4EQ9A

1.4 angstrom crystal structure of abc transporter glutathione-binding protein gsht from streptococcus pneumoniae strain canada mdr_19a in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
KKEIIVATNGSPRPFIYEENGELTGYEIEVVRAIFKDSDKYDVKFEKTEWSGVFAGLDADRYNMAVNNLSYTKERAEKYLYAAPIAQNPNVLVVKKDDSSIKSLDDIGGKSTEVVQATTSAKQLEAYNAEHTDNPTILNYTKADFQQIMVRLSDGQFDYKIFDKIGVETVIKNQGLDNLKVIELPSDQQPYVYPLLAQGQDELKSFVDKRIKELYKDGTLEKLSKQFFGDTYLPAEADIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title 1.4 Angstrom Crystal Structure of Putative ABC Transporter Substrate-Binding Protein from Streptococcus pneumoniae strain Canada MDR_19A in Complex with Glutathione.
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords ABC transporter substrate-binding protein-amino acid transpo
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A02
3DELB 5BWJA 4RXLA 4HCYA 4LZ5A 3KEIA 1ZKBA 1M5BA 3U72A 3N5LA 4RNSA 1B52A 2QPQA 3O6GA 3QYTA 4QFKA 2QS1A 1TXFA 1NNFA 5I59B 4ZEDA 4OERA 4ND9A 4X1BA 4DZ1A 4AB6A 4F2OA 4O3BA 1MQGA 1US5A 4XXUA 5H8HA 3C33A 3O97A 1B40A 3KN7A 3PD8A 3MZ9A 2V3TA 2G93A 3VVDA 3VXCA 2F6GA 5EHSA 1ELJA 3MVXA 1YCJA 3SEWA 1B2HA 3MQ9A 1SYIA 1NH8A 1ZU0A 1MXVA 5TPAA 4ONYA 2DE4A 4PQJA 3F11A 4KI0E 2FNCA 3SEVA 4IGRA 1MPBA 1HSEA 3N94A 2UVIA 3LC8A 4F2QA 1R1NA 1VR5A 1Y3NA 2Q8JA 1FQCA 3TCHA 4THIA 5H8FB 2DVZA 2DXYA 2F7CA 2IA4A 4G8MA 3U94A 5CMBA 3EQ1A 3T93B 5H8SA 3KSXA 3G3IA 4XTCQ 4E0WA 3IOWA 3C4MA 3FJMA 3GZGA 1PB9A 3IOTA 1GV8A 1P1OA 3TZAA 2DE3A 3V8XB 1NL5A 4DXCA 1IXCA 3KZGA 2Q9TA 4YICA 5DT6A 3C35A 1MDP1 2A5TB 4ISUA 1H45A 3CR9A 2I3VA 2QMWA 3QUJA 3B6TA 2G29A 1I69A 2CMOA 1MM6A 3FVGA 1AH5A 4R9GA 4P0GA 4GQOA 4R72A 1MY3A 2GFEA 4ZS9A 4GLIA 2IEEA 5FHOA 4NF5A 1ZBMA 4YU0A 1OIBA 2F7BA 4ELRA 4LVQA 1JEVA 4H5FA 1PEBA 3T66A 3E3KA 1QVSA 