4HW8A

2.25 angstrom structure of the extracellular solute-binding protein from staphylococcus aureus in complex with maltose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
KDKPNQLTMWVDGDKQMAFYKKITDQYTKKTGIKVKLVNIGQNDQLENISLDAPAGKGPDIFFLAHDNTGSAYLQGLAAEIKLSKDELKGFNKQALKAMNYDNKQLALPAIVETTALFYNKKLVKNAPQTLEEVEANAAKLTDSKKKQYGMLFDAKNFYFNYPFLFGNDDYIFKKNGSEYDIHQLGLNSKHVVKNAERLQKWYDKGYLPKAATHDVMIGLFKEGKVGQFVTGPWNINEYQETFGKDLGVTTLPTDGGKPMKPFLGVRGWYLSEYSKHKYWAKDLMLYITSKDTLQKYTDEMSEITGRVDVKSSNPNLKVFEKQARHAEPMPNIPEMRQVWEPMGNASIFISNGKNPKQALDEATNDITQNIKILHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Solute-binding protein
molecule keywords Bacterial extracellular solute-binding protein, putative
publication title 2.25 Angstrom Structure of the Extracellular Solute-binding Protein from Staphylococcus aureus in complex with Maltose.
rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 124
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A02
3KGCA 3O6GA 3T9UA 3SEVA 4G4PA 2H5YA 5AE4A 2H25A 1CB6A 3VE1B 3H6TA 5AA4A 3VXCA 3B6WA 1NNPA 4IO6A 4WEDA 3IB2A 4H1XA 1URGA 4IO3A 1VE4A 3ZS6A 3IB1A 1YCJA 5BWJA 4F2OA 3MP8A 3ZKLA 4YB6A 3HPIA 4ZE9A 2DWHA 1QJMA 4HW8A 1GTKA 5H8HA 1OVBA 1SI1A 1FTKA 3RQTA 5DEXB 1B32A 3KFMA 5HBCA 1POY1 3K4UA 1Q35A 1FW0A 3DP4A 3N26A 1H3DA 1MXZA 1OQGA 1H45A 3SEUA 5H8FA 2GH9A 1CE2A 1DSNA 4OFOA 5JK4A 4LA9A 1MQGA 1FQDA 5H8NA 1OLAA 1FQBA 3EQ1A 3RY3A 1AH5A 4FATA 2DWIA 1LAHE 4RK9A 4ELPA 5HPQA 4E0XA 4YAHX 3GBBA 2I0CA 1R9LA 1EH3A 2HZLA 5AA2A 3RN8A 2F78A 3O2AA 2RKMA 3QUFA 1QW0A 2O84X 5DVJA 3SDFA 4NF6B 3RTWB 4R2BA 5EYFA 3QK6A 1I6BA 2Z8DA 3BBRA 5ELVA 1FTLA 3T9HB 1JNFA 3M3KA 1RKMA 3FJGA 4QSCA 2QSXA 1PBPA 2OCUA 2ZYMA 2F7AA 3F11A 2QS4A 3B6QA 4X1DA 2VOZA 4G2ZA 1NMUA 3H3GA 4ONYA 4KCDA 2E0SA 4AB6A 2UVJA 2Q8JA 4EQBA 4QRZA 4OFJA 