEUA 1XVXA 2Q2CA 2OWSA 1MQGA 2FA7A 4JWYA 1XVYA 3C31A 4ZZAA 4Q5TA 3MP6A 4PFTA 3S4UA 5M2VA 1JW4A 3HN0A 3O9PA 2ONRA 3RT6B 4ZEKA 2F6PA 3N6UA 1FTKA 2ZMBA 1M5CA 3DP8A 3TELA 3PUZE 2UYEA 2XXXA 3PPRA 3PPPA 2O1LA 4E0XA 3MZBA 5ELVA 1QVSA 3E3KA 1SQYA 3SKPA 2XXHA 3KEIA 4OMBA 3K4UA 5FTHA 4QSDA 1Y9UA 2Y7RA 3AXFA 5L9MA 2F6GA 5JEIA 2I48A 5TP9B 2XXRA 1SDXA 1Y1ZA 1UTBB 4OEVA 2AYSA 1R9LA 2Z8DA 2REGA 4NF8B 4F39A 4IO7A 4H67A 1MQDA 4RPOA 2F5XA 2H4IA 3CR9A 4NF6B 5ICTA 5B70A 3WAEA 1UTHA 4JDFA 4ELQA 3GBBA 1EH3A 3CIJA 3K0VA 3K1NA 3VV5A 5I2NA 3R6UA 1B7ZA 1POTA 3H3GA 1H43A 3UORA 2XHDA 3FJGA 2PT1A 2RC7A 1MQIA 3EHTA 3IB1A 2DXRA 1ELJA 4PETA 4KR5A 3IL1B 5I84A 2Q2AA 3KG2A 2CZLA 4ELRA 4OYVA 1P1UA 4BDMA 2O7UA 4K3FA 2GHAA 3MVYA 4OETA 4O3BA 3UP9A 4U2RA 2H25A 2RC8A 2D21A 4EQBA 1LAHE 1A8EA 4NF5B 2F7CA 2IEEA 3IB0A 2KLFA 4OQOA 3IOVA 5H8QA 4G68A 1OVBA 1B5JA 4KI0E 2Y84A 1B40A 4GL0A 4YMBA 4POXA 1B32A 5FHOA 5KCJB 3PD8A 4GVOA 1MXWA 4BDRA 1MY0A 3P7IA 3UA8A 1M5EA 2Z22A 2E0SA 2DS9A 3PGFA 4LVQA 3ZS6A 4ZEDA 5ITPA 3FV1A 1F9BA 1B4ZA 3E4RA 2V93A 5AA2D 3FD3A 5ICQA 3TEPA 2QMWA 3OENA 4KYSA 1MH4A 1N76A 1SI1A 4R6HA 4NTLA 4R72A 3PUYE 5FTIA 4I9DA 4X1BA 3T93B 3R7XA 1NKXA 3PU5A 1Y20A 1H44A 3LBSA 3OELA 1AL3A 4R6YA 2QRYA 2HZKA 4WKMA 4JWOA 3MZ1A 4OXVA 5I56A 3SESA 1T0KA 4ZS9A 2DXYA 2HQ0A 4WEDA 3QIMA 1ZLQA 1ZIUA 4R6KA 4E0WA 3O6HA 3VLWA 1B0LA 4G77A 4IGTA 2DE2A 4O3AA 5H8SA 2F8DA 1MY3A 3H06B 4TLLB 4EXLA 5CBRA 3FZVA 2R9JA 4FAJA 1LLSA 4UACA 4Q30B 4F1VA 4TLMB 4R9GA 1I6QA 2DWAA 2RKMA 4KHZE 3TQLA 1MDP1 4H6DA 3N26A 1O63A 4EQ7A 1DMBA 3LUYA 4RPNA 4NE4A 4DXBA 2XXVA 3TDJA 1XS5A 3ZSFA 4MLVA 3S9EA 2ZYMA 2ZNTA 3QYTA 1IXGA 3K6XA 2PYYA 4QF9A 3H7MA 4BDLA 3BFUA 4NF4B 4RA1A 4Q0CA 1GVCA 3TCGA 4YMAA 1TFDA 1D9VA 1SVXB 1UQWA 1BLFA 5ITOA 4JSDA 3VLUA 5JK4A 1HSEA 1XOCA 5H8FA 1TT1A 5I59B 4RNSA 5I58B 3KN7A 4HW8A 3Q27A 4IGRA 1PB9A 1Y3NA 2RF1A 3CSBA 2UVGA 2GHBA 3S9NC 3IX1A 4UA8A 3IO4A 3CSGA 1BKAA 1GV8A 5CRYA 1NNTA 4PQJA 1IEJA 1SI0A 3KOTA 5TP9A 3TZAA 2LAOA 4BDOA 2Z8FA 2XXQA 2DOJA 5JTYB 5K2XA 3TTKA 4DCYA 4IY5A 3VFJA 3SEUA 1MM7A 3OEKA 3N94A 4NF6A 3KJ7A 3PPQA 5EHSA 5IAIA 