4F1UA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 4.5
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1uA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1uA01
4RY1A 4KYEA 3ZSFA 2DWIA 4YKKA 1H43A 4WEDA 4PFYA 2H98A 1JNFA 1O63A 2RKMA 3V83A 2PBWA 4G4PA 5I84A 1MPBA 2A5TA 5AA4A 3LC8A 2GFEA 1MXWA 1MDP1 3VLWA 3K4UA 2E1SA 1MY1A 1PEBA 3IAZA 4OZ9A 5H8SA 3HN0A 3MQ9A 2G93A 4XKNA 4FECA 1H3DA 1MY2A 4KHZE 3M3LA 4C1UA 3T9HB 1H44A 2QSXA 4JWXA 1UTBA 3Q26A 4GD5A 4NMYA 3B6WA 2FNCA 4G8NA 1FQCA 4HCYA 4ZDMA 3TQWA 1HSJA 5EHMA 5BUUA 1B3GA 1IIWA 4KYSA 4F39A 4LZ5A 3TFLA 5KCJA 2V3QA 2XXPA 1LGBC 1EZPA 4EUOA 1PB7A 2QMWA 3BFUA 1SQYA 1LFHA 3O6GA 3HHFA 5CMBA 5ICTA 4DZ1A 3MZBA 4JXIA 4R72A 3SEXA 2QL3A 3DELB 3CSBA 1I6BA 4AQ4A 1VR5A 4OMBA 3THIA 1EZOA 3E3KA 1QW0A 4RK2A 2VHAA 4ZS9A 2DE3A 3GXAA 2VOZA 4R6KA 1S7YA 4KCDA 1SDXA 4QFNA 4JB7A 1H76A 1B1XA 2Z8EA 1UTHA 3TZAA 2XXVA 3H7MA 3IR1A 1SD3A 2NWJA 1DTGA 2DVCA 4PETA 2HXWA 4NF5A 3C33A 3U72A 3W9WA 3UK4A 3G3IA 3T22A 4TQUQ 1MY4A 1SW1A 1PB8A 4RJZA 4NF6B 4HTGA 4WKMA 2ZYOA 1PC3A 1CB6A 3OO7A 2I0CA 2XX9A 3TELA 3TPAA 4IO4A 3VXBA 4ELPA 2R9JA 4FJPA 4OETA 2O51A 1DPPA 3H6VA 2DXYA 1NNKA 4R6HA 2HQ0A 3O66A 1URSA 4RA1A 1LBBA 1B1HA 4DLDA 1BLFA 3RTWB 5CMMA 3FASA 1QUKA 3RNNA 1B2HA 1B40A 3E4RA 5I58B 4NF4A 2GHBA 1DSNA 4IY5A 2P1SA 2NVUB 3QIMA 3KFMA 3QUJA 4EQ9A 5L9MA 5CM6A 4H67A 1MQJA 1JW1A 2R6GE 2XXHA 4OFOA 3PPRA 5H8QB 5A5XB 1B46A 1YTVA 2UVGA 2H25A 1VFEA 3VXCA 1B4HA 3IOVA 2XX7A 4I62A 3FD3A 3K1PA 5FTIA 4UACA 4EXLA 1EU8A 3DLNA 3JZJA 1A55A 2FA7A 3CFZA 4AB6A 2PYYA 3KJTA 5DVFA 2Z8FA 4MF3A 1AOVA 4U22A 4YMBA 3G3JA 1ATGA 4ZE9A 5AA2D 4RXLA 3E13X 1QVSA 4M4GA 1FTLA 2OK2A 2QS3A 3ECRA 1MXVA 2CZLA 5ICQA 2XXUA 4BDRA 1SVXB 2F36A 3KZGA 1Y4CA 1MXZA 4IO2A 2V84A 3VDFA 3MC2A 3UORA 3H06B 4LZ8A 1J1NA 3EHUA 2OBGA 4NF8A 3RY3A 4U21A 2DP8A 5H8NA 3O97A 3T9UA 1EZ9A 1I6AA 1ZJLA 3UA8A 2B65A 3MP6A 1B5JA 2XXRA 2ZNSA 3O9PA 1QUJA 4XKPA 1MXYA 1QKAA 4IGRA 4LQ2A 1WODA 5ELVA 4I9DA 4N13A 3HPIA 2X7QA 3KBRA 3OO6A 1MDQA 2THIA 1WDNA 3PUVE 3U94A 1LSTA 5I56A 1QULA 3K1MA 5CC2A 1D4NA 1GVCA 4THIA 3D4GA 3OSQA 