5AA4B 3LC8A 4KYEA 4C0RA 5A5XB 2G93A 4GLIA 1B05A 3H6VA 3H06B 3WAEA 5ITOA 4ELRA 1ZIUA 3RLFE 3W15C 1QUIA 4OVJA 3WAFA 3S9EA 4LZ7A 1Y20A 3CG3A 5H8HB 4I8CA 3MPLA 3RTFB 4N13A 3EPEA 1MDP1 4QFNA 3MZ9A 2PT1A 3CSGA 2D5WA 2ONRA 4G68A 2OZZA 1B3GA 1UQWA 4ZZEA 3W9VA 1XVYA 2IA4A 4YKIA 5I57B 3HHGA 3DLNA 3H6WA 5H8FB 2O1LA 2Y7IA 2CMOA 3C34A 3A3UA 1FCKA 3PUXE 3E13X 5EHMA 3IB0A 4R75A 1Z7ME 3UGWA 1SW2A 3ILTB 3LSFB 3LSXA 4YU0A 4ZECA 1PB8A 4EDPA 3FVOA 2HAVA 2XXYA 1OLCA 4JBZA 2Q2CA 3TTNA 1HSEA 2REJA 5L8DA 1ATGA 4QSEA 3QXMA 3CFLA 1D4NA 4KCCA 3IAZA 2XX8A 4IO7A 4JB7A 3PMXA 4X48A 1P1UA 2BJJX 4RY1A 2OBGA 3FVKA 2RINA 1N7XA 1I6QA 2H99A 3TDJA 3DP6A 4YKPA 4NF5A 1IIWA 3PPOA 3SEYA 1D3KA 2FNCA 2AIXA 3KN3A 3FVGA 3S4UA 1MG1A 4F1YA 4U4XA 1B4ZA 4K3FA 2ZYOA 5CM6A 3V89B 3IORA 2Z8EA 4JDFA 3MZBA 1MY1A 2FA7A 4R6KA 2O51A 5CMCA 1XVXA 3OEKA 1P1WA 3O6HA 4RNSA 1LBBA 4F1UA 3AXFA 4GVOA 3ZKKA 1SQYA 1LLSA 3QAXA 4GXSB 4F18A 2QS3A 3QYTA 4FE8A 3GLBA 4BDLA 2ZNUA 1JQFA 4G68B 2I0BA 5LOMA 4G8MA 5FTIA 3FJMA 1US5A 4R6YA 3E4RA 4U1OA 4GL0A 2UVIA 1LAFE 4XXUA 3CVGA 4DDDA 3R7XA 5KCJA 3OO6A 3C31A 3O66A 2ABHA 3IL1B 1SW4A 1WODA 1M5BA 5K2YA 1VR5A 4GIZA 1NNKA 2F34A 1FQEA 2VHAA 2PVUA 5H8QA 4DLDA 3PMWA 1A54A 5TPAA 3MP1A 4XIGQ 3VV5A 1JW4A 3G3FA 3T96B 3DELB 1URDA 1LFGA 4NE4A 3ILUB 1LGBC 3PD8A 2PYYA 4OQOA 4U22A 1SYIA 2E1SA 4YB5A 2UXAA 4F2QA 3G3KA 1AOVA 3OD7A 4YMAA 2A5TA 2QMWA 4P0IA 3TTMA 1XHYA 5IKBA 4MF3A 3K01A 3KBRA 1QKAA 1ANFA 3BFTA 2ZXTA 5FTHA 5I2NA 1S7YA 1D9VA 4XKRA 3TKDA 2RF1A 3PUYE 1UTBA 3CFZA 3O97A 2P1SA 4YB7A 4EXKA 3KN8A 2I58A 3CI8A 1ELJA 4NF8A 2XXUA 4RJZA 4QFPA 1B7ZA 2O68A 1A99A 3TTKA 1EZPA 1N84A 1YPNA 2DE2A 3B6TA 2OWTA 2I49A 4OHNA 2H9BA 4ELOA 2W7YA 3PPPA 4AB5A 1B3EA 2D21A 5CMBA 4IO4A 3Q28A 1WVJA 5AA3A 1JEUA 1B0HA 4H8IA 1A8FA 1M5FA 1SI0A 1B51A 1B2HA 3S9LC 4TLMB 4I62A 3FXRA 5FHMA 5J1DA 2Q2AA 