4THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus with covalently bound 4-amino-2,5-dimethylpyrimidine
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
total genus 115
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4thiA02
5EYFA 4PE5B 4RY1A 1QUIA 4M4GA 2F6PA 4XKPA 2E1SA 4JB7A 1MXUA 1SW5A 4HTGA 4GL8A 2ZYMA 2Q89A 3C9HA 2XD2A 4ELOA 3WAFA 2GHBA 5I59A 4BDOA 4R73A 1MQIA 2XXVA 1M5EA 3HN0A 1CB6A 4OFJA 4P0GA 2NOOA 4QHQA 3EHTA 5H8FB 1EZPA 1YCJA 3KSJA 3O9PA 2QS3A 3C31A 3RTWB 1ZKBA 2A5SA 4Q8RA 2ANJA 4UACA 1DPPA 5IAIA 1LB9A 4FATA 4NTLA 1QULA 3VVEA 3CRBA 1Z7ME 1B58A 4ZEBA 3A09A 4RK9A 4LUBA 5I2KB 4G8HA 1PBPA 3LR1A 4GFRA 4YU0A 4NWCA 3VV5A 2F7CA 1DPEA 2F7BA 1FTLA 1CE2A 3RTFB 3D4GA 4JSOA 1Y3QA 1B4HA 5CMMA 2UXAA 5L9OA 1B5IA 1FQCA 2ABHA 3H6WA 2Y7KA 4H65A 4GOTA 4POWA 4IY6A 4IGRA 2RCAA 3H4ZA 4PQJA 1B3HA 2PT2A 1MY1A 3GBBA 2XHDA 1MPDA 4RXLA 4YB7A 1DTZA 3CVGA 3HCQA 1IXGA 3T9UA 1QUJA 4XKNA 4IY5A 4E0XA 4IGTA 3KJ7A 3PU5A 2I4BA 1MQJA 1B6HA 3KN7A 5CBRA 3DP8A 3L6HA 2P2AA 2G93A 4G68A 4O3AA 4JBZA 3RLFE 4QSDA 3VXBA 2VOZA 4EUOA 5ITPA 4NF4B 4ZS9A 4P11A 4XKRA 1IEJA 3H03A 5FTHA 3T96B 4OZ9A 4G77A 3UIFA 1OLAA 3RN8A 4OESA 5H8FA 2Z23A 3PPQA 5ICTA 1B51A 3EF7A 3V89B 1AIVA 1N3XA 4ESWA 4F39A 2FYIA 4DLDA 1ATGA 4EXKA 3VLUA 5HBCA 4ZECA 5I2KA 1ZIUA 4R72A 2YPNA 4X48A 1B1HA 3K01A 5ITOA 1XC1A 1D9YA 2ZYOA 1OVTA 2H9BA 1EU8A 4KFQA 3M3KA 1B5JA 4G8MA 3OELA 3CSGA 5H8NB 1N3WA 2THIA 2ZNUA 3CFXA 1H3DA 5DEXB 2R71A 3EHUA 1I6QA 4FIMA 2DWJA 1XVXA 3M3FA 4EF2A 4ESXA 1NNTA 4ZEKA 2F97A 3GLBA 1TXFA 3PMVA 4EQ7A 3MP1A 2REJA 1QUKA 3KJTA 3TCGA 3V83A 1MG1A 3MC2A 1MQGA 2DE4A 3CSBA 3C35A 1NNKA 3TFLA 3MVXA 3O6HA 3FASA 4H5GA 3E9XA 1YTVA 4KPTA 2XXXA 4I8CA 1SW1A 1B9JA 1SW4A 3PGFA 2I3WA 4F1YA 1I6AA 3KOSA 3S9EA 3OMBA 2XXPA 4ZEIA 1Y1MA 1IXHA 3ZSFA 4NF4A 5BWJA 2O7UA 3OO9A 4DXCA 3MZBA 2Y84A 4C0RA 3GBAA 2YLNA 4GXAA 4IO2A 3T66A 1LBBA 4LONB 3K6UA 3HO7A 1QJMA 5A5XB 3PPPA 4H6DA 3FV2A 4U22A 4ELRA 3ILTB 5L9MA 1PEBA 2UVJA 4OTEA 1R9QA 4ELQA 1LAHE 5JK4A 3Q29A 4R9FA 1HSLA 5F1QA 4KR5A 4WKMA 1P1UA 5H8NA 1B0HA 4O3BA 3I3VA 1QKBA 4G4PA 3KGCA 3VE1B 3DP4A 