5AA2A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
KEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 143
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A02
3N5LA 1MH3A 1OVTA 1MM7A 1F9BA 2DOJA 1BP5A 1XS5A 2D5WA 1IZ1A 3C4MA 3QUJA 3TCGA 2DWAA 1RKMA 3TODA 2ALUA 3JYRA 4ELPA 1RYOA 2P2AA 4ELRA 3MQ9A 1KWHA 3PPOA 1MM6A 4XKNA 4IB2A 2F7BA 1BKAA 1D9VA 4U2RA 3OO7A 1BIYA 2Z23A 3O9PA 1M5DA 3RLFE 1N0TA 3CSGA 1NNKA 3IB2A 3G3IA 2ZYKA 3FVKA 3QSLA 2F34A 1MPBA 4FATA 4G68C 3PPRA 1OIBA 2R9JA 3H3GA 2DYXA 1SYHA 1QVSA 4BDQA 4IY5A 5ITPA 2F5XA 3HPIA 2DVCA 1CB6A 3UN6A 4PE5B 4ESWA 1I69A 1MQJA 4YMAA 2P0SA 4XTCQ 2Z8DA 1B2HA 1MDQA 4YKPA 2BJJX 1B3EA 4AB6A 4G4PA 1JEVA 4GOTA 2DWJA 3PV0E 1P1OA 3S4UA 3V83A 4G68B 5KDTA 4R9GA 1A55A 3G3JA 4H5GA 3SKPA 4H6DA 3ECRA 3RQTA 5FHNA 3K6XA 3TQWA 3GLBA 5DEXB 3W15C 2ONRA 2XX8A 3H6TA 3MZ1A 3QUFA 2VD2A 2RC8A 3VV5A 3T93B 4R6YA 3K0VA 4OXVA 4GQOA 4QFPA 2O69A 5KCJA 3OELA 4GRKA 3PD8A 3O6IA 4OQOA 2Z22A 4YB7A 5IAIA 1JEUA 4YKIA 3VLVA 2O6AA 3O2AA 2B3FA 2H98A 5JK4A 2DP8A 5CMKA 4NMYA 4XXUA 4P11A 1EZ9A 3BKIB 4F2QA 4H8IA 3TKDA 5H8QA 2PBWA 2OZZA 4ISUA 1Z7NE 1LBBA 1TWYA 1S7YA 1ZLQA 4QSDA 5H8SA 5L9SA 4HCWA 5I58A 4IO7A 1B3FA 2XXXA 4GIZA 3SEYA 3S9NC 3HHFA 1B6HA 4I8CA 2M8CA 5KDTB 2THIA 5TP9A 1JQFA 2HZLA 2XXYA 1LAFE 4OFOA 3EPEA 3ZKLA 1MH4A 3N26A 3EHTA 2PMSA 4QHQA 1O63A 1AH5A 4F2OA 3CFLA 3HSTA 1A7LA 4HW8A 4OVJA 1AMFA 5K2XA 4YMBA 2Q2AA 2PYYA 3FATA 1LAGE 1PDAA 2OBGA 2QRYA 4DIGA 4OFLA 4MLQA 1B05A 1MXYA 3KFMA 4ZE8A 5KCJB 2NWJA 1TFDA 1R1NA 4LA9A 3OOAA 5AE4A 3ZSFA 1EU8A 4ND9A 3CG1A 1XOCA 5H8HB 3O6HA 4DE8A 3TTMA 3FJGA 4WEDA 3OO6A 2ZNSA 3KOSA 2F78A 3OD7A 3FASA 3FIRA 3TELA 1LSTA 2V25A 3SEWA 2Y7WA 2O1LA 5L9MA 3LUYA 1URGA 3VLUA 1Y4CA 3PD9A 1B1HA 3HHGA 2Q88A 2F6GA 5FTIA 5TP9B 5H8FA 1WVJA 4LVQA 4ESXA 4R6HA 3P7IA 3C34A 3C9HA 1FQFA 4OERA 4N07A 1CE2A 2I4BA 2UXAA 2DE4A 3K1PA 1I6QA 3N6UA 4NF6B 