4ELOA

Ferric binding protein in apo form 1
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
TLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
publication title Crystal structure of the ferric binding protein A
rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 110
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA02
4IO2A 3R26A 3MQ9A 3DP6A 1ZBMA 4QFLA 1BKAA 4GQOA 4OMBA 2V84A 5AA2A 1CB6A 3MZ9A 4THIA 1XT8A 3ZS6A 3B6WA 2RCAA 3N94A 1D3KA 3THIA 3T96B 2OJTA 3IJXB 1XVYA 2QS3A 1ANFA 3OEKA 3MVXA 1SD3A 1LCFA 4FE8A 3R6UA 1B51A 3ZKKA 2O51A 4TLLB 2ABHA 4NF6B 2DWAA 1TT1A 4LVQA 4JWYA 4QHQA 2IA4A 2XX8A 2OK2A 1XC1A 1B2HA 2F35A 1P1UA 2NXOA 4GVOA 1N0TA 3K1NA 4DXBA 4ESXA 1JNFA 4F3PA 3TQWA 3DM0A 1USYH 4RK2A 4F22A 1JETA 3TMGA 4XKQA 2ZXTA 3VVFA 3PPQA 4WKMA 2PVUA 4M4GA 1SW1A 2O1MA 4Z0IA 4R6HA 2H99A 3TTKA 1SI0A 5H8NB 4JDFA 3UN6A 2F5XA 1Y9UA 3C34A 3H4ZA 3TCFA 2Q8JA 1QUKA 2RF1A 2VOZA 4F1VA 5HPQA 5CI5A 1D4NA 4N13A 4GL8A 1TXFA 3U92A 1VFEA 1IXHA 3C31A 4YB6A 1MQIA 4NF8B 1US5A 2O84X 1XOCA 2Q2CA 3PPPA 4QF9A 4EQ7A 4NF5A 4H65A 4MH5A 2V3TA 3PUZE 4NF4B 3LR1A 3PPOA 3LSLA 3FV1A 3EF7A 3HPIA 5AA2D 2NWJA 3OXNA 2ONRA 1FQAA 2I49A 2ONSA 3LSFB 1H44A 1P1WA 1B40A 2FA7A 1FQEA 2THIA 5L8DA 5JTYA 4GL0A 1II5A 1FQBA 4E0WA 1MXYA 2F36A 1HSLA 1NH7A 2Y7KA 1JEVA 4YKKA 3V8XB 1ZTYA 4QSDA 1B5JA 2D3IA 4R9GA 5I59B 1LCTA 3H06B 1URSA 4OHNA 4ZEIA 4JSOA 4R74A 3CR9A 4YMBA 4POWA 4GD5A 2DS9A 3GBBA 4N07A 5KCJA 3BFTA 1TFDA 1A8EA 2I4CA 4PFTA 2PYYA 1MPBA 5HM4B 2VGQA 3P7IA 4IGRA 3G3FA 1AL3A 1FTJA 3L6HA 1JVXA 1H45A 1MQDA 3V83A 3G3JA 1FTMA 3ONMA 4R75A 3CFZA 2V3QA 5K2YA 3O2AA 3EHSA 3I5OA 1PDAA 1NFTA 3USDA 2XHDA 2VD2A 1Y1ZA 3C35A 1FQDA 3G3IA 2PMSA 4G68B 2XD2A 3IOTA 5FHNA 3TZAA 2Z23A 3RQTA 3SDFA 1EZOA 4ZDMA 2F78A 1LAFE 4F1YA 1B9JA 1SQYA 3OO9A 3K0VA 3MVWA 2OWTA 1LB9A 3DLNA 5DVJA 5CMBA 2QJEA 4OFLA 3HHGA 1MM6A 3MP6A 4F1UA 1P1OA 4KR5A 2I4BA 1H76A 3HV1A 4R72A 2KLFA 4OZ9A 