4LATA

Crystal structure of phosphate abc transporter, periplasmic phosphate-binding protein psts 1 (pbp1) from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a in complex with phosphate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ESITAVGSTALQPLVEVAADEFGTIHVGKTVNVQGGGSGTGLSQVQSGAVDIGNSDVFAEEKDGIDASALVDHKVAVAGLALIVNKEVDVDNLTTEQLRQIFIGEVTNWKEVGGKDLPISVINRAAGSGSRATFDTVIMEGQSAMQSQEQDSNGAVKSIVSKSPGAISYLSLTYIDDSVKSMKLNGYDLSPENISSNNWPLWSYEHMYTLGQPNELAAEFLNFVLSDETQEGIVKGLKYIPIKEMKVEKDAAGTVTVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS 1 (PBP1) from Streptococcus pneumoniae Canada MDR_19A in complex with phosphate
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords Phosphate-binding protein PstS 1
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4latA02
3RN8A 2UVJA 3TELA 5K2XA 1MXUA 3S9EA 4LQ5A 2I49A 5I2KA 2Z22A 2A5TA 4GXAA 2H4IA 3FXRA 4F3PA 3FJGA 1LBCA 1IIWA 5H8QB 3K6VA 4EXLA 1UTHB 3U93A 1N3WA 4YZZA 1XT8A 3O66A 1UTBB 3MUQA 3K0VA 3MW0A 4LZ5A 1Y3PA 5ICQA 1SW5A 1Y1MA 3U94A 3O6HA 3PD9A 1JETA 5LOMA 4THIA 4QHQA 1OQHA 4Q0CA 3LSXA 5H8FB 4ELPA 2HCAA 5H8HA 5EHMA 4OEUA 5A5XA 2I0BA 1FW0A 2DWIA 3KJTA 3TDJA 2QMXA 5FHNA 2XD3A 3E13X 4FATA 3I5OA 3IAZA 2F36A 1NH8A 4GRKA 1N3XA 4NF8B 1RYOA 3TCGA 1N7XA 4POWA 4I9DA 3VLWA 1IUDA 1YAEA 4RPOA 1GV8A 3MP8A 4EQBA 2AYSA 2PYYA 2V3QA 4KYEA 2I48A 5I2NA 1MQJA 3K4UA 2HAUA 2FYIA 1LFHA 1B4HA 1XVXA 4U21A 5K2YA 4DCYA 5JK4A 3CRBA 2ZXTA 4GF8A 3KJ7A 4RNSA 3VE1B 5FTHA 4OWDA 2NOOA 3HHGA 4JWYA 2I0CA 5FTIA 3KOTA 3JZJA 4ZE9A 3T9VA 4H65A 5CMCA 1EZOA 3B7DA 4RK9A 1LFIA 2XXXA 4GWOA 1MQDA 1TWYA 3ZSFA 3IX1A 4R2BA 5H8NA 4YKIA 4FEDA 4FE8A 4NF5B 3TTLA 5L9SA 3IR1A 1MDQA 4NMYA 1MXVA 4G4PA 2RINA 4IY5A 1B40A 4O3CA 5ISUA 5EHSA 2V84A 3AXFA 3TEPA 4M1VA 1L5TA 2O51A 4AB5A 3TQWA 