4PQJA 3ILUB 2ZMBA 3WAFA 4ELQA 4LP2B 5KDTB 4IGTA 1IZ1A 4Q8RA 1B7UA 4OXVA 1XVYA 1AL3A 4FORA 1LBCA 2Q2AA 3LR1A 1SW5A 4KYDA 1SW2A 4GF8A 4H1XA 3UIFA 3R26A 5DEXB 5M2VA 3V5AA 2F34A 1POY1 2D21A 3VVFA 5I57A 4YICA 4MBPA 5B7DA 3A3CA 3FGSA 5TP9A 4ISUA 5EHSA 1MRPA 3QK6A 2Z8DA 4YKPA 5JEIA 4WXJA 2I48A 1URDA 3PPOA 3K6UA 1Y1ZA 1ZKBA 4N6PA 3TAJA 5FTHA 3USDA 4OVJA 2DQVA 2Q8JA 3MZ9A 1A8FA 1MM6A 5AA2B 1M5EA 3FUZA 1WVJA 2V25A 4DDDA 3SETA 4PE5B 3FXUA 3BBRA 4QFKA 3FIRA 3LSFB 3G3FA 1JW4A 3LSLA 3QXMA 4NTLA 5CMCA 1P1UA 4NWCA 2QS2A 2XXTA 5CI5A 3PUWE 3MVYA 5TPAB 2UYEA 4DIGA 4H8IA 4IB2A 5DTBA 1MS7A 1B4ZA 1B9JA 5H8HB 3TCFA 1USYE 1A40A 1MY3A 4DXBA 2P0SA 4F1YA 3W9VA 4MH5A 3SKPA 3OELA 3TDJA 4OERA 3TTRA 2Q9TA 3MAMA 4KR5A 5FHMA 4ECFA 4F3PA 3S4UA 1HSEA 1MY0A 1N76A 3HV1A 5J1DA 1A99A 4ESXA 4Q5TA 3IOUA 4O3CA 4OFLA 1BP5A 3MP8A 4F29A 4GL0A 1M5BA 3I6VA 3PV0E 4ZECA 2H4IA 4ZE8A 5DVJA 4YZZA 1BTJA 2DE4A 2OLBA 3C4MA 1LAGE 1OQHA 4FATA 3PPPA 3TCHA 1LAXA 4JSDA 2P2AA 2REGA 5ITOA 2H5YA 3UN6A 4F2QA 3RUMA 4YAHX 4KD5A 1GR2A 3H4ZA 4LVQA 4ZEIA 2AL4A 4EQBA 4EF1A 2I49A 3LSWA 4U1ZA 3K6VA 4GWOA 3MVWA 1XHYA 4BDMA 2A5SA 3N94A 1FQEA 1Q35A 4R6YA 2I3VA 3MJNA 4AB5A 2B3FA 5ISUA 3CIJA 3MBPA 2BJJX 4HCWA 3KOTA 1GV8A 1FQFA 4NF6A 2O7IA 2ESNA 2XX8A 4KQPA 3S2VA 2VGQA 4P0IA 3T66A 2AIXA 1S9TA 1Y3QA 4IO7A 1LCTA 2GH9A 3K6WA 3MPKA 1JVYA 1Y3NA 4QF9A 1MH4A 1A7LA 1PB9A 3G3KA 4U1OA 3M8UA 4MFIA 1RYXA 3N6TA 4LATA 1P1OA 1N7XA 1A54A 3KOSA 1D3KA 5I58A 1JQFA 4F1UA 2RINA 1NNPA 3HO7A 2Y7PA 3VV5A 3M3FA 3H6WA 3QYTA 1JVXA 4X9TA 3BKIB 4YB5A 3GBBA 2UVHA 3K6XA 4L17A 1UTHB 3CG3A 3UGWA 3PMWA 4F2OA 4FAJA 4F3SA 3S9LC 3OOAA 1NNFA 5H8QA 2DXRA 5A5XA 1VSOA 2Q89A 3FVNA 2O68A 4XTCQ 4G68B 3K2DA 3MVZA 4R9GA 3U92A 2I6EA 4Z7EA 2PMSA 4R74A 2ONKE 1UIVA 4BDOA 4YB7A 1N7WA 5DVIA 3R7XA 5HBCA 1MG1A 4DCYA 1LLSA 3KSJA 3IO6A 3MP1A 4POXA 4JBZA 3JYRA 3IO4A 3QUFA 4FEBA 3EHTA 4GOTA 5L8DA 3RT6B 3C35A 1MQDA 4YMAA 4GIZA 5L9OA 2OJTA 1ZU0A 3QSLA 2UVIA 3L6HA 4R9FA 1A8EA 2UXAA 4RNSA 1N3XA 4P0GA 3IOWA 2ZYNA 3HCQA 5IKBA 4K3FA 4OTEA 1FW0A 5JK4A 3DP6A 4OEVA 4MLQA 1US4A 1ZLQA 2RC8A 5I2NB 4IY6A 