4EQ9A

1.4 angstrom crystal structure of abc transporter glutathione-binding protein gsht from streptococcus pneumoniae strain canada mdr_19a in complex with glutathione
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
KKEIIVATNGSPRPFIYEENGELTGYEIEVVRAIFKDSDKYDVKFEKTEWSGVFAGLDADRYNMAVNNLSYTKERAEKYLYAAPIAQNPNVLVVKKDDSSIKSLDDIGGKSTEVVQATTSAKQLEAYNAEHTDNPTILNYTKADFQQIMVRLSDGQFDYKIFDKIGVETVIKNQGLDNLKVIELPSDQQPYVYPLLAQGQDELKSFVDKRIKELYKDGTLEKLSKQFFGDTYLPAEADIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords ABC transporter substrate-binding protein-amino acid transpo
publication title 1.4 Angstrom Crystal Structure of Putative ABC Transporter Substrate-Binding Protein from Streptococcus pneumoniae strain Canada MDR_19A in Complex with Glutathione.
rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eq9A02
1QVSA 3FXQA 2XX9A 1WODA 2I58A 3CG3A 1PB7A 3OENA 4LUBA 3MP6A 5EYFA 4EDPA 1XVYA 4BDLA 4G2ZA 5FHOA 2VGQA 3EPEA 2D21A 1RYOA 3ZKKA 3SETA 4F31B 5TPAB 3F11A 2AIXA 3TCHA 2OWTA 4RPOA 3KEIA 1PB8A 1B1XA 4EXLA 4P0GA 1HSJA 1LBBA 1VR5A 2VD3A 2ZNUA 4WKMA 1EZPA 3PPPA 1LLSA 2XXRA 1SYIA 1QUIA 4E0XA 1MM7A 2ZNTA 4F1YA 4QSDA 1GV8A 2THIA 4NF5A 3G3JA 3H7MA 3IJOB 3EHTA 4N07A 1Y3NA 3KN7A 4YKJA 1ZJLA 3OO6A 2HAUA 5CBSA 2V3TA 1NL5A 4LP2B 3U92A 3D4CA 1SD3A 3IOWA 4H65A 3KJTA 2DS9A 1VFDA 1P99A 3DP8A 3G7WA 4PP0A 1N04A 3M3FA 1B3LA 3WAFA 1EU8A 3N6TA 2F35A 2OK2A 3CSGA 4NE4A 1LB8A 2RC8A 3VVDA 4F1VA 3R26A 2QL3A 2GFEA 3QK6A 4U4SA 1PEBA 4C1UA 2ONRA 5I2NB 3K2DA 1A99A 1UQWA 4NF5B 4GLIA 3TDJA 4XTCQ 2HEUA 2I6EA 3Q26A 4Q0CA 3HV1A 1BLFA 1ANFA 3S4UA 3RN8A 2FNCA 1MY4A 1Z7NE 4H8IA 3QIMA 1Y1ZA 4U4XA 1S50A 4N6PA 2Z23A 3K6VA 3C4MA 1QW0A 2OBGA 1B52A 3TTNA 3T9HB 3S9LC 3HSTA 1HSLA 3THIA 2IA4A 3SESA 4RK9A 4ZE8A 4F2OA 4EUOA 3K1NA 1MQGA 4FIMA 