4P11A

Native crystal structure of mltf pseudomonas aeruginosa
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
428
structure length
428
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Native crystal structure of MltF Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
total genus 152
structure length 428
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2014-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4p11A02
3TUSA 2XXRA 5AA3A 4GIZA 3GXAA 3FVKA 3SESA 3F11A 1OQHA 4FEDA 1P1OA 2XXVA 5CMMA 3FGSA 4EQBA 2P0SA 1Y1ZA 3I3VA 1I6BA 3SEYA 4X9TA 5AA2D 3ECRA 1DPEA 4ELPA 4U21A 3R6UA 2E1SA 2ANJA 2Q2CA 3TTMA 5I59A 3IL1B 1IZ1A 4HW8A 3O6HA 3K4UA 4G2ZA 1LBCA 3TZAA 4OVJA 3EF7A 2ESNA 4MBPA 1UIUA 3K6VA 5HBCA 1B40A 1IXIA 5DVJA 1FQCA 4QFOA 3CSBA 5CI5A 1PEBA 1Y3PA 3LR1A 1XS5A 2FA7A 3TYHA 3TPAA 4DLDA 1N04A 3KG2A 1FQDA 2VOZA 2QMXA 2FYIA 4R6YA 2O7IA 1LLSA 1MQGA 3MPKA 1AMFA 3UGWA 3IOVA 2H9BA 4R74A 3HHGA 4H5GA 4RA1A 2HAVA 4LZ5A 3WAEA 1M5CA 1IEJA 1EZOA 2LAOA 4OYVA 1ZIUA 1UQWA 4IY6A 2QRYA 2OK2A 2QS3A 3RY3A 4N07A 3MPLA 4QFLA 1EU8A 1HSJA 4C1TA 1UTBB 2F7BA 4TOZA 2B3FA 3IJOB 1RYXA 2OBGA 3EPEA 3TCGA 4GWOA 2I3WA 3TODA 3TTNA 1ATGA 3PU5A 1B32A 1B7UA 2H98A 1B1HA 5DVFA 1Y4TA 2X7QA 1PDAA 3OELA 3TAJA 1PC3A 1OIBA 5ITPA 3RN8A 1B1XA 1TFAA 3HPIA 5CC2A 4NF8A 4OFOA 3RT8A 5TU0A 5H8SA 4NF6A 3TMGA 2G93A 1SW2A 1QUIA 3C35A 4DXCA 5HM4B 2DS9A 3T9VA 4OMBA 1IUDA 1B3GA 1LCTA 1XT8A 3FV2A 4YZZA 4AB5A 3EN3A 4RNSA 5AA2A 4KCCA 2I4CA 4FECA 3MP8A 2ONSA 4XIGQ 1A54A 4P11A 1ZJLA 4LP2B 1CB6A 3ZKKA 2XHDA 1YAEA 4GD5A 5H8HA 3UA8A 3BFTA 2Z8FA 3KN8A 3K01A 3K1PA 3BBRA 3W9WA 4KYEA 3B6QA 3FVGA 5FTHA 4ZEIA 2DYXA 1Q1KA 3D4GA 1JW1A 3JYRA 4F1UA 4RYAA 4ELRA 1MH3A 2F6PA 4IGTA 3USDA 3MBPA 1LBBA 2PVUA 2UYFA 1B46A 3QYTA 4ONYA 4NF5A 4TLMB 3KOTA 1YTVA 5KDTB 3OENA 3VLWA 2OWSA 4G68C 1ZU0A 3JZJA 2P2AA 4KI0E 5L9SA 3QSLA 4FORA 3FD3A 4NWDA 3K6WA 4PFYA 3K6UA 1FTMA 1LAFE 2A5TB 3OXNA 3N6UA 5I56A 