3FD3A 3B6QA 1GR2A 4NF4A 4YB5A 4OQOA 1B4HA 5FHMA 5KZTA 4QF9A 4G4PA 1BIYA 2XXWA 5I2NA 3TKDA 4H5GA 5ELVA 3OENA 1D3KA 4Q5TA 2R71A 4ZE9A 4QFPA 1B7HA 3T96B 2E0SA 2OJTA 4HW8A 3FV1A 1KWHA 3H6WA 3M3FA 4YB6A 1LFIA 1MXZA 4KQPA 3OO8A 4R73A 1XC1A 4OTEA 3W15C 2ZNSA 2QMXA 1YAEA 4GFRA 2V84A 3KGCA 4OVJA 3QUFA 1HSJA 3DM0A 3MP8A 3O2AA 1DTZA 3K6WA 3TELA 3EHUA 2P0SA 4F3GA 2D21A 5H8NA 1US4A 1FTJA 1ZIUA 1S9TA 4LUBA 4H67A 1FQDA 4P0IA 3ZSFA 2O7UA 1SQYA 3TPAA 3C9HA 5AA4A 1JVXA 4OHNA 1MS7A 2UYEA 3N6UA 3R26A 5L9MA 3SEUA 3D4CA 4DDDA 4FAJA 1NNPA 1MQIA 4YKJA 3VLWA 3I5OA 1XS5A 4Z7EA 1MXYA 3EPEA 1YTVA 4F18A 4QRZA 2P2AA 3K02A 4YB7A 3Q25A 3VV5A 4QFLA 4DXBA 4I62A 2DWAA 1SW4A 3SERA 3K0VA 1FQFA 1PB8A 4EQ9A 1QULA 2Q88A 4XKRA 1A8FA 4ZECA 4OWDA 4PE5B 4ESXA 3MC2A 5M2VA 4R2BA 4XKPA 1NMUA 2H9BA 4YMBA 3OD7A 3OO6A 4OENA 1URGA 4NWCA 3Q26A 2ABHA 2PT1A 2ZYNA 2D5WA 3EHTA 2B65A 3H06B 4NF8B 4HCWA 3SESA 1A55A 5I56A 1EU8A 2XXPA 1N7WA 1R9LA 5FHNA 2O1LA 1O63A 1B58A 1Y20A 3BBRA 4X48A 1A7LA 4QSEA 2XHDA 3LSXA 4WKMA 3SDFA 4FEDA 3VE1B 1FTLA 4OMBA 5AE4A 4EUOA 3IO4A 1BKAA 1I6AA 4YKPA 3LSWA 4Q8RA 1OLAA 1LCFA 1ZTYA 2F78A 1B3EA 5DYHA 3D4GA 3FV2A 3HCQA 1WODA 3G3KA 3KN3A 3RT6B 4FATA 1BP5A 4EXLA 1MY1A 5AA3A 2Z8DA 1FQEA 2V3UA 3PD9A 4Q30B 4JBZA 3FIRA 4U23A 4NTLA 3KJTA 1MXUA 3FJ7A 3L6HA 3TUSA 5EYFA 4WEDA 3O6IA 2QSXA 3V83A 3Q29A 1OVBA 4F19A 2DYXA 2AIXA 3BKIB 5CBSA 4X1DA 1FTMA 2I4BA 4NF6B 3Q27A 5ITOA 4DLDA 4H65A 4ELOA 1Q35A 1B05A 1EH3A 2O51A 2H98A 5I58B 1XT8A 3H6TA 3PMWA 2O6AA 3VXBA 4BDNA 3QK6A 1MY2A 3CRBA 3H4ZA 2RC9A 4DIGA 2Q89A 1BTJA 3B7DA 2O68A 1MH3A 3DP4A 3TODA 1PDAA 3B6WA 3C31A 1SW5A 4N6PA 5DTBA 4FEBA 4EQBA 2I49A 4OEUA 3OSQA 1SD3A 1QUJA 5CMKA 3S2VA 4OXVA 3K00A 1DPPA 3DLNA 2LAOA 4G8HA 4IO7A 5TP9B 3CG3A 1B4ZA 1VSOA 2NUVA 2GHBA 3MP1A 4K3FA 4ZDMA 1B1HA 1UTBA 1UTHA 3T9HB 