5H8HA 3O6IA 3UN6A 4NWDA 4RA1A 4QSEA 1TT1A 4PE5B 4UACA 1R9LA 4RXLA 2HXWA 4H5GA 3PUXE 4H1XA 1NNFA 2F6PA 1LBCA 3GLBA 3KOTA 1N7XA 2NWJA 3VLUA 4NTLA 1FQCA 2D5WA 3PV0E 4ZEBA 2I3VA 3M8UA 4R2BA 1UTBA 2ZXTA 2QS4A 4I62A 2Y7RA 2OLBA 5KCJA 1B1HA 4TQUQ 5KZTA 1HSEA 1B46A 4THIA 3LSXA 3CG1A 1ZTYA 5H8HB 4DIGA 3MWBA 5A5XB 3MAMA 1O7TA 3EN3A 3OEKA 5H8FA 4XKQA 3PUVE 3N94A 1MY3A 1GGGA 4ONYA 4ESXA 1XT8A 4GRKA 3FXRA 5FTHA 3H6TA 4R2FA 3KGCA 3S9NC 1US5A 4YKKA 3TMGA 4XXUA 2QSXA 1MXYA 2NUVA 2QJEA 2F78A 1UTBB 3OO9A 3LR1A 4QF9A 3QAXA 4M1VA 5KCJB 2PT1A 4C1TA 1Y20A 4LZ5A 4OXVA 1Q1KA 4OTEA 2V3UA 3G3GA 1IXIA 5H8FB 2G93A 1MXUA 3TQWA 4ESWA 4IY5A 5FTIA 3TTKA 4BDMA 2HQ0A 3Q25A 5CMCA 3MC2A 3U93A 2G29A 3H4ZA 1PBPA 1PBQA 5L9MA 1B7HA 2F97A 2O84X 4L17A 1ZKBA 2X7QA 3C33A 1A8FA 1FQBA 1MH4A 2R9JA 3VDFA 1A8EA 4YICA 1B51A 3RUMA 5DT6A 2Z22A 4YU0A 2OCUA 1P1NA 5I56A 3PD8A 1M5FA 3QYTA 3T66A 1UIUA 2I4BA 3FGSA 1MG1A 4YKPA 3RT8A 3U8QA 5AA3A 1O64A 1Y1MA 3K1MA 1FQAA 4JWXA 4OYVA 2V3QA 1B4HA 1ZBMA 1B0LA 3RLFE 1P1UA 3DLNA 3MZ1A 1I6QA 4QHQA 5IKBA 2Q8JA 1H44A 3KSJA 2Y7PA 4PFUA 1BIYA 2CMOA 3W15C 4POWA 3WAEA 5I58A 5I56B 4ZZEA 5CC2A 5CRYA 1M5CA 2DOJA 3JZJA 1BP5A 4F3PA 1GVCA 4OETA 3CSBA 1Y3QA 1MQDA 1QULA 2V93A 3MW0A 3SEUA 4QFOA 1XOCA 3FXUA 4KI0E 2HFBA 1YCJA 1H43A 3HN0A 1FQEA 2O1MA 2HZLA 1B3GA 3TTRA 2XXPA 3OO8A 5CMBA 1MS7A 2HAVA 3V83A 2PVUA 1JVXA 3FJMA 2I3WA 3TCGA 2O7UA 4LQ2A 4X48A 3VVFA 1SW4A 5I58B 4KR5A 4F3SA 1TFDA 2QS2A 1QKBA 3CFXA 4BDOA 1FTMA 3AXFA 2B65A 2XXYA 3W9WA 3MJNA 1B5IA 1I6BA 3BFUA 4QRZA 1P1WA 1N3XA 2I4CA 1IQ7A 1B7UA 1B5JA 4G68A 3KN8A 1GTKA 2DE2A 3I3VA 1TFAA 1OIBA 5DVIA 1Z7ME 2DXYA 2QMWA 2YLNA 5LOMA 5F1QA 1M5DA 4P0IA 3E13X 3LC8A 4GL0A 4P11A 2ESNA 3VLWA 1ELJA 3QSLA 4JBZA 4H5FA 2F7BA 3LSFB 2H99A 4WXJA 2AL4A 4JWYA 4H8JA 1MXXA 3K01A 3B7DA 2QRYA 3B6WA 