4F2QA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA02
2OZZA 3PPPA 2NUVA 3MP6A 3OSRA 4KQPA 4M1VA 3TTLA 2P0SA 5DT6A 4U23A 1ZIUA 1B5HA 5TU0A 4G8MA 4OEUA 4ELPA 1R9LA 4HS7A 4OFOA 4F3BA 1H44A 4G68B 3HV1A 4JWXA 5H8FA 2OWTA 3EQ1A 3QUJA 4F22A 1B3GA 3H3GA 1CB6A 1MRPA 3PUWE 4YAHX 1JETA 4JB7A 1AH5A 3FVKA 1OIBA 2Q89A 3TTRA 3L6GA 1GR2A 4LZ8A 1M5CA 3VXBA 4FJPA 3EHTA 5HM4B 4KD5A 5I56A 1FQFA 4FAJA 2UYFA 3N94A 2UXAA 3O6IA 5I59B 1WVJA 2FA7A 4OENA 2RC7A 1Y1MA 2R9JA 3N6TA 4Z7EA 2A5TA 1P99A 2F34A 3BFTA 2I49A 1FTOA 2O84X 3DP8A 2H5YA 1B9JA 1MPCA 2RKMA 4RK2A 1SI1A 3TZAA 2QMXA 2THIA 1H43A 1JW4A 2I4BA 2DE2A 2AL4A 5L8DA 4FECA 4IO5A 5EHSA 1B7ZA 4QSDA 1FQAA 3FD3A 1MXUA 5CMBA 4BDLA 3TQWA 2RCBA 4Q30B 3TEPA 1O64A 1P1QA 4EQ9A 2I3VA 3FATA 1QULA 3HSTA 1EU8A 4THIA 1USYE 2HFBA 4LA9A 4NTLA 1SYHA 1RYXA 3MZ1A 4F19A 4ESWA 1OVTA 1US5A 4F2OA 4RPNA 3BFUA 1LSTA 1F9BA 1NNTA 1B51A 3ODBA 4QHQA 1NH7A 2GHBA 1MQGA 2DWJA 3GLBA 1FQDA 5JTYA 1LAFE 3RQTA 5K2XA 1NNPA 4RK9A 4X1DA 3SETA 1LFGA 3IOUA 3IOWA 1B6HA 1DOTA 2PT2A 2XXRA 4C1UA 4OYVA 1Y4TA 1VFDA 5H8QA 5ISUA 4DXCA 2DVZA 4HCWA 2V84A 1BLFA 2Y7PA 4R74A 1A7LA 2I4CA 1N7XA 3CSGA 4FIMA 4R9GA 3H7MA 4FATA 3UA8A 4QRZA 1AIVA 5H8SA 1D9YA 3MZ9A 1NMUA 3UN6A 3VLUA 3S9NC 1IIWA 1YAEA 5TP9A 1FQCA 2A5SA 3Q29A 1SYIA 4H0WA 3C9HA 1XVYA 3FUZA 3OO9A 5BWJA 3RN8A 4KR5A 4NF8B 1A8FA 3IOVA 3KFMA 2DQVA 3JZJA 3FV1A 1Y4CA 3MUQA 4O3AA 3TCFA 4ZDMA 1ZTYA 2ZNTA 1LFHA 2F6GA 1LB9A 5B7DA 5A5XB 3U92A 1B3EA 4LQ2A 1SW5A 2QS3A 3I6VA 4RA1A 2XXWA 3TODA 5CMKA 2ZYKA 1D3KA 1XS5A 2F35A 3PMWA 2I48A 4U4SA 4AQ4A 3O2AA 4KYSA 4TLLB 1Z7ME 3OO8A 1MQHA 2Q2AA 3IX1A 1MDP1 4MLQA 1EZOA 3ZKKA 2REGA 5CBRA 3P7IA 4OTEA 4RXLA 2LAOA 5H8FB 3VDFA 3A3CA 4OVJA 5L9SA 4IGRA 3B6WA 3FIRA 1SI0A 1B5JA 5J1DA 2QSXA 3CFZA 3KOSA 1B1HA 1MY1A 3RY3A 4QFLA 3SERA 1JVYA 4ECFA 3QAXA 3FVGA 2Z8FA 1MQIA 3V83A 3LR1A 4GXAA 3E13X 3G3IA 4POWA 4EXKA 2G93A 2NXOA 4DCXA 3T9HB 4F2QA 1OVBA 2A5TB 1UQWA 3USDA 2DE4A 4RJZA 5H8NA 3PPNA 4X9TA 2YPNA 3TUSA 2RCAA 3KSXA 4EQBA 3LUYA 2Q9TA 1AMFA 3DLNA 1TWYA 2H4IA 2AYSA 1WODA 4ZECA 5AE4A 