4F3BA

Glutamate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein/substrate
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA02
4LVQA 2F36A 2Q8JA 4R2FA 1CE2A 3ODBA 3U8QA 3N5LA 1Z7NE 3OOAA 5H8NB 3EPEA 4QFNA 4YKKA 1GVCA 4QF9A 4R2BA 4QHQA 1OVBA 4ELOA 2KLFA 1MQGA 2DWHA 3Q29A 4KHZE 2I58A 3EHSA 3FJGA 4U4XA 1LB9A 3IOTA 5DVFA 3V8XB 2ONRA 1B2HA 5CMKA 4X48A 1MPBA 4OMBA 2DWIA 3TPAA 2OWTA 2Z23A 2PMSA 5K2XA 2DVCA 5FHOA 2I0CA 5DYHA 3OO7A 5TPAB 4N6PA 1B7ZA 3S9NC 1B4HA 3LSWA 4RK9A 5ITPA 1PC3A 2ZYMA 3KJTA 4FEDA 2UVGA 2R71A 4ECFA 1RYXA 4I1DA 3U72A 1SW5A 3USDA 4RYAA 3TCHA 4IGTA 1QUJA 2ZNSA 3K00A 2WKYA 3IOWA 3R26A 2Y7RA 2DYXA 4H8JA 3MUQA 3SESA 2B65A 4PETA 1B52A 3T9XB 4EQ9A 3VVFA 3VDFA 4QSEA 1LB8A 4HCWA 3QUFA 1MY3A 3CG3A 1EZOA 2QS1A 4OXVA 3RT6B 2XXTA 4G68A 2QSXA 4GXSB 4IO3A 1NH7A 1OVTA 1USYH 3CFXA 4M1VA 2O51A 4ZS9A 1N84A 1URDA 4F1YA 1IZ1A 1B46A 4THIA 1NKXA 4P0IA 4TLLB 1ZKBA 3G3GA 2AIXA 4ZEKA 2XXVA 4JWXA 1B0HA 4XKQA 3EHTA 3C9HA 5DTBA 1H45A 3VVDA 1UQWA 1FQFA 2AL5A 1MRPA 3HHFA 4EXKA 2Y7WA 3MZ9A 2E0SA 1A55A 5EHMA 4JB7A 2O7IA 3H6TA 5AA2B 1A99A 1MG1A 5CBRA 1XS5A 1OIBA 1PBQA 3BFUA 3HSTA 4ZZAA 1XVXA 4F3PA 3A3UA 3O97A 3VFJA 1IXIA 4JWYA 2RC7A 1GV8A 4IB2A 4KD5A 2OWSA 4E0WA 3LR1A 2ZYKA 4XIGQ 4HCYA 1AIVA 2G93A 1HSEA 2UXAA 4BDOA 1D4NA 3H4ZA 5K2YA 1CB6A 4MFIA 4HTGA 1RKMA 5AE4A 3E9XA 5L9MA 1A40A 1HSJA 1GR2A 4TLMB 2ZYOA 1ATGA 3I5OA 1M5CA 4XKPA 2RC9A 3TCFA 4OZ9A 4IY6A 1LCFA 1MPCA 4P11A 1ZTYA 1S7YA 2H9BA 2F7CA 1MS7A 5H8NA 2HXWA 3FD3A 3MVYA 3IJXB 3THIA 3T96B 1NMUA 2ZNTA 3PGFA 2FYIA 1B0LA 3M3KA 3OEMA 3KBRA 1Y4CA 1ZBMA 3VE1B 3M3FA 3OO9A 4WEDA 3PMXA 3I3VA 3IB1A 4OEUA 4F22A 3GXAA 3S2VA 2QJEA 1EZPA 1AH5A 4LQ2A 5H8HB 2R9JA 2O1MA 4E0XA 3EQ1A 2RF1A 3VXCA 4KCCA 3SETA 2XXYA 5JTYB 5HBCA 2F7AA 3QSLA 2QS4A 1HSLA 1JW4A 2OK2A 3SKPA 4H5FA 1OQGA 1Q1KA 4ZEBA 3EHUA 4F3BA 3DP6A 1A8EA 1L5TA 5DVJA 4DLDA 3IOUA 1VSOA 3PPRA 3TKDA 4WXJA 1OLAA 1BIYA 1P1UA 4AQ4A 3H6WA 4G8NA 5I59B 4LQ5A 3FASA 1FQCA 2PVUA 3O2AA 3T66A 2DSFA 1S9TA 3GZGA 4G77A 3TUSA 4MLVA 4QFOA 1B5JA 4NF6A 3D4GA 3KSXA 1BLFA 1P99A 1QKBA 4C0RA 