5AA2A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
419
Chain Sequence
KEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 143
structure length 419
sequence length 419
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2A02
4OFLA 3ZKKA 1YCJA 1LB8A 2ONKE 4TLLB 5TPAB 2H98A 4U1OA 1Y3PA 3IB1A 4N6PA 2I3WA 2ZXTA 1SYIA 2QS1A 4H5GA 2THIA 5M2VA 5I2NB 1XVYA 2G29A 2XXXA 4TOZA 1BTJA 3H03A 2H5YA 3CVGA 3U72A 3RNNA 2O7UA 4G2ZA 1LAGE 2XXHA 1BIYA 4MLVA 5AA4B 3TTRA 3SDFA 2DWJA 1I6QA 4THIA 4M1VA 1B7ZA 2QS4A 4DZ1A 1PBQA 1LCTA 5KCJA 1MQJA 4OFJA 4QFNA 2VP1A 5B70A 1Y1ZA 4U22A 4F18A 3T9VA 1MDP1 4I62A 1B3GA 2O51A 1MQIA 2XD2A 5BUUA 3OSRA 4LP2B 1DPPA 1BLFA 3O2AA 3GBBA 1GGGA 1M5BA 3OD7A 2E1SA 2G93A 1JETA 2OZZA 4BDQA 3H3GA 2OLBA 4KYDA 3EHUA 3QIMA 4ZEKA 2QS2A 3OXNA 4KI0E 4KYSA 2B65A 3CFLA 4ZZEA 1QUKA 3MJNA 4IB2A 5DVIA 3EN3A 3L6GA 3D4GA 1S50A 4DE8A 3O97A 1TXFA 4HS7A 3I3VA 4GOTA 1QULA 2UVJA 3IORA 3PPPA 5L9OA 1B7UA 5H8NB 1NH7A 2I48A 3FJMA 3TQLA 3KFMA 2HFBA 3FZVA 2F7AA 1NL5A 3IOVA 2XX9A 1TFAA 1N04A 4OXVA 1B9JA 1B3FA 1SYHA 2P2AA 3K6UA 3TCHA 2UYEA 1H45A 3IR1A 4EQBA 4RK9A 1LGBC 4EF1A 2ZNSA 3GBAA 1SD3A 1Y9UA 1SDXA 1ZIUA 3F11A 3K0VA 3C35A 3MVYA 5I57B 2A5TB 2CZLA 3FD3A 4JBZA 4N13A 4ZEDA 4HW8A 3H7MA 3OO6A 1Q35A 4YB7A 4ZDMA 4F3GA 4OFOA 3T93B 1UTHB 2I0BA 4PFTA 1URDA 3PGFA 4EF2A 5CM6A 5I56B 2V84A 2Y84A 2I4BA 3A3CA 2WKYA 3IO6A 5I58B 2IA4A 1B52A 4OYVA 1LBBA 3TZAA 4BDMA 2NXOA 4ZEBA 3MVWA 4NE4A 4G8MA 4TQUQ 4XXUA 1JW1A 1JEUA 1Z7ME 3B6TA 3KG2A 3N94A 1FQCA 1B4ZA 4LQ5A 2Z8EA 1GV8A 3QXMA 1LBCA 3MVXA 5JK4A 5LOMA 1MQHA 4Z0IA 2Q89A 1MXYA 2I0CA 4ZE8A 2XXVA 2Y7WA 2V25A 4NF8B 3IO4A 4HTGA 2Q2CA 4JSOA 1A8FA 4XKNA 5HPQA 4F1VA 1DTZA 1KWHA 4U21A 4POWA 2NOOA 3Q29A 4EUOA 4H8IA 2A5SA 5J1DA 1PB7A 2I49A 4RPOA 1B1XA 1XS5A 4LQ2A 4YKKA 2W7YA 4OHNA 5DEXB 4OZ9A 3RQTA 1FTOA 3IOWA 2HAVA 4H0WA 4ELOA 2DXRA 5A5XA 4YKIA 1NNTA 4KD5A 2DVCA 2ZYMA 3K00A 