4ELQA 3LBSA 1OQGA 4AB6A 2RCBA 3ZS6A 2XXVA 3QSLA 5TPAA 3OELA 1MXXA 4HS7A 3S9MC 2RC7A 1SI0A 3FATA 1LGBC 1EZPA 2VD3A 2P0SA 1M5DA 1QKAA 3PGFA 1MY2A 3MZ1A 4KFQA 2ESNA 3UP9A 4C1UA 1VR5A 5DVIA 1N04A 1B4ZA 3P7IA 1A54A 4WEDA 5I56B 3O97A 4OFOA 1ZMGA 4XKRA 1M5CA 3TFLA 1DTZA 3DP6A 3O29A 4P0IA 4IO7A 4ZDMA 2DXRA 2HEUA 2D5WA 3PPNA 4F3BA 4IO3A 2Y7RA 5AE4A 3WAFA 3L6HA 2VOZA 1D3KA 3R26A 3RTWB 1A7LA 4TLMB 3K1NA 1IXGA 4QF9A 3S2VA 4ZEDA 3IOUA 4QRZA 3SETA 4F1YA 1OVBA 4G8MA 4ZZEA 4JDFA 3Q28A 4QSDA 2DOJA 1BKAA 3VVDA 3C4MA 4FORA 2YJPA 2UVIA 4GFRA 2OWSA 3CFZA 3FUZA 4PFYA 3MZBA 4TOZA 2X7QA 2DE4A 2Z23A 5CMMA 4HCYA 5CRYA 1I69A 3EHSA 3MWBA 4OZ9A 4BDNA 4XKPA 5ITOA 3KFMA 2A5SA 4E0XA 4Q8RA 4OQOA 5IAIA 2ALUA 3LC8A 2HAVA 1MY0A 1YTVA 1MQGA 2F7BA 3RNNA 1QW0A 3IB1A 1O63A 3O2AA 3PUYE 3C9HA 1B7ZA 4N13A 5B70A 5CBRA 1B1XA 1LAGE 4GLIA 4LZ7A 3RY3A 3T22A 3VVEA 1LAHE 1DPPA 4O3AA 3MC2A 2DQVA 3IB0A 3G7WA 3HV1A 2F8DA 3SEWA 3FV1A 2AL5A 3KGCA 1II5A 1JVYA 2ZNTA 3LSLA 3TMGA 1B7UA 2AIXA 2ZYMA 3K1MA 2OWTA 2XXWA 1PB9A 2QS1A 3GLBA 4BDRA 3H03A 1OLCA 3BFUA 3ILTB 1NNKA 1P1OA 3WAEA 1Z7NE 2RKMA 4HCWA 3UA8A 3K6UA 3N26A 3T66A 1VFEA 4F2OA 1JW4A 4OMBA 2RCAA 4KYSA 1PB7A 2Y7IA 3OO6A 5KCJB 4NF6A 1M5BA 2DWAA 3MBPA 4LP2B 3G3FA 3OOAA 1ZTYA 1SW2A 1FQFA 3H06B 4IB2A 3C35A 3T93B 3ZKKA 1Z7ME 4H8IA 2H98A 4DIGA 5ELVA 4ZEKA 1LAXA 1NNPA 4DXCA 1N7WA 1DMBA 1LB9A 2ZYOA 2PT1A 5JEIA 1B3FA 4P0GA 3KN8A 2R9JA 1ZKBA 1I6QA 4R72A 2UYFA 5TP9A 3QK6A 3T9XB 1Q35A 3DELB 5B7DA 5I2KB 3H4ZA 5I57B 2A5TB 2VGQA 2QPQA 3TQLA 4FAJA 2V3UA 2ZNUA 2Q89A 3CIJA 1FQEA 1LLSA 3MJNA 1FQCA 2NWJA 4OESA 2VD2A 4I62A 4F3SA 2WKYA 4YKKA 1US4A 1HSJA 3K02A 2PX1A 5CMBA 4FEBA 3OSRA 4PFUA 3MZ9A 1SI1A 1B7HA 3O6GA 4OTEA 4KCDA 1MPCA 3QYTA 1PDAA 4DZ1A 3EPEA 2KLFA 5I58B 3M3LA 1IZ1A 2UVGA 1F9BA 2P1SA 2THIA 5A5XB 1B32A 