3D4GA 4PFTA 1MXWA 5I59B 1SW4A 3LSLA 2W7YA 4NE4A 2CZLA 1IUDA 5TU0A 3SESA 1DSNA 4I1DA 2I48A 3K6VA 4R74A 3O66A 2HAUA 1MXVA 1N3XA 5ELVA 3OENA 1YPNA 1NKXA 3FVNA 3USDA 4WXJA 4GL0A 3SERA 4KI0E 4LATA 4KPTA 4N13A 5I57B 3RUMA 3E13X 3TQLA 1A8FA 1Y1MA 2I0BA 4X1DA 3R26A 2ZMBA 3TFLA 1Y1ZA 3I6VA 1XVXA 2V3QA 5JEIA 3E9XA 4RNSA 3A3UA 4YAHX 4F29A 4EXLA 3EQ1A 1A40A 1M5CA 1IXHA 4X1BA 1AIVA 4GFRA 1QUJA 4G2ZA 4LQ2A 2OCUA 2G93A 1UTHB 1GTKA 1Y9UA 3KSJA 3L6HA 1D3KA 2IA4A 5DTBA 4BDMA 5FTHA 4TLMB 3VE1B 1B7HA 4QSCA 3H6UA 3K2DA 3HN0A 3CG3A 4R2BA 3I3VA 1O7TA 2F97A 1HSJA 2OWTA 5AA1A 1B3HA 2ABHA 2PT2A 4XKQA 4YKJA 2DE3A 3CIJA 4Q30B 4XKRA 4OESA 3FZVA 2HEUA 3CFZA 3FVOA 1P1QA 3FJMA 1EZOA 4PFUA 4ONYA 3IORA 3DELB 1EH3A 2QS3A 4F18A 5I84A 4F31B 3H06B 2OK2A 2Q9TA 2VOZA 2F35A 1FW0A 1B9JA 3O29A 2HFBA 4U1OA 3C35A 1P1NA 1XC1A 1N04A 1PEBA 4O3BA 1B0LA 3UORA 2AL5A 1VFDA 3GZGA 4OENA 3PUYE 2Y7KA 1PC3A 4G68A 3DP4A 3FGSA 3K01A 1MRPA 1MS7A 1B46A 1H45A 1ZBMA 2XXRA 2UYEA 1P1WA 1B51A 4LONB 4IO6A 2E0SA 3T9VA 3FJ7A 5DEXA 3VXCA 3TTNA 3R7XA 2UVHA 2O1MA 1NMUA 1ANFA 1FQBA 2I3VA 3T9XB 2XX9A 4EUOA 2XHDA 1B5IA 2B65A 4OWDA 4YKKA 2REGA 3E4RA 5JTYB 1HSEA 1MQHA 2YLNA 3FXQA 3DM0A 1B5HA 4TQUQ 4LQ5A 4FJPA 2DS9A 1URSA 4PFWA 3FD3A 3KSXA 1SW1A 1B32A 1FQEA 4E0WA 1JVXA 4WEPA 1B52A 3GBBA 4DZ1A 5BUUA 3D4CA 5F7VA 3SEVA 5AA2B 3C36A 1DTGA 3LR1A 4R75A 3HO7A 1N7XA 1R9LA 1POTA 3IOTA 1Y3PA 3MJNA 4KYEA 2RC9A 3KZGA 1FCKA 3RT6B 3K00A 1L5TA 4KCDA 1JETA 4AQ4A 3MP8A 1Y4TA 2PVUA 2X7QA 4EQ9A 2XXTA 1Z7ME 5I2KB 1VFEA 4XKPA 3FV2A 2F36A 3SEUA 2GFEA 2NVUB 2QJEA 3SDFA 4DDDA 1ZKBA 4GD5A 3G3HA 5K2YA 2UVGA 1Y3QA 4THIA 3BFTA 1NH7A 3IOWA 2XXQA 4UACA 4G8NA 3LSXA 1ELJA 5DVFA 5ITOA 5H8HA 3MAMA 3Q27A 1FTKA 3PMXA 2XD2A 1NFTA 3IAZA 3IB1A 2QMXA 2DE2A 4FEDA 2REJA 3PUVE 1GR2A 3DP6A 1A54A 4OZ9A 2ANJA 5CM6A 2F8DA 3MVWA 4DXUA 2DXRA 4O3CA 3V5AA 2QL3A 4YICA 4LUBA 2GRVA 5H8NB 3MC2A 3O28A 4HTGA 