4F18A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 8.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f18A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f18A01
3K6UA 3VVEA 4KHZE 4OEUA 3K6XA 3UP9A 5EYFA 1P1QA 4KD5A 3K0VA 1TFAA 2H99A 1TT1A 1SVXB 3TFLA 3S9LC 3CIJA 2XXTA 2Q88A 3KJ7A 3O6HA 1Y9UA 3Q27A 3CVGA 4DXBA 4F18A 3S9EA 3UA8A 1B58A 1LAHE 2NUVA 3IR1A 4DCYA 4NE4A 1B0LA 1LB8A 4GVOA 2X7PA 1B51A 4F3GA 3PD8A 4F1YA 1WVJA 3C36A 5H8FA 5I56B 3S2VA 3TCGA 4ELPA 3LBSA 4R75A 3TQWA 4H5GA 4ONYA 1R9QA 3KJTA 3Q25A 2DXRA 3HN0A 1N3WA 3IORA 4LVQA 2A5SA 1JEUA 3RNNA 1GTKA 1YTVA 4NWCA 2V3QA 2PMSA 5DTBA 5TPAB 5M2VA 3BKIB 1VFEA 2VD3A 3M8UA 1A7LA 4MLQA 4HCWA 5I58B 4ESWA 1B6HA 1PB7A 1MH4A 3CR9A 1XHYA 1O7TA 2OZZA 3T9HB 4RNSA 1B05A 4RYAA 2I3WA 1JETA 2YPNA 1DOTA 1S9TA 4PFUA 4KCCA 3GZGA 3N26A 2DP8A 4JXIA 3SESA 1PC3A 3VLUA 5H8HA 3TPAA 4F39A 4RJZA 4H5FA 1OMPA 1QVSA 5H8QA 3B6TA 2NOOA 2Q2AA 4QSCA 4KCDA 4P0GA 1UQWA 1A99A 3MVYA 3P7IA 3FD3A 3OXNA 2VD2A 2UXAA 4P11A 4ELQA 3GBBA 3OSQA 4HS7A 4ZEIA 3LC8A 2AYSA 4RPOA 4O3AA 4OTEA 1JQFA 2ZYKA 4NTLA 4G8MA 4YKIA 3MP8A 2V3UA 2AL4A 4N13A 4OFJA 2P0SA 3V8XB 4GXAA 3C31A 1BLFA 1PEBA 1Z7NE 3AXFA 3GXAA 5ICTA 3QK6A 5I56A 1MG1A 2OJTA 1RKMA 1LCFA 4PP0A 1Q35A 2D3IA 2IEEA 4YICA 4EF2A 5JEIA 1R9LA 2ANJA 1S7YA 5DVIA 4O3BA 1MY0A 5TU0A 3FASA 1MY4A 4OVJA 1JW5A 3FUZA 2O7IA 3H6VA 2UYFA 4PQJA 2ZYNA 3I6VA 5I58A 2O7UA 1URSA 2UVIA 3KN3A 2XXRA 3N94A 3MJNA 3PMVA 3FJMA 4U1OA 4OENA 1P1UA 3G3IA 4NF6A 3UK4A 3DLNA 4H8IA 4R6YA 4R9FA 4NWDA 3JZJA 2R9JA 3TMGA 3G3FA 2F97A 1LFGA 1OVTA 3MP1A 3EHTA 3TCFA 2Y7WA 4MFIA 1OLAA 4U4SA 4LONB 2Y84A 1LCTA 5I57B 5ELVA 3HPIA 4AB5A 5FHNA 3PUVE 5K2YA 3IL1B 1CB6A 4F1UA 2I6EA 1MY1A 2H4IA 4FIMA 3O6IA 3VDFA 1B0HA 3ZS6A 5KZTA 3H6WA 1O63A 2D5WA 4F2QA 4U21A 1B3FA 3RT8A 3PPNA 4QSEA 3MBPA 2DE2A 1EH3A 1XVYA 1JVXA 3IB1A 4G2ZA 1B32A 5DVJA 4YU0A 3U93A 2XX8A 1MXYA 3TTKA 