1I6BA 3IOVA 1OMPA 2H5YA 1XOCA 1S9TA 4LA9A 3TTKA 1N84A 3CFXA 4JWOA 5J1DA 1GGGA 4GQOA 1BLFA 4R73A 2O7IA 2R6GE 2DS9A 2CMOA 4QSCA 4OERA 4GVOA 4G2ZA 3U8QA 1DTGA 4YU0A 2DXYA 2I3VA 1YCJA 1UTHA 1MG1A 3M3KA 4POXA 5I59A 4YB5A 1HSLA 4OVJA 3G3JA 1MS7A 1RYXA 1UTBA 1B2HA 5I84A 5KDTB 3GZGA 3OSQA 4QFLA 2GHBA 3THIA 4F22A 4ESWA 1XHYA 2G29A 2XXRA 1B1HA 1IXCA 4NE4A 2O84X 3PUWE 5DVFA 3MP1A 4U22A 4F1VA 1URGA 2OLBA 3KSJA 2O69A 1H44A 4C1TA 4I8CA 5M2VA 3TCFA 2P2AA 4F39A 2ONKE 4IO5A 4IO6A 3IB2A 1JQFA 1MH4A 3IJXB 4NF8A 3HN0A 4ZEFA 2Z8FA 3DP4A 5CBSA 1LFGA 3OD7A 3S9LC 2Y7PA 4IO2A 3CG1A 3PPOA 3D4GA 1USYH 4X48A 2PBWA 1MDP1 4F29A 3MVWA 5L9MA 1SYIA 1B3LA 3B6QA 1HSEA 2RC8A 1ATGA 2R71A 4QFNA 1AIVA 3MPLA 3JYRA 1Y3NA 3G3IA 4G68B 1N76A 3RLFE 2F6PA 4OETA 3CVGA 3UK4A 3OEKA 3ILUB 2O1MA 3U1OA 3N6TA 3IO4A 1B0LA 4DDDA 4BDOA 3EN3A 1IXHA 3ODBA 4RY1A 2XX7A 3D4CA 3V89B 1Y3QA 2XXQA 4LVQA 1JEVA 1MPDA 3OENA 1MQHA 3CR9A 1POY1 4FJPA 1PC3A 1Y4TA 3CSBA 4BDMA 2OBGA 2XXYA 5IKBA 1LCFA 1US5A 3IO6A 2DVZA 4EUOA 2O1LA 3A09A 3T9HB 2HXWA 4FIMA 1B5HA 2PVUA 5JTYA 1B46A 1VFDA 1LBBA 2GH9A 2I4BA 3QUJA 4YMBA 2OZZA 1NFTA 4PE5B 4R9GA 3DLNA 3N5LA 4X1DA 3H7MA 1TFAA 3MPKA 1MXZA 3Q29A 2G93A 4U1OA 3G3GA 4NWCA 5HPQA 3TZAA 1ZLQA 2IEEA 5DYHA 3I3VA 2B3FA 4GL8A 4RJZA 5I56A 3OMBA 3TYHA 3CG3A 1I6AA 2D3IA 2ABHA 4U1ZA 3H6UA 3CSGA 2DP8A 4DE8A 2F97A 4DXUA 1IQ7A 1MPBA 4PP0A 4DLDA 1ZJLA 4KCCA 1AL3A 1QULA 1WDNA 4BDQA 3PPRA 1N0TA 5DEXA 1A8FA 2PMSA 1SVXB 3W15C 1BP5A 1BIYA 3IOTA 1UQWA 4YB7A 1A40A 5CI5A 4H5FA 3OO7A 2VP1A 4NF4B 1SBPA 4LZ8A 2W7YA 2YPNA 1PBPA 4FECA 1OIBA 4F1UA 2F78A 1A55A 3MP6A 3T96B 1LAFE 3C34A 4EF1A 1AH5A 4WXJA 1ZU0A 4ESXA 4KD5A 3VLVA 4EQ9A 3BFTA 2Q8JA 5AA1A 2O68A 3ECRA 1BTJA 4MLVA 3Q25A 3S9NC 4GD5A 4H6DA 4C0RA 3A3UA 1FTMA 3UORA 3C33A 1EU8A 3U72A 1A8EA 4MFIA 2E1SA 