3W15C 1YTVA 1ZIUA 4I9DA 4PETA 1B7UA 2RC7A 1YCJA 4BDLA 2OCUA 3FVOA 2DWIA 4ZE9A 4O3CA 3C4MA 3E4RA 4YMAA 4G77A 1NMUA 4IY6A 3RTFB 3W9WA 1UQWA 2QMWA 1MY0A 3TODA 4U1OA 3IX1A 4BDNA 2ZNSA 3OO8A 3ILTB 5CBRA 4RA1A 4DIGA 2XXUA 5H8FB 3M3KA 1RKMA 2UYFA 3RGYA 2E0SA 5I2NA 4OERA 1SI1A 4QFNA 2D5WA 3SKPA 2HXWA 1UTBB 4TLMB 3KN8A 4OESA 4EQBA 5JEIA 1JVYA 3E3KA 2V25A 3PV0E 3TTMA 4BLAA 2UXAA 1RYXA 1OQHA 3RN8A 5I58A 3OSRA 1I6QA 4HS7A 3KSXA 2A5SA 2XXPA 2RCBA 1P1NA 1UTHA 4E0XA 4G2ZA 1YAEA 3PU5A 2PBWA 3I6VA 3SEUA 3RT6B 4YKJA 3TELA 5F1QA 3SEWA 3KEIA 1GGGA 1WDNA 4ZEBA 3IJOB 1ZU0A 2R6GE 3LC8A 3EHUA 1DOTA 5KDTA 2Y7RA 2XXIA 2P2AA 4XTCQ 1OLCA 1MXVA 2VHAA 1MS7A 3LBSA 4G8NA 2O7IA 3QXMA 4R6KA 2HZLA 5HBCA 1PBQA 1B6HA 4WEPA 1JQFA 4I62A 4QRZA 3HSTA 4F19A 4ECFA 1PB9A 1B0LA 3BBRA 1DPPA 1Y4CA 4RPOA 3U93A 1FQFA 4BDQA 1EZ9A 4DZ1A 4DLDA 1LAGE 4RY1A 3OELA 1S7YA 2VP1A 4MLVA 2UVIA 4LONB 5DEXB 3FIRA 2Y7IA 3DP4A 2DYXA 2X7PA 3U72A 3BFUA 4IO5A 3AXFA 4ELPA 2UYEA 4POXA 4R6YA 3C36A 4JWXA 2GHAA 4EDPA 1L5TA 5AA4B 4JB7A 1B4HA 4OFJA 3GLBA 1ELJA 1OLAA 4P0IA 3Q27A 3O6HA 3TCHA 4C0RA 4H8JA 4X1BA 2V93A 3E13X 4JXIA 5H8QA 3E9XA 3PMWA 4RK9A 2I58A 3K2DA 3K1MA 2O6AA 3IK6B 4JBZA 3K6WA 5I2KA 2QPQA 1B58A 3OEMA 3FD3A 2F97A 2PT2A 1SBPA 1R9QA 4FAJA 4KYSA 4Q30B 1DSNA 4YAHX 1EH3A 3PUYE 4DCYA 4EQ9A 3FUZA 4O3BA 5FTIA 4AQ4A 3TCGA 1NNPA 2I3VA 2Q9TA 2QSXA 2F7BA 4AB6A 3MWBA 3CFXA 3MPKA 1Y20A 3G3GA 2DXYA 4OENA 5A5XB 4AB5A 1R6ZA 2NOOA 1IXIA 4H8IA 3CI8A 5ISUA 2R71A 3RNNA 1XVXA 3QUJA 4NF6A 1DMBA 3K00A 2G29A 4TQUQ 4GXSB 2Z8DA 2VD3A 1VR5A 3O29A 5KZTA 4UA8A 2H4IA 1O64A 3M3FA 1WODA 2ZYNA 3M8UA 4ESWA 1B05A 1Z7ME 4BDOA 4XKPA 4IY5A 3T22A 3D4GA 4GIZA 2A5TB 4P11A 4H5GA 3FZVA 5TPAA 3KZGA 5DVIA 3R7XA 4OQOA 1HSEA 4OXVA 3TQLA 4IO6A 1PEBA 5H8SA 3VLVA 2AIXA 1URDA 3S9LC 1DTGA 1URGA 4R9FA 2RINA 4IB2A 4NMYA 4EF2A 4LZ7A 2Q89A 3KFMA 4FECA 3B6QA 1B3LA 2O68A 2ZNTA 3LSWA 2H5YA 4ISUA 1WVJA 3PUXE 3VLUA 4NF4A 3QK6A 