1M5CA 5CMCA 3HN0A 3IL1B 3PMXA 4F2OA 1FQAA 4OEUA 1P1NA 3A3UA 5AA2B 3TTNA 1NH8A 4DCYA 1FTMA 4QRZA 1FTKA 1VFDA 2ZNTA 3U1OA 2Z23A 4KCDA 1N76A 3DP4A 3FGSA 4GD5A 2XXUA 3TAJA 1FQFA 1FTJA 1DTGA 3USDA 3CRBA 1ZKBA 1POY1 4HCWA 1O7TA 1LB9A 3HPIA 1MM6A 5H8HA 4IO7A 2XXQA 1B40A 1PDAA 3PV0E 3U8QA 3MZBA 3RTWB 3TEPA 2DYXA 1CE2A 2RC8A 4DDDA 3M8UA 2O1LA 4E0XA 4C1UA 2I58A 1NNFA 2XHDA 4PFUA 3SKPA 3DP6A 4IY6A 5I56A 4BDLA 1JQFA 3HCQA 1MG1A 5I58A 1OMPA 3CG3A 1LFHA 4JWOA 4NMYA 1A8EA 2V3UA 2GHAA 3GZGA 3MZ9A 3FVOA 2UVIA 2Z8DA 2F8DA 3ZS6A 4G77A 2PMSA 3FJ7A 3UP9A 4R73A 4E0WA 2VGQA 4IGRA 5KDTA 2QMXA 3S4UA 1B5IA 1ELJA 4NF8A 3LSXA 5CBRA 1P1OA 3H4ZA 4JSDA 3VE1B 1B1HA 4IO2A 4ECFA 3QK6A 1SW2A 2Y7PA 3MP6A 1FQEA 4QSDA 4MLQA 3IAZA 3O6GA 2QSXA 5I2KA 1O64A 2YPNA 1DMBA 4Q8RA 4G4PA 1P99A 4ZE9A 2QRYA 3V89B 5L9SA 1FW0A 3E3KA 1GTKA 1QVSA 4IO6A 1R1NA 2OCUA 2DE3A 3OO7A 3Q28A 2VOZA 4GIZA 3K4UA 1GR2A 4PETA 3W15C 2H9BA 5H8FB 1R9LA 4F19A 3TTKA 1EZPA 5I59B 4R75A 3KOSA 4YICA 3PPRA 3SEWA 1UTBB 3RUMA 4Q30B 5IAIA 1H76A 1MY2A 4ND9A 4ONYA 1D3KA 4G8HA 4EQ7A 2HZLA 1D4NA 1ATGA 1P1UA 4NTLA 5F7VA 5FHMA 4X9TA 2RC9A 1VSOA 4K3FA 3MC2A 2ZMBA 3M3KA 4RA1A 3PPNA 1MPDA 1UIUA 1UIVA 1PB9A 1MDQA 3G3HA 3MQ9A 1Y4TA 2QL3A 2DOJA 2HXWA 4AB5A 3FXQA 3LSFB 1MS7A 2ZYNA 5FTHA 1I69A 4GFRA 5ICQA 3S9EA 1Y3NA 3PUXE 2DXYA 1WODA 3UIFA 2NVUB 4ELPA 1B5HA 1MRPA 1PEBA 1LSTA 1POTA 1HSLA 4DIGA 4QFLA 1B3LA 2Y7RA 1MY4A 4G68B 1A7LA 3ZSFA 5ITPA 3M3FA 5I84A 4ESWA 4GL8A 4TLMB 3UA8A 3IB0A 2PT1A 1IIWA 4KHZE 3S2VA 3SESA 3VVFA 2XXIA 4OERA 4QFPA 2HAUA 3TQWA 4JWYA 3LSLA 1N7WA 5EHMA 1LAXA 1I6BA 5AE4A 1H44A 2GFEA 5JEIA 4FATA 3FXUA 1N7XA 1QKBA 2D5WA 3K1PA 4GXSB 4OTEA 4Q5TA 1MXZA 1FQDA 3K6WA 4OESA 1FQBA 2R9JA 2M8CA 3CSBA 3U94A 3PU5A 1LCFA 4ESXA 4IO5A 2F97A 4JDFA 3HHGA 3V5AA 1US5A 1MY1A 4KPTA 1AOVA 1LAHE 4PE5B 2DQVA 3OO8A 3E13X 1IXHA 4NF4A 4NF6B 1NNKA 5B7DA 2HZKA 1MXVA 2R6GE 5H8FA 3KOTA 3TCFA 3RY3A 