4F2OA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA02
1FQBA 4HCWA 5DVJA 3H3GA 4F18A 1OLCA 1TT1A 2A5SA 5I2KB 2Z23A 4NWDA 2RC7A 4BDLA 3TAJA 5IKBA 3VE1B 1MH4A 3QAXA 1B5HA 1MPBA 3OSRA 3VXBA 5TU0A 3FATA 2IA4A 3K0VA 3CRBA 2D21A 1UIVA 3KEIA 5TP9B 1BTJA 3FJ7A 3H6WA 4PETA 3RN8A 1OQHA 2QS1A 3TPAA 3IB2A 4H8JA 3OD7A 5DTBA 5HPQA 2F34A 1B1HA 3RT6B 3HCQA 4NF4A 1IUDA 3KN3A 4ZE9A 3C9HA 1USYH 4H5FA 2HEUA 3EPEA 3C32A 2Q8JA 3IOUA 1B6HA 2R9JA 4ELPA 2Y7RA 3PPPA 2DWIA 2Y7PA 1RYXA 4KI0E 3IO4A 4OQOA 3H7MA 3KG2A 2H4IA 1MY3A 4TOZA 3FXRA 5ITOA 1Q35A 1I6AA 1NKXA 3ZSFA 4PFYA 5KZTA 4EQ9A 2ZNUA 3VVEA 3CVGA 5F1QA 3H6TA 4ELQA 4OFJA 5H8NB 1B0LA 3G3GA 3HPIA 3MP8A 4L17A 3MVXA 3KSJA 5J1DA 4Q5TA 2F6GA 1MRPA 1PDAA 3SETA 2AL4A 1IXCA 3KOTA 3HN0A 3ECRA 4YB5A 1MPCA 2P1SA 4F22A 1DSNA 2I4BA 4E0XA 4DCYA 3USDA 3SERA 3TELA 4ESWA 1A7LA 4ZS9A 5M2VA 3TTRA 1N7XA 4FECA 4IB2A 1IIWA 1QUIA 5DEXA 3T96B 2FA7A 1B5IA 1Y4TA 3SEYA 3OO8A 1ZBMA 1LSTA 4F19A 3UGWA 1P1UA 3MP6A 3FGSA 3ODBA 1BKAA 3PMXA 2F8DA 4FEDA 3OO9A 2DVZA 3D4CA 2XD2A 2Z8EA 3TODA 2ZNTA 4ESXA 1UIUA 2ZYMA 4NF5A 1AL3A 1AIVA 4LONB 2XXPA 1B46A 1SYHA 5I59A 2PT1A 2Y7WA 3E9XA 2GH9A 4QFKA 4GXSB 4R9FA 4EXKA 5CMCA 4KD5A 3ZKKA 3PGFA 3UP9A 1LAXA 1M5DA 4NF6B 5I56A 3OMBA 3FUZA 4GLIA 1AOVA 4AB5A 5JK4A 3RY3A 4GXAA 1VFDA 3S9EA 4G68B 2XXXA 1LGBC 1B0HA 3MVZA 1UQWA 1IITA 4H1XA 1JEUA 3K2DA 1TFAA 3FVGA 4RXLA 4GD5A 2PT2A 3FXUA 4RPNA 1IZ1A 2UYEA 2HZLA 3EHUA 4HS7A 4HTGA 1XVYA 4NF8B 1LCFA 2XXIA 2DE3A 5I2NB 5JTYA 1KWHA 2UYFA 5L8DA 3MQ9A 2HQ0A 4KYSA 5KDTB 2RC9A 4U1ZA 3MZ1A 5DT6A 1ZTYA 4EF1A 4HCYA 4YZZA 3VVDA 4QRZA 3FASA 4DCXA 3MWBA 1T0KA 4M4GA 4NWCA 4OERA 4IO6A 3FZVA 3B6QA 3IR1A 1Y1MA 2QMXA 3CG1A 5BUUA 1A8FA 1SQYA 4FE8A 3DP4A 4LQ2A 3FV2A 4THIA 1B2HA 2V3TA 4OTEA 3K01A 4U1OA 1WDNA 1MQDA 1OLAA 3RUMA 1B3HA 1LAGE 1CE2A 4EUOA 3GXAA 5AA2A 2F7CA 1I69A 2ESNA 3WAEA 3LBSA 4POWA 1SI1A 4ONYA 1L5TA 1M5EA 3H03A 2Q2CA 4XKRA 1US5A 2GFEA 4KCCA 3EQ1A 3UA8A 4ND9A 5LOMA 2R6GE 5JEIA 1MY4A 4MF3A 2QSXA 1B4ZA 1XHYA 3SDFA 4Z0IA 5DVIA 1UTBA 1URSA 1MM7A 5KCJB 2V3QA 5AA1A 1FQFA 