2F7CA 4F31B 1MH3A 4RJZA 2XX7A 2XD3A 4GFRA 5I84A 3Q26A 3FXQA 3KGCA 1A7LA 3T93B 4KPTA 1NNTA 1LFIA 1FCKA 2F6PA 2XXXA 3F11A 3CVGA 2F34A 4OVJA 3KJTA 3IOVA 1B32A 3CIJA 3S9MC 3FXUA 4QFKA 4G8MA 3L6GA 5DVFA 1VE4A 5I56B 3G3HA 3BKIB 4ZEDA 2ZNUA 3VV5A 3IAZA 4C1TA 1B1XA 4TOZA 1SYIA 4Z7EA 4IO3A 1JW5A 2DVCA 3CG3A 4XKNA 4ZZAA 2DQVA 3MPLA 4MBPA 3PMVA 4FIMA 3TYHA 1N84A 3MP1A 4KCCA 4U22A 5CC2A 1B52A 1NKXA 1P1QA 3OMBA 1JEUA 4U23A 2LAOA 1M5BA 3N6UA 5M2VA 3UORA 1MY3A 1SYHA 1MRPA 4F39A 1LAHE 3UK4A 2B3BA 2DSFA 5B70A 1BLFA 4ZE8A 2QMXA 3GXAA 4GOTA 1OVTA 1FTOA 2H98A 2Q2AA 3TDJA 1MG1A 4WEDA 2E1SA 4K3FA 3FXRA 2I48A 2P1SA 4U2RA 1IXCA 1EU8A 4QSEA 4G68A 3SESA 4U1ZA 4MLQA 2B65A 2Y84A 5CM6A 3VVEA 2O7UA 1LAXA 3T9HB 2I0BA 4MFIA 3MZBA 1LBCA 2YPNA 3O6GA 5BWJA 1BTJA 3UA8A 5ICTA 4GRKA 2H25A 1A40A 1M5FA 1IUDA 2R9JA 3T9XB 3VVDA 2XX9A 4LQ2A 3C33A 4KD5A 4DDDA 2HQ0A 4F18A 4HCWA 3N5LA 4DXUA 3FATA 5CMCA 3C9HA 1MM7A 3KJ7A 5IAIA 5LOMA 1B5IA 3H03A 3PD8A 1PBPA 4ZS9A 4I8CA 4YKPA 3K1PA 3TFLA 1Y3NA 2REGA 1QJMA 2HCAA 4OWDA 3MW0A 4MF3A 4Q8RA 1ZJLA 2HAVA 3FASA 5L9OA 3FJMA 3T9VA 3IOUA 2ZMBA 1PB7A 4FEDA 1Q35A 3PGFA 5H8FA 3A09A 2XXWA 4OYVA 3TTLA 3UIFA 2RC8A 1QVSA 3VLWA 5H8HA 1UTBA 5J1DA 1DTZA 1ZLQA 1N76A 4R2BA 1QKBA 5BUUA 3K4UA 4HW8A 3RY3A 1MPCA 3S9NC 4Q0CA 1A55A 2OBGA 4PFYA 5CMMA 2UVJA 3EN3A 1Y1MA 3FVNA 5FHMA 3EPEA 5KDTB 1MXZA 4I1DA 3RT8A 2Q88A 3VE1B 4LP2B 4FEBA 1MQJA 4KYDA 3IORA 2W7YA 1MH4A 1S9TA 1RYOA 4ONYA 2M8CA 1MY4A 2QS2A 3CSBA 4KI0E 5JK4A 5EYFA 2XXYA 1PB8A 5I57B 3PMXA 2HZKA 2DWJA 1VFDA 3FV2A 1MQGA 3S9EA 3WAFA 4JSDA 1FTKA 1B1HA 3TTNA 1N3XA 2QL3A 3UP9A 2OZZA 1ZMGA 2IEEA 3KN7A 1TWYA 3H7MA 3EQ1A 4XXUA 4GF8A 3ZKLA 3CSGA 5TP9B 2GFEA 1B3EA 1I6BA 1T0KA 1H3DA 5DEXA 1D9VA 4OETA 5H8QB 1USYE 2CZLA 5AA4A 1UIVA 3K6VA 5AA2B 4FATA 3OO7A 1JW1A 1I6AA 2H9BA 3ODBA 1TFAA 1Y3QA 4F3SA 5FTHA 1A8FA 4EF1A 1Z7NE 2YJPA 3N6TA 4R2FA 3EHTA 3I3VA 3FJ7A 1NNKA 4U4XA 2YLNA 1M5DA 1B3FA 2F7AA 