4F1VA

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with phosphate at ph 8.5
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas fluorescens
total genus 119
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f1vA02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f1vA01
4IGRA 2KLFA 3VE1B 3Q28A 1MDP1 3SEUA 3IJOB 3S9MC 4ZEFA 4PQJA 2F8DA 3OO8A 3PPNA 4JBZA 1YPNA 1T0KA 4H8IA 1ZMGA 2Z8EA 4QFKA 3V8XB 2F78A 1S7YA 4H5FA 4OYVA 2HQ0A 1BIYA 3TPAA 3K01A 4WXJA 1MQHA 1A7LA 2AL5A 1MXWA 2THIA 1MY1A 1IXHA 4EQ9A 1QUJA 4NE4A 4ZEIA 4DLDA 3G3KA 3L6GA 3V5AA 1O63A 4G68C 2E0SA 1M5CA 3T9XB 3K1NA 1NH7A 2VP1A 1SYIA 4YZZA 4LZ8A 3EHTA 3QYTA 1L5TA 1VR5A 3BBRA 3OXNA 4DCYA 1MXVA 3RUMA 3C36A 4X48A 1ATGA 1AL3A 1IXCA 1I6AA 1ZBMA 4U22A 3TTMA 1S9TA 3PD8A 1UTHA 4DXUA 1DTZA 3TCHA 5AA2A 3TTKA 1NKXA 3VXCA 3D4GA 1A55A 5H8NA 3LSLA 1LFHA 1OVTA 4C1TA 2OWSA 4U1ZA 1H3DA 1N3WA 2V3TA 5DVIA 3UN6A 3G3FA 2ZMBA 3LSXA 3RT8A 4N6PA 2NXOA 3UA8A 2REGA 5L8DA 2XXIA 5L9MA 3O9PA 4DIGA 5CM6A 3R26A 1TFDA 3O28A 4KCCA 2NOOA 4FE8A 3VFJA 4IGTA 1A99A 3KJ7A 4IB2A 3MW0A 1FCKA 2CZLA 4YAHX 5I2KA 5CI5A 3PMWA 1LFGA 3L6HA 2R71A 2O1MA 5CMCA 3EN3A 4MF3A 1FQEA 4F3GA 5A5XA 1ZTYA 3KN8A 1Q1KA 5TP9A 1GGGA 3ZSFA 5DTBA 1SI0A 5EYFA 4F29A 2Y7WA 1TXFA 1LCFA 1Y1MA 4F1UA 1Z7NE 4AB5A 5I59A 2ZYMA 3RTWB 1EZ9A 2D3IA 2Z22A 4ZS9A 4RK2A 4GLIA 2Y7PA 4IY6A 1CE2A 2QS1A 3A3UA 4QSDA 3KSXA 1ELJA 3FJMA 4G8HA 2V93A 3Q29A 3IAZA 1WDNA 3EHSA 1FQAA 1YAEA 1QW0A 3QK6A 2O69A 3CRBA 4U2RA 2ONSA 2Q8JA 3P7IA 4XXUA 3K0VA 4QFOA 4U4SA 4F1YA 4QFPA 5I57A 2AIXA 4NMYA 3MP6A 1WODA 3A09A 4H8JA 2HCAA 3HSTA 1B0HA 1B40A 4RPOA 3IX1A 3TQLA 2H98A 2ALUA 3FATA 4QSEA 5ICTA 3ZKKA 3O6IA 1PDAA 4QFNA 1R9LA 3G3GA 1ANFA 1EZOA 1TT1A 4F19A 3LUYA 2ONRA 1RYOA 3OMBA 1P99A 4R73A 1P1OA 1LLSA 4BDQA 2AL4A 2ESNA 4IO3A 4OERA 4NF6A 2BJJX 3PMXA 2ANJA 3FIRA 1LAGE 2XXYA 2Q9TA 4LQ5A 5JTYB 1JQFA 3LSFB 2RKMA 2HXWA 2XD2A 3T9VA 1MS7A 3S2VA 5TPAB 1MQJA 1YTVA 5IKBA 2RF1A 4YMBA 2PYYA 5BUUA 2UVIA 3VDFA 4U23A 4N13A 2QL3A 3U72A 1NNFA 2FNCA 4IO4A 1AH5A 2R9JA 2NWJA 1JW1A 2QRYA 1CB6A 4G68B 1Y20A 3RGYA 2DXYA 3FVKA 1B05A 1DOTA 3OO6A 1N0TA 