4HW8A

2.25 angstrom structure of the extracellular solute-binding protein from staphylococcus aureus in complex with maltose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
KDKPNQLTMWVDGDKQMAFYKKITDQYTKKTGIKVKLVNIGQNDQLENISLDAPAGKGPDIFFLAHDNTGSAYLQGLAAEIKLSKDELKGFNKQALKAMNYDNKQLALPAIVETTALFYNKKLVKNAPQTLEEVEANAAKLTDSKKKQYGMLFDAKNFYFNYPFLFGNDDYIFKKNGSEYDIHQLGLNSKHVVKNAERLQKWYDKGYLPKAATHDVMIGLFKEGKVGQFVTGPWNINEYQETFGKDLGVTTLPTDGGKPMKPFLGVRGWYLSEYSKHKYWAKDLMLYITSKDTLQKYTDEMSEITGRVDVKSSNPNLKVFEKQARHAEPMPNIPEMRQVWEPMGNASIFISNGKNPKQALDEATNDITQNIKILHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 2.25 Angstrom Structure of the Extracellular Solute-binding Protein from Staphylococcus aureus in complex with Maltose.
rcsb
molecule tags Solute-binding protein
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords Bacterial extracellular solute-binding protein, putative
total genus 124
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A02
5DVIA 1PB8A 5H8QB 4UA8A 3MVZA 4MBPA 1I6AA 3VXCA 1ELJA 5I2KB 4AQ4A 4G68A 3PD9A 4LZ8A 2RKMA 3IO6A 1A55A 1XOCA 3CI8A 4LQ2A 4BDRA 3S9LC 2H5YA 4G68C 3KSXA 4U2RA 4JSOA 2F6GA 3JZJA 1O64A 3MW0A 4N07A 3WAFA 4WXJA 3ZKLA 4GL0A 3OEMA 2D3IA 2XX9A 5I59B 1RKMA 3S2VA 3VLWA 5CBSA 5H8NA 4ESXA 3T9VA 5TU0A 1QW0A 4ESWA 5IAIA 4G77A 3TCGA 3KSJA 4F2OA 3T96B 2HXWA 4R2BA 4EQ9A 1MDQA 2QS4A 1DSNA 1NH8A 3VLUA 2ESNA 3FVNA 3M3LA 4OZ9A 4YB6A 4Q30B 3UIFA 3RT8A 1B3EA 4F1VA 5AA2D 2DQVA 1WODA 1O63A 1SQYA 1SW5A 1N7XA 5KDTB 3RQTA 2O51A 1URSA 5M2VA 3FXRA 3SEUA 2AL5A 1H3DA 4IO3A 2ANJA 5KCJB 2AL4A 3JYRA 3H06B 2XXQA 3C36A 2Q2CA 1PBQA 2THIA 2ONSA 3QXMA 3TQWA 1LCTA 3K02A 3CSBA 1MQJA 2IA4A 3K1NA 2V3TA 3TAJA 4NF4B 3HCQA 4OXVA 2ONRA 2GHAA 2H4IA 4OWDA 1QVSA 4YZZA 1P1NA 3OD7A 1FTLA 2GHBA 1MQDA 3RTFB 2Q9TA 2B65A 3SEXA 2HFBA 5K2XA 4G8MA 3OSQA 3MPLA 1M5FA 1B1XA 1UTBA 4PFWA 5AA4A 2XHDA 2V3QA 1A99A 4XKRA 4R9GA 1H43A 3N5LA 1NL5A 3Q29A 1AIVA 5H8FA 1YAEA 1IXHA 3MJNA 3G3JA 2I4CA 5ITPA 4JWOA 4IY5A 4GXSB 3GBBA 4GVOA 1QUJA 4RK2A 3Q28A 1MH4A 4NF5B 