3RN8A 4XKRA 3GLBA 2Z8DA 3CFZA 4FORA 1YAEA 1DTGA 3HV1A 3W9VA 2DOJA 2XXPA 3CVGA 4OESA 4POWA 3E13X 1M5DA 4GQOA 4XKNA 2O7UA 1XOCA 3A3CA 1MY2A 4H0WA 3FZVA 2DWJA 4OFOA 3MBPA 4LP2B 3C32A 5I2KB 2UVIA 4FEBA 1ZU0A 4EXLA 4H67A 1UTHA 4ZE9A 3IO6A 1XVYA 3BKIB 2DQVA 3W9WA 3UIFA 1MH4A 2PT2A 1LLSA 1NNTA 1SW1A 1ELJA 3V5AA 4TOZA 3MZBA 1MPDA 4Q30B 5CC2A 4JBZA 2VOZA 1KWHA 3P7IA 2VGQA 3MQ9A 3FV1A 1JEUA 1WVJA 4KCDA 4OQOA 1DMBA 1B05A 3QYTA 2HZKA 2QRYA 1S50A 3K0VA 2B3FA 2V93A 2DP8A 1SI0A 1SVXB 4OENA 2CZLA 1N0TA 3U1OA 1BP5A 1Z7ME 2HEUA 2M8CA 4F2OA 3N94A 2I3WA 2DVZA 3B6QA 4YICA 4LZ7A 4G2ZA 3JV9A 4JSOA 5FHNA 2I3VA 5JK4A 3MVXA 1P1QA 3H3GA 1P1NA 2HAUA 3VV5A 4AB5A 5AA2D 3K1NA 2IEEA 1Y1MA 3C31A 4JSDA 1FTOA 4I62A 4WEPA 1POTA 1O64A 3K4UA 1Y9UA 3H6VA 3PPOA 4LZ5A 4QFKA 2GFEA 5H8QA 4OFLA 1I69A 2H25A 3Q28A 5H8HA 3TODA 4JXIA 3VLWA 5HM4B 5L8DA 3HPIA 1TWYA 2E1SA 2UVJA 4NMYA 5JTYA 3PUYE 3FVNA 5EYFA 1UTBB 4I9DA 4RPOA 1QJMA 1MXVA 4OYVA 1Y4TA 3OXNA 2F6PA 3K6UA 3MVWA 3RGYA 4ESWA 4RJZA 1JW5A 2I4BA 3QXMA 3UGWA 5I58A 1RYOA 4GL8A 3TYHA 3ONMA 4M4GA 4GD5A 4O3AA 5I59A 3ZSFA 2YPNA 4IO2A 3FVOA 2Z8EA 4OWDA 1OLCA 2V25A 4Q8RA 3SEYA 2Y7KA 5TP9B 4NF8B 5I56B 3TQLA 3IAZA 4U4SA 4YB5A 2ONSA 2QPQA 2XXWA 1MY1A 3RLFE 3KZGA 3HCQA 3OENA 2H99A 3O29A 4EF2A 3K01A 2Q9TA 2YJPA 3O6IA 3ZKKA 1PDAA 3PMWA 3H06B 4KI0E 3ZKLA 3FXQA 4BDQA 3LC8A 4MF3A 3TDJA 1PB9A 5I2KA 1B7HA 3IX1A 1AMFA 4PFUA 2F34A 4GIZA 4R6YA 5EHSA 5B7DA 3UA8A 3MPLA 1WODA 3G3FA 2BJJX 3WAEA 4NF4B 4YMAA 2A5TB 4K3FA 3FXRA 1B1HA 3KN8A 3RNNA 5A5XB 3C4MA 4KPTA 2P1SA 2YLNA 3MP6A 4R6HA 2XX7A 4PE5B 3FJ7A 3RY3A 4XXUA 1YPNA 3FATA 4POXA 2V3UA 3K6WA 2Y84A 2FNCA 1R9LA 2DE3A 1UIVA 3MC2A 4LONB 3VVEA 3KFMA 2Z8FA 4ESXA 3B6TA 4LUBA 4U1ZA 3MVZA 1LBCA 1Y1ZA 4R73A 4OFJA 1SD3A 4OEVA 3OMBA 1USYE 3W15C 1AL3A 2O84X 5JEIA 4FAJA 2F8DA 1SQYA 2XXQA 2Q88A 3GBBA 2XXHA 2VP1A 5H8FB 4G8MA 1N04A 2HFBA 1B6HA 2H5YA 3MWBA 1QVSA 1R1NA 2RCBA 2ZYNA 1B3EA 1FTJA 1UTBA 2UVHA 3ZS6A 1LAFE 4X9TA 2ANJA 4GOTA 4H5GA 3RUMA 4Z7EA 1JETA 1MQIA 3JYRA 3ECRA 2XXRA 4U23A 2DE2A 3KOSA 1PEBA 2GH9A 1EU8A 4ELRA 1MQDA 1T0KA 1JVYA 