4U21A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form e
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A02
1S9TA 3A09A 4ND9A 1JETA 3OELA 3RTWB 1ZKBA 3Q25A 5ELVA 2QSXA 4G68B 4IB2A 2I0BA 3THIA 3L6HA 4YMBA 4YKPA 3MP6A 2O7IA 4BDRA 5TP9B 4R2FA 1B7HA 4JXIA 1MY1A 2QS2A 1P1UA 3FATA 4F3BA 3SERA 1PDAA 2D5WA 3LR1A 3IOUA 4MLQA 5ICTA 1B3FA 2GRVA 4Q0CA 4ZZEA 5ISUA 1URDA 4DIGA 4FE8A 4YMAA 3K6UA 2O6AA 4G8MA 4G2ZA 1B7ZA 4R9GA 4EQBA 2UVJA 5FTIA 1R6ZA 5AA3A 2REJA 2AYSA 1B1HA 1B32A 1JVXA 3MWBA 4OMBA 1WDNA 4NF4A 1PBQA 4OESA 4LATA 3MAMA 5TPAB 1LCFA 1MH4A 2B3BA 1Y9UA 3OD7A 4HTGA 1JEVA 3PMVA 5B7DA 4EXKA 1MXZA 4DCYA 2VGQA 5JEIA 5LOMA 1QUIA 4ZEIA 2OZZA 2QMXA 2DVCA 3TFLA 4RK2A 3G3GA 3RPWA 3FVNA 1PC3A 1F9BA 4IGTA 3TTRA 1MXWA 4KYDA 3N26A 1LSTA 1MQGA 2F8DA 3DP6A 3HSTA 3PPPA 1ZJLA 2CMOA 4U1ZA 4L17A 1M5BA 4R75A 5DEXA 1JW1A 1PB9A 5CBSA 4X9TA 2GH9A 4TOZA 3TUSA 1O7TA 1NH8A 4C1TA 4BDNA 3ECRA 2VD3A 1B0LA 3MVYA 3MP1A 4C1UA 2HEUA 4QRZA 5A5XA 2R9JA 4ESXA 5IAIA 1LAGE 5CMBA 4KR5A 3VVEA 2FYIA 3O6IA 4F3GA 2THIA 3QXMA 1QVSA 4NF4B 2H99A 3O6GA 4I9DA 3MUQA 2V3UA 4O3CA 1B5JA 2O84X 2B3FA 1O64A 3IOTA 5FHMA 2HZKA 4OENA 2O69A 2XD3A 4TLLB 5J1DA 1DPPA 2O51A 3KSXA 4LA9A 1Y3NA 2HQ0A 4HW8A 4LZ7A 4F1UA 3JZJA 1B5HA 1USYH 1TXFA 2DOJA 4ISUA 1Y4CA 3K2DA 1XVXA 5H8HA 1N76A 3T22A 3VDFA 3MVWA 2QL3A 1MM7A 4OEVA 3E3KA 5DEXB 1P1WA 5I58A 1MS7A 1B05A 1B0HA 1EZPA 1FW0A 3R26A 4BDQA 1IIWA 1N04A 2ZYOA 4MFIA 4DXBA 1J1NA 1FQDA 1OVBA 2PVUA 4YB7A 4U4XA 4RJZA 2ONKE 5A5XB 3HHGA 1KWHA 3OENA 4OYVA 3VVDA 1ZLQA 2I49A 5CM6A 5HBCA 2OWSA 4DLDA 3D4GA 4BDMA 4KQPA 1AIVA 4DCXA 4KYSA 4RNSA 1CE2A 1I6BA 3TTLA 2ONSA 1A99A 3UORA 3B6TA 2Y7KA 1ZU0A 4JSDA 3QIMA 4GLIA 3B7DA 5L9MA 2ESNA 3MZ9A 3S9LC 3KSJA 4RXLA 1MPBA 3AXFA 1SYIA 1GV8A 4OFOA 4M1VA 2BJJX 5DT6A 3RNNA 3OO9A 4I1DA 3FXQA 3PD9A 4LQ5A 2DE2A 4R73A 2P2AA 4EF2A 1WODA 2XXWA 5DYHA 4OERA 4Q5TA 3LSFB 4RPNA 3CG3A 3OO7A 3MW0A 4LP2B 1JVYA 4PP0A 5I58B 3IORA 2UYEA 3ZKLA 4DDDA 3LBSA 1QKBA 3CFLA 4NEDA 1O63A 5CMKA 1SW5A 4KD5A 2M8CA 3MZ1A 1SQYA 5H8FA 3EQ1A 2FNCA 1XC1A 4EUOA 1D4NA 3D4CA 4H6DA 