2RINA 3PPOA 1A54A 1LLSA 4LQ5A 5DVJA 4R6YA 4LQ2A 4PP0A 3O2AA 3MP6A 2QJEA 1Y3NA 4PFWA 4LP2B 1B2HA 4O3CA 1JW1A 3OOAA 1QKAA 1B32A 2DQVA 1XS5A 4OETA 3BKIB 2XX7A 3MVZA 4AB6A 3MQ9A 1VFDA 3IOVA 3H6TA 2RKMA 3HHFA 2REGA 4OENA 1AMFA 2I6EA 4GRKA 1DTGA 2IEEA 3VFJA 2Q88A 3IB0A 3KG2A 3K1PA 5BUUA 4BDNA 4FEBA 4XKQA 4K3FA 4F3PA 1UIUA 3JV9A 4ECFA 2I48A 3OO6A 2R6GE 3ODBA 1VFEA 4RJZA 3SEWA 1IZ1A 2VP1A 4HW8A 4G68C 3VVFA 3WAEA 3TELA 2NUVA 1GR2A 5KCJB 2DSFA 2UVGA 4GLIA 3MW0A 5A5XA 4MLVA 3TTRA 4HCWA 3R26A 1Y3PA 3H3GA 1Y1ZA 1JEVA 3RGYA 2A5TB 3MVWA 4OMBA 2H99A 2DXRA 3ONMA 5HM4B 1XHYA 3K4UA 1NNFA 2QL3A 4U4SA 5I2NB 3FATA 4HCYA 3T9HB 3TQWA 4ZE9A 3SEVA 2ZNTA 3V8XB 5AA2B 3TCFA 3KZGA 2Q2CA 2VGQA 1USYE 3FD3A 4C1UA 2NVUB 2FNCA 1M5FA 3I6VA 3PD9A 4UA8A 3SERA 1NH7A 1ZLQA 4OEVA 1ZMGA 1BIYA 5B70A 3UK4A 1OQHA 4POXA 4Z0IA 2RCBA 1LCTA 1JQFA 1IIWA 1D4NA 1AH5A 4YKJA 2H4IA 4U21A 3MJNA 1O64A 2PX1A 1URDA 3CG3A 4C1TA 1FCKA 1P1OA 2V3QA 1DMBA 3CIJA 1FW0A 2O68A 1II5A 2ZXTA 3CG1A 1PDAA 3FJ7A 3A3UA 4IO7A 5AA4B 1QW0A 3SKPA 3BFUA 2IA4A 1US4A 1B7ZA 4JXIA 1MY4A 1SVXB 3K6WA 1MRPA 3HV1A 5I58B 3QXMA 3EN3A 4F1VA 4LZ7A 4QFNA 5KCJA 5TPAB 3B6WA 4DCYA 1JVYA 1YAEA 2DS9A 3KN8A 1TWYA 2M8CA 3K1MA 3IJOB 4RYAA 2A5TA 3MUQA 4KQPA 3LSFB 4DCXA 5I2NA 3LC8A 3H06B 1WDNA 5DYHA 1QVSA 1BP5A 3KFMA 4HS7A 1JNFA 3TEPA 2V3TA 2RF1A 3P7IA 4KI0E 3HHGA 1B3GA 4F18A 3RUMA 2F7AA 1LCFA 2QS1A 4PETA 1OQGA 1XOCA 3W15C 1M5CA 4FE8A 4F2OA 4FEDA 3LUYA 1SD3A 3MBPA 3IO4A 1EZ9A 4QFOA 2Z8DA 3QYTA 5HPQA 1HSEA 2OBGA 5AE4A 1JETA 3VLVA 3V5AA 1N76A 2D3IA 4ELPA 1TT1A 3TZAA 1FTOA 3FVOA 2XD3A 5EHSA 3THIA 1SYHA 1MXXA 2XXUA 5K2XA 3JZJA 3ILUB 4WEDA 2FA7A 3RY3A 1NH8A 3Q26A 3S2VA 3FXRA 1R9LA 4OWDA 3PMWA 1BLFA 1LGBC 4KD5A 4IO3A 5AA4A 1Y9UA 4DZ1A 5H8SA 3A3CA 1MQHA 2DVZA 5I57B 3DM0A 3U94A 1XT8A 1SI0A 2O1LA 4DIGA 3EHSA 4Q30B 5ISUA 4ZEDA 2QSXA 3FVNA 4BDLA 1NL5A 3FXUA 1B3LA 5I58A 1MY2A 2DE3A 5TPAA 4LZ8A 4EQ9A 1HSJA 2WKYA 1UTBB 4ISUA 4OFOA 3G3IA 4G2ZA 2XXQA 1USYH 3S9NC 1S7YA 3HPIA 5L8DA 4NWDA 4IB2A 3BBRA 4YICA 1FQFA 4H67A 4KYSA 2HZLA 3DELB 4DXBA 1IXCA 4U4XA 2O6AA 5I56B 1MXZA 2HCAA 1MPBA 2O84X 4FECA 