2BJJX 2XX8A 3MP8A 4P0IA 3TCFA 1QJMA 2XX9A 2V3QA 4XXUA 2H5YA 3TYHA 4H8IA 4N07A 4ONYA 3JYRA 4THIA 2Z23A 2A5TB 4F2OA 4G2ZA 3TODA 5AA1A 3KFMA 3MC2A 2O68A 1Y3QA 2I58A 4M4GA 1PEBA 3L6GA 5CMCA 1MXXA 1LAGE 5HBCA 5CMBA 2UVIA 2I4BA 2I6EA 1QUKA 2THIA 4POWA 3CFZA 1FQBA 3MVZA 4JXIA 2YJPA 1A40A 4HTGA 3RPWA 2UVHA 4L17A 3VXCA 4FEDA 3HSTA 4RK2A 2QS2A 3RTWB 3C36A 1IXIA 1B3EA 2VHAA 1B3LA 3ILUB 4LUBA 1B3FA 4LATA 4F3BA 1JETA 3U92A 4QFNA 3Q29A 3G3GA 3EHUA 2REJA 5H8HB 2W7YA 3FVOA 1EZPA 1A99A 3HO7A 1IIWA 3VLVA 3CG1A 1RYOA 3G7WA 2V84A 3PPOA 4RYAA 1R9QA 3K00A 1IQ7A 3G3FA 1I6BA 1LAFE 3ZKLA 1LBBA 1B7UA 3IO6A 2G29A 3LC8A 3ONMA 4FATA 1Y4CA 1OQHA 2Y7WA 3FIRA 2Y7KA 3HHFA 5K2YA 1USYH 4F3GA 4PFWA 2H98A 4QFKA 4ND9A 4P11A 4NMYA 3DP4A 3FVGA 3OO8A 4QHQA 3PD9A 2B3FA 1MXUA 3V83A 2HZLA 4HCYA 2B65A 1IITA 1B1XA 3EF7A 2QJEA 1HSJA 3K6VA 1MS7A 2DE4A 4HCWA 3C33A 3K01A 2ESNA 3G3KA 1LB8A 3LSWA 1FCKA 1MRPA 4DLDA 1LCTA 2F34A 1IXCA 3L6HA 3SERA 4ELOA 3Q26A 1D3KA 1MPDA 4I8CA 4EQ9A 1N7WA 3G3JA 3IJOB 4PP0A 1Q35A 3O28A 1FTLA 2R71A 3QXMA 4C0RA 3FVNA 2XD2A 2O69A 5DEXB 4H5FA 4O3CA 3U1OA 1Y1MA 2AL5A 4ECFA 2R6GE 3PMWA 1BTJA 1B5IA 3TQWA 1FQAA 4YKJA 4NF4A 3GBAA 1QKAA 5EYFA 5B7DA 5TPAA 1FQFA 3RT8A 3QUFA 4HS7A 4G4PA 4PFYA 5I59A 1Z7ME 5I58A 3GLBA 1Y4TA 1HSLA 1N3XA 3FXUA 3PMXA 1LGBC 1IUDA 1URSA 2OBGA 1MQHA 4P0GA 4OFLA 4C1UA 2XX7A 2ANJA 1ATGA 5HPQA 3QUJA 2H9BA 2OLBA 3C9HA 3MJNA 4GXSB 3D4CA 1JQFA 1MPBA 1POY1 1II5A 1UIVA 1D4NA 2O1MA 1H45A 3S9MC 3B6WA 2D3IA 5JTYA 4YKKA 2FYIA 5H8NB 2ONKE 1MXVA 2YLNA 3N5LA 3TTRA 1PBQA 5KDTB 4ZE8A 3FXQA 2O6AA 4MF3A 3CFLA 3RGYA 3N6TA 4ESXA 1FQDA 2Q89A 5I57B 4U21A 5IKBA 2A5TA 4GF8A 4R73A 1P99A 2OZZA 1EZ9A 3LSFB 4GIZA 1DSNA 4OEUA 1JW1A 2VGQA 4XKQA 4X1DA 3IOWA 2F7BA 4BDQA 2NOOA 3QSLA 1OLCA 1URGA 4ZECA 1DOTA 3EPEA 3DLNA 1EU8A 4XKRA 4H0WA 1SW5A 4KPTA 5KZTA 3PUVE 4EUOA 4YICA 2DSFA 1GGGA 4F22A 1OVTA 3KN3A 2DVZA 2X7PA 4XIGQ 4OENA 5DYHA 4JB7A 3CFXA 3IORA 4ZEIA 3UN6A 4GD5A 4YKIA 2P1SA 3OO9A 4GQOA 1L5TA 3T96B 2CMOA 4KCDA 4N6PA 3C4MA 3K1PA 1MH3A 1MXYA 1GTKA 1URDA 1BP5A 1DTGA 3C34A 2ABHA 4RY1A 2I0CA 1WDNA 1JVXA 5AA4A 3S2VA 