4GD5A 1XC1A 3O6HA 4NF6A 2F34A 1RKMA 2DWAA 1KWHA 1LFGA 5F7VA 5I2NA 4IGTA 2Z8EA 3MVWA 3PPOA 4G4PA 3RNNA 4MLQA 4YB7A 4IO2A 3H03A 4G68B 2VP1A 1JQFA 5DVJA 1A54A 3FIRA 3O9PA 5FHNA 4Z7EA 1MY2A 1PC3A 1JVYA 4OFJA 2UVGA 5I59A 3U94A 1DPPA 4KCCA 3ILTB 1US4A 1M5EA 1NNPA 3R6UA 4IO6A 2A5SA 1M5BA 3H6VA 1AMFA 3DP4A 1BKAA 2OWSA 3FZVA 5HPQA 1SBPA 3TPAA 2DQVA 4OFOA 2Q2AA 4X1DA 3FATA 2Z8DA 1JW5A 3FVGA 4GQOA 2RC7A 4ZECA 2BJJX 4NF6B 2WKYA 3O28A 4FAJA 1RYXA 1P1QA 4BDQA 3FASA 1DTGA 2F6GA 2AL5A 4I8CA 2F5XA 4F18A 5I59B 4F1UA 1UTHA 3N5LA 3RQTA 3IL1B 3G3HA 4KYDA 1OVTA 2XX8A 3TEPA 1JW1A 4Q8RA 5CMMA 3CR9A 3IOTA 3U72A 4GF8A 4OENA 3TKDA 1EZ9A 2XX7A 2RC9A 3TODA 1S7YA 5EHSA 4R73A 2H25A 2ZNSA 2P2AA 1OVBA 3BKIB 4YAHX 2X7PA 3TZAA 3IJXB 1B3EA 3LUYA 2NXOA 1LCFA 5A5XA 2KLFA 3TQLA 1D3KA 3N6UA 1IXHA 1UTHB 4HW8A 1POTA 3I6VA 1SVXB 1SDXA 3Q27A 4DDDA 1ZIUA 2W7YA 2O6AA 3PGFA 3IO4A 3PMXA 2P1SA 3TCFA 2ZMBA 2VOZA 3B6TA 2O1LA 1J1NA 4UA8A 3H3GA 3O29A 4LZ8A 1T0KA 1MH3A 5KDTA 3KJ7A 2GRVA 3OSQA 1MQIA 3MPKA 3MQ9A 1B7ZA 4I9DA 5H8NA 1I6AA 2FYIA 4OESA 1D4NA 5B70A 4GIZA 2ONKE 3PUWE 3CI8A 2XXTA 5DVFA 1ZLQA 4EXKA 5J1DA 4R9FA 3LSLA 3VVEA 1AIVA 4G8NA 2RKMA 4RYAA 4XKNA 3OSRA 3JV9A 3HO7A 1N7WA 3O6GA 2QS3A 4PQJA 4G8MA 3MP1A 3LSWA 1UIVA 3CRBA 3RTWB 3K1PA 3PPQA 3PMVA 4KFQA 2B3FA 5KDTB 3EHSA 2A5TA 2ALUA 3QUJA 4LQ5A 3H6UA 2F8DA 4U2RA 1IZ1A 5H8NB 2UVJA 4NMYA 1QUJA 4WEDA 2DYXA 4JSDA 3S2VA 4MLVA 1I69A 2HCAA 4ZEFA 1Y9UA 4BLAA 5FHMA 1B3HA 3OO7A 5DEXA 1CE2A 3Q28A 3K6UA 2DVCA 5K2XA 4LONB 4EQBA 1GR2A 2A5TB 1MM6A 3ODBA 2XXUA 3D4GA 5L9SA 3HCQA 4KPTA 5AA2A 1MY0A 3KZGA 4R9GA 4HS7A 1JEVA 3VXCA 1OQHA 4IO7A 1H3DA 1B4ZA 5H8SA 1MXVA 4ELQA 3FVOA 1LCTA 3IOUA 2Q88A 3HHGA 2HZKA 3FVNA 3OMBA 4EF2A 2P0SA 2FA7A 4GFRA 3UP9A 5DEXB 1B40A 4AB5A 4DLDA 5HBCA 3MZ9A 2PBWA 4PFWA 1IIWA 1URSA 5JEIA 