4G8NA 4HTGA 5BWJA 4Q30B 4R75A 3HSTA 3U94A 2PT2A 2ZMBA 4C1UA 3FXQA 3TTRA 3C36A 1DOTA 3VXCA 3K1NA 3FJGA 3I6VA 3UP9A 4OEUA 1YPNA 3FASA 1MQJA 3VVEA 3LSLA 4FATA 1JVXA 4WEDA 1LAHE 3N6TA 3S2VA 1LCFA 4WEPA 3SETA 4OZ9A 3O66A 1Y3QA 3IB0A 5AA1A 4U2RA 4QSEA 3UK4A 3U92A 2UYEA 2RCAA 4RK2A 4IO5A 4YMAA 3U93A 3CG3A 3H6WA 3RPWA 1ZBMA 1WDNA 3T9UA 5TP9B 5A5XA 3EQ1A 4RY1A 3L6HA 5JK4A 5AA4A 3EHTA 5DEXA 5ITOA 3KGCA 4PFWA 4KPTA 3C34A 2DSFA 1FTJA 1PB8A 1A40A 2ZNUA 1MY3A 3QIMA 4C0RA 4YAHX 4ZE8A 4L17A 2QS1A 3CFLA 3KOSA 1B9JA 2Y7IA 3O28A 2IEEA 5TPAB 1Z7NE 1POTA 1Y1MA 1JEVA 1VFEA 4YU0A 2I48A 4KD5A 5FHNA 5CRYA 4POWA 2UVHA 2RC8A 1AIVA 2PMSA 2PT1A 1IITA 1QJMA 4KYSA 3E9XA 1RKMA 3G3HA 1FQFA 2YJPA 4BLAA 3O6IA 2HZLA 4LQ5A 1IXHA 3DP4A 1H43A 3IO6A 2RF1A 1ELJA 3OO6A 1DMBA 3ZKLA 2ONKE 3KSJA 3SDFA 3TFLA 4OESA 3M3FA 3MZ1A 1TWYA 4JWXA 3CIJA 4FJPA 1Y3NA 5JTYB 3IOWA 3GBAA 2KLFA 3K1MA 1TT1A 3PPQA 4R9FA 3DELB 4I9DA 4QFNA 1SW1A 5F1QA 3OMBA 5DEXB 4IB2A 4EF1A 3OSRA 4F22A 3FZVA 1MXXA 1IXCA 4MH5A 4XKQA 3PPRA 3RUMA 4DCXA 4Q0CA 2DVZA 3IOUA 1IQ7A 4ZEBA 2Q9TA 2G29A 3KSXA 4BDOA 1MY1A 1FW0A 1ZKBA 4LZ7A 4IO2A 4U1ZA 5L8DA 1OVTA 2XX9A 1NNTA 1B51A 2VHAA 3EHUA 4ZZAA 2Q2AA 2XXWA 1HSLA 3R26A 5LOMA 2PBWA 4R72A 2Q89A 4GOTA 5ELVA 4BDMA 3PUXE 3EHSA 4EDPA 1N7XA 4DDDA 3ILTB 1SI0A 1BLFA 4RK9A 4GL8A 1DPPA 3SEUA 4TLLB 1NNKA 3ZSFA 4N13A 1JW4A 4OXVA 4ZS9A 2VP1A 2I3VA 3KN3A 3RTFB 1M5FA 5IKBA 1TXFA 4IO7A 4HCYA 3TQLA 4DZ1A 3C9HA 3G3FA 1I6QA 4X1DA 2I49A 3HCQA 4N6PA 2ZYNA 1NL5A 4YMBA 1US4A 4NWCA 3A09A 5I58A 3KZGA 1I69A 3IORA 5I57A 5JEIA 4PE5B 1MQIA 1FQEA 2XXPA 3IAZA 3MUQA 4ZZEA 1B3FA 1S9TA 3MAMA 2VD3A 1B4ZA 2W7YA 5I2NA 3TTLA 4DE8A 2ALUA 2FNCA 3BFUA 4R73A 2V3UA 4JXIA 2Y84A 4LONB 3QAXA 3E4RA 1IIWA 1MM7A 1NH7A 4Q8RA 4U1OA 2OLBA 3OO8A 3V89B 1UIVA 3IJXB 4OTEA 4POXA 3OO7A 4ELQA 4U4SA 4QSDA 4R2BA 3PPPA 1GTKA 5DTBA 1OMPA 2H5YA 1KWHA 4GL0A 1NH8A 2WKYA 4PFTA 2X26A 1O7TA 1H76A 2I0CA 4BDRA 1HSEA 3D4CA 3V8XB 3H03A 3Q29A 