1USYE 2R9JA 2DOJA 3FD3A 4ZEDA 1UTHB 3JV9A 4Z0IA 1I6BA 2ZYOA 1SDXA 4I8CA 1IEJA 1MPBA 4NWDA 2PVUA 4WEDA 5BWJA 1P1WA 3K4UA 5EHSA 3V83A 4OVJA 5DTBA 3FASA 1S7YA 4F3BA 1GV8A 4OEVA 3MZBA 5I2NA 1AOVA 2Q8JA 4KCDA 3BKIB 4E0XA 5H8HB 3GZGA 4C1UA 3RTWB 3A3UA 2RCAA 1P1UA 4LZ5A 3I5OA 4ZEKA 3RPWA 2RC9A 3U94A 3UK4A 2RF1A 5F1QA 1D3KA 2RINA 5A5XB 2F34A 3HO7A 4R73A 3MVYA 3H03A 1Y4CA 3KBRA 3I3VA 1JW5A 4KYEA 4Q0CA 2DWHA 1RYOA 1TXFA 1LAHE 1QKAA 2XXHA 3KEIA 5JTYA 2O7IA 3CG1A 2H9BA 4G8HA 5CRYA 2BJJX 3ZSFA 3LSFB 2NUVA 2VGQA 4R2FA 4M4GA 4RPOA 2REGA 5L8DA 3RNNA 4BDOA 5HBCA 3V8XB 3TODA 4U4XA 4Q8RA 1FTOA 3OO9A 1ZJLA 4BLAA 4R9FA 3IJOB 3W9VA 4FJPA 1MXZA 5TPAA 3OEKA 1XT8A 3MP8A 1B51A 2OWSA 4C1TA 3ONMA 4H8IA 2F7AA 4GXAA 1DOTA 1B7UA 4ZE8A 2PX1A 3PPOA 3IOWA 3MC2A 2XXUA 3TCFA 1R9LA 5I58B 1Y4TA 4G2ZA 1UIVA 3PU5A 3IB1A 1DPEA 1JW1A 3KN7A 1B3FA 1FCKA 4YAHX 3TZAA 2DYXA 5CMMA 2Z8DA 3TQLA 3O6IA 4ZEIA 4ND9A 2XXXA 4GLIA 1ZMGA 2XXVA 1N84A 3HHGA 4AB5A 1N3WA 5JK4A 3PPQA 3O2AA 1LLSA 1IXCA 4YKIA 1JEUA 2I58A 3OXNA 1LFGA 1JNFA 2LAOA 3C31A 4U4SA 4YKKA 1R1NA 4NE4A 4YB7A 5B70A 4JWXA 1MY1A 4G8NA 5ELVA 3SDFA 4NF6A 2ZXTA 2XXYA 4RA1A 2QL3A 2GFEA 1MH3A 4O3AA 2F7BA 5FTIA 5DEXA 3C32A 4FECA 1AMFA 2FA7A 4U23A 1I6QA 4NF8B 1POY1 5ITOA 3OMBA 4YICA 4XXUA 3CSGA 3TKDA 4ISUA 4BDNA 1M5DA 1OIBA 3H6UA 2F36A 1O7TA 4F3PA 5CC2A 2NXOA 3QK6A 3TTLA 3T9XB 2HAUA 1TT1A 2YPNA 2Y84A 1Z7ME 1QKBA 3IK6B 2VOZA 4POWA 2QMWA 1LFHA 3G3FA 4ZEFA 4F18A 1IITA 5H8QA 5I2KA 1B5HA 3MUQA 5F7VA 2PT1A 3T66A 3G3KA 3VVFA 2RC7A 4LQ5A 1GGGA 3RT6B 1A54A 1PB7A 4O3BA 4PFYA 2OBGA 1MQIA 4ZEBA 2X26A 4HTGA 1OLAA 3ECRA 2OZZA 4DE8A 2UVIA 1MM6A 4I1DA 1FW0A 1YCJA 4I62A 2H98A 5AA2B 2HZLA 4R6YA 1R6ZA 4QHQA 3EN3A 4XKPA 2YLNA 1MY2A 5TP9B 5I59A 3O97A 3R6UA 4FATA 3T93B 5EHMA 3K6UA 4DXBA 3VXBA 1B0HA 4QF9A 4U22A 3LUYA 4ZZAA 2CMOA 1Q35A 4RK9A 1B40A 3OO6A 3UN6A 5HM4B 4PFTA 2X7QA 1H45A 3OELA 1MXYA 2XXPA 3PMVA 2PMSA 4TQUQ 4YKPA 4EXLA 3EQ1A 4OERA 3IOUA 5L9SA 3N94A 5KDTA 4YU0A 4GF8A 3FVGA 2YJPA 2VHAA 4P0GA 3TTKA 1BKAA 4MH5A 3T22A 3ZS6A 5DYHA 4ZS9A 1B46A 2B3FA 