3MW0A 4M1VA 1B7ZA 1R1NA 4NE4A 1B52A 1MPDA 4OHNA 3MZ1A 2DS9A 3U93A 2Q2CA 1P1NA 1D9YA 3OO8A 4ZEKA 4Q0CA 3TODA 4QFOA 3TTMA 3GLBA 2HEUA 4H8JA 2HFBA 1NFTA 3IORA 1OVBA 1SI0A 1SYHA 3KN3A 1I69A 1OLCA 3PD8A 3K00A 2CMOA 2XXIA 4GVOA 1ZTYA 3B7DA 1IEJA 4I1DA 5KDTA 2ZXTA 1BKAA 1VFDA 4KI0E 5I59B 4LZ7A 4PFUA 1TFDA 3V89B 1FTMA 3IB0A 3ZKKA 5DEXA 4BDLA 2Y7WA 5JTYB 3FJ7A 2Q88A 5AE4A 2Y84A 5I2KB 3VVDA 4GXAA 2GRVA 3FV2A 4GLIA 3SDFA 1FTKA 2VD3A 3A3UA 4F22A 4N07A 4JDFA 3EN3A 5CBSA 1TFAA 3T9VA 1MH3A 2DSFA 1S50A 3O6IA 3MUQA 1Y20A 4NEDA 4XKQA 3QAXA 1UQWA 2B3BA 3C31A 3ODBA 5AA2A 3FJGA 1B5HA 4FEDA 3GBAA 3N26A 3F11A 4QFPA 2XXYA 5CRYA 1LCFA 3LSXA 1B58A 4KPTA 2O1LA 1N84A 2O69A 4POWA 1O64A 1Y3PA 4O3AA 3TYHA 3TQLA 3N6UA 3O29A 1MPCA 2IEEA 3PMXA 1CE2A 5IAIA 4XXUA 2I3WA 3SESA 4F31B 2YPNA 2F7CA 4RK9A 4E0XA 2ZYKA 4QSEA 3SERA 4BDQA 5TPAA 2PVUA 3DM0A 3S9MC 2R71A 1SYIA 2OWSA 1P1WA 2QS1A 1AIVA 2ANJA 4FE8A 4LQ5A 2F6PA 5H8HA 3CG1A 3KGCA 4ELRA 4OYVA 2AL5A 3EF7A 4G68C 4ZZEA 3FXQA 1MQIA 4H6DA 3MWBA 3MVXA 3PU5A 1N3WA 4YB6A 4TLLB 2I0BA 4EQ7A 3IX1A 3CVGA 1YAEA 1NMUA 4G8HA 4H0WA 3T96B 3TTNA 3C32A 3PUYE 3PUXE 4QSDA 1I6QA 3H6TA 4PFTA 4GL8A 4HW8A 1N04A 4C1TA 1NKXA 4JWYA 4ZEFA 5AA3A 1IXCA 4BDNA 1PBQA 2O7UA 3ZKLA 1F9BA 2H9BA 1TWYA 4F3GA 2DOJA 1SI1A 2GHAA 4PP0A 2V3TA 4GXSB 3V8XB 1PDAA 4I8CA 2V3UA 2F7AA 3U1OA 3CI8A 3G7WA 4JSOA 5TU0A 5B70A 3D4CA 4OESA 4OQOA 3U8QA 3FVOA 3ILTB 3RQTA 3C34A 5H8FB 2DYXA 2HAUA 1VE4A 3K1NA 3Q27A 2XD2A 2I4BA 4KFQA 2DVZA 3OXNA 2XD3A 3TCGA 3KN7A 1LB8A 5F1QA 2HCAA 4BLAA 3OENA 2Y7RA 2Y7IA 1OMPA 4X1BA 1OQGA 5CBRA 3O2AA 1MXXA 4GRKA 1ZMGA 2Z23A 1B6HA 2IA4A 2A5TB 3RGYA 5AA4B 1LAFE 3SEYA 5FHNA 2O1MA 1B0LA 2HZKA 1B3FA 4H5GA 1YPNA 3G3HA 5DT6A 4EF2A 4DXUA 1NH8A 3PD9A 3PGFA 4R2BA 1XVXA 4U2RA 2RC7A 3L6GA 2I58A 1UTBB 1IXHA 2O84X 1JW5A 2ONSA 3IOTA 2QPQA 2DWAA 2D5WA 1OIBA 3FXRA 3CFXA 5BWJA 2M8CA 1FTOA 3FZVA 1SBPA 3BFTA 3OO9A 3SEWA 4QSCA 3FVGA 4RPNA 5KCJB 3TTLA 3N5LA 2ALUA 3RTFB 4F1VA 2I4CA 3SEUA 3IB2A 3PPQA 1JEVA 2AYSA 5DYHA 1FQAA 1O7TA 1R9QA 4OWDA 1ZIUA 2H99A 1GGGA 3Q28A 2ZYMA 3C9HA 2QMXA 1UIUA 1JETA 3TTKA 