4R2FA

Crystal structure of sugar transporter achl_0255 from arthrobacter chlorophenolicus a6, target efi-510633, with bound laminaribiose
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
GAIKFWDMPWATPAYNDAAKKIAEGFSGANSKATYQIIQWNNFYQTFSSAIASKTGPAVSTGGGFQAFQFEEQGQIAYADKVIEKLKSNGQFDDFLPGVVEPFKTSKGYVAVPWQLDIRPLWYRKSLFEKAGVGVPTDWASLLEAGKKLKGVGAVGFATGSGAGNNIGNHLMIMMMLNNGGGVFTKDGELDVLNDRNVEAVEFLLELVSNGVIDPAAVSYTTDNLNAQWKDSKAAYGMLTLGVPERVGDTSGDIVVASPIAGPHGDKAALIFPNNIMMYTNTPSQEASEEFVVYYLGKLKELWQQKLMNALPVFKSITEMPEFTADPNNVKIVNEYVPIAKTFASQGTALSANLAALDGGQALNQFTQTVLTGKTDAKSALTAFDTGLKSVLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of sugar transporter ACHL_0255 from Arthrobacter chlorophenolicus, target EFI-510633
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Arthrobacter chlorophenolicus
molecule keywords Extracellular solute-binding protein family 1
total genus 135
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4r2fA02
4KFQA 3K1NA 4U23A 3S9LC 2NWJA 2H4IA 2QRYA 4GLIA 1UIVA 4BDQA 2PX1A 1MY4A 3T22A 4KHZE 3H4ZA 1URSA 3T96B 2DP8A 3SEWA 1DPEA 1VSOA 3FV1A 1LCTA 1MRPA 1LCFA 1Q35A 5CC2A 1NNPA 3B7DA 3KBRA 2DOJA 2H99A 5EYFA 3QXMA 5H8FB 2ZYMA 1R1NA 1A99A 1IEJA 4PE5B 5HM4B 2F8DA 4OHNA 5JEIA 1A55A 4EQ7A 1LFHA 1FW0A 1NFTA 3RLFE 4OXVA 3N6UA 3TELA 3ZSFA 4TLMB 3C36A 3U8QA 3IX1A 1GR2A 3KG2A 1MY1A 4MH5A 1FTJA 4ISUA 2H98A 3O6HA 3E4RA 1IUDA 1IITA 2NOOA 3VV5A 1O64A 3KEIA 5CMMA 4XXUA 2PMSA 2A5SA 4JWYA 1B3LA 3HSTA 4RJZA 1H3DA 4IY5A 3U72A 3S9MC 1UQWA 4NF8A 1Y4TA 1FTMA 1B1XA 1B7HA 3M3KA 2XXIA 5JK4A 2YJPA 3EF7A 2DWJA 1QUKA 5KCJA 2QMWA 3CFLA 4R6HA 3OOAA 2XXWA 4ZEIA 3I6VA 1B05A 1JNFA 1USYH 2ZYOA 1JW4A 1FCKA 1SD3A 4MBPA 3TTKA 3D4GA 3JV9A 2UYEA 4QF9A 2NUVA 2CMOA 1XC1A 4F19A 1LBBA 4IO2A 4POWA 2VGQA 2Q88A 2O51A 2RCBA 4F2OA 1ZTYA 2XXQA 