3KN3A 1A8EA 3B6TA 3F11A 4R75A 3SEYA 4BDQA 5DTBA 1B1XA 3OENA 1WVJA 1RYOA 3OD7A 1ELJA 4X1BA 3T22A 2F36A 2Y7IA 3SEUA 4U1OA 1GV8A 2G29A 4IO6A 1FTKA 3C32A 3H7MA 2XXRA 1LFIA 3MZ1A 2UVIA 3IOWA 4EDPA 2ONKE 1SW2A 1ZJLA 4YMBA 1MH3A 4OYVA 3QK6A 4R2BA 2PBWA 2DYXA 1LSTA 2D21A 3MWBA 3C33A 3IB1A 1PBQA 4R9GA 4MLQA 3U1OA 3IOTA 2HXWA 1MY0A 4F3GA 4R2FA 2QPQA 5FHMA 5DT6A 2GFEA 4KCCA 4AQ4A 1PB7A 5I57A 4GF8A 2OK2A 2I0CA 2VD3A 1SQYA 1MM6A 4RPOA 2F5XA 4IO4A 2Y7WA 4FAJA 1FQAA 4ZEFA 2PYYA 4QFLA 3MAMA 4F31B 5IKBA 1MH4A 1ZTYA 3QSLA 2Y7RA 3OEKA 1VR5A 4BDRA 3QAXA 2Z22A 1EH3A 3RPWA 1UTBA 2X7PA 4F3SA 4NF8B 2F35A 3QIMA 3TCHA 5AA3A 4RK2A 3IL1B 3T9XB 2DWHA 2HEUA 1N7XA 2O1MA 5H8HB 4YB6A 3BFTA 3G3KA 3M8UA 5DEXA 4YB5A 1LAGE 4WXJA 5FHNA 3TUSA 1A55A 2X7QA 5I56A 1P1QA 2VHAA 2HQ0A 1MPCA 3LBSA 4NEDA 1SYIA 4F3BA 1BKAA 2O69A 2UYEA 5DVIA 1IXIA 2OLBA 3M3LA 3U92A 3VVDA 2QS2A 5TU0A 2XXWA 3S9LC 3U8QA 1WODA 3T9VA 1LBCA 1A8FA 2UVHA 3ZKLA 4X9TA 3OSRA 1FTJA 3K1NA 3OXNA 4QFPA 4H8JA 3IO6A 1VE4A 3FIRA 4R74A 1PC3A 4IO5A 2ONSA 3L6GA 4H1XA 3S4UA 1A99A 1FQDA 3ZKKA 4DDDA 3LSLA 4BLAA 4R6KA 3SEXA 1MY3A 3K02A 3SDFA 1LB8A 4NF5B 4QRZA 5ICQA 1LAXA 2ALUA 1SBPA 3CFLA 1PB9A 3UA8A 3TMGA 4P0IA 3LSXA 4KHZE 1JW4A 1NMUA 1FQEA 5JTYB 1EZOA 3FUZA 3TKDA 4N07A 2ZMBA 2ESNA 2P0SA 4YKIA 1FTMA 4NF8A 2GH9A 2F8DA 4OERA 3K6XA 5H8HA 2OCUA 2HFBA 3VLWA 1R1NA 2XXIA 5CMKA 3FJMA 3FGSA 1ZBMA 1SI1A 1OIBA 2DXYA 4KCDA 1A7LA 3RT8A 5I84A 3CI8A 1M5DA 2HAUA 1URGA 3MPKA 4MBPA 1OVBA 4TOZA 1S9TA 1UTHB 3W9VA 3E3KA 2H5YA 4JWOA 4QSEA 1ZU0A 3N94A 3TODA 4F1UA 2F6GA 1N7WA 2I4CA 4OXVA 1MM7A 3PPRA 3G3JA 4RPNA 1OMPA 4TLLB 4ONYA 4OEUA 1MS7A 5KDTB 4Q5TA 1US5A 3PMXA 4WEPA 3IORA 1OLCA 3CR9A 3DLNA 3K0VA 1ANFA 5AA1A 2I58A 3EPEA 1MXYA 4U1ZA 1R6ZA 3OO7A 4ZDMA 3TTLA 3TPAA 1LFHA 1GGGA 3KEIA 4LVQA 4NF5A 4FJPA 2ZYNA 3G3GA 4BDMA 1P1WA 3TYHA 4R6HA 1B0LA 3D4CA 4XXUA 5JTYA 2GHAA 1B3EA 2E0SA 2DWAA 4PFYA 4TQUQ 2RC8A 1XVYA 3KSXA 3IJXB 4MFIA 5AA2A 2PVUA 2NXOA 5F7VA 1POTA 1UIVA 5FTIA 2W7YA 4E0WA 1NKXA 2HAVA 1MDQA 4MH5A 2V3UA 1N0TA 3ECRA 3T93B 2DP8A 2QRYA 4JWXA 3U72A 2ONRA 1MDP1 2B65A 2OWTA 2OJTA 3K2DA 2AYSA 