2PBWA 4OWDA 3H6TA 2XX9A 1B3GA 2DOJA 2DYXA 4POXA 3CSGA 5L9SA 1HSJA 4Z7EA 5ITPA 1B4HA 4H67A 4Q0CA 1MDQA 4GD5A 4TQUQ 4LVQA 1USYH 2QSXA 3ILTB 3CG1A 3MC2A 4MLQA 4GXSB 3USDA 2YJPA 4R74A 2DWAA 3E13X 3UGWA 2Z23A 1VFEA 1MH3A 3HO7A 4JXIA 1A40A 3MUQA 4YB7A 2ZYOA 2O7IA 3MP8A 3IOVA 3OENA 4EDPA 3K02A 5CMKA 2DVZA 2XXRA 2DQVA 4NF8A 1JW4A 1OQHA 4U21A 1HSLA 3CG3A 4YKPA 3TELA 3ZKLA 3DP4A 1OVBA 4KR5A 4PE5B 4PFUA 2PT2A 4BDRA 1HSEA 3BFUA 1NFTA 5K2XA 1N04A 2X26A 1B3EA 5AA3A 4BLAA 4KCDA 4XTCQ 1XVYA 5CBRA 2OCUA 2VD3A 3DP6A 4ZEBA 1TFAA 3N6UA 4IO2A 4DXCA 1MQGA 3S9LC 4YKJA 4YU0A 3T96B 1NNTA 2HAVA 5DEXA 3H3GA 4NEDA 3TQWA 2F6GA 4O3AA 4OFLA 3TUSA 3FVGA 2Z8FA 4JB7A 1UTHB 4ESXA 3Q26A 5CMBA 2HZLA 3PD9A 3D4CA 4RPNA 2I58A 1QJMA 1VE4A 5H8NB 5KCJA 1UIVA 4ZE8A 2DWJA 4G2ZA 2V3QA 2GFEA 3M3FA 4R6YA 1B3HA 4R2FA 3GBAA 4Q8RA 3KN3A 1LBBA 2HZKA 2PX1A 1MG1A 5HBCA 1NL5A 4Z0IA 5F7VA 3FJGA 4ONYA 1R6ZA 1US5A 1QKAA 1GVCA 4GXAA 3GLBA 3K2DA 5H8QA 2GRVA 5I2KB 4NTLA 3IJXB 1N3XA 2XXQA 4GOTA 2Q2AA 4UA8A 4EXLA 3MVYA 1M5EA 3MZBA 4JSDA 3H4ZA 5A5XB 2I0CA 3GZGA 2ABHA 1A8FA 2RCAA 5TP9B 3T9UA 1IXIA 1EZPA 3C31A 3FUZA 4R6HA 4PETA 1B9JA 2ZNUA 1URDA 4OMBA 2I0BA 1XVXA 2NVUB 5I59B 4WEDA 3H03A 4IO6A 3VVFA 3O29A 3RNNA 3U1OA 4NF5B 3WAEA 5AA2D 2QMWA 3HPIA 4M4GA 1SYHA 1MY3A 4MLVA 5KZTA 3QSLA 2OZZA 4ECFA 2F7CA 2OK2A 4BDOA 5CBSA 3KZGA 1FQBA 3G3JA 4YICA 4ZEKA 4G8MA 5L9OA 1R1NA 4YMAA 1P1QA 1FQCA 3IK6B 4MH5A 3CFZA 2XD3A 3RY3A 3TTNA 2VGQA 1IIWA 1MM6A 2B3BA 5I57B 2XXXA 4LZ7A 3DLNA 3I5OA 1NNKA 4H65A 3R6UA 2H4IA 4F1VA 3BKIB 2O7UA 5FHNA 2DSFA 1J1NA 2O1LA 2HEUA 3KG2A 3TAJA 3N6TA 4F3BA 2P1SA 2XHDA 4C1UA 4U4XA 4OHNA 2XX8A 4ELPA 4NF6B 2CMOA 3T66A 1N7XA 3RN8A 4XKQA 3MWBA 1Y3NA 4F3SA 4N07A 3S9NC 4RXLA 1LAXA 2YPNA 3B7DA 2XXPA 2O84X 4PFWA 4NF5A 1LBCA 4GQOA 5FHMA 3CFLA 1URGA 3ILUB 3C34A 2DVCA 1RYXA 3PUYE 1A8EA 1UQWA 2M8CA 1QULA 4EXKA 3C9HA 3O6HA 1H45A 2W7YA 3IOWA 1XHYA 3B6QA 3UIFA 4ELOA 4F2QA 3C35A 4OEUA 1OLCA 5B70A 2F5XA 3QUJA 3FVNA 4OVJA 4YKIA 2RC7A 5AA4A 1B6HA 2I4BA 4H6DA 1PB8A 1XS5A 3O6GA 4RK9A 4OQOA 3FJ7A 2H25A 1OMPA 3OOAA 1MQIA 3MZ9A 4PFYA 1B5JA 3C32A 3PGFA 3I6VA 4FEBA 1II5A 