2CZLA 1Z7ME 5AA2D 1S7YA 4RK2A 1MY0A 1QUKA 4HTGA 2DWHA 3T9XB 2XXUA 3THIA 1P1QA 3MWBA 1IQ7A 2F36A 4KYDA 2ONSA 4YKKA 2DE2A 1B1XA 1P99A 3EN3A 4NEDA 5FTIA 4LP2B 1H44A 1A40A 5LOMA 1POY1 3SKPA 5I59A 1NKXA 2HQ0A 4PFTA 3RLFE 3W9WA 1Y3QA 3VDFA 4TOZA 5AA2B 5DVFA 5F7VA 4U1OA 3FXRA 3TTKA 4TLMB 5FTHA 1B9JA 1B0LA 3OO7A 4YKIA 1O7TA 2AL4A 2V3QA 2AL5A 1L5TA 1VFEA 4O3CA 2YJPA 2R6GE 4ZEBA 2VD2A 5DEXB 5H8QA 5KDTB 4GWOA 3UK4A 2THIA 4H0WA 4KYEA 3GXAA 2Y7KA 1MG1A 1LB8A 2PX1A 4IB2A 4IY6A 1LLSA 3VVFA 5TU0A 1RYOA 2DXRA 4I9DA 5H8FA 1PC3A 4JWOA 2GRVA 2A5SA 3R7XA 1H76A 1H43A 2OZZA 2ESNA 1PB7A 3JYRA 1A8EA 1TFAA 4R6YA 3HO7A 5A5XB 2V25A 2X26A 3K1PA 4GOTA 2I3WA 1MXWA 2F7AA 1DPEA 1POTA 2QL3A 4RPOA 5JTYB 3O9PA 1MPDA 4G68B 1LB9A 4ZEIA 4OFJA 3IOVA 3A3CA 1JVYA 2GHAA 1IZ1A 4IY5A 3KOSA 2OBGA 1P1UA 3SETA 5I2NB 2HEUA 3UIFA 5ITPA 3HN0A 1B7ZA 2WKYA 4FECA 1DSNA 1JW5A 1Q1KA 1SI0A 4QFOA 4G68C 1CE2A 1T0KA 2QS2A 1LBCA 2O84X 4OESA 4MLVA 4KD5A 5L8DA 3QSLA 4KHZE 4X9TA 1XOCA 3E4RA 4F1UA 1OMPA 5HM4B 4NMYA 2B3BA 2YPNA 3LSLA 1SBPA 2Z22A 2UYFA 5ISUA 3DP6A 3PUZE 4GVOA 2F97A 3TFLA 4POXA 4RY1A 5K2XA 1M5EA 1ANFA 4JXIA 4DCYA 1O64A 1Y4TA 3TDJA 3S9EA 3QAXA 1URDA 3PPNA 2XX7A 3OSRA 1OVTA 1NFTA 3FASA 1N3WA 3TAJA 3H7MA 4JDFA 3HPIA 4QHQA 3ONMA 2XXHA 2B3FA 2GH9A 1D9VA 1NNTA 4POWA 1B46A 3KBRA 3RN8A 4BDMA 2I4CA 2OWTA 2UVJA 1Y3PA 3CFLA 1IXIA 1LGBC 2I0CA 2AYSA 4TLLB 5I57A 1QUIA 4I8CA 4U21A 3KJ7A 2P1SA 4KCCA 1F9BA 2PT2A 1FW0A 2PMSA 3HHFA 3FUZA 4EF1A 2YLNA 3SEYA 1DMBA 4RA1A 1I6QA 1BLFA 1FQAA 1JETA 1OQHA 1SDXA 4DE8A 2NVUB 4F39A 1MQJA 4C1UA 1EZOA 3IL1B 4F29A 3BFUA 3HV1A 1AIVA 1M5CA 2NOOA 1MXXA 1XHYA 2OWSA 3TCGA 4ESWA 1B5IA 1CB6A 2D3IA 3TQLA 3PV0E 3QXMA 3LSFB 1NH7A 2QRYA 2NWJA 3LBSA 3R6UA 2VP1A 5IAIA 5HBCA 2I0BA 1Y4CA 1MM7A 2Z8FA 3E13X 4U22A 2I6EA 2Y84A 3EF7A 1QW0A 3IOUA 1SW1A 