4F3BA

Glutamate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/substrate
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f3bA02
5L9OA 3K01A 2DXYA 3WAEA 1O63A 3BBRA 1NH8A 5B70A 1ZMGA 3FD3A 4KCCA 2DSFA 2F6PA 4YICA 3U72A 4GF8A 2HXWA 4K3FA 1JETA 3U1OA 1EU8A 4WEDA 5I2KA 3M3FA 2DWAA 2D21A 3PUWE 3IK6B 3K2DA 4OESA 3WAFA 4F29A 2ZMBA 3VVEA 1LCTA 1UTHB 2H4IA 4NF5A 2DS9A 5H8NA 3TUSA 3TODA 3O66A 1P1NA 2Q8JA 3C33A 1SBPA 2ZNUA 1DTZA 2XXQA 2GHAA 1FW0A 5CC2A 4P0IA 4WXJA 1H76A 4TLMB 1P99A 3HV1A 2XXUA 1PB7A 1B5JA 4PE5B 4MH5A 3FV1A 1ANFA 4QFNA 1XC1A 1MDP1 1M5BA 2XXRA 4QSEA 1H45A 5AA2D 1US4A 3FATA 1FTOA 4Z0IA 1QUKA 1IXGA 1TFDA 4QF9A 5I2NB 2O51A 3MVWA 4GFRA 4R2FA 3GZGA 3TTMA 3FVGA 1B0HA 3G3FA 3KN8A 1JQFA 1LLSA 4R72A 1PC3A 2RCBA 3N6TA 1S7YA 1J1NA 3PUZE 2RINA 3KSXA 1SVXB 4QFPA 5FTIA 4F1VA 2XXTA 4HS7A 2UYFA 3W9VA 1GVCA 1LGBC 4OFOA 3TAJA 2YPNA 4O3AA 4H6DA 1LSTA 2P1SA 5KDTA 4X48A 4FEDA 1MXYA 1SDXA 4PP0A 3QK6A 3ZKLA 2OJTA 4R6HA 2YLNA 1MM6A 2CMOA 1SW4A 1AIVA 4Q8RA 3FJ7A 3DP6A 5HBCA 1MY1A 1B2HA 3G7WA 4AB5A 4JB7A 4F22A 3OEMA 2REGA 2F7BA 2QSXA 3E9XA 1ZJLA 3TQWA 1ZKBA 1OLAA 3G3GA 3VDFA 2OWTA 4BDOA 1EH3A 3MPKA 2V3UA 2V25A 1M5EA 2YJPA 3FZVA 5K2XA 2O69A 2Z22A 1MG1A 3KOTA 2Z8DA 3DP8A 1P1OA 5FHMA 3V5AA 3LC8A 3TFLA 1Y3NA 4EF2A 1ZU0A 4U2RA 4DLDA 3PUXE 3SKPA 3MUQA 4C0RA 3S9MC 3G3JA 3KSJA 1WODA 2XXYA 4EXKA 4U1ZA 3UA8A 4R9GA 2IEEA 3EF7A 3FXUA 1NMUA 2QS4A 4FIMA 5DT6A 1IITA 2ONSA 4DCXA 2ZYMA 5A5XA 1LB9A 1D4NA 3VV5A 2Q89A 1B5IA 2HAUA 3FXRA 3GXAA 1B7HA 2E0SA 1I6QA 5CMMA 3HHFA 5CBSA 2XXPA 2B3FA 4IO5A 1A54A 4NMYA 4RK2A 5K2YA 4EQBA 1TT1A 3S2VA 4YKPA 3IR1A 3OSQA 1N3WA 4KCDA 3L6GA 1ZIUA 1IIWA 2VP1A 4ZEBA 5I57B 1M5FA 2RCAA 1SW1A 3VFJA 4ZZAA 3UN6A 4JSDA 5IAIA 3EHUA 4KQPA 3O9PA 1OVBA 5J1DA 2RC9A 3FVKA 2A5TB 1A8FA 2H9BA 4ELPA 2H99A 3E4RA 4OEUA 2ANJA 3FV2A 4Q0CA 5DEXB 2NVUB 1B3GA 5KZTA 3PUYE 1Y1ZA 5DVIA 3HPIA 2R6GE 2DE3A 3PPQA 3MZBA 1FCKA 1MQDA 4YB5A 5M2VA 4GLIA 3KN7A 1B05A 4F31B 3N26A 3VE1B 2IA4A 1IZ1A 2LAOA 3T9HB 3TTRA 1TWYA 2ZYKA 1Z7NE 2PX1A 2F8DA 2XX8A 4RPNA 4YU0A 2F35A 3FJMA 2Y7IA 3IJOB 