1MM6A 1MPCA 1P99A 4XKNA 1QUJA 3CI8A 3OO6A 4IY5A 1EU8A 5I59A 2DQVA 3VFJA 3MJNA 3FD3A 1BIYA 1RYOA 2A5TA 2RC8A 1LB9A 1FTKA 5AA4A 3IB2A 3QUJA 1VE4A 2I3WA 3QYTA 3USDA 2NVUB 4JSOA 1N0TA 5FHOA 4UACA 4P0GA 3KFMA 4ZEKA 1AMFA 2VP1A 1Y3PA 3O97A 1JW5A 4H67A 3ILUB 5I2NA 3CR9A 1IUDA 3FJMA 2PT1A 3VXBA 4WKMA 3FXUA 4R6YA 2XX7A 1YPNA 2DWAA 3H6UA 3F11A 3C35A 3KN3A 1AH5A 2PX1A 5AA2B 3PPQA 2P0SA 3GLBA 4F31B 3K1PA 4H0WA 3PMXA 2Q2AA 3BBRA 2XXYA 2XXXA 5DVIA 5H8FB 1DPEA 3IO4A 3C31A 3MPKA 3UP9A 4OVJA 3IX1A 1MQHA 2Z8EA 3FJGA 5L9OA 5I59B 4YICA 3G3IA 2QRYA 3N94A 2A5TB 2QJEA 5AA4B 3W9WA 4G77A 1FQCA 4M4GA 2G93A 2D21A 1VFEA 3TODA 3IB1A 2QPQA 4RY1A 5DTBA 1QULA 4G8HA 1YTVA 2UVGA 5K2XA 1AL3A 1B3EA 2YLNA 1UQWA 3SEYA 3FZVA 1XVYA 1N7XA 1OMPA 2ANJA 5I2NB 3BFUA 4QSEA 4ELRA 1BLFA 3TAJA 1SW2A 1BP5A 3DP4A 2ZYKA 3VVFA 1MPDA 4PE5B 4WEPA 2O7UA 4GQOA 3H03A 2DE4A 4IO2A 3TQLA 3KOTA 3C34A 4OTEA 1YAEA 3PV0E 2XHDA 1B3LA 2XX8A 4GF8A 4HCYA 5KDTA 1H3DA 3KZGA 5CMMA 3Q28A 2F35A 3DLNA 3EHSA 1TT1A 3KN8A 4QFLA 3OO8A 1A55A 2RC9A 3KBRA 4MLVA 4FEDA 4OFLA 2Z8DA 2AL4A 3RT6B 2I48A 3VE1B 4F1VA 4F3SA 1FQFA 1MDP1 2RC7A 3ILTB 4ZZAA 2ZNSA 4QHQA 3O66A 3LSXA 5HM4B 4RYAA 3K6WA 4OWDA 4FORA 1LBCA 3CSBA 3OSQA 1N84A 5I84A 1FQBA 3SEWA 1M5FA 1M5DA 4I62A 3A3UA 5H8QA 2F36A 4WXJA 4QF9A 3TTNA 1ZTYA 2XX9A 1YCJA 1II5A 1OLCA 2DSFA 3PU5A 1FTJA 1Y1MA 3MZBA 1LAXA 1PEBA 2XXUA 3G3HA 3QSLA 4IO5A 4G68C 1A8EA 3IR1A 2XXPA 3MPLA 2Y7WA 3Q26A 1NNPA 2F7BA 2UYFA 2O68A 4ZDMA 5CC2A 2I6EA 3QK6A 4R2BA 4FEBA 3U93A 3R7XA 2ABHA 5KDTB 3K01A 1DTGA 3GBBA 2XXRA 4GOTA 4IO3A 1EZOA 4QFPA 1QUKA 2KLFA 3H6TA 4Q30B 1B1XA 3G3FA 4U4SA 3UGWA 2V3TA 3OXNA 1UIVA 4OXVA 4RK9A 1FTMA 2DS9A 1US5A 2E0SA 3HPIA 2Q2CA 3HHFA 4DXCA 1VSOA 1B6HA 4R9FA 4WEDA 1FTLA 2I3VA 4JB7A 1ATGA 3K02A 4FJPA 3RQTA 1TFDA 1MY0A 4H5GA 1B46A 1A7LA 4NF6A 1US4A 2RCAA 1N3XA 1S7YA 5DVJA 4GD5A 2XXIA 2ZNTA 3PGFA 3JV9A 2RCBA 4AQ4A 3C4MA 3S2VA 4F19A 2DWJA 3DM0A 5JTYA 1A8FA 4HCWA 1SD3A 4GFRA 1MY4A 2H4IA 2HAVA 4XXUA 2X7PA 3BFTA 4OQOA 4FATA 2H5YA 1HSLA 3ZKKA 2OLBA 2XD2A 1BKAA 3GZGA 3IOWA 4ELPA 1H76A 2HAUA 