1H3DA 1B7HA 1EZ9A 2CMOA 3B6TA 5L9MA 4IY5A 2M8CA 3VLVA 2Z8EA 3SEWA 5I59B 3LBSA 2DQVA 2QS4A 5F7VA 1SW5A 3T9XB 2NXOA 2O6AA 2I4BA 3FXRA 4IO4A 2V93A 1AH5A 2NWJA 2ZYMA 1MDQA 3P7IA 1JW5A 1NFTA 1LFGA 4GF8A 1VFDA 4FIMA 5HPQA 4BDLA 1MRPA 2A5SA 1QVSA 1FQAA 5H8QA 1GVCA 1T0KA 3TCHA 4AQ4A 4GXAA 5CMKA 1USYH 5M2VA 4F39A 4M4GA 1JVYA 4ZEKA 3TKDA 3S9MC 3KJTA 5H8FA 4M1VA 2OCUA 4KQPA 3HO7A 3N5LA 1FTOA 4O3CA 3H6TA 2NUVA 3RNNA 4K3FA 2F5XA 4OWDA 4LUBA 1B7ZA 3S4UA 1B52A 1N3XA 4GLIA 4QHQA 2YLNA 3G3KA 5I84A 2REJA 3HV1A 3CRBA 1MH4A 1VE4A 3FIRA 1LSTA 1URSA 1MDP1 3A3CA 4EF2A 2QJEA 2V3QA 1XC1A 2GHAA 5CBRA 2O68A 4KR5A 4NF8B 3OEMA 5K2XA 2IA4A 4EXLA 4ISUA 3ONMA 4NTLA 4NMYA 2RKMA 1JQFA 3KBRA 1FTKA 1H45A 4NF6B 4JSOA 3IX1A 3N94A 2PYYA 2XXXA 3N26A 4H0WA 3VXBA 3LSXA 1SVXB 1S7YA 1B6HA 2D5WA 3S9NC 3QK6A 5DT6A 4PFUA 1BP5A 3RGYA 4OERA 1WVJA 3KEIA 2REGA 2QPQA 3OEKA 5AA2B 4RPOA 5KZTA 2H4IA 1AL3A 2Z22A 2ZYOA 5H8HB 4ESXA 1P1WA 3CFXA 1QKAA 3E3KA 2HEUA 5I2KA 3H3GA 4GRKA 4JSDA 1N76A 4G8HA 1J1NA 3MJNA 4R2FA 1B58A 5B7DA 4U4XA 4X1BA 5H8FB 1ZMGA 4IO3A 4G68A 1SBPA 4OFJA 1L5TA 1R9LA 4MLQA 2XXQA 4HCWA 4PETA 1RYOA 2DXRA 1SW4A 1M5BA 5EYFA 5CMCA 1NMUA 2ZNSA 4NF5B 4F2QA 4H1XA 2NVUB 2DWIA 1N84A 5H8NA 3CVGA 1LGBC 1UTHA 3O97A 2E0SA 1JETA 1AOVA 1A8EA 1A55A 4H8IA 4Z0IA 1GR2A 1OQGA 2HXWA 4GFRA 4EUOA 3PMWA 2ZYKA 4EXKA 3R7XA 5DYHA 1N7WA 5FTIA 1BKAA 2DWJA 2V25A 5I56B 3OD7A 4KCDA 1B2HA 2BJJX 1R9QA 2OZZA 4AB6A 1MQDA 1QUJA 3TQWA 2XD2A 3IB2A 2R71A 4YKIA 2O7UA 4IGRA 2O1MA 1A7LA 4U22A 4BDQA 4NF4A 3DM0A 2O51A 3C33A 3B6WA 3K00A 3ZS6A 4XKPA 1OLCA 2ONRA 3H7MA 4LVQA 1II5A 3VE1B 1PBQA 1MG1A 2HQ0A 2R6GE 1OLAA 4JB7A 2GH9A 2DXYA 2UVJA 5J1DA 2OWTA 4F2OA 4R9GA 3CI8A 4ZDMA 3SKPA 5A5XB 4NE4A 1SQYA 5AA4B 1QKBA 3C32A 1SI1A 4H65A 1XHYA 3PPNA 2ABHA 2AL5A 3H06B 4OHNA 3OO9A 1YCJA 1JEUA 2F36A 3DP6A 2V84A 1JNFA 1VSOA 4QSCA 1UTHB 2O84X 1B5IA 4OEVA 4JBZA 2QS2A 3SERA 3MVYA 2UXAA 2F7CA 2Y7KA 4F1YA 1NNPA 5AE4A 3OOAA 3T96B 