1UTHA 3O97A 3K00A 2XXYA 2DE2A 3PUWE 1B52A 1RYXA 2AL5A 4MF3A 5KDTA 5LOMA 1Y4CA 1AOVA 4Q0CA 4N13A 3R6UA 1SDXA 2OWSA 4JDFA 4U23A 3UN6A 3Q27A 1H45A 3IK6B 5H8QB 2Y7PA 2ZYKA 1D9VA 3RT6B 1JW5A 3Q25A 1IUDA 2QMXA 1B40A 4LA9A 4I62A 3GZGA 3G3FA 3DP6A 4F19A 3I5OA 2X26A 1M5BA 3H6UA 2H25A 4OVJA 5M2VA 2Z8FA 2XXTA 1FQBA 3RNNA 3FZVA 1Z7NE 4LZ5A 3MZ9A 1VSOA 1JEUA 2OZZA 2PT1A 1GTKA 3IAZA 4QFKA 2QS4A 3KOTA 3TTKA 2DOJA 3IB2A 4YKKA 1H43A 3FV1A 4PFUA 4EQBA 2GRVA 1O7TA 1BTJA 4NMYA 1Q35A 1B3FA 5ELVA 4OFLA 3AXFA 1I69A 4M1VA 2AL4A 4ND9A 1Y4TA 2NWJA 4Z7EA 5CM6A 4F29A 3B6QA 5K2YA 4QF9A 4H0WA 3PUZE 4NF6B 3C4MA 3U93A 2HZKA 2Q2AA 1POY1 1IQ7A 2H98A 2V93A 4GIZA 1MXVA 1F9BA 1P1NA 4ZZEA 2F78A 5TP9B 5CI5A 2XX9A 3IOUA 3O6IA 3OSQA 1Y20A 1B7HA 4JWYA 3PUXE 3IR1A 3QUFA 1TFDA 3MVYA 4TLMB 3TTNA 1T0KA 1O63A 4RA1A 5CBSA 1IITA 5CRYA 1MXWA 4EF1A 2BJJX 4OQOA 3HSTA 1NNPA 4GWOA 1I6BA 3PV0E 4KYDA 4F22A 5CC2A 5H8QA 3ZS6A 4DXUA 3K6VA 4NE4A 3VXCA 4G8NA 3O29A 5FHOA 3N6UA 3SETA 4GL0A 5J1DA 2DWIA 4YZZA 4GD5A 1TFAA 1D3KA 2D5WA 3E13X 2V84A 1Q1KA 2DVCA 3PUYE 3C36A 1DOTA 3N6TA 2XXHA 5KZTA 5L9SA 3PPNA 4YMAA 3QUJA 4YAHX 1N04A 3UP9A 2I3VA 1YPNA 4N6PA 1DSNA 4GVOA 3GXAA 3SESA 3PD8A 5EHMA 3USDA 3H6VA 4ZE8A 1B5HA 1N84A 3OEMA 2I49A 3MPLA 4H8IA 2Q8JA 3FJGA 4L17A 2YJPA 4PFTA 2O7IA 3N26A 4LATA 3TQLA 4NF6A 3LSWA 1B7UA 3RQTA 4XTCQ 3PUVE 1J1NA 3FVGA 4I9DA 2UYFA 1S50A 4F2QA 5AA2D 5TP9A 3FVKA 3UORA 3FXQA 1AL3A 1KWHA 1B4ZA 2VD2A 2B3FA 4OHNA 2RC9A 4THIA 2V25A 4YKPA 5I59B 1NFTA 2QMWA 4FORA 1B46A 2Q9TA 2KLFA 3TAJA 1LFGA 1PB8A 4AB5A 4EXLA 4KYEA 4RNSA 3O28A 2Z8EA 4XIGQ 1A40A 3B7DA 3E4RA 2I0BA 3R7XA 5DVFA 3O6GA 2RC7A 3C34A 3G3HA 3KBRA 1P99A 1JVXA 1URSA 4JSDA 3UGWA 5CMBA 4X1DA 3IX1A 4U2RA 2ZNSA 3O66A 4I1DA 3TTMA 3G7WA 3Q28A 3TDJA 2O51A 2PMSA 1B05A 2P1SA 1LAFE 4DE8A 2AIXA 1H44A 1MQDA 4QSCA 3JYRA 2LAOA 3CFZA 2R9JA 5JEIA 3OO8A 1L5TA 4GXSB 2B3BA 3S9MC 3N5LA 5B7DA 2XX8A 2F34A 3MP8A 5CMCA 1UQWA 3EQ1A 4GQOA 3VDFA 4H5FA 2CMOA 1RKMA 1H76A 3W9WA 1GVCA 4G68B 4ZZAA 2CZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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