3N5LA 3EHSA 3FJGA 4TQUQ 2UXAA 4Q30B 2Y84A 5DYHA 2A5TB 4OEVA 1MY0A 1QVSA 3EN3A 3PPOA 3ILUB 3B6WA 3VV5A 3K6WA 3T93B 2W7YA 1R9QA 2Z8FA 4PP0A 1LAFE 3CR9A 4P0GA 1J1NA 3VLUA 1PBQA 2KLFA 3H6UA 1B3FA 3LSLA 3LUYA 5CBSA 1Z7NE 2PBWA 3Q26A 1SI0A 1FCKA 3FXQA 4GIZA 2F35A 1GGGA 4I62A 4RPOA 1TFDA 4I1DA 1D4NA 2XXUA 3CG3A 4TLLB 4PFWA 3RT8A 1B5JA 4O3AA 1Y3QA 1ZKBA 4M1VA 4LZ7A 3QK6A 4ZZAA 1XOCA 3O6IA 1Y20A 2QRYA 1OVTA 4FIMA 4R6KA 4GWOA 4ZEKA 1MXVA 1HSJA 4U23A 5H8QA 3TCHA 2DWHA 1Y3NA 4PFUA 5F7VA 2DYXA 4ELOA 3H4ZA 3DLNA 2Q88A 4OFLA 1S50A 4KYEA 4QFOA 3MZBA 5I59B 4G8HA 5I58B 4OVJA 4R2BA 2DOJA 3N26A 4R6YA 5H8FB 4KCDA 4RYAA 5I56B 1Y3PA 2DP8A 5HM4B 1MQJA 1GVCA 4DE8A 4AB6A 4R75A 1P1OA 4N07A 2F97A 1YAEA 3E13X 4I8CA 5K2YA 3FVKA 4LATA 4LA9A 3KFMA 2YLNA 3UORA 4F2OA 2ABHA 1I6BA 2VOZA 2X7PA 3IB1A 3O6HA 2V84A 1POTA 3Q27A 4R74A 2G29A 4U4SA 3E4RA 5FHNA 3C34A 5H8HA 3MUQA 4X1DA 3G3JA 2XXRA 4DIGA 2XXHA 4LZ5A 2I58A 2QS3A 2P2AA 1B4HA 2ZYNA 4IO4A 1XT8A 1B1XA 3H06B 4GL0A 1JW4A 1QULA 5B70A 2DE4A 1DPPA 1LFGA 3D4GA 3KOSA 3OELA 5CBRA 5FHOA 2UVHA 2XXWA 4EDPA 3QXMA 4GVOA 2RCAA 3U8QA 3IAZA 4K3FA 4GFRA 4MLQA 3KN8A 3EHTA 1LFHA 3TCGA 3HV1A 3MPKA 1N7WA 2NXOA 3PD8A 1MXUA 2QPQA 1H44A 4R73A 2O1LA 1IXHA 3G3HA 1EH3A 3CFLA 5AA4B 2FYIA 2YPNA 3QUJA 1IXIA 4NEDA 3IK6B 2OZZA 1N76A 2REJA 2RF1A 2XX9A 1O63A 3L6GA 1DOTA 2B3BA 2OJTA 3U72A 1P1QA 3PUYE 4F39A 1O7TA 3VDFA 5EHSA 2THIA 3U93A 3ILTB 2AYSA 1SVXB 3OO6A 3A09A 4O3BA 2G93A 4WEDA 4BLAA 4XKNA 2DXYA 2OWSA 2H99A 4RNSA 4FJPA 3IJXB 4ZEFA 1B7ZA 3LSWA 3K02A 3MC2A 3TQWA 1IQ7A 1FTKA 3N6UA 1B40A 4BDRA 1S9TA 1AMFA 1JVXA 5A5XA 1B7HA 4DLDA 4ZEIA 2RCBA 3JV9A 1SW4A 2DWJA 3DP8A 4KQPA 1ATGA 2NOOA 5DVFA 1M5CA 3CI8A 4ZEBA 4BDMA 1S7YA 3M3LA 2Q89A 1VFEA 2M8CA 2QJEA 2ANJA 1EZPA 4G68C 4BDNA 4ZZEA 4YB6A 3OEKA 3I5OA 3VLWA 3U1OA 5ICTA 1II5A 2HAUA 4NMYA 5EHMA 2HFBA 3ONMA 3IX1A 3V8XB 1LLSA 2ONSA 3OENA 1Y4CA 2B3FA 2RC8A 3GBBA 4H67A 4F31B 3R6UA 4YU0A 4X1BA 1FTLA 3KN7A 1OIBA 3CFXA 4DDDA 5I2KA 3PPRA 2P0SA 4H0WA 2X26A 3BFTA 3TYHA 4WXJA 4ISUA 4E0WA 1H43A 4R6HA 3CSGA 4GL8A 3OSQA 