2REJA 4QFLA 4LA9A 4P11A 4ZEDA 5EYFA 2V93A 4G68A 3SEVA 3LUYA 3I5OA 3W15C 1TXFA 4IO5A 4R75A 1Q1KA 2OCUA 2X26A 1Y1MA 2ABHA 4X48A 1FQDA 2KLFA 2YLNA 3RLFE 3R6UA 2OZZA 1JEUA 2RCAA 1AH5A 3LBSA 3RPWA 3TEPA 4NF5B 1IITA 1MM7A 5CMKA 1LAHE 4U4SA 4C0RA 1NNTA 2PX1A 1ZBMA 3T93B 1OLAA 1IQ7A 2LAOA 3G3GA 1B3EA 4U23A 3S9NC 1POTA 3O6HA 4MLVA 3WAEA 1QKBA 4LONB 4RYAA 4WEPA 4PFWA 1RYOA 1M5FA 2ONRA 3K02A 5AA1A 3P7IA 4XKRA 2HAVA 5ITPA 1IUDA 1R6ZA 3OD7A 3IL1B 2YJPA 3PPNA 3H3GA 4QRZA 4F18A 2O6AA 2F5XA 3I3VA 4OENA 1B5IA 1PBPA 1FTJA 2XXQA 1DOTA 2HZLA 3EQ1A 5I2NA 3ZS6A 1B3LA 1GTKA 1QJMA 1XOCA 1LFIA 3O28A 4NF4B 1URGA 3OEKA 3AXFA 4YU0A 4ESWA 2XHDA 4G2ZA 2E0SA 1B51A 3PMVA 3VLUA 2F6GA 4OFJA 3IB1A 1N0TA 1FQBA 3PUZE 1RKMA 1DPEA 3MPLA 1US5A 2WKYA 3CRBA 2NOOA 3TMGA 5I59A 4R2FA 2Y7KA 4IO3A 3OSRA 1M5DA 3S9EA 2OWTA 3HSTA 4GQOA 3M3KA 4H5FA 4NWDA 4JWOA 4XIGQ 1OVTA 2NUVA 5JTYA 1D9VA 5HPQA 1M5CA 3FVKA 4U4XA 3FV1A 1MQGA 1Y4TA 1P99A 3RN8A 3DP8A 1B32A 5I2KA 2RC9A 2PT2A 2F7BA 3TUSA 4E0WA 3JV9A 4DE8A 2UYFA 1B05A 5FHOA 1L5TA 2F8DA 3HHGA 2XXXA 1NL5A 3KN8A 4DCXA 2X7PA 2W7YA 4F19A 1TT1A 3VFJA 1LFGA 4QHQA 1FCKA 4ZEBA 4NF8B 3KSXA 5H8NB 4YKIA 4ONYA 4EDPA 4FIMA 2DWHA 1Z7NE 4Z0IA 2ZNTA 2DWJA 2VD2A 3E9XA 3IJOB 3KEIA 1ANFA 1SW4A 5LOMA 1QUIA 4IO6A 1IXIA 4HS7A 3H6UA 3VLVA 2D3IA 2QS4A 4LUBA 2FYIA 4OEUA 1IXGA 5I56B 1B3HA 4G77A 1II5A 3GZGA 4H65A 1YCJA 4GFRA 3K01A 3CFLA 1KWHA 4O3BA 5KZTA 3A09A 3RT8A 2NXOA 5L9SA 1H45A 1P1QA 4DXCA 2XXWA 4KCCA 1Z7ME 4X1DA 3FJMA 5HM4B 4RPOA 4YKJA 2RCBA 2F78A 2QJEA 4Q30B 3C36A 1LB9A 3CSGA 4R73A 3Q29A 4ELOA 1USYH 4TOZA 1R9LA 1BIYA 5K2YA 4ZZAA 1T0KA 3B6TA 3DP4A 5I57B 4EXKA 3KG2A 2QRYA 1EH3A 3EHSA 1HSLA 5TP9B 1XT8A 4UA8A 4ND9A 3IK6B 3B6QA 3H03A 1Y9UA 1XC1A 3K0VA 2RF1A 3ONMA 3T9XB 2PT1A 1ELJA 2ZNUA 3KJ7A 2DE2A 2F35A 3OEMA 4G8MA 2F97A 1MQHA 3UP9A 3OMBA 1MXUA 1NH7A 1XS5A 5H8FA 1AMFA 4TLMB 5F7VA 4F3BA 2Z22A 3VE1B 3CR9A 3FATA 3TKDA 1B7HA 2UVJA 3Q25A 3IJXB 1DTZA 2VP1A 3EPEA 1B0HA 5K2XA 3VVEA 1DMBA 2G29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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