3OMBA 3U8QA 2X7QA 3W9WA 1SW2A 2I3WA 3IR1A 4F18A 1QUIA 5I2KA 2IA4A 4LP2B 3T93B 4OEVA 4PP0A 2F7BA 4H8JA 1IQ7A 2CMOA 3U93A 2XXQA 4NF4A 1B4ZA 3B6TA 1IXCA 4GOTA 2Y7KA 3OSQA 4I62A 2RINA 3W9VA 3SEXA 3H03A 3H6VA 4QSCA 3UORA 5JTYB 4OFLA 3C36A 2XXYA 3OOAA 1Y20A 2D5WA 3PV0E 3CFLA 1A55A 1LCFA 1XOCA 4P11A 3HHFA 1O63A 1URSA 5AA3A 4DE8A 4AB5A 3HHGA 3UK4A 5CMMA 5EHMA 2ONSA 1URGA 4ZEIA 2V3QA 3TQLA 4ND9A 3IJXB 1UTBA 3GZGA 4WEPA 3RTWB 1AOVA 5AA2A 1VFEA 2HXWA 2VHAA 3TDJA 5LOMA 5BUUA 3LC8A 3OEKA 4U2RA 1QJMA 3O29A 5TP9B 2I0CA 3FV2A 2RC8A 2ZNUA 2BJJX 3BKIB 1MY0A 1N76A 3T9UA 1ZU0A 3U72A 2QS2A 4EQ7A 2DWHA 4LATA 2B3FA 4C1TA 2XD3A 3RPWA 1SW4A 1B0HA 1Z7NE 1FTKA 2D21A 3OELA 4IO4A 4JWOA 2H9BA 3U1OA 1B52A 2Z22A 3PGFA 1SD3A 2I6EA 4TOZA 1UIVA 4G77A 4NWDA 3MC2A 4H5FA 3B7DA 1YCJA 3F11A 2PT1A 4BDRA 4BDQA 4ONYA 3MPKA 4R2FA 4IGTA 5FTIA 2O1MA 2M8CA 4ZS9A 2FYIA 3H6UA 5DVJA 3TMGA 4BDOA 3DM0A 3I3VA 3GBAA 3THIA 3EPEA 3PD9A 5DTBA 4FEBA 4NF5A 3MQ9A 1M5FA 1ZMGA 2DS9A 5ITOA 1MY4A 4E0XA 2H99A 3CRBA 2QJEA 3C31A 2UYEA 3SESA 4QFOA 3FXQA 2HZKA 1BKAA 2W7YA 2ZMBA 4F1VA 2Z8DA 3VVDA 1CE2A 3S9EA 2O7UA 1Y3NA 3IO6A 3K1PA 3TCGA 4Q8RA 1B3FA 4P0IA 3T66A 1DSNA 3CSBA 3CFXA 1URDA 1LAHE 2DP8A 3K4UA 2NVUB 1FQBA 3FZVA 3G3KA 3T9VA 4G4PA 3PUXE 1PEBA 5IKBA 5CBSA 3TKDA 2V25A 5DVFA 3AXFA 4EXLA 1QW0A 3V5AA 3LSXA 4MFIA 2I0BA 1Q1KA 1FTMA 5I2KB 4Q5TA 1A99A 5CI5A 5ELVA 2ZXTA 2OK2A 3SEUA 4I8CA 4LVQA 3SKPA 5I2NA 2HQ0A 1LLSA 1N3WA 4ISUA 3TELA 3OXNA 4LQ5A 1MPDA 3RTFB 4H65A 4NF4B 3R7XA 3VV5A 3RLFE 2OJTA 4R6YA 3IB0A 2XX8A 1QKAA 5H8HA 1POTA 1S9TA 2ABHA 4YKJA 3K01A 3CIJA 5FHOA 2O6AA 4FORA 4ESXA 3PPOA 1HSEA 1XHYA 3N6UA 2D3IA 4LUBA 3Q25A 3RUMA 4DZ1A 1M5DA 4QFKA 1A40A 4KYEA 4DXUA 1N84A 4EUOA 2CZLA 5CMCA 1QKBA 2Y7IA 4QSEA 3TFLA 3IK6B 3LBSA 2ONRA 3M3KA 2XXHA 1ELJA 4R9FA 3N5LA 2Y84A 1S7YA 1IXHA 1N3XA 4X48A 3PU5A 2VOZA 5AA2B 4I1DA 3V8XB 4ELOA 1NL5A 3EF7A 3MJNA 4OZ9A 4XKQA 2O68A 3C32A 2GFEA 4JWYA 1B05A 4NEDA 1R6ZA 5DEXA 3H4ZA 4ZEDA 2F7AA 3SDFA 4JSOA 2O1LA 4FEDA 1LB8A 4FE8A 1PBPA 3H06B 4M4GA 3T96B 5M2VA 1EZPA 1B58A 3KG2A 