4FJPA 2H4IA 2Q8JA 5I59A 3FVNA 1A54A 2D21A 4GWOA 4XIGQ 1RYOA 3KZGA 3EHSA 4O3BA 3LUYA 4LZ7A 3WAEA 2F6GA 2OJTA 4ELQA 1T0KA 1J1NA 3O6IA 4OQOA 3S9MC 3C32A 5TPAA 3N6UA 1JNFA 4UA8A 1Z7NE 2OK2A 3VFJA 5I2NA 4QFOA 4YB6A 3FV2A 4YZZA 2V3QA 4PFYA 5FTIA 4R6YA 1M5EA 5AA4A 1URSA 1EH3A 2DWIA 3SEUA 3LSWA 3MP1A 2ZNUA 4MFIA 1IXGA 4Z7EA 4U1ZA 5AA2D 1B3HA 3KN7A 3MAMA 3CIJA 4RJZA 3QUFA 1SW5A 1USYH 1Y1MA 1M5DA 4QSEA 2H99A 2BJJX 3K6XA 2PVUA 5DYHA 2DVZA 2Q2AA 3MZ1A 3W9WA 4NF5B 2NUVA 3IOTA 1XT8A 1Y20A 4YKJA 3PD9A 1QJMA 4F2QA 1Q1KA 5IKBA 5H8QB 3KN8A 4OENA 3K02A 2NWJA 1Y3QA 2ZYKA 5TP9B 1P1WA 4RY1A 4O3CA 4PP0A 1SI1A 2Z22A 3CG1A 3G3JA 5H8NA 4H8JA 3RT6B 1B0LA 1N84A 4QHQA 3UORA 4F1YA 4NWDA 3G3FA 4NF6A 5K2YA 3G7WA 5ISUA 4RPNA 2F5XA 2UYFA 3UN6A 4GF8A 4P11A 4MH5A 5CC2A 4U4XA 3ONMA 1HSEA 2Y7KA 4KQPA 1MPBA 3OSQA 3TCGA 2QMWA 1B2HA 1UQWA 2P1SA 2VHAA 4IGTA 4NEDA 3IK6B 3T22A 4ISUA 1URGA 2I3VA 4JB7A 5DVJA 3G3KA 1VE4A 5I57A 2A5TA 3SEVA 2RF1A 3KJ7A 1MPCA 1BP5A 3VXCA 2AL5A 1FCKA 4YMAA 1UTHA 3I5OA 3EHTA 1NKXA 4OETA 1LFGA 2XXRA 5ICTA 3O9PA 3RPWA 4WXJA 1AIVA 1EZ9A 2F34A 1B32A 2Y7IA 5TU0A 4DLDA 4N07A 1B4HA 2AIXA 1ZBMA 1B05A 1M5FA 1DOTA 1MXUA 2X26A 3AXFA 3RTFB 4KYEA 4AQ4A 4DCXA 4F1UA 1IZ1A 2DS9A 4UACA 2VD3A 3K01A 2PT2A 3H6WA 1R6ZA 1LFIA 1JEVA 4F31B 3DELB 5KCJB 4H1XA 3BKIB 4GVOA 4WEPA 4R9FA 2HEUA 4X1DA 1MM7A 2O84X 3QYTA 3S9NC 2ANJA 3CSGA 4BLAA 2REGA 3QUJA 2XX7A 4BDNA 1IUDA 3HV1A 3KSJA 3VVEA 4U23A 4IY5A 2DE2A 5CI5A 1II5A 1N3XA 3PUYE 4XTCQ 3LBSA 1DPEA 4FEBA 1YAEA 3RGYA 1OLAA 4XKQA 2O1MA 4LUBA 3T9UA 5DEXA 4KR5A 3PMVA 5FHOA 3R6UA 1B6HA 4PFWA 3KJTA 1SBPA 5TP9A 2GHBA 5EHSA 2F36A 1LLSA 3FV1A 4MF3A 3KN3A 1F9BA 1ANFA 5BWJA 4BDOA 3W9VA 2XX8A 4MBPA 2YLNA 4R2FA 4RK2A 3VXBA 1EZOA 1B0HA 5AA2A 2B3BA 4F3SA 3PMWA 3FVGA 3R7XA 2YJPA 3A09A 1Y4CA 2IEEA 1EU8A 2ALUA 3B6WA 4I1DA 3ILTB 5JTYB 1B46A 1LAFE 3OO9A 1O63A 2XXWA 3C36A 3C33A 4GQOA 4GLIA 4F3BA 4LATA 