5CMBA 3T9VA 1N0TA 1QKBA 1R1NA 2QS2A 1MY1A 3PMWA 4UACA 2OLBA 1FQAA 3DP6A 5L9OA 1LB9A 4R2FA 4ZECA 5TP9A 1IEJA 2ZNSA 2GRVA 4MBPA 3WAFA 1LFIA 5H8SA 4YKKA 4PE5B 5FHMA 4XXUA 1ZMGA 1YCJA 1JW1A 2XX7A 4OXVA 3MPLA 4Q0CA 1MG1A 2X7QA 2D3IA 2I3VA 1WODA 4U22A 3KBRA 2OWTA 3K1NA 2F78A 1BP5A 3BKIB 1VE4A 3RTFB 4LZ8A 2I0BA 1B3EA 1YTVA 3O6GA 4X9TA 2PX1A 2XXYA 4F3BA 1IXGA 4IO7A 1M5FA 5CI5A 5ELVA 3QSLA 1MH3A 4EXLA 1A54A 4NF4B 2I3WA 3S9NC 1LCTA 1CB6A 1N3WA 1PC3A 3KSXA 1EU8A 4OYVA 1NNKA 3C36A 3RLFE 3G3IA 4IGTA 3A3UA 1FQDA 3VLVA 1OQGA 2ZYOA 1VR5A 1XS5A 3BFUA 3TUSA 3MP1A 2UVGA 5FTHA 4PFTA 1UTHA 4H5GA 4JBZA 3Q28A 3MVWA 3T9HB 2Q9TA 2O6AA 4FAJA 2OK2A 2PYYA 2O1MA 1FTOA 3Q25A 3RNNA 3G7WA 3T66A 3KZGA 3Q29A 4C0RA 2XHDA 3I3VA 3C35A 1ELJA 1POY1 3G3KA 4QHQA 5CRYA 5CC2A 4AQ4A 4QFNA 3CFZA 3UIFA 2UVJA 2Q2AA 2PMSA 1MXYA 4YMBA 1US4A 2BJJX 4C1UA 3RQTA 5ITPA 1Y9UA 2DSFA 3T9XB 4PQJA 3O97A 3K6VA 3OOAA 4IY5A 2VD3A 2F6PA 4RK9A 1LBBA 1LAHE 2HAVA 2I4CA 5DEXB 2PVUA 1O64A 1P99A 2OBGA 4NF6A 3T22A 4KPTA 1RYOA 4BDQA 5L9SA 1XVXA 3IO6A 4QFPA 3HO7A 3EF7A 4G68A 1YPNA 1AH5A 2IEEA 4FORA 3S9LC 4NF5B 3P7IA 1RKMA 4F3GA 3LR1A 2F36A 1NH8A 1FQCA 1H76A 3TZAA 4LQ5A 1QKAA 1B52A 4RY1A 2CZLA 5ISUA 3W9WA 2O69A 2DS9A 4OEUA 2CMOA 4NF8A 4NTLA 5I2NA 4F3SA 4EF2A 4HW8A 1B3LA 3IB0A 4YKPA 3RPWA 4QSEA 2VP1A 3UN6A 4YKIA 1P1NA 3DELB 4G8NA 1B3GA 1QJMA 4JXIA 3VVFA 3L6HA 2ALUA 3SESA 2RKMA 2V25A 3FJMA 2NVUB 4LVQA 1DPEA 2Z22A 5HBCA 1ZIUA 5JTYB 1SW1A 4JWOA 4FEBA 3R26A 4F1YA 2GHBA 3MZ9A 3PPNA 3VFJA 3B7DA 1F9BA 2DVCA 3K00A 1B58A 4IY6A 5EYFA 3FVNA 3GLBA 4F1UA 3PUZE 1FTMA 1JQFA 4WEPA 2I48A 4RK2A 3E3KA 4EQBA 3S4UA 2QL3A 1MS7A 3O29A 3TTLA 1B7UA 3TTKA 3ZKLA 4R9GA 4F29A 1ZU0A 1VSOA 1LB8A 3C4MA 1SBPA 3IORA 5I57A 4U4XA 3OXNA 4ECFA 3R7XA 5AA2B 3IJOB 3V83A 2VGQA 4OESA 5KCJA 2ZXTA 3B6TA 4MFIA 1WVJA 4P0IA 3AXFA 1FTJA 2H9BA 4GQOA 3G3FA 3W15C 1NFTA 3JYRA 4IGRA 3K6XA 4FATA 4ELRA 2A5TA 5AA3A 4Z7EA 1PEBA 3MBPA 1MPDA 2GHAA 4JSOA 4F3PA 3F11A 3KGCA 1XC1A 1UTBB 3N94A 3IOVA 1PB8A 3K6UA 1Q1KA 3MAMA 5K2XA 1SDXA 1R6ZA 4XKQA 3TQLA 2ZYKA 2HCAA 1UTHB 