2AL5A 3R26A 1MXXA 1H3DA 4OFJA 3OENA 1DMBA 3UP9A 3L6HA 3QUFA 5AA1A 1NFTA 4YMAA 2QS1A 2GH9A 5IAIA 2XXTA 2ZYNA 3U94A 3TTKA 3A09A 4POXA 4JDFA 5AA2D 1HSLA 3VLWA 3MVZA 2F7CA 3EHSA 3KJ7A 3TCHA 4IO7A 1NNFA 3ILTB 4YMBA 4H6DA 4O3CA 1Q35A 2UVIA 4NF5B 3DELB 1Y3QA 1GV8A 4BDNA 3OO6A 4YKPA 1UTHA 3BBRA 2DXYA 3D4GA 3K6UA 2F5XA 4OHNA 3T9XB 5JEIA 1SVXB 1B1XA 4GFRA 2O69A 1MH4A 4AB6A 1MXZA 3FASA 4UACA 1AL3A 4ZZEA 1B46A 5I56B 1IXIA 1RKMA 3CG1A 2O7IA 4GL0A 2PVUA 1ATGA 1VSOA 4IY6A 4NF6A 1IEJA 2B65A 3G3GA 4JXIA 3O66A 3K00A 2Z23A 3IB1A 3LSWA 4ZEBA 1QUJA 1O7TA 2KLFA 3QYTA 3KOTA 3V89B 3TAJA 2DSFA 3M3LA 5AA4A 1DPPA 1B32A 4R72A 4R75A 3FJMA 3MVYA 3TTNA 1DTGA 1EH3A 2XXVA 1I6BA 2XX9A 1MQJA 4Q0CA 2H25A 1MXVA 5TPAA 3QK6A 4N07A 4EF2A 1II5A 2GRVA 5KDTA 2OCUA 4ZEFA 5FTHA 3O6HA 4Z0IA 3MVWA 2VD2A 1UIUA 4XTCQ 3Q28A 1XT8A 3GBBA 4E0WA 3KZGA 3MP8A 1GVCA 3OEMA 3TPAA 4DIGA 3MP1A 4O3BA 2ZNSA 1JQFA 1Y3PA 1IUDA 1SDXA 4YU0A 5H8QB 3D4CA 1MDQA 3LSFB 3H6TA 3C35A 3C33A 1B0LA 3G7WA 4U21A 4F1UA 2X26A 1ZJLA 3CI8A 2R6GE 2O51A 3FGSA 3K1MA 3KBRA 4YKKA 3H6WA 1PDAA 4KYDA 2P2AA 2Y7RA 4BDMA 2VD3A 4QFNA 4KCDA 1TFAA 3K6XA 3TTMA 1KWHA 1YTVA 1OQGA 3LSLA 4HW8A 1NH8A 4LONB 4H8IA 4U1OA 2ANJA 4HTGA 4GWOA 4MLVA 3HCQA 4OMBA 3QSLA 3CG3A 5CRYA 2HAVA 4XIGQ 3WAFA 1LAGE 4GVOA 3ILUB 1DPEA 4PFTA 4G8NA 4F31B 2AIXA 1QVSA 1B7UA 4QFPA 4MBPA 4TLMB 1SQYA 3TYHA 2XXUA 4DXBA 3T22A 4KPTA 3S2VA 4ZE9A 3Q26A 1IZ1A 3MVXA 1JEUA 1N0TA 4NMYA 1MM7A 2YJPA 4PETA 4WEDA 2G29A 1LFIA 5HBCA 1UTHB 2HZLA 3K6VA 2REJA 1NNKA 1TXFA 3QIMA 1NKXA 3IL1B 4OWDA 4GXSB 1PC3A 1HSJA 4GQOA 3M3FA 4OERA 4OESA 1WDNA 2VGQA 4UA8A 1US4A 1BP5A 4ZE8A 3SEYA 1LAXA 1PB9A 1N04A 4H5GA 4PFWA 3EN3A 4NF6B 2HCAA 4MF3A 3N26A 5CC2A 4LZ7A 3VXCA 2IEEA 5H8NB 3ZSFA 5ICQA 2DWIA 3O97A 2NOOA 4KCCA 2QRYA 4IO2A 4KHZE 3UGWA 1GGGA 2DOJA 5AA4B 2PX1A 1FQEA 4H67A 4GIZA 3ZKLA 1QUKA 1FTLA 3KEIA 3VE1B 4ZEKA 3EHUA 4YB6A 5I58A 2ZYMA 2XXIA 1A8EA 1ZBMA 1MH3A 5TPAB 1LGBC 1JNFA 1IXGA 1JW5A 2V93A 5KDTB 4PFYA 5KCJA 4DLDA 3RT8A 1M5EA 4IO3A 1MY2A 4U4XA 2H98A 3O6GA 2YLNA 2X7PA 1FTJA 2DXRA 3RT6B 2B3BA 