2ALUA 2O69A 4G68C 1IQ7A 4EXLA 2AL5A 1M5EA 2HFBA 1NH8A 1KWHA 4RNSA 3RTWB 3RLFE 3VXBA 5ELVA 1AMFA 3ILUB 2WKYA 4U21A 1MXWA 2DE4A 1N7WA 4KYEA 4H6DA 3MZ1A 5TU0A 2XXHA 5F7VA 2F6GA 2DXRA 4LUBA 3C32A 3Q28A 1OMPA 3K02A 1B5HA 1DPEA 1B3HA 3H6VA 3OSQA 3SEYA 3GZGA 2AYSA 5A5XA 4Q5TA 4NTLA 1HSJA 1MDP1 1MXXA 4PE5B 4RPNA 1FQCA 1B3GA 4H67A 3MJNA 1O63A 2RC9A 2QS4A 5TPAB 5AA3A 1SVXB 4F29A 4ZEKA 4JWOA 4LA9A 1AOVA 4ZZEA 1B7HA 2Z8FA 3IB1A 4NWDA 5H8NA 1MDQA 4H5FA 5L9MA 3KG2A 1FTLA 2OWSA 3B6TA 2A5TA 4NF5B 2BJJX 1IIWA 3V5AA 2XXQA 1NL5A 4G8HA 4PQJA 1Q1KA 3GBAA 3HHFA 3QIMA 4NF8A 3TKDA 3HCQA 1NNFA 3IO4A 2RKMA 2XXTA 2DE3A 3H6TA 3SERA 1H43A 3A3UA 2GRVA 1O7TA 4PFWA 4FJPA 5JTYB 1EZPA 2FYIA 3FVGA 3JZJA 3MVZA 4F2OA 4ND9A 2DVZA 3T9UA 4OFOA 1CE2A 2O1LA 2Z22A 4LZ5A 3HO7A 4RYAA 1SW5A 1US4A 2NUVA 1IXGA 1R9LA 3V89B 5ICQA 1OVBA 4ELOA 3FJGA 1LGBC 2X7QA 5CMKA 1AIVA 2Y7WA 4C1UA 2I0CA 1XS5A 2QRYA 2G93A 3N26A 1GTKA 5L9SA 5KCJB 2Z8EA 3K01A 1B46A 3UGWA 4KHZE 1BIYA 5B7DA 5I59A 3DP8A 3QAXA 2HEUA 4IO7A 3D4CA 1POTA 3PUVE 5I56A 1FW0A 1MXUA 2PX1A 1LB8A 2I3WA 4GLIA 4YB7A 3O9PA 3O6IA 4NEDA 3TEPA 3MC2A 1IZ1A 2REJA 4ELQA 1R1NA 1I69A 2V3UA 3G3KA 1P99A 3S2VA 1Y3PA 4RXLA 1J1NA 4U4SA 4X48A 4X1DA 3LUYA 3B7DA 1JW4A 4F3BA 3QYTA 4KCDA 5EHSA 4OTEA 4DCXA 3OOAA 1N3WA 3G7WA 3ZSFA 2Y7PA 3LSXA 2UVHA 4H1XA 3HN0A 5ITPA 1D9YA 3OO6A 2ANJA 3IO6A 2F8DA 3IB2A 3CG1A 4PFUA 5DT6A 1GR2A 3Q25A 2DOJA 3H3GA 3SEXA 4WXJA 1LLSA 1IEJA 3H6WA 2ZYMA 3O66A 3PUWE 4HTGA 2GHBA 4YICA 3TTRA 4ELRA 4G4PA 3WAEA 4BDMA 4YKIA 3VDFA 3IL1B 3H6UA 2PT1A 4KFQA 2CMOA 2P0SA 4NWCA 3KOSA 3KOTA 2XXRA 5CRYA 1LFHA 3PPRA 5DTBA 1AH5A 4QFOA 4NE4A 2DP8A 1IITA 3MUQA 3MBPA 1POY1 3SETA 4ZECA 1SW2A 1QW0A 3K6UA 1QUIA 3JV9A 4UACA 4XIGQ 1MQHA 2QS1A 3O28A 3MVYA 3TAJA 1VSOA 1SW4A 2UVGA 5I2NB 1A99A 3K6XA 4DXCA 4EUOA 5IKBA 1QKAA 1XHYA 4LATA 1Y4TA 2OLBA 4R73A 3T66A 2DE2A 2AL4A 2X26A 2HAUA 5K2XA 3IOWA 3KN3A 5I58B 1MY1A 4FORA 3U94A 2ZYOA 