1URGA 1FTLA 3LBSA 1DSNA 1D9YA 1LAXA 1LSTA 1MDP1 2XXXA 4BDNA 1B6HA 2LAOA 5CM6A 4F39A 4FJPA 3IO6A 2I0CA 5AA2B 1B0HA 4R72A 3TYHA 3PUYE 1VFEA 2O68A 4LATA 2R6GE 3QUFA 3DP6A 4FATA 2QS1A 1OLAA 1N0TA 4FE8A 3RY3A 3E9XA 2O7IA 2OJTA 4GWOA 3U1OA 4H0WA 2ZYMA 5CBRA 3PPNA 1NNKA 3T9VA 1AH5A 1MXZA 1B05A 3I5OA 2GHBA 3SEYA 4RK2A 1USYH 3C9HA 4BDRA 3G3KA 3TFLA 2ZYNA 4ECFA 3ZS6A 2PYYA 1ZU0A 4OHNA 3IB1A 2DWHA 1MPBA 1FW0A 4TOZA 3FUZA 4QSCA 1YTVA 2VD2A 3C32A 4QFLA 1FTOA 1B5HA 4OEVA 3MBPA 2O69A 3O66A 4OVJA 3JYRA 3MZBA 4Q30B 1MQJA 3P7IA 2ZYOA 3SDFA 3V8XB 4R6HA 3EF7A 4F3BA 1R6ZA 2XXHA 2F7CA 2Y7KA 4XIGQ 3ONMA 4U1ZA 3KN3A 1DTZA 1VSOA 1TXFA 2YJPA 3G3FA 1H45A 5IAIA 3UA8A 1FCKA 4EQ9A 4GOTA 1OQGA 1Y3PA 1XVXA 1P1OA 4ZE9A 5CI5A 4IB2A 5I84A 3MVZA 2XD3A 4JB7A 4ELRA 4JXIA 1II5A 4U22A 5L8DA 1MXWA 4G77A 3PMWA 3EQ1A 4QFNA 3OXNA 3TTLA 3L6HA 4O3CA 1JETA 4U23A 3S9MC 1XHYA 3RPWA 4LA9A 1WVJA 3SEWA 3IR1A 1USYE 3UORA 3K0VA 3FV2A 3CFZA 4OFLA 1N3WA 1PB9A 5EHMA 5TU0A 2IEEA 3DELB 3IB0A 1R9QA 4QFPA 1MPDA 3O2AA 1B3FA 3C35A 3Q29A 5L9OA 1B58A 1XS5A 1O63A 1PDAA 5H8QA 3M3LA 3MP8A 4ZEDA 3KFMA 2GH9A 1Y4TA 1YPNA 4EQ7A 4G68C 4H6DA 1ATGA 2V25A 1VE4A 1MY1A 3PUZE 2B3BA 5M2VA 4DXCA 3FD3A 4WEPA 2REGA 1NFTA 3KBRA 4U1OA 1NMUA 4O3AA 1N76A 3V5AA 3C36A 2UVIA 5BUUA 3UIFA 4KHZE 5CMKA 3T22A 4YZZA 1QUKA 1SYHA 3CFLA 1NKXA 4ND9A 2XXVA 5H8QB 2DE3A 3ZSFA 3GZGA 4KQPA 1LB9A 4C0RA 5DYHA 4LZ7A 3FV1A 2DE4A 4F2QA 1NH7A 3T9UA 2H4IA 2DP8A 2R71A 2DSFA 4JDFA 3ILUB 3H6WA 3GBAA 4F22A 4K3FA 3R7XA 4KYSA 3MVXA 2H5YA 4R6YA 1DOTA 2XHDA 4IO4A 1JW4A 1POY1 2I0BA 1S9TA 3A3UA 4DCYA 3K02A 4JWOA 2XXIA 4XKRA 4IO5A 3VV5A 4LVQA 1IITA 1OLCA 3E3KA 3IORA 4RY1A 5AE4A 3TUSA 3C34A 2E0SA 1JEUA 4F29A 1LFHA 2ZYKA 1MQHA 4PFYA 3A09A 3MUQA 4YKIA 2XXQA 4OEUA 3QXMA 5JTYA 2VHAA 2XD2A 2UYEA 3RTFB 2Q9TA 4Z0IA 1FTJA 2PMSA 