3TODA 2KLFA 3FVKA 3CFZA 3D4CA 4DXUA 1B51A 2F7CA 3HHFA 3PUZE 1I6AA 1WDNA 5CMBA 1HSJA 1YPNA 4XKRA 1NFTA 4OVJA 2F35A 3E9XA 1S9TA 1ZLQA 1TT1A 3G3IA 4EDPA 2ONSA 5ELVA 1MQDA 1SVXB 4IO4A 3U93A 2LAOA 4X48A 1ZU0A 3TMGA 3L6HA 3LR1A 3PPOA 5HM4B 3JYRA 3THIA 4H6DA 3U92A 3S9LC 5H8SA 5AA1A 1IXIA 1TWYA 3T9XB 4P0GA 1XOCA 3G3GA 4C1TA 3UK4A 1MY3A 5L9MA 1B7HA 1TFDA 3PD8A 3TTLA 2O68A 2CMOA 3MUQA 2O69A 3O29A 4ZEFA 4GL0A 4ELRA 1L5TA 2V3TA 4H65A 2X7PA 2RCAA 2XXYA 3V8XB 4Q0CA 3EF7A 2Q88A 5DTBA 1P1QA 3VDFA 3C31A 2R71A 4OMBA 3RN8A 5A5XB 2X7QA 4FE8A 2F7BA 2DE4A 4GRKA 3BFTA 3CFXA 3QSLA 2UXAA 4WEDA 3KEIA 3Q25A 5CMKA 1ZTYA 3E4RA 1RYXA 2XXTA 3GLBA 2PBWA 4WKMA 2O7IA 1D9VA 5CMMA 3T66A 4LA9A 2FNCA 3TPAA 2ESNA 3EPEA 4R2BA 3OOAA 3RT8A 1XHYA 3GXAA 1UTBA 3T9HB 4RNSA 4EXKA 2B3FA 5K2XA 4QF9A 1SI0A 3IJOB 3ZKLA 2OWSA 3LC8A 1OQGA 3KBRA 3JZJA 1VR5A 4PQJA 3VVDA 1A40A 5JTYA 2F78A 2GRVA 1DSNA 4F39A 4LVQA 5H8HB 1N3WA 1SW1A 3FASA 5ITOA 3PUVE 3OEMA 4OEVA 1PBPA 4H67A 2VD2A 3VV5A 4HCYA 2H25A 1US4A 3TFLA 3RLFE 1A55A 1B3EA 3C4MA 1XC1A 4ZECA 2FA7A 3B7DA 4NWCA 4JWXA 3O28A 2DP8A 1A99A 5EYFA 4LONB 5L8DA 4F29A 1QUIA 5F1QA 4G68A 3M3LA 1JVXA 3I6VA 5KZTA 4P0IA 2I6EA 3P7IA 3BBRA 3BFUA 1ZMGA 4DXCA 4H5FA 5FHNA 4FEDA 3H6TA 2XXPA 1JW5A 3B6QA 5CRYA 3MVZA 5KDTB 1PC3A 1R9QA 5AA3A 2AYSA 4YB5A 4R6HA 2ABHA 1AL3A 3IOUA 3FXRA 3QAXA 1USYE 2REJA 3UGWA 4L17A 1H3DA 2PYYA 3TDJA 4EQ9A 2RC7A 5I2KB 3SERA 1IQ7A 3CI8A 1AH5A 4YAHX 3K1MA 2D3IA 1NNPA 3SEXA 1JW4A 4ZS9A 1SQYA 3FJGA 4DXBA 2RCBA 3TELA 1YTVA 4R72A 2HCAA 3TUSA 3DP8A 3TYHA 1GVCA 1D9YA 1H43A 4KFQA 4F3PA 2UVHA 2O6AA 1MH4A 5HBCA 3OENA 3O6HA 4AB6A 4IO3A 1IXCA 1OVBA 3FIRA 3K6VA 3FATA 3IJXB 4U2RA 4YU0A 4LZ8A 1MXWA 1IEJA 4I9DA 4FORA 4O3AA 2DWHA 3ODBA 5DT6A 3IX1A 2DWAA 1CB6A 1NMUA 3N26A 2P0SA 4M4GA 3IB2A 1WVJA 4RXLA 2Q9TA 1B58A 2RINA 4G8NA 3T96B 3H6VA 1IITA 4RYAA 1QW0A 3Q27A 3WAFA 2V93A 4FAJA 4GXAA 1MH3A 3HSTA 2QPQA 3PPQA 