5KCJA 2PYYA 5LOMA 1MG1A 4YKJA 2WKYA 3KJ7A 1TWYA 3MWBA 4F19A 5AA1A 3G3IA 4OFLA 3SKPA 2AYSA 3MPKA 1UQWA 2D5WA 3O29A 4NF4A 3V5AA 1TFDA 5BUUA 3S9MC 1BP5A 4H65A 4PFUA 4POXA 3LSLA 3IO4A 3E13X 4QRZA 3MP6A 1DTZA 3PD8A 3RGYA 3RN8A 1MY0A 4OQOA 5L9OA 3FATA 1VSOA 3MBPA 4QSDA 3TPAA 1NKXA 1MY3A 1FQEA 2Z8FA 1B3HA 4QFNA 1JVYA 1EZOA 1L5TA 1EH3A 1URGA 1R9QA 4BDLA 2XD3A 3PV0E 4P0IA 3O28A 2ZYNA 1D4NA 3TTNA 1NNFA 1II5A 3IB2A 3MQ9A 1ZBMA 4EUOA 3IAZA 1DMBA 1UTHA 2AIXA 3DLNA 1SYIA 3TTRA 3H3GA 4L17A 3VVDA 1IZ1A 4X48A 3CG3A 3ZKKA 1LSTA 3S9EA 4DZ1A 3A09A 4DXCA 1MM7A 1ZLQA 1UTBB 3CVGA 3HPIA 1D9YA 1MXUA 1Y1MA 4ELPA 4KYDA 1BLFA 1B3GA 3MVWA 3B6WA 3RLFE 5H8HA 3TCHA 3A3CA 5CI5A 2V84A 1US5A 4Z7EA 3C34A 2HEUA 4KYSA 3TFLA 3LBSA 2VD3A 4OEUA 2H25A 3PUVE 3FVOA 4R6HA 2I49A 2DE3A 2DVZA 3G3HA 2P1SA 1JVXA 2QS3A 1MXXA 2O7UA 3KFMA 2D21A 1NNPA 1IIWA 1KWHA 1FQCA 3LSWA 2F35A 3VDFA 3VLVA 1B32A 1CE2A 3FIRA 4X1DA 1OQHA 3E3KA 2E1SA 3BBRA 4THIA 2HZKA 3H6VA 1SYHA 3U93A 1LCFA 5CM6A 4N13A 1FTJA 3CIJA 4E0WA 3R7XA 4F1YA 1Y3NA 3O9PA 2DWAA 3G7WA 1ZIUA 1NH7A 4IO7A 3FZVA 1DPPA 4XKNA 5ICQA 2UYEA 3M3FA 5HPQA 4U21A 5CMCA 1D9VA 4KCCA 3O6HA 3FXUA 3IJXB 1Y9UA 3ILUB 3K1MA 1LFIA 4M1VA 3N6UA 4H8JA 5KZTA 2Y7RA 3O6GA 5I58A 4FAJA 3CFZA 4RXLA 4KI0E 4QFOA 3FJMA 3IB0A 4Q5TA 4R6KA 4RNSA 3EPEA 5DT6A 1SVXB 1SW2A 1LAXA 2A5SA 3H6WA 3W9WA 1PC3A 1B4ZA 3FVKA 3U1OA 2UVGA 3LSXA 4LZ7A 3H6TA 1MPCA 2Q88A 3GLBA 3S9NC 2V93A 3OO8A 3TDJA 3C9HA 3LC8A 3U8QA 1AH5A 1N0TA 3SEWA 5B7DA 3M8UA 3FUZA 1N7WA 3MZ1A 4NWCA 3KG2A 3T9UA 2Y7IA 2DXYA 4R72A 1TFAA 3FV2A 4NF8A 3PUZE 3QAXA 1XS5A 3Q27A 2UVJA 4H6DA 1RYXA 3UA8A 3SEVA 1URDA 1N3XA 1EZPA 2UYFA 3T9HB 4OFJA 4RPNA 1MQGA 4NMYA 1ATGA 5DVJA 4ZECA 2XXTA 2OCUA 1MXVA 3L6HA 4H67A 4JXIA 1B6HA 2O1MA 2I6EA 1LBCA 5FHOA 3CRBA 3MAMA 3KGCA 4GWOA 3GBAA 3UGWA 2A5TB 3C4MA 1CB6A 3RY3A 1USYH 3OOAA 1YPNA 2UXAA 1NFTA 1EU8A 2Z22A 4IY6A 2DVCA 1QUKA 5I56B 3VVEA 1MRPA 2X7PA 1VFDA 1HSJA 2Q2AA 3TTMA 4OMBA 4KR5A 3K0VA 3PUYE 2G29A 1QJMA 1A8FA 4H5FA 1VE4A 2Y7WA 5K2YA 4QSCA 4GIZA 1MDP1 3Q26A 1Y20A 4XIGQ 3L6GA 