5TPAA 2O68A 4I8CA 1FTLA 1FQAA 1D9VA 3K1PA 4GVOA 4ZEFA 4MH5A 2GHAA 1M5EA 5TP9A 5I56A 1NFTA 1PBPA 3C35A 5CBSA 4U1OA 3PUWE 3PMVA 3U92A 3OD7A 4UACA 1I6BA 4Q5TA 4IO4A 4KQPA 4GL0A 4MLQA 3O28A 3S4UA 1EZ9A 4BDRA 1VE4A 4P0GA 5F7VA 3B6WA 1SDXA 1B51A 4F39A 3CSGA 1BKAA 1QKAA 2QS2A 1NH8A 4QFPA 4GFRA 5DT6A 1VR5A 1B3LA 3I6VA 2XXIA 2O1LA 3IK6B 1MM7A 5I57B 4N07A 3HN0A 3C36A 2Z22A 1R6ZA 2PT1A 3G3JA 1P1OA 3ILTB 1MXUA 2G29A 3SEUA 4YB6A 2OCUA 4R74A 3AXFA 3PUVE 2A5TA 1JNFA 2CMOA 2XX8A 2H4IA 3C34A 4ZDMA 4YMBA 5A5XA 1H3DA 3OSQA 3QUJA 5AA2A 5I84A 1MDP1 1DPEA 1B5IA 3OELA 1LFHA 4YU0A 3K02A 1MY4A 2O6AA 4NE4A 2GRVA 1IUDA 2Q2CA 5BUUA 1ZMGA 3MPKA 1JEVA 4U21A 4JWOA 3E4RA 3Q27A 4F29A 2AYSA 2UYEA 3Q26A 3RT8A 2UYFA 3T22A 3G3KA 2NXOA 3IOVA 3PUZE 4QRZA 3SERA 3TCGA 2H98A 4DXCA 4UA8A 3K1MA 5CRYA 4O3BA 5ELVA 3O6GA 2F97A 3G7WA 5I2NB 3PD8A 3IR1A 3TTKA 3UN6A 1LBBA 2D5WA 2XD2A 4U22A 1DSNA 4PFWA 1WDNA 3QK6A 5H8FA 2HZLA 4X1BA 1M5BA 1N3XA 1B40A 5CMCA 3RPWA 3FVKA 4G4PA 4JDFA 1B58A 1PB8A 1MY0A 4IO7A 2Q2AA 5TU0A 2QL3A 4EQBA 5L9OA 1B5HA 4N13A 1NL5A 1MXXA 1VFDA 5F1QA 1JW1A 3R7XA 1TT1A 4YKIA 4RY1A 3PU5A 3TFLA 4F2QA 2X26A 2RINA 1F9BA 2NWJA 4FE8A 3V89B 4XTCQ 4BLAA 3JZJA 3K6XA 2ZMBA 3QAXA 2XXUA 3CR9A 2LAOA 4BDMA 3TELA 3HO7A 2F5XA 3MP1A 5CMMA 5KZTA 4LATA 1N7XA 2VD3A 2Q89A 2PX1A 3FJMA 2VHAA 4EF1A 4ELPA 5FTHA 3TTNA 4OHNA 4YB7A 4C1TA 1MQHA 4EDPA 3CG1A 1QULA 4DIGA 5FTIA 5KCJB 5CM6A 3L6GA 1QW0A 2HCAA 5L9SA 3FXUA 1DOTA 2V3TA 3DLNA 3MZ1A 2ABHA 3LUYA 3OSRA 2I4CA 4HS7A 4YKJA 4OERA 3PUXE 4LZ8A 2V3QA 1OMPA 4GRKA 1PB7A 3GBAA 2OLBA 3DP8A 4QSCA 2ZXTA 3CI8A 2REGA 5DEXB 3K6VA 3C33A 4TQUQ 5I57A 3FGSA 1GTKA 4DXBA 1URGA 3IJOB 1MQJA 3R6UA 2OZZA 2P2AA 4ZECA 3F11A 3EN3A 1DTZA 3T9VA 4H6DA 2HQ0A 3CFLA 4NTLA 2ZNUA 2RCAA 4NEDA 1O63A 3RQTA 5ICQA 1FTKA 1D9YA 4OTEA 3N6UA 1SBPA 2ALUA 5CI5A 5FHMA 4NF6B 1A7LA 1ZJLA 4RNSA 3PPPA 1NNPA 3SEVA 1XHYA 2F78A 2DXYA 3KGCA 2I6EA 3U94A 4U2RA 3O6HA 3E3KA 2DE4A 4IGRA 2OBGA 3CSBA 4ISUA 3WAFA 3UK4A 2F35A 5I2NA 5ICTA 5ITOA 2A5SA 2DWAA 1B3GA 3VLUA 4G68C 3OO6A 4OVJA 4IY5A 4NF5B 1NNKA 1UTHB 3IO4A 1B32A 