1OIBA 2OBGA 4JXIA 1ZJLA 4YKPA 4POXA 4X1BA 3N6TA 3C34A 3C9HA 4KCCA 4QSCA 4R6KA 2ZYOA 3O66A 1OVTA 3MWBA 3HO7A 1SW4A 3DLNA 3KSXA 3MW0A 4C0RA 3VLWA 2RKMA 1N0TA 1B5JA 2QS3A 1MXXA 4R9GA 3H6UA 3TTMA 1MY0A 4XKPA 2AL4A 3SEYA 3TKDA 4R74A 2QJEA 3SETA 4EXLA 1RKMA 4NF5A 3VLUA 2I4CA 5DVFA 3PUWE 3N5LA 1JVYA 3K2DA 2GH9A 4FECA 1QUJA 1PB8A 3ECRA 3Q26A 5H8QA 1S7YA 1XVXA 4G68C 4FIMA 4OWDA 2HQ0A 3K1NA 3EQ1A 3DM0A 1FTLA 3OEKA 2FYIA 2PX1A 4YMBA 2OWTA 2F6PA 3VLVA 4NF4B 4F22A 2XD3A 4ZEIA 2E0SA 4ZZAA 3MP8A 3OMBA 4I8CA 1MQGA 1QKAA 1AMFA 5CBSA 4BDRA 1VFEA 3FUZA 3OELA 3MPLA 2DSFA 3H06B 4LZ5A 3JV9A 1OLCA 1BKAA 1OQHA 3KGCA 2Z8FA 3R26A 4U4SA 3ILUB 3MBPA 4QFKA 3V83A 3MPKA 2UVGA 3CR9A 2ONRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OFLA 3ZKKA 1YCJA 1LB8A 2ONKE 4TLLB 5TPAB 2H98A 4U1OA 1Y3PA 4MJOA 3IB1A 4N6PA 2I3WA 2ZXTA 1SYIA 2QS1A 4H5GA 2THIA 1FPLA 4PBQA 5M2VA 5I2NB 1XVYA 2G29A 2XXXA 4TOZA 1BTJA 3H03A 2H5YA 3CVGA 3U72A 3RNNA 2O7UA 4G2ZA 1LAGE 2XXHA 1BIYA 4MLVA 5AA4B 1CNQA 3TTRA 3SDFA 3IFAA 4JVDA 2DWJA 5IZ3A 1I6QA 4THIA 4OVTA 4M1VA 1B7ZA 2QS4A 4DZ1A 1PBQA 3BIGA 1LCTA 5KCJA 1MQJA 5FBPA 4OFJA 4QFNA 2VP1A 5B70A 1Y1ZA 4U22A 4F18A 3T9VA 1MDP1 4I62A 1B3GA 2O51A 1MQIA 2XD2A 5BUUA 3OSRA 1RDYA 4LP2B 1DPPA 1BLFA 1FPDA 1K9YA 5EQAA 3O2AA 3GBBA 4PTKA 1GGGA 1M5BA 3OD7A 2E1SA 2G93A 1JETA 2OZZA 4BDQA 2B4MA 3H3GA 2OLBA 4KYDA 3EHUA 3QIMA 4ZEKA 2QS2A 3OXNA 4KI0E 4KYSA 2B65A 3CFLA 4ZZEA 1QUKA 2P3VA 3MJNA 4IB2A 5DVIA 3T0JA 3EN3A 3L6GA 3D4GA 1S50A 4DE8A 3O97A 1TXFA 2DDKA 4HS7A 3I3VA 4GOTA 1QULA 2UVJA 3IORA 3PPPA 5L9OA 1B7UA 5H8NB 3FBPA 4GBVA 1NH7A 2I48A 3FJMA 4P56A 5ET8A 3TQLA 3KFMA 4NN3A 2HFBA 1QGXA 3FZVA 2Y5KA 2F7AA 1NL5A 3BIHA 3IOVA 2XX9A 1TFAA 1N04A 3A29A 4OXVA 1B9JA 1B3FA 1SYHA 2P2AA 3K6UA 3TCHA 2UYEA 1H45A 3IR1A 4EQBA 4RK9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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