3PV0E 4F19A 2QRYA 4GF8A 2DWJA 5I2KA 3DM0A 4P11A 4OYVA 3LUYA 1LB9A 4JWYA 5H8QB 3I6VA 3DP8A 5K2XA 1NH8A 5CBRA 1IXHA 1LCTA 1A55A 4H8JA 1PBQA 4M1VA 4DZ1A 4EQ9A 5DT6A 1A7LA 3S9MC 4WXJA 2XD2A 3N6UA 1MDQA 3FATA 3IO4A 3W9WA 4PP0A 2GHBA 1MM6A 4YZZA 5FHOA 3TQWA 4YKKA 3ODBA 1NKXA 3MW0A 2UVGA 4UACA 4U21A 4AQ4A 1MS7A 4Q30B 3VVFA 3P7IA 5ICQA 5KZTA 2KLFA 4O3BA 1MQIA 3SERA 1Y4TA 1L5TA 2NXOA 4OERA 2R6GE 1UTBB 4NMYA 3H6UA 2X7PA 1MXYA 2HAUA 4JSDA 1QULA 2V3TA 1RYXA 5B70A 1UIVA 4QFOA 5IAIA 4G8HA 3HV1A 4TOZA 2HCAA 1Y3PA 3L6GA 4PETA 1I6AA 1II5A 3FV1A 5L9MA 4ZEBA 3R26A 2VD2A 3N5LA 4F3GA 2AL5A 4PQJA 1XOCA 1MY2A 4R73A 4MH5A 3U92A 4RPOA 2V25A 4F1VA 3U72A 3LR1A 3FD3A 2V84A 1AIVA 1USYE 4LQ2A 1TXFA 2OLBA 2YPNA 2B3BA 3H7MA 4YKJA 4XKQA 3HCQA 2PBWA 3KZGA 5TP9A 1S9TA 4OESA 1DMBA 5F1QA 2GHAA 3U94A 2F6GA 2YLNA 1MRPA 4ZEIA 3U1OA 3K1MA 4ESWA 1IXCA 2O7UA 2ZNSA 1Y1ZA 3OSRA 4GOTA 3G7WA 3BFUA 3PPRA 4X1BA 3Q26A 1QVSA 4BDRA 4OWDA 1B46A 2ESNA 3OELA 3KEIA 3CSBA 3U8QA 2AYSA 4Q5TA 5I84A 2QJEA 5JTYA 5ICTA 1BKAA 1B5HA 3C32A 3OSQA 4H65A 4KQPA 2X7QA 5HM4B 5KDTA 2I4BA 2VD3A 3OOAA 4G68C 4RYAA 1MPBA 4BDNA 4R2FA 3SEWA 1B7UA 4WKMA 5CMMA 3TODA 3ZSFA 2OWSA 2P0SA 3MVWA 2LAOA 1IXGA 2RCBA 2X26A 4U2RA 2V3QA 3OO8A 1B5IA 1MXUA 1SW1A 4LZ8A 3M3LA 5H8NB 1I69A 3FV2A 1O7TA 1GR2A 3EN3A 4NWCA 2F5XA 3S9NC 4IO2A 2XHDA 3PUZE 3VDFA 1MQDA 3OXNA 2Y84A 2I3VA 3G3IA 4PFYA 2F7BA 4JWXA 2DQVA 1B0LA 1R6ZA 5AA2B 3PGFA 3SESA 4Z7EA 5I58A 4WEPA 4XKPA 3K6XA 1EU8A 3EHUA 1B3LA 4GRKA 4U4SA 1POTA 3K1NA 4LVQA 4N6PA 4XTCQ 2DVZA 2UYFA 4FORA 3B7DA 2VGQA 1B58A 3IOTA 1IQ7A 4HCWA 4O3CA 4QF9A 3RNNA 4IGRA 4R9FA 3MP6A 3UN6A 1WDNA 4KFQA 3FZVA 1AMFA 4F3PA 3VLVA 3MVYA 1SVXB 2F8DA 3MZ1A 4F39A 1IITA 2I6EA 3K6UA 2HFBA 2XXVA 4ND9A 5B7DA 2F7CA 2R71A 2DVCA 2ANJA 1Y3QA 5DTBA 5JTYB 1TFDA 1PEBA 4U1ZA 4PFWA 3OMBA 3QIMA 1LB8A 1BLFA 4H0WA 