3LSFB 4NE4A 4X1DA 1B46A 1FQAA 3KGCA 3FIRA 4ZEDA 1L5TA 4OWDA 3SETA 4R6YA 3S9EA 5EHMA 1AL3A 3OENA 1R9QA 4R73A 3U8QA 2CZLA 1XOCA 3QYTA 3QIMA 2E1SA 1VFEA 3PPPA 4QFOA 3OEKA 1DPPA 3EHSA 1MXWA 3ZS6A 5F1QA 3K4UA 2BJJX 1XHYA 4ZE8A 1QULA 3GLBA 3VXBA 1Y3PA 2PMSA 4GIZA 4FEBA 2XXHA 4MFIA 3UK4A 1B51A 4ISUA 3PMXA 4ZEIA 2OBGA 1MPCA 3N94A 4JDFA 4AB6A 3PMVA 3KFMA 4G8HA 2DVZA 1MQGA 4UACA 2UVJA 1D9YA 2O84X 5ELVA 1ELJA 4QSDA 2KLFA 2ZNSA 3FVOA 2R9JA 1PEBA 4GOTA 4F2QA 3QXMA 1IUDA 3SESA 4N07A 4X9TA 1LBBA 4H5GA 1N7XA 3UGWA 4U1OA 2DYXA 1MPDA 2F36A 3CR9A 4BLAA 3FVNA 3K1NA 1MH4A 4KYSA 1D3KA 3VLUA 2NXOA 4I62A 1NNPA 3LSWA 1JVXA 1DMBA 2UVGA 3OELA 1UQWA 1R9LA 4ELOA 3U92A 2M8CA 1UTHA 1B52A 2DOJA 2ALUA 2O68A 3C35A 1VE4A 2RC7A 4LVQA 1QW0A 4YKKA 1GV8A 4IGTA 4NEDA 2OCUA 3K02A 2Q2AA 3TEPA 4OMBA 1H43A 1BTJA 3FASA 3MVZA 1Y4TA 2F34A 2PYYA 4U22A 5AA3A 1NNFA 3E13X 2QJEA 2NWJA 1O7TA 3MQ9A 3OSRA 1Y3QA 2ZYNA 4OETA 3MWBA 4OTEA 3C4MA 2Z8FA 3M3KA 4Q30B 3E3KA 4KPTA 3O2AA 2UYEA 4DE8A 1B1HA 4I8CA 3U94A 1HSLA 3JYRA 1PB9A 1LAFE 3KJ7A 1N76A 2DXRA 1OQHA 5I2NA 5H8FB 3TTLA 1UTBB 4F1YA 2I6EA 2D5WA 1FQEA 4DDDA 2Y7PA 5I56B 2HFBA 4G2ZA 3IOUA 3N5LA 3BFTA 3MZ1A 3HO7A 2DWIA 4POXA 3OD7A 4BDQA 4HTGA 1B5HA 3RT8A 1DOTA 4LP2B 4X1BA 2AYSA 4R74A 2P0SA 5BUUA 4YB7A 1RYXA 1QVSA 1MY4A 3KN3A 5ICTA 2QMWA 1M5CA 3H6TA 1MS7A 1MDQA 5CBRA 4LZ8A 2HQ0A 5I84A 1YAEA 4E0WA 3H3GA 4EQ7A 3S9NC 3C36A 5AA4B 2A5SA 3A09A 1LFHA 5I58B 4OFLA 3CIJA 2FNCA 5JTYB 3TELA 4FECA 3TCHA 4MLQA 2Y7RA 1JEVA 4H1XA 2XXWA 5L8DA 3O6HA 1SD3A 1NH7A 3SDFA 4FORA 4H65A 3H6WA 4YMBA 1FQBA 4QSCA 4XIGQ 3FXQA 4NF6B 4G77A 1MQJA 1H44A 4QHQA 4R2BA 4GXSB 1B3HA 3IB2A 3PD8A 4GD5A 1S9TA 3T66A 4RXLA 4TQUQ 5TP9B 3VVFA 3IO6A 3PPOA 5DTBA 4LQ2A 3L6HA 4LATA 3PV0E 2I3WA 4NF8B 1IXCA 1QUJA 4QRZA 3RUMA 1ZBMA 3K6WA 3T22A 1MQHA 4ZE9A 4QFLA 2GH9A 2I0BA 3SEUA 4FE8A 3PGFA 2ESNA 1LCFA 4LZ5A 1WDNA 2GRVA 1XVYA 1JNFA 3KZGA 3ONMA 3MBPA 1EZPA 1I6AA 2D3IA 4ONYA 2DE4A 3I5OA 4NTLA 1SQYA 2G29A 1R1NA 3SEVA 1B4ZA 2Y7KA 4DXUA 4N13A 1MQIA 3UIFA 3LSLA 5ISUA 4BDNA 3EN3A 3MAMA 2OK2A 1URGA 5H8SA 4JXIA 2F6GA 2ZXTA 