3G3IA 4ONYA 5DT6A 3ZKLA 2O68A 3PUYE 3C34A 3SEVA 3HCQA 2XXYA 5IKBA 4GOTA 1MY2A 1LB8A 4OETA 3F11A 3Q29A 4R2BA 1B5IA 1GV8A 3IO4A 1SW4A 5K2XA 5TPAA 4MLQA 2Z8EA 2R71A 2QPQA 3B6WA 2DXYA 1LFIA 1LB9A 1Y1MA 2O6AA 3U93A 3TDJA 3OSRA 1FTLA 3PMVA 5CMBA 4GIZA 5L9OA 1MXVA 4RK2A 3LUYA 2A5TB 4GL8A 3EPEA 3V83A 2PBWA 1IXCA 4YKKA 3UN6A 5FHOA 1LAHE 3FZVA 3EQ1A 3KFMA 4EF2A 2F7CA 2E0SA 3WAFA 1R9LA 5TPAB 2X7QA 4GWOA 2O7IA 1PB7A 4RA1A 3MJNA 4GXAA 5JTYB 1FQFA 3B6TA 3ECRA 1ZLQA 2DWHA 1TXFA 3S9EA 3VLUA 4DDDA 1Z7ME 4ELQA 1A40A 1POTA 1DPPA 2I3VA 4AQ4A 3KN8A 4JBZA 4YU0A 1N84A 2DE3A 2HZKA 1BLFA 4KYEA 3E3KA 4NF4B 3V8XB 1DOTA 3MBPA 3OO6A 1MH4A 1MM7A 2I49A 2VP1A 5A5XA 1FQAA 3M3FA 4HCWA 5LOMA 4M1VA 4X9TA 1NKXA 1QKAA 4IY6A 3MVWA 3TTMA 3GXAA 5BWJA 4E0XA 5H8NB 3FXRA 4WKMA 5I58B 5FTIA 3G7WA 4LZ8A 3LBSA 2XXRA 4Q5TA 3MZ9A 3SEXA 2I4BA 2F97A 4X1BA 4LONB 3TZAA 3O6GA 2W7YA 2B3BA 3U1OA 3SKPA 2HFBA 3BFUA 1EZOA 3FV2A 1Y4CA 1N7XA 2HZLA 2XXHA 1NNTA 1AH5A 1US5A 4PFUA 4XKNA 1FTOA 1B3GA 4LZ5A 4OEUA 2F7AA 4NF6B 1B4HA 4NWDA 3IB2A 4POXA 3DP4A 3L6GA 5L9SA 3S2VA 3T9HB 1MXYA 1ATGA 2VD2A 3P7IA 3TTRA 4MF3A 2ZNTA 1A7LA 4DCXA 4ZEDA 4F29A 4KR5A 2QMXA 1P1UA 1FTKA 1B6HA 2P1SA 1HSEA 4F1VA 3EHSA 1BKAA 1WVJA 4NF5A 4EQBA 3HHGA 1D9VA 5I59A 4BDOA 3HV1A 4YB6A 4GXSB 4YICA 1SW1A 3C4MA 3FD3A 4E0WA 3PU5A 3FGSA 1H44A 5CBSA 2LAOA 3O6IA 3OELA 2PT2A 4U22A 3W15C 2Q2CA 4Q30B 1P1NA 1Y9UA 2ZMBA 4IO5A 1DTZA 3K6WA 5L9MA 4QFLA 4R73A 4TOZA 4P0GA 3CIJA 5CBRA 1IXIA 2IEEA 4JSOA 4N07A 3IB1A 5ICTA 3EN3A 4F3PA 4F2QA 4OFOA 2F6PA 4R75A 4WEDA 1L5TA 1XVXA 1IXGA 1ZMGA 4KPTA 2GRVA 3M8UA 1MQDA 3H3GA 1AL3A 3OO7A 3VLVA 3HO7A 3LC8A 3T9XB 1H45A 3FVOA 1DMBA 1LAXA 3G3GA 4THIA 3TQLA 4R6YA 3C35A 4ELRA 3IOUA 1M5BA 4R9GA 3HHFA 1N04A 1SW2A 3OENA 1A8EA 4FATA 2IA4A 1O7TA 3ILUB 1IXHA 3Q26A 1ELJA 5I2NA 3VVDA 3ILTB 2DWIA 2P0SA 1MS7A 4F22A 