2GH9A 3CI8A 3PMVA 1O7TA 1UTHB 4KD5A 4F29A 3HV1A 5L8DA 2Y7PA 3G3HA 4NEDA 1ZMGA 2ONSA 1VFDA 3THIA 3VVFA 2F36A 3CRBA 1J1NA 4R74A 1B9JA 1LFIA 1P1NA 1RKMA 3B6TA 4ISUA 4YZZA 4TQUQ 3TMGA 2Z8EA 4FEBA 3GZGA 3M3FA 1NNPA 1PB8A 1PDAA 4X9TA 4F1UA 1R6ZA 1Y3PA 5CBSA 1TXFA 3V5AA 5AE4A 5F1QA 4G68C 4OHNA 3SDFA 1NH8A 3K02A 3MW0A 3SEYA 1VE4A 3CG3A 1FQCA 1UTBA 3FJ7A 2Q8JA 3O66A 4EDPA 4G68B 4AB6A 4NF8A 3SEXA 1N04A 4OZ9A 2I0BA 3RLFE 3H6UA 2X7QA 3I6VA 2V3TA 4DCXA 2OJTA 4GFRA 3OEMA 1OLAA 3IB2A 3FJMA 1H3DA 1I69A 1Z7NE 3Q25A 2M8CA 1S7YA 1NFTA 1QUIA 4KCCA 2ZXTA 1D9YA 3ZKKA 1R1NA 4EF1A 2O84X 3W9WA 3OOAA 3H6VA 1USYE 3TKDA 3FVKA 1B3HA 2NUVA 3KZGA 2XXUA 5EHMA 3SETA 2QS4A 4U23A 1H76A 2PX1A 3O2AA 3SEVA 2E1SA 3T9HB 3VXBA 2OK2A 3VVEA 4OVJA 4H65A 2Q9TA 3EN3A 4AB5A 4NF5A 5BWJA 5LOMA 4IO3A 1OMPA 2DWIA 4JSOA 1QULA 1VR5A 4YU0A 2ZYNA 3VE1B 3USDA 3DP6A 4WEPA 3SEWA 3OO6A 3K2DA 5KCJA 4YB6A 3KBRA 3S9LC 1US4A 2NXOA 3CVGA 3HCQA 4IO5A 3PV0E 5H8NA 2DWHA 4NWCA 3TTNA 4OERA 1B6HA 1O64A 1JW5A 5L9SA 2QS1A 5KDTA 4DE8A 1MY1A 1IZ1A 2GRVA 4OFJA 3GXAA 4QSCA 3IOTA 2XD3A 2I49A 1JNFA 4QRZA 3TPAA 1B7HA 2RC9A 4LP2B 1PBPA 1SW2A 3O97A 2ZNUA 3M8UA 4G8NA 3K6WA 4JBZA 3KSXA 4R2BA 4LA9A 1XT8A 2P0SA 3LSLA 2I3VA 4AQ4A 4H1XA 3VDFA 2F35A 2A5SA 4YB7A 3MPKA 2H99A 3G3IA 3T9VA 3D4GA 2VD2A 5H8FB 4NWDA 2NVUB 1A7LA 1YPNA 3O6GA 3A3UA 4BLAA 3IJXB 3M3KA 3VVDA 4C1TA 1A54A 1N0TA 4U22A 1ZU0A 3RNNA 2ZYOA 3U93A 3RQTA 3OMBA 2DWJA 2F7AA 2V25A 1S50A 1PB7A 4Z7EA 5I2KB 5DT6A 1B52A 3A09A 3FATA 3WAFA 5HM4B 2PMSA 3K6UA 4QFOA 3KJTA 2PT2A 4KQPA 1FTMA 4IY6A 3E9XA 3UGWA 3MBPA 4F31B 1DPEA 3MP1A 1JVYA 5BUUA 1FQEA 3ODBA 1Q1KA 1VSOA 5DVJA 1ZKBA 1LCFA 4KYEA 4LQ5A 3HPIA 4GL8A 2YPNA 4PE5B 4OWDA 2Y7IA 4MLQA 4BDNA 3MVWA 3KSJA 4OESA 1MM6A 2OCUA 3OD7A 1FTJA 3IAZA 4FJPA 3IK6B 4U4XA 5DVIA 1I6AA 3DELB 4F18A 2DVCA 2PBWA 4EXKA 1SW1A 4MFIA 3ECRA 3Q28A 2IA4A 4IO4A 4YB5A 4XTCQ 2Q88A 1NL5A 5AA2B 1P1OA 3JZJA 3O29A 2ZNSA 4I1DA 4FORA 3OXNA 3M3LA 1B58A 1DPPA 1MG1A 1SYHA 4KFQA 2AIXA 3LSXA 4OFOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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