3K6XA 4OZ9A 3A3CA 4OWDA 4RNSA 1SI0A 4DZ1A 4FORA 3ZKLA 3OOAA 4M4GA 4R75A 3OD7A 4Q5TA 5ICQA 5ISUA 4KYEA 3TAJA 1H76A 4FEDA 1Y4CA 1LAFE 1ZMGA 4F19A 2DWIA 2RCBA 2YPNA 4R6KA 3HHFA 3V89B 4DCXA 3FJ7A 1AL3A 4N13A 3C31A 4KD5A 5HM4B 1NH8A 3ECRA 1SI1A 2D3IA 1LFIA 5JTYB 3T96B 2F36A 3SEXA 1BTJA 1MRPA 2QMXA 5TP9A 4EF1A 2Z8FA 2Y84A 3FJGA 3O97A 1DPEA 2ABHA 3VXBA 3KOSA 4POXA 5AA1A 3OELA 5DTBA 1Q35A 2ONSA 3T9XB 2M8CA 2PX1A 3IK6B 4YB6A 2DXRA 5JK4A 4TLLB 4R74A 2CZLA 4E0WA 3VE1B 4ELPA 3PU5A 3L6GA 3UK4A 4FECA 4KCDA 3CIJA 1B32A 2Y7IA 3M3KA 3K6WA 5B7DA 3RGYA 2PT2A 3W9VA 4X9TA 3SERA 5AA2D 4ZEIA 3KG2A 4ZS9A 1EZOA 3RT6B 4F3GA 3N26A 5ITPA 5ICTA 1IEJA 1N84A 1SW5A 3OEMA 5I2KA 2X26A 4IO3A 3IAZA 3VFJA 4O3BA 5TP9B 4HTGA 4H67A 1IUDA 3IOVA 1QJMA 2Y7WA 1EH3A 4GVOA 2H98A 3IX1A 3E4RA 4YMAA 3PPRA 4ZZAA 2I48A 4PETA 2H9BA 1JNFA 3K00A 3TELA 3CVGA 4AQ4A 2GHAA 4RPNA 1LGBC 3DM0A 4FEBA 1DMBA 2UYFA 3H06B 4DXBA 4NF8A 4G8HA 3UGWA 4OQOA 4YB5A 4NF4A 2OZZA 1LAGE 1MPCA 2I49A 3B6QA 3GBBA 3MVYA 5I2KB 1IXGA 1A55A 1OMPA 1YAEA 4HCYA 4X1BA 4PFTA 4HCWA 2UVHA 3T93B 3USDA 1D9VA 4XKPA 2XXWA 4DE8A 3EHUA 4ZEKA 4JSOA 4OMBA 5ELVA 3IB2A 5K2YA 4GXAA 5I57A 2REJA 1A7LA 5ITOA 2NVUB 4NF8B 3G3IA 4GL8A 4NWCA 5BWJA 1B9JA 1B2HA 2RF1A 2RINA 4NF4B 3SEVA 4MBPA 1MDQA 5AA4A 1LAHE 3BFTA 4ZDMA 1CB6A 2F7AA 4OERA 1IXCA 4YMBA 1FQFA 2E1SA 2ANJA 1A40A 3GXAA 2V84A 1NNTA 2RCAA 4U21A 1AOVA 4AB6A 3KSXA 4QFKA 1QKAA 1F9BA 1L5TA 3PD9A 3VLVA 4DXUA 4MFIA 4RJZA 3TTMA 4MH5A 5I57B 2AYSA 4ELOA 4IGRA 4IY6A 2O51A 4TLMB 4MF3A 5TPAA 4ISUA 3SKPA 3FVKA 3S9EA 1SQYA 1SW1A 2Q2CA 3HPIA 1FTKA 5AA4B 1FQDA 1R1NA 3MPLA 3BBRA 4GXSB 2NOOA 2DVZA 1TWYA 2Q89A 4NEDA 2DWJA 1URDA 3K4UA 2UXAA 2QPQA 1WDNA 4I1DA 1SW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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