1PB8A 4R2BA 4E0WA 4M4GA 3D4GA 1M5CA 2RINA 2Q8JA 3LSWA 1Y20A 2OWTA 4DXUA 2ABHA 3HCQA 4ECFA 3PD9A 1XT8A 5AA2B 2RKMA 4NF4B 3BBRA 3BFTA 3PPQA 5IKBA 1I6BA 4IY6A 4NEDA 2O84X 4G68B 1USYH 4F31B 4U2RA 5AA2D 3FVKA 2B65A 3G3KA 2DSFA 2QL3A 3QXMA 4JWYA 3VFJA 4F3PA 3UORA 3W15C 4Q8RA 4YB7A 1FQAA 3ILUB 2HZLA 4HW8A 2CZLA 4PFYA 1YPNA 1NH8A 4N6PA 3TUSA 2G29A 3E3KA 1TXFA 4ZEFA 1SBPA 3W9VA 2FNCA 5I57A 4WKMA 2XXVA 3DP6A 4HCYA 3MP6A 1FQEA 2NVUB 3HHGA 4KFQA 1N76A 1GVCA 1FQBA 3T66A 1HSJA 1B7UA 4LQ5A 1A8EA 1FTLA 3MPKA 3S9MC 5CC2A 1NFTA 5L9OA 1NL5A 2AL5A 4G8HA 3OO7A 1NNKA 4DZ1A 1N84A 3FVOA 1M5EA 2PYYA 4GL8A 3UN6A 3M3FA 3H7MA 3E4RA 4JDFA 3K6VA 3VVFA 5TP9A 2F34A 3IOVA 1L5TA 4H8JA 2RC8A 1I6AA 1URDA 2GH9A 1PBQA 4DDDA 1EZPA 1H43A 1MQHA 3LSXA 3WAFA 2E0SA 3VV5A 3FGSA 5CMCA 3IOWA 4BDQA 1FTKA 4LZ8A 5FHOA 4LATA 4ND9A 1YCJA 5AA2A 3TEPA 4ISUA 4NF4A 4XKQA 3IJXB 4EXKA 4YKJA 3O97A 3K1NA 3HV1A 3FZVA 4G68A 3FV1A 3SETA 1OVBA 2FA7A 2ZXTA 3FXUA 4LA9A 2Z8DA 2QMWA 3CFZA 3QIMA 2F7CA 1ANFA 1H76A 4IB2A 3L6HA 2ONRA 4FECA 3PV0E 3OO6A 5FTIA 3TTMA 1DMBA 3WAEA 2Y7RA 4G4PA 3PPRA 2D21A 3C9HA 1WDNA 3RTWB 1SW5A 3K01A 2V93A 2DE3A 4YB5A 4NF5B 1AH5A 3E13X 1XVXA 1Y3QA 2QS1A 2RC9A 4UA8A 4BDLA 5L8DA 1CE2A 2QS3A 1IZ1A 3S9NC 1P1WA 1US5A 2Z8EA 3ZKKA 1IUDA 1TWYA 1B3GA 1UIUA 4XIGQ 4H0WA 3QSLA 5CMBA 3TYHA 1FTMA 3L6GA 4WEDA 1UTBB 1SD3A 2WKYA 4QFKA 4FJPA 3SKPA 2I0BA 2I49A 1EU8A 4LZ7A 1N0TA 3G3JA 4QSDA 3IB2A 2NWJA 1MXZA 4KI0E 3RGYA 1ZU0A 3H06B 4GRKA 3RT6B 4XKPA 5JTYB 1PBPA 3FVNA 2F36A 5DT6A 4DCXA 1IXHA 1B3LA 1GGGA 4R6HA 2A5TB 1B1XA 4NF8A 3ILTB 3H6UA 3BFUA 3JV9A 5H8NB 1AOVA 2PT1A 5L9SA 4RK9A 1QJMA 3I3VA 1RYXA 4RK2A 4IO7A 4XKNA 1MQIA 3IK6B 4MF3A 2HXWA 4JSDA 1DPEA 2GHBA 2VGQA 1PB9A 3DM0A 1TFDA 3KN8A 3M3LA 5H8SA 3VE1B 3TZAA 1I6QA 4PFTA 5B70A 3N6UA 3H4ZA 5AE4A 3FVGA 4F22A 2I48A 4ESXA 4QFLA 3PU5A 5CBSA 3CFLA 4OERA 3LR1A 2HQ0A 1QUKA 4QHQA 4EQ7A 2O69A 1IITA 