1B7HA 4GL0A 3EHUA 3K4UA 2I3WA 1P1UA 1P1WA 4KI0E 4WKMA 1Z7ME 1Y4CA 3M8UA 5AE4A 4YB5A 4ND9A 1WVJA 2O6AA 4JWOA 4LATA 3RT6B 3U92A 3MAMA 4JDFA 4NF8B 1B1HA 2Q88A 1B7UA 4KYEA 3RPWA 2UYFA 2AYSA 3OEMA 2PMSA 5ITOA 1MY0A 1P1NA 3ONMA 4OENA 2UVJA 5DYHA 1LAFE 3FXQA 1GV8A 1LCTA 3TTRA 1D3KA 1B5IA 1R9QA 2H99A 1D4NA 4OZ9A 3DELB 2UXAA 4ZECA 1LGBC 3QAXA 3RLFE 3KEIA 3TCGA 3IOTA 3O66A 3IB2A 5F1QA 3ZS6A 4C0RA 3HCQA 4MFIA 3W15C 4EF1A 3HHGA 3UK4A 3O2AA 4PFTA 2DE4A 5DEXB 4FJPA 4LUBA 3TKDA 1SW2A 5DT6A 4JSOA 5H8FA 2DP8A 4LP2B 1H43A 2GHAA 1B51A 1FTJA 2R6GE 3M3LA 2Q89A 2OWTA 3PU5A 3S9EA 2F35A 1AOVA 5FHOA 1D9YA 1PEBA 4K3FA 2F97A 3JZJA 2I48A 3QXMA 5KCJB 1BLFA 4YB6A 2DE2A 3OSRA 2Y7IA 1SW4A 5CRYA 4FATA 1B7ZA 3FVOA 1B1XA 2DXRA 1B3LA 1S50A 1PC3A 4XKPA 1B46A 2F7BA 4ZZAA 1DPPA 3CI8A 3HV1A 3F11A 1B32A 5H8QB 4I62A 2X7PA 3MQ9A 3U93A 1MM7A 2LAOA 1FTMA 1MRPA 3IORA 3H6VA 1LSTA 4F22A 2IA4A 4XKNA 2WKYA 4LZ5A 1QUKA 4LA9A 3SEVA 1JW5A 2PVUA 2FYIA 1JVYA 1LB9A 3VVEA 3EPEA 1POY1 4KD5A 3KSJA 3IOUA 3B6TA 4RYAA 4G77A 3TMGA 1OQGA 2PT1A 3E9XA 4M1VA 5K2YA 2RC8A 1NH8A 1FTKA 1VSOA 3S4UA 1MPBA 2G93A 4G4PA 3CSBA 1UIUA 2OLBA 1QUIA 4RJZA 4JWXA 4EUOA 1SD3A 1Q35A 3FZVA 1DTGA 1SW1A 4F39A 4ZDMA 3Q25A 4FIMA 4BDMA 4ZEDA 1ZIUA 5KDTA 4F3PA 1ZU0A 1B58A 4O3BA 5EHSA 2XX7A 3K6WA 4KYSA 1US4A 3W9VA 3FGSA 3QIMA 3OD7A 4HTGA 4LQ2A 4HS7A 1MXZA 5LOMA 2B3FA 4ELQA 2P2AA 1AMFA 2D21A 1XT8A 1B0LA 1M5FA 1H76A 1URSA 1IEJA 1B2HA 3SKPA 1M5DA 1Y3QA 4BDNA 1MPCA 3EQ1A 3FV1A 5ELVA 3N26A 3I3VA 4QHQA 1DPEA 1FQFA 2RINA 3KJTA 4JWYA 2VOZA 3VLUA 1Y3PA 2ZYKA 3K1PA 4OFOA 4ZE9A 4FECA 5I2NA 4H0WA 1B52A 2DE3A 3G3HA 5EHMA 5H8HA 3U8QA 3UP9A 4HW8A 3GBBA 2V3UA 2UYEA 5AA1A 4QFLA 4DE8A 1FTLA 5HPQA 2A5SA 2DS9A 3SEYA 4I9DA 4KQPA 3JYRA 3IO4A 2DWHA 2VD2A 3K6UA 4OTEA 4RY1A 1XOCA 4AB6A 4EQBA 4DCXA 1AIVA 4F18A 2I3VA 3FD3A 3SEWA 1UTBA 4OESA 2QJEA 5AA4B 3IR1A 4KHZE 2REJA 3TDJA 3HHFA 2F6PA 3TCFA 5I58A 3CFXA 5M2VA 3PPOA 4LONB 1M5BA 4QSCA 1PB7A 3OELA 4E0XA 4Q30B 1MY4A 1PBPA 2XXWA 1DMBA 1I6BA 3T22A 5DVFA 1EU8A 3N5LA 2HAUA 3U94A 1IXGA 2V84A 3ECRA 2RCBA 3QUFA 1SI1A 1JETA 5B7DA 3DM0A 3A3CA 4I8CA 1SQYA 3CVGA 4GVOA 