4ECFA 1ZJLA 3U92A 4G8MA 3G7WA 4EXKA 4F19A 2VP1A 1B0HA 1QULA 4R6KA 2LAOA 4JBZA 2O68A 4LZ5A 4Q5TA 3TYHA 4RXLA 5AA4B 2V3UA 4OMBA 5B70A 1IXGA 3SETA 2I3WA 3RY3A 2IEEA 3S9LC 4NF6A 3MZ9A 2ONSA 4LZ7A 2XXWA 3CSBA 1N7WA 5I59A 3GXAA 5EHMA 3MP1A 1DPPA 1URDA 3S2VA 4GWOA 4AB5A 1JNFA 1PB7A 1MQDA 5ICQA 1RYXA 1YTVA 2X7PA 5F1QA 1FTLA 5EYFA 1UQWA 4P0GA 4RPOA 4C1TA 2FYIA 2AL4A 5CMCA 3DP8A 1UIUA 4NWCA 2DWIA 5I57A 2RKMA 4ZEDA 4PQJA 4Z7EA 4OETA 3B6TA 4F3GA 1SI0A 1QUIA 1SW5A 4NF5A 4RYAA 1JW5A 4NF4B 1MY1A 3FVGA 2NOOA 3FXRA 4H67A 1IEJA 3G3FA 5EHSA 2H4IA 2I49A 5L8DA 3IX1A 2H5YA 2UYFA 1UTHA 3IB0A 2OLBA 1M5EA 3PUWE 3EN3A 1I6AA 1S50A 3OMBA 1O64A 1FTJA 3CR9A 2O84X 1Y20A 1MY0A 4YZZA 3ZKKA 3U8QA 3H6VA 1A99A 4QFLA 2QMWA 2RF1A 4PFYA 2X26A 2HCAA 2ZYOA 3RGYA 3A09A 3CFXA 4GL8A 3OSRA 1ATGA 2RCAA 3O97A 1SBPA 4F1VA 1QKBA 2YPNA 2R71A 3FV1A 3LC8A 3C32A 3KN8A 1QUKA 4F3PA 3T96B 3H6WA 3R6UA 4NF5B 1UIVA 3K4UA 3CVGA 4JSDA 4F3BA 1US5A 4FECA 1S9TA 1Y3NA 5HBCA 3VXBA 3BBRA 1D9YA 3RT8A 3U72A 4FAJA 2RINA 5DYHA 1FTMA 3K1MA 1SQYA 1QJMA 2WKYA 3OEKA 1ZMGA 4QFKA 3L6GA 4OEUA 3EHUA 1MQIA 3VVDA 3UGWA 3IOVA 5B7DA 2I0CA 1LBCA 1LCTA 1N84A 3PGFA 4MF3A 4P0IA 5L9OA 1II5A 1M5BA 3MZBA 2AYSA 1SYIA 2PT1A 4IGRA 4RK2A 5JTYA 1B1XA 1P1UA 4MH5A 4R2FA 3KN7A 4LP2B 3IJXB 2XXUA 2XX7A 3UIFA 1NNPA 1EZPA 2VHAA 1PB9A 3TZAA 1DMBA 3VVFA 4GLIA 5ISUA 4X48A 4NF8B 3TMGA 1MG1A 1JVYA 5AA2A 4DLDA 4FEBA 5M2VA 3W9WA 2P1SA 1PB8A 3TPAA 5CBSA 1OMPA 4C1UA 2H99A 4MFIA 5AA3A 3TAJA 4RA1A 2GHBA 4OHNA 1UTBA 1US4A 2ZYNA 4MLVA 2D21A 1B40A 3K1NA 5I2KA 4IO3A 3HV1A 2Q2CA 2DQVA 2E1SA 3KBRA 5CC2A 3SEXA 4F3SA 3GBAA 4BDNA 4WKMA 3MPLA 5CMBA 5I2NB 3E3KA 2DXYA 5ICTA 1AOVA 3IK6B 3KJTA 1MXUA 1H44A 3EHSA 4KD5A 4JWOA 2A5SA 3U93A 3KOTA 1B58A 2D3IA 3ILTB 3G3KA 4U22A 4KYSA 1IITA 1WDNA 4TLLB 1Q1KA 4JSOA 3PU5A 4K3FA 2UVIA 2V93A 4QFOA 3MVZA 4U21A 5TPAB 2HAVA 1MDP1 3Q26A 3U1OA 3Q25A 4QSEA 4R73A 4POXA 