2E1SA 3GBAA 4H8IA 2R71A 3HHFA 4TLMB 3ZS6A 1DMBA 5AE4A 1MM6A 2DE2A 5TPAA 3LSXA 3PPQA 1JW5A 3IOWA 1MQHA 3MW0A 2XXTA 1A40A 2HZKA 1NL5A 3TTMA 4KYDA 4ZE8A 3KJTA 4OMBA 2QS4A 4U2RA 1JVYA 1HSLA 2ONRA 1JEVA 4YAHX 3PV0E 1B32A 4WKMA 4NE4A 3TKDA 3SEWA 4EQ7A 4JWXA 1JNFA 5I84A 4RJZA 4YMAA 5I58A 3RGYA 3OO7A 4N6PA 1MQGA 3PUWE 5H8FA 3PUVE 1DTZA 3QUFA 1SYIA 3K1MA 1MY2A 5H8QB 4XKPA 2XX8A 5BWJA 3H6VA 2H98A 4P11A 4MH5A 2LAOA 3SEXA 1SW5A 3VXCA 4YB7A 1SD3A 4JB7A 4LUBA 4C1TA 1GV8A 3CIJA 1QW0A 2REGA 3I6VA 5CMMA 4IO3A 1NNFA 1LBCA 1MDP1 3N6TA 3DM0A 2FNCA 2H5YA 4YICA 2QMWA 2F7BA 3QIMA 2DXRA 2HXWA 1USYE 1JETA 3SKPA 3PMVA 1NNTA 1URGA 2DQVA 4R72A 2E0SA 2I0CA 1PBPA 4JDFA 3V89B 3FD3A 4DXUA 4Q8RA 1B05A 1TXFA 2F7AA 1BLFA 4H65A 1OMPA 2XD3A 1TWYA 3OEMA 3KJ7A 1FW0A 5H8HB 3O28A 1N04A 3MVYA 1N84A 1A99A 2AL5A 4O3CA 3U94A 1N3XA 2OCUA 3O9PA 1P1WA 1PB9A 2H25A 1D3KA 2Z8DA 2NWJA 2O7IA 5ICQA 3FV1A 4GOTA 4OHNA 4MLVA 4QSDA 3LC8A 4I9DA 4POXA 1QUKA 4IO5A 3TCFA 4OENA 5AA4A 1GR2A 4ZEDA 1B9JA 3HHGA 2O68A 3K1PA 3O2AA 3T9UA 2DWAA 3JZJA 4BDOA 5IAIA 5H8NA 4OFOA 3SEUA 1MDQA 3TDJA 2YJPA 4GRKA 3IOTA 3THIA 1DTGA 4F1VA 1NNPA 1ZLQA 2WKYA 4G8MA 1MQIA 3TEPA 1D9YA 1SW2A 3BBRA 5I57B 2ZMBA 2XXVA 4XIGQ 3U92A 1Y1ZA 1EZOA 5L9MA 4RA1A 1BIYA 1HSEA 2O7UA 3PU5A 3M3FA 4G2ZA 3MJNA 3QYTA 3M3KA 5B7DA 2NUVA 4KR5A 3HSTA 2O84X 4DXCA 1FQEA 4JSDA 3TMGA 2I6EA 2D5WA 3RTWB 3SEVA 4KFQA 2UVIA 1NMUA 2Y7IA 1H3DA 1OVBA 4GF8A 3S2VA 2XXQA 1ZJLA 3V5AA 3PD9A 1GTKA 2AIXA 4KHZE 1EZ9A 2B65A 5CM6A 3CSBA 3A3CA 4QSCA 3S9MC 1PB7A 4XTCQ 3UK4A 4YKJA 1M5BA 3C31A 4JWYA 2VD2A 2ONKE 4DZ1A 5TPAB 4X48A 4IO2A 4OETA 3FVOA 1MXZA 3FIRA 3LSFB 4DXBA 1R9LA 1A55A 5A5XB 2F5XA 4F2QA 2V3UA 1ANFA 1NH7A 4UA8A 4G77A 4U21A 4OWDA 4ZDMA 3W9VA 1B51A 3M8UA 1URDA 4LP2B 1I6QA 2V93A 4N13A 3TFLA 1QUJA 2VHAA 2RINA 4OZ9A 1MXXA 4QF9A 4QFLA 5FTIA 1A8EA 3GZGA 1D9VA 3C33A 1MXWA 5AA2D 2Y7KA 3K4UA 4G4PA 2I49A 3TTNA 4H6DA 1H45A 2O51A 3PUXE 3IL1B 1Z7ME 3O66A 5CMKA 5KDTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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