2V93A 3G3FA 1IIWA 2VOZA 2X7QA 4OETA 2DQVA 4BLAA 4GL8A 3RY3A 1IITA 2RKMA 3H03A 1QKAA 5KCJB 4OFOA 3QIMA 5CBRA 4Q0CA 3TTNA 1RKMA 5ICTA 4RJZA 3A3UA 4JSDA 3CSBA 1JW1A 3V89B 4EQ7A 2XD2A 4GF8A 1B5JA 5CI5A 2I58A 4L17A 2UVHA 1QKBA 3JV9A 1MY4A 1SVXB 3GBAA 3H3GA 1B51A 2ONRA 3HHGA 3MPLA 3U92A 2XXXA 2HZKA 1YPNA 1LSTA 3PGFA 3IJOB 4F1YA 2DSFA 2HZLA 1I6BA 4IGTA 2XXRA 4F3PA 1NNKA 1Y1ZA 1LCTA 2RCBA 3MJNA 1UIVA 2RC8A 4LA9A 4QSCA 4Z0IA 2Y7WA 1MRPA 3O66A 2F35A 1XVXA 4G8NA 5I2KB 2QS4A 4M4GA 3UGWA 2FA7A 4XKNA 4PFUA 4BDQA 5L9SA 4GRKA 4DXUA 1LAGE 4H8JA 4P11A 2ALUA 3TQWA 4ZEKA 4QFNA 2Z23A 1AOVA 4IO2A 2XXTA 3C36A 4OZ9A 5I84A 2BJJX 2HAUA 5CMCA 4EXKA 4R6KA 3IR1A 1B32A 5K2YA 5DVIA 1USYH 4NF6A 4GXSB 4JB7A 2HCAA 4BDOA 1LFGA 3IAZA 3O29A 4EDPA 5H8HB 3FGSA 5I58A 3SEXA 5B7DA 5HPQA 3VVEA 4WEPA 4ZEFA 2ZYMA 2W7YA 3V5AA 1VFDA 3MP6A 2H5YA 3H6VA 1MH4A 4ELPA 1IXHA 1FCKA 4NWDA 2REJA 4R2FA 5TPAB 1MPCA 3K1MA 2R9JA 2E1SA 4IO6A 4BDRA 3PUYE 3PU5A 4MFIA 3FATA 1LFHA 3M8UA 5TP9A 4C1TA 1FQBA 4UA8A 2O69A 2XXQA 3IB1A 3G3JA 3RNNA 1XVYA 4AB5A 4R6HA 3O28A 5F1QA 4MH5A 4IO3A 4KFQA 3K01A 4LATA 1Y1MA 1RYXA 4MF3A 1VE4A 4WXJA 3FXUA 3IORA 3MUQA 5H8QB 1J1NA 4PFYA 2ZNTA 2XXVA 2DWIA 4AQ4A 3PUXE 3W9VA 3IO6A 3FZVA 4M1VA 4F22A 4UACA 4JSOA 3IX1A 3ILTB 1EZ9A 4U2RA 5EHMA 3FJGA 3VLVA 4R74A 2ZMBA 4U4SA 5J1DA 5AA2A 1GVCA 3RUMA 4FIMA 3MZBA 3UP9A 3RTWB 3K6UA 3S9NC 2DOJA 3IB0A 1ZLQA 1LAFE 3K6XA 3I3VA 5AA1A 1ATGA 3CVGA 3KOTA 5DEXA 3IB2A 5KDTA 4NF5B 4LZ7A 3U1OA 2ZYKA 2VD3A 1R9QA 2VHAA 4F31B 1B3FA 3M3LA 3MVWA 3G3GA 3CIJA 2I48A 2ONKE 3PPPA 3G3HA 4N07A 3RQTA 2ZNUA 4ELQA 3FVNA 4G2ZA 4NF4B 1EZPA 4C0RA 2ANJA 4IO5A 2A5TA 2Q2AA 2RF1A 2RINA 2H99A 5A5XA 2X7PA 3GBBA 4H8IA 1SI1A 2OK2A 2OCUA 3OXNA 1DOTA 1OQGA 1FTKA 3RPWA 3VLUA 3S9MC 4TQUQ 4MLQA 2F5XA 1B3HA 3E9XA 1N04A 1D4NA 1B3GA 4E0XA 