4O3AA 3E3KA 1MXWA 2D3IA 2ALUA 2THIA 1NNFA 3PD9A 1DTGA 1XS5A 2OJTA 5L9SA 3TCFA 2QPQA 1P99A 3CFXA 1ZU0A 3TCGA 4OENA 2XX9A 2V93A 4QFLA 5ITPA 4HCYA 5AA1A 4DXCA 1D9YA 5DVIA 1B3FA 2HEUA 3VFJA 4Q0CA 1JW5A 1ZJLA 1PB7A 3T22A 1SBPA 3TYHA 3IOWA 2H4IA 4GQOA 4DIGA 1Q1KA 2DOJA 2XXQA 3C33A 3KSJA 1B1XA 3TTLA 3K00A 1Z7NE 3RPWA 4M4GA 1MH4A 3MWBA 3K1PA 1O64A 1MY0A 1FTMA 1OIBA 4GD5A 4NF5B 3UORA 4DCYA 5DEXA 3JV9A 4YMBA 3TQLA 4RK2A 3MPKA 1B52A 1FQAA 3FXQA 4ECFA 3C4MA 1EZOA 1O63A 1IZ1A 2XXHA 2NVUB 4KI0E 2F6PA 1PDAA 1S50A 3K02A 1B6HA 3RT8A 3IK6B 3KJ7A 3D4GA 1LCFA 1BIYA 3VLUA 1TFAA 3MJNA 2RC8A 2Z22A 1XT8A 1NL5A 2VP1A 2WKYA 1LAGE 3FIRA 1USYH 2RC9A 4OMBA 3L6HA 3MQ9A 1UTHA 3RUMA 3FJ7A 4BDQA 4IGTA 3RT6B 1P1QA 2Q89A 3K0VA 3TTRA 2REGA 1HSJA 2HXWA 3ONMA 4F29A 2ZNTA 2QMXA 4E0WA 1DPPA 5KCJB 2HQ0A 4TQUQ 1M5CA 2F36A 3O28A 3IJXB 3UA8A 4PE5B 2XXXA 1LBCA 4F3BA 5FHNA 4FECA 4OTEA 4MLQA 2I48A 3U93A 3EHSA 3KG2A 3UP9A 4HTGA 3PUWE 5TPAB 1TWYA 5A5XA 3PU5A 3OEMA 4R6HA 1MY4A 1URSA 3OO7A 3FGSA 4QHQA 3CIJA 3A09A 3FXUA 1DPEA 2O1MA 1LFIA 1JW1A 2XXTA 3KOSA 4EF1A 3I3VA 3C36A 4JSOA 1XC1A 1N76A 1EZ9A 1H44A 3KN7A 4C1UA 2A5TB 4GL8A 3FUZA 1GV8A 2PX1A 1GVCA 3OO9A 1YTVA 2AL4A 4C1TA 3TZAA 2O6AA 1SYHA 3M8UA 1QUJA 5I2NB 4KR5A 3Q29A 4JWOA 4IB2A 3IOVA 5I57A 3FVNA 2FYIA 2DS9A 4QSDA 3E9XA 1LAXA 4ELQA 4HS7A 2O69A 2ZYKA 2ZMBA 1ZTYA 4BDMA 4OEUA 4R72A 2DP8A 4OZ9A 4NF8B 1PC3A 4F3SA 3N94A 2XX7A 2A5SA 1JVYA 3EF7A 1OQHA 4KYDA 4FJPA 5I59A 4JXIA 3R6UA 2HZKA 1T0KA 1QUKA 3C35A 1UTHB 3I5OA 1US4A 4GWOA 4NF4A 4ZEFA 1DTZA 1ZKBA 2NWJA 1B5JA 2GFEA 4FIMA 4H5GA 3O29A 1M5EA 2I4CA 1N04A 4LQ5A 1SW5A 4GFRA 4EUOA 4RA1A 3MVXA 5I56A 1MM7A 2XXIA 4MBPA 4IY6A 1J1NA 2DYXA 1N7WA 1MQHA 2DE4A 3H4ZA 2B3FA 3TUSA 1ZMGA 3VLWA 2OK2A 3USDA 5I2KB 2NOOA 3Q27A 4IO5A 3QSLA 3C9HA 5DYHA 3LSWA 4FEBA 3V83A 4NEDA 4ZEKA 4EXLA 1JVXA 