1FQEA 4PFUA 4BLAA 3K1MA 3PUYE 4YKKA 3FVKA 2PYYA 3E9XA 4YKJA 2H98A 4C0RA 3U8QA 4RPOA 1SDXA 3H3GA 1P1QA 3I6VA 3K00A 3CSGA 3EN3A 1NMUA 4OZ9A 2OWTA 2X7QA 1LAFE 4F22A 1SI0A 2ZYNA 3I3VA 1P1NA 4PFWA 1XHYA 4Z0IA 5ITPA 1NNTA 1XT8A 3T93B 3Q29A 5DVFA 2NXOA 4F2QA 5KZTA 4NF6B 1R9QA 4LONB 3BKIB 1MXXA 2DE3A 4X1BA 1Y20A 3FGSA 5H8HB 1LGBC 2IEEA 3SEUA 4E0XA 5JTYB 1ZIUA 2O1LA 3DELB 3QUFA 3FUZA 4GL0A 3H06B 1SI1A 1OVTA 1JQFA 4U23A 4LUBA 4IO4A 2AIXA 3C33A 3O29A 1L5TA 3PUZE 3IJXB 1USYE 4ZEFA 3V89B 5ICQA 3RLFE 4GIZA 3K6VA 3EF7A 1UIUA 3TTMA 4AB5A 2ONRA 3FJ7A 4NWDA 3UN6A 3ZSFA 2QS3A 1JW4A 4QSCA 2OBGA 5L8DA 1IXGA 4YKIA 2F7AA 5BWJA 5KCJA 3EHTA 2XXTA 3FXRA 3PUXE 4GXSB 3C32A 2OK2A 3I5OA 1ELJA 2F7CA 4F3PA 3W9VA 3TCFA 3CG1A 4KI0E 1M5CA 4GVOA 2HZLA 4TLMB 2NOOA 3O28A 1LCTA 4PETA 2FA7A 2F5XA 1MDQA 3FASA 2G29A 3PUWE 4MF3A 5TU0A 5I57A 5F7VA 4X1DA 1QJMA 4P11A 4EXLA 3B6WA 3SDFA 1DMBA 3PMWA 4LQ2A 4NMYA 1SBPA 1POY1 2DXYA 3DP8A 3VXCA 1IXIA 1HSJA 3ZS6A 5HPQA 3OEKA 1Y1ZA 2Q9TA 2ZNUA 1B4ZA 1LFIA 1MH3A 2Z22A 1VR5A 1IZ1A 1OQHA 4KCCA 2RKMA 4OETA 3V83A 4P0IA 1QW0A 2OCUA 1SW1A 2X26A 3HO7A 3T96B 1UTHA 3TCGA 3MQ9A 3Q27A 4JBZA 3TMGA 1MY2A 2IA4A 1MY3A 2P1SA 2DWHA 1GVCA 1UTBA 4ZEBA 5CRYA 4DE8A 1B40A 1NNFA 3FVGA 3H6WA 3KGCA 3WAEA 1I6AA 3V5AA 3OSRA 2QS4A 5H8NA 4U22A 3H6VA 1NNKA 4EF1A 1JEUA 4IGRA 4X48A 3HCQA 4YB6A 4ZE9A 2NUVA 2R71A 4ONYA 4Q8RA 1IEJA 1LFGA 5I57B 3LSLA 1WVJA 4NF5A 1N3WA 3SEXA 1Y4TA 2Q8JA 2E1SA 1Q35A 4XKPA 5CI5A 2DYXA 5CBRA 3M3LA 4Z7EA 5AE4A 5FTHA 1LB8A 1H45A 4UA8A 5I56A 2REGA 3KEIA 3T9XB 1DOTA 1DTZA 3IK6B 1MXYA 2YPNA 1H44A 1R1NA 3IL1B 2RF1A 1URGA 2Z8FA 4U2RA 3HV1A 5EHSA 3B6QA 4F18A 2H9BA 1UTHB 3TTKA 2F6PA 3VV5A 3VLUA 2ZMBA 2Y84A 4EQ9A 1B3GA 4ELOA 3EPEA 3G3KA 1UTBB 4ZECA 4XIGQ 3RN8A 4N13A 4AB6A 3IB0A 3MP8A 1Z7ME 5AA1A 3PPOA 2Q89A 4MBPA 3GXAA 1IXCA 3MBPA 3ONMA 5ITOA 5H8NB 3A3CA 3W15C 2D3IA 1B3HA 4FIMA 2I4CA 4R6HA 1MRPA 1MQDA 3R6UA 1MXUA 2ZYMA 2HFBA 5L9SA 5EHMA 1A54A 2VD2A 4JWXA 4NF5B 1I6QA 2DXRA 3K0VA 3LC8A 1SW4A 2RINA 4G8NA 1OLAA 4G4PA 3K6XA 3RUMA 1AOVA 4N07A 5I2KA 1B52A 1SYHA 1GTKA 4GRKA 