3Q28A 2Y7PA 3K1PA 5AA1A 1MXVA 2W7YA 3U92A 3UIFA 3TDJA 2QPQA 4R9GA 5LOMA 4FATA 1B52A 1MQDA 4ZE8A 4JWXA 2UVJA 1H45A 3EHSA 3E9XA 1D9VA 3PUXE 1HSLA 3K00A 1FW0A 3KG2A 1GV8A 2RCBA 3G3HA 3C34A 2XXUA 4P0IA 4X9TA 4JWOA 2HFBA 1LAXA 4I9DA 3CSGA 1M5FA 3OD7A 2F5XA 5AA4B 5JTYA 4GIZA 5TPAA 3CG3A 1I69A 4AQ4A 5F7VA 4EUOA 3GBAA 2A5TA 3K1MA 2XD3A 4G68C 5HPQA 2YJPA 5A5XB 4IGTA 2XXHA 1R6ZA 1B5HA 2OCUA 2F6GA 1LAFE 2UVGA 4IO4A 1AIVA 1NKXA 2XHDA 2HAUA 4G8NA 4JBZA 4LP2B 3DP4A 4ZE9A 2PX1A 2DOJA 1II5A 1ZMGA 1JW1A 4U22A 2X26A 1MY3A 3D4CA 4FORA 4BLAA 4FAJA 1UIVA 2H98A 1IEJA 4UACA 3C32A 2G93A 1ZBMA 3C35A 4PETA 2F35A 2F78A 3K4UA 2E1SA 4I1DA 4X48A 3TTRA 4TQUQ 1IXIA 1B46A 4KQPA 5L9MA 3TCHA 3MWBA 2Q2CA 1GR2A 3SDFA 3UGWA 4U23A 1NMUA 1ELJA 1MH3A 2HAVA 3A09A 4THIA 4OYVA 3O6GA 1B4HA 1JW4A 4IGRA 1Q1KA 5I84A 1XC1A 4H1XA 2QRYA 2P2AA 1A8FA 2F8DA 5AA4A 1OQGA 3PGFA 3CFXA 2I4CA 4KPTA 3QUFA 2DWIA 1H3DA 1FQFA 3IAZA 1F9BA 2R71A 3OO8A 5A5XA 1MXXA 3OMBA 2X7QA 1MS7A 4IY5A 2VP1A 4KYEA 3OELA 2NXOA 1RYOA 2M8CA 1MY2A 1LFIA 4LZ5A 3IO6A 5EHSA 1ZKBA 2RF1A 1MPCA 3FV2A 4NMYA 4ELOA 5DEXB 1P1NA 2RCAA 5ITPA 2BJJX 2IA4A 1MM6A 2QS2A 4F2OA 2QS4A 4RPNA 1POY1 5HBCA 1UTHB 1USYE 3Q29A 2XXWA 2H9BA 1LLSA 1MQJA 5JK4A 5CM6A 1IXCA 4YB6A 3T9VA 3W9WA 2ZMBA 4KYSA 3IX1A 2ESNA 1D9YA 3TODA 2REJA 1ZJLA 2I58A 1DSNA 2DYXA 3SERA 2V3TA 4YMAA 1MXUA 1LBCA 5B7DA 2P1SA 4ELRA 1SW1A 3TKDA 4ZDMA 1VR5A 3CG1A 1SI1A 2XX7A 5CRYA 2Y7IA 4Z0IA 3LSFB 3ZKLA 2F7AA 3KN7A 2XX9A 3MC2A 5ISUA 3FIRA 1S50A 3RPWA 4IO5A 2I4BA 4KYDA 5I2NB 1B3EA 3MVXA 2ZNUA 1IQ7A 1FQCA 3SEVA 3VXCA 1AMFA 1QW0A 2AIXA 4IO6A 4L17A 4F3BA 1JEVA 4RXLA 4XKRA 3RTFB 1NNFA 1B1HA 1B7ZA 2FYIA 3PUZE 4OESA 3KSXA 3QAXA 3M3KA 4ZECA 4WEPA 5CMMA 1BIYA 4QFPA 3TTLA 3ZSFA 4O3CA 1M5DA 2I3VA 2V25A 3T22A 4QFOA 3PPPA 3VLWA 1VSOA 2OWSA 4GL0A 3MAMA 2Z23A 3EF7A 1LFHA 2Q9TA 3TQLA 1UTHA 1SQYA 3MPLA 3PUWE 1XOCA 1Y1MA 2H5YA 1B3HA 