2O1LA 4YB5A 4Q5TA 3K0VA 3RT6B 1NNFA 3T9HB 3K6XA 3IK6B 5B70A 4MLVA 3Q28A 4QFKA 4QFPA 3O29A 4YB6A 4YKJA 3GBBA 4H8JA 3FV1A 2AYSA 1US5A 2XXHA 2DOJA 3QXMA 1PBPA 3T22A 3PUWE 3O2AA 1N0TA 1B3LA 4WKMA 5FHOA 3MZ9A 2GHBA 4NF4B 2NOOA 1UTBA 3H6VA 2UVIA 1D4NA 2Z8DA 4P0IA 1FCKA 3FJMA 2X7PA 1USYE 4LZ8A 3FJ7A 3CSGA 1Y4CA 1Q35A 3KN7A 1TFDA 2XXIA 3T93B 4G8MA 3O6GA 1SYHA 3W15C 3VVFA 4YB7A 3OSQA 1LFHA 1XVYA 1EZPA 4ZEFA 3PV0E 4F3PA 4OQOA 4X48A 2DE3A 1F9BA 4MFIA 4JWOA 2THIA 1EH3A 3TDJA 2AL4A 4R6HA 3PMVA 1I6AA 2DVCA 4ND9A 1B3HA 1B5JA 3PD9A 2AIXA 3K02A 4F19A 3BKIB 3FUZA 2VGQA 1D3KA 1POY1 5K2YA 3RQTA 1MXVA 4PQJA 2XXUA 1MQHA 5EHMA 1ANFA 2ZXTA 4YKKA 1Y20A 3ODBA 3DP8A 5EHSA 4O3BA 3TEPA 4ELOA 2YPNA 3PUVE 3LC8A 1B5HA 1DTGA 1LB9A 2UVGA 4LQ2A 5KDTA 2Y7RA 4KYDA 1URDA 4QF9A 2OJTA 5CMBA 5DVIA 4GXSB 1P1NA 3U8QA 3GLBA 4RPNA 1P1UA 2A5TA 1M5DA 2DE2A 2QSXA 1ZTYA 3PPOA 3Q26A 5CBSA 4LATA 4U23A 2B3BA 2DWHA 2XX8A 4KFQA 1BTJA 1MM6A 2H99A 5I58B 4FEBA 4ZECA 4F3SA 2F78A 4HS7A 5I57B 2Y7PA 4O3AA 4P0GA 3ILUB 3WAFA 4I62A 3H6UA 5IAIA 1S50A 1Y9UA 1ZLQA 4YKPA 5I2NB 4JWYA 2DWAA 1BIYA 1CE2A 3M3KA 3IOTA 1MXYA 3FVOA 3Q27A 1OVBA 2XXYA 4WXJA 5CM6A 3MVXA 3QUJA 3FVNA 2GFEA 2HAUA 3MC2A 3MVWA 3VVDA 3LSWA 1B0HA 2HFBA 1P99A 4KHZE 4EQ9A 4I1DA 3TELA 5TP9A 4MF3A 5FHMA 3T66A 1D9YA 3MVZA 4XTCQ 1SDXA 1LFIA 1B3EA 4OENA 2DP8A 3TTKA 1R6ZA 2RCBA 3UIFA 4YICA 1DSNA 3W9VA 1PB7A 2RC7A 5TPAA 3A3UA 3MP6A 3MZBA 5L9OA 3M3LA 3PGFA 4H6DA 3E13X 4IO6A 1O63A 3HHFA 2GRVA 5BUUA 3MP1A 4XKNA 2QMWA 4OETA 1XVXA 2F7AA 4G77A 1Z7ME 1MY0A 4R6KA 5KCJA 2QL3A 1PB9A 4H67A 3DLNA 2XD3A 4BDNA 5H8QB 3Q25A 1QW0A 2VD2A 3KFMA 3VV5A 4DCYA 3RLFE 3CFZA 3SEXA 3S9LC 3G3IA 2XXTA 4QRZA 2I6EA 4GQOA 4ZEDA 1D9VA 2P1SA 4DXBA 3UN6A 1M5EA 3U72A 4NEDA 4EQ7A 1WODA 3I5OA 1MPCA 4UA8A 3FATA 1MS7A 4DIGA 4ESWA 4ECFA 5JTYA 3LSFB 1MY4A 3MQ9A 4LA9A 1VR5A 3PUZE 2B65A 1MXUA 4XXUA 1DTZA 3V83A 3RTWB 2XX7A 4GVOA 2Q88A 3THIA 1LAGE 2F97A 2DE4A 4PP0A 1URGA 3UORA 