5JTYA 4G68A 4QSDA 2ZXTA 3RGYA 2HAVA 3S9LC 1M5FA 2XXYA 3WAFA 2REGA 2RCAA 2OLBA 1N76A 2PYYA 4OFLA 2M8CA 3OELA 3DP8A 4F3BA 4F3SA 2DVCA 4FORA 3S4UA 5H8NB 1N3XA 4HS7A 4LQ2A 4I1DA 2HFBA 4BDLA 4LZ8A 4XIGQ 5AA4B 1B3LA 2VGQA 3I6VA 3TTMA 3MVZA 3OMBA 1TWYA 1B6HA 2DP8A 1N84A 4EF2A 4GD5A 4JWXA 4G77A 1R6ZA 4H1XA 5I57B 3HSTA 1USYE 3MW0A 3TMGA 4OEVA 1JQFA 2UXAA 1MDQA 4KYSA 1HSLA 3OEKA 3PMXA 3PPOA 1B5HA 4F1VA 3MPKA 1A99A 2XX9A 1PBPA 3PPRA 4ZZEA 5CRYA 3KG2A 1JEUA 2Y7RA 4GIZA 4RYAA 1N7XA 2O7IA 4R9FA 2ZYOA 1GGGA 1JNFA 3TTLA 1TT1A 3K4UA 4PETA 2H25A 2O1MA 4GL0A 3Q28A 1B7UA 3UN6A 4LONB 3RT8A 2Y7PA 5I56B 3K6VA 3PUVE 5JK4A 1WDNA 3MAMA 3CSGA 3O6HA 4IO4A 3T22A 1II5A 3K1NA 2F34A 3U8QA 1UQWA 2QS3A 3WAEA 1MQDA 1FTOA 4ECFA 3TCFA 3OOAA 1B0HA 3CFXA 1LBBA 1PBQA 1IEJA 4O3AA 1SW2A 4YZZA 3M3KA 5ICQA 3CI8A 3BFTA 3ILUB 3FVOA 3LR1A 3C34A 3OO9A 1ZMGA 3A09A 4FE8A 3UORA 1A54A 2RC7A 2DS9A 3VFJA 3L6GA 1GTKA 4NE4A 2KLFA 1LAHE 3TEPA 2FYIA 3ZKKA 3USDA 4LQ5A 3FVKA 4PFWA 4ZZAA 4U1ZA 3TTRA 4NF8A 3MVYA 3ODBA 5CC2A 3TYHA 4FJPA 4KCDA 3UA8A 3GLBA 4KR5A 4RK9A 3N6TA 4XKQA 4RPNA 3JZJA 1JW4A 3PMVA 1UIUA 5BUUA 2UVGA 3CFZA 2QJEA 5B70A 3FXQA 3ZKLA 1ZJLA 3U93A 3KFMA 3KSJA 2F6PA 3EHSA 3H6UA 5KCJA 1N0TA 3PUWE 5IKBA 3RTFB 3G7WA 1D9YA 4MBPA 1WVJA 3IK6B 5CMMA 1H3DA 1TFDA 1MQHA 2F8DA 3CG1A 2Z8EA 4PP0A 4ZE8A 1Z7NE 2XX8A 5L9OA 2DWJA 4DCXA 1S50A 1LAXA 4KPTA 4JWYA 1P1WA 3MBPA 3ECRA 1AL3A 1DTGA 1AMFA 3ZS6A 4N13A 3K2DA 5CM6A 2Y7IA 1P1NA 4YAHX 3PPQA 4U4XA 1Y9UA 4OYVA 4GXAA 3MZ1A 1IUDA 3LUYA 1SYHA 1OLCA 2HXWA 2XXIA 2NXOA 2H4IA 2PBWA 1M5DA 3C32A 3T9UA 5DVJA 5JEIA 1IXGA 4YMAA 1UTBB 4H6DA 1UTHB 5I2KA 1QJMA 3IJXB 3P7IA 3AXFA 3T9VA 3N26A 2XD3A 4R75A 2PVUA 2Q2CA 1URSA 3OEMA 3KN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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