1JQFA 1CE2A 4KQPA 3TTLA 3VXCA 3Q28A 3IL1B 1MPDA 3CG1A 1TFDA 3ONMA 4U2RA 1TFAA 1OVBA 3LSXA 2Y7IA 4YKJA 2F78A 3UP9A 2B65A 3I3VA 1EU8A 4QFPA 4M4GA 4FECA 4G8HA 3FJ7A 4YZZA 4YKPA 4G77A 4PFYA 1AMFA 1ANFA 5H8SA 5I2NB 3RY3A 4OERA 1P99A 1OQHA 3ZKKA 2QS2A 5AA1A 3O66A 4ZECA 4ECFA 4OWDA 1OMPA 3IJXB 3KJ7A 1GGGA 3W9VA 5KDTA 4R72A 2UXAA 4O3AA 4GL0A 5ISUA 4DZ1A 4XTCQ 4ESWA 3PD9A 2I3WA 2VD3A 4U4XA 3JYRA 4C1UA 2Q89A 3FXUA 2Q2AA 1D4NA 4EUOA 1N76A 4HTGA 2F5XA 1D9YA 3BKIB 3OD7A 1FQEA 1NNKA 2I48A 1KWHA 1XOCA 3IOVA 1DSNA 1XVYA 4H67A 4IO4A 5I2KB 3TODA 4BDNA 5DEXB 1SW5A 4GD5A 5KDTB 1B0HA 5AA3A 2GH9A 1NH7A 1B5JA 3N5LA 3USDA 4ZZAA 3TPAA 4YB7A 1JW1A 3FASA 3QAXA 1RKMA 5F1QA 4C1TA 3D4CA 4KCCA 1BP5A 2I6EA 1B52A 3OMBA 1H76A 1MDQA 4RPOA 2A5TA 4DIGA 3N6TA 3LSLA 4BDRA 3K02A 3K4UA 1Q1KA 2H9BA 1BTJA 2ANJA 4G68C 3VXBA 1YTVA 3RTWB 2WKYA 2X26A 3K1MA 1QUIA 2QSXA 4WEPA 1SQYA 1NH8A 4UACA 4XIGQ 1EZ9A 4DXCA 4F3SA 4LATA 3VDFA 4JWXA 4ELOA 5JTYA 1B32A 3KSJA 5IAIA 1LSTA 2V84A 4H8JA 2I4CA 3MWBA 2F35A 1I6AA 3KGCA 1ZJLA 3R26A 1H43A 3TAJA 4PP0A 4F1YA 3FVGA 1XHYA 3H6VA 4YMAA 4RXLA 2OWTA 4LQ5A 3C32A 2HXWA 5DVJA 1NMUA 3T9UA 1SYIA 4NF4A 1OLCA 1M5FA 2H25A 1NNFA 1OVTA 2R6GE 2FNCA 1ZKBA 3A09A 4H65A 3QUJA 3OEKA 2I0CA 2AYSA 4YKIA 5H8NA 2UVJA 4H5FA 5I58A 1MQHA 3C31A 3MVZA 3N26A 1UTBB 4Q8RA 3M3LA 4H0WA 1LGBC 1JVXA 3PPRA 3S9NC 1LAGE 1MXXA 1LBCA 1QW0A 4GVOA 3HN0A 2M8CA 3CI8A 1SI1A 2QL3A 1US4A 4G68A 3MZBA 4XKPA 3SDFA 2UVGA 5DYHA 4EXKA 1SYHA 4I1DA 4MFIA 5FTHA 1VFEA 4ZZEA 3RTFB 4RYAA 3SEYA 2PYYA 4NF6A 1PDAA 2XX9A 2HQ0A 1PC3A 3ZS6A 2AL4A 3G3JA 2PT1A 4F31B 2D3IA 1T0KA 4IO3A 4QHQA 3PD8A 1VE4A 4ZEKA 2FYIA 5ICQA 2Q9TA 5HPQA 2DE4A 3GBBA 2F6GA 4GQOA 2OK2A 4EF1A 1Y3NA 3TEPA 3K00A 1MXWA 3ODBA 2X7PA 1EZPA 2HAVA 5B7DA 4JXIA 1QJMA 3G3KA 1XT8A 3IORA 4G68B 1SVXB 3Q25A 4MLVA 1B4ZA 4X1DA 3K2DA 1DTGA 