3CI8A 3MZ1A 1Z7ME 1JVYA 2HZKA 1Y1ZA 2QSXA 2GFEA 1QUIA 4KR5A 1J1NA 3R6UA 2QMXA 2ZNSA 5J1DA 4F1VA 3A3UA 1NNPA 4YKKA 2O68A 4ZEDA 1O64A 3HO7A 4R73A 1Y3NA 2DXYA 3MW0A 1SI0A 4F19A 3IB0A 4EDPA 4Q30B 2ONSA 4OETA 1DTGA 1OIBA 4X1BA 3KOTA 3OO9A 2H25A 3HSTA 4BDRA 5I2NA 3FJ7A 1EZ9A 3IO4A 1SDXA 4YAHX 3ONMA 5I59B 2KLFA 2OK2A 1LAGE 2REGA 2Z8FA 1P1OA 3KOSA 3OSRA 3MUQA 3O66A 3PPOA 1MQGA 3VLVA 3G3GA 4NF6B 2O1LA 1FQDA 3PMXA 3FATA 3B7DA 1FCKA 3R26A 1A54A 4NF5A 2V84A 4OQOA 4K3FA 4H6DA 1KWHA 2VHAA 3MVZA 1IXGA 1JNFA 4ZEBA 3IOUA 3THIA 3VXBA 3RQTA 4C1TA 1PDAA 3T9UA 3SEXA 3KGCA 3QYTA 1BKAA 3IJOB 3MQ9A 4OMBA 4EF1A 1LB9A 2OLBA 2O1MA 1UTBA 3H3GA 1SYIA 3K02A 4N07A 3ECRA 4OFLA 4GLIA 4OWDA 1LSTA 1MXWA 2B3BA 4ZZEA 4MH5A 2DQVA 2DWHA 4DXCA 4TLLB 1B5IA 1BP5A 3KSJA 4BDNA 1QKAA 1ZIUA 4IO3A 4JB7A 1ZLQA 3H6TA 2B3FA 2HCAA 3USDA 5FHMA 1MDP1 1Y4TA 3FJGA 2GRVA 5H8NA 4Q5TA 4HTGA 4TLMB 5ITOA 1P99A 2RC7A 5I59A 3H03A 2ZYOA 1MM7A 2F6PA 5EHMA 3N5LA 4GD5A 3S4UA 2XXPA 4ZEKA 3GLBA 3O29A 4EXLA 3FXQA 3CRBA 3I5OA 3MVWA 2DVZA 2XXYA 3C33A 4LUBA 4ZS9A 2CMOA 1B4ZA 4U1ZA 1MRPA 4I8CA 3EQ1A 3T9XB 5KCJB 1QULA 2PT2A 1EZOA 4OHNA 3G7WA 2XD2A 1MPDA 1US4A 3KZGA 4FE8A 5HM4B 2ZNTA 4G77A 3B6WA 4GOTA 4Q0CA 4IO2A 2XXXA 1AL3A 2HEUA 4FEDA 3FXRA 4LQ2A 5TP9B 4RY1A 2PVUA 5DYHA 5F1QA 1B5JA 4F3SA 1D4NA 5I2KB 2XXQA 3O9PA 3DELB 4RA1A 2DWJA 2Z22A 1VE4A 3KEIA 1B2HA 1POTA 4AB6A 3T93B 3F11A 1R1NA 4GXSB 4POWA 2PBWA 5BUUA 2ZYMA 5KDTB 1OLCA 3U8QA 4PE5B 1DTZA 4GFRA 1YAEA 2ALUA 1WODA 4YZZA 3V83A 1XS5A 1FTOA 5IAIA 2OBGA 3OOAA 1A55A 3IOTA 3N6TA 4GQOA 5ICQA 4R6KA 4JSOA 2O6AA 3EPEA 1SW2A 3EN3A 4PFWA 4DLDA 4H67A 1N3XA 3Q26A 1Y3PA 3DP8A 3OEMA 3K2DA 3C4MA 4QF9A 4F29A 2ONKE 4OEVA 1H44A 1Y4CA 3V89B 3HHFA 4EQ9A 3RN8A 1N7WA 2Q89A 3A3CA 4OZ9A 4Z7EA 2QJEA 5KCJA 4ZZAA 3SEWA 4OFOA 1OQHA 4QRZA 3OEKA 1B40A 3PMWA 3PUYE 1URGA 4I62A 1D3KA 4WXJA 2YLNA 3U1OA 3VVDA 1N7XA 4M1VA 1MPBA 2Y7KA 