4OHNA 3N6UA 3S4UA 5I56B 2R6GE 1GGGA 3TPAA 4F2OA 4H1XA 2V93A 4IO6A 4R74A 3WAFA 3K1NA 1IQ7A 2PT2A 1B51A 1LLSA 3L6GA 2V84A 4N6PA 4POXA 4NTLA 2Y7PA 3M3FA 4R72A 3LSWA 3PPNA 2Y7IA 1XOCA 3VLVA 3IJOB 1M5EA 3U92A 3P7IA 1S50A 4IO7A 1P1OA 2DP8A 1A40A 4RA1A 4BDLA 4U1OA 2I4BA 4GL8A 1MXVA 3QAXA 2DWIA 4PFTA 2ZXTA 4QFNA 3TCHA 4TQUQ 4U21A 4F1YA 2VOZA 3EHUA 3TELA 2GHBA 2YJPA 4DZ1A 2B65A 5H8QB 4O3BA 1IITA 3KOSA 1H43A 4KPTA 3TKDA 1NKXA 4BDOA 4ELQA 1MQIA 4H8JA 3N5LA 1RYXA 1NFTA 1OQGA 2A5SA 5I2KB 3RTFB 1LBBA 4K3FA 4F39A 2VHAA 3VLWA 4ZS9A 4YAHX 3M8UA 2V25A 1D9VA 4QSDA 4PFYA 5B70A 1NH7A 2OJTA 1B7UA 4XKRA 3SKPA 4YB5A 1EH3A 3SETA 4KCDA 1QKAA 1ZMGA 2QS1A 2PMSA 3S9EA 2Q88A 4QFKA 1ANFA 3IOVA 1URSA 4LVQA 2UVIA 2XXQA 3IO6A 4POWA 3CVGA 1FCKA 3FV1A 3V8XB 4I8CA 1R9LA 2HCAA 1I69A 2XXHA 3E13X 4JWOA 4YZZA 2V3QA 4O3AA 1DSNA 5M2VA 3K4UA 4F29A 3OMBA 3U1OA 3RT8A 3G3JA 4MH5A 3O2AA 5AA2D 3RGYA 1LAHE 2F34A 4FECA 2I58A 4QFOA 4XKQA 3SESA 2DVZA 1LFHA 1B9JA 3H4ZA 1NL5A 3TZAA 3KN7A 3O9PA 5JK4A 1Q1KA 4KHZE 4LZ5A 3FIRA 1XS5A 3ODBA 3T9HB 4JWYA 3HN0A 1D3KA 2F78A 1FQAA 2UVHA 4NF8A 5K2YA 2I0CA 1POTA 3TEPA 2WKYA 5IKBA 2F97A 3FVOA 1D9YA 4LZ8A 3UIFA 4IY6A 4ECFA 2CZLA 2Z23A 1OIBA 3S9NC 1B5IA 3TDJA 2GFEA 5AA2A 5EYFA 2QMWA 3S9MC 3G7WA 4FAJA 4EDPA 2GHAA 1B58A 3CIJA 4H65A 5H8SA 3PD8A 3FV2A 3MVXA 4ZE8A 3TYHA 1BTJA 4ZEDA 3IAZA 1CB6A 4R6KA 4PQJA 3KG2A 4GXAA 1ZBMA 4GWOA 3UK4A 3KJ7A 3KJTA 3T66A 4H8IA 5F1QA 3SEVA 1MQJA 1HSEA 2LAOA 1N7WA 1PB7A 4KYEA 1JNFA 1T0KA 1FTOA 1PBPA 1MG1A 4OFJA 4YU0A 1B4HA 2NWJA 2F6GA 1SVXB 3M3KA 4EQ7A 3UA8A 2ALUA 3C9HA 3T9UA 4NF8B 4THIA 3E4RA 1B2HA 4G68A 1PB8A 2H25A 1TFAA 3JYRA 3MVZA 2W7YA 2HXWA 3U72A 4HS7A 3N6TA 5CMCA 5TP9A 5FHNA 3OEMA 3PPRA 4NE4A 2AL5A 2PBWA 4OEUA 1GR2A 2XXVA 4DXUA 3GBAA 1EZ9A 3OOAA 4NWCA 3CFXA 4KFQA 3T9VA 4H5FA 3CFZA 5KCJB 1TWYA 3RY3A 3H7MA 2O1MA 3PUVE 1RKMA 4XTCQ 3TQWA 4ESWA 3U94A 3MC2A 1IXHA 3LUYA 2UXAA 2Y7RA 5TPAA 3O6HA 4JDFA 1VFDA 3C36A 3CRBA 1Z7NE 4E0WA 1Y3QA 5BUUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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