5AA2D 1IIWA 3R6UA 3TTNA 3MZ1A 4QSCA 4XKRA 3TCFA 2G93A 3B6QA 4ELPA 3KN3A 2VHAA 2Y7KA 3MC2A 1VR5A 2HAUA 3KN7A 3SEUA 2FA7A 3IOWA 3PUXE 2DYXA 3C9HA 2RF1A 4OZ9A 2NXOA 4R74A 5H8HA 1B40A 3UA8A 3LR1A 3THIA 4JB7A 3H7MA 1IZ1A 5AA2B 3CSGA 4O3CA 4LUBA 3PPNA 1VFDA 2REJA 3RT8A 4KYSA 3FVKA 4KI0E 4OENA 2I0BA 3IJOB 4IO6A 4FE8A 2Z8DA 1QULA 4RNSA 4IGTA 4I8CA 3PGFA 2V3QA 4DE8A 2RC8A 3MAMA 1TT1A 2ZYKA 2H5YA 1B3FA 4U1ZA 5H8HB 1AOVA 2QJEA 3DP8A 3LSWA 1LAFE 3OEMA 4U21A 2Y7WA 2QS1A 2O1MA 1P1WA 2Y7PA 4OYVA 4DLDA 1II5A 3K6XA 1B2HA 2O1LA 1AIVA 4ZE8A 3PUZE 4NE4A 3O29A 5B70A 1N3XA 4OESA 2GHBA 5CM6A 3U94A 2Z8FA 3O2AA 4JSDA 4ZEBA 3KZGA 5KZTA 3PPOA 3QK6A 4P0IA 5I84A 3FATA 3H6TA 3A3CA 1HSLA 2E1SA 2QS4A 4Z0IA 4OQOA 4ZEFA 3RN8A 5I57A 2XHDA 4FORA 5CMKA 4R6KA 4IGRA 5FHNA 1Z7NE 1B5HA 1MXUA 3CVGA 2UYFA 3TUSA 4EDPA 1PBQA 1P1QA 3RNNA 1B3HA 4LQ2A 1B7ZA 1PEBA 3MPLA 3S4UA 3V5AA 4RY1A 1R6ZA 2ZXTA 1TWYA 2ESNA 2O69A 1FQDA 3VVFA 4HW8A 2G29A 4RK9A 4RPNA 2YLNA 2BJJX 2DE2A 4JDFA 2VOZA 3IR1A 1N7WA 5I57B 2OLBA 4EQ9A 1MQIA 1I6QA 3I5OA 1SI0A 1MQJA 1O63A 5DVFA 3TFLA 5AA4B 2Q8JA 2Y7RA 1NL5A 1J1NA 2GHAA 3QIMA 4EXLA 4LVQA 5F7VA 3CG3A 1UTHB 5CMCA 5I2KA 5AE4A 3VVEA 5DEXA 4NTLA 1SDXA 4KD5A 2DWAA 4BDLA 3BFTA 2ONRA 1UIUA 4Z7EA 2PVUA 2O84X 2XD2A 1MH3A 5FHMA 4F18A 1PBPA 4YMBA 3KOSA 1OQGA 4GFRA 2B3FA 2XXTA 4FJPA 3QUFA 3PPPA 3DLNA 4WXJA 2ZYNA 4KCDA 1IQ7A 2XXUA 1JETA 1OIBA 2QS3A 3PUVE 3W9WA 1WDNA 4ESXA 4PQJA 2UVIA 1B9JA 4G2ZA 3H6WA 2D5WA 3OO9A 5ITOA 3RGYA 3IK6B 1B58A 1I6BA 5HBCA 1B51A 2DS9A 1I69A 2AL5A 3FIRA 3G3FA 3O28A 4H6DA 3Q27A 4H8IA 3MP6A 4F1UA 3SETA 1MDP1 1XS5A 3RQTA 1B3EA 2DVZA 2NVUB 4FIMA 3EHUA 1ZU0A 5EHSA 1S9TA 1MG1A 3TMGA 4NWCA 3UIFA 4IB2A 1BIYA 1M5EA 1GVCA 2RCAA 2OJTA 4DXUA 2F36A 5M2VA 4DCYA 3GZGA 5TP9A 3OXNA 4F3BA 4ZE9A 5CI5A 3OO8A 4NF8B 1Y3QA 4FEDA 3T66A 1B1HA 5KCJB 1LLSA 