5CBRA 1M5BA 1ZTYA 1A40A 2DS9A 2I0CA 3OENA 4GWOA 2O51A 4C0RA 1QKBA 3TAJA 3U94A 3TTNA 4POXA 4DIGA 4FEBA 3U72A 3RUMA 2LAOA 2R6GE 4YMBA 2THIA 3B6QA 3T96B 3R7XA 1FTJA 5K2XA 4XTCQ 4X1DA 3SEYA 4H65A 2DE4A 1DPPA 5FTHA 1BTJA 5I2KA 4OXVA 1SW4A 4DE8A 1T0KA 5H8FB 5BWJA 4BDOA 1LBBA 3MZ9A 1N04A 4R74A 1VFDA 3O28A 5KDTA 1ATGA 4E0XA 2DVCA 1HSEA 4MLVA 3QUJA 5DVFA 4C1UA 4YKPA 4EQBA 4GF8A 3ODBA 1SYHA 1NNTA 3TELA 2DWAA 2GHAA 4TOZA 5CMKA 3MZBA 2UYEA 2UVHA 3JYRA 3SEUA 3KBRA 4R72A 3O2AA 4NF8B 1QUJA 2VOZA 2F7BA 4BDMA 4QFNA 5CI5A 4R2FA 3KFMA 4XXUA 3K6WA 2XXIA 1LGBC 5DEXA 4MBPA 1NH7A 5AA3A 1MDQA 5H8HB 4U4XA 1B7HA 3LUYA 3EHUA 3LSLA 5H8QB 3V5AA 3RLFE 1IIWA 1B9JA 3RY3A 3CSBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4RPOA 4O3AA 4OTEA 1JQFA 2ZYKA 4NTLA 4G8MA 4YKIA 3MP8A 2V3UA 4PF8A 1FBEA 2AL4A 4OFJA 4N13A 2P0SA 2FVZA 3V8XB 4GXAA 3C31A 4PTKA 1BLFA 1PEBA 1Z7NE 3BIHA 3AXFA 3GXAA 5ICTA 1RDYA 3QK6A 5I56A 1MG1A 2OJTA 1RKMA 1LCFA 4PP0A 1Q35A 2D3IA 2XXKA 2IEEA 4YICA 5IM2A 4EF2A 5JEIA 1R9LA 2ANJA 1S7YA 5DVIA 1DCUA 4O3BA 1MY0A 5TU0A 3FASA 1MY4A 4OVJA 1JW5A 3FUZA 2O7IA 3B8BA 3H6VA 5F24A 2UYFA 4PQJA 2ZYNA 3I6VA 5I58A 4PE3A 2O7UA 1URSA 2UVIA 3KN3A 2XXRA 3N94A 3MJNA 3PMVA 3FJMA 4U1OA 1JP4A 4OENA 1P1UA 3G3IA 4NF6A 3UK4A 3DLNA 4H8IA 4R6YA 4R9FA 1G0IA 4NWDA 3QMFA 3JZJA 3IFCA 4P1LA 2R9JA 2XWVA 3TMGA 3G3FA 2F97A 1LFGA 1OVTA 3MP1A 3EHTA 3TCFA 2Y7WA 4N4UA 4MFIA 4N8YA 1OLAA 2QVRA 4U4SA 4LONB 2Y84A 1LCTA 5I57B 5ELVA 3HPIA 4AB5A 5FHNA 3PUVE 5K2YA 2XWOA 3IL1B 1CB6A 4F1UA 2I6EA 2V4CA 1MY1A 2H4IA 4FIMA 3O6IA 3VDFA 5LDZA 4GWSA 1B0HA 3ZS6A 5KZTA 3H6WA 1O63A 2D5WA 4F2QA 4U21A 1B3FA 1NV7A 3RT8A 3PPNA 4GX3A 4QSEA 1QGXA 2KR0A 3HFUA 3BIGA 3MBPA 2DE2A 1EH3A 1XVYA 1JVXA 3IB1A 4G2ZA 1B32A 5DVJA 4YU0A 3U93A 2XX8A 1MXYA 4JVIA 1PB8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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