3K1PA 4I9DA 1CE2A 5I59B 3HSTA 4IY5A 4BDRA 1ATGA 3G3HA 1VR5A 1YPNA 5I57A 1FTLA 4PFTA 2FYIA 3MC2A 3UORA 2QS3A 4P0GA 1MM7A 2ZNTA 2O7UA 2W7YA 4LUBA 2V3QA 1FQFA 2V93A 4RK9A 2A5TA 1PDAA 1Y4CA 3IO4A 4G8MA 1USYE 3H7MA 5DEXA 4LQ5A 2REJA 2VD3A 3JV9A 4NWCA 2OLBA 3PUVE 4PETA 5ITPA 2XD3A 1B40A 3TDJA 2F5XA 4G8NA 4RPOA 4GVOA 2P2AA 3RTWB 2Z8EA 3C32A 1YTVA 4YAHX 4YKJA 2O6AA 4RNSA 1XS5A 4DZ1A 5CMCA 2O7IA 3H03A 2RF1A 1HSJA 1MXZA 2X7PA 5FHNA 3B6QA 2XD2A 5L9MA 3KEIA 1LFIA 1LBCA 2XX9A 5AA2B 3FJGA 2VGQA 4LA9A 4O3CA 4N6PA 1FTKA 1D9VA 1MY2A 4H5FA 3MP1A 2I3VA 2RKMA 3ILUB 2ABHA 5DYHA 1UIUA 3QUJA 3KJTA 1OVTA 3PD9A 3PU5A 3Q28A 4NF4B 3N6UA 2O1MA 4GQOA 3ILTB 2B3BA 3ECRA 4FAJA 5ICQA 4U4SA 3OMBA 3RT6B 4G68B 3IORA 4XTCQ 4ESXA 3K6UA 3H6UA 3OXNA 4GXAA 1N84A 4OYVA 3RN8A 1CB6A 2Y7WA 3HHGA 1BKAA 3F11A 1GTKA 4HCYA 1Y1MA 4FJPA 3M8UA 2VHAA 1F9BA 1FTMA 1GR2A 4ELQA 1URSA 2NOOA 1FQDA 4IY6A 1AH5A 4BDLA 5JEIA 3RPWA 1AMFA 5TPAB 2OWSA 2HZKA 3A3CA 4JWXA 5F7VA 1PBQA 4YB6A 5KCJB 3MPLA 3IB1A 1A99A 1N04A 3K0VA 2Z23A 3IJXB 2PBWA 1A40A 4QFKA 3O6IA 3MZ9A 4PQJA 2I4CA 3A3UA 2F7CA 1MXXA 4HCWA 5H8HB 1JW5A 3CFLA 3ZKKA 1B0LA 1T0KA 3THIA 1EZOA 1TXFA 1QJMA 2AL5A 5DVJA 4KHZE 3O29A 4IGRA 3ZSFA 5DVFA 3VVDA 4YZZA 1HSEA 2X7QA 3CFXA 3TQLA 1PBPA 4R6KA 4FATA 5H8FA 1UTBA 5TU0A 1IXIA 2RC8A 4RJZA 5I56A 4G4PA 2OZZA 1Y20A 3TKDA 5L9SA 1RKMA 4O3BA 2QL3A 3RNNA 4F3PA 4H67A 1DTGA 3DP4A 3TCFA 2UXAA 2DVCA 1JEUA 3M3LA 1BP5A 4TLLB 3CFZA 3EHTA 3KBRA 4IO3A 3BFUA 4EUOA 2XX7A 5AA4A 4GWOA 3B6TA 1IEJA 1ZTYA 5I58A 1UIVA 2UVIA 1B7UA 5JTYA 1YCJA 3I3VA 3H06B 4RA1A 1QKBA 2Y84A 1GGGA 5H8QB 3LSXA 3C34A 4ESWA 3T96B 1I6BA 4JSOA 1DPEA 2I48A 4IB2A 3MVYA 1MY3A 4NF6A 1NFTA 4H8IA 4XKNA 3DLNA 1BLFA 2QRYA 3PPRA 1TFAA 1MY0A 1DSNA 2GHBA 5TP9A 1MH3A 1NL5A 1QKAA 1B3FA 4DXCA 1H3DA 3R26A 3B6WA 5BWJA 4ZDMA 1P1QA 4NF8A 4OENA 1O64A 5I2KB 3R6UA 3IL1B 3CG3A 1R6ZA 3C31A 1A55A 3OO7A 3T93B 4F3BA 3G3IA 5AE4A 3HCQA 2THIA 2NUVA 4NF5B 5H8NB 2GFEA 1OQGA 1XVXA 1B32A 1B1XA 3OO8A 4RY1A 3W9WA 1NNKA 4OVJA 1OMPA 1P1WA 2I58A 4IO7A 4MF3A 3DELB 3RY3A 2H25A 1BIYA 1NKXA 3OO6A 3CSGA 3QSLA 