3MVXA 4HCYA 4KYDA 2XD3A 1GTKA 1LFGA 1UTBA 3O9PA 1MY0A 1ZIUA 1P1OA 4LZ7A 1QVSA 1B0LA 4K3FA 4QSDA 3BBRA 4ND9A 1FQCA 5L8DA 2D21A 2OWSA 3R7XA 4ZS9A 3PMWA 4OEVA 2YPNA 1CB6A 1R9QA 1HSJA 4FAJA 4FEBA 1JEVA 5TP9B 1Y1ZA 1MXZA 1WODA 1S50A 1QKBA 2ABHA 2ZNSA 3KJTA 3C33A 2XXPA 4AB5A 3TKDA 5K2YA 3MVYA 3SESA 2V25A 2THIA 2Z22A 5H8QA 4L17A 4DXBA 2GFEA 4LP2B 4C0RA 2XX7A 4QRZA 4UA8A 3CR9A 3PPQA 2O7UA 2OZZA 3KOTA 5ITPA 4G8NA 1POY1 3EHTA 3H06B 3FXQA 4R2FA 3FVNA 1RYOA 2V3TA 4LA9A 4OMBA 3TCHA 4O3BA 1B7UA 2KLFA 4HS7A 4TLLB 3CFZA 4YB5A 5H8QB 1N0TA 4F39A 4PFWA 2ALUA 3L6HA 3DP6A 5DTBA 1A54A 3IAZA 4QSEA 2DVCA 1OLAA 4N6PA 3FJMA 1YPNA 2F34A 1JEUA 4TQUQ 4F3GA 1Y3PA 5AA2A 2REGA 3T93B 2DSFA 4G4PA 3GBAA 3QSLA 1SBPA 4OVJA 5TU0A 1JVYA 4H1XA 3VLWA 4U4SA 4JWOA 5BUUA 3MUQA 2R9JA 1S7YA 4QFKA 3HPIA 5EHMA 3RUMA 3GLBA 5A5XB 1M5DA 1MM6A 2V3UA 2XXXA 3SERA 3H03A 1D3KA 3CRBA 4OTEA 5I56A 2RKMA 2RC7A 4AB6A 1FQBA 3VE1B 4X48A 2AIXA 3OSQA 1URGA 4H5GA 4BLAA 2P2AA 3UORA 3RPWA 3WAEA 3H6UA 3E13X 3TYHA 1A8FA 2OCUA 3IOTA 4QFNA 3MPKA 4N13A 1USYE 3UGWA 3V89B 3K6UA 3CSBA 3A3UA 1B46A 2Y84A 3E9XA 5I56B 2RC9A 2HCAA 1M5CA 2ONKE 3AXFA 4U1OA 2OBGA 3IB0A 1YAEA 3DM0A 3IO6A 3K01A 3MP1A 4I62A 4BDMA 3TQWA 4ZDMA 4PFTA 2XXVA 5DVIA 1MPCA 4G8MA 3JZJA 1Y20A 4IO7A 4NMYA 4YAHX 3FUZA 2CZLA 4NF5B 2Z23A 2ZNUA 3T9VA 1PB9A 4Q0CA 3N94A 4R9FA 3LSFB 4NEDA 2XX8A 2V93A 1URDA 3K0VA 1ZBMA 5I59B 1F9BA 3FJGA 3K1PA 4OFJA 2HEUA 3QYTA 2I58A 1MPBA 3O97A 3PV0E 4GF8A 1YCJA 3UK4A 1N3WA 3G3HA 1PB8A 4QFOA 5J1DA 1MQGA 3MW0A 2DXRA 5AA4A 3PUWE 3CFXA 2UVHA 2RINA 1QUJA 3MP8A 3RT6B 3PMXA 3MQ9A 3KSXA 3VFJA 1RYXA 2DQVA 1EH3A 1UTHA 4XKQA 5CRYA 3DELB 4OFLA 3K6VA 1MY3A 3U92A 1JW5A 2F7BA 5H8FA 4GRKA 5ELVA 4PETA 3TCGA 4P11A 4I9DA 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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