1DOTA 5AA2D 1GV8A 3THIA 3UK4A 3B7DA 4F1YA 4BDRA 1NL5A 5BWJA 1FTOA 2ZYMA 3IJOB 2XXPA 3RN8A 3H7MA 4FE8A 3MPKA 1IIWA 4IGTA 5H8NA 4IO4A 4X9TA 1UTBB 1TT1A 4IY6A 4KHZE 1JW4A 2RC7A 5I56A 3LSWA 3LBSA 1LAHE 1B4HA 1B3GA 4PETA 1FQAA 4GF8A 1IXIA 4KFQA 5AA4A 5FHMA 1NNTA 4QRZA 1LFGA 4BDLA 2V84A 1MY2A 2Y7PA 5CMMA 1PBPA 3T22A 2XD3A 1USYE 4ELQA 5CRYA 3KGCA 3QK6A 2Y7IA 4R9FA 3V89B 4ZEBA 4JDFA 3PPQA 1VSOA 1QW0A 4ZDMA 5CI5A 1IQ7A 1SDXA 2F7CA 1MY4A 2Z8FA 3QYTA 3VLWA 1BTJA 4BLAA 4Q0CA 4QF9A 4IO2A 4YB6A 3N94A 1B7UA 2I6EA 3I5OA 2HXWA 1M5FA 4POWA 1USYH 1LB8A 2I4CA 3Q28A 3B6WA 4ZEKA 3MW0A 4NF4A 1R9QA 4F39A 3WAFA 1LB9A 3VDFA 2CMOA 2H25A 4RY1A 4F1UA 3K6WA 4LZ8A 3Q29A 3O6GA 2VD3A 5I56B 3M3LA 1LAXA 3MBPA 4RJZA 4GXAA 2ZXTA 1B4ZA 4ELOA 4MBPA 3UA8A 3MVXA 4N6PA 1MPDA 4EF2A 3MWBA 1LLSA 1R6ZA 5HPQA 1B3LA 1B7ZA 2Y7RA 1AL3A 3KJ7A 4ZECA 3KG2A 3FXUA 3TCHA 3G3GA 1ZTYA 1SD3A 2QS4A 2QPQA 2DWHA 4M1VA 3T9UA 3WAEA 3F11A 3S9EA 4DCXA 1N76A 3W9VA 4H1XA 1MXXA 3C33A 2ZNTA 3LSFB 4L17A 3IOUA 3OSQA 4HCYA 1P99A 1SVXB 4G8HA 3OXNA 3JZJA 3TTRA 4OTEA 4G77A 2ONKE 4BDOA 4NWDA 3M3FA 4FORA 3KEIA 1WODA 4EQ7A 2NUVA 3PMWA 4KQPA 2G29A 4NEDA 4H5FA 3U94A 3IL1B 2H9BA 4NTLA 1OQGA 1JW1A 2O7UA 3HCQA 4ZZAA 3MP6A 2V3TA 1VE4A 3TUSA 4RPNA 1H3DA 3AXFA 2XXIA 3B6QA 2O51A 2DVZA 3MUQA 3N6TA 4JWYA 4GVOA 2ESNA 1SW2A 1H43A 5H8QB 1FQCA 2Y84A 1LGBC 1LCFA 3PPNA 3K02A 2UVJA 4E0XA 5A5XA 3TDJA 1OLCA 1VR5A 5I58B 3UP9A 2O7IA 2XXHA 4OYVA 1POY1 4Z0IA 4EDPA 2B3BA 3TTLA 4I62A 4GXSB 3ZS6A 5IKBA 3OO8A 1OQHA 2FA7A 4JXIA 3FUZA 3IO6A 4KYDA 4O3AA 2QS2A 3RNNA 5J1DA 1GVCA 4KCCA 1LFHA 3A3CA 2NXOA 4PP0A 2VGQA 1BLFA 3KN3A 3TCFA 2Q89A 1GGGA 2RCBA 3IO4A 3ODBA 1OLAA 3VVEA 2KLFA 4HS7A 1QKAA 4UA8A 3QIMA 2AIXA 3C31A 5DVJA 4NF8A 3K6UA 2HQ0A 1FQDA 3ONMA 2F7AA 1TXFA 2QSXA 3QAXA 3PPPA 2PX1A 3RPWA 2OJTA 3CI8A 3IR1A 4OFJA 1MPCA 2A5TA 1I6BA 3M3KA 5A5XB 4Q8RA 5DVIA 1XHYA 4TOZA 4ZEIA 1MY3A 