2VD2A 4U21A 1MXVA 4F3SA 3QAXA 4ELRA 3S9LC 2HAVA 2PT1A 4ZECA 4LONB 1IQ7A 1B4HA 3ODBA 3D4CA 2AL4A 4M1VA 4EXLA 1US5A 5I59A 2ZYOA 4ZEFA 1JW4A 3G3KA 1LAHE 1KWHA 1IXHA 3H4ZA 4BDMA 2F97A 3EQ1A 2I0CA 4G68C 1RYOA 1ZLQA 4XKQA 3OOAA 4OHNA 3EPEA 3MP8A 3H6VA 2I4BA 4L17A 5CRYA 3CVGA 4F18A 1S50A 3FGSA 1EZ9A 1B7ZA 3MW0A 3CG1A 1B3LA 5HPQA 3KOSA 3CI8A 1Z7ME 2Q2CA 5ITOA 5EYFA 5KDTB 3MJNA 4C1TA 2O1LA 2HZLA 4DIGA 1MXUA 1P1UA 2DP8A 3D4GA 1MPBA 3JZJA 3TTNA 4DXBA 1SI0A 3VLVA 4Q5TA 4PFUA 3Q29A 4F1UA 1Y9UA 3VXCA 4WKMA 2H5YA 5FHOA 2F78A 2XXVA 4E0XA 1LB8A 4AQ4A 4HW8A 3TMGA 3V8XB 1QUIA 1FQCA 4LZ7A 1VSOA 5IKBA 3V83A 4OFJA 5AA1A 3CSBA 2DE2A 5AA2A 3K00A 1B58A 1WVJA 2R71A 4ND9A 1VFDA 4F3GA 4WEPA 3SEWA 4OXVA 4EF1A 4PFYA 4OZ9A 2G93A 4ZEKA 3KG2A 3P7IA 2PT2A 3U93A 5CMKA 4DCYA 4F39A 3DM0A 2QMXA 3C9HA 4IO4A 4GL0A 4KR5A 3HN0A 3AXFA 1AOVA 4NF4A 4TOZA 4KYEA 2QS2A 4JWYA 3IOWA 5CM6A 3R7XA 4XKPA 4G68A 3W15C 1NNTA 1FTJA 4GL8A 1LAGE 2I49A 1Q35A 3MVXA 4XKRA 4JBZA 4XXUA 3K1MA 5A5XB 4ECFA 3Q27A 4THIA 2B65A 4ZZEA 1JW1A 3MP6A 4NWDA 1SYIA 2QS1A 3TYHA 1LAXA 4OQOA 2ONKE 1B6HA 1B3EA 1POY1 5TPAA 3RGYA 4H0WA 3B7DA 4KFQA 5KCJA 4OEVA 1SYHA 3UP9A 3K6VA 3OO9A 3SERA 2UVHA 3T9VA 1Q1KA 3SEYA 3USDA 5JK4A 2HCAA 4F2OA 3GBBA 4PFWA 5H8HA 3O6GA 3T9XB 4MBPA 3IB0A 3RTFB 5HM4B 3FUZA 3RLFE 4OERA 3RQTA 4JWOA 2DWJA 1B9JA 3SEXA 3IX1A 1A7LA 2FA7A 2XXIA 1POTA 2HEUA 3O97A 2F7AA 4U4XA 4R75A 3PMWA 3O28A 4POWA 1USYH 2DQVA 3I6VA 1A8EA 3K6XA 4YMAA 4EQ9A 4C1UA 2VOZA 3LUYA 4I1DA 1SW2A 4U23A 1SW5A 2X26A 3V89B 4F19A 3IOTA 4EDPA 3QUFA 3T9UA 2V84A 4IO6A 1II5A 2XHDA 2AIXA 1N7WA 3CRBA 4RYAA 4R9FA 3GBAA 1N0TA 3TPAA 2Q9TA 4UA8A 3BKIB 5CMBA 5LOMA 2XXXA 4GRKA 3TZAA 4KI0E 2V3TA 5EHSA 5FTHA 2WKYA 2Q88A 1OLCA 2DWHA 4KD5A 5CI5A 1MRPA 3IAZA 1PB8A 3S4UA 1XT8A 3Q26A 2QPQA 4KYDA 3PPNA 1N3XA 1URDA 4Z7EA 1JVYA 3TCGA 3TTKA 3Q25A 1M5DA 1OIBA 3LBSA 4IO2A 4ZS9A 4H8JA 5H8QA 1I69A 4M4GA 1LFGA 2H98A 2PVUA 3LR1A 5B7DA 3IOVA 2ONRA 1SI1A 3VLWA 4YKIA 4P11A 4MLVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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