3D4CA 3K01A 1M5BA 1T0KA 5CMBA 3CFLA 3KN3A 3KOSA 4DLDA 3C33A 3I6VA 5ICTA 1ZTYA 4R75A 2GRVA 5AA2A 1S9TA 3B7DA 4DCYA 2O1LA 2F78A 3P7IA 2FNCA 5I57B 1P1OA 4WEPA 1MY4A 5EYFA 4QFKA 3IOVA 3IR1A 2V3UA 2F97A 5IKBA 1POTA 2I0CA 5TP9A 3KZGA 1XHYA 1WVJA 2ZNUA 4OFOA 2ABHA 3B6TA 1MXWA 1Z7NE 1HSLA 5H8SA 3KJTA 2OK2A 4IO4A 3OO7A 4F31B 3OENA 3PGFA 1B7ZA 2Q89A 3MVXA 4IO5A 4EF1A 1B2HA 1ZU0A 4LP2B 1A40A 3HHFA 1US4A 3ILTB 3TUSA 1FTMA 1B5IA 1A8EA 1MS7A 4FE8A 1LAFE 2ZNTA 4KQPA 3KN8A 4G68B 1ZKBA 1A7LA 3SEYA 4F3GA 1UIUA 1B52A 3E4RA 4ZZEA 4ECFA 4YMBA 1Q1KA 1ANFA 4NEDA 5AE4A 2I3WA 3K1PA 2ZNSA 4GQOA 1OMPA 4KD5A 4FIMA 1MQHA 4JB7A 2GH9A 1I69A 3QSLA 2I3VA 1DTGA 4X1BA 2XD2A 2ZYKA 3DM0A 4H0WA 3HN0A 3Q25A 1JETA 4YMAA 3K6VA 4FORA 2M8CA 3B6QA 2F7CA 1P99A 1SW1A 4IB2A 2Z23A 1SW4A 3K00A 3TYHA 2ONKE 5H8NB 2F8DA 2E0SA 3TELA 1B7HA 2I0BA 4K3FA 3BFUA 5AA3A 2O6AA 2OLBA 3H4ZA 2P0SA 4DCXA 3N6TA 2ALUA 4H1XA 5L9MA 4P11A 4ZDMA 2QS1A 3U72A 4LUBA 1JW4A 3EHTA 2RCBA 4JWYA 3U92A 1QULA 5CBRA 3TEPA 2HQ0A 1B3LA 2XX8A 3PUXE 1XC1A 5FTHA 2VP1A 1B05A 2QJEA 4OESA 1B5JA 1F9BA 1XVYA 4I9DA 2R6GE 4PQJA 4OETA 4GFRA 3UORA 4NF5A 1M5CA 1SI1A 4EDPA 4ELOA 4TOZA 1BTJA 4BDQA 4AB6A 3QUFA 4IO2A 2PT2A 4JSDA 4HCWA 1FQFA 2QS2A 3DP6A 1GVCA 1LB9A 2VD2A 3BFTA 4UACA 4OYVA 1JQFA 2F5XA 1SD3A 3V89B 3F11A 3TMGA 1QUIA 2B3BA 2OJTA 4DDDA 5AA4B 1GR2A 2O68A 3H7MA 2DE2A 2H99A 4QFLA 1LGBC 1P1QA 3DP4A 3IORA 1EZ9A 5H8FB 5FHNA 1YTVA 1Y3PA 2DWJA 3W15C 2V25A 4HCYA 2XXWA 1SI0A 4O3CA 4G4PA 2DP8A 3MP1A 3QIMA 4GOTA 2QPQA 4RYAA 5A5XA 1PB9A 1LB8A 2NWJA 3IX1A 3PPPA 2F6PA 3KOTA 1IUDA 3PUWE 3SERA 3K6XA 1B1HA 4GD5A 4JBZA 2R71A 4F1UA 3IL1B 3FGSA 4QFPA 4OHNA 2QRYA 4PP0A 5J1DA 5JEIA 4XKQA 1VFEA 3PPNA 2DXRA 4LA9A 1PEBA 1N76A 1N04A 1J1NA 5I2NB 1OVBA 2ZYMA 3DELB 4U1ZA 2DWIA 3EF7A 2HAVA 1IXIA 2HCAA 2O69A 3D4GA 4ELRA 1MPDA 4U1OA 5FHMA 4GL8A 1AL3A 1FQDA 4IO6A 4DXUA 1OVTA 3AXFA 3E9XA 1WDNA 4EXKA 4MLQA 4PE5B 4LVQA 2I48A 2DSFA 3G3GA 3OSRA 4RY1A 2G93A 3VFJA 2Y7KA 1JEVA 3HV1A 4IGTA 4PETA 3UP9A 4F22A 2REJA 1B9JA 3PMWA 2XXRA 1M5EA 4JDFA 2XX7A 5JTYB 3PMXA 