1MY3A 3PMXA 5B70A 4WXJA 5DVIA 3FJ7A 1JEVA 4KI0E 1POY1 3G3JA 3MBPA 4RYAA 2ESNA 3O9PA 3KJTA 3A3UA 4IY5A 3C4MA 4G68C 4ELRA 1B4HA 3DP6A 3Q27A 1BTJA 3CVGA 4YICA 3M8UA 4MH5A 3PUVE 3ONMA 1ZKBA 1Y1ZA 5EYFA 1UTBB 1OLAA 4H1XA 4NE4A 2Q88A 1N7WA 1D9VA 4OETA 3PD8A 2PYYA 4R2BA 4PFUA 2HAUA 3WAEA 5FHMA 2QPQA 3MAMA 1TFDA 4PE5B 1EZ9A 2XX7A 3FXRA 3IJOB 2DWAA 3FVNA 2OBGA 2E0SA 1BIYA 2DYXA 4WKMA 4QF9A 4I9DA 1SBPA 2OWSA 5I84A 3S4UA 4ZZAA 1P1OA 1R1NA 3E9XA 4RPOA 3S9LC 1T0KA 2QL3A 3IOTA 3MPLA 1MS7A 3RGYA 1L5TA 1XC1A 1ZLQA 2Q8JA 2UVHA 3OO7A 1FW0A 2UVGA 4YKIA 3G3HA 1XVXA 4R73A 4HCYA 4RNSA 3HN0A 1B3LA 5HPQA 3VVFA 3KN3A 2XD2A 3E4RA 1GTKA 3FXUA 4IB2A 4GRKA 1TT1A 1VE4A 3IORA 3K6WA 4OXVA 1YPNA 1MG1A 1JVXA 1SW1A 3ZS6A 2NWJA 2QS4A 5I57A 2HEUA 2DVCA 5FHNA 4N6PA 1VR5A 2UVJA 1I69A 4YB5A 3IO4A 4DCYA 1USYH 1MPBA 2XXPA 4R6HA 1J1NA 3VLVA 1M5BA 2ONKE 3B6QA 4F3SA 3ECRA 1I6AA 3JYRA 3IAZA 1A54A 3RNNA 1B3HA 4G68A 3SEWA 4F1YA 3K2DA 3KSJA 1LBCA 4IO6A 3FJGA 1FCKA 1LCTA 4DDDA 5KZTA 2F78A 5ITPA 2GHAA 3KGCA 1OQHA 5I58B 1OMPA 5ICTA 1R9QA 5L9OA 5I59A 5KCJB 4TQUQ 2F36A 4EDPA 4G8HA 4JSDA 3FVOA 5I2NB 1B7HA 2RC9A 4RY1A 3PMVA 4U1ZA 3DP4A 1DTZA 4X1BA 3IB2A 4JBZA 5H8HB 3JV9A 2XXXA 1D4NA 1IITA 1ANFA 1PBQA 2F8DA 2QMWA 4YB7A 2I58A 3S9MC 2Y7WA 4YZZA 1PB7A 5CM6A 4PQJA 2P1SA 1P1UA 3KN8A 4GF8A 3E3KA 4XXUA 4GD5A 3SEVA 4ELQA 1B40A 5K2YA 3PPQA 4G2ZA 2DE3A 3KN7A 3VVEA 4F3PA 3W15C 2V3UA 3GXAA 1MM6A 3R6UA 4N13A 4F3GA 1B5IA 2RF1A 4XKNA 2ZYOA 1H45A 4U22A 3G3FA 5L9MA 2F97A 2PBWA 2V3TA 5JK4A 2PMSA 5F1QA 2F6PA 5DEXB 1I6QA 4F39A 2Z8EA 4GLIA 1H76A 4EF1A 1MXYA 4XKPA 2OLBA 4P0GA 2R71A 1Y9UA 1S50A 4R6KA 3HPIA 3UIFA 1OLCA 4KFQA 1MQDA 3O28A 4XKRA 4K3FA 1LBBA 3OD7A 3PPRA 3VFJA 5DYHA 4NWCA 1P1WA 4L17A 1RYOA 4BLAA 3PUZE 3MWBA 4GL8A 1MXWA 2E1SA 3I5OA 1JW1A 3MW0A 2FNCA 3MZBA 1P1NA 3K0VA 2XHDA 4OQOA 4NF8A 2VP1A 4F29A 3K02A 1PB8A 3PUYE 5F7VA 2Q2CA 1B2HA 3HO7A 4LZ5A 5I57B 2ALUA 2WKYA 3C34A 4C0RA 3CR9A 5A5XA 3QXMA 3K1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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