1IZ1A 3ODBA 3VVDA 4GF8A 1FW0A 4ISUA 2V25A 4EF2A 5CC2A 1H44A 4DXBA 5I84A 3BFTA 5ISUA 3OSQA 3C4MA 2OBGA 1BKAA 1ZLQA 1O7TA 3PPRA 4GWOA 2A5TB 2HFBA 4DZ1A 3LBSA 3KBRA 3M3KA 3V83A 2XXUA 1Y9UA 2QS2A 3MBPA 5JK4A 1B4ZA 1MXUA 3TFLA 3FXUA 1B5HA 3LR1A 2I49A 2FA7A 3AXFA 2IEEA 1MXXA 4DDDA 4X1DA 2Y84A 1N76A 3VLWA 5H8FB 3SESA 3R7XA 3TODA 1SBPA 3THIA 4ZZEA 2ONKE 5BWJA 4X9TA 2ZNSA 3SERA 5J1DA 3H6WA 1SW5A 2F34A 4H1XA 3SETA 1O64A 2QMXA 1QKBA 3N94A 4GIZA 3IB1A 1N7WA 4XIGQ 1N84A 3FASA 3PUWE 4EQ7A 1MH4A 4H5GA 4OXVA 4P0GA 2F36A 3PPPA 4O3CA 3FV2A 3KFMA 2DWIA 2Z8DA 1JEVA 1YCJA 4HCWA 1USYE 3E3KA 4NF4B 2H5YA 4AQ4A 3H7MA 3WAFA 3W9WA 1QVSA 4GL8A 3V89B 2X7QA 1F9BA 3MJNA 3Q27A 4POWA 1DSNA 1POTA 3KOTA 1LB8A 1BTJA 4Q5TA 3GXAA 4XKRA 5TU0A 3VXBA 4R9GA 3K6XA 4IO7A 4F2OA 3H06B 4TLMB 2A5TA 3CR9A 1MQDA 3K00A 3RQTA 3PMVA 1FQDA 1IUDA 3K6VA 1B3FA 4HCYA 1MPDA 3IL1B 1FTOA 4U1OA 3OO7A 2XXHA 3PPQA 4MBPA 3IB0A 4OEVA 4WEPA 2I4CA 2GH9A 3KOSA 2QS3A 3LC8A 4G8NA 3TYHA 2F7AA 2Y7KA 4R2BA 3PUXE 4L17A 4R6KA 5I56B 3TTLA 2Y7RA 1LAHE 2NUVA 4I1DA 4YKKA 2G29A 3CIJA 4IY5A 1Y1ZA 1JNFA 4UACA 5KDTB 3MVWA 5JEIA 4BDLA 1JVXA 2E1SA 4OFJA 4P11A 4NWDA 4ESWA 2O68A 1I6QA 3EF7A 3SDFA 1ZKBA 2I6EA 4IO5A 3FXRA 1SVXB 3MVXA 3G3IA 5HM4B 3DP8A 4KPTA 3OO9A 4F31B 3MZ1A 4NF4A 4GRKA 2QPQA 5ICQA 3TEPA 1XC1A 1IITA 2GHBA 1JEUA 1KWHA 3MVZA 3E4RA 3KN7A 4QF9A 3K1MA 4TLLB 4GFRA 4TOZA 5I2NB 2B65A 4KFQA 3RTFB 3B6WA 1VFDA 1NMUA 3C33A 3JV9A 5H8HB 1IQ7A 1D9VA 1ZJLA 3SEXA 1EH3A 1OLAA 4X1BA 1TWYA 3MPLA 5JTYA 5CMMA 2O51A 5H8SA 1NNPA 2VHAA 4KYDA 5FTHA 3OEKA 4RA1A 3TZAA 3PUZE 4ELRA 2ZYNA 4THIA 5TPAA 3MP1A 1I69A 1MXYA 3H6UA 1Y4TA 3IO6A 2OJTA 1OIBA 1RKMA 2D5WA 4R72A 1LFIA 4OETA 3LSWA 4P0IA 3VV5A 4QRZA 3PUVE 3T9HB 3UORA 4G68A 1PB9A 5I56A 2YLNA 1A54A 2Q2CA 2QS4A 3MPKA 4E0WA 2XXTA 2UVHA 2ZNTA 1UTBB 4RNSA 1PBQA 1GR2A 1GTKA 3PV0E 5DVJA 4NWCA 3VLVA 3O97A 2RC9A 5I58B 4R9FA 4FEDA 5AA2B 1SDXA 1BP5A 5IAIA 5FTIA 4PP0A 3HN0A 2UVGA 3KGCA 4FORA 4FAJA 2P0SA 4R75A 2XXVA 3G7WA 2H9BA 1MY2A 2ZXTA 3T93B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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