2ZMBA 3HSTA 1QUKA 2I58A 1KWHA 4HW8A 3PPPA 1QUIA 3Q26A 2H9BA 2X26A 3PD8A 2V93A 1H76A 3QXMA 2QMWA 2QRYA 2OJTA 4NF6B 2QS2A 2XXUA 4R6YA 1JEUA 3BKIB 3V8XB 4R2FA 3H6WA 3K6XA 4RPNA 4YKJA 1VE4A 1T0KA 1EH3A 3H6VA 3VV5A 1M5EA 1B3EA 1FQAA 3BBRA 3R6UA 3LSWA 1ANFA 3G3HA 2RC9A 1A99A 4LQ2A 1Q1KA 3TTRA 3VDFA 3VVFA 1IEJA 4R75A 2NXOA 4R6KA 2F7AA 3TCHA 3PUZE 1P1WA 2LAOA 4YICA 3TKDA 1SYHA 1TT1A 1B05A 1H45A 1LSTA 3JV9A 2Y7WA 4X9TA 2GHAA 1B5JA 3RUMA 1JVXA 3SEVA 3EQ1A 3V5AA 2ZNSA 3CFLA 5AA2B 5AA4B 4U23A 3E3KA 5KCJA 1FTOA 2YLNA 2Y84A 2FNCA 3FXUA 3B6WA 4OFJA 4PFTA 1GR2A 3I6VA 3KOSA 3R7XA 1Y4CA 5ICTA 4JSOA 3FJ7A 4HTGA 3TAJA 3VXCA 3K2DA 4ZECA 1FQBA 1MXYA 2ONSA 2AL4A 3FJMA 3C31A 2XHDA 3SERA 4AQ4A 4U2RA 4Q30B 3O28A 1SQYA 1SW1A 4Q5TA 2DE2A 4TQUQ 3KN7A 1CB6A 1FCKA 1POTA 3FVKA 4RYAA 4QFPA 3O9PA 3FVGA 4U4XA 1D4NA 5I57A 1NL5A 4RK2A 5H8HB 2XXIA 4DCXA 3VXBA 2UYEA 3IK6B 3H3GA 1SD3A 1PBQA 1EZ9A 3VLUA 5I59B 3K1PA 3N6UA 3E9XA 3HHFA 3Q27A 1NKXA 1Y20A 4P11A 3PUVE 1B5IA 5HM4B 3HPIA 4F2QA 4H5GA 2RF1A 2FA7A 4OEVA 2I3WA 2XX9A 4X1BA 2F35A 1SDXA 4BDLA 5H8QA 1LB8A 1WODA 1UIUA 3RPWA 5I58A 5I2NB 3GBAA 4NTLA 3LUYA 3L6GA 4JBZA 3IORA 4EXKA 1AOVA 3QIMA 3LR1A 2DE3A 3EF7A 3PU5A 5L8DA 4OXVA 2NVUB 4NWDA 5EYFA 1S50A 4N07A 3G3KA 1NNTA 4JWXA 1P1QA 3ZKLA 3DM0A 4ND9A 5H8FA 1SW4A 3FZVA 4ELRA 1R9QA 3FV2A 1B3GA 3RGYA 4QSEA 5F1QA 1IITA 3ONMA 1ELJA 5HBCA 3EHTA 1XC1A 1LCTA 3SEYA 1OLAA 1IXIA 2DVCA 3IJOB 4IO4A 4E0WA 1QKBA 3FXQA 5KDTA 5H8NB 4GOTA 4KR5A 4F19A 4OENA 1MY3A 2M8CA 3C32A 3PV0E 3C36A 2BJJX 5CMKA 2DSFA 1TFDA 1YPNA 1MRPA 1MQIA 4KYDA 4WEPA 3GXAA 4KI0E 1QUJA 2I4CA 4MLQA 2ANJA 3W9WA 5F7VA 1RKMA 4F18A 2OK2A 5TPAB 5DT6A 1XVYA 3DP8A 4YB6A 3M8UA 2VHAA 4U4SA 4MBPA 3F11A 4QFOA 3PMXA 3IL1B 1FQDA 3SESA 2Y7KA 2F6GA 1P1UA 2I6EA 2ZYNA 3FIRA 4XKQA 4OYVA 2HFBA 2Z8EA 