1FQDA 4ELQA 2I0BA 2D3IA 3LSFB 1Y20A 1FCKA 1M5FA 4R75A 2RC8A 3MP8A 1JQFA 4NWCA 4IO5A 2X7QA 5J1DA 1FW0A 4H65A 3D4CA 3HHGA 5ISUA 4DCYA 3OEKA 2ONKE 1IIWA 4YZZA 5KDTB 5AA4B 2I49A 3FUZA 4G8HA 4GF8A 4Q0CA 4OETA 4F18A 2RKMA 3IORA 5DVIA 3FIRA 2NVUB 3LBSA 4ZEDA 1GGGA 1B3HA 4ZE8A 5IKBA 2V84A 4R6KA 3PPNA 1ANFA 4GXAA 3MAMA 2PYYA 3O9PA 3SEXA 5B70A 4BDNA 3VLVA 3IB2A 2XXXA 3OO8A 1IXHA 4NWDA 2QMWA 1B7UA 1LFIA 1R9QA 4AB6A 5KCJA 2QS3A 2VD2A 1IEJA 1MXWA 3IL1B 2Y7IA 2DXRA 4EUOA 1MM6A 3TQWA 1FTMA 4ND9A 3T9UA 1LFGA 4QFLA 2F7BA 4GLIA 1IQ7A 1MXZA 2X7PA 2XHDA 5H8QB 4F1VA 4YAHX 4F3GA 4NF8A 5M2VA 3M3LA 1N3WA 1N7WA 3KSJA 3PD9A 5DEXA 4KR5A 3MJNA 1SYHA 3DP4A 1SW2A 3CRBA 3VXBA 3KEIA 1XC1A 4O3CA 1JVXA 2GHBA 4H8IA 2PBWA 4QSDA 3BFTA 3UP9A 2DS9A 3U93A 3H6UA 1LSTA 5I58B 1UIUA 4PQJA 3KN3A 3N26A 4RPNA 3B7DA 4X1DA 3MW0A 3RTFB 4ZEIA 3KG2A 3G3HA 5CMBA 2NUVA 1OQHA 1LGBC 3LSLA 3O66A 2O69A 5H8SA 1QUKA 4R9GA 1SI1A 3DELB 1TFAA 2FA7A 1TFDA 1N76A 1ZLQA 5LOMA 2ESNA 4EQ7A 3ILUB 4F31B 3UORA 1DPPA 1YTVA 4PFYA 4Z0IA 4FIMA 1VFEA 4NF4A 3BBRA 1LCTA 3TZAA 4LA9A 4DZ1A 1FQBA 3L6HA 3TTRA 1B3FA 4R72A 3TEPA 4R9FA 1H43A 5AA3A 1IXCA 4HW8A 1MDQA 4PP0A 1I6QA 1EH3A 1IITA 4GWOA 3DM0A 1LAXA 4F1UA 1J1NA 1P1WA 4NF5A 5AA1A 1Y3NA 2HAVA 4G68B 4ZZEA 3M8UA 1US4A 4DCXA 1B1XA 1Y3QA 2R6GE 1H76A 3KN7A 2P0SA 4WKMA 3EF7A 4KYDA 3H7MA 2THIA 1SW4A 3H03A 4RXLA 2AL4A 4ONYA 1Y3PA 4YKPA 3PV0E 3S9EA 3K2DA 2XX9A 2IA4A 1SYIA 2Y7PA 4RK2A 5KDTA 4FECA 4C1UA 5AA4A 1YCJA 4BDLA 1QUIA 3V83A 1MH3A 1H44A 2W7YA 1NNFA 2QMXA 3KJ7A 1D3KA 1A8FA 3SDFA 5IAIA 1Q35A 3KOTA 2REJA 4DDDA 4DE8A 1POY1 3SEWA 3RTWB 3T9HB 4KYSA 1URSA 1XT8A 3IB0A 1AOVA 1LAGE 5BWJA 4IO6A 3TAJA 5HPQA 1A54A 3TTMA 3S9MC 1B9JA 1LAHE 4MBPA 1US5A 1B4ZA 2NOOA 2XD3A 2OJTA 4PFTA 3QIMA 3S9LC 1ZIUA 4H1XA 1I6AA 1IXGA 3PPQA 4KYEA 4F19A 3A09A 4F3SA 2D21A 4KFQA 3TTLA 4FJPA 3Q25A 2F6GA 1FQEA 3FV2A 2B3BA 4FATA 1II5A 1TXFA 3TMGA 4DXUA 1BTJA 4RA1A 3FVGA 3T93B 4L17A 1O7TA 3N6TA 2I48A 3G3IA 3LSXA 3CIJA 1MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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