1NKXA 3CR9A 5ICQA 3VLUA 3S9EA 2R9JA 1GGGA 3PMXA 3FXUA 2HZKA 5ICTA 4OFLA 4E0WA 2F8DA 1MY2A 1R1NA 4FE8A 3KJ7A 1MPBA 4XKRA 3O9PA 3CG1A 4F3GA 3U1OA 3IO4A 2PX1A 4F29A 3M8UA 4FAJA 3IR1A 3V5AA 4RJZA 2F35A 1MPDA 2I58A 3PD8A 4THIA 1LAXA 4Z7EA 1N3WA 3C4MA 1QUKA 5KCJB 1FTLA 1LB8A 4UACA 4E0XA 3G3GA 1XOCA 5I2KB 2D3IA 2Q8JA 2Z23A 3TCFA 2H25A 1O64A 2O69A 3B7DA 3QUFA 2I0BA 4F3BA 4F18A 4JDFA 1A99A 4G68B 4ZE9A 3LUYA 1FQBA 3VDFA 4F1VA 1SYIA 3AXFA 1MXWA 5H8NB 3PUYE 3H4ZA 4H5FA 2F34A 2CZLA 4DXUA 3G7WA 3MW0A 4F31B 4G4PA 3IB1A 2ZNTA 2F6GA 5ISUA 4TQUQ 1A8FA 1H44A 1B05A 2RINA 3JV9A 3G3JA 3MWBA 1B0LA 1P1QA 1SD3A 2HCAA 1QULA 2V3TA 2RC9A 3HN0A 3L6GA 3C31A 2Y7WA 1IXGA 4I8CA 3K2DA 1B4HA 3VFJA 1MXZA 3GZGA 4RXLA 2D21A 1GV8A 3SEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TUSA 2XXRA 5AA3A 4GIZA 3GXAA 3BIHA 3FVKA 3SESA 3F11A 1OQHA 4PBQA 4P3LA 4FEDA 1P1OA 2XXVA 3KC0A 5CMMA 3FGSA 4EQBA 2P0SA 1Y1ZA 3I3VA 1I6BA 1KA0A 4P56A 3SEYA 4X9TA 5AA2D 3ECRA 1DPEA 4ELPA 4U21A 4MNPA 4MNIA 2B4LA 4OVRA 3R6UA 2E1SA 2ANJA 1FPFA 2Q2CA 3TTMA 5I59A 3IL1B 1IZ1A 4HW8A 3O6HA 3K4UA 4G2ZA 1LBCA 3TZAA 4OVJA 3EF7A 2ESNA 4MBPA 1UIUA 4JVIA 3K6VA 5HBCA 1FBEA 1B40A 1IXIA 5DVJA 1FQCA 4QFOA 3CSBA 5CI5A 1PEBA 4OVTA 1Y3PA 5I5PA 3LR1A 1FPKA 1XS5A 2FA7A 3TYHA 3TPAA 4DLDA 4QXDA 4UABA 1N04A 3KG2A 1FQDA 2VOZA 4I40A 2QMXA 2FYIA 4R6YA 2O7IA 1LLSA 1MQGA 3MPKA 1AMFA 3UGWA 3IOVA 2H9BA 4R74A 3HHGA 4H5GA 4RA1A 2HAVA 4LZ5A 3WAEA 1M5CA 1IEJA 1EZOA 2LAOA 4OYVA 1ZIUA 1UQWA 4IY6A 2QRYA 1FJ6A 2OK2A 3FXBA 2QS3A 3RY3A 4GWUA 4N07A 3MPLA 3PTYA 4QFLA 1EU8A 1HSJA 4C1TA 1IMDA 1UTBB 5IM2A 2F7BA 4TOZA 2B3FA 3IJOB 1RYXA 2OBGA 3EPEA 3TCGA 4GWOA 3LV0A 1LBXA 2I3WA 3TODA 3TTNA 1ATGA 1YZ0A 3PU5A 1B32A 2XWOA 1LEVA 1B7UA 2H98A 1B1HA 5DVFA 4AS5A 2KQZA 1Y4TA 2X7QA 1PDAA 3OELA 4IR8A 3TAJA 1PC3A 1OIBA 5ITPA 3RN8A 4DI4B 1B1XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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