3SKPA 5JTYB 3RT8A 3M3FA 3S4UA 4RXLA 4G68A 4R6HA 1B6HA 3N94A 4G77A 4NF5A 4BLAA 1Y9UA 2GFEA 2B65A 2F7CA 1B58A 2NUVA 3USDA 1GTKA 1R9LA 4R9FA 5BWJA 1MM7A 1PB8A 4DXBA 3K6WA 2OCUA 1PEBA 2O6AA 2H25A 3TTMA 1R1NA 3H6TA 2V25A 3PMWA 4EF2A 1DPEA 4M4GA 4EDPA 3KZGA 4NEDA 5FHOA 4XIGQ 2CZLA 4KPTA 4H8JA 4LUBA 3FGSA 3CI8A 1XS5A 4ZE8A 1TXFA 3OXNA 1JNFA 2QS3A 2HZLA 3OO8A 2UXAA 4XKNA 5BUUA 2Q88A 2ZYKA 1DSNA 4GL0A 1R6ZA 4OHNA 3W9VA 5DEXB 4LATA 2UVHA 3FVOA 2E0SA 4IGRA 4EQ7A 4Z7EA 1ZBMA 4ELOA 3K01A 3UGWA 5ITPA 5AA3A 2DYXA 5DVJA 3K00A 3KG2A 3IOWA 3PUXE 4K3FA 2Q2AA 3V83A 1MM6A 4MH5A 1H43A 3VFJA 4ONYA 4OFLA 3SDFA 3UIFA 4PETA 4QFKA 2GRVA 2XXTA 1MXWA 3KSXA 3EHUA 4YMAA 4RA1A 1D9VA 1FTLA 4KQPA 2XXPA 1JW5A 3QUFA 4F3GA 3B6TA 1DOTA 3KEIA 4G8NA 3PPQA 2Z8DA 4IY6A 1B52A 5CC2A 3RT6B 2PT2A 4UA8A 1MY4A 3LSFB 1H3DA 5KZTA 1AMFA 4ZS9A 3RTFB 2HZKA 2QSXA 4TLLB 3KBRA 4YKPA 4H67A 4KHZE 1NMUA 4NF4A 3MAMA 1B3HA 3A3CA 1B0HA 2D21A 1M5FA 1CE2A 4YAHX 1URSA 1GVCA 3UN6A 5CM6A 4ZZAA 3HO7A 2B3BA 4ZEBA 4I1DA 3TTNA 2O7UA 1O64A 2H99A 3MVZA 4UACA 3TPAA 2XD2A 5H8SA 3FD3A 4Z0IA 4JB7A 3OO9A 4ISUA 4ZEIA 4PFWA 4PQJA 3T9UA 4L17A 3U92A 2QJEA 3RQTA 1USYE 5FHMA 1FTJA 3QAXA 4WKMA 5AA2D 2HQ0A 3SEUA 2XX8A 3O6IA 3KN3A 5TP9B 4XTCQ 1J1NA 1QJMA 4H0WA 3E4RA 2V3TA 1NNFA 4XXUA 1O7TA 4H1XA 2Q9TA 2ONRA 2DWHA 1FTKA 5DTBA 1S7YA 1P1NA 5L9OA 2QS4A 1Y1ZA 1URDA 3HCQA 4GXSB 3MQ9A 1D9YA 2X7PA 1MH3A 1VSOA 3GBBA 3PMVA 4JXIA 4ECFA 2F34A 4LONB 1ZIUA 3SEXA 2DWJA 3TUSA 4G68C 1WVJA 3MVXA 2XXHA 1B9JA 4G8HA 4JSDA 1MY1A 4R74A 3FASA 2IA4A 3OEMA 3MVYA 4IGTA 1B51A 1P99A 2REJA 4MF3A 4GIZA 3FVNA 1NH7A 3TODA 4F31B 2REGA 4O3BA 5TU0A 1QVSA 5AA2A 2F5XA 4N6PA 2Q2CA 5AA4A 1OVTA 1JW1A 1UIVA 2QL3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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