3KSJA 1OQGA 3RUMA 3M3LA 2ONKE 5H8HB 3CRBA 4H0WA 1UTHB 4BDRA 3KBRA 4N6PA 1ZKBA 2B3FA 2ESNA 3S4UA 1QULA 1MPDA 4OEVA 4L17A 3JYRA 4KQPA 3W9VA 3SEVA 4HCYA 1B4ZA 3TUSA 2DWHA 2NVUB 4IO4A 2I6EA 3PPNA 4QSCA 4YU0A 3Q29A 3CFLA 3VXCA 3OD7A 4X9TA 1N7XA 3ECRA 1A54A 1M5CA 3FVKA 3TPAA 3IR1A 3A3CA 4LZ8A 2GH9A 4GXAA 3RPWA 1QUJA 4F3GA 1YPNA 2ZYKA 1F9BA 1PC3A 4O3AA 2XXVA 3MP8A 3U1OA 4QFPA 5DYHA 1LFGA 4LQ5A 3QUFA 3U8QA 4PP0A 4M1VA 4YB5A 3PD9A 1LSTA 5I57A 1B0HA 5AE4A 4IGTA 3O97A 1OIBA 3MAMA 4P0GA 4OEUA 1BP5A 5FHOA 4F2QA 1SDXA 1GVCA 5CBSA 4DE8A 1UIUA 1GV8A 1ATGA 4YZZA 5EHMA 4EXKA 3VFJA 3FGSA 2FNCA 2D21A 5TP9A 5AA1A 1S50A 5I2KB 3DELB 1LBBA 3QSLA 1B7ZA 3IB0A 4XKRA 5ITOA 1MY2A 4GWOA 1N04A 4ZEFA 3OENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IO2A 2FVZA 3R26A 1FPEA 3MQ9A 3DP6A 1ZBMA 4QFLA 1BKAA 3B8BA 4GBWA 4GQOA 4OMBA 2V84A 4MCOA 5AA2A 1CB6A 3MZ9A 4THIA 3MSTA 1XT8A 3ZS6A 3B6WA 2RCAA 3N94A 1D3KA 1FBDA 3THIA 3T96B 2CZKA 2OJTA 3IJXB 4QXDA 1XVYA 2QS3A 1ANFA 3OEKA 3MVXA 1SD3A 1LCFA 4FE8A 3R6UA 1B51A 2WBDA 1XI6A 1IMAA 1IMEA 2PFYA 3ZKKA 2O51A 4TLLB 2ABHA 4NF6B 2DWAA 1TT1A 4LVQA 4JWYA 4QHQA 2IA4A 2XX8A 2OK2A 1XC1A 1B2HA 2F35A 1P1UA 2NXOA 4GVOA 1N0TA 3K1NA 4DXBA 4ESXA 1JNFA 4F3PA 3TQWA 4OANA 3DM0A 1NV4A 1USYH 4GWYA 4RK2A 4F22A 1FPLA 1JETA 4AS5A 3TMGA 4P9KA 4XKQA 2ZXTA 3VVFA 3PPQA 4WKMA 2PVUA 3MYUA 4M4GA 1SW1A 2O1MA 4Z0IA 4R6HA 2H99A 3TTKA 1SI0A 2XWOA 5H8NB 4JDFA 3UN6A 4PAFA 2F5XA 1Y9UA 3C34A 3H4ZA 3TCFA 2Q8JA 1QUKA 2RF1A 2VOZA 4F1VA 5HPQA 5CI5A 1D4NA 4P1EA 4N13A 4GL8A 1TXFA 2QVRA 3U92A 1VFEA 1IXHA 3C31A 4YB6A 1MQIA 1KA1A 1US5A 4NF8B 2B4LA 2O84X 1XOCA 2OWZA 2Q2CA 3PPPA 4QF9A 4O7IA 4EQ7A 4NF5A 4H65A 4MH5A 2V3TA 3PUZE 4NF4B 3LR1A 3PPOA 3LSLA 3FV1A 3EF7A 2QVVA 3HPIA 5AA2D 2NWJA 3OXNA 4PC9A 2ONRA 1FQAA 2I49A 2ONSA 3LSFB 1H44A 1P1WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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