4OTEA 2OWTA 4FEDA 2Y7PA 1FTKA 2Z8EA 4DIGA 1Y1ZA 3GXAA 4EQBA 4N6PA 1S50A 4X9TA 2DE4A 1XVXA 2CZLA 5DVFA 4TLLB 5TPAB 4F2QA 2QSXA 4QSEA 3K2DA 3THIA 4LONB 4OENA 3SESA 3N26A 1FQAA 3EHSA 2QMXA 5ISUA 3IOTA 1BIYA 1OLCA 2W7YA 1B0LA 2IEEA 4NTLA 4GRKA 3CR9A 1H76A 1LBBA 3M3KA 3SETA 4ONYA 1LAGE 3QYTA 4ZE9A 2ZMBA 2A5TA 2I4BA 4F29A 3S4UA 1Y3QA 2DS9A 3PPRA 3ODBA 2NVUB 3K6WA 3LR1A 1NNKA 3RUMA 2RC8A 4F3SA 4R74A 2PBWA 4H5GA 4WKMA 3QUJA 5I56A 4XTCQ 3C35A 4IGRA 1PDAA 1SBPA 1FQBA 3FJGA 4EF2A 4EQ7A 4F39A 4NF6B 2NOOA 1NNTA 2O84X 4LATA 2KLFA 3WAEA 3HSTA 3FV1A 2UVHA 5DEXB 4HW8A 1B58A 3EHUA 4TLMB 4MFIA 4KHZE 2XXIA 1PBPA 3DP8A 3CFXA 4KPTA 1NMUA 5CMKA 5I57A 4YB5A 2P2AA 1IXGA 2FYIA 3VV5A 3FXQA 1H44A 4BDMA 4HS7A 1OQGA 4MF3A 3USDA 1IQ7A 3VE1B 5I84A 1B4HA 4RJZA 4ELQA 3R26A 4FEBA 3FJ7A 1HSEA 4C0RA 1VR5A 1GTKA 4MLVA 3MZ9A 3O66A 4KFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IFAA 5DVIA 3BIHA 1PB8A 5H8QB 4UA8A 3MVZA 4MBPA 1I6AA 3VXCA 1ELJA 5I2KB 4AQ4A 4PTKA 4G68A 3PD9A 2XWKA 4LZ8A 4PGNA 4NX1A 2RKMA 1RDYA 3IO6A 1A55A 4GWWA 1XOCA 4GBVA 3CI8A 4LQ2A 4BDRA 3S9LC 3T1BA 2H5YA 1FBHA 4G68C 3KSXA 4U2RA 4JSOA 2F6GA 3JZJA 1O64A 3MW0A 4N07A 3WAFA 4WXJA 3ZKLA 4GL0A 3OEMA 4PFRA 2D3IA 2XX9A 4MNIA 5I59B 1RKMA 3S2VA 3VLWA 5CBSA 5H8NA 4ESXA 3T9VA 1FPEA 5TU0A 1QW0A 4ESWA 1RDXA 4G77A 5IAIA 3TCGA 3KSJA 4F2OA 3T96B 2HXWA 4R2BA 4EQ9A 5ET8A 1MDQA 2QS4A 1DSNA 1NH8A 3VLUA 2ESNA 3FVNA 3M3LA 4OZ9A 4YB6A 4Q30B 3UIFA 3RT8A 1NUYA 1B3EA 2QVRA 4F1VA 5AA2D 2DQVA 1WODA 1O63A 1SQYA 1SW5A 1N7XA 5KDTB 1FPDA 3RQTA 2O51A 1URSA 5M2VA 3FXRA 3SEUA 4P3LA 2AL5A 1H3DA 4IO3A 2ANJA 5KCJB 2AL4A 3JYRA 3H06B 2XXQA 3C36A 4PBHA 2Q2CA 1Q9DA 1PBQA 2THIA 2ONSA 3QXMA 3TQWA 1LCTA 3K02A 3CSBA 1MQJA 2IA4A 3K1NA 3FBPA 5ESYA 2V3TA 1IMAA 4P1LA 3TAJA 4NF4B 3HCQA 4OXVA 5LTCA 2HXRA 5EYGA 2ONRA 5IM2A 2GHAA 2H4IA 4GWYA 4OWDA 1QVSA 4YZZA 1P1NA 3OD7A 4MIJA 1FTLA 2GHBA 1MQDA 3RTFB 4PAIA 5F24A 2Q9TA 2B65A 4X8RA 3SEXA 2HFBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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