5H8SA 4PFUA 1NH7A 3CRBA 2UYEA 3UK4A 4H67A 3M3FA 1IEJA 5ISUA 2QS2A 4F22A 1VFDA 4Z0IA 4NTLA 1KWHA 4MLVA 1OMPA 3FASA 3MUQA 2B65A 1QKBA 1DOTA 3PUVE 4H5FA 4DXUA 1OVTA 3IR1A 1H43A 1JEVA 1MPDA 5DVFA 1R1NA 1JETA 1NFTA 1N3XA 2Y7PA 2PMSA 2UVHA 1Y9UA 1B9JA 3HSTA 2XXRA 4F31B 5CC2A 4FAJA 4UA8A 2DSFA 1RYOA 3HN0A 3IJOB 4N07A 3S2VA 1F9BA 2M8CA 3MAMA 4YICA 3G3JA 4ZS9A 4OFLA 1Y3NA 3MBPA 5I59B 2NUVA 3TMGA 4KYSA 3KOTA 5CI5A 1N0TA 2P2AA 3T93B 4NF4B 1VFEA 4RPNA 3K6WA 5CMKA 3KJTA 4X9TA 4LONB 5TP9B 5L9OA 4LZ5A 4ZEDA 4ZZAA 1MQJA 5I56B 1Y4CA 4ZE8A 4Q8RA 3IOUA 3QUJA 3GBAA 2Q9TA 3T9VA 3PPQA 4KHZE 4OEVA 3T9XB 3VVEA 2V3UA 4QFKA 1LFHA 4G8NA 1IXIA 1SD3A 4POXA 2F97A 1ZBMA 3RGYA 5JEIA 4P0GA 2DXRA 4KPTA 2DXYA 3H03A 1FTOA 2I3WA 1LSTA 2O7IA 1MPCA 5KDTB 3JYRA 5CRYA 4G77A 4GXAA 3T66A 1FTJA 4LUBA 1M5DA 4DCXA 1GGGA 4DXBA 1B1HA 1BP5A 3TELA 3V8XB 5TU0A 1P1OA 1Y1MA 3EHTA 3VVDA 4NWDA 3D4CA 2GRVA 4U23A 4OETA 4MFIA 2XXPA 4TLLB 4R74A 2Q88A 1B3HA 2IEEA 3CG1A 4ISUA 2XXWA 2Z23A 1ZLQA 1B40A 2PT2A 2DWAA 3KSXA 4KD5A 2Z8FA 2F35A 5M2VA 2QS1A 2ONKE 5I58B 1HSLA 2DE3A 1MY3A 3UIFA 4RXLA 3TPAA 1FQFA 2XD3A 3HHFA 3CR9A 4EQ7A 1H76A 3TEPA 1B4HA 4OXVA 4L17A 2YJPA 1AL3A 1VSOA 4LATA 3G3HA 3BKIB 4PFTA 2R9JA 3A3CA 3TFLA 4BLAA 1R9QA 3IX1A 1B7HA 2RC7A 4EF2A 3GXAA 1BTJA 4I9DA 3MC2A 3JZJA 3O9PA 4DE8A 2ONSA 4ZDMA 3LSLA 2RCAA 3TCHA 2Y7RA 4THIA 3MVZA 5CBSA 4FEDA 4BDOA 3V5AA 2G29A 4IY5A 3HO7A 5AA2D 4I1DA 2ZYNA 3PPNA 3K6VA 4POWA 4LP2B 1A40A 2H98A 3O6IA 5BUUA 1TT1A 4R9GA 3G3GA 4NF6A 3VXBA 3LBSA 2Y7KA 3IO6A 2Y7WA 3K2DA 1N3WA 3N6TA 1PB9A 3SKPA 3ECRA 1YAEA 1MH3A 1IUDA 3SETA 1MXVA 5EHSA 1A8EA 5F7VA 3TAJA 1UIUA 1SDXA 3OENA 2CZLA 1P1NA 2QL3A 1NNTA 3PMVA 1FQCA 4H6DA 1MXXA 4XKNA 3THIA 3Q25A 3SEXA 3GZGA 4ESXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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