4F22A 5CBRA 3V8XB 4JWXA 1D4NA 3S9MC 3CRBA 1YAEA 3PMVA 2GHAA 4EQBA 4DXBA 3PUZE 5H8FB 3T9HB 5LOMA 1ZIUA 3JV9A 3OEMA 5HM4B 2Q8JA 2Z8EA 3EF7A 1A8EA 2R6GE 1MQGA 1MXZA 1XVYA 4FIMA 3M8UA 2I58A 2XXVA 3TTKA 1PBQA 5I2NA 4H65A 4ZS9A 1N3WA 4JB7A 4DXCA 3QXMA 1NNFA 4ZE9A 3BFUA 2DSFA 4H0WA 1SI1A 4YB5A 3DLNA 4DCYA 4C0RA 1T0KA 1HSLA 1XT8A 2F6PA 1DPEA 2QS1A 4I9DA 4KR5A 1B5JA 4R72A 2GH9A 2ZNUA 2HZKA 3PUXE 3T66A 1J1NA 3H03A 4ZEFA 5KZTA 4U4XA 3MVYA 4ZZEA 1IXCA 2FNCA 1Q35A 4IO5A 5TPAA 1OVBA 3H4ZA 4EF1A 3TEPA 3RTFB 2YJPA 4OEVA 1DTZA 4U1ZA 4XIGQ 3ILUB 4U23A 4YU0A 3OO9A 1TFAA 5DT6A 1H76A 2A5TB 5FHOA 4U4SA 4M4GA 1ZU0A 1YCJA 3VFJA 4RK9A 1NH8A 3RTWB 4H8JA 2OWSA 4QFNA 1LFIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N5LA 1MH3A 1OVTA 2WBDA 1MM7A 1F9BA 2DOJA 1BP5A 1XS5A 2B4MA 2D5WA 1IZ1A 3C4MA 3QUJA 3TCGA 2DWAA 1RKMA 3TODA 2ALUA 3JYRA 4ELPA 1RYOA 1FBCA 2P2AA 4ELRA 1D9QA 3MQ9A 1KWHA 3PPOA 1MM6A 4XKNA 4IB2A 4N4UA 2F7BA 4NX1A 1BKAA 1D9VA 5IM2A 4U2RA 3OO7A 1BIYA 2Z23A 3O9PA 1M5DA 3RLFE 1N0TA 3CSGA 1NV7A 4N17A 1NNKA 3IB2A 3G3IA 2ZYKA 3FVKA 3QSLA 1IMCA 2F34A 1MPBA 1FPIA 4FATA 4G68C 3PPRA 1OIBA 2R9JA 3H3GA 2DYXA 5DW8A 1SYHA 5FBPA 1QVSA 4BDQA 4IY5A 5ITPA 2F5XA 3MYUA 3HPIA 2DVCA 1CB6A 3UN6A 4PE5B 4ESWA 1I69A 1MQJA 4YMAA 2P0SA 4XTCQ 2Z8DA 2QVUA 1B2HA 1MDQA 4YKPA 2BJJX 1B3EA 4AB6A 4G4PA 1JEVA 4GOTA 2DWJA 3PV0E 1P1OA 3B8BA 3S4UA 3V83A 4G68B 5KDTA 4R9GA 4FBPA 1A55A 3G3JA 4H5GA 3SKPA 4H6DA 3ECRA 3RQTA 5FHNA 3K6XA 3TQWA 3GLBA 5ET6A 5DEXB 3W15C 2ONRA 2XX8A 4PF8A 3H6TA 3MZ1A 2FIEA 3QUFA 2OX3A 2VD2A 2RC8A 3VV5A 3T93B 4JVIA 4R6YA 3K0VA 4OXVA 4GQOA 4QFPA 2O69A 5KCJA 3OELA 4GRKA 3PD8A 3O6IA 4OQOA 2Z22A 4YB7A 5IAIA 1JEUA 1FBGA 4YKIA 3VLVA 2O6AA 1